2003-2014年浙江省宁波市乙型流行性感冒病毒血凝素和神经氨酸酶基因变化特征分析

目的 分析2003-2014年宁波市乙型流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子流行病学特征。方法 采集宁波市2003-2014年哨点监测医院的流感样病例标本进行流感病毒分离鉴定,选取不同时期的乙型流感毒株进行HA和NA基因序列测定,采用生物信息学软件分析变异和进化。结果 宁波市乙型流感病毒Victoria和Yamagata两大普系流行株的HA及NA基因在2003-2014年间每年均有不同程度的氨基酸序列变异,其中最明显的为2005年与2009年的Victoria系毒株及2007年与2010年的Yamagata毒株变异。每当HA基因序列发生明显变异时NA基因也同时出现明显的变异,而且有时NA基因的变异比HA基因更明显。同时发现2013-2014年流行的乙型流感病毒为Yamagata系HA与Victoria系NA的重配株。结论 乙型流感两大谱系流行株的HA基因发生变异时NA基因也会出现变异,甚至较HA基因更快。2013-2014年宁波市乙型流感高发的流行株为Yamagata系HA与Victoria系NA基因的重配株。     

2005-2007年吉林省乙型流行性感冒病毒HA1基因序列分析

目的了解2005-2007年吉林省乙型流行性感冒（流感）病毒HA1基因的演变特征。方法采用MDCK分离培养流感病毒,提取病毒RNA,经反转录和聚合酶链式反应扩增后测序。结果2005-2007年吉林省同时流行着乙型Victoria系和Yamagata系流感毒株。与B/Shanghai/361/02相比,2005年流行的乙型Yamagata系病毒有8个氨基酸位点发生改变;2007年流行的乙型Yamagata系病毒有10个氨基酸变化位点;2007年流行的乙型Victoria系毒株与B/Malaysia/2506/04相比,只有3个氨基酸位点发生替换。结论2005-2007年吉林省流行的乙型Yamagata系病毒与B/Shanghai/361/02相比已经发生变化;吉林省2007年Victoria系毒株与疫苗代表株B/Malaysia/2506/04比较接近。     

2009-2010年浙江省宁波市乙型流行性感冒的流行与人群抗体水平变化

目的 了解2009-2010年宁波市乙型流行性感冒(流感)病毒的流行特征及人群对乙型流感的抗体水平变化。 方法 从流感监测哨点医院采集患者标本进行流感病毒分离及疫情监测,于2009年7月和2010年3月底2次采集宁波市正常人群血清,用微量血凝抑制法进行乙型流感抗体检测。 结果 在2009-2010年期间乙型流感的Victoria系毒株比较活跃,共出现2次流行的高峰期,且从2009年6月起血凝素基因出现了新变异株。人群血清抗体水平检测结果,2009年7月采集的标本阳性率为42.12%,而2010年3月底采集的标本为51.11%。 结论 2009-2010年Victoria系乙型流感的流行与毒株的血凝素基因变异有关。从2009年7月至2010年3月底,人群对Victoria系乙型流感的抗体阳性率有明显的增高。     

2009年宁波市甲3亚型流感流行特征 与HA1基因特性的分析

目的 了解2009年宁波市甲3亚型流感病毒的流行特征及血凝素基因HA1区域的变异情况。 方法 全年度每周从流感监测哨点医院收集流感样病例标本进行病毒分离,获得的甲3亚型流感毒株按不同时间、地点进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因特性分析。 结果 所选取的15株甲3亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为987 bp,编码329个氨基酸;2009年上半年的流行株与2008年秋季的流行株在该区域有7个氨基酸位点存在差异,2009年下半年的流行株与2009上半年又存在10个氨基酸位点的差异。上半年与下半年的流行株在种系发生树上形成两个分支,为不同性状的流行株。 结论 2009年上半年及下半年宁波市甲3亚型流感流行株与2008年相比,在血凝素基因HA1区域都发生了较为明显的改变,且上半年与下半年的2个流行株之间血凝素基因的差异也较大。说明2009年宁波市流行的甲3亚型流感病毒变异较为频繁。     

2009年广东省深圳市B型流感病毒系统进化及分子变异分析

目的 了解2009年深圳市B型流感病毒的系统进化及分子变异情况。 方法 对2009年深圳市分离的B型流感病毒的时间分布进行统计分析,并通过MEGA等软件对其HA1基因的系统进化及分子变异情况进行研究。 结果 深圳市2009年1-10月均有B型流感病毒流行,3-5月为流行高峰;Victoria系分支D的毒株是优势流行株;与2008 - 2009年度的国际疫苗株相比,Victoria和Yamagata系的HA1分子在其抗原决定簇区均出现了多个氨基酸位点的变异。 结论 2009年深圳市B型流感病毒的流行时间长,一些氨基酸位点的变异并没有导致一个新流行株系的形成。     

2009-2012年浙江省湖州市甲3亚型流行株基因特性分析

目的 分析2009-2012年湖州市甲3亚型流感病毒主要抗原基因血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子变异特征。 方法 选择浙江省湖州市2009-2012年流感流行期间分离的甲3亚型代表株11株,提取病毒RNA,扩增HA1和NA基因,进行序列测定,用MegAlign软件分析处理。 结果 湖州市近几年甲3亚型流感流行株在HA1区的核苷酸长度均为987 bp,编码329个氨基酸;在NA区的核苷酸长度为1362 bp,编码454个氨基酸。2009-2012年甲3亚型流感病毒分离株HA1区与NA区的氨基酸同源性分别在94.7%～99.9%与96.2%～100.0%之间,HA1区的变异较NA区更大。4个流感流行期分离的甲3亚型流感毒株相比HA和NA发生了多个氨基酸位点的替换。此外,近几年来世界卫生组织推荐的甲3亚型流感疫苗株与当年的流感流行株之间存在一定的差异。 结论 2009-2012年湖州市甲3亚型流感病毒流行株发生明显变异,基因重配和抗原漂移是病毒发生变异的主要机制。     

2007-2008年泰安市流行期流行性感冒病毒分离及分析

目的　对山东省泰安市2007-2008年流行期流行性感冒（流感）病毒进行分离鉴定及分析,了解泰安市流感流行情况。方法　采集流感样病例（ILI）的咽拭子标本用犬肾传代细胞（MDCK）进行病毒分离,采用血凝抑制方法（HAI）进行流感病毒型别鉴定。结果　2007年10月至2008年3月共检测2所哨点医院ILI咽拭子标本281份,分离到流感病毒94株,阳性分离率为33.45%，经分型鉴定A型H3N2亚型51株,H1N1亚型1株；B型的 Yamagata系39株，Victoria系3株。结论　2007-2008流行季中，泰安市流感病毒流行的优势毒株为A型H3N2亚型和B型Ymagata系,同时有A型H1N1亚型和B型Victoria系毒株的存在。     

2007年江西省甲3亚型流感毒株HA1基因特性的分析

目的了解江西省2007年分离的甲3亚型流感病毒株HA1基因变异特征,分析WHO2007～2008年甲3亚型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感的预防效果。方法采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的H3型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit（Version5.0）、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果所选取的8株甲3亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为960bp,未发现核苷酸的丢失和插入,平均点突变率为1.13%。2007年甲3亚型流感病毒分离株与2007～2008年WHO疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是97.8%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为3.25个,但有毒株已出现在2个抗原决定簇区4个氨基酸替换。结论2007年根据WHO2007～2008年推荐疫苗株生产的疫苗对我省的甲3亚型流感预防效果不够理想。     

2007年江西省甲3亚型流感毒株HA1基因特性的分析

目的了解江西省2007年分离的甲3亚型流感病毒株HA1基因变异特征,分析WHO2007～2008年甲3亚型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感的预防效果。方法采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的H3型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit（Version5.0）、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果所选取的8株甲3亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为960bp,未发现核苷酸的丢失和插入,平均点突变率为1.13%。2007年甲3亚型流感病毒分离株与2007～2008年WHO疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是97.8%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为3.25个,但有毒株已出现在2个抗原决定簇区4个氨基酸替换。结论2007年根据WHO2007～2008年推荐疫苗株生产的疫苗对我省的甲3亚型流感预防效果不够理想。     

马鞍山地区606例流感样病例病毒分离和监测分析

目的阐明2005年10月至2006年4月马鞍山地区流行性感冒(流感)流行特点和流感病毒优势株的特性。方法流感病毒分离采用细胞分离;流感病毒亚型鉴定采用血球凝集抑制试验。结果2005年10月至2006年4月,全市3家国家流感监测哨点医院共采集流感样患者咽拭子标本共计606份,经鉴定流感病毒阳性69株,分离率11.4%。在69株流感病毒中,A1型14株、B型流感病毒Victoria55株,分别占总分离数的20.3%和79.7%,未分离到A3型和B型流感病毒Yamagada。优势流行株为H1N1和B型Victoria株。A1型流感病毒主要分离于2006年1月和2月,而B型Victoria系流感病毒主要集中分离于2￣4月。结论马鞍山地区感染人群的流感毒株依然以A型(H1N1)和B型Victoria为优势株。与全国监测相比,B型Victoria分离比例高。     

2014－2020年广东省不同型别流感病毒季节性流行特征及变化趋势

  目的  探讨广东省不同型别流行性感冒（流感）季节性流行特征差异及动态变化趋势,为该省流感的精准防控提供依据。  方法  收集广东省2014年第36周至2020年第35周6个监测年度每周流感病原学监测数据,采用移动流行区间法（MEM）确定每个年度流行季,分析流感病毒流行季节性特征;采用χ2检验比较分析不同型别流感季节性流行特征及变化趋势。  结果  广东省流感主要呈现冬春季和春夏季流行,2016 — 2017年度及之前流行高峰多出现在夏季,2017 — 2018年度及之后均出现在冬季。 分析比较2014 — 2015年至2018 — 2019年季节性流行特征,结果显示,0～2岁阳性率最低,随年龄增长,阳性率先上升,7～18岁阳性率最高,然后呈现下降趋势;不同年龄组各型别分布存在差异,A型高于B型。 A（H1N1）pdm09亚型和B（Yamagata）系冬季流行,A（H3N2）亚型夏季流行,B（Victoria）系为春季流行。 与2016 — 2017年及之前相比,2017 — 2018年及之后,7～18岁和19～59岁感染比例上升,而其他年龄组则下降。 A（H1N1）pdm09亚型、B（Yamagata）系由春季流行为主变为冬季流行为主,A（H3N2）亚型由夏季为主转为春季多见,B（Victoria）系仍以春季多见。  结论  广东省在2017 — 2018年度以来出现冬季流行高峰;不同亚型/系流感流行具有型别特异的流行特征和变化趋势;需持续做好流感病原学监测,以科学精准判定与防控流感流行趋势。     

The rapid detection kit based on neuraminidase activity of influenza virus

The ZstatFlu test(ZymeTx, USA) is a rapid detection kit for influenza types A and B virus. This test is based upon the reaction between viral neuraminidase from influenza viruses and chromogenic substrate. The positive specimen of influenza type A or B virus cleave the substrate and produce a blue colored product. The ZstatFlu was evaluated by a prototype viruses, isolated viruses and clinical specimens. At result, this kit was reactive for all human influenza type A and B virus. No cross reactivity was detected with other respiratory viruses, including parainfluenza type 1, 2, 3 and mumps viruses with neuraminidase activity. Throat swabs were used for the test. By comparison with cell culture and RT-PCR. The sensitivity and the specificity was 77.0% and 90.2% respectively. The ZstatFlu should be useful for the rapid diagnosis of influenza virus infection.     

2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行和进化分析

目的 了解2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行分布和基因进化情况。方法 通过测序和全球流感共享数据库（global initiative on sharing all influenza data,GISAID）获得2010-2015年湖北省乙型流感病毒血凝素（hemagglutinin, HA）和神经氨酸酶（neuramidinase, NA）氨基酸序列,分别对其进行系统进化树、氨基酸突变位点和三维建模分析,结合同期病毒分离株流行分布,分析重配株基因进化与病毒流行分布间的关系。结果 2010-2015年湖北省乙型流感病毒存在系内重配和系间重配,首例重配株出现后,该病毒都会形成较大流行。同期病毒在HA四个主要抗原表位上发现的突变位点有:N116K、N129S、A146T、K162R和N197S,在NA上发现了神经氨酸酶活性突变位点D197N,三维建模表明该位点并非直接与底物或抑制物接触。结论 2010-2015年湖北省乙型流感病毒的流行与该病毒的基因进化关系密切,监测该病毒抗原表位突变位点和耐药突变位点有助于深入分析其进化特性。     

2011－2019年江苏省不同型别流感病毒流行特征差异分析

  目的  了解2011 — 2019年江苏省流行性感冒（流感）病毒不同亚型和系之间的流行病学特征差异,为本地区流感的精准防控提供依据。  方法  对2011 — 2019年中国流感监测系统中报告的江苏省实验室确诊的流感病例进行分析,分类资料的分布差异比较使用χ2检验,使用logistic回归识别危险因素并计算OR值。  结果  在2011年1月至2019年12月期间,江苏省共报告26 934例流感确诊病例,A（H3）亚型占比最多,占40.40%。 在不同监测年度和地区间,流感病例中各个亚型和系分布比例的差异有统计学意义（χ2=13588.399,P<0.001;χ2=180.333,P<0.001）。 A（H3）亚型在12月至次年1月以及8 — 9月呈双峰流行,A（H1）亚型和B-Y系在1 — 2月出现高峰,B-V系则滞后至3 — 4月病例数增多。 在人群分布上,各年龄组、职业的流感亚型和系分布差异有统计学意义（χ2=1126.665,P<0.001;χ2=70.724,P<0.001）。 多因素logistic回归分析显示,经调整地区和月份,不同年龄组人群感染流感病毒各亚型和系的风险差异有统计学意义,0～5岁儿童更容易感染A（H1）亚型,6～15岁易感染B-V系,而65岁以上老年人易感染A（H3）亚型和B-Y系。  结论  江苏省流感病毒型别交替变化并呈现一定规律,不同亚型、系流行具有型别特异的季节性特征和人群感染风险,及时分析不同病毒亚型和系的流行特点是流感精准防控的关键。     

2006-2007年辽宁省儿童流行性感冒病原学检测分析

目的　分析辽宁省2006-2007年度流行性感冒（流感）的病原学及流行特征。方法　在流行季节采集咽拭子用鸡胚和细胞分离方法，进行间接血凝抑制试验。结果　共采集儿童标本213份，分离流感毒株41株，分离率为19.25%；其中A型31株（H1亚型14株、H3亚型17株），B型10株，流感的高发年龄主要集中在4～9岁之间。结论　2006-2007年辽宁省内同时有三种亚型的流感病毒在流行，2006年底前优势株是H1亚型，2007年优势株转为H3亚型和B亚型。     

2004～2005年山西省流感样病例的病原学检测

目的了解2004～2005年山西省流感流行季节流感样病例的病原学特征。方法在太原市的三所哨点医院和有流感样病例的地区、门诊部采集鼻、咽拭子,用MDCK细胞进行分离鉴定。结果采集到的454份标本,分离到B型流感病毒13株(2.86%),均为B/上海/361/2002类似株。分离到流感病毒的病人以10岁以下儿童为主(9/13),男女无显著性差异。各医院阳性分离率无显著性差异。三个地区报告的中、小学校疫情,经病毒分离和血清抗体(HI)检测,其中两地均可确定为乙型流感病毒引起的局部小流行。三所医院各年龄组分离的19株非流感病毒(4.18%)细胞病变特征一样,不能确定何病毒。结论2004～2005年山西省流感流行季节主要以乙型流感病毒为主。未分离到其他型病毒以及分离率较低,分析原因与流感样病例和标本采集时间的把握有重要的关系,另一方面也可能与所用细胞的敏感性以及细胞的状态有关,加强实验室的质量控制,应用两种方法进行病毒分离对于提高病毒的分离率是非常必要的。     

荧光RT-PCR对乙型流感病毒爆发的检测

目的探讨荧光RT-PCR方法对乙型流感病毒爆发的诊断价值。方法采集暴发性疫情的流感样病例的咽拭子,提取病毒RNA,PCR方法分别检测甲型和乙型流感病毒的核酸。然后,对核酸检测阳性标本进行MDCK培养,经红细胞凝集和凝集抑制试验对病毒进行鉴定和分型。结果 18份咽拭子中15份乙型流感病毒核酸呈阳性,甲型流感病毒未检出;15份乙型流感病毒核酸阳性标本经MDCK培养,9份标本发生细胞病变,经鉴定和分型,都属于乙型流感病毒Victoria系。结论 RT-PCR方法对乙型流感病毒爆发的检测具有快速、敏感和高度特异性的特点。本地区爆发的乙型流感病毒为乙型流感病毒Victoria系,提示在今后决定我国疫苗成份时应考虑地区流行的特点。