数据挖掘分析SLC7A11在食管癌中的表达及通过P53/ROS通路调节细胞铁死亡的意义

目的： 分析溶质运载蛋白7家族成员11（SLC7A11）在食管癌（ESCA）组织中的表达与功能，及对患者生存预后的影响。方法： 基于Oncomine及GEPIA数据库，检索SLC7A11在ESCA组织与正常食管组织中的表达差异；采用GeneMANIA数据库构建有关SLC7A11的蛋白互作网络（PPI），并进行功能注释分析其共同富集的生物学功能；通过KEGG Pathway数据库分析其参与的信号通路；利用R2基因分析可视化平台，绘制Kaplan-Meier函数曲线，分析SLC7A11的表达对患者生存预后的影响。结果： Oncomine及GEPIA数据分析显示，SLC7A11在ESCA组织中mRNA的表达水平较正常组织显著升高（P < 0.05），且高表达组患者生存预后较差，差异具有统计学意义（P < 0.05）；SLC7A11与SLC3A2、BSG、ASNS、PHGDH、TERT、CD44等20种蛋白相互作用，主要富集于氨基酸转运、修饰氨基酸的跨膜转运活性、白细胞游走、多肽抗原绑定等生物学功能；SLC7A11通过P53/ROS信号的活化介导细胞铁死亡信号通路（hsa04216）的调节。结论： SLC7A11在ESCA组织中表达升高，且高表达组患者预后不良；SLC7A11可能通过P53、ROS代谢通路参与细胞铁死亡，有望成为ESCA患者早期诊断、治疗及判断预后的分子靶标。     

基于数据挖掘分析极光激酶A在食管癌中的表达及意义

目的：探讨极光激酶A（AURKA）在食管癌组织中的表达与功能，并分析其对患者生存预后的影响。方法：基于GEPIA及Oncomine数据库检索AURKA在食管癌组织与正常组织中的表达差异；通过STRING网络在线数据库构建有关AURKA的蛋白相互作用（PPI）网络，并将数据导入Cytoscape软件后采用CytoHubba分析插件筛选出核心基因；在GEPIA数据库中，基于TCGA和GTEx数据集分析AURKA与核心基因表达的相关性；采用DAVID网络分析工具对核心基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析；基于R2基因分析可视化平台分析AURKA的表达与食管癌患者生存预后的关系。结果：GEPIA、Oncomine数据库分析显示，AURKA在食管癌组织中的表达较正常组织明显升高（P < 0.05），但与患者肿瘤分期无关（P > 0.05）；AURKA与CDC20（r=0.78）、PLK1（r=0.83）等核心基因的表达呈显著正相关，其生物学功能主要富集于细胞分化、DNA损伤检测点、细胞增殖、负性调控细胞凋亡等；参与细胞周期调控、细胞衰老、P53以及FoxO等信号通路的调节；AURKA高表达组与低表达组患者相比预后较差，差异具有统计学意义（P < 0.05），且核心基因CCNB1、BUB1B、NEK2高表达组患者的生存率也显著低于低表达组（P均 < 0.05）。结论：AURKA在食管癌组织中表达升高，且高表达组患者预后不良；AURKA与CCNB1、NEK2等核心基因共同参与了肿瘤发生相关的功能与通路，AURKA有望成为食管癌患者早期诊断、治疗及判断预后的候选分子靶标。     

TPX2在非肌层浸润性膀胱癌中的表达及其临床意义

目的： 研究Xklp2靶蛋白（TPX2）在非肌层浸润性膀胱癌中的表达及其临床意义。方法： 通过挖掘GEPIA数据库中的研究数据,对TPX2 mRNA在膀胱癌组织中的表达及其与患者生存的关系进行分析;采用免疫组织化学染色检测TPX2蛋白在60例非肌层浸润性膀胱癌石蜡标本组织中的表达,并分析其表达与肿瘤临床病理指标和患者预后的关系。结果： GEPIA数据库分析提示TPX2 mRNA在膀胱癌组织中的表达较正常组织升高（P<0.05）,且TPX2 mRNA高表达组患者的无病生存率较低表达组患者降低（P<0.05）;免疫组织化学染色检测结果显示TPX2蛋白在非肌层浸润性膀胱癌组织中的阳性表达率为75%（45/60）,而在对应的基底组织中,TPX2蛋白表达均为阴性,二者之间的差异具有统计学意义（P<0.01）;且TPX2的表达水平与患者肿瘤数目、肿瘤直径、病理分级及术后复发等病理指标有关（P<0.05）,生存分析提示TPX2高表达的膀胱癌患者的生存期较低表达者短（P<0.05）。结论： TPX2在非肌层浸润性膀胱癌中表达上调,且其表达水平较高的患者预后较差,TPX2可能作为预测非肌层浸润性膀胱癌患者预后的肿瘤标记物。     

基于生物信息学方法分析甲酰肽受体1在胶质瘤中的表达及临床意义

目的：分析胶质瘤与正常组织表达差异的基因,筛选和胶质瘤预后相关的关键基因。方法：通过下载GEO（Gene Expression Omnibus）数据库GSE15824原始数据,利用R语言分析正常组织与胶质瘤组织中差异表达的基因,通过生物信息学分析工具（DAVID、String、Cytoscape、oncomine和GEPIA）对差异表达的基因进行生物学功能、蛋白互作网络（PPI）分析及筛选胶质瘤的预后标志物。结果：共筛选出648个差异表达的mRNAs。差异表达mRNAs的生物学功能主要富集于T细胞的激活,调节白细胞的黏附和细胞的迁移。KEGG信号通路分析显示差异基因主要富集于PI3K/Akt,MAPK和钙离子信号通路。FPR1在胶质瘤中明显高表达,其表达水平与胶质瘤的预后呈负相关（Log-rank P < 0.01）。结论：通过基因芯片数据库的分析,FPR1在胶质瘤中高表达,且与患者生存预后相关,为进一步分子机制的研究提供了新思路。     

溶质载体超家族50蛋白在乳腺癌中的表达及其临床意义

目的：探讨溶质载体家族50蛋白成员1(SLC50A1)在乳腺癌中的表达及其临床意义。方法：选取符合入组标准的乳腺癌患者 39例，使用酶联免疫吸附测定法(ELISA)对入组患者的血浆进行 SLC50A1蛋白浓度检测。分别使用 Kendall's tau-b以及Mann-Whitney U检验对SLC50A1蛋白浓度与患者治疗期间的临床指标进行相关性及差异性分析，并根据log-rank检验结果进行多因素 Cox回归分析。应用生物信息学技术分析 TCGA数据库中乳腺癌组织及癌旁正常组织 SLC50A1基因表达水平的差异。结果：乳腺癌患者血浆SLC50A1水平在早期与晚期患者组、雌激素受体阳性和阴性组、Ki67高表达与低表达组中的差异均有统计学意义(P<0.05)，SLC50A1表达与 CA153水平存在正相关关系(Kendall's tau-b=0.257，P=0.004)。Cox回归分析结果显示 SLC50A1表达水平是乳腺癌患者的独立预后因素(HR=0.385，P=0.03)。TCGA数据库分析结果表明，乳腺癌组织中的SLC50A1基因表达水平较癌旁正常组织升高(P<0.01)。结论：晚期乳腺癌患者血浆 SLC50A1水平升高，SLC50A1表达水平是乳腺癌的独立预后因素，SLC50A1有望作为乳腺癌预后预测与治疗的靶点。     

柠檬酸转运体SLC25A1对食管鳞癌细胞体外放射敏感性的影响及其分子机制

目的： 探讨线粒体柠檬酸转运体SLC25A1对食管癌细胞体外放射敏感性的影响及其分子机制。方法： 采用癌症基因组图谱（TCGA）数据库及UALCAN交互式网络工具比较分析184例食管癌组织与11例正常组织的SLC25A1 mRNA表达水平的差异；采用亚致死剂量X射线多次暴露法建立放射抵抗及对照组食管癌细胞系，放射克隆存活法线性二次靶模型分析两株食管癌细胞株放疗反应性的差异；多次X射线照射（总剂量6.0 Gy）上述两株食管癌细胞后，Hoechst33258染色荧光显微镜观察细胞凋亡形态学变化，流式细胞术检测细胞活性氧水平；免疫印迹法分析慢病毒小发夹RNA稳定转染敲低SLC25A1表达对DNA损伤修复关键信号分子H2AX和DNA-PKcs磷酸化水平的影响。结果： TCGA肿瘤组织数据库比较分析证实，与正常食管组织比较，食管癌组织SLC25A1 mRNA表达水平升高1.65倍（P=1.64×10^-4）；多轮亚致死剂量暴露法构建的放射抵抗食管鳞癌细胞株SLC25A1蛋白表达水平较对照组升高2.36倍（P < 0.05）；与对照组比较，稳定敲低SLC25A1表达的放射抵抗食管癌细胞株凋亡率增加1.58倍（P < 0.05）；活性氧水平下调（65.3±14.3）%（P=0.007）；并下调磷酸化H2AX（Ser139）和磷酸化DNA-PKcs（Ser2056）水平（P均 < 0.05）。结论： SLC25A1可能是一种参与食管鳞癌发病和放射抵抗的癌基因，通过下调活性氧水平，抑制DNA损伤修复，诱导细胞凋亡并可作为食管鳞癌放射增敏的潜在分子靶标。     

柠檬酸转运体SLC25A1对食管鳞癌细胞体外放射敏感性的影响及其分子机制

目的： 探讨线粒体柠檬酸转运体SLC25A1对食管癌细胞体外放射敏感性的影响及其分子机制。方法： 采用癌症基因组图谱（TCGA）数据库及UALCAN交互式网络工具比较分析184例食管癌组织与11例正常组织的SLC25A1 mRNA表达水平的差异；采用亚致死剂量X射线多次暴露法建立放射抵抗及对照组食管癌细胞系，放射克隆存活法线性二次靶模型分析两株食管癌细胞株放疗反应性的差异；多次X射线照射（总剂量6.0 Gy）上述两株食管癌细胞后，Hoechst33258染色荧光显微镜观察细胞凋亡形态学变化，流式细胞术检测细胞活性氧水平；免疫印迹法分析慢病毒小发夹RNA稳定转染敲低SLC25A1表达对DNA损伤修复关键信号分子H2AX和DNA-PKcs磷酸化水平的影响。结果： TCGA肿瘤组织数据库比较分析证实，与正常食管组织比较，食管癌组织SLC25A1 mRNA表达水平升高1.65倍（P=1.64×10^-4）；多轮亚致死剂量暴露法构建的放射抵抗食管鳞癌细胞株SLC25A1蛋白表达水平较对照组升高2.36倍（P < 0.05）；与对照组比较，稳定敲低SLC25A1表达的放射抵抗食管癌细胞株凋亡率增加1.58倍（P < 0.05）；活性氧水平下调（65.3±14.3）%（P=0.007）；并下调磷酸化H2AX（Ser139）和磷酸化DNA-PKcs（Ser2056）水平（P均 < 0.05）。结论： SLC25A1可能是一种参与食管鳞癌发病和放射抵抗的癌基因，通过下调活性氧水平，抑制DNA损伤修复，诱导细胞凋亡并可作为食管鳞癌放射增敏的潜在分子靶标。     

数据挖掘分析MYB家族在乳腺癌中的表达及其预后评估价值

目的：通过数据挖掘分析MYB家族（包括MYB、MYBL1和MYBL2）在乳腺癌中的表达和预后评估价值。方法：利用Oncomine、GEPIA2、cBioPortal、bc-GenExMiner v4.4、Kaplan-Meier Plotter和DAVID数据库分析MYB家族基因在乳腺癌中的表达、变异、临床病理特征相关性、预后意义，并进行功能富集分析。结果：MYB家族在多个数据集中显示其在乳腺癌组织的表达高于正常乳腺组织（P < 0.05）。在乳腺癌中，MYB家族基因主要以基因扩增、mRNA转录增强和转录减弱的方式变异。MYB家族基因表达与乳腺癌患者年龄、分子分型、SBR分级等临床病理特征相关（P < 0.01）。其中，在三阴性乳腺癌、基底细胞样乳腺癌和P53突变型乳腺癌中，MYB低表达、MYBL1和MYBL2高表达（P < 0.01）。MYB低表达和MYBL2高表达的乳腺癌患者无复发生存期和进展后生存期缩短（P < 0.01）。单因素Cox分析结果显示，MYB低表达和MYBL2高表达的转移复发乳腺癌患者预后差（P < 0.01）。多因素Cox分析结果表明MYBL2可作为乳腺癌转移复发的独立预后因子（P < 0.05）。同时，MYBL2共表达基因主要富集于细胞分裂生物学过程和细胞周期信号通路。结论：MYB家族成员在乳腺癌转移复发过程中发挥重要作用，可作为潜在的临床诊断和预后评价标志物，为后续深入开展分子机制研究和药物开发提供了依据和方向。     

基于生物信息学数据库探讨FOXO3基因在膀胱癌中的表达及临床意义

目的：探讨叉头转录蛋白O亚族3（FOXO3）基因在膀胱癌中的表达及临床意义。方法：利用GEPIA数据库分析FOXO3基因在膀胱癌与其癌旁正常组织中的表达情况，及其与患者预后的关系，利用UALCAN数据库分析膀胱癌中FOXO3表达与淋巴结转移的关系；通过TIMER数据库分析FOXO3基因表达与膀胱癌免疫浸润水平的相关性；通过String数据库分析与FOXO3相互作用的蛋白。结果：GEPIA数据库分析结果显示，FOXO3基因在膀胱癌组织中的表达显著低于癌旁正常组织（P < 0.01）；低表达FOXO3基因的患者总生存率（OS）和无疾病生存率（DFS）均显著高于高表达者（P < 0.05）。UALCAN数据库分析结果显示膀胱癌中FOXO3的表达与淋巴结转移无明显相关。TIMER数据库分析显示FOXO3基因表达与B细胞（r=0.133，P < 0.05）、CD8⁺T细胞（r=0.262，P < 0.01）、CD4⁺T细胞（r=0.12，P < 0.05）、巨噬细胞（r=0.252，P < 0.01）、中性粒细胞（r=0.242，P < 0.01）和树突状细胞（r=0.162，P < 0.01）的免疫浸润水平呈正相关。蛋白相互作用网络分析发现，AKT1、SIRT1、EP300、BCL2L11、SOD2、SGK1、AKT2、CREBBP、CDKN1B、SMAD4等蛋白与FOXO3具有明显相互作用。结论：基于肿瘤基因数据库分析发现，FOXO3基因在膀胱癌组织中低表达，其高表达与患者预后不良相关；FOXO3表达与膀胱癌免疫细胞的浸润水平有关。     

基于生物信息学数据库探讨FOXO3基因在膀胱癌中的表达及临床意义

目的：探讨叉头转录蛋白O亚族3（FOXO3）基因在膀胱癌中的表达及临床意义。方法：利用GEPIA数据库分析FOXO3基因在膀胱癌与其癌旁正常组织中的表达情况，及其与患者预后的关系，利用UALCAN数据库分析膀胱癌中FOXO3表达与淋巴结转移的关系；通过TIMER数据库分析FOXO3基因表达与膀胱癌免疫浸润水平的相关性；通过String数据库分析与FOXO3相互作用的蛋白。结果：GEPIA数据库分析结果显示，FOXO3基因在膀胱癌组织中的表达显著低于癌旁正常组织（P < 0.01）；低表达FOXO3基因的患者总生存率（OS）和无疾病生存率（DFS）均显著高于高表达者（P < 0.05）。UALCAN数据库分析结果显示膀胱癌中FOXO3的表达与淋巴结转移无明显相关。TIMER数据库分析显示FOXO3基因表达与B细胞（r=0.133，P < 0.05）、CD8⁺T细胞（r=0.262，P < 0.01）、CD4⁺T细胞（r=0.12，P < 0.05）、巨噬细胞（r=0.252，P < 0.01）、中性粒细胞（r=0.242，P < 0.01）和树突状细胞（r=0.162，P < 0.01）的免疫浸润水平呈正相关。蛋白相互作用网络分析发现，AKT1、SIRT1、EP300、BCL2L11、SOD2、SGK1、AKT2、CREBBP、CDKN1B、SMAD4等蛋白与FOXO3具有明显相互作用。结论：基于肿瘤基因数据库分析发现，FOXO3基因在膀胱癌组织中低表达，其高表达与患者预后不良相关；FOXO3表达与膀胱癌免疫细胞的浸润水平有关。     

基于数据挖掘分析极光激酶A在食管癌中的表达及意义

目的:探讨极光激酶A(AURKA)在食管癌组织中的表达与功能,并分析其对患者生存预后的影响。方法:基于GEPIA及Oncomine数据库检索AURKA在食管癌组织与正常组织中的表达差异;通过STRING网络在线数据库构建有关AURKA的蛋白相互作用(PPI)网络,并将数据导入Cytoscape软件后采用Cyto Hubba分析插件筛选出核心基因;在GEPIA数据库中,基于TCGA和GTEx数据集分析AURKA与核心基因表达的相关性;采用DAVID网络分析工具对核心基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;基于R2基因分析可视化平台分析AURKA的表达与食管癌患者生存预后的关系。结果:GEPIA、Oncomine数据库分析显示,AURKA在食管癌组织中的表达较正常组织明显升高(P<0.05),但与患者肿瘤分期无关(P>0.05);AURKA与CDC20 (r=0.78)、PLK1 (r=0.83)等核心基因的表达呈显著正相关,其生物学功能主要富集于细胞分化、DNA损伤检测点、细胞增殖、负性调控细胞凋亡等;参与细胞周期调控、细胞衰老、P53以及Fox O等信号通路的调节;AURKA高表达组与低表达组患者相比预后较差,差异具有统计学意义(P<0.05),且核心基因CCNB1、BUB1B、NEK2高表达组患者的生存率也显著低于低表达组(P均<0.05)。结论:AURKA在食管癌组织中表达升高,且高表达组患者预后不良;AURKA与CCNB1、NEK2等核心基因共同参与了肿瘤发生相关的功能与通路,AURKA有望成为食管癌患者早期诊断、治疗及判断预后的候选分子靶标。     

ILF2及NF90在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨白细胞介素增强结合因子2(Interleukin enhancer-binding factor 2,ILF2)及核因子90(Nuclear fac-tor 90,NF90)在口腔鳞状细胞癌(Oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达及临床意义.方法 使用免疫组织化学(Im-...     

基于生物信息学方法分析PTGIS基因在膀胱癌中的表达及临床意义

目的:利用Oncomine、GEPIA、LinkedOmics数据库分析前列环素合酶(prostacyclin synthase,PTGIS)在膀胱癌中的表达及与临床预后的关系。方法:应用Oncomine、GEPIA数据库中关于PTGIS研究的数据,对其在膀胱癌中的表达水平变化进行分析。采用GEPIA数据库分析PTGIS表达水平与膀胱癌患者生存预后之间的关系。LinkedOmics数据库分析PTGIS基因表达与膀胱癌临床病理特征的相关性。应用Genecards数据库收集与 PTGIS 基因有关的蛋白,并通过 STRING 绘制PTGIS有关蛋白网络图,分析蛋白富集的生理过程。结果:对Oncomine数据库、GEPIA数据库关于膀胱癌和膀胱正常组织中PTGIS基因差异表达的研究,结果显示膀胱癌组织中PTGIS 基因的表达显著低于膀胱正常组织（P＜0.05）。通过GEPIA数据库生存分析发现PTGIS 基因低表达患者的总体生存率明显高于高表达患者,低表达患者的预后更好（P＜0.05）。通过Genecards数据库收集到与PTGIS有关的蛋白有CYP51A1、PTGES、PTGDS、AKT1、TBXAS1等30个,其有关蛋白富集分析结果显示主要富集在前列腺素代谢、调节活性氧代谢、炎症反应等生理过程。结论:PTGIS基因在膀胱癌中低表达,其表达水平与生存预后相关,PTGIS基因可为膀胱癌的治疗提供参考,为其进一步深入研究提供理论基础。     

基于生物信息学方法分析LAYN在甲状腺癌中临床预后价值及对免疫细胞浸润的影响

目的 探索LAYN基因在甲状腺癌组织中的表达与临床预后的相关性及对免疫细胞浸润的影响,为进一步研究潜在的分子机制提供基础。方法 在Oncomine和GEPIA数据库中检索甲状腺癌相关的基因,分析LAYN基因在甲状腺癌组织与正常组织之间表达的差异。通过GEPIA数据库分析LAYN基因与甲状腺癌患者临床分期及预后的相关性。结合ImmucellAI及TIMER2.0工具分析LAYN基因与甲状腺癌组织中CD4⁺T细胞和CD8⁺T细胞浸润丰度的关系。联合STRING数据库分析LAYN表达相关的蛋白。通过实时荧光定量PCR(RT-PCR)进一步验证检测甲状腺癌组织及癌旁组织,甲状腺癌细胞系SW579,TPC-1及甲状腺上皮细胞TEC中LAYN的表达水平。结果 Oncomine、GEPIA和STRING数据库结果表明,与正常甲状腺组织相比,LAYN基因在甲状腺癌组织中低表达(P＜0.05)。LAYN基因与甲状腺癌临床TNM分期相关(P＜0.05),Ⅲ/Ⅳ期患者肿瘤组织中LAYN基因低表达。LAYN基因高表达组患者总生存期(Overall survival,OS)较差,而无疾病生存期(Disease free survival,DFS)较好(P＜0.05)。在甲状腺癌组织中,CD4⁺T细胞和CD8⁺T细胞的浸润丰度较低,且CD4⁺T细胞和CD8⁺T细胞的浸润丰度与LAYN基因的表达水平呈正相关(P＜0.05)。此外,LAYN相互作用的蛋白为PNRC1,MAGEH1,HAPLN1,SMOC1,PRSS12,HMMR,NF2,TLN2,TLN1,TLE2。RT-qPCR验证结果表明,LAYN在甲状腺癌及甲状腺癌细胞系SW579及TPC-1中低表达(P＜0.05)。结论 LAYN基因在甲状腺癌组织中低表达,且与甲状腺癌患者临床TNM分期及预后相关,可作为预后判断的分子标志物。其潜在机制可能通过影响浸润性免疫细胞丰度发挥作用。为研究甲状腺癌致病机制及靶向药物的开发提供理论依据。     

胰腺癌中CLDN-7的表达及临床意义

目的： 探讨紧密连接蛋白claudin-7 （CLDN-7）在胰腺癌中的表达情况,以及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法： 应用Oncomine、GEPIA和GEO数据库综合分析CLDN-7 mRNA在胰腺癌中的表达水平,应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析胰腺癌中CLDN-7的表达水平与生存预后的关系;选取兰州大学第二医院普外科2015年至2018年手术切除的44例胰腺癌患者的癌组织及31例癌旁组织标本,采用免疫组织化学染色法检测CLDN-7蛋白的表达水平,并分析其与临床病理特征以及预后的关系;GO分析和KEGG通路富集分析 CLDN-7可能参与的信号通路及发挥的主要功能,并且在TCGA和GEPIA数据库中进行验证。 结果： 数据库及收取的临床样本分析均显示,CLDN-7在胰腺癌组织中显著高表达, 其高表达与胰腺癌患者临床预后有关联,并且CLDN-7的表达水平是影响胰腺癌患者术后总体生存时间的独立因素（均P<0.05）;GO分析和KEGG通路富集分析证实,CLDN-7参与胰腺癌患者DNA损伤修复、糖代谢等;TCGA和GEPIA数据库验证显示,胰腺癌中CLDN-7的表达与DNA损伤修复相关基因POLD4、SMUG1、NTHL1 及糖代谢的相关基因 ALDOA、TALDO1、PGLS 的表达呈现出明显的正相关性（均P<0.01）。 结论： CLDN-7在胰腺癌中高表达且标志着更差的临床预后,并与胰腺癌的DNA损伤修复及肿瘤内糖代谢相关。     

基于生物信息学分析ASPH在预测肺腺癌预后中的价值及机制研究

目的:探讨天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)在肺腺癌中的表达情况、预后价值和在癌症中的作用机制。方法:使用Oncomine、GEPIA和TIMER数据库分析ASPH在肿瘤组织和正常组织中的表达差异,并用HPA数据库在蛋白水平验证,推测其临床意义。应用Kaplan-Meier plotter及GEPIA探讨ASPH表达水平与肺腺癌患者总生存时间的关系,提取Oncomine数据库中患者的生存信息加以整理分析,绘制生存曲线,研究ASPH表达水平与预后的关系。绘制ASPH蛋白互作网络,并进行功能富集分析,研究其作用机制。结果:来自Oncomine、GEPIA和TIMER数据库的数据均表示ASPH在肺腺癌组织中显著高表达(P＜0.05),GEPIA数据库还证明了ASPH与肺腺癌患者病理分期显著相关。分析Oncomine数据表明,ASPH表达升高肺腺癌患者的生存时间更短(HR=0.39,95%CI:0.17~0.88,P=0.024 0),GEPIA及Kaplan-Meier plotter分析结果均支持ASPH高表达预示着肺腺癌患者预后更差(P=2.4E-08)。ASPH及相关基因功能涉及钙离子调控及缺氧反应,并参与Notch、mTOR信号通路,影响肿瘤的发生与发展。ASPH还与免疫细胞浸润及相关标志物呈现弱相关性。结论:ASPH在肺腺癌组织中表达明显升高,预示着患者预后不良,且参与多条与癌症相关的信号通路,与免疫细胞浸润呈现弱相关性,ASPH可能是肺腺癌新的预后和潜在治疗标志物。     

基于Oncomine数据库及GEPIA数据库分析CHI3L2基因在胶质母细胞瘤中的表达及与预后的相关性

目的:基于Oncomine数据库及GEPIA数据库分析CHI3L2基因在胶质母细胞瘤中的表达及与预后的相关性。方法:检索Oncomine和GEPIA数据库中相关胶质母细胞瘤的数据集，分析胶质母细胞瘤组织与正常对照组织之间基因表达的差异，采用GEPIA数据库进行在线生存分析。结果:Oncomine数据库中共收集了449项关于CHI3L2基因在肿瘤与正常组织中表达比较的研究结果，表达差异有统计学意义的研究结果有23项，其中有9项研究结果呈高表达，14项研究结果呈低表达。与对照组相比，在胶质母细胞瘤组织中CHI3L2的表达显著高于正常组织（P＜0.05）。结论:CHI3L2在胶质母细胞瘤组织中呈高表达，且与胶质母细胞瘤患者预后相关，为临床胶质母细胞瘤的治疗及基因靶向药物的研制提供重要理论依据。     

基于生物数据挖掘分析DKC1在肝细胞癌中的表达及其与预后的关系

目的:探讨先天性角化不良基因1（dyskeratosis congenita 1,DKC1）在肝细胞癌（HCC）中的表达及预后意义。方法:运用Oncomine、GEPIA分析DKC1在HCC组织中的表达情况,通过GEPIA分析DKC1与HCC患者生存期的相关性,利用STRING工具分析DKC1的蛋白相互作用网络。结果:Oncomine数据库中DKC1基因癌组织/正常组织表达量分析结果共有421项研究,在癌组织中显著高表达48项,低表达0项。其中有2项研究结果涉及DKC1在HCC与正常肝脏组织中的表达。与对照组相比HCC组织中DKC1 mRNA表达显著高于肝脏正常组织（P＜0.05）;利用GEPIA 数据库生存分析功能发现,DKC1高表达与HCC预后呈负相关（P＜0.05）;通过STRING数据库构建蛋白互助网络图显示DKC1与NHP2、GAR1、NOP10、NOP56、NOP58、MPHOSPH10、NHP2L1、FBL、TERT、SHQ1等蛋白具有明显相互作用。结论:DKC1基因在HCC组织中高表达,DKC1表达与HCC患者预后相关,高表达患者预后差。