独活-牛膝药对治疗膝骨关节炎的网络药理学机制及实验验证

【目的】应用网络药理学及分子对接技术探讨独活-牛膝药对治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制，并通过体外实验进行验证。【方法】检索TCMSP、中国药典、BATMAN-TCM数据库获取独活、牛膝的活性成分，筛选去重后应用TCMSP数据库确定作用靶点，运用GeneCards和OMIM数据库筛选KOA相关的靶点。采用Cytoscape构建药物活性成分-KOA-靶点网络模型并进行分析；运用STRING数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络，通过R 4.0.2软件对交集靶点进行基因本体论（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集；运用AutoDockTools对前5位的核心靶点进行分子对接。进而通过体外细胞实验验证有效成分槲皮素对核心靶点的调控作用。【结果】通过筛选得到14个有效活性成分、171个活性成分靶点、2 040个KOA靶点和99个交集靶点。GO分析结果显示独活-牛膝药对治疗KOA关键靶点的生物功能主要涉及炎症反应、细胞代谢、调节蛋白激酶及磷酸酶活性等。KEGG通路主要富集到肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、癌症通路等。分子对接结果显示独活...     

基于网络药理学研究“当归-鸡血藤”药对治疗肾性贫血的作用机制

目的 基于网络药理学研究“当归-鸡血藤”药对治疗肾性贫血的活性成分、潜在靶点及可能作用机制。方法利用TCMSP数据库和Uniprot数据库检索并筛选得到“当归-鸡血藤”药对主要活性成分及其作用靶标。通过Drugbank、Genecards及OMIM数据库收集肾性贫血相关靶标,对肾性贫血药物靶标和相关基因取交集,运用STRING数据库构建蛋白质互作（PPI）网络图,利用Cytoscape 3.6.0软件构建“药物-活性成分-靶点”网络模型。使用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析并可视化,并用Autodock＿vina和Pymol软件对蛋白和活性成分进行分子对接。结果 获得“当归-鸡血藤”药对中24个活性成分,相关潜在靶点140个,肾性贫血相关靶点992个,交集靶点44个;其主要作用于MAPK1、TP53、TNF、CASP3等多个靶标,涉及包括HIF-1、PI3K/Akt、TNF在内的99条信号通路发挥治疗肾性贫血作用。分子对接结果显示木犀草素与TP53、STAT3等关键靶点有较好的结合能力。结论 从网络药理学的角度对“当归...     

基于网络药理学研究补阳还五汤治疗脊髓损伤的作用机制

目的 基于网络药理学、分子对接验证补阳还五汤治疗脊髓损伤的作用机制。方法 通过TCMSP、SymMap、PubChem、Swiss Target Prediction数据库筛选补阳还五汤的活性成分和靶点。从OMIM、GeneCards、TTD、DrugBank数据库检索脊髓损伤的靶点。通过venny软件获取补阳还五汤与脊髓损伤的交集靶点。用Cytoscape软件构建补阳还五汤治疗脊髓损伤的活性成分-靶点网络。通过DAVID数据库对共同靶点进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析，分子对接技术分析药物与靶点的结合能力。结果 共得到补阳还五汤中活性成分106个，作用靶点225个，脊髓损伤靶点1315个，药物-疾病交集靶点112个。补阳还五汤主要通过槲皮素、山柰酚、鞣花酸、木樨草素、常春藤皂苷元等药物活性成分治疗脊髓损伤。结论 补阳还五汤可通过多种信号通路达到治疗脊髓损伤的目的。     

基于网络药理学与分子对接技术探讨黄芪建中汤治疗腹泻型肠易激综合征的作用机制研究

背景 肠易激综合征（IBS）是一种常见的复杂性功能性胃肠病，临床治疗效果欠佳。中药黄芪建中汤治疗腹泻型肠易激综合征（IBS-D）临床运用普遍且疗效肯定，但确切机制尚不十分明确，相关研究亦不多见。 目的 通过运用网络药理学和分子对接技术，初步探讨黄芪建中汤治疗IBS-D的潜在作用机制。 方法 通过TCMSP数据库获取黄芪建中汤的活性成分和潜在作用靶点，利用GeneCards、OMIM、TTD、Drug Bank、PharmGKB数据库获取IBS-D靶点，对疾病靶点和药物靶点取交集，获取黄芪建中汤治疗IBS-D的潜在靶点。使用Cytoscape软件、String数据库、Metascape数据库分别绘制"药材-活性成分-靶点"网络图、构建蛋白相互作用（PPI）网络和基因本体论（GO）功能及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析，利用AutoDock Vina和PyMOL进行分子对接和结果的可视化。 结果 最终得到黄芪建中汤活性成分123个，潜在靶点247个，IBS-D相关靶点3 486个，药物与疾病的交集靶点180个。GO功能富集分析中生物过程得到2 376个条目，分子功能得到194个条目，细胞成分得到115个条目；KEGG信号通路富集分析获得丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、核因子κB（NF-κB）信号通路、cAMP信号通路、雌激素信号通路等通路。分子对接显示，黄芪建中汤治疗IBS-D的主要活性成分槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、刺芒柄花素、豆甾醇、毛蕊异黄酮、7-O-甲基-异微凸剑叶莎醇与核心蛋白丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、细胞肿瘤抗原p53（TP53）、肿瘤坏死因子（TNF）、白介素（IL）-6、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）、IL-1B、表皮生长因子受体（EGFR）、连环蛋白β1（CTNNB1）有较好的结合性。 结论 黄芪建中汤可能通过增强肠屏障功能、降低内脏敏感性、减轻炎性反应、调节肠道菌群起到治疗IBS-D的作用。     

基于网络药理学研究抵当芪桂汤治疗糖尿病周围神经病变的潜在机制

目的 利用网络药理学及分子对接技术分析抵当芪桂汤治疗糖尿病周围神经病变的作用机制。方法通过TCMSP、HERB数据库筛选出抵当芪桂汤的有效成分;使用UniProt数据库下载相关基因靶点。通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB、DrugBank数据库筛选出糖尿病周围神经病变的基因靶点;取抵当芪桂汤药物成分与糖尿病周围神经病变的交集靶点,根据交集靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）代谢通路分析;通过分子对接实验进行验证。结果 筛选得到抵当芪桂汤有效化合物123个,药物与疾病的交集靶点214个,通过网络图分析得到抵当芪桂汤治疗糖尿病周围神经病变有效药物成分为槲皮素（quercetin）、熊果酸（ursolic acid）、D-甘露醇（D-mannitol）、山柰酚（kaempferol）等,有效基因靶点为SRC、STAT3、MAPK3、PIK3CA、MAPK1和AKT1等,主要涉及通路为PI3K-AKT信号通路、脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症、内分泌抵抗、HIF-1信号通路等;分子对接结果表明：槲...     

土茯苓复方治疗口腔鳞状细胞癌的作用机制研究

目的 基于网络药理学研究土茯苓复方治疗口腔鳞状细胞癌（OSCC）的活性成分及其潜在靶点和可能的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台和通用蛋白质资源数据库检索并筛选得到土茯苓复方的主要活性成分及其作用靶标。通过癌症基因组图谱数据库获得OSCC表达谱和临床资料，分析OSCC与正常组织间的差异表达基因，并通过Gene-cards和OMIM数据库收集OSCC相关基因，对药物作用靶标和疾病相关基因取交集获得潜在治疗靶点。利用STRING数据库和Cytoscape3.9.1软件构建蛋白质互作网络图和“OSCC靶点-药物活性成分”网络模型。对潜在治疗靶点进行基因本体分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析，并评估关键作用靶点与OSCC患者预后的关系。最后用Autodock_vina和Pymol软件进行最关键作用靶点和有效成分的分子对接。结果共获得土茯苓复方治疗OSCC的潜在治疗靶点141个。土茯苓复方主要通过丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、丝苏氨酸特异性蛋白激酶（AKT）1、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）、血管内皮生长因子A基因（VEGFA）、IL-1β、表皮生长因子受体（EGFR）等多个靶标，涉及包括TNF、IL-17、缺氧诱导因子-1α（HIF-1α）、NF-κB在内的多条信号通路发挥治疗作用。大多数治疗靶标与OSCC患者预后显著相关，其中与总生存期显著相关的靶标有9个，与无进展生存期显著相关的靶标有7个。分子对接结果显示柚皮素与MAPK3，β-胡萝卜素、山奈酚与CASP3结合能力较强。结论土茯苓复方中包括柚皮素、β-胡萝卜素和山奈酚在内的8个主要活性成分，可通过MAPK3、AKT1和CASP3等多条信号通路作用于OSCC的141个靶点，有助于OSCC治疗药物的研发。     

基于网络药理学和分子对接的三九胃泰颗粒抗炎镇痛作用机制研究

目的:基于网络药理学探讨三九胃泰颗粒抗炎镇痛的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库和相关文献筛选出三九胃泰颗粒的活性成分，并对其活性成分作用靶点进行预测，运用Cytoscape软件构建“三九胃泰颗粒-潜在活性成分-靶点”网络。通过GeneCards数据库收集炎症、疼痛相关靶点并与药物靶点相交集。通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析，京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集、基因本体(GO)分析于DAVID数据库中进行。Cytoscape软件构建“三九胃泰颗粒潜在活性成分-炎症疼痛相关靶点-通路”网络。AutoDockTools和PyMOL软件用于三九胃泰颗粒抗炎镇痛核心成分和核心靶点的分子对接。结果:共获取三九胃泰颗粒的潜在活性成分73种，其中核心活性成分15个，包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等；三九胃泰颗粒发挥抗炎镇痛作用的核心靶点22个，包括PTGS2、HSP90AB1、PTGS1等，参与药物的应答、炎症应答、MAPK级联的正调节等生物过程，涉及脂质和动脉粥样硬化、TNF、PI3K-AKT、MAPK等信号通路。核心成分槲皮素、山柰酚、β-...     

基于参芪地黄汤治疗膜性肾病作用机制的网络药理学和分子对接技术分析

目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨参芪地黄汤治疗膜性肾病（MN）的作用,并阐明其机制。 方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选参芪地黄汤中7味中药所含有效成分及相应的靶蛋白,采用GeneCards数据库、孟德尔OMIM数据库和Drugbank数据库获取MN的相关基因靶点,采用Cytoscape软件构建“药物-化合物-靶点”网络,采用STRING 数据库和 Cytoscape 软件制作蛋白相互作用（PPI）网络,并进行拓扑学分析寻找核心靶点,采用分子对接软件对核心靶点与作用于核心靶点的活性成分进行分子对接,筛选出参芪地黄汤治疗MN的核心成分,采用 Bioconductor R 软件进行靶点基因本体论（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。 结果 经筛选后获得参芪地黄汤的有效活性成分55个,药物作用靶点214个,MN相关靶点3 655个,获得药物疾病共同靶点144个,其中核心靶点5个,分别为蛋白激酶B1（AKT1）、表皮生长因子（EGF）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、肿瘤蛋白P53（TP53）和表皮生长因子受体（EGFR）;基于分子对接技术筛选出3个潜在核心成分,包括槲皮素、木犀草素和薯蓣皂素;GO富集分析得出2 268个生物学过程、53 个细胞组成、175个分子功能;KEGG通路富集分析发现169条相关信号通路。 结论 参芪地黄汤可能通过降低炎症水平、抑制肾脏纤维化和维持肾小球滤过屏障的完整性等机制发挥对MN的治疗作用。     

基于生物分子网络调控研究柴芪益肝方治疗肝纤维化的作用机制

目的基于生物分子网络研究柴芪益肝方治疗肝纤维化的作用机制。方法检索TCMSP、TCMID、Swiss Target Prediction数据库,挖掘柴芪益肝方的潜在活性成分及其作用靶点,并基于OMIM和Gene Cards数据库筛选肝纤维化的相关靶点。运用String数据库和Cytoscape软件对PPI进行可视化及拓扑学分析。借助clusterprofile对交集靶点行GO分析以及KEGG富集分析,运用Autodckvina软件进行分子对接。结果筛选出柴芪益肝方137种潜在活性成分以及257个对应靶点,肝纤维化相关靶点6807个,其抗纤维化作用可能与丝裂原激活蛋白激酶MAPK1/3/8、原癌基因酪氨酸激酶Src、激活子蛋白c-Jun、热休克蛋白HSP90α、表皮生长因子受体、p53抑癌基因、血管内皮生长因子、连环蛋白β1、肝细胞生长因子等靶点有关。柴芪益肝方抗纤维化的靶点显著富集于PI3K-Akt、TNF、IL-17、MAPK/NF-κB、HIF-1α/VEGF等信号通路中。分子对接结果表明,柴芪益肝方的主要活性成分槲皮素、白藜芦醇、山柰酚、木犀草素、丹参酮ⅡA等对丝裂原激活蛋白激酶MAPK1/3/8、原癌基因酪氨酸激酶Src、激活子蛋白c-Jun、热休克蛋白HSP90α、表皮生长因子受体、p53抑癌基因、血管内皮生长因子、连环蛋白β1等靶点表现出显著性亲和作用。结论柴芪益肝方中槲皮素、白藜芦醇、山柰酚、木犀草素、丹参酮ⅡA等活性成分可能作用于丝裂原激活蛋白激酶MAPK1/3/8、原癌基因酪氨酸激酶Src、激活子蛋白c-Jun、热休克蛋白HSP90α、表皮生长因子受体、连环蛋白β1、肝细胞生长因子等靶点,参与PI3K-Akt、TNF、IL-17、MAPK/NF-κB、HIF-1α/VEGF等信号通路,调控氧化应激反应、肝脏炎症反应、肝再生等生物过程,最终发挥治疗肝纤维化的作用。     

Network Pharmacology and Molecular Docking Study of Tongmai Zhuyu Decoction(通逐瘀汤) in Treatment of Atherosclerosis

目的:采用网络药理学与分子对接技术探讨通脉逐瘀汤治疗动脉粥样硬化(AS)的潜在作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库(TCMSP)、分子机制的生物信息学(BATMAN)数据库、通用蛋白质资源(Uniprot)数据库获得通脉逐瘀汤的活性成分及其作用靶点;通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(Gene Cards)数据库、基因疾病关联(DisGeNET)数据库和毒性与基因比较(CTD)数据库获取AS的相关靶点并与通脉逐瘀汤作用靶点取交集;基于Cytoscape软件构建通脉逐瘀汤治疗AS的化合物-靶点-疾病网络并进行网络拓扑学分析;通过检索交互基因搜索工具(STRING)数据库构建靶点蛋白质交互作用(PPl)关系网络并进行网络拓扑学分析;利用AutoDock Vina软件进行分子对接模拟;最终利用Bioconductor中的R包Cluster-profile version 3.12.0对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:共筛选到279种活性成分和586个靶点;分子对接模拟发现,川陈皮素、(+)-儿茶素、黄芩素等活性成分与关键靶点的结合活性较好;GO富集分析结果共有1749个GO条目,其中1627个生物过程条目、30个细胞组分条目和92个分子功能条目;KEGG通路富集分析结果共有94条通路,主要有低氧诱导因子-1 (HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、钙离子信号通路等通路.结论:通脉逐瘀汤可通过多成分、多靶点、多通路参与治疗AS.     

"一个目标"和"三个改进"--关于提高德育课教学效果的思考

德育课作为学校对学生进行德育的专设课程，有着不同于一般文化课程教学的特殊规律和方法．在教学内容已作系统规定的情况下，教学效果的好坏，往往取决于对这些规律和方法的运用。笔者以为，提高德育课的教学效果，应着力于树立“一个目标”和在“三个改进”上下功夫。     

“直”与“真”的思考

《小儿药证直诀》一书为我国现存第一部儿科专著,作者对书名中"直"怀有疑问,思考后提出三个假设。通过查阅文献得出结论,书名"真"因避讳制度改为"直"的可能性大。     

《马氏文通》句读刍议

《马氏文通》在中国语法史上具有开拓之功 ,其中很多术语成了后人研究的重点。句与读的关系一直是研究者关注的焦点。《马氏文通》句读观的缺点、句与读的关系、句与句的关系等问题是以往研究的薄弱环节。     

学生管理中助人自助思想的实践与探索

学生违纪是学生管理中经常遇到的问题，如何对学生的违纪行为进行科学处理，引导学生形成良好的学习和生活习惯，引导学生认识自我，并进行自查、自律、自控是值得每一位教师认真研究的问题。通常情况下，依据校纪、校规，教师对于学生的违纪行为都采用轻则提醒、批评教育，重则警告、处罚的方式。