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相似文献
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1.
施敏  刘富林  夏旭婷  张婷 《世界中医药》2023,(15):2128-2133
目的:借助网络药理学和分子对接技术探讨黄芪治疗慢传输型便秘的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪的活性化合物并预测其作用靶点,借助Cytoscape 3.7.2软件构建黄芪活性成分-靶点网络图;以“slow transit contipation”为关键词在OMIM及GeneCards数据库检索慢传输型便秘相关靶点,并与黄芪化合物作用靶点取交集,将共同靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,将PPI导入Cytoscape 3.7.2进行拓扑分析;利用R语言进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其作用机制;通过Swiss Dock在线分子对接工具对关键靶点进行分子对接。结果:黄芪筛选得到20个活性成分,对应作用靶点189个,与慢传输型便秘的共同靶点143个,交集String数据库和Cytoscape 3.7.2拓扑分析度值靠前的靶标为血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素-6(IL-6)。GO功能富集分析得到生...  相似文献   

2.
目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨地骨皮调血脂的作用机制。方法 使用TCMSP数据库并查阅相关文献确定地骨皮活性成分;采用SwissTargetPrediction、GeneCard和OMIM数据库预测地骨皮活性成分靶点和高脂血症相关靶点,应用Venny 2.1取两者交集;运用Cytoscape 3.8.2软件绘制成分-靶点-疾病网络;应用String数据库构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;将交集靶点输入Metascape数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用Cytoscape3.8.2软件绘制地骨皮活性成分-靶点-通路网络,预测其调血脂作用机制;采用分子对接和细胞实验进一步探究地骨皮的调血脂作用机制。结果 共筛选出地骨皮潜在活性成分14个以及153个交集靶点;GO功能和KEGG通路分析发现主要涉及过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome prol...  相似文献   

3.
目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨寿胎丸治疗复发性流产(RSA)的主要作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库检索寿胎丸所含主要的活性化学成分,并在TCMSP数据库中查询药物成分对应靶点,检索GeneGards数据库获得RSA相关靶点。运用R软件取药物与疾病靶点的交集制成韦恩图,再利用Cytoscape 3.7.2软件将药物-活性成分-靶点-疾病网络可视化,通过STRING数据库获得靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。最后运用R软件对靶点基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共得出主要活性成分21个,寿胎丸与RSA相关靶点共108个,通过GO分析得出133个功能条目,通过KEGG分析得出147条信号通路,涉及细胞因子受体结合、受体配体活动、泛素样蛋白连接酶结合等功能及AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化等通路。分子对接验证显示,寿胎丸的主要活性成分与RSA核心靶点具有较强的结合活性,为二者的相互作用提供了基础。结论:该研究利用网络药理学方法初步揭示了寿胎丸通过多成分、多靶点、多通路治疗RSA的作用机制,预测了寿胎丸可能通过TGF-β、PI3K/AKT、MAPK、JAK-STAT等通路保护妊娠,为进一步临床及实验研究提供了良好的理论依据。  相似文献   

4.
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨半夏治疗糖尿病胃轻瘫(DGP)的可能作用机制。方法:从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中检索半夏的活性成分和对应靶点,利用SwissTargetPrediction对半夏活性成分进行靶点预测补充;从Genecards、TTD、NCBI数据库中检索DGP相关靶点基因;取半夏活性成分与DGP的交集靶点,利用Cytoscape 3.8.0构建“半夏活性成分-交集靶点”网络;借助Cytoscape 3.8.0的BisoGenet构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络图,利用CytoNCA对PPI网络进行拓扑分析并筛选核心靶点;借助ClueGO对核心靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因组与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Autodock 4.2软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:半夏13个活性成分靶点与DGP相关靶点的交集靶点共68个;PPI网络拓扑分析得到核心靶点327个;核心靶点的GO功能富集分析显示其与黏着斑、泛素蛋白连接酶结合及mRNA分解代谢过程等调控相关;KEGG通路富集分析显示其与细胞周期、甲状腺激素信号...  相似文献   

5.
目的 基于网络药理学方法探讨怀牛膝治疗高血压的作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选怀牛膝的有效成分及相应的靶蛋白,通过Genecards、OMIM数据库获取高血压的靶点,利用Venn在线软件获取怀牛膝-高血压交集靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件构建“化合物-靶点-疾病”网络图。使用String数据库绘制蛋白互作(PPI)网络,利用David数据库和R语言3.6.3中clusterProfiler包对关键靶点进行GO功能富集及KEGG通路分析,通过分子对接技术将怀牛膝主要活性成分与关键靶点进行对接验证。结果 共筛选出怀牛膝潜在活性成分16个,有效作用靶点183个。通过Venn图获得76个药物疾病共同靶点,PPI网络发现IL6、AKT1、VEGFA、CCL2、MMP9、NOS3、PTGS2等可能是怀牛膝治疗高血压的关键靶点。GO分析共包含396条富集结果,其中生物过程307条,分子功能54条,细胞组成35条。KEGG通路分析发现60个条目。分子对接筛选得到与靶点有结合潜力的化合物。结论 怀牛膝通过“多成分-多靶点-多途径”发挥降压作用,为深入研究其物质基...  相似文献   

6.
目的:采用网络药理学的方法预测三棱-莪术药对治疗子宫内膜异位症(EMT)的主要活性成分、靶点及信号通路,探讨其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索三棱-莪术药对的中药化学成分,以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值筛选潜在的活性化合物;通过TCMSP查询活性化合物对应的靶标;运用GeneCards和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)预测疾病靶点;利用韦恩图找到活性成分靶点和疾病靶点的交集靶点;使用Cytoscape 3.7.2软件构建疾病-药物-有效成分-靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;采用String在线数据库和Cytoscape软件绘制交集靶点PPI网络;最后借助R软件和Bioconductor生物信息软件包进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并使用Cytoscape软件绘制靶点-信号通路网络图。结果:筛选得到三棱-莪术活性成分8个,对应靶点77个,EMT相关靶点1 600个,交集靶点34个。GO功能富集分析结果显示三棱-莪术药对可影响1 054个生物学过程、22个细胞组分和65个分子功能。KEGG通路富集分析得到91条通路,三棱-莪术药对治疗EMT主要与雌激素信号通路、IL-17信号通路、AGE-RAGE信号通路、甲状腺激素信号通路、P53信号通路等有关。结论:三棱-莪术药对治疗EMs具有多靶点、多途径、多通路的特点。  相似文献   

7.
目的:采用网络药理学方法及分子对接技术研究清热祛湿汤治疗膝骨关节炎的作用机制。方法: 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP) 数据库检索清热祛湿汤药物成分靶点; 通过TTD、 Genecards、OMIM 数据库检索膝骨关节炎靶点;制作韦恩图获取药物-疾病交集靶点;通过Cytoscape3.9.0 软件 绘制药物有效成分-疾病-共同靶点网络图;利用String 数据库构建蛋白相互作用(PPI) 网络;使用R 语言软 件对交集靶点进行基因本体(GO) 富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG) 富集分析; 使用 AutoDockTools1.5.6 等软件对药物主要有效成分与疾病核心靶蛋白进行分子对接验证。结果:清热祛湿汤的有 效成分为槲皮素、木犀草素等;PPI 网络构建获得的核心靶蛋白是蛋白激酶B 抗体(AKT1)、纤溶酶原激活物 抑制物1 (SERPINE1) 等;GO 富集分析获得1 902 条GO 条目;KEGG 富集分析获得105 条信号通路;将 5 种药物有效成分与5 种核心靶蛋白进行分子对接,均具有较好的结合活性。结论:清热祛湿汤治疗膝骨关节 炎具有多成分、多靶点、多途径的特点,具体通过发挥调控炎症反应、软骨基质降解、软骨细胞的凋亡和增殖 等作用,延缓膝骨关节炎的进展。  相似文献   

8.
王钦  金智华  蔡亮亮 《新中医》2024,56(8):189-197
目的:采用网络药理学方法和分子对接技术分析胆通胶囊治疗胆汁淤积症的作用机制。方法:使用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)、PharmMapper和Uniprot数据库搜索胆通胶囊的活性成分及作用靶点。使用GeneCards数据库获取胆汁淤积症的靶点。绘制韦恩图得到药物-疾病交集靶点。利用Cytoscape 3.10.0软件构建胆通胶囊活性成分-靶点网络,得到胆通胶囊的主要活性成分。将主要活性成分、药物-疾病交集靶点通过STRING数据库与Cytoscape 3.10.0软件进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析,得到核心靶点。利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用PubChem数据库与PyMol、AutoDockTools软件将胆通胶囊主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:共收集胆通胶囊的活性成分25个,获得疾病靶点1 039个。韦恩图显示,药物-疾病的交集靶点92个。胆通胶囊活性成分-靶点网络分析结果显示,苏齐内酯、决明内酯、番泻苷E、20-殷金醇棕榈酸、(-)-儿茶素和...  相似文献   

9.
目的 基于网络药理学及分子对接方法探讨大豆异黄酮(SI)治疗骨质疏松(OP)的可能作用机制。方法 通过文献检索收集SI所含成分,并利用SwissADME数据库根据Lipinski类药五原则评估各成分的药代动力学参数,筛选SI有效活性成分。通过STITCH及SwissTargetPrediction数据库预测SI有效活性成分的作用靶点;通过TTD、DrugBank及DisGeNET疾病数据库获取OP疾病相关靶点。将SI活性成分靶点与OP疾病相关靶点导入Draw Venn Diagram在线平台,得到两者交集靶点(共同靶点),即SI治疗OP的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建SI治疗OP的“活性成分-潜在作用靶点”网络。通过STRING数据库和Cytoscape软件对交集靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析,并用cytoHubba插件筛选出核心靶点。利用Metascape平台对交集靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina软件对SI有效活性成分与核心靶点进行分子对接。结果 共收集大豆异黄酮成分12种,通过SwissADME数据库筛选出3种有效...  相似文献   

10.
目的 基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制.方法 通过数据库检索文献获取罗布麻活性成分、作用靶点、抑郁相关靶点,采用String数据库构建蛋白互作用网络,Cytoscape 3.8.1软件构建成分-靶点-疾病网络,Bioconductor生物信息软件包进行GO功能富集和KEGG通路分析,DockVina分子对接...  相似文献   

11.
张帆  王嘉陵  钱家庆 《中草药》2000,31(10):753-755
采用4种药物及冠动脉结扎诱发的在体动物心律失常模型,比较了异莲心碱和奎尼丁的抗心律失常效果,证实了异莲心碱对抗多种实验性心律失常,且作用优于奎尼丁。采用标准微电极法,研究了异莲心碱对豚鼠右心室乳头状肌的快、慢反应动作电位的影响,结果表明异莲心碱降低APA、Vmax,缩短APD50。提示其抗心律失常作用机制可能与阻滞Ca^2+、Na^+电流有关。  相似文献   

12.
A selection of essential oils obtained by steam distillation from scented-leaf Pelargonium species, hybrids and cultivars were assessed for their method of spasmolytic activity in vitro using an isolated smooth muscle preparation. Their mechanism of action was postsynaptic and not atropine-like. The spasmolytic action was correlated with the chemical composition of the essential oils assessed by gas chromatography and mass spectroscopy. The spasmolytic effect of Pelargonium essential oils with a rose-like odour was most likely mediated through cAMP, and not through cGMP; the action of all other essential oils with diverse odours was neither through cAMP, cGMP, nor via calcium channel blockade or potassium channel activation. The mechanism of action of the main components of the rose-like pelargoniums, citronellol and geraniol, reflected that of the whole oils. © 1998 John Wiley & Sons, Ltd.  相似文献   

13.
淫羊藿苷是天然中药淫羊藿的主要有效成分之一,具有抗血管平滑肌细胞迁移和增殖、抑制炎症反应、抗氧化应激反应、抗细胞程序性死亡、抑制内皮间质化、抗肺血管重塑和抗心肌纤维化等作用,可通过调控多个信号转导通路中的靶点防治心血管疾病。本文以淫羊藿苷防治心血管疾病的作用机制进行归纳总结,为临床新药开发提供参考依据。  相似文献   

14.
中药源于自然,治疗疾病有自身的优势和特点,其作用方式一直是中药研究者们不断研究和探索的重要内容。本文从中医的“整体观”对中药起效机制进行深入思考,认为中药成分多样可契合生物多靶,而生物靶标之间的协同作用是中药起效机制的重要补充;此外,中药对情志及肠道菌群稳态的调节作用也不容忽视,或许可为今后开展中药作用机制的研究提供新的思维和方法。  相似文献   

15.
芍药甘草汤及其组成的镇痛泻下作用   总被引:6,自引:0,他引:6  
结果表明:白芍是君药,甘草是臣药和佐药;白芍与甘草的剂量配比以2∶1为最佳;生甘草与白芍配伍会使白芍的镇痛作用消失;芍药甘草汤的镇痛部位在外周;芍药甘草汤有泻下作用。  相似文献   

16.
赵珏  吴少俊  王卫星 《光明中医》2014,(6):1345-1348
急性冠脉综合征是冠心病中急性发病的临床类型,造成心肌急性缺血性损伤。近年来,随着溶栓疗法、经皮冠状动脉介入技术( Percutaneous coronary intervention ,PCI)、动脉搭桥术等方法的建立和推广,明显的减少了心肌由于缺血导致的细胞坏死,但缺血心肌恢复血流后,出现的心肌缺血再灌注损伤已成关注重点。本文主要从中医药对心肌缺血再灌注损伤干预机制及相关的临床研究进行阐述。  相似文献   

17.
孙伟  王钢  曾安平 《辽宁中医杂志》2001,28(12):739-740
肾炎灵颗粒剂能改善慢性原发性肾小球疾病患者的血液流变学指标 ,说明有改善全身和肾组织微循环的作用 ,分析这可能是其临床疗效作用机理的一个组成部分。  相似文献   

18.
卵巢癌在女性生殖器官恶性肿瘤中的发生率及病死率均较高,传统的治疗手段包括手术治疗、化学药物治疗(化疗)、放射线治疗及上述治疗方式的联合应用。近年来发现我国传统中药成分如金雀黄素、薏苡仁、植物固醇类、姜黄素、五羟黄酮、人参皂苷等可在体内和(或)体外发挥对卵巢癌细胞的抑制增殖、诱导凋亡、增加对化疗药物的敏感性等抗癌作用。其作用机制涉及到抑制细胞代谢关键酶活性、影响细胞基因表达、抗氧化、抑制肿瘤新生血管形成等方面,其作为卵巢癌的一种辅助治疗手段,有着广阔的临床应用前景。  相似文献   

19.
车前子的药效学研究   总被引:15,自引:2,他引:15  
张振秋  李锋 《中药材》1996,19(2):87-89
车前子能明显降低皮肤及腹腔毛细血管的通透性,降低红细胞膜的通透性,表明车前子具有一定的抗炎作用;车前子又能明显提高SOD活力,降低LPO含量,升高半数溶血值(HC_(50)),延长游泳时间,增强抗缺氧能力,表明车前子具有一定的抗衰老作用;同时,车前子能提高肠道内水分,提高炭末推进百分率,改善排便情况,具有一定的致缓泻作用。  相似文献   

20.
目的:研究乳香-没药药对治疗类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)的作用机制。方法:依托GEO、GeneCards、OMIM数据库挖掘RA相关基因并进行合并。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索乳香-没药的有效化学成分和相关靶点,使用Cytoscape 3.8.0软件绘制“药物-成分-靶标-信号途径”的可视化网络。运用STRING数据库构建化合物靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。运用R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:GEO、GeneCards、OMIM数据库筛选出类风湿性关节炎相关基因4 655个,共筛选出乳香-没药药对主要活性成分46个,对应靶点90个。获得乳香-没药治疗类风湿性关节炎的靶点60个,核心靶点6个。此外,KEGG通路富集结果主要包括流体剪切应力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、白细胞介素-17信号通路。结论:乳香-没药药对可通过多靶点、多通路来治疗类风湿性关节炎。  相似文献   

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