石菖蒲-郁金配伍治疗癫痫的网络药理学研究

采用网络药理学方法筛选石菖蒲、郁金的化学成分和作用靶点,分析石菖蒲配伍郁金治疗癫痫的作用机制。通过中药系统药理数据库(TCMSP)检索石菖蒲、郁金所有化学成分并筛选作用靶点,构建成分靶点PPI网络。通过PharmGkb数据库检索癫痫相关基因,采用Cytoscape软件绘制疾病靶点PPI网络。利用Cytoscape软件进行网络合并,筛选核心网络,进一步进行基因GO功能和KEGG通路富集分析,并通过实验研究验证。检索出石菖蒲105个化学成分、郁金222个化学成分,根据OB,DL值筛选出19个化合物作为有效成分候选化合物,其中石菖蒲4个化学成分、郁金15个化学成分。通过TCMSP共检索出88个靶点蛋白,构建成分靶点PPI网络。通过PharmGkb数据库检索出癫痫相关基因29个,建立疾病靶点网络。利用Cytoscape软件及插件进行网络合并和核心网络筛选,共筛选出69个基因。通过GO功能分析和KEGG通路分析,发现抗癫痫作用机制与催乳素信号通路、HTLV-Ⅰ感染信号通路、MAPK信号通路、单纯疱疹感染信号通路有关。通过进一步实验验证发现癫痫大鼠血清泌乳素水平明显升高,癫痫发作24 h大鼠海马CA1区神经元变性、坏死、脱失,部分神经元间隙水肿。石菖蒲配伍郁金的可能机制与催乳素血清水平、MAPK信号通路、HTLV-Ⅰ感染、单纯疱疹感染有关。分析可能与HTLV-Ⅰ病毒、单纯疱疹感染引起病毒性脑炎有关,损伤神经细胞,引起癫痫发作。     

基于网络药理学的中药复方知柏地黄丸治疗代谢综合征的机制研究

目的:应用网络药理学的研究方法挖掘中药复方知柏地黄丸治疗代谢综合征的物质基础及其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库检索中药复方知柏地黄丸中八味中药的主要活性成分,并进行靶点预测。通过OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索代谢综合征的相关靶点,将中药靶点与疾病靶点取交集得到共同作用靶点。应用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape软件对其进行拓扑学分析筛选出核心靶点。最后,基于Metascape软件并进行GO-BP生物功能富集和KEGG通路分析。结果:经数据库分析中药复方知柏地黄丸中含有活性化合物74个,作用靶点906个,其中290个为与代谢综合征共有靶点;通过对共有靶点的拓扑分析,筛选出核心靶点78个,GO-BP生物功能富集以及KEGG通路分析发现,其可通过循环系统、G蛋白偶联受体信号通路、脂多糖调节、调控血压、脂质代谢调节等多种生物学功能以及血管内皮生长因子信号通路、钙信号通路、ErbB信号通路等多条代谢通路发挥其治疗作用。结论:中药复方知柏地黄丸可通过过氧化物酶体增殖激活受体(PPAR)、转录激活因子-3(STAT3)、磷脂酰肌醇激酶(PIK3)等靶点经过循环系统、G蛋白偶联受体信号通路、与环状核苷酸第二信使偶联以及VEGF信号通路、钙信号通路、ErbB信号通路等代谢通路发挥治疗代谢综合征的作用,为其临床和基础研究提供新的科学依据。     

基于网络药理学分析"钩藤-白芍"治疗小儿抽动障碍的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨钩藤、白芍治疗小儿抽动障碍(TD)的作用靶点及相关信号通路,以明确其作用机制.方法:在TCMSP数据库中检索钩藤、白芍化学成分并筛选作用靶点,并检索相关文献进行补充;从GENECARD、OMIM、TTD及DrugBank数据库检索与抽动障碍相关的疾病靶点,利用Cytoscape 3.7.0软件构建化合物-靶点网络,并筛选核心网络,进行GO功能和KEGG通路富集分析.结果:共筛选出钩藤治疗TD的化合物30种,与之相对应的作用靶点590个;白芍治疗TD的化合物7种,与之相对应的作用靶点81个.活性成分靶点与抽动障碍疾病靶点的交集基因共37个,交集基因的PPI网络共包含节点37个、边198条,平均节点度值为9.89.GO分析结果显示,上述交集基因的分子功能主要包括G蛋白耦联受体活性、儿茶酚胺结合、神经递质受体活性等,生物过程主要涉及腺苷酸环化酶激活肾上腺素能受体信号、化学突触传递等,细胞组分主要包括突触膜固有成分、突触后膜等.KEGG分析结果显示,信号通路主要涉及神经活性配体-受体相互作用信号通路、钙信号通路、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路、PI3K-Akt信号通路等.结论:本研究初步验证了钩藤-白芍治疗TD的药理学作用机制,为进一步从细胞生物学层面验证其作用机制奠定了基础.     

基于网络药理学探讨五苓散治疗糖尿病肾病的作用机制

目的：根据网络药理学方法对五苓散治疗糖尿病肾病(DKD)的作用机制进行研究探讨。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对五苓散中有效成分进行筛选及靶点预测，检索GeneCards、CTD数据库筛选DKD疾病靶点，利用韦恩图在线平台筛选五苓散治疗DKD交集靶点，借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选五苓散治疗DKD核心靶点，使用Cytoscape 3.7.1建立化合物-疾病-靶点调控网络，基于DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果：基于TCMSP得到五苓散的27个有效成分和62个潜在靶点，筛选获得与DKD疾病发生、发展相关的靶点21 153个，借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选五苓散治疗DKD核心靶点16个，GO功能富集分析得到条目99个，其中生物过程条目64个、分子功能条目24个、细胞组成条目11个，主要包括过脂质反应、G蛋白偶联受体信号途径、肾上腺素能受体活性、四吡咯结合、胞膜小凹等功能途径；KEGG通路富集分析得出条目61个，主要包括NF-κB信号通路、细胞凋亡、TNF信号通路、雌激素信号途径、IL-17信号通路等通路途径。结论：基于网络药理学初步探讨并验证了五苓散治疗DKD多成分、多靶点、多通路的整体调节作用特点，预测了五苓散治疗DKD的潜在作用机制，以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

基于网络药理学的皮肤解毒汤治疗湿疹作用机制研究

目的基于网络药理学方法探讨皮肤解毒汤治疗湿疹作用机制。方法采用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)预测皮肤解毒汤中已知化学成分的作用靶点,用cytoscape软件构建皮肤解毒汤中化合物与其靶点网络,并用DAVID 6.8平台对化合物靶点网络进行基因功能注释分析(GO)和信号通路富集分析(KEGG),揭示皮肤解毒汤治疗湿疹的作用机制。结果 TCMSP平台发现皮肤解毒汤中8个主要化合物作用于133个靶点蛋白,化合物靶点网络解析发现该受体辅激活蛋白2(NCOA2)、一氧化氮合酶(NOS2)、凝血因子Ⅶ(F7)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)是化合物-靶点网络中的关键节点蛋白,同时靶蛋白基因功能注释分析发现,主要与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录调控、蛋白激酶B信号通路的正向调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录负调控、G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、γ-氨基丁酸A受体活性、细胞外配体门控离子通道活性等生物学过程和分子功能有关。信号通路富集分析显示,大多数基因富集到了神经配体—受体相互作用信号通路、钙离子信号通路等。结论本研究应用网络药理学的方法预测出皮肤解毒汤治疗湿疹的可能作用机制,为其进一步研究提供新的思路与线索。     

基于网络药理学探讨肾衰饮治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:根据网络药理学方法对肾衰饮治疗糖尿病肾病(DKD)的作用机制进行探讨。方法:利用中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对肾衰饮中有效成分进行筛选及靶点预测,检索GeneCards、TTD、DisGeNET数据库筛选DKD靶点,利用韦恩图在线平台筛选肾衰饮治疗DKD交集靶点,借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选五苓散治疗DKD核心靶点,使用Cytoscape 3.7.1建立化合物-疾病-靶点调控网络,基于DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集和KEGG信号通路富集分析。结果:基于BATMAN-TCM、TCMSP得到肾衰饮的178个有效成分和280个潜在靶点,筛选获得与DKD疾病发生、发展相关的靶点2 699个,借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选肾衰饮治疗DKD核心靶点31个,GO功能富集分析得到条目346个,其中生物过程条目278个、分子功能条目44个、细胞组成条目24个,主要包括氧化应激、脂质反应、生长因子受体结合、细胞因子受体结合、转录因子结合、血小板α颗粒等功能途径;KEGG信号通路富集分析得出条目101个,主要包括AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路等通路途径。结论:基于网络药理学初步探讨并验证了肾衰饮治疗DKD多成分、多靶点、多通路的整体调节作用特点,预测了肾衰饮治疗DKD的潜在作用机制,以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

基于网络药理学的石菖蒲-郁金药对治疗抑郁症作用机制研究

采用网络药理学方法筛选石菖蒲-郁金药对治疗抑郁症作用靶点,明确抗抑郁作用机制。通过检索中药系统药理数据(TCMSP)检索石菖蒲、郁金的所有化学成分并筛选作用靶点,构建成分靶点PPI网络。通过Pharm Gkb数据库检索与抑郁症相关基因,采用Cytoscape软件绘制疾病靶点PPI网络。利用Cytoscape软件进行网络合并,筛选核心网络,进一步进行基因GO功能和KEGG通路富集分析。并进一步采用动物实验进行机制验证。筛选出成分-靶点PPI网络有62个节点,87条连接。疾病靶点PPI网络有1 289个节点,17 714条连接。网络合并后建立成分-靶点-疾病网络有1 337个节点,17 801条连接。通过筛选核心网络有63个节点,935条连接,体现了成分和靶点之间的复杂相互作用。基因GO功能分析提示涉及生物过程、分子功能、细胞组成3方面。基因KEGG通路富集分析发现与错误折叠蛋白、性激素分泌、海马神经元凋亡有关。进一步通过动物实验验证,石菖蒲-郁金药对能提高性激素(血清总睾丸酮)水平,抑制大鼠大脑海马CA3区神经元凋亡。石菖蒲-郁金药对治疗抑郁症可能机制是调节错误折叠蛋白、性激素分泌、海马神经元凋亡。     

基于网络药理学探究健心胶囊治疗心律失常的作用

目的基于网络药理学方法探讨健心胶囊治疗心律失常的物质基础及作用机制。方法借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取健心胶囊的主要活性化学成分、对应靶点及靶标基因,应用OMIM、PharmGkb、Drugbank、TTD、DisGeNET及NCBI Gene数据库筛选心律失常的疾病靶点,进一步筛选健心胶囊治疗心律失常的靶点。进而应用DisGeNET数据库分析靶点属性。利用Cytoscape3.7.2软件构建"中药-化合物-靶点-疾病"网络,并采用String数据库构建蛋白与蛋白相互作用网络(PPI),利用DAVID 6.8在线工具进行潜在作用靶基因GO注释分析及KEGG通路富集分析。结果筛选出健心胶囊41个化合物和22个作用于心律失常蛋白靶点;作用靶点类型包括多种酶、转运体、转录因子、酸受体等;通过网络拓扑特征评价筛选出健心胶囊抗心律失常作用重要靶点,包括NOS3、IL6、SLC6A4、GJA1、PRKCA、PTGS2、ADRA1B、MMP3;GO分析生物过程富集到血管收缩的积极调节、腺苷酸环化酶激活肾上腺素能受体信号通路、血小板活化等。KEGG通路富集筛选cGMP-PKG信号通路、VEGF信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导等17条主要通路在抗心律失常方面具有作用。结论通过网络药理学证实了健心胶囊治疗心律失常是多成分、多靶点、多途径的复杂过程,预测了健心胶囊治疗心律失常的可能作用机制。     

基于网络药理学的肾气丸治疗糖尿病作用机制研究

目的运用网络药理学方法筛选肾气丸的活性成分及核心靶标,探讨肾气丸治疗糖尿病的作用机制。方法经中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献查询,筛选肾气丸的活性成分;通过TTD数据库和Swiss Target Prediction数据库筛选肾气丸活性化合物的作用靶点,建立靶点数据集;通过OMIM数据库和DrugBank数据库筛选糖尿病相关的靶标;PPI数据库构建肾气丸和糖尿病的交互靶标;用Cytoscape软件构建成分-靶点-疾病交互网络图,并通过ClueGO富集分析涉及的靶点基因功能及信号通路;应用Autodock软件进行核心靶标分子对接。结果筛选得到肾气丸100个活性成分,网络分析表明肾气丸活性成分涉及低密度脂蛋白受体相关蛋白6、胰岛素受体底物1、SHC转化蛋白1等靶点58个,靶点与调控基因的转录、细胞凋亡、细胞增殖、胰岛素受体等生物过程相关,通过调节胰岛素抵抗、TNF信号通路、2型糖尿病信号通路、胰岛素信号通路等通路来发挥其抗糖尿病作用。结论肾气丸治疗糖尿病具有多成分-多靶点-多途径的特点,为进一步研究肾气丸治疗糖尿病的作用及分子机制提供了新思路和新方向。     

基于网络药理学的双丹方治疗冠心病的作用机制研究

目的利用网络药理学的方法探索双丹方治疗冠心病(CHD)的活性成分和分子作用机制。方法采取类药五原则筛选双丹方活性成分;经TCMSP数据库获得双丹方活性成分的靶蛋白,并在OMIN数据库查找CHD的靶点蛋白;运用Cytoscape软件构建双丹方活性成分-潜在靶点、双丹方活性成分-CHD疾病靶点的相互作用网络,通过度等网络拓扑特征评价筛选出双丹方在CHD作用的核心靶点;通过STRING数据库进行蛋白质相互作用分析;采用斑马鱼模型研究双丹颗粒的促进血管生成作用。结果从TCMSP数据库得到双丹方中丹参酮、丹皮酚等39个活性成分和205个蛋白质靶点,筛选出与双丹方作用CHD的IL6、MAPK1、TP53、AKT1、VEGFA等核心靶点111个,GO分析共包含RNA调节、炎症反应、G蛋白偶联、类固醇激素受体活性、细胞分化、血管收缩等19条富集结果。利用DAVID数据库对相关通路富集,筛选出对冠心病具有作用的VEGF信号通路、FXO信号通路、ErBb信号通路等13条通路。结论通过网络药理学验证了双丹方多成分、多靶点、整体调节的作用特点,预测了双丹方在CHD中的主要作用机制。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗阿尔茨海默病的作用机理

目的探讨当归芍药散治疗阿尔茨海默病的可能作用机制。方法采用网络药理学研究方法,应用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库,对当归芍药散和阿尔茨海默病进行靶标预测。采用STRING在线数据库,对二者交集的靶点蛋白构建蛋白相互作用网络,并在Cytoscape 3. 6. 1软件中进行可视化处理。在Unitprot数据库查询靶标蛋白的基因名,使用DAVID工具对查到的基因进行基因本体论(GO)富集分析以及KEGG通路富集分析,探讨潜在靶标可能具有的生物学功能及通路。结果从当归芍药散中筛选出38个化合物,涉及治疗阿尔茨海默病的9个靶点,网络分析结果表明靶点该方可能通过胆碱能突触传递、乙酰胆碱受体信号通路、神经系统发育、信号转导等生物过程,并结合G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、过氧化物酶活性、细胞外配体门控离子信号通路、淀粉样β结合蛋白等分子功能发挥作用;其作用机制主要与胆碱能突触通路、神经配体-受体相互作用通路、钙信号通路、尼古丁成瘾相关的信号通路、PI3KAkt信号通路等有关。结论当归芍药散治疗阿尔茨海默病具有多靶点、多通路的特点。     

当归四逆加吴茱萸生姜汤调节雷诺病的系统药理学和先导化合物研究

目的：探究当归四逆加吴茱萸生姜汤调节雷诺病的系统药理学机制，筛选先导化合物。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology, TCMSP)和Cytoscape 3.6分析软件，构建当归四逆加吴茱萸生姜汤的“中药-成分-靶点”调控网络，对本方调节靶点进行通路富集分析，综合使用系统药理学和计算机辅助药物设计的方法，筛选本方的潜在活性成分。结果：本方初步筛选出696个化合物成分，获得401个特异性靶点，形成“化合物-靶点”5 446调控对。本方调节靶点基因本体(gene ontology, GO)富集通路包括氨基酸结合、G蛋白偶联受体活性等生物学过程及线粒体基质、线粒体等细胞组分相关，受预激抑制、谷胱甘肽代谢过程、抑制性突触后电位等分子功能影响；京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集包括HIF-1信号通路、cAMP信号通路、IL-17信号通路等。分子对接和药效团筛选得出化合物(-)-Medicocarpin具有较好的...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨黄芪-丹参治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术探究黄芪-丹参治疗缺血性脑卒中(IS)的作用机制。方法 通过中医药整合药理学研究平台(TCMIP)V 2.0获取黄芪与丹参的活性成分及靶点,利用GEO数据库检索IS的靶点信息,构建蛋白互作网络(PPI)、成分-靶点网络,筛选黄芪-丹参治疗IS的关键成分和核心靶点,并利用Autodock 4.2软件进行分子对接技术验证,GO和KEGG富集分析预测黄芪-丹参治疗IS的分子机制。结果 共筛选出黄芪-丹参治疗IS的7个核心靶点和6个关键成分。GO生物过程涉及脂质定位、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性调节、脂质转运、急性炎症反应正向调控、脂肪酸转运等,KEGG通路富集主要集中在抗叶酸剂、一碳单位池、脂肪细胞因子信号通路、PPAR信号通路等。分子对接结果提示黄芪-丹参中关键成分与核心靶点存在结合位点。结论 黄芪-丹参中多种活性成分通过调控靶点蛋白,调节叶酸代谢、脂肪代谢、炎症反应等信号通路,发挥了对IS的治疗作用。     

基于网络药理学探讨化痰祛瘀汤治疗缺血性中风的潜在作用机制

目的:基于网络药理学研究方法,探讨化痰祛瘀汤治疗缺血性中风的潜在作用机制.方法:运用TCMSP和相关文献记载检索筛选化痰祛瘀汤的主要活性化合物及相关作用靶点,通过Uniprot数据库获取作用靶点的标准名称,通过Gene-Cards数据库获取疾病的相关靶标,通过STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件构建与本病相关的核心靶点蛋白互作PPI网络.利用R语言软件对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析.结果:根据筛选条件得到化痰祛瘀汤207个有效化合物和176个药物相应靶点,根据平均度值7.43,筛选出核心靶点48个.GO功能富集分析得到条目89条(P＜0.05),KEGG通路富集分析得到158条通路与本病有关(P＜0.05).化痰祛瘀汤中的活性化合物可能通过乙肝信号通路、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、Th17细胞分化信号通路、C型凝集素受体信号通路、内分泌抵抗信号通路、细胞凋亡信号通路、Toll样受体信号通路等途径作用于JUN、MAPK3、MAPK1、TNF、IL6、AKT1、ESR1等核心靶点发挥其疗效.结论:化痰祛瘀汤与缺血性中风发病过程中的炎症反应、动脉粥样硬化、神经细胞凋亡、免疫反应等生物过程具有潜在的关联性与治疗作用.本研究为本药的临床应用及后续的效应机制研究提供了一定的理论基础.     

基于网络药理学的麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘作用机制

目的利用网络药理学技术,探索麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取麻黄、甘草的化学成分及其作用靶点,UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,通过OMIM数据库获取哮喘相关靶点,将疾病靶点与药物靶点进行交集,筛选得到疾病-药物成分共同靶蛋白。利用Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,通过Cytoscape软件构建"中药活性化合物-关键靶标-主要通路"多维网络关系图。结果筛选出115个活性成分,12个作用于小儿哮喘的蛋白靶点;GO富集(P0.01)提示有24个生物过程条目、3个分子功能条目、3个细胞组分条目,KEGG富集29条通路(P0.01),关键靶点包括TNFRSF1A、TNF、IKBKG、TP53、NFKBIA、IKBKB等,关键通路包括细胞凋亡、NF-κB信号通路、TNF信号通路、小细胞肺癌、脂肪细胞因子信号通路、RIG-I样受体信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路等。结论该研究通过网络药理学初步揭示了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的多维调控网络,从多角度探索了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的潜在分子机制及药理作用,为其的临床应用提供了理论依据。     

基于网络药理学预测小麦抗抑郁作用机制

目的基于网络药理学原理,预测小麦抗抑郁靶点及通路来明确作用机制,为进一步实验探究其作用机制做铺垫。方法从中草药系统药理学平台(TCMSP)检索出小麦中的有效活性成分及相关靶点,依据Genecard疾病数据库现有的抑郁疾病靶点,构建PPI蛋白互作网络,进行关键靶点的GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果最终获得13个化合物,85个化合物靶点,8880个抑郁相关靶基因。蛋白互作网络共72个节点。GO功能富集分析得到1792条GO条目,KEGG通路富集分析得到135条信号通路。结论研究初步预测小麦抗抑郁作用机制,通过多靶点多通路作用,主要依靠各个通路中抗炎、抗氧化作用进行抗抑郁治疗,存在其他未明确抗抑郁机制。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨石菖蒲治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的:借助网络药理学和分子对接技术研究石菖蒲治疗缺血性脑卒中(CIS)的作用机制。方法:以"石菖蒲"为关键词在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索其活性成分和作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点蛋白信息进行标准化,构建中药、成分、靶点网络。利用GeneCards、TTD、OMIM和DRUGBANK 4个数据库检索CIS相关疾病靶点。将疾病和药物靶点导入微生信软件绘制韦恩图得到交集靶点,使用在线软件String 11.0建立蛋白质相互作用(PPI)网络。采用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行可视化分析,筛选出核心靶点。在Metascape数据库对核心靶点进行GO富集分析及KEGG通路分析。最后采用分子对接技术确定石菖蒲的有效成分作用于CIS的核心靶点。结果:获得38个潜在作用靶点,PPI网络拓扑分析发现RAC-α丝氨酸/蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)可能是石菖蒲治疗CIS的核心基因。GO富集分析结果显示石菖蒲可能是通过对血压的负向调节、调控白细胞迁移等炎症反应、神经递质合成过程、血管生成以及血液循环等生物学过程来发挥作用。KEGG通路富集分析表明,石菖蒲作用于CIS中的通路涉及血流剪切应力与动脉粥样硬化、钙信号通路、cAMP信号通路、VEG通路以及炎症和癌症等通路。分子对接技术验证了石菖蒲有效成分中的山柰酚与潜在靶点AKT1和TNF具有较好的结合活性。结论:石菖蒲的主要活性成分山柰酚可能通过作用于AKT1等多个靶点,调控钙信号通路等多条信号通路,从而发挥血管生成、抗神经细胞凋亡、抗炎、抑制细胞凋亡等作用,来达到预防或治疗CIS的目的。     

基于网络药理学研究清脉活血方治疗肢体动脉硬化闭塞症的作用机制

目的:运用网络药理学方法研究清脉活血方治疗ASO的作用机制。方法:在中药数据库TCMSP中筛选出清脉活血方的化学成分及对应的靶点,通过Uniprot数据库将靶点名称标准化;通过OMIM、GeneCards数据库检索ASO相关靶点,取药物靶点与疾病靶点交集靶点制作韦恩图,交集靶点即为清脉活血方作用于ASO的预测靶点;使用Cytocsape3.7.2软件构建"中药活性成分-靶点-疾病"网络图,选出关键活性成分;然后在STRING数据库中构建关键蛋白相互作用网络(Protein-proteininteraction, PPI),选出关键靶点基因;利用Rstudio对交集靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果:筛选出清脉活血方有14个有效成分和273个靶点,作用于ASO的相关靶点有152个。GO分析显示,清脉活血方治疗ASO的机制可能与G蛋白偶联胺受体活性、类固醇受体活性、肾上腺素能受体活性、蛋白酶结合、RNA聚合酶II特异性等相关;KEGG通路富集显示清脉活血方治疗ASO影响的通路主要有AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路、白介素-17信号通路、内分泌抵抗、EB病毒感染通路、雌激素信号通路、乙肝病毒、钙信号通路等通路途径。结论:清脉活血方可能是通过JUN、TNF、TP53、IL6、VEGFA、CXCL8等多靶点,通过调节AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路等多条信号通路的形式治疗ASO。     

失笑散治疗冠心病心绞痛作用机制网络药理学分析

目的：通过网络药理学方法研究失笑散治疗冠心病心绞痛的作用机制。方法：通过TCMSP数据库检索得到蒲黄的化合物及靶点蛋白,在UniProt数据库中匹配靶点蛋白对应的靶点基因,在BATMAN-TCM数据库中得到五灵脂的化合物及靶点基因;通过GeneCards数据库检索“心绞痛”得到疾病靶点基因,进而构建药物疾病作用的PPI网络。利用Metascape数据库对关键靶点进行生物和代谢通路分析。结果：筛选得到失笑散12个活性成分,37个关键靶点,主要涉及IL6、TNF、CCL2、IL1B、VCAM1、VEGFA等;GO富集分析得到972个条目,提示失笑散通过调节细胞对炎症的反应、细胞表面受配体结合的活性等生物学过程来发挥作用,KEGG富集分析共得到137条通路,主要涉及流体剪切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGERAGE信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用等。结论：失笑散可能主要通过抗炎、抗血小板、抗氧化,改善内皮功能等药理作用对冠心病心绞痛起到治疗作用。     

基于网络药理学四逆散治疗抑郁症的作用机制探讨

目的探讨四逆散治疗抑郁症的作用机制。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索四逆散中柴胡、白芍、枳实、甘草的化学成分和作用靶点,通过OMIM、TTD、Drugbank、Digsee等多个数据库查询与抑郁症(depression)相关的基因。通过Uni Prot数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape 3.2.1构建化合物-靶点(基因)网络、蛋白相互作用(PPI)网络筛选出核心靶点,最后通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。结果化合物-靶点网络包含121个化合物和相应靶点259个,关键靶点涉及PTGS2、CALM1、ESR1、HSP90AA1、AR等。PPI核心网络包含15蛋白,关键蛋白涉及CASP3、CHRM2、CYP3A4等。GO功能富集分析得到GO条目375个(P0.05),其中生物过程(BP)条目307个,细胞组成(CC)条目37个,分子功能(MF)条目31个。KEGG通路富集筛选得到37条信号通路(P0.05),涉及神经活性配体-受体相互作用信号通路、多巴胺信号通路、IL-17信号通路等。结论四逆散中的有效活性成分主要通过作用于CASP3、CHRM2、DRD1等15个关键靶点调节多条信号通路从而发挥抗抑郁作用。