2010年六安市肠道病毒71型的分子流行病学特征

目的:探讨六安市手足口病患者中EV71的流行趋势及其基因特征,为手足口病的进一步防控提供科学依据。方法:六安市疾控中心从手足口病患儿中采集咽拭子标本进行肠道病毒核酸检测,选取其中8份EV71核酸阳性标本进一步进行VP1全基因序列测定,结果使用Bioedit和DNA Star软件与世界各地EV71各型参考株及我国大陆的EV71流行株序列进行对比分析,构建种系进化树。结果:8株病毒核酸VP1基因全长均为891个核苷酸,编码297个氨基酸,与我国大陆分离的C4a基因型最为相近,核苷酸同源性在96.7%～99.4%之间,氨基酸同源性在97.0%～100%之间;而与A、B基因型参考株差异较大,核苷酸同源性分别为82.6%～83.2%、83.1%～85.0%;氨基酸同源性分别为96.6%～97.0%、96.0%～97.7%;说明本文的8株病毒均属于EV71 C4a基因型。结论:六安市2010年EV71流行株在种系进化上与我国大陆近几年分离的毒株具有较高的同源性,同属于C4a基因型,目前C4a亚型病毒在我国大陆可能有较广泛的分布和传播。本研究对于肠道病毒的基础研究和防范EV71在中国的大规模暴发与流行具有重要意义.     

北京市2008年肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析

目的了解北京市2008年手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD）流行期间,人肠道病毒71型（Human Enterovirus71,HEV71）分离株的VP1编码区基因特征。方法采集发病1～3d的咽拭子标本33份,采用人横纹肌肉瘤（Human Rhabdomyosarcoma,RD）细胞进行EV分离,用特异引物通过逆转录-聚合酶链反应扩增进行毒株鉴定。对分离到的HEV71进行VP1编码区全长扩增,并对扩增产物采用双脱氧链终止法进行序列测定,Bioedit7.0.5和Mega3.1软件进行序列比对和系统进化树分析。结果从33份咽拭子标本中共分离到16株病毒,经鉴定：HEV7114株,柯萨奇病毒（Coxsackie Virus,CV）A组16型（CVA16）2株,其中1例为HEV71和CVA16混合感染。对10株HEV71进行了VP1编码区全序列测定,10株病毒的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.5%～100%和98.9%～100%;与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.4%～99.1%;与C4基因型代表株的核苷酸序列同源性〉92%。基于HEV71的VP1编码区核苷酸序列构建亲缘性关系树,北京市2008年流行株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型中的C4a分支;且10株病毒处于四个相对独立的进化分支。结论北京市2008年从HFMD患儿分离的HEV71均为C4亚型,且属于2004年以来我国的优势分支——C4a。亲缘性分析提示,此次流行中至少存在4个HEV71传播链。由于近年来HEV71在中国持续大规模流行,迫切需要对HEV71进行连续的分子流行病学监测,及时阐明现阶段流行毒株的基因特征,为疾病预防控制提供病毒学依据。     

2010一2011年湖南省郴州市手足口病EV71型VP1区基因序列分析

目的了解2010-2011年湖南省郴州市手足口病EV71病毒的基因特征,为手足口病的预防控制提供科学依据。方法从2010-2011年郴州市各县（市、区）送检的手足口病肛拭子标本中随机挑选60份标本采用RD细胞进行病毒分离,采用Realtime—RT—PCR方法检测肠道病毒核酸,挑选14株致细胞病变阳性且EV71核酸检测阳性的标本（其中2010年的4株均为郴州市手足口流行夏季高峰期分离株,2011年的毒株主要为冬季高峰期分离株）,采用RT—PCR法扩增出EV71分离株的VP1区片段,随后进行VP1区核苷酸序列测定和分析,并使用生物信息学方法作基因特性分析。结果郴州市14株EV71毒株在生物进化树上与CAa亚型的代表株属同一分支。14株EV71毒株之间核苷酸序列的同源性在96．1％～100．0％之间,氨基酸序列的同源性在99．3％～100．0％之间;与A、B、C各基因型和亚型代表株EV71VP1编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分析表明,郴州各分离株与安徽阜阳2008年毒株C4a亚型代表株（EU703812）的同源性最高,其中核苷酸同源性在91．8％-93．3％之间,氨基酸同源性均为99．3％。14株分离株与安徽阜阳2008年毒株（C4a亚型代表株）VP1区段的氨基酸编码序列进行比较,发现K98E、S283T和A293S3处位点变异,重症病例与普通病例的EV71病毒VPI氨基酸变异无明显差异。结论2010-2011年郴州市手足口病的优势毒株EV71属于C4a基因亚型。郴州市各县（市、区）的EV71亲缘关系近,毒株基因较稳定,未发现氨基酸突变位点与病例类型有关联。     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

宁夏地区2008年肠道病毒71型分离株基因特征分析

目的 研究宁夏地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株的基因特征.方法 采集手足口病患者标本进行病毒分离培养,阳性标本进行RT-PCR鉴定后,选取29株EV71分离毒株,对其VP1区进行核苷酸序列测定,并参考A、B、C各基因型的参考毒株和以往中国EV71的分离毒株进行同源性分析并构建系统发生树.结果 从439份标本中分离肠道病毒215株,经RT-PCR鉴定,93株为EV71.选取其中29株进行VP1基因全序列测定,根据VP1全基因序列构建系统发生树,29株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支,与C4亚型代表株核苷酸同源性为91.7%～99.4%,氩基酸同源性为96.6%～100.0%.结论 宁夏地区手足口病患者中分离的EV71毒株属C基因型的C4亚型.     

低场MRI:设备基于大视野的快速扫描探讨

通过对低场MRI 各部位不同参数配置研究,提出较大视野、较薄层厚、小激励次数(NEX=1 或2)的组合方案图像信噪比用空间分辩率适中,且扫描时间明显缩短,移动伪影较少,检查成功率可得到提高.     

流感病毒B/四川/379/99的核苷酸及氨基酸序列分析

目的：从分子水平研究四川省乙型流感病毒的变异规律，了解其变异特性和变异程度。方法：病毒分离及鉴定方法按照国家标准GB15994－1995的方法，抗原分析用常量半加敏红细胞凝集抑制法。核苷酸序列测定采用逆转录双脱氧链终止法，DNA序列测定仪读序。结果：发现流感病毒B／四川／379／99属于B／Yamagata/16/88毒株系列，但与B／北京／184／93相比抗原性发生了明显的变异，核苷酸序列也有27处发生了点突变，导致氨基酸序列12处发生突变，其中有6处位于70－90和110－210这两个与抗原决定族有关的部位。结论：流感病毒B／四川／379／99是一个新变异株。     

Emergence of methicillin-resistant,vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus among patients associated with group A Streptococcal pharyngitis infection in southern India

Beyond Staphylococcus aureus being an etiological agent for several serious clinical complications, the foot prints of S. aureus in pharyngitis infection has also been recently recognized. With due response to the fact, a prospective study was conducted between 2009 and 2010 to describe the molecular epidemiology of S. aureus in throat swabs of pharyngitis patients. A total of 63 methicillin-resistant S. aureus (MRSA) and 102 methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) isolates were recovered from 265 throat swabs, representing a community-acquired outpatient population from Tamil Nadu, India. Molecular characterization of MRSA was done by two conventional multiplex PCR assays including Panton-Valentine leukocidin (PVL), mecA and nuc genes, and staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) typing. Among 165 S. aureus isolates, methicillin resistance was observed in 38.2% (n = 63), in which 69.8% (n = 44/63) of the MRSA along with 55.9% (n = 57/102) of MSSA harbored PVL toxin genes. SCCmec typing showed 50.8% of isolates as SCCmec V (n = 32), 44.4% as SCCmec III (n = 28), and 1.6% as SCCmec types I, II and IVa (n = 1). Multilocus sequence typing performed for 26 selected MRSA isolates resulted in 12 different sequence types (ST), including a novel ST2129/SCCmec III, PVL-positive. Ten MRSA isolates were categorized as ST772 (38.5%)/SCCmec V, PVL-positive, and three isolates as ST368 (11.5%)/SCCmec III, PVL-negative. Though the prominent clones of ST772/SCCmec V were multidrug-susceptible worldwide, they were highly multidrug-resistant in the current study, including four clones intermediate to vancomycin. Totally, 10 (15.9%) out of 63 MRSA isolates were documented as vancomycin-intermediate S. aureus (VISA). Collectively, the present study for the first time portrayed the high prevalence of active MRSA pharyngitis infection and also emphasizes an alarming need for discrimination of pharyngeal-asymptomatic carriers of S. aureus from those with an active S. aureus pharyngitis infection.     

1.5T磁共振3D-SPACE序列与3D-TSERT序列在MRCP成像中的应用对比

目的：通过MR可变翻转角的三维快速自旋回波（3DsamplingperfertionwithapplicationoptimizedcontrastsUS—ingdeifferentflipangleevolutions,3D～SPACE）序列与三维快速恢复快速自旋回波（3D—TSERetore,3D—TSERT）序列对胰胆管水成像（MRcholangiopancreatgrapgy,MRCP）中的成像质量进行对比,优化MRCP的成像序列。方法：对48位受检者分别用3D—SPACE序列与3D—TSERT序列行MRCP检查,将采集到的影像利用siemens3D软件进行MIP（maxi．umintensityprojection）重建,并对2种图像的显示情况进行分析比较。结果：3D—SPACE序列的MRCP显示肝段胆管、胰管的效果明显优于3D-TSERT—MRCP序列（P〈0．05）,2种成像序列显示左右肝管、肝总管、胆囊、胆总管的效果差异无显著性意义（P〉0．05）。结论：在1．5TMRI检查中,应用3D—SPACE序列的MRCP在检查时间及成像质量上都优于3D—TSE序列。应成为常规MRCP的首选序列。     

第二代双源CT的Flash序列在肋骨外伤检查中的应用价值

目的：探讨第二代双源CT的Flash序列在肋骨外伤检查中的应用。方法对28例肋骨外伤患者分别使用常规螺旋序列扫描和二代双源Flash序列扫描,比较两种扫描方法的图像质量及辐射剂量。结果常规螺旋序列扫描图像的优良率明显低于Flash序列扫描图像。Flash序列扫描的管电流、CT容积剂量指数、剂量长度乘积、有效剂量、扫描时间均低于常规螺旋扫描,差异具有统计学意义（P＜0.05）。结论Flash序列扫描具有辐射剂量低、扫描时间短、图像质量高等特点,优于常规螺旋序列扫描,值得推广。     

探讨前置胎盘并胎盘植入的MRI诊断价值

目的:探讨前置胎盘并胎盘植入的MRI诊断价值。方法:选择2017年6月~2019年6月经手术证实前置胎盘患者66例进行回顾性分析,合并前置胎盘并植入患者50例,总结比较不同序列对前置胎盘并植入的评价。结果:HASTE序列子宫肌层、联合带、胎盘内低信号、植入灶情况显示率高于true FISP序列(P<0.05),血管情况显示率差异无统计学意义(P>0.05);前置胎盘伴植入盘内信号不均、胎盘内增粗血管影、T₂W1胎盘内条带状低信号影、胎盘与子宫分界不清影像特征高于前置胎盘不伴植入的患者(P<0.05),前置胎盘伴植入子宫轮廓局部外凸、膀胱突起影像特征低于前置胎盘不伴植入的患者(P<0.05)。结论:MRI能提高前置胎盘并胎盘植入诊断效能,对临床上制定合理的治疗方案具有重大意义。     

湖北钉螺微卫星锚定PCR产物序列分析

目的 分析4个种群湖北钉螺中微卫星序列及其两侧序列的特点.方法 以(CA)8RY为引物对湖北钉螺基因组DNA进行微卫星锚定PCR(SSR-PCR)扩增,对全部159个扩增产物进行T克隆并测定其中82个片段的核苷酸序列.结果 SSR-PCR的扩增产物是湖北钉螺基因组DNA上的散在区域,不是微卫星序列,但扩增产物中含有微卫星序列,测序的82个片段中36个克隆片段含有微卫星序列.微卫星序列其侧翼序列有一定的保守性,同一个微卫星的侧翼序列多数情况下是相同的.(GA/CT)n、(TTAGGG/CCCTAA)n两类微卫星在4个钉螺种群中均有发现,(CAA)n仅在福建福清种群中发现,(TCTCTG)n仅在安徽贵池种群中发现,(GAA～TTC)n、(CAA/TTG)n、(CAT)n三种微卫星序列仅在四川普格种群中发现.结论 SSR-PCR扩增的不是微卫星,其结果的分析应当类似于随机扩增多态性DNA.因此SSR-PCR不能十分有效体现微卫星作为分子标记的优势,应当根据微卫星的侧翼序列设计针对微卫星的引物,对微卫星进行PCR扩增并进行分析.     

广州市201 1年柯萨奇病毒A组6型的分子流行病学特征

手足口病主要由柯萨奇病毒A组16型(CvAl6)与人肠道病毒71型(EV71)感染引起,也有少量由CVA6感染引起。本研究对2011年广州市手足口病标本检出的CVA6病毒开展分子流行病学研究。     

Multilocus sequence typing approach for a broader range of species of Leishmania genus: Describing parasite diversity in Argentina

Leishmaniasis is a vector-borne protozoan infection affecting over 350 million people around the world. In Argentina cutaneous leishmaniasis is endemic in nine provinces and visceral leishmaniasis is spreading from autochthonous transmission foci in seven provinces. However, there is limited information about the diversity of the parasite in this country. Implementation of molecular strategies for parasite typing, particularly multilocus sequence typing (MLST), represents an improved approach for genetic variability and population dynamics analyses. We selected six loci as candidates implemented in reference strains and Argentinean isolates. Phylogenetic analysis showed high correlation with taxonomic classification of the parasite. Autochthonous Leishmania (Viannia) braziliensis showed higher genetic diversity than L. (Leishmania) infantum but low support was obtained for intra-L. braziliensis complex variants suggesting the need of new loci that contribute to phylogenetic resolution for an improved MLST or nested-MLST scheme. This study represents the first characterization of genetic variability of Leishmania spp. in Argentina.     

中国狂犬病毒疫苗株（3aG株）N,NS,和M蛋白基因的核苷酸序列测定

本文报告了中国狂犬病毒疫苗株（３ａＧ株）核衣壳蛋白（Ｎ蛋白），核蛋白壳磷酸蛋白（ＮＳ蛋白，又称Ｍ＿１蛋白）和基质蛋白（Ｍ蛋白，又称Ｍ２蛋白）的蛋白基因的核苷酸序列和氨基酸推导序列，各基因编码区的全长分别是Ｎ基因１３５２，ＮＳ基因８９４和Ｍ基因６０９个核苷酸，３ａＧ和ＣＶＳ株的Ｎ，ＮＳ和Ｍ基因的核苷酸序列都具有高的同源性，它们分别为９１．９５％，９０．２７和９０．８０％。