miR-449a：WNT亚型髓母细胞瘤潜在的表观遗传学标志物北大核心CSCD

目的筛选可能受甲基化调控的,与髓母细胞瘤（medulloblastoma,MB）WNT分子亚型相关的微小RNA（miRNA）分子标志物。方法采用NanoString技术对45例原发性MB石蜡样本进行了包含22个经典MB亚型特异性基因的mRNA表达水平的检测,从而对肿瘤进行分子亚型鉴定。同时通过miRNA表达芯片检测去甲基化药物处理前后MB细胞系（Daoy、D283、D341）的miRNA表达情况,筛选出可能受甲基化调控的miRNA分子标志物,并用甲基化特异性PCR（MSP）和即时荧光定量PCR方法对其甲基化状态和表达水平分别进行验证。最后,对照分子亚型找到与MB亚型相关的受甲基化调控的miRNA。结果45例MB除1例无法准确划分亚型外,其余44例中4例为WNT组,8例为SHH组,16例为Group3,16例为Group4。miR-449a在去甲基化药物处理前后的MB细胞系中表达水平具有明显差异,生物信息学分析确认了其启动子区CpG岛的存在,MSP方法进一步证明了部分肿瘤受启动子高甲基化的调控,且WNT亚型MB肿瘤样本中发现miR-449a存在相对高表达。结论基于金标准（NanoString技术）对MB肿瘤进行分子亚型鉴定,并发现miR-449a在MB细胞系中受到甲基化调控,其可能为WNT亚型MB的分子标志物。     

乳腺癌HER2检测的必要性

乳腺癌是一种具有生物学异质性的肿瘤,它包含不同的分子亚型,表现为不同的疾病自然史,具有不同的临床结局.这些与大多源于分子水平的异质性不同.一些有临床意义的分子标志物可为乳腺癌患者提供预后信息,有助于制定个体化治疗方案.人表皮生长因子受体2(HER2)就是这样一个有意义的分子标志物.     

间变性淋巴瘤激酶克隆号1A4抗体在儿童髓母细胞瘤中的表达及其意义

目的探讨间变性淋巴瘤激酶(ALK)克隆号1A4抗体在儿童髓母细胞瘤中的表达及意义。方法采用NanoString技术和测序技术对浙江大学医学院附属儿童医院2014至2017年诊治的44例儿童髓母细胞瘤标本进行分子分型鉴定,同时应用免疫组织化学EnVision二步法检测ALK在44例髓母细胞瘤整张切片中的表达,统计分析蛋白表达与分子分型的关系。结果患者年龄范围0.5~13.0岁,平均年龄5.8岁。男性28例,女性16例。经典型31例,促纤维增生/结节型5例,广泛结节型3例,大细胞/间变型5例。44例儿童髓母细胞瘤除3例无确切划分亚型外,其余41例中5例为WNT型,12例为SHH型,9例为Group 3型,15例为Group 4型。44例肿瘤组织中13例ALK免疫组织化学阳性,阳性率为29.5%,其中强阳性6例、弱阳性7例。ALK蛋白表达与WNT型相关(P<0.01)。WNT型中特征性出现核旁点状阳性。结论ALK克隆号1A4免疫组织化学可辅助儿童髓母细胞瘤分子分型,强阳性且出现核旁点状阳性提示WNT亚型。     

基于结直肠癌活检标本的稳健性肿瘤细胞固有亚型的前瞻性病例分层法

<正>结直肠癌(CRC)活检是准确诊断的基础,也与基于分子分型的临床试验的病例分层相关。共识分子亚型(CMS)和结直肠癌固有亚型(CRIS)的转录特征对于提高患者预后、预测研究的病例分配等方面具有潜在的临床应用价值。然而,其提供可靠分类的能力尚未得到验证,尤其是对治疗前取自多个部位或不同时间点的活检标本。在这项研究中作者通过当前临床和转化研究中所应用的一系列肿瘤取材方     

北方汉族人群HLA-A2亚型分布及p53的合成肽体外诱导CTL反应

目的 研究北方汉族人群中HLA-A2亚型的分布及树突状细胞提呈基于p53基因合成肽体外诱导特异性T杀伤细胞(CTL)反应的影响.方法 利用PCR-SSP技术分析北方汉族人群中HLA-A2基因型及其亚型的分布,并在适当A2亚型背景下,选择与HLA-A201分子具有高亲和性的2个来自p53蛋白及1个来自HBV核心抗原的蛋白合成多肽,将其分别负载到经体外GM-CSF+IL-4刺激增殖的人脐带血树突状细胞(DC)上,诱导自身外周血单个核细胞(PBMC)多肽特异性CTL反应.结果 200例北京正常个体中共有53例HLA-A2型,其中以A201及A207亚型分布最多,亚型分布较分散;在GM-CSF+IL-4刺激下获得的典型DC培养后期加入TNF-α,可增加其HLA-Ⅰ类及Ⅱ类分子的表达;多肽p53149～157,p53264～272,HBVc18～27均可诱导出HLA-A201分子限制的自身PBMC肽特异性的CTL,然而,只有p53264～272经多次刺激才诱导出HLA-A207分子限制的肽特异性CTL.结论 北京人群HLA-A2基因型分布具有独特性;从人脐带血获得的DC肽疫苗可以使自身p53蛋白多肽抗原打破机体的外周耐受状态而诱导出CTL反应;HLA-A2分子个别位置上氨基酸的差异可显著影响其提呈抗原多肽的能力.     

霍奇金淋巴瘤亚型Richter综合征免疫球蛋白重链可变区基因突变及克隆相关性分析

目的 检测霍奇金淋巴瘤(HL)亚型Richter综合征免疫球蛋白重链可变区(IgVH)基因重排、突变、克隆相关性等基因特征及其与预后的关系,初步探讨其可能涉及的分子机制.方法 用基因扫描分析HL亚型Richter综合征及慢性B淋巴细胞性白血病(B-CLL)伴CD30阳性R-S细胞样细胞病例IgVH基因的克隆性重排,测序分析IgVH基因的突变状态及其分子特征;用激光显微切割结合半套式PCR扩增R-S细胞和R-S细胞样细胞的IgVH基因,比较两种肿瘤成分的克隆相关性;用免疫组织化学LAB-SA法检测两种肿瘤中zeta相关蛋白70(ZAP70)、p53、干扰素调节因子4(IRF-4)及EB病毒潜伏膜蛋白-1(LMP1)等因子表达的不同.结果 (1)6例向HL转化及6例向R-S细胞样细胞转化的B-CLL患者中,携带突变型IgVH基因的患者各占5例;(2)4例IgVH基因克隆相关性分析中,与相应B-CLL克隆不相关的2例R-S细胞和1例R-S细胞样细胞表达LMP1.而1例与B-CLL来自相同克隆的R-S细胞样细胞不表达LMP1;(3)HL亚型Richter综合征中B-CLL肿瘤细胞常使用的IgVH基因是VH3和VH4家族,6例中各有2例使用VH4-34和VH3-48基因.结论 (1)转化的HL和R-S细胞样细胞主要与生发中心或生发中心后的B-CLL有关,提示不同类型的Richter综合征可能涉及的发病机制不同;(2)HL与R-S细胞样细胞既可以是B-CLL克隆相关病例,也可以是克隆不相关的病例.而后者可能与B-CLL患者免疫抑制后继发EB病毒感染有关;(3)IgVH基因在HL亚型Richter综合征B-CLL中的偏向性使用,提示抗原在转化中的作用.     

CD44分子与肿瘤

CD44分子在正常淋巴细胞循环中起重要作用。CD44基因选择性剪接导致CD44有多种亚型。CD~(44)变型可提高肿瘤细胞的浸润和转移能力。肿瘤CD~(44)的异常表达可以作为肿瘤早期诊断、肿瘤转移等早期监测的生物学标志物。     

基于泛癌分析法的WASH基因亚型在肿瘤中的意义北大核心CSCD

目的:利用泛癌分析法初步探讨WASH2P、WASH3P、WASH4P、WASH6P、WASH7P、WASH8P、WASH9P在33种癌症中的意义。方法:从TCGA数据库下载33种癌症的转录组数据,利用Perl软件提取WASH2P、WASH3P、WASH4P、WASH6P、WASH7P、WASH8P、WASH9P在33种癌症中的表达水平。采用R软件的limma包鉴定部分肿瘤类型(癌旁样本≥5)中的差异基因,结合TCGA的临床信息,利用Kaplan-Meier和Cox分析WASH亚型的临床预后意义。通过ESTIMATE包探讨WASH与肿瘤免疫浸润微环境的相关性,结合TCGA数据,分析WASH亚型与干细胞指数、免疫亚型间的相关性。最后,分析WASH亚型与单个肿瘤的免疫亚型、干细胞指数、临床分期及肿瘤免疫浸润微环境间的关系。结果:WASH3P和WASH8P在33种癌症类型中总体表达水平相对其他亚型呈高表达。WASH基因亚型在大部分肿瘤中(癌旁样本≥5)显著差异表达,共同协作影响肿瘤进展。生存分析显示其与多种癌症的预后相关(P<0.05)。在大部分肿瘤中,WASH基因亚型与肿瘤干细胞指数呈正相关。WASH基因亚型在C6免疫亚型中低表达,在C1~C4中等水平表达,在C5中高表达。WASH基因亚型表达水平越高,免疫成分、基质成分越少。单肿瘤分析结果显示,在部分单个肿瘤中,WASH基因亚型与TNM分期、免疫亚型、肿瘤微环境、干细胞指数存在相关性。结论:WASH在肿瘤发生发展中扮演重要角色,有望成为多种类型癌症的临床评估标志物。     

短寡核苷酸原位标记和乳头状瘤病毒分型

近年来有关人乳头状瘤病毒 (ＨＰＶ)的研究有了长足的进步 ,特别是在ＨＰＶ的分型以及分型与病理变化的关系上的研究越来越深入[1,2 ] 。目前已经发现有 1 0 0多种不同的ＨＰＶ亚型 ,其中 40种见于肛门和生殖道 ,包括与肿瘤和瘤样病变相关的高危险性ＨＰＶ亚型 (如 1 6、1 8等 )和低危险性ＨＰＶ亚型 (如 6、1 1等 ) [3 ,4 ] 。研究ＨＰＶ分型、定位与宫颈和外阴病变的相互关系 ,对于这些疾病的诊断、治疗和预后判断均具有十分重要的意义。在ＨＰＶ的分子病理检测方面 ,已经建立了几种检测方法 ,包括斑点印记杂交、液相杂交、原位杂交、聚合…     

乳腺小叶肿瘤组织学亚型及其分子病理学研究进展

第5版WHO乳腺肿瘤分类(2019), 将小叶瘤变定义为"起源于终末导管小叶单位(terminal ductal lobular units)失黏附上皮细胞的不典型增生, 伴或不伴有终末导管的派杰样播散"。小叶瘤变包括不典型小叶增生(atypical lobular hyperplasia)和小叶原位癌(lobular carcinoma in situ)。根据细胞形态将小叶原位癌细分为经典型小叶原位癌、旺炽型小叶原位癌和多形性小叶原位癌3种组织学亚型。近年来, 随着分子病理学不断发展, 对组织学形态特征的认识不断深入, 加深了对小叶瘤变及其亚型的研究和分析。本文将对小叶肿瘤各组织学亚型的临床病理学特征和分子病理学等方面进行综述。     

乳腺小叶肿瘤组织学亚型及其分子病理学研究进展

第5版WHO乳腺肿瘤分类(2019), 将小叶瘤变定义为"起源于终末导管小叶单位(terminal ductal lobular units)失黏附上皮细胞的不典型增生, 伴或不伴有终末导管的派杰样播散"。小叶瘤变包括不典型小叶增生(atypical lobular hyperplasia)和小叶原位癌(lobular carcinoma in situ)。根据细胞形态将小叶原位癌细分为经典型小叶原位癌、旺炽型小叶原位癌和多形性小叶原位癌3种组织学亚型。近年来, 随着分子病理学不断发展, 对组织学形态特征的认识不断深入, 加深了对小叶瘤变及其亚型的研究和分析。本文将对小叶肿瘤各组织学亚型的临床病理学特征和分子病理学等方面进行综述。     

髓母细胞瘤的分子分型及预后进展

髓母细胞瘤是常见于儿童的中枢神经系统肿瘤,主要发生于小脑。目前治疗首选手术切除,术后辅以放、化疗。现有的治疗方案使患者总体生存率可达70%。随着分子生物学的发展,将髓母细胞瘤分成4个分子亚型,每个分子亚型有着独特的流行病学、分子生物学及预后特征。     

青岛及周边地区A3、B3亚型的分子机制研究

目的 分析2014年1月~2016年4月青岛及周边地区血型血清学疑似A3或B3亚型样本的分子机制.方法 采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)直接测序的方法分析ABO基因增强子(-3 988 bp~-3 645 bp)、启动子(-149 bp~-2 bp)、外显子1~7及侧翼序列、以及第一内含子中转录因子GATA结合位点(~+5.8 kb)序列,对于有突变的样本再进行单倍型测序确认.结果 2014年1月~2016年4月青岛及周边地区共发现28例血清学疑似A3、B3亚型样本,占同期亚型样本的10.9 %.通过基因序列分析共发现了4例A307、2例B301、1例B310和1例B311.未发现台湾人多见的B303和日本常见的启动子和调控区域突变亚型.结论 青岛及周边地区A3亚型分子机制变化小,B3变化较大,与台湾、日本差别明显,与上海、浙江等国内省市较接近.     

英国医学研究委员会(MRC)拨款支持的分子生物学研究项目

1、伯明翰(Birnlingham)大学尘物化学系教授Sv Perry,ScD FRC PATH:心脏和平滑肌收缩调节的分子机制。 2、布里斯托尔大学(Bristol)细菌学系教授MH Richmo门d ScD:R因子和其他质体的分子和流行病学研究. 3、剑桥(Cambridge)大学化学实验室olgaKe‘“,“ard,ScD F INSTp:生物学上重要的中等大小分子X线结品学观察。 4、敦提(Dunde)大学生物化学系教授PBGarla,飞d MB,phD FRSE:膜的合成和它的控制。 5、爱丁堡(Edingburg)大学分子生物学系JG Seaife,PHD:基因表达的控制。 6、格拉斯哥(Glasgow)大学Beatson肿瘤研究所J pau…     

糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B在肾嗜酸性肿瘤鉴别诊断中的意义

目的探讨糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B(glycoprotein nonmetastatic melanoma protein B, GPNMB)在各种肾嗜酸性肿瘤中的表达情况, 并比较GPNMB与细胞角蛋白(CK)20、CK7、CD117在肾嗜酸性肿瘤鉴别诊断中的价值。方法收集南京大学医学院附属鼓楼医院病理科2017年1月至2022年3月传统类型肾肿瘤嗜酸细胞亚型, 包括22例肾透明细胞癌嗜酸细胞亚型(e-ccRCC)、19例肾乳头状细胞癌嗜酸细胞亚型(e-papRCC)、17例肾嫌色细胞癌嗜酸细胞亚型(e-chRCC)、12例肾嗜酸细胞瘤(RO)和新兴的具有嗜酸细胞特征的肾肿瘤类型, 包括3例嗜酸性实性囊性肾细胞癌(ESC RCC)、3例肾低级别嗜酸细胞肿瘤(LOT)、4例延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌(FH-dRCC)以及5例肾脏上皮样血管平滑肌脂肪瘤(E-AML), 采用免疫组织化学EnVision法染色检测GPNMB与CK20、CK7、CD117在上述肿瘤中的表达情况, 并统计分析其在以上各种肾肿瘤鉴别诊断中的意义。结果 GPNMB在ESC RCC、LOT、FH-dRCC这3种新...     

CPT1基因在肿瘤中的研究进展

肉碱棕榈酰转移酶1(CPT1)是肝脏组织细胞中长链脂肪酸β-氧化的关键调节酶和限速酶。其亚型CPT1A和CPT1C能够促进肿瘤的生长。CPT1A在胶质母细胞瘤、淋巴瘤、食管癌和乳腺癌等多种恶性肿瘤中扩增且高表达,抑制CPT1A活性和表达的药物具有明显的抗肿瘤作用。因此CPT1在肿瘤癌变中具有重要促进作用,可能成为肿瘤诊断的分子标志物和抗肿瘤治疗的新靶点。     

PET特征改变对非小细胞肺癌放射治疗的预测价值

目的:探索~(18)F-FDG PET/CT分子影像代谢特征参数与非小细胞肺癌(NSCLC)放疗近期疗效的关系。筛选早期预测NSCLC放疗近期疗效的有效指标。方法:对21例经病理证实的NSCLC患者进行回顾性研究。所有患者均接受治疗前和治疗后~(18)F-FDG PET/CT扫描。使用Matlab程序重建和分割肿瘤靶区。同时提取患者治疗前后PET/CT图像的4个传统特征,包括最大SUV、最小SUV、平均SUV、SUV峰值,以及5个纹理特征,包括角二阶距、对比度、逆差距、熵和自相关。用Spearman相关系数法分析患者治疗后图像特征变化率与肿瘤体积变化率的相关性。以治疗后1个月肿瘤体积减小≥50%为标准,将患者分为无效组(Group150%)和有效组(Group2≥50%)。最后,通过Mann-Whitney U检验确定PET/CT影像特征变化率是否能区分肿瘤治疗疗效。结果:Spearman相关性分析结果表明逆差距(RS 0.557, P=0.009)和最大SUV(RS 0.468, P=0.033)与肿瘤体积变化率有相关性,其它参数无相关性。Mann-Whitney U检验结果表明,逆差距和最大SUV均具有统计学意义。结论:在所选的9个指标中,逆差距和最大SUV具有较好的预测价值,但本研究是回顾性研究,病例数相对较少,所选特征也较少,缺乏前瞻性。     

乳腺癌分子亚型中CAIX的表达及临床意义

目的：探讨乳腺癌各分子亚型中碳酸酐酶IX(carbonic anhydrase IX,CAIX)的表达及临床意义。方法：采用免疫组织化学检测CAIX在4种不同乳腺癌分子亚型中的表达水平并分析其与临床病理参数的关系。结果：CAIX在管腔A型、管腔B型、HER-2过表达型和基底样型乳腺癌中的阳性表达率分别为6.65%(28/421)、12.50%(7/56)、60.61%(40/66)和32.31%(84/260)。ER阴性的HER-2过表达型及基底样型乳腺癌组织中,CAIX的阳性表达明显高于ER阳性的管腔A型和管腔B型(P<0.001),并且HER-2过表达型乳腺癌组织CAIX的阳性表达率明显高于基底样型相比,差异有统计学意义。CAIX与乳腺癌的组织学分级、淋巴结转移、临床分期及高增殖指数相关(P<0.05),而与患者年龄、是否绝经及肿瘤大小无关。结论：CAIX在不同乳腺癌分子亚型中的表达具有明显差异,可能与ER阴性乳腺癌关系更密切,并在乳腺癌的侵袭、转移中发挥重要作用,可能成为乳腺癌浸润、进展及预后评估的指标。     

通过DNA甲基化测序来破译髓母细胞瘤的基因序列

表观遗传学的改变,DNA甲基化和核染色质结构的破坏,目前被认为是肿瘤发生过程中最普遍的的特征。这种现象也毫无例外的发生在儿童脑的髓母细胞瘤中。尽管从目前基因组学的研究中,对髓母细胞瘤取得较大的进展,然而四种不同分子亚型(WNT、SHH、Group 3及Group 3)间均存在许多不同的特点,许多案例仍缺乏明显的基因启动子。作者对34个人类和5个鼠类动物的髓母细胞瘤,加上8个人类和3个鼠类正常对照组进行深入分析,包括对整个基因组     

乳腺癌中p53、PD-1和PD-L1的表达及相关性分析

目的探讨乳腺癌中肿瘤细胞p53、肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes,TILs)中程序性死亡受体-1(programmed death receptor-1,PD-1)、肿瘤细胞及TILs程序性死亡配体-1(programmed death receptor ligand-1,PD-L1)表达的相关性,及与乳腺癌分子亚型的关系。方法将94例乳腺癌分为四种分子亚型(管腔A型、管腔B型、HER-2过表达型、三阴型),采用免疫组化法检测p53、PD-1和PD-L1的表达,整理并分析数据。结果 p53、PD-1和PD-L1的阳性率分别为63. 8%(60/94)、21. 3%(20/94)、29. 8%(28/94)。p53与PD-1、PD-L1表达之间无明显相关性(r=0. 067,P=0. 517; r=0. 006,P=0. 952)。PD-1与PD-L1的表达呈正相关(r=0. 684,P 0. 001)。四种分子亚型中,p53的阳性率分别为40. 0%(12/30)、73. 3%(22/30)、100. 0%(10/10)、66. 7%(16/24),PD-1的阳性率分别为6. 7%(2/30)、13. 3%(4/30)、40. 0%(4/10)、41. 7%(10/24),PD-L1的阳性率分别为13. 3%(4/30)、20. 0%(6/30)、40. 0%(4/10)、58. 3%(14/24)。不同亚型中p53、PD-1及PD-L1的表达差异均有统计学意义(P=0. 003,P=0. 005,P=0. 002)。p53在HER-2过表达型中的阳性率最高。PD-1/PD-L1均在三阴型乳腺癌中的阳性率最高。结论 p53与PD-1、PD-L1的表达无相关性。PD-1与PD-L1的表达呈正相关,且均在三阴型乳腺癌中表达最高,提示阻断PD-1/PD-L1信号通路有望成为治疗三阴型乳腺癌的研究方向。