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1.
方斌  刘琳琳  李翔  叶国军  余晓  宋毅 《疾病监测》2016,31(7):554-560
目的 了解2010-2015年湖北省乙型流感病毒流行分布和基因进化情况。方法 通过测序和全球流感共享数据库(global initiative on sharing all influenza data,GISAID)获得2010-2015年湖北省乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuramidinase, NA)氨基酸序列,分别对其进行系统进化树、氨基酸突变位点和三维建模分析,结合同期病毒分离株流行分布,分析重配株基因进化与病毒流行分布间的关系。结果 2010-2015年湖北省乙型流感病毒存在系内重配和系间重配,首例重配株出现后,该病毒都会形成较大流行。同期病毒在HA四个主要抗原表位上发现的突变位点有:N116K、N129S、A146T、K162R和N197S,在NA上发现了神经氨酸酶活性突变位点D197N,三维建模表明该位点并非直接与底物或抑制物接触。结论 2010-2015年湖北省乙型流感病毒的流行与该病毒的基因进化关系密切,监测该病毒抗原表位突变位点和耐药突变位点有助于深入分析其进化特性。  相似文献   
2.
方斌  徐晖  余晓  李翔  叶国军  刘琳琳 《疾病监测》2019,34(11):994-1000
目的了解2015 — 2019年湖北省甲型H1N1流感病毒流行和进化特征、抗原表位和耐药位点突变情况。方法在中国流感监测信息系统下载流感病毒核酸检测阳性率并划分流行高峰,选取2015 — 2019年湖北省39株经实时荧光PCR检测阳性后病毒分离培养的甲型H1N1流感病毒株并测序,另在全球流感共享数据库下载13株湖北省毒株序列,采用生物信息学软件分析其进化簇分布、抗原表位和耐药突变位点,通过三维建模,分析其突变位点结构。结果2015 — 2019年湖北省甲型H1N1流感病毒每年流行高峰持续长达11~14周,流行强度逐年增加,在血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)进化树6B簇内进化出6B.1A到6B.1A7等多个分支,发现12处HA抗原表位突变位点和2处NA基因耐药位点,其中毒力标签D222G和耐药位点I223V三维模拟结构差异明显。结论2015 — 2019年甲型H1N1流感病毒流行强度不断提高,进化出多个分支簇,零星检出毒力标签和耐药突变位点,该分析有助于提高湖北省流感病毒流行病学和基因进化监测水平。  相似文献   
3.
目的分析湖北省2000年以来甲型流感病毒株神经氨酸酶(NA)和M基因特性,以及耐药性位点的变异情况。方法从2000~2008年临床样品中分离毒株,运用RT-PCR扩增NA和M基因,对扩增片段进行序列测定,利用DNAStar软件与世界卫生组织推荐的流感疫苗毒株进行同源性比较,对NA和M基因重要功能性位点和耐药性位点进行分析,利用Mega软件进化分析。结果2000~2008年临床样品流感病毒分离株的NA和M基因与同年疫苗株相应基因的同源性分别为96.6%~99.7%和96.6%~99.6%,分离株NA基因中潜在的抗原性位点和糖基化位点与2000~2008年疫苗株基本相同,与2009年疫苗株有一定差异。NA基因未发生耐药性突变,但M基因在2005年以后的分离株中发生了S→N突变。NA和M基因进化分析表明不同年份分离株呈现出不同的亲缘关系。结论湖北省季节性甲型H1N1流感病毒分离株与2000~2008年世界卫生组织推荐的疫苗毒株有高度同源性,但与2009年疫苗株有所不同,未出现达菲类药物抗药性位点的核苷酸突变,但2005年后的分离株在M基因上均发生金刚烷胺类耐药性突变。NA和M基因进化树中可以看到甲型H1N1流感病毒进化关系在时间(年)上具有聚集性。  相似文献   
4.
2008年4月22日,潜江市江汉油田总医院报告,江汉油田广华幼儿园发生手足口病,经湖北省、武汉市、潜江市、江汉油田疾控中心联合调查组流行病学调查核实,从2008年4月20日至5月3日,潜江市江汉油田广华片区幼儿园共发生手足口病40例。实验室检测确认为由肠病毒EV71引起的一起经密切接触传播的手足口病暴发疫情,经过科学有效的防控处理,该起疫情迅速平息,现将调查处理情况报告如下。  相似文献   
5.
目的 了解2014—2021年湖北省鄂州市外环境禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)分布情况及相关职业暴露人群感染状况,为鄂州市防控人感染禽流感疫情提供依据。方法 2014—2021年鄂州市3个区的4类场所,5种类型外环境标本,采用荧光定量PCR方法对标本进行A型、H5亚型、H7亚型、H9亚型流感病毒检测,同时采集禽流感职业暴露人群血清标本,使用红细胞凝集抑制实验法检测禽流感病毒H5N6、H7N9、H9N2抗体,采用描述性流行病学方法对检测结果进行统计分析。结果 2014—2021年鄂州市采集禽流感外环境标本2 187份,检出流感病毒A型(Influenza virus type A,FluA)阳性标本645份,阳性率为29.49%;以H9亚型和H5+H9混合型为主,分别占50.39%和17.36%。鄂城区禽流感病毒检出阳性率最高(38.41%),梁子湖区最低(11.92%)。4类场所中城乡活禽市场禽流感病毒检出阳性率最高(46.60%)。5种类型外环境标本中,清洗禽类污水禽流感病毒检出阳性率最高(46.09%)。时间分布,第1季度(39.09%)和第4季度...  相似文献   
6.
目的对恩施地区2003年3月上、中旬发生的两起流感局部暴发流行进行病原学分析。方法采集患者咽拭子进行病毒分离鉴定,采集急性期和恢复期双份血进行抗流感病毒IgG抗体测定。结果证实湖北恩施地区出现的流感局部暴发流行是由B型流感病毒引起的,分离的B型流感病毒的抗原性与2001年香港分离株(B/香港/维多利亚30/2001)和浙江分离株(B/浙江/2/2001)很接近,而与1999年四川分离株(B/四川/397/1999)和2001年上海分离株(B/上海/20/2001)相差甚远。结论湖北省恩施地区2003年3月流感局部暴发流行是由流感病毒B型引起的。  相似文献   
7.
湖北省2001~2004年流感病毒分离情况分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
流感是人类尚未征服的急性传染病之一。流感的发病率居各种传染病之首.目前尚无有效方法进行预测和控制。只有对流感进行长期的病原学监测。深入研究流感病毒的变异规律,才有可能最终找到彻底控制这类疾病的方法。  相似文献   
8.
2004年2月20日~3月11日,湖北省利川市团堡镇某初级中学发生了流感暴发疫情。接到疫情报告后,省、州疾控中心专业人员迅速赶到现场,进行了详细调查,现将调查结果报告如下。  相似文献   
9.
目的 对2006-2012年湖北省流感监测结果进行分析,为湖北省的流感防控工作提供科学依据.方法 通过流行病学调查及病原学监测,对湖北省近年的流感流行状况进行分析.结果 2006-2012年,湖北省共报告297起流感样病例暴发疫情,流感样病例(influenza-like illness,ILI)比例平均为4.63%;0~5岁年龄组人群在ILI中所占比重最大,为50.71%;随着年龄的增长,ILI比例逐渐递减,60以上年龄组人群所占比重最低,仅为2.24%.各年龄组流感样病例比例随时间呈现季节性差异,疫情报告的时间分布主要为每年春节前后及开学季.毒株型别分布呈现交替流行态势,且除2011年外,其余年度均呈现冬春季及夏季两个流行高峰.结论 湖北省流感流行峰及优势毒株呈现季节性及交替分布态势,长期稳定的病例及病原学监测可以为流感疫情的预警、疫苗株的选择提供良好的实验室依据.  相似文献   
10.
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