山东省新型冠状病毒感染密切接触者追踪管理系统的构建及应用研究

目的：建立省域统一的新型冠状病毒感染密切接触者追踪管理系统,提高密切接触者追踪管理的时效性和准确性。方法：根据疫情防控工作需要,分析山东省密切接触者追踪管理工作的现状与需求,提出系统设计的思路、总体框架与主要功能,依据SMART原则,应用PDCA循环和敏捷开发技术进行系统构建。结果：系统完成了对不同来源密接数据的统一管理与共享,实现了对省域内及省际间密接的点对点快速高效追踪和精细化闭环管理,降低了疫情扩散风险。结论：该系统在山东省疾控系统的推广使用,提高了对密接的追踪效率和质量;实现了数据的收集、共享、存储与展示,为疫情防控提供了有力的信息化保障和数据支撑,达到了系统建设的目的。     

基于信息生命周期理论的个人健康档案共享影响因素及对策分析

目的：总结患者对PHR的共享意愿,分析阻碍其共享的因素,并提出针对性的解决对策,为国内PHR的广泛使用和共享提供参考。方法：结合信息生命周期理论,将PHR共享流程划分为创建、存储、传输、使用4个阶段,建立PHR生命周期共享模型。结果：在创建阶段,预期回报和利他主义积极影响患者共享意愿;存储阶段的影响因素有信息敏感性、信任和社会责任;在传输阶段,感知行为控制和技术阻碍影响患者的共享意愿;在使用阶段,影响因素则是自我效能与情感支持、个性化服务和隐私忧虑。结论：PHR不同阶段的共享意愿取决于患者对共享感知利益与风险的衡量,从利益维护、规范标准、隐私保护和提升信任4个角度提出促进共享的对策。     

言语测听汉语系统的开发

目的为了使我国的言语测听临床工作与国际听力研究接轨,研制一套适应我国耳病患者的汉语语言训听系统。方法作者利用Visual Studio2008、Access2003、DirectX9开发了汉语言语测听系统,系统包括受试者管理、言语测听、测试表管理、数据管理、系统设置5个功能模块。结果本测听系统受试者管理模块可以添加、修改、删除、检索、导出患者的各项信息;言语测听模块可以进行言语识别阈和识别率的测听,测试完毕系统可以自动存储分析受试者的测听结果 ,并绘制出受试者的PI曲线;测试表管理模块可以查看、添加、修改、删除测试表及测试项的文字、关键字、声音;数据管理模块可以查看、筛选、导出受试者的测试结果 ;系统设置模块中,用户可以设置测试表的选择方式、播放方式、自动播放时间间隔、刺激声及噪声。结论本系统改变了传统的手工测听模式,简便了言语测听工作,缩短了测试时间,降低了测试成本,可以为我国的言语测听提供一个统一的平台,进一步促进言语测听的科学化、标准化、信息化。     

美国癌症数据标准注册存储库的实践与启示

目的：深入分析通用数据元素（CDE）框架和癌症数据标准注册存储库（caDSR）的架构,结合我国生物医学领域数据管理与共享的实际需求提出合理化建议。方法：系统梳理caDSR的实践流程,包括数据元素的标准化转换和注册,通用数据元素的管理、访问、应用与病例报告表（CRF）构建。结果：caDSR及其应用工具支持研究人员创建、注册、管理、访问、共享CDE,并利用CDE构建规范化、可重用的病例报告表,促进了数据资源的标准化收集、管理与互操作。结论：我国针对生物医学领域元数据组织管理与关联融合等技术的研究还处于初探阶段,caDSR的通用数据元素框架与数据整合机制对我国建立标准化元数据管理平台有重要的指导意义。     

医院多服务台时两种等待队列的性能分析

目的利用排队论的相关知识，对医院中多服务台时两种排队模型进行分析比较。方法从医院信息系统（HIS）中提取有关排队数据，计算出平均到达率和平均服务率，运用排队论的数学模型，借助M／M／1模型和M／M／C模型的算法及有关辅助程序，得到评价指标。结果医院多服务台时，单一共享等待队列的性能显著优于多个独自的等待队列。结论在医院安排排队方式时，尽量采用单一共享等待队列。     

基于铁死亡相关基因构建头颈部鳞状细胞癌的预后预测模型并验证

目的 构建基于铁死亡相关基因(ferroptosis-related genes, FRGs)的头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)预后预测模型并验证。方法 从TCGA和GEO数据库下载HNSCC RNA-seq数据及相关临床数据,分别作为训练队列和验证队列。从FerrDb网站提取共259个FRGs。利用单因素COX回归分析在训练队列中筛选与HNSCC患者预后有关的FRGs(P<0.01)。利用Lasso COX回归分析构建预后预测模型,并根据风险评分公式计算各临床样本的风险系数,然后使用Kaplan-Meier生存曲线和时间依赖性受试者操作特征(time-dependent receiver operating characteristic, time ROC)曲线评估该模型效能。同理,验证该模型在验证队列中的可行性和可重复性。最后采用单因素及多因素COX回归分析对该预后预测模型进行独立预后分析。结果 训练队列中与HNSCC患者预后显著相关的FRGs共有12个,在此基础之上利用Lasso COX回归算法构建...     

基于专病队列的重大疾病临床样本生命组学数据库建设

目的：探索全国范围的重大疾病临床样本生命组学数据协作网络及生命组学数据库建设。方法：调查疾病队列临床表型及组学数据现状,分析重大疾病临床样本生命组学数据协作网络及数据库建设的内容,并探讨各项任务的关键技术问题。结果：提出了重大疾病生命组学数据库建设涉及的关键内容及技术环节,指出利用PheWAS方法解决表型与组学领域新技术的融合,以及多粒度、多模态检索及计算服务问题。结论：建立数据协作流程、安全管理的标准规范、研发协作网络平台及数据库,基于数据协助网络开展精准医学大数据融合的服务模式研究,对推动我国精准医学计划长远目标实现意义重大。     

NIH生物医学数据共享仓储分析

目的：对美国国立卫生研究院（NIH）的共享仓储进行分析,为生物医学科学数据领域相关研究和我国医学科学数据共享仓储建设提供参考和借鉴。方法：对UniProt、Protein Data Bank、GenBank等10个典型的数据共享仓储进行对比分析,总结其在数据获取方式、数据管理及共享模式、服务方式等方面的经验。结果：各仓储根据自身特性,设计了符合自身特点的数据管理链条及流程规范。结论：我国可借鉴美国国立卫生研究院生物医学数据共享仓储的建设经验,设计数据服务工具、开展半人工半自动模式的数据审核,收集尽可能详尽的元数据,并制定符合自身仓储特点的引用规范等。     

纸质病案数字化存储管理研究

目的通过对纸质病案数字化后的图片数据进行合理的存储以及管理,以达到对数字化病历可靠、安全和高效访问的目的。方法规范存储组织,设计开发专门的存储管理系统和客户端管理系统。其中,存储管理系统通过建立网络设备索引以达到存储良好的扩展性;通过建立文件索引以达到快速高效的文件访问。结果研究的存储方式以及存储管理系统安全、可靠、高效、扩展性好,已在多家医院使用。结论合理的数据存储组织结合有效的系统管理是病案数字化的关键,为后续的病案服务提供了保证。     

临床研究的伦理审查:受试者退出研究的数据保留

临床研究过程中受试者退出研究,研究者是否可以对已经采集的数据进行分析使用、甚至是否可以继续采集受试者的数据,目前我国尚缺乏相关法规条例对此问题进行规定,作者参考美国相关指南规定,提出如下建议:食品药品监督管理局管理的药物临床试验不得销毁已经采集的数据;科研课题研究,研究者应事先考虑到该问题,在研究方案和知情同意书中做出相应规定。研究者可以根据研究有效性的考虑,决定是否同意受试者不使用数据的要求,事先告知,征得受试者的同意后再入组。     

国外药物研发数据共享案例及经验借鉴

数据质量与数据共享是我国新药研发领域需要迫切解决的2个关键问题。梳理了我国药物研发平台建设存在的问题,深入分析了欧洲制药工业协会联合会的新药研发毒性数据共享项目e TOX(基于生物信息学和化学信息学方法的计算机毒性预测专家系统)的数据共享机制、流程和成果,包括数据的采集、敏感性分级、整合、协调和管理,以及Open PHACTS的数据整合利用模式,为我国药物研发数据的共享与质控提供思路与经验借鉴。     

队列数据共享的必要性与可行性

近年来,复杂性疾病（例如恶性肿瘤、心脑血管疾病等）逐渐成为现代社会最主要的疾病负担,并造成巨大的健康和经济损失［1］。复杂性疾病的发生是基于生活方式、环境、遗传的相互作用而导致的,探讨此类疾病的发病机制已经成为现代病因学研究的重要课题。队列研究是流行病学最基本的分析性研究设计之一,在病因学研究中具有不可替代的地位和作用。当检验病因假说时,队列研究可以探讨有害暴露的致病作用,而基于人群构建的队列（population based cohort）可以用来研究多种暴露因素和多种健康结局的关系,且研究结果具有较好的外推性［2］,不仅是解决现代医学一些迫切问题的重要研究手段,也是转化医学研究的重要基础［3］。     

开放共享环境下科学数据安全治理路径

深入探究科学数据安全治理路径,以期为我国数据安全战略的实施提供参考。基于信息生命周期管理模型,从制度、技术、设施、人员4个要素出发对科学数据在存储、管理、应用3个层面的安全问题进行归纳,并从科学数据治理主体出发探究治理路径,进而提出我国政府应从宏观层面完善以数据安全为核心的基础性制度建设,研究机构应从中观层面构建全面的科学数据安全管理机制,科研人员应从微观层面提高科学数据安全管理素养等建议。     

国外科学数据管理与共享政策及对我国精准医学数据管理的启示

选取美、英两国生物医学科研资助机构的部分数据管理与共享政策,对其基本特征及政策概况、数据汇交、数据保存与管理、数据共享以及数据安全与保护5大类、25个具体指标进行详细对比分析,结合我国精准医学专项基本情况,获得政策制定方面的启示,以期为我国精准医学专项数据政策制定提供参考。     

伦敦卫生与热带医学院医学科研数据管理经验及其启示

通过对伦敦卫生与热带医学院的医学科研数据管理实践的案例研究,分别从实践背景、政策制定、基础设施建设等方面剖析了伦敦卫生与热带医学院的成功经验,以期对我国医学科研数据管理的研究与实践提供有益的启示。     

面向我国人口与健康领域数据汇交的科研项目调查策略

介绍了国内外科技计划项目数据汇交政策和实践,指出了开展以数据汇交为目的的我国人口与健康领域科研项目调查的必要性,分析了科研项目的调查对象和范围,阐述了人口与健康领域科研项目调查的方法,为实施我国人口与健康领域科研项目的数据汇交提供参考。     

癌症基因组学相关数据管理与应用探析

目的：梳理美国癌症基因组图谱计划（The Cancer Genome Atlas,TCGA）相关数据的收集、整理、组织、共享及应用情况,为建立及完善国家级大型的开放癌症基因组学相关数据资源提供参考。方法：系统调研TCGA计划的数据管理相关机构工作流程、数据共享利用等方面的解决方案和最佳实践。 结果：TCGA计划通过多中心合作,建立了组织样本采集、处理、质量控制、序列测定、特征分析、数据共享与研究应用等全链条的癌症基因组图谱数据管理流程,从所属癌症、数据类型、处理水平等角度对数据进行精细分类,并针对汇总数据和个体数据分别采取开放存取和受控访问两种共享机制,研究者们利用其共享数据开展了相关癌症特征基因的突变、扩增和缺失、以及受影响的信号通路等多方面研究。 结论：癌症基因组图谱计划的实践探索可为大规模癌症基因组学相关研究计划的实施提供数据管理方面的经验借鉴与参考。     

区块链技术在电子健康档案中的应用与存在的问题

我国电子健康档案建设还处于初级阶段,数据的交互与利用和数据隐私安全问题之间的矛盾尚未能得到很好解决。区块链技术的出现,为数据共享与隐私之间的矛盾问题提供了新的解决方案。通过总结区块链技术在国内外电子健康档案中的应用及存在的问题,为区块链技术在电子健康档案建设中的发展提供借鉴。