Strengthening the reporting of Genetic RIsk Prediction Studies (GRIPS): explanation and elaboration

The rapid and continuing progress in gene discovery for complex diseases is fuelling interest in the potential application of genetic risk models for clinical and public health practice. The number of studies assessing the predictive ability is steadily increasing, but they vary widely in completeness of reporting and apparent quality. Transparent reporting of the strengths and weaknesses of these studies is important to facilitate the accumulation of evidence on genetic risk prediction. A multidisciplinary workshop sponsored by the Human Genome Epidemiology Network developed a checklist of 25 items recommended for strengthening the reporting of Genetic RIsk Prediction Studies (GRIPS), building on the principles established by prior reporting guidelines. These recommendations aim to enhance the transparency, quality and completeness of study reporting, and thereby to improve the synthesis and application of information from multiple studies that might differ in design, conduct or analysis.     

如何撰写高质量的流行病学研究论文第二讲分子流行病学研究报告规范--STROBE-ME介绍

背景/原理(ME-2)在“前言”中应明确该文献纳入的-种或多种特定生物标志物的选择过程。明确阐述选择特定生物标志的背景资料和理由, 以及该生物标志如何被引入研究设计(生物标志物的暴露、内部剂量、早期生物学变化和易感性), 例如某些多态性位点的选择是基于候选基因策略还是通路策略。此外，应澄清该生物标志是否被(某种物质/结构)替代, 如果是, 还应提示如何替代。     

如何撰写高质量的流行病学研究论文第六讲观察性营养流行病学研究报告规范(STROBE-nut)

如何提高观察性营养流行病学研究的报告质量是当前的一个关注热点。“加强观察性流行病学研究报告质量——营养流行病学研究（Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology-Nutritional Epidemiology,STROBE-nut）”以STROBE声明为基础进行了扩展,补充说明了营养流行病学和膳食评价领域的相关问题,从而为如何加强该领域中观察性研究的报告质量提供了指导。本文旨在介绍STROBE-nut并对新增条目中的一些要点进行解读,同时结合实例说明STROBE-nut条目清单在实际中的应用。     

某综合医院2003—2011年道路交通事故住院患者的死因分析

目的揭示某综合医院道路交通事故住院患者的直接死因及其主要交通事故特征,为预防道路交通事故的发生和医院创伤救治提供基础资料和参考依据。方法对汕头市某综合医院2003—2011年道路交通事故住院患者的住院病案信息进行核实、统计分析。结果共收集7039名病例,男女之比为2．35：1,总死亡人数为145人,其中男性104人,女性41人,致死率为2．06％,秋季致死率高,随着年龄增加,死亡率增高,男性致死率高于女性致死率,其死亡率之比为1．08：1。病人死亡的前3位直接死因为：重型颅脑损伤,脑肿胀,脑挫伤和创伤性硬膜下血肿;前3位交通事故类型为：未特指的机动车交通事故,骑摩托车与小汽车（轻型货车）相撞,行人与摩托车相撞;死者主要为摩托车骑乘者（64例,44．14％）。结论道路交通事故住院患者直接死因为颅脑损伤,主要事故类型为摩托车交通事故。应加强对摩托车事故预防,佩戴好头盔,医院要加强对颅脑损伤的有效救治与管理。     

Body mass index and risk of head and neck cancer by race: the Carolina Head and Neck Cancer Epidemiology Study

PurposeMost studies, primarily conducted in populations of European ancestry, reported increased risk of head and neck cancer (HNC) associated with leanness (body mass index [BMI] <18.5 kg/m²) and decreased for overweight or obesity (25.0 to <30.0 and >30 kg/m², respectively), compared with normal weight (18.5 to <25.0 kg/m²).MethodsThe Carolina Head and Neck Cancer Epidemiology Study is a population-based, racially diverse case-control study of 1289 incident HNC cases (330 African Americans) and 1361 controls (261 African Americans). Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were estimated for associations between BMI 1 year prediagnosis and HNC risk stratified by race and adjusted for age, sex, smoking, alcohol, and education.ResultsMultiplicative interaction between BMI and race was evident (P_int = .00007). Compared with normal weight, ORs for leanness were increased for African Americans (OR, 3.91; 95% CI, 0.72–21.17) and whites (OR, 1.48; 95% CI, 0.60–3.65). For overweight and obesity, ORs were decreased in African Americans (OR, 0.51; 95% CI, 0.32–0.83 and OR, 0.47; 95% CI, 0.28–0.79, respectively) but in not whites. The increased risk associated with leanness was greater for smokers than nonsmokers (P_int = .02).ConclusionsThese data, which require replication, suggest that leanness is associated with increased HNC risk among African Americans to a greater extent than whites and overweight and obesity is associated with decreased HNC risk only among African Americans.     

Case-control studies and Bayesian inference

We outline the methods of Bayesian inference for applications to case-control studies. These methods appear as the natural way of making inferences, since much of the controversy that surrounds a specific case-control study is subjective. We derive conjugate prior distributions of exposure, posterior distributions of the ratio of the odds of being incident with a disease both with and without exposure to a potential causal agent, and convenient approximations. In particular, we show how one may carry out 'case-control studies' without necessarily having a control group. We illustrate these ideas with the data that first showed the relationship between in utero exposure to diethylstilbestrol and cancer of the vagina in young girls.     

STrengthening the Reporting of OBservational studies in Epidemiology - Molecular Epidemiology (STROBE-ME): an extension of the STROBE statement

Advances in laboratory techniques have led to a rapidly increasing use of biomarkers in epidemiological studies. Biomarkers of internal dose, early biological change, susceptibility and clinical outcomes are used as proxies for investigating the interactions between external and/or endogenous agents and the body components or processes.The need for improved reporting of scientific research led to influential statements of recommendations such as the STrenghtening Reporting of Observational studies in Epidemiology (STROBE) statement. The STROBE initiative established in 2004 aimed to provide guidance on how to report observational research. Its guidelines provide a user-friendly checklist of 22 items to be reported in epidemiological studies, with items specific to the three main study designs: cohort studies, case–control studies and cross-sectional studies.The present STrengthening the Reporting of OBservational studies in Epidemiology — Molecular Epidemiology (STROBE-ME) initiative builds on the STROBE Statement implementing 9 existing items of STROBE and providing 17 additional items to the 22 items of STROBE checklist.The additions relate to the use of biomarkers in epidemiological studies, concerning collection, handling and storage of biological samples; laboratory methods, validity and reliability of biomarkers; specificities of study design; and ethical considerations. The STROBE-ME recommendations are intended to complement the STROBE recommendations.     

遗传与智力发育

智力是一种复杂性状,许多遗传因素与环境都可以对智力发育产生影响.基因对智力影响的数量效应以及作用特点仍未完全确定.近几十年来,遗传学研究提示许多基因及其变异与智力水平之间的关系可以是正向作用,也可以是负向作用.这些复杂的模式都需要进一步研究.     

贵州省贞丰县疫苗衍生脊髓灰质炎病毒传播的流行病学调查

目的 分析2004年8月贵州省黔西南州贞丰县挽澜乡窑上村发生的疫苗衍生脊髓灰质炎病毒（VDPV）的传播及其影响因素。方法 对报告的2例急性弛缓性麻痹（AFP）患儿和同村21名5岁以下儿童的粪便标本进行病毒分离;对窑上村59名儿童的常规疫苗接种、贞丰县AFP发病及监测系统指标完成情况进行调查。结果 2例明确诊断为Ⅰ型VDPV病例;3名同村儿童的粪便中也分离到Ⅰ型VDPV。贞丰县自2002年来共漏报7例AFP病例。挽澜乡常规免疫接种处于较低水平;窑上村属免疫空白点。结论 我国是用脊髓灰质炎减毒活疫苗（OPV）预防脊髓灰质炎的国家,此次在贞丰县发生VDPV的传播,对消灭脊髓灰质炎提出了新的挑战;防范VDPV的发生,要加强常规免疫,并保持高水平的AFP监测。     

加强药物基因组学研究报告规范（STROPS）及解读

药物基因组学研究旨在探究遗传变异与药物的疗效和不良反应之间的关联,对样本量有很高的要求。为有效进行Meta分析以探究药物遗传关联,亟需提高药物基因组学研究报告质量。2020年制定的加强药物基因组学研究报告规范（Strengthening the Reporting of Pharmacogenetic Studies,...     

家鼠型鼠疫监控中的病死鼠报告

目的深入认识病死鼠报告在家鼠型鼠疫监控中的作用及其与关联监测法在监控中的相互配合。方法（1）分析比较病死鼠报告、疫情三报在及时发现家鼠型鼠疫鼠间疫情中的作用;（2）分析病死鼠报告与关联监测法的关系及后者的功用。结果（1）病死鼠报告与及时发现家鼠型鼠疫鼠间疫情有关,而疫情三报中除病死鼠报告外的其他两报与及时发现家鼠型鼠疫鼠间疫情无关;（2）病死鼠报告与关联监测法共同构成家鼠型鼠疫监控的两项核心技术（2HD技术）;在2HD技术中,病死鼠报告主要担负着及时发现家鼠型鼠疫鼠间疫情的任务,而关联监测法有减少和发现鼠间疫情的双重功用,但以前者为主。结论在家鼠型鼠疫监控中,为了及时发现并成功控制鼠间疫情,应重点推广2HD技术;同时要正确理解和对待疫情三报。     

临武县第五次结核病流行病学抽样调查分析

目的了解临武县肺结核疫情动态,为制定防治措施提供科学依据。方法根据《全国第五次结核病流行病学抽样调查实施细则》,于2010年6月在临武县梓木山村流调点开展结核病流行病学调查。结果共抽取研究对象2 362人,应检人口1 543人,实检人口1 473人,受检率达95.46%;摄胸片1 456人,痰涂片检查67人,同时均进行痰培养;结核病防治知识知晓率调查表明青壮年组、中老年组5题回答全对的正确率分别为76.88%和69.00%,差异有统计学意义(χ2=10.70,P<0.05),男、女5题回答全对的正确率分别为72.33%和76.09%,差异无统计学意义(χ2=2.72,P>0.05);共发现活动性肺结核9例,其中已知在治疗者1例(涂阴),新发8例,新发病人中2例菌阳(涂阳1例、痰涂片阴性但痰培养阳性1例),6例涂阴;活动性肺结核患病率为611.00/10万,菌阳患病率为135.78/10万,涂阳患病率为67.89/10万。结论临武县肺结核疫情十分严重,应加强健康教育,落实结核病归口管理规定,严格实施直接督导下短程化疗(directly observed treatment short-course,DOTS)策...     

高血压前期的流行病学研究进展

本文介绍高血压前期的定义,就国内外高血压前期的流行病学研究进展和争论焦点做了简要综述,并对高血压前期的研究前景进行了展望。     

2013-2017年广州市住院儿童呼吸道合胞病毒流行特征及分子生物学分析

目的分析广州人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征及遗传变异特征。方法2013—2017年在广州两家哨点医院(广东省妇幼保健院和中山大学孙逸仙纪念医院)采集0~6岁急性呼吸道感染住院儿童的鼻咽拭子作为标本。采用逆转录PCR和巢式PCR方法进行HRSV的检测和分型,通过MEGA 6.0、NetNGlyc 1.0等软件对HRSV序列进行基因亲缘性分析以及N?糖基化位点的预测。结果共收集鼻咽试子标本1225份,其中男性783份,女性442份;月龄M(P25,P75)为8(3,24)月。共检出HRSV儿童感染者209例(17.06%),其中HRSV?A为117例(55.98%),HRSV?B为92例(44.02%)。2岁以下儿童HRSV检出率为18.83%(196例),占总阳性标本的93.78%。209例检出HRSV儿童中,32例(15.31%)还感染了至少1种其他呼吸道病毒。进化树分析显示,62株HRSV?A属于ON1基因型,2株属于NA1基因型,53株HRSV?B全部属于BA基因型。G蛋白的第二高变区在氨基酸替换,终止密码子的使用以及糖基化位点方面均具有多态性。结论广州2岁以下儿童是感染HRSV的高发人群,ON1为HRSV?A主导基因型,BA为HRSV?B的主导基因型。多样化的氨基酸替换,某些糖基化位点的缺失与插入,体现了G蛋白作为主要保护性抗原的多样性。     

2005-2012年安徽省结核病流行特征分析

目的 了解安徽省2005-2012年结核病流行病学特征,探索适合国情的结核病预防和控制策略,为进一步控制结核病疫情提供依据.方法 采用描述性流行病学研究方法,对安徽省2005-2012年结核病网络登记报告的结核病患者资料进行分析.结果 2005-2012年安徽省共报告结核病患者341 679例,男女性别比为2.75∶1.患者发病主要集中在15岁以上年龄段,人数占到患者总数的99.47％;患者报告发病率随着年龄的增加而升高,以65～74岁年龄段最高,为245.64/10万.各职业类型中,以农民、工人和学生3类人群报告发病患者数最多,分别占患者总数的76.22％、5.13％和3.60％.报告患者自每年的3月份开始整体呈逐月下降的趋势,次年1月份降至最低.全省16个地市均有患者发病报告,地区分布不均,铜陵市、合肥市、淮北市报告发病率较高.结论 结核病报告发病率总体呈逐年下降趋势,男性、高龄组、农民群体、春季等是结核高发因素,应加强相应人群或领域的预防控制措施.     

常州市2005-2011年度活动性结核报告病例流行特征分析

目的 了解常州市2005 -2011年活动性结核报告病例流行特征,探讨适合常州市结核病特征的预防与控制策略.方法 采用SPSS 13.0软件对常州市2005-2011年网络报告登记的结核病例资料进行描述性分析.结果 2005-2011年常州市共报告活动性结核病例19336例,总体呈下降趋势;痰涂片阳性结核病人占总病例的44.00％,其中新发涂阳病例占89.67％.男性病例占72.57％,男女性别比为2.65∶1.发病年龄主要是25 ～44岁和65～岁年龄组,分别占47.18％和21.88％;农民和民工报告病例共占57.37％;病例散在发生、无明显季节性.结论 活动性结核报告病例总体呈下降趋势;应开展流动人口、男性青壮年人群和老年人群的疾病监测,加强预防与控制结核发生.     

武汉市2002至2010年农药中毒报告4713例分析

目的 了解武汉市农药中毒发生的特点及原因,为制定防治对策提供科学依据.方法 收集武汉市2002至2010年农药中毒登记数据,采用SAS 9.1软件进行统计分析.结果 2002至2010年武汉市共发生农药中毒4713例,其中,生产性农药中毒2737例,占58.1％,死亡2例,病死率为0.07％;非生产性农药中毒1976例,占41.9％,死亡159例,病死率为8.05％.引起生产性农药中毒的主要农药类别是杀虫剂1713例,占70.6％,在杀虫剂中主要是有机磷,且以对硫磷、敌敌畏、甲胺磷为主.生产性农药中毒以男性(1884例)为主,占68.8％;而非生产性农药中毒则相反,以女性(1319例)为主,占66.8％.生产性农药中毒的高发年龄为30～59岁(2239例,占81.8％);非生产性农药中毒者的高发年龄为30～44岁和≥70岁组,分别为665例(33.6％)和209例(10.6％).生产性农药中毒高发的地区分布为蔡甸区最高(1016例,占37.1％),其他依次为东西湖区、汉南区和黄陂区.农药中毒发生时间集中在第三季度.生产性农药中毒的原因主要有防护不良、持续作业时间过长及未执行操作规程.非生产性农药中毒的主要原因为服毒自杀.结论 武汉市的生产性农药中毒高发人群以中年男性为主,中毒农药主要为杀虫剂.     

Genetic susceptibility to dermatophytosis

Clustering of cases of dermatophytosis suggests that inherited susceptibility may play a part in determining the epidemiology of some forms of this infection, notably tinea imbricata. Some studies of T. concentricum infection show that autosomal recessive susceptibility may provide an answer although this is not the case in all endemic areas. Further support comes from the association between dermatophytosis in man and inherited conditions such as atopy, chronic mucocutaneous candidosis and tylosis as well as experimental data showing that susceptibility to dermatophytosis in mice varies in different inbred strains. Possible mechanisms are discussed.     

2010年湖北省武汉市第5次结核病流行病学抽样调查分析

目的了解湖北省武汉市结核病疫情现状,为制定2011-2020年武汉市结核病防治规划提供依据。方法采用分层整群等比例随机抽样方法对5个流行病学抽样调查（简称＂流调＂）点≥15岁应检人口进行胸部X线检查,对所有应查痰对象进行痰涂片和痰培养检查。对所有调查对象进行结核病防治知识知晓情况问卷调查。结果调查对象实际受检率为96.3%,2010年≥15岁人群活动、涂阳和菌阳肺结核的患病率分别为436.3/10万,63.8/10万,178.5/10万。2000-2010年活动性肺结核患病率下降2.6%,年递降率为0.3%;涂阳肺结核患病率下降53.4%,年递降率为7.4%;菌阳肺结核患病率下降23.7%,年递降率为2.7%。疫情特点为男性患病率高于女性（活动性χ2=30.56,P〈0.001;涂阳χ2=4.69,P=0.030;菌阳χ2=15.39,P〈0.001）,老年人活动性和菌阳结核病患病率高于非老年人（活动性χ2=7.83,P=0.007;菌阳χ2=3.98,P=0.046）,城区活动性肺结核患病率高于农村（χ2=2.59,P=0.047）。公众结核病知识总知晓率为64.4%,≥65岁老年人总知晓率仅为53.3%,农民知晓率低于城镇居民。结论武汉市近10年来结核病疫情呈下降趋势,防治工作取得了一定的效果;武汉市结核病预防和控制工作仍有许多挑战,应继续提高防治水平。