深圳市盐田区人群肠道病毒及常见感染性腹泻病毒调查分析

目的 了解深圳市盐田区人群肠道病毒及常见感染性腹泻病毒隐性感染状况,为制定防控措施提供科学依据。 方法 2020 年在盐田区海山、沙头角、盐田、梅沙四个街道,分别整群随机抽取 1 个社区为调查点,采集居民粪便样本用实时荧光定量 PCR 方法检测诺如病毒、札如病毒、轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒、肠道病毒通用型、肠道病毒 71 型(EV71)和柯萨奇病毒 A16 型(CV-A16)。 结果 共收集并检测粪便样品 813 份,未检出札如病毒、轮状病毒、星状病毒、肠道腺病毒、EV71 和 CA16;检出肠道病毒通用型 2 例,阳性率为 0. 25%,均为幼童口服脊髓灰质炎疫苗所致;检出诺如病毒 4 例,均为诺如 GⅡ型,阳性率为 0. 49%。 4 例诺如病毒阳性样本成功测序 2 例,分别为 GⅡ. 2-GⅡ. P16 型和 GⅡ. 17-GⅡ. P17 型,均与近年国内流行株有较高同源性。 结论 深圳市盐田区人群存在诺如病毒隐性感染,应加强对重点人群、重点场所的监测。     

实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应在脊髓灰质炎病毒型内鉴定中的应用

目的应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)对脊髓灰质炎病毒(PV)进行型内鉴定,为进行常规rRT-PCR型内鉴定方法奠定基础。方法采用世界卫生组织(WHO)推荐的rRT-PCR方法,对WHO发放的PV株和实验室分离的PV株进行型内鉴定(ITD)和疫苗衍生PV株(VDPV)筛选。结果 ITD rRT-PCR的实验结果与毒株的VP1编码区序列测定结果完全相符,VDPV rRT-PCR的结果与VP1编码区序列测定结果大部分相符,但有2株Ⅱ型脊髓灰质炎疫苗类似株(SL)PV2-SL被错判为非疫苗类似株(NSL),假阳性率为3.03%;1株Ⅲ型SL被错判为NSL,假阳性率为1.92%。结论在新疆脊髓灰质炎实验室rRT-PCR可以应用于脊髓灰质炎病毒的常规监测及型内鉴定。     

烟台地区病毒性脑炎病毒分离与病原学分析

目的了解烟台地区病毒性脑炎病原谱及其基因特征。方法采集烟台地区病毒性脑炎患者脑脊液46份及粪便标本10份,通过细胞培养分离病毒,RT-PCR扩增肠道病毒VP1区并测序,进行基因序列分析。结果从46例病毒性脑炎患者脑脊液标本中分离到11株病毒,分离率为23.91%,10份粪便标本中分离病毒5株。16株病毒经鉴定7株为肠道病毒,其中EV71型4株。EV71与其他地区流行株VP1区序列差异较小。结论烟台市病毒性脑炎以肠道病毒为主,有EV71型流行,与其他地区流行株相比,EV71型VP1区基因变异较小。     

实时荧光定量RT-PCR在脊髓灰质炎病毒型内鉴定中的应用

目的应用实时荧光定量RT-PCR(rRT-PCR)对脊髓灰质炎病毒(PV)进行型内鉴定(ITD)及基因型鉴定。方法以PV衣壳蛋白(Capsid Protein)VP1编码区基因序列为目标,设计并合成引物和Taqman探针,建立实时荧光定量RT-PCR检测体系,对WHO发放的PV株和实验室分离的PV株进行型内鉴定(ITD)和疫苗衍生PV株(VDPV)筛选。结果 10份WHO考核标本经ITD试验结果和ITD筛查后的5份苗类似株(SL)VDPV实验结果,经WHO验证完全符合;青海省脊髓灰质炎(下称脊灰)实验室2017年在健康儿童中分离获得2株PV,经ITD和VDPV,结果为SL1。毒株经国家脊灰实验室验证,与上报结果完全符合。结论 rRT-PCR方法操作简便、快速,特异敏感,适用于PV的型内鉴定及其感染的实验室诊断。     

手足口病流行期健康儿童及其监护人肠道病毒带毒状况调查

目的了解5岁以下儿童及监护人肠道病毒携带情况,分析健康人群带毒情况及其在手足口病传播过程中的作用。方法 2010年分别于手足口病流行前期、流行高峰期和流行后期,在济宁市泗水县和嘉祥县随机采集城镇托幼机构儿童和农村散居儿童及其监护人的粪便标本,荧光定量PCR检测肠道病毒核酸。结果健康人群肠道病毒带毒率在手足口病流行期最高(20.10%),其次是流行前期和流行后期(14.56%和8.29%)。5岁以下儿童带毒率高于成人,其中3岁以下儿童带毒率最高。三次调查共检出肠道病毒核酸阳性标本177份,99.44%(176/177)鉴定为其他肠道病毒,未检测出EV71型肠道病毒,仅检测出1例CoxA16型肠道病毒。结论 5岁以下健康儿童及监护人肠道病毒带毒较为普遍,夏季带毒率较高;EV71型和CoxA16型肠道病毒核酸检测阳性率较低,提示健康人群肠道病毒带毒在手足口病传播中的作用不大。     

上海地区2009年上半年手足口病患儿肠道病毒71病毒壳体蛋白VP1基因的检测与亚型分析

目的 了解2009年4月至5月肠道病毒(EV)71在上海地区儿童手足口病(HFMD)中的分子流行病学特点.方法 收集2009年4月至5月在复旦大学附属儿科医院临床诊断为HFMD的95例住院患儿咽拭子标本73份与粪便标本38份,采用TaqMan实时RT-PCR及套式RT-PCR进行EV71病毒壳体蛋白VP1基因检测,并进行基因测序分析.结果 73份咽拭子标本中,EV71阳性6份,检出率为8.2%;38份粪便标本中,EV71阳性24份,检出率为63.2%.28份套式RT-PCR阳性标本基因测序分析结果显示,27株为C4亚型,为绝对优势流行株,另有一株为C2亚型株;1例死亡患儿分离株为C4亚型,其VP1基因序列未见明显变异.结论 EV71是上海地区2009年4月至5月儿童HFMD的重要病原体,C4亚型株占绝对优势地位,同时伴有C2亚型株的流行.     

潮汕地区中枢神经系统疾病肠道病毒感染调查

目的对潮汕地区1972年-2003年间临床诊断为中枢神经系统(CNS)疾病的1 605例患者进行肠道病毒(EV)感染调查.方法采集临床诊断为CNS疾病的患者脑脊髓液、血液、咽拭子或粪便标本共l 605份.用Hep-2细胞对标本进行病毒培养;用免疫血清微量中和试验对分离出的毒株进行鉴定;采集患者的双份血清进行中和抗体检测.结果从l 605例CNS疾病患者(包括疑似脊髓灰质炎、脑炎、格林-巴利综合征、脊髓压迫症、脑血管意外、颅内积水或占位和多发性硬化)的各种标本中共检测出4种25个型EV病原541例,EV病毒总检出率为33.7%,患者EV感染型别分布及检出率构成比分别为:脊髓灰质炎病毒(Polio)260例(0.480 6);柯萨奇病毒(Cox)169例(0.3124);埃可病毒(ECHO)57例(0.105 4);新型EV 55例(0.101 6).结论潮汕地区CNS疾病中存在EV感染.不同年份EV的检出率不尽相同,1972年-1979年、1980年-1989年、1990年-1994年这三个时间段里EV检出率以Polio最高;1995年-2003年EV检出率则以Cox最高.随着脊髓灰质炎疫苗的普及接种,1995年后未再发现Po-lio.     

2013-2014年福州市环境污水应用于肠道病毒监测结果分析

目的 了解环境污水监测对肠道病毒(Enterovirus,EV)相关疾病防控的意义和作用.方法 选择福州祥板和洋里两个污水处理厂作为监测点,每月采集进口污水各1份,应用阴离子膜进行污水浓缩,接种RD、L20B和HEp-2进行病毒分离,微量血清中和试验及RT-PCR确定其血清型,VP1测序遗传特征分析.结果 2013-2014年采集的48份污水标本中44份(91.67％)病毒分离阳性,分离到268株病毒,已鉴定涵盖22个血清型;病毒分离高峰期为2-7月,较监测病例高峰早约2个月.2013年埃坷病毒(Echovirus,Echo)7型为优势血清型(43.61％),2014年转变为Ech06占绝对优势(62.96％);遗传特征分析显示:Ech06和Ech07污水分离株较同时期病例分离株更为多样;病例株与污水株具高度同源性,在遗传进化树图位于同一个分支.结论 环境污水应用于肠道病毒监测,较现有的病例监测更为敏感.     

新疆兵团第五师手足口病流行病学及病原学特征分析

目的 分析新疆生产建设兵团(简称兵团)第五师手足口病实验室检测结果,了解手足口病流行病学及病原学特征.方法 2011-2019年采集兵团第五师疑似手足口病患者粪便标本133份,应用荧光RT-PCR方法检测肠道病毒(HEV)、肠道病毒71型(EV 71)、柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)、柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)和柯萨奇病毒A组10型(CoxA10)的特异性核酸,选取部分阳性标本扩增VP1序列、测序并分析序列.结果 133份标本,检出阳性123份,临床标本实验室检测总阳性率92.48％;患者男性多于女性,1～5岁病例最多(109例、占81.95％);4月开始发病并呈上升态势至6月后逐渐下降,5-8月为发病高峰期;核酸检测肠道病毒病原分型以CoxA16 (46.34％)、EV71(23.58％)和Cox A6(17.89％)为主,其他未分型占12.19％;病毒VP1基因序列分析,病例标本中CoxA16均属B1b亚型、Cox A6均属D2亚型,与国内近年某些地区流行株有较近亲缘关系.结论 兵团第五师手足口病主要以EV 71,CoxA16和Cox A6感染为主,存在感染人群年龄组和季节性差异;应根据当地手足口病流行病学及病原学特征制定政策,强化当地手足口病防控措施.     

2010年新疆塔城地区手足口病病原学检测分析

目的了解新疆塔城地区手足口病病原体分布,为采取有效控制措施提供科学依据。方法通过各县(市)疾病预防控制中心和医院采集的咽拭子、粪便、疱疹液等标本,用实时荧光PCR核酸检测技术进行EV71型和CA16型肠道病毒的检测。结果共采集128份手足口病临床诊断病例标本和疑似标本,检测出肠道病毒92份,阳性率71.87%,其中EV71型病毒54份(含1例死亡病例),阳性率42.18%,CA16型病毒37份,阳性率28.90%,其他肠道病毒1例;发病年龄集中在0～5岁,散居儿童发病数多于托幼儿童,男性高于女性。结论塔城地区手足口病发病率男性高于女性,小于等于5岁组儿童明显高于其他年龄组,散居儿童发病数多于幼托儿童,病例以轻型为主,但也有少数患者出现并发症,并发展为重症病例,甚至死亡,病原以肠道病毒EV71型为主。     

2010-2015年广西崇左市手足口病患者病原学检测结果分析

目的分析广西崇左市手足口病病原学检测结果,为该地区今后防制提供科学依据。方法收集整理该市2010-2015年各县(市、区)送检的2 401例疑似手足口病患者的粪便、肛拭子、咽拭子、疱疹拭子标本,应用RT-PCR检测样本中肠道病毒(PE)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)的数据。结果该市6年间共检测疑似手足口病患者标本共2 401份,核酸检测阳性1 586份,阳性率66.06%(1 586/2 401)。在1 586份患者中EV71病毒占25.03%(397/1 586);CoxA16病毒占24.78%(393/1 586);其他肠道病毒占50.19%(796/1 586)。结论该市手足口病患者EV71和CoxA16病毒隔年交替出现高峰,上半年以EV71和CoxA16患者为主,而下半年以其他肠道病毒感染患者为主。     

实时荧光RT-PCR与普通RT-PCR检测手足口病病原体的比较分析

目的对比分析实时荧光RT-PCR和普通RT-PCR方法在检测手足口病病原体的差别。方法选择临床诊断为手足口病患者粪便256份,提取RNA,用实时荧光RT-PCR和普通RT-PCR检测手足口病肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CoxA 16)和总肠道病毒(PE),对实验结果进行统计学分析。结果实时荧光RT-PCR和普通RT-PCR检测手足口病患者粪便标本,CoxA 16结果差异有统计学意义(P<0.01),CoxA 16阳性率分别为62.22%和16.67%;EV71、PE结果差异无统计学意义(P>0.05),实时荧光RT-PCR方法EV71和PE阳性率为42.22%和65.00%,普通RT-PCR方法为37.78%和55.00%。普通RT-PCR检测的36份EV71、CoxA 16和PE全阴性标本,荧光RT-PCR方法检出PE阳性9份、EV71阳性4份、CoxA 16阳性14份。结论实时荧光RT-PCR方法比普通RT-PCR方法更灵敏、快捷,适用于临床手足口病病原体的检测。     

武威市凉州区禽类职业暴露人群及外环境禽流感病毒监测分析

目的了解甘肃省武威市凉州区职业暴露人群禽流感病毒的感染现状及在外环境中的分布,为制定预防控制策略提供科学依据。方法以Real-time PT-PCR方法检测外环境标本的核酸,采用马红细胞血凝抑制实验检测职业暴露人群标本中的H5N1,H7N9和H9N2血清抗体。结果 2017年武威市凉州区采集外环境标本300份,检出禽流感病毒阳性76份、阳性率25.33%,均为A型H9亚型;禽流感病毒阳性率从高到低分别为清洗禽类的污水标本(38.89%)、宰杀或摆放禽肉案板表面擦拭标本(36.67%)、笼具表面擦拭标本(24.32%)、粪便标本(17.78%)和禽类饮水标本(0.00);不同场所(χ~2=19.807)、不同类型(χ~2=18.164)和不同时间(χ~2=33.376)标本禽流感病毒阳性率差异有统计学意义(均P<0.05);200份职业暴露人群血清标本H5,H7和H9血凝素抗体检测结果均为阴性。结论武威市凉州区涉禽外环境标本中H9亚型禽流感病毒阳性率较高,存在人感染的风险,职业暴露人群尚不存在禽流感病毒隐性感染;今后应重点加强对禽类市场的监管和宣传教育。     

2018—2020年焦作市手足口病病原检测结果分析

目的分析2018—2020年河南省焦作市手足口病实验室病原检测结果,了解病原特征,为手足口病防治提供依据。方法采用实时荧光PCR法检测手足口病临床诊断病例标本的肠道病毒通用型(EV),柯萨奇病毒A16型(CoxA16)和肠道病毒71型(EV71)的核酸,同时采集114例临床病例的咽拭子和粪便标本开展检测,结果采用配对卡方检验进行统计学分析。结果2018—2020年焦作市共检测手足口病临床诊断病例1312例,检出肠道病毒通用型核酸阳性1033例、阳性率为78.73%,3年间阳性率呈逐年下降趋势(χ^(2)=94.884,P<0.05);不同年度手足口病流行型别不同,2018年和2020年均以其他EV型为主,分别占84.96%和99.12%,2019年以CoxA16型为主(220例、占63.58%);114例临床病例的咽拭子、粪便标本中仅检出其他EV核酸阳性,阳性率分别为85.09%和92.98%,粪便标本阳性率高于咽拭子(χ^(2)=4.920,P<0.05)。结论2018—2020年焦作市手足口病阳性率呈下降趋势,不同年度主要致病病原不同,其他肠道病毒占比增加;应加强病原分型的实验室检测和监测,对指导疫情防控具有重要意义。     

2010年广州地区手足口病病例病原学检测结果分析

目的了解2010年广州地区手足口病病例标本中CoxA16和EV71的感染情况。方法采集临床诊断为手足口病患者的粪便,用Real-time PCR同时检测总肠道病毒、CoxA16和EV71。结果共检测手足口病病例标本1 271例,总肠道病毒阳性率为61.32%;其中,CoxA16阳性率占29.82%,EV71阳性率占70.18%。阳性标本主要分布于0~4岁患者阶段,总肠道病毒、CoxA16和EV71阳性数分别为694、209和485。结论 CoxA16和EV71为广州地区2010年手足口病的主要病原病毒,EV71占多数,0~4岁儿童是感染的主要人群。     

591例手足口病患儿临床实验室分析及分类管理治疗

手足口病是由肠道病毒引起的传染病,常在4至7月份发生,多发生在婴幼儿.病原体以肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A(CoxA)16型最为常见 ~[1].1969年从美国加利福尼亚州患有中枢神经系统疾病的婴儿粪便标本中首次分离出EV71且1974年首次报道以来 ~[2],EV71在全球范围内引起十多次暴发与流行 ~[3-6].我国1981年在上海最先发现本病,此后各省市均有报道 ~[7].     

2011年天津市手足口病病原检测与基因特征分析

目的对天津市2011年手足口病(HFMD)进行病原学检测,并对引起HFMD的肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)进行基因特征分析,为天津市HFMD的防控提供基础资料。方法采用Real time RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,用人横纹肌瘤(RD)细胞对部分阳性标本进行病毒分离;随机挑取16株EV71病毒分离株和9株CVA16病毒分离株,进行VP1区基因扩增,并进行核苷酸序列和遗传进化关系分析。结果共检测HFMD疑似病例1 853例,总阳性率为70.91%(1314/1853),其中EV71占49.10%,CVA16占21.61%,EV71和CVA16双阳性占0.91%,其他肠道病毒(EV)占28.46%。16株EV71分离株与C4a亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性(97.3%～99.1%),属于C4a基因亚型;9株CVA16分离株与B1b亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性(94.9%～95.4%),属于B1b基因亚型。结论 2011年引起天津市HFMD的EV71型病毒流行株为C4a基因亚型,CVA16型病毒流行株为B1b亚型,并兼有一定比例的其他肠道病毒。     

手足口病患儿密切接触家属分泌物肠道病毒检测分析

目的 了解手足口病（HFMD）患儿密切接触家属呼吸道、消化道分泌物肠道病毒检出情况.方法 随机选取HFMD患儿密切接触家属50例,分别于患儿入院（急性期）及出院时（恢复期）采集咽拭子、粪便标本共200份,应用荧光定量RT-PCR方法进行肠道病毒（EV）核酸检测,包括EV、EV71、柯萨奇A组16型（CoxA16）.结果 EV阳性患儿密切接触家属总EV阳性率78％,其中97.3％为隐性感染者.HFMD患儿密切接触家属EV阳性检出率粪便明显高于咽拭子（P≤0.05）,且在患儿疾病恢复期阳性率高于急性期（P≤0.05）,尤其是粪便标本（P≤0.05）.结论 手足口患儿病密切接触家属EV隐性感染率高,应加入防控重点范围.     

黄梅县手足口病临床分离株的基因型分析

目的:了解手足口病暴发高峰时段临床患者的咽拭子标本中分离出的人肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)的基因型,为手足口病的防治提供依据。方法:将手足口病高峰时期收集的咽拭子标本109份进行病毒分离鉴定,对分离到的4株EV71型病毒株的227bp VP3-VP1基因序列和3株CA16株的736bp VP1-2A基因序列进行基因测序,并进行系统进化分析。结果:检测到的4株EV71分离毒株均属C4a亚群,3株CA16分离毒株均属于B1b亚群。结论:2013年黄梅县手足口病暴发高峰时段的EV71流行株为C4a亚群,CA16流行株为B1b亚群。     

用RT-PCR和ELISA对暴发性急性胃肠炎事件中诺沃克样病毒检测的比较

目的　诺沃克样病毒是世界范围内急性非细菌性流行性胃肠炎的重要病原。采用RT-PCR和ELISA两种方法对广州市多起暴发性急性胃肠炎事件中病人标本进行诺沃克样病毒检测 ,了解广州市诺沃克样病毒流行情况 ,并对RT-PCR和ELISA两种检测方法进行比较。方法　用RT-PCR和ELISA对 76份腹泻病人粪便 ,2 3份肛拭子 ,12份食物进行诺沃克样病毒检测。结果　粪便通过RT-PCR检出阳性 37份 ,ELISA检出阳性 17份 ,肛拭子仅通过RT-PCR检出 1份阳性 ,食物无阳性检出。结论　这是首次我国实验室证实的由诺沃克样病毒引起的急性胃肠炎暴发。RT-PCR的阳性率大于ELISA ,且检品以粪便为好。并且我们的分离株与诺沃克原型株相应序列比较的同源性大于 90 %