东莞地区汉族冠心病患者CYP2C19基因多态性分布特征分析

目的探讨东莞地区汉族冠心病患者CYP2C19基因多态性分布特征。方法选取该院2016年9月至2019年1月收治的800例汉族冠心病患者作为研究对象,采用等位基因特异PCR技术对患者CYP2C19基因多态性进行检测,了解CYP2C19基因多态性分布情况,并根据患者的年龄、性别进行分组分析。结果 CYP2C19基因型中*1/*1出现频率为38.50%,*1/*2频率为40.00%,*1/*3频率为6.38%,*2/*2频率为11.75%,*2/*3频率为3.00%,*3/*3频率为0.37%;其中快代谢型为38.50%、中代谢型为46.38%、慢代谢型为15.12%;等位基因分布中CYP2C19*1占61.69%,CYP2C19*2占33.25%,CYP2C19*3占5.06%。不同年龄、性别、患者CYP2C19各基因多态性分布虽存在一定的差异,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论东莞地区汉族人群冠心病患者CYP2C19基因型中以快代谢型与中代谢型为主,基因分布以CYP2C19*1占比较高,不同性别、年龄患者CYP2C19基因型间差异不明显。     

重庆地区CYP2C9和VKORC1基因多态性与华法令药物敏感性的相关研究

目的探讨重庆地区CYP2C9和VKORC1基因多态性频率分布及与华法令药物敏感性的相关性。方法收集陆军军医大学大坪医院2017年2月至2018年12月CYP2C9和VKORC1基因多态性检测患者657例作为研究对象,采用基因芯片杂交法检测CYP2C9及VKORC1基因多态性。结果 (1)重庆地区共检测出8种基因型,主要以*1/*1AA为主,频率为73.52%;(2)重庆地区人群以华法令敏感型(*1/*1AA、*1/*3GA、*1/*2AA、*1/*2GA、*1/*3GG)为主,频率为74.73%,华法令建议起始剂量3.0～4.0mg;(3)CYP2C9和VKORC1基因多态性分布在性别、疾病间差异无统计学意义(P0.05)。结论重庆地区CYP2C9和VKORC1基因型以*1/*1 AA为主,其中华法令敏感型占74.73%,建议华法令用药前进行CYP2C9和VKORC1基因检测便于指导华法令用药。     

武汉地区冠心病患者氯吡格雷药物代谢相关基因CYP2C19的多态性分布分析

目的 探讨武汉地区冠心病介入患者氯吡格雷代谢相关基因CYP2C19多态性的分布。方法 选取2014年1月～12月武汉大学人民医院心内科进行介入治疗(PCI)的316例冠心病患者作为研究对象。通过基因芯片法检测氯吡格雷代谢相关的CYP2C19*1,*2,*3基因,并将患者按CYP2C19基因型别分为不同代谢类型:强代谢型(*1/*1),中间代谢型(*1/*2,*1/*3),弱代谢型(*2/*2,*3/*3,*2/*3)。结果 根据CYP2C19基因多态性位点功能代谢分型,携带CYP2C19*1的强代谢型(*1/*1)占43.4%,携带CYP2C19*2或*3的中间代谢型(*1/*2和*1/*3)及弱代谢型(*2/*2,*2/*3和*3/*3)分别占42.4%,14.2%。不同性别在CYP2C19基因分型上差异无统计学意义。结论 武汉地区冠心病介入患者中分布有较多的CYP2C19氯吡格雷代谢功能缺失基因。     

西北地区530例临床患者CYP2C19遗传多态性分析

目的采用DNA微阵列芯片法对西北地区人群等位基因CYP2C19*2和*3进行基因多态性检测,以了解本地区人群CYP2C19基因型。方法在完成PCR扩增获得目标片段后,运用DNA微阵列芯片法,通过具有位点特异性的寡核苷酸探针与目标序列的杂交及显色,判读基因多态性类型。结果在530份样本中,由CYP2C19*2和*3等位基因突变而产生的六种基因型(*1/*1,*2/*2,*3/*3,*1/*2,*1/*3,*2/*3)均通过DNA微阵列芯片法检测出。西北地区人群中,CYP2C19*2突变常见,为52.64%(n=279),其中,纯合突变率8.87%(n=47);CYP2C19*3基因突变率为10.94%(n=58),而该位点的纯合突变罕见,仅0.19%(n=1);CYP2C19*2/*3双突变率为3.21%(n=17)。进而据基因型判断强代谢型(EM)465例(n=210+215+40),占87.74%,弱代谢型(PM)65例(n=47+1+17),占12.26%。结论本地区人群CYP2C19快代谢与慢代谢基因型比率与国内其他地区报道相近,但发生于*2和*3位点的杂合型突变率显著高于之前文献报道。其中*2位点的突变频率较*3更为常见(52.64%vs.10.94%)。提示CYP2C19基因多态性存在一定的地区差异,掌握本地区人群的基因分布频率对临床用药具有重要的指导意义。     

CYP2C9和VKORC1基因多态性在高寒地区汉族人群中的分布情况分析

目的探究CYP2C9和VKORC1基因多态性在我国高寒地区汉族人群中的分布情况,比较其与同纬度不同国家及我国低纬度汉族人群的差异。方法在高寒地区汉族人群中收集服用华法林的受试者210例,收集患者相关临床病例资料并检测患者的CYP2C9和VKORC1基因型。结果210例受试者CYP2C9的基因型*1/*1、*1/*3和*2/*3频率分别为96.2%、3.3%和0.5%;*1/*1基因型频率高于法国、加拿大、俄罗斯、瑞典和西班牙国家人群(P0.05),*1/*3和*2/*3低于上述国家(P0.05)。VKORC1基因AA、GA和GG的基因型频率分别为81.0%、17.6%和1.4%;AA基因型频率高于法国、加拿大、俄罗斯、瑞典和西班牙国家人群而GG基因型频率低于上述国家人群(P0.05)。CYP2C9和VKORC1基因型与我国广州、湖北、江苏、华南等低纬度地区分布差异无统计学意义(P0.05)。结论 CYP2C9和VKORC1基因型在我国高寒地区汉族人群中以对华法林敏感性较高的类型居多。同纬度不同国家人群上述基因多态性分布差异较大,我国不同纬度汉族人群上述基因多态性分布无差异性。     

重庆地区汉族人群CYP2C19基因多态性分布与不同种族间比较

摘要：目的：了解重庆地区汉族人群CYP2C19基因多态性分布,比较不同种族间CYP2C19代谢型的分布。 方法：用基因芯片法检测140例重庆地区汉族健康人群CYP2C19基因多态性,并比较分析不同种族间的CYP2C19代谢型分布。 结果：在140例重庆地区汉族人群中,*1/*1基因型（636GG,681GG）62例（44.3%）,*1/*2基因型（636GG,681GA）57例(40.7%)〖JP〗,*1/*3基因型（636GA,681GG）8例（5.7%）,*2/*2 基因型（636GG,681AA）10例（7.1%）,*3/*3基因型（636AA,681GG）0例,*2/*3基因型（636GA,681GA）3例（2.1%）;快代谢型62例（44.3 %）,中代谢型65例（46.4%）,慢代谢型13例（9.3 %）。CYP2C19代谢型（快、中、慢代谢型）与美洲印第安人、高加索血统种人、黑白混血人种分布比较差异有统计学意义（χ²分别为46.78, 24.45,12.29,P均<0.05）,与非洲人差异无统计学意义（χ²=3.21,P＞0.05）。 结论: 重庆地区汉族人群CYP2C19位点存在基因多态性,与其他种族比较,代谢型分布有差异。     

癫痫患者CYP2C19基因多态性对丙戊酸钠血药浓度的影响

目的:探讨癫痫患者丙戊酸钠代谢相关基因CYP2C19多态性对丙戊酸(VPA)血药浓度的影响。方法:选取服用VPA单药治疗的癫痫患者177例,采用酶放大免疫分析法检测患者体内VPA药物浓度;采用基因芯片法检测CYP2C19基因(*l,*2,*3),并将患者按CYP2C19基因型别分为不同代谢类型:强代谢型(*1/*1),中间代谢型(*1/*2,*1/*3),弱代谢型(*2/*2,*3/*3,*2/*3);比较CYP2C19代谢型对血药浓度的影响。结果:根据CYP2C19基因多态性功能代谢分型,携带CYP2C19*1的强代谢型(*1/*1)占40.7%,携带CYP2C19*2或*3的中间代谢型(*1/*2和*1/*3)及弱代谢型(*2/*2,*2/*3和*3/*3)分别占43.5%,15.8%。不同性别在CYP2C19基因分型上差异无统计学意义。3种代谢型服用单位剂量VPA后的标准化血药浓度分别为(2.69±0.48)μg/m L,(2.71±0.33)μg/m L和(3.78±1.08)μg/m L,其中弱代谢型标准化血药浓度高于强代谢型和中间代谢型(P0.05)。结论:本组癫痫患者中分布有较多的CYP2C19代谢功能缺失基因,临床医生在使用VPA进行抗癫痫治疗时可参考相关基因检测结果,减少弱代谢型患者用药剂量。     

荧光PCR-熔解曲线法检测新疆回族人群CYP2C9和VKORC1基因多态性研究

目的应用荧光PCR-熔解曲线法检测新疆回族人群细胞色素P450酶2C9(CYP2C9)和维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1(VKORC1)基因多态性,研究新疆回族人群CYP2C9和VKORC1基因分布及基因突变频率情况,并评价荧光PCR-熔解曲线法临床使用的适用性。方法采用荧光PCR-熔解曲线法和测序法对比检测CYP2C9*2、CYP2C9*3和VKORC1(-1639G/A)的基因多态性。结果 228例新疆回族人群中,共检测出CYP2C9*1/*1标本199例,CYP2C9*1/*2标本2例,CYP2C9*1/*3标本26例,CYP2C9*3/*3标本1例,未检测出CYP2C9*2/*2和CYP2C9*2/*3标本。VKORC1(-1639G/A)检测出2种等位基因G和A,其中VKORC1-1639G/G型标本检出2例,VKORC1-1639G/A型标本检出39例,VKORC1-1639A/A型标本检出187例,与测序法对比检测比较,荧光PCR-熔解曲线法与测序法检测结果完全一致。结论新疆回族人群同样具有CYP2C9基因*2、*3位点和VKORC1基因-1639位点的多态性,其发生频率与新疆维吾尔族及其他地域人群的具有一定差异,所采用的荧光PCR-熔解曲线法用于基因多态性检测可满足临床检测要求。     

高原世居藏族和移居汉族人群CYP2CI9基因多态性比较分析

摘要:目的比较细 胞色素P450( cytochrome P450, CYP450)的同工酶CYP2C19在高原世居藏族和移居汉族人群中的不同基因型及等位基因分布特点,为高原地区抗血小板药物氯吡格雷使用前是否进行基因检测提供依据。方法选取2021年1 月 至12月在西藏自治区人民医院就诊的藏、汉人群(分别为200例、120例),采用荧光定量PCR检测藏、汉人群CYP2CI9基因多态性,并比较高原地区藏、汉人群基因型和代谢型的分布特点。结果CYP2CI9 在高原地区藏、汉人群中*1/*1.* 1/ *2. *1/*3. *2/*2.*2/ *3、*3/*3基因型分布频率分别为49% .36.5%、6.5% .7.5% .0.5% .0%和47.5%、39%.4% .6%、2.5%、1%,等位基因*1、*2. *3分布频率分别为70.5%、26% .3.5%和69.1%、26.7% .4.2%,两组间基因型和等位基因分布差 异无统计学意义(P>0.05);快代谢(EM,*1/ *1)、中间代谢(IM, * 1/ *2. *1/ *3)、慢代谢(PM, *2/ *2、*2/*3. *3/ *3)分布频率分别为49%、43% .8%和47.5% .42.5%、10%,两组间差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论高原世居藏族人群中 CYP2C19基因代谢型和基因型与移居汉族人群比较无差异,且中间代谢型及慢代谢型人群占比超过50%。在高原地区藏、汉人群中使用氯吡格雷之前有必要进行CYP2CI9基因型检测,并根据基因型结果调整用药。     

中国汉族人群CYP2C9及VKORC1基因多态性及其对华法林用药剂量的相关性研究

目的分析中国汉族人群CYP2C9和VKORC1的基因多态性及其与华法林稳定维持剂量的相关性。方法回顾性研究。收集2017年10月至2018年4月在北京大学人民医院进行凝血分析检测的458例中国汉族患者,男性213例,女性245例,年龄范围26~94岁。采用PCR-荧光探针法检测CYP2C9*3位点和VKORC1-1639A>G位点基因多态性,458例患者中服用华法林进行抗凝治疗且凝血酶原时间国际标准化比值(INR)达标(在2.0~3.0范围内)的患者130例,记录患者基本信息、华法林用药剂量及凝血酶原时间国际标准化比值(INR),应用SPSS统计分析数据,与美国FDA推荐的不同基因型患者华法林推荐剂量的参考表格进行对比,并且对华法林预测剂量公式进行简单验证。结果458例抗凝患者中CYP2C9*1/*1(AA)基因型频率90.8%,CYP2C9*1/*3(AC)基因型频率8.5%,CYP2C9*3/*3(CC)基因型频率0.7%;VKORC1-1639GG基因型频率0.9%,VKORC1-1639AG基因型频率14.2%;VKORC1-1639AA基因型频率84.9%。在达到抗凝指标(国际标准化比值INR 2.0~3.0)后,结果显示CYP2C9*1/*3与*3/*3基因型患者平均每日剂量为(2.92±1.29);3(2.75,3.375)mg,低于野生型CYP2C9*1/*1基因型患者所需的平均每日华法林剂量(3.91±1.63);3(3,5)mg,差异有统计学意义(P=0.018)。VKORC1纯合突变基因型VKORC1-AA患者平均每日剂量为(3.68±1.64);3(3,4.31)mg,低于杂合基因突变型的平均每日剂量(4.54±1.29);4.5(3.28,6)mg,差异有统计学意义(P=0.001)。不同VKORC1+CYP2C9基因型患者的华法林应用剂量与美国FDA参考表格的推荐剂量具有一致性。Miao2007公式的预测准确度较IWPC公式低,且94.1%的患者华法林剂量被低估。结论携带CYP2C9*3突变基因或VKORC1-AA纯合突变基因型的患者所需华法林剂量较低,CYP2C9和VKORC1基因多态性与华法林稳定维持剂量具有一定的相关性。     

陕西地区CYP2C19基因多态性在不同性别、年龄、民族冠心病患者中的分布特征以及与国内其他地区的对比分析

目的探讨陕西地区冠心病治疗患者CYP2C19基因多态性分布情况。方法选取该院冠心病治疗患者4248例,检测CYP2C19的基因型,统计等位基因及代谢表型分布特征,并对比不同地区汉族和其他民族等位基因及代谢表型分布差异。结果CYP2C19*1、CYP2C19*2和CYP2C19*33种等位基因的频率分别为64.67%、30.65%、4.68%;快代谢型(*1/*1)1749例,发生率41.17%,中间代谢型(*1/*2、*1/*3)1996例,发生率46.99%,慢代谢型(*2/*2、*2/*3、*3/*3)503例,发生率11.84%;不同性别之间基因型及代谢型分布差异无统计学意义(P>0.05);不同年龄段患者CYP2C19基因型分布差异无统计学意义(P>0.05),等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05);我国不同地区汉族人群等位基因分布差异有统计学意义(P<0.05),代谢型分布差异无统计学意义(P>0.05);不同民族等位基因及代谢型分布差异均有统计学意义(P<0.05)。结论陕西地区冠心病患者基因型主要以CYP2C19*1/*2为主,代谢表型主要以中间代谢型为主,可以评估其氯吡格雷抵抗风险,为患者制定个体化的抗血小板治疗方案。     

赤峰地区蒙古族冠心病患者CYP2C19基因多态性分布研究

目的分析赤峰地区蒙古族冠心病患者CYP2C19基因多态性分布状况。方法选取2018年3-12月于该院确诊为冠心病并行经皮冠状动脉介入术治疗的患者558例为研究对象,其中蒙古族患者299例为研究组,汉族患者259例为对照组。抽取两组患者的外周血2 mL,提取基因组DNA,采用实时荧光定量PCR方法检测CYP2C19基因多态性,比较两组间CYP2C19基因型、代谢型分布情况。结果研究组患者CYP2C19*1/*1、*1/*2、*2/*3型所占比例均高于对照组(P<0.05);两组CYP2C19*1/*3、*2/*2、*3/*3型所占比例比较,差异无统计学意义(P>0.05)。研究组中间代谢型和慢代谢型基因所占比例低于对照组(P<0.05),快代谢型基因所占比例高于对照组(P<0.05)。结论赤峰地区蒙古族冠心病患者CYP2C19基因存在不同基因型和代谢型,与汉族冠心病患者间存在差异。掌握CYP2C19基因的多态性分布情况对冠心病患者抗凝药物的选择具有重要意义。     

CYP2C9 and CYP2C19 genetic polymorphisms: frequencies in the south Indian population

The aim of the study was to establish the frequencies of CYP2C9*1, *2, *3 and CYP2C19*1, *2 and *3 in the south Indian population and to compare them with the inter-racial distribution of the CYP2C9 and CYP2C19 genetic polymorphisms. Genotyping analyses of CYP2C9 and CYP2C19 were conducted in unrelated, healthy volunteers from the three south Indian states of Andhra Pradesh, Karnataka and Kerala, by the polymerase chain reaction-restriction fragment-length polymorphism (PCR-RFLP). The allele frequencies of the populations of these three states were then pooled with our previous genotyping data of Tamilians (also in south India), to arrive at the distribution of CYP2C9 and CYP2C19 alleles in the south Indian population. Frequencies of CYP2C9 and CYP2C19 alleles and genotypes among various populations were compared using the two-tailed Fisher's exact test. The frequencies of CYP2C9*1, *2 and *3 in the south Indian population were 0.88 (95% CI 0.85-0.91), 0.04 (95% CI 0.02-0.06) and 0.08 (95% CI 0.06-0.11), respectively. The frequencies of CYP2C9 genotypes *1/*1, *1/*2, *1/*3, *2/*2, *2/*3 and *3/*3 were 0.78 (95% CI 0.74-0.82), 0.05 (95% CI 0.03-0.07), 0.15 (95% CI 0.12-0.18), 0.01 (95% CI 0.0-0.02), 0.01 (95% CI 0.0-0.02) and 0.0, respectively. CYP2C19*1, *2 and *3 frequencies were 0.64 (95% CI 0.60-0.68), 0.35 (95% CI 0.31-0.39) and 0.01 (95% CI 0.0-0.03), respectively. As a result of a significant heterogeneity, the data on CYP2C19 genotype frequencies were not pooled. The frequency of CYP2C9*2 mutant alleles in south Indians was higher than in Chinese and Caucasians, while CYP2C9*3 was similar to Caucasians. CYP2C19*2 was higher than in other major populations reported so far. The relatively high CYP2C19 poor-metabolizer genotype frequency of 12.6% indicates that over 28 million south Indians are poor metabolizers of CYP2C19 substrates.     

Pharmacogenetics of acenocoumarol: CYP2C9, CYP2C19, CYP1A2, CYP3A4, CYP3A5 and ABCB1 gene polymorphisms and dose requirements

BACKGROUND AND OBJECTIVE: Acenocoumarol (AC) is a coumarin derivative, vitamin K antagonist anticoagulant drug. It has a narrow therapeutic index and shows large pharmacokinetic and pharmacodynamic interindividual variability. Our objective was to investigate the association between AC dose requirements to achieve a target level of anticoagulation and genetic polymorphisms of genes possibly associated with its metabolism (CYP1A2, CYP2C9, CYP2C19, CYP3A4, CYP3A5) and transport (ABCB1). METHODS: Ninety-six Bulgarian patients treated orally with AC for at least 3 months were included. They were separated into three groups according to their AC dose requirement, i.e. low, medium and high. RESULTS AND DISCUSSION: CYP2C9*1/*3 (associated with an intermediate CYP2C9 activity), CYP2C9*2/*2, and CYP2C9*2/*3 genotypes (associated with a low CYP2C9 activity) were more prevalent in the group with low dose requirement of AC compared with the other two groups (P = 0.003). The frequency of CYP2C9*1/*1 genotype, which is associated with an extensive CYP2C9 activity, was higher in the group of patients with high dose requirements (79%), compared with the groups of the medium and low dose requirements (67% and 21% respectively). In addition, the ABCB1 2677GG/3435CC haplotype was associated with use of lower AC dose, whereas the 2677TT/3435TT and 2677GT/3435TT haplotypes were associated with use of higher AC dose (P = 0.03). The distribution of polymorphisms of other genes did not show significant differences between the three groups. CONCLUSION: In vivo, cytochromes P450 isoforms other than CYP2C9 [corrected] were not significantly associated with dose requirement of AC. In our Bulgarian patients, the presence of CYP2C9*2 or/and CYP2C9*3 alleles, as well as the ABCB1 2677GG/3435CC haplotype were associated with low dose requirement of AC.     

Cytochrome P450 CYP2C19 genotypes in Nigerian sickle‐cell disease patients and normal controls

Background and objective: Subjects with different CYP2C19 genotypes may metabolize proguanil, a pro‐drug used for malaria prophylaxis differently and the frequency of the different alleles may be different in patients with sickle‐cell disease (SCD) and normal controls. The objective of this study was to evaluate CYP2C19 *1, *2 and *3 allele and genotype frequencies in Nigerian normal controls and SCD patients, and to further compare variant CYP2C19 frequencies in Nigerians with other African populations. Methods: Genotyping was carried out with PCR and restriction fragment length polymorphism analysis. Results and discussion: CYP2C19 *1 (84·3 vs. 84·9%) or *2 allele frequency (15·7 vs. 15·1%) was not significantly different between patients with SCD and normal subjects. No *3 allele was detected in the cohort. The SCD group exhibited a statistically significantly lower frequency of *1/*1 genotype (69·6%) compared with normal controls (74·4%). Frequency of *2/*2 was significantly lower in SCD (0·9%) compared with normal controls (4·7%). Frequencies of *1/*2 (29·6 vs. 20·9%) were no different in SCD and normal controls. Conclusion: Prevalence of CYP2C19 polymorphisms was defined for the first time in Nigerian normal and SCD populations. Nigerian SCD patients exhibited significantly lower CYP2C19 *1/*1 and *2/*2 frequencies than normal controls. No differences were detected in CYP2C19 allele or genotype frequencies in normal subjects between this study and previous reports in other African populations.     

DNA微阵列芯片法与直接测序法检测CYP2C19基因型的比较研究

目的 用DNA微阵列芯片法和直接测序法两种方法检测氯吡格雷相关基因CYP2C19的突变情况,并进行比较分析。同时将基因型检测结果与临床资料进行分析,初步探讨CYP2C19基因型检测在氯吡格雷用药治疗中的临床意义。方法收集180例诊断为急性冠脉综合症并首次接受经皮冠状动脉介入治疗术(PCI)的全血标本。其中90例患者术后服用氯吡格雷之前,采用DNA微阵列芯片法和DNA直接测序法检测CYP2C19突变位点,确定其基因型。另外90例对照组患者使用氯吡格雷药物但不检测CYP2C19基因型。分析两组患者随访过程中发生冠脉血栓事件的差异。结果 ①两种检测方法准确度比较:在试验组90例患者中,DNA微阵列芯片法和DNA测序法均检出4种基因型组合:*1/*1(636GG,681GG),*1/*2(636GG,681GA),*2/*2(636GG,681AA)和*1/*3(636GA,681GG),分布频率分别为44例(48.9%),36例(40%),5例(5.6%)和5例(5.6%),而*3/*3(636AA,681GG)和*2/*3(636GA,681GA)未检测到。两种方法的准确度完全一致。②将检测结果与临床资料进行相关性分析:经CYP2C19基因型指导氯吡格雷用药的患者发生支架冠脉血栓事件的比例(0%)明显低于对照组(3.33%,P<0.05)。结论①DNA微阵列芯片法灵敏度和准确度与DNA直接测序法(金标准方法)检测相符率为100%。②DNA微阵列芯片法是一种快速、准确发现CYP2C19突变位点,鉴别CYP2C19基因型的检测方法。③检测结果与临床相关性分析结果显示基因型指导氯吡格雷用药有助于患者用药剂量的调整,或选用其它抗凝血药物,从而可降低冠脉血栓事件的发生率。