鉴定五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的多重PCR方法

目的 建立一种快速鉴定和鉴别五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的多重PCR方法.方法 利用五类致泻性大肠埃希菌和志贺菌的毒力基因stx1、stx2、eaeA、lt、stIb、aggR、ipaH及16S rRNA基因rrs,建立8重PCR反应体系,并对PCR引物、反应体系和循环条件进行优化.结果 8对PCR引物均能特异地扩增相...     

多重实时PCR检测致泻性大肠埃希菌志贺毒素和紧密素基因

目的 建立多重实时PCR检测志贺毒素（stx1、stx2）基因和紧密素基因（eae）的方法。方法 优化多重实时PCR反应条件，检测系列稀释的阳性菌DNA提取物及纯化阳性质粒。检测42株携带已知毒力基因的大肠埃希菌株，并比较其阳性和阴性符合率。对比3种粪便样品处理和DNA提取方法，选出最适方法。同时用该方法对36份腹泻患者粪便标本进行直接检测且对阳性标本进行菌株分离和鉴定。结果 多重实时PCR方法最低可以检测到10^1拷贝／pJ的毒力基因和10。CFU／p．1的DEL933大肠埃希菌。检测42株携带已知毒力基因的大肠埃希菌的阳性和阴性符合率均为100％。粪便样品的DNA提取以BP肉汤增菌6h后煮沸提取效果最好。36份腹泻患者粪便中2份eae阳性，均鉴定为大肠埃希菌。结论 建立的同时检测stx1、stx2、eae基因的多重实时PCR方法，具有较高的敏感性，可用于产志贺毒素大肠埃希菌（STEC）和肠致病性大肠埃希菌（EPEC）毒力基因鉴定及临床腹泻粪便标本的快速筛检。     

食品和公共场所从业人员致泻性大肠埃希菌携带情况分析

目的了解食品和公共场所从业人员的致泻性大肠埃希菌携带情况。方法 2013年4月至2014年12月对新建县食品和公共场所从业人员采集肛拭子标本共计3032例,进行致泻性大肠埃希菌的检测。按照GB4789.6—2003对致泻性大肠埃希菌进行生化鉴定、血清学分型,用荧光PCR进行分子生物学鉴定。结果 3032例标本中,共检出致泻性大肠埃希菌12株,检出率为3.96‰,其中食品从业人员1694例检出11株,公共场所从业人员1338例检出1株;沙门菌3株,检出率为0.99‰;志贺菌2株,检出率0.66‰,致泻性大肠埃希菌的检出率明显高于沙门菌、志贺菌的检出率。检出的12株致泻性大肠埃希菌有7株肠侵袭性大肠埃希菌,其中1株携带毒力基因ipa H;5株肠致病性大肠埃希菌,其中2株携带毒力基因,分别为eae和bfp。结论在食品从业人员预防性健康体检项目中增加致泻性大肠埃希菌的检测具有一定的可行性,为预防和控制腹泻病病原及食源性食物中毒等有重要意义。     

儿童肠道感染中致泻性大肠埃希菌的检测

目的了解儿童肠道感染中致泻性大肠埃希菌的感染情况。方法对95份腹泻患儿粪标本中分离出的大肠埃希菌,用荧光聚合酶链反应（PCR）的方法检测毒力基因,鉴定致泻性大肠埃希菌。结果检测出15株阳性菌株,阳性率为15．8％,其中肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）6株、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）4株、弥散聚集性大肠埃希菌（DAEC）4株和肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）1株。结论致泻性大肠埃希菌是引起儿童腹泻的主要致病菌,临床实验室应加强对致泻性大肠埃希菌的检测。     

2016年福建省永安及南平监测点五种致泻性大肠埃希菌监测分析

目的 对福建永安及南平两个检测哨点2016年的281份腹泻病例进行5种致泻性大肠埃希菌病原检测,为病例的确诊及致泻性大肠埃希菌流行病学的提供实验数据.方法 收集281份其他感染性腹泻病例(排除霍乱、菌痢、伤寒副伤寒)的粪便标本,接种麦康凯平板,选取初步生化符合大肠杆菌的菌落,然后用致泻性大肠埃希菌多重PCR和单重PCR检测方法确定其致病型别.结果 281份腹泻病例粪便标本共检出致泻性大肠埃希菌17株,检出率6.05%,其中aEPEC 4株,ETEC 6株,EAEC 7株,其他型别未检出.结论 福建地区致泻性大肠埃希菌致病型别以aEPEC,ETEC,EAEC为主,多重PCR检测方法能有效的对致泻性大肠埃希菌病进行确诊及了解菌株的毒力基因携带情况,并为我省的致泻性大肠埃希菌的流行病学资料的积累及疾病防控提供快速客观的依据.     

多重PCR快速检测3种致泻性大肠埃希菌方法的建立

目的利用多重聚合酶链反应(PCR)技术,建立一种可以同时快速检测肠致病性大肠埃希菌(EPEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、肠出血性大肠埃希菌(EHEC)3种致泻性大肠埃希菌的多重PCR方法。方法根据EPEC的eae基因、EIEC的ipaH基因、EHEC的stx1基因筛选设计引物,建立多重PCR检测体系,并对PCR反应体系和条件进行优化。结果设计的3对PCR引物均能特异地扩增出相应的目的基因,该多重PCR体系能同时检测3种目的菌,特异度强。结论初步建立了一种能够同时快速检测3种致泻性大肠埃希菌的多重PCR检测方法,可用于食品安全及食物中毒事件的快速筛查。     

长沙市食品从业人员致泻大肠埃希菌实时荧光多重PCR检测结果分析

目的了解长沙市食品从业人员致泻大肠埃希菌感染、分布及毒力基因携带情况。方法抽取长沙市9个单位258例食品从业人员为研究对象,采用实时荧光多重聚合酶链反应(PCR)检测致泻大肠埃希菌。结果致泻大肠埃希菌感染率为15.5%(40/258),其中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)占10.9%(28/258),肠致病性大肠埃希菌(EPEC)占3.1%(8/258),肠出血性大肠埃希菌(EHEC)占1.6%(4/258),未检出肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)和肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)。28株EAEC携带uidA基因26株,aggR+pic基因13株,astA基因27株,携带率分别为92.9%、46.4%、96.4%;8株EPEC全部携带eae和uidA基因;4株EHEC中3株携带eae基因,且都携带stx1+stx2基因。结论建立持续监测致泻大肠埃希菌的机制和深入研究其分子流行病学理论,除了为监管部门制订和评价公共卫生措施提供基础数据,对评价食品安全状况,有效控制传染源、保护人民群众健康具有重要意义。     

江苏省建湖地区大肠埃希菌O157:H7毒力基因分析

目的对检测出的17份肠出血性大肠埃希菌0157：H7阳性菌株进行毒力基因分析。方法收集江苏省建湖地区2008年5月～9月监测出的17株肠出血性大肠埃希菌0157：H7阳性菌株,利用单一和多重PCR法检测不同来源菌株0157抗原编码（rfbE）、H7鞭毛抗原编码（fliC）、志贺样毒素（stx1和stx2）、溶血素（hly）和黏附抹平因子（eaeA）。结果通过血清学方法确定的17株肠出血性大肠埃希菌0157：H7阳性菌株,再通过PCR法检测,其中15株大肠埃希菌rfbE和fliC基因检测为阳性,确认为EHEC O157：H7,其中9株菌株扩增出全部毒力基因,5株菌株扩增出除stxl外其它全部毒力基因,1株仅检出stx2,hly毒力基因;2株大肠埃希菌rfbE基因检测阳性、fliC基因检测为阴性,确认为O157：H7-大肠埃希菌,无毒力基因检出。结论该地区存在O157：H7大肠埃希菌强毒株污染,从流行病学角度看具潜在的流行性危险,当地疾控部门应加强O157：H7的综合监测。     

弥散黏附性大肠埃希菌多重PCR检测方法的建立及其在感染性腹泻患者中的流行情况

目的 建立一种快速检测弥散黏附性大肠埃希菌（DAEC）的普通多重PCR方法,了解DAEC在腹泻患者中的流行情况。方法 根据DAEC黏附基因afaB、afaC、afaD、daaE及16S rRNA基因rrs,建立4重PCR反应体系,对PCR引物、反应体系和反应条件进行优化,评价敏感性和特异性,并应用于389份腹泻患者粪便标本的筛查。结果 4重PCR反应可以特异性扩增DAEC菌株afaB/C、afaD、daaE基因片段,除2株肠集聚性大肠埃希菌（EAEC）外,检测引物对其他致泻性大肠埃希菌及常见肠道病原菌均无特异性扩增,此多重PCR方法的检测下限可达3.20 101 CFU/反应（8.01 103 CFU/ml）。利用本研究建立的多重PCR方法对腹泻患者粪便标本进行检测,发现DAEC菌株分离率为6.2%（24/389）。结论 本研究建立的多重PCR方法可用于DAEC菌株的快速鉴别,也可用于人粪便标本DAEC的初步筛查。     

多重PCR检测肠出血性大肠埃希菌O157：H7

目的 建立一种快速、特异的检测肠出血性大肠埃希菌O157:H7菌株的多重PCR方法。 方法 针对O157:H7菌株的O157、H7抗原特异基因rfbE O157、fliC H7以及stx1、stx2、eaeA和hlyA四种毒力基因设计相应引物,在同一扩增体系中进行PCR反应,通过优化多重PCR 反应条件和循环参数,建立检测O157:H7菌株的多重PCR方法,并测定其特异性和灵敏度。 结果 6 对特异性引物各自扩增相应的基因片段,检测结果与常规PCR 获得的结果一致。细菌纯培养物的检测灵敏度为1.33×10⁴ CFU。 结论 该多重PCR方法能在一次检测中同时反映待测菌株是否为肠出血性大肠埃希菌O157:H7及其携带毒力基因的情况,可为O157:H7大肠埃希菌感染的诊断及流行病学调查提供一种简便、快速的检测手段。     

Identification of Shiga toxigenic Escherichia coli seropathotypes A and B by multiplex PCR

A multiplex PCR assay was developed to identify the six clinically important enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) serotypes classified in seropathotypes A and B and to differentiate these from Shiga toxigenic E. coli. The assay simultaneously detects genes for Shiga toxin (stx) and intimin (eae), including allelic variants of both genes, 16S internal amplification control, as well as unique sequences in the wzx genes that are specific for serotypes O157, O26, O111, O103, O121 and O145. PCR analysis of 40 representative strains showed that the assay correctly identified the virulence genes, if present, and the respective O antigen type of all the strains, including some atypical EHEC, as well as enteropathogenic E. coli and E. coli strains examined.     

Multiplex PCR for detection of trait and virulence factors in enterohemorrhagic Escherichia coli serotypes

A multiplex PCR assay was developed which allowed the simultaneous detection of five trait genes or virulence markers in enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) serotypes. A primer pair, designed to detect a single base-pair mutation in the uidA gene, is specific only for the prototypic EHEC of O157:H7 serotype and its toxigenic, non-motile variants. In a similar way, primers to the eaeA gene of the gamma-intimin derivative specifically detects strains in the EHEC 1 clonal group, which consists mostly of O157:H7 and some O55:H7 serotypes. The other three primer pairs, specific for stx1, stx2 and both variants of ehxA genes, will detect the presence of these virulence genes in all EHEC serotypes. Analysis of 34 strains, including various serotypes of EHEC, Shiga toxin-producing E. coli and enteropathogenic E. coli, confirmed that the multiplex PCR assay detected the presence of these genes in a manner consistent with the known genotype of each respective strains.     

北京市朝阳区腹泻患者致泻性大肠埃希菌流行特征及毒力基因携带情况分析

目的分析北京市朝阳区感染性腹泻样本中致泻性大肠埃希菌（DEC）流行特征及毒力基因携带情况。方法收集2014 — 2017年北京市朝阳区哨点医院感染性腹泻样本,分离培养后应用real-time PCR方法检测DEC的主要毒力基因。 其中利用eae、stx1、stx2、lt、st、aggR和ipaH 7种毒力基因进行DEC的分型鉴定,此外,检测并分析bfpA、astA、escV、pic、perA、ehxA、pet和ipaBCD等重要的毒力基因分布情况。结果从1 977份腹泻样本中共分离出94株DEC,检出率为4.75%。 DEC的检出率具有随年龄增加而升高的趋势。 0 ~ 5岁年龄组肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）和肠致病性大肠埃希菌（EPEC）构成比分别是59.62%、23.08%。 5岁以上年龄组肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）构成比是59.52%。 81.25%EPEC（13/16）未携带bfpA,为非典型EPEC（aEPEC）。 38株EAEC中astA、pic和pet的携带率分别为39.47%、68.42%和92.11%。 30株ETEC的st、lt和astA携带率分别是46.67%、56.67%和53.33%;仅1株（3.33%）ETEC同时含有st和lt。 4株EHEC全部携带 eae、escV和ehxA。 6株肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）中ipaBCD、astA携带率为16.67%和33.33%。结论北京市朝阳区流行的DEC以EAEC、ETEC和EPEC为主,其中EPEC主要为aEPEC。 婴幼儿主要感染EAEC,成年人主要感染ETEC。 DEC中存在多种毒力基因,其中astA广泛存在于多种DEC中。     

Semi-automated fluorogenic PCR assays (TaqMan) forrapid detection of Escherichia coli O157:H7 and other shiga toxigenic E. coli.

Semi-automated detection of Enterohaemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 and non-O157:H7 Shiga toxin-producing E. coli (STEC) was achieved using fluorogenic polymerase chain reaction (PCR). These PCR assays were designed to amplify 80, 120 and 150 bp regions of virulence genes stx1, stx2 and eaeA, respectively, using specific primers. The fluorogenic probes were used for specific detection of amplified products of the stx1 and stx2 genes of STEC, and the eaeA gene of EHEC O157:H7. For multiplex PCR assay, the three sets of primers and fluorogenic probes were included in one reaction to simultaneously amplify and detect any of the three targeted virulence genes. In non-multiplex PCR assay, each of the three virulence genes was amplified and detected in independent reactions. The specificity of these assays was evaluated using suspensions of STEC and other bacterial species lacking stx1, stx2 and eaeA. The multiplex assay detected all STEC harbouring any combination of three virulence genes. Three non-multiplex PCR reactions identified types of Shiga toxin genes carried by a STEC and identified STEC as either EHEC O157:H7 or non-O157:H7 STEC. Sensitivity limits of these assays in beef and faeces inoculated with EHEC O157:H7 were 5.8 to 580 cfu and 1.2 to 1200 cfu, respectively. These assays can be completed within 8-10 h when performed simultaneously or within 13 h if the multiplex assay is used as an initial screen for detecting STEC and the non-multiplex assay is used for subsequent detection of stx1 and stx2 of STEC and eaeA of EHEC O157:H7 Copyright 1999 Academic Press.     

Development of a multiplex polymerase chain reaction assay for diarrheagenic Escherichia coli and Shigella spp. and its evaluation on colonies, culture broths, and stool

Detection of diarrheagenic Escherichia coli (DEC) typically depends on identification of virulence genes from stool cultures, not on stool itself. We developed a multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay that detects key DEC virulence genes (stx1, stx2, eae, bfpA, ipaH, LT, STh, aaiC, aatA). The assay involved a multiplex PCR reaction followed by detection of amplicon(s) using Luminex beads. The assay was evaluated on over 100 colony and broth specimens. We then evaluated the assay using DNA extracted from stool, colony pools, and Gram-negative broths, using stool spiked with known quantities of DEC. Performance of the assay on stool DNA was most quantitative, while stool broth DNA offered the lowest limit of detection. The assay was prospectively evaluated on clinical specimens in Tanzania. Stool DNA yielded higher sensitivity than colony pools compared with broth DNA as the standard. We propose using this assay to screen for DEC directly in stool or stool broths.     

2014－2017年烟台市腹泻病患者中致泻性大肠埃希菌的检测与病原特征分析

目的 了解烟台市腹泻病患者中致泻性大肠埃希菌（DEC）的感染状况和致病型分布特点，对社区和综合医院中两家哨点医院腹泻门诊的腹泻患者进行DEC监测，为DEC的防治提供依据。 方法 采用全自动毛细管电泳仪对生化反应符合DEC特征的菌落进行聚合酶链式反应确认，根据5种DEC特征基因，确定型别。 结果 在1 174例腹泻病患者的粪便中共检出生化反应鉴定为DEC的268株，进行基因确认25株，感染率为2.13%，其中肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）15株，占阳性菌株的60.00%，肠产毒性大肠埃希菌8株、肠致病性大肠埃希菌2株、肠出血性大肠埃希菌和肠侵袭性大肠埃希菌均未检出，毒力基因pic占53.33%，20 ~ 44岁年龄组患者检出率最高（64.00%），6 — 10月检出率为84.00%。 结论 烟台市DEC感染的致病型以EAEC为主，基因型以pic为主，DEC感染年龄主要集中在20 ~ 44岁年龄组，全年均有感染，夏秋季多发，应注意加强季节性防控。      

Multiplex PCR for detection of trait and virulence factors in enterohemorrhagic Escherichia coli serotypes

A multiplex PCR assay was developed which allowed the simultaneous detection of five trait genes or virulence markers in enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) serotypes. A primer pair, designed to detect a single base-pair mutation in the uidA gene, is specific only for the prototypic EHEC of O157:H7 serotype and its toxigenic, non-motile variants. In a similar way, primers to the eaeA gene of the γ-intimin derivative specifically detects strains in the EHEC 1 clonal group, which consists mostly of O157:H7 and some O55:H7 serotypes. The other three primer pairs, specific for stx1, stx2 and both variants of ehxA genes, will detect the presence of these virulence genes in all EHEC serotypes. Analysis of 34 strains, including various serotypes of EHEC, Shiga toxin-producing E. coli and enteropathogenic E. coli, confirmed that the multiplex PCR assay detected the presence of these genes in a manner consistent with the known genotype of each respective strains.