丙型肝炎病毒5′端非编码区和NS3蛋白酶共调控外分泌性碱性磷酸酶表达细胞模型的建立及意义

目的构建丙型肝炎病毒5′端非编码区(HCV 5′NCR)和NS3丝氨酸蛋白酶共调控外分泌性碱性磷酸酶(SEAP)表达细胞模型,并分析其用于抗HCV药物筛选和评价的可行性.方法用聚合酶链反应技术扩增HCV 5′NCR和NS3/4A片段,定向克隆至表达质粒pSEAP2-Control的SEAP基因上游,构建含HCV 5′NCR-NS3/4A-SEAP嵌合基因的重组表达质粒pNCR-NS3/4A-SEAP.将重组质粒转染至肝细胞株QSG7701,用化学发光法检测SEAP的表达,并观察HCV 5′NCR区对应的反义寡聚核苷酸(ASODN)和丝氨酸蛋白酶抑制剂TPCK对SEAP表达的影响.结果重组质粒pNCR-NS3/4A-SEAP有高强度SEAP表达,5 μmol/L、10 μmol/L ASODN和100μmol/L TPCK对SEAP表达有显著抑制作用(f值分别为4.315、6.985、6.949,P值均＜0.01).结论重组质粒pNCR-NS3/4A-SEAP的SEAP表达受HCV 5′NCR和NS 3蛋白酶共调控,建立的细胞模型可用于以H CV 5′NCR和NS 3蛋白酶为靶位点的药物筛选和评价.     

丙型肝炎病毒基因片段体外转录和真核表达载体的构建与鉴定

目的 探讨基因免疫和基因治疗用于丙型肝炎病毒（HCV）疫苗及抗HCV感染的可行性，构建含HCV基因片段的体外转录和真核表达载体。方法 从HCV慢性感染患者血清中提取总RNA后，采用逆转录PCR扩增出含有5'NCR和编码核心蛋白C区上游基因片段的HCV－cDNA，经HindⅢ和EcoR I双酶切后，定向克隆入体外转录载体pGEM3ZF(-)和真核表达载体pBBS212中，构建成pGEM3ZF-HCV和pBBS212-HCV重组表达质粒，并经双酶切鉴定。结果 用HindⅢ和Eco R I双酶切鉴定证实，克隆的HCV基因片段正确插入载体pGEM3ZF(-)和pBBS212中。结论 成功构建含5'NCR和部分核心C区基因的体外转录及真核表达载体，可为进一步研究HCV基因疫苗以及核酶基因治疗HCV奠定基础。     

丙型肝炎病毒5''端非编码区的5''端序列对其翻译启动活性的影响

目的分析丙型肝炎病毒(HCV)5’端非编码区(5’NCR)的5’端序列对其翻译启动活性的影响。方法用PCR技术扩增获得全长和5’端17个碱基缺失的HCV5’NCR片段,定向克隆至表达质粒pSEAP2Control的SEAP基因上游,分别构建成全长和5’端截短的HCV5’NCR调控SEAP表达的重组质粒pNCRSEAP和pdNCRSEAP。用脂质体方法将重组质粒转染至肝细胞株QSG7701,并用化学发光法检测SEAP的表达。结果酶切和测序结果表明,重组质粒pNCRSEAP和pdNCRSEAP构建成功。表达的发光强度分别为390482±42856和635265±52285RLU,二者有差异显著性(P<0.01)。结论HCV5’NCR的5’端碱基缺失提高了它对SEAP基因的翻译启动活性,为进一步分析HCVIRES的结构提供了实验基础。     

一种竞争性HCV定量方法的建立及其应用

目的:建立检测丙型肝炎病人血清HCV RNA水平的竞争性定量方法。方法:采用含HCV5＇非编码区(5＇NCR)缺失突变重组质粒5Tld,将前期目的基因亚克隆进体外转录载体pCDNAI,获得特录重组体5Tld＇。线性化后用SP6 RNA聚合酶体外转录竞争性缺失突变模板RNA,定量后与血清HCV RNA一起作逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),建立检测血清HCV RNA水平的竞争性定量方法。结果;检测15例丙肝病人20份血清,滴度为6.6×10~(12)～6.6×10~6拷贝/ml,经干扰素治疗后病毒水平下降1～5个log,年龄<20岁者干扰素治疗效果较好。结论:竞争性逆转录聚合酶链反应是一种较好的检测HCV RNA水平的定量方法。     

丙型肝炎病毒5''非翻译区DNA序列在HepG2细胞中的启动子活性

目的研究丙型肝炎病毒(HCV)基因组5'非翻译区(5'UTR)DNA序列在HepG2细胞中的启动子活性,以了解HCV的复制调控机制.方法分别构建HCV基因组5'UTR DNA正反向序列驱动虫荧光素酶基因表达的质粒5'UTR- Luc(+)/(-)和5'UTR DNA序列驱动绿色荧光蛋白基因表达的质粒5'UTR -EGFP(+)/(-),分别转染HepG2细胞,用双荧光素酶检测系统检测虫荧光素酶的表达水平,逆转录聚合酶链反应检测虫荧光素酶基因m R N A水平,荧光显微镜观察绿色荧光蛋白基因的表达水平,并与相应对照作比较,来证实H CV基因组5'UTR DNA序列的启动子活性.结果 5'UTR- LUc(+)有明显的虫荧光素酶表达,但比pGL3 control表达水平低(Luc/R为0.690 ± 0.086,Luc/RL为4.210±0.340),而5'UTR-Luc(-)和pGL3 enhancer无明显虫荧光素酶表达(Luc/RL分别为0.095±0.008和0.044±0.00 5);逆转录聚合酶链反应结果与之相符,5'UTR- Luc(+)检测到虫荧光素酶基因mRNA,而5'UTRLuc(-)则未检测到.5'UTR- EGFP(+)观察到较强绿色荧光,而5'UTR -EGFP(-)无荧光表达.结论 HCV基因组5'UTR DNA序列具有明显的启动子活性,能启动下游基因的表达,在HCV基因组复制过程中有重要作用.     

丙型肝炎病毒转基因小鼠模型的研究

0引言丙型肝炎病毒(HCV)是1989年美国Chooetal[1]利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术分离鉴定的一种新型肝炎病毒,属黄病毒科丙型肝炎病毒属.其基因组为单股正链RNA,长9.4kb左右,两侧分别为5’和3’非编码区(NCR),中间为单一的开放读码框(ORF),可分为核壳蛋白区(C区)、包膜蛋白区(E区)和非结构蛋白区(NS区).其中,5’NCR区变异较小,内含内部核糖体进入位点(IRES),在病毒蛋白的翻译中有重要的调控功能.C区与E1/E2区构成结构基因,分别编码衣壳蛋白和包膜糖蛋白,内含重要的中和抗原表位与细胞免疫抗原表位,与HCV的免疫致病及防…     

丙型肝炎病毒非结构蛋白5A抑制肿瘤坏死因子α诱导HepG2细胞凋亡的作用研究

目的 研究丙型肝炎病毒非结构蛋白5A(HCV NS5A)对肿瘤坏死因子α(TNFα)诱导HepG2细胞凋亡的抑制作用。方法 设计HCV—1b NS5A区基因片段的特异引物,以逆转录巢式PCR方法扩增NS5A基因片段,并将其进行TA克隆,对阳性克隆进行酶切与序列鉴定;构建NS5A基因表达载体;通过Lipofectamine基因转染法,将NS5A区基因导入HepG2细胞,加入TNFα培养48h;应用Western blot检测caspase-3被切割、细胞色素C释放的情况以及通过AnnecxinV-FITC染色两种方法,观察NS5A蛋白对TNFα诱导的HepG2细胞凋亡的抑制效应。结果 成功建立HCV NS5A蛋白真核表达转基因细胞模型,发现该蛋白对TNFα所诱导HepG2细胞凋亡有抑制作用。结论 HCV NS5A蛋白可以抑制TNFα诱导的HepG2细胞凋亡。     

逆转录病毒载体介导人凝血因子Ⅷ在肝细胞中的表达

目的 建立逆转录病毒载体介导的人凝血因子Ⅷ(FⅧ)鼠肝细胞BRL-3A.方法 将一B区缺失(760～1 639 aa)的人FⅧ cDNA(FⅧBD cDNA)克隆至逆转录病毒载体pLNCX2,构建重组表达载体pLNCX2-FⅧBD.感染BRL-3A细胞,分别采用一期法、ELISA法检测细胞培养上清中人FⅧ的凝血活性(FⅧ:C)和抗原含量(FⅧ:Ag).结果 pLNCX2-FⅧBD在鼠肝细胞BRL-3A细胞中获得良好表达,在24 h内每毫升中106细胞表达FⅧ:C为1.12 U,FⅧ:Ag为350 ng.结论 逆转录病毒载体能够介导人FⅧ在肝细胞中的表达,为血友病A的基因治疗奠定了基础.     

丙型肝炎病毒5′非翻译区 DNA 序列在 HepG2细胞中的启动子活性

目的 研究丙型肝炎病毒(HCV)基因组5′非翻译区(5′UTR)DNA 序列在 HepG2细胞中 的启动子活性，以了解 HCV 的复制调控机制。方法 分别构建 HCV 基因组5′UTR DNA 正反向序列驱动 虫荧光素酶基因表达的质粒5′UTR-Luc(+)/(-)和5′UTR DNA 序列驱动绿色荧光蛋白基因表达的质粒5′ UTR-EGFP(+)/(-)，分别转染 HepG2细胞，用双荧光素酶检测系统检测虫荧光素酶的表达水平，逆转录 聚合酶链反应检测虫荧光素酶基因 m R N A 水平，荧光显微镜观察绿色荧光蛋白基因的表达水平，并与相应 对照作比较，来证实 HCV 基因组5′UTR DNA 序列的启动子活性。结果 5′UTR-Luc(+)有明显的虫 荧光素酶表达，但比 pGL3 control 表达水平低(Luc/R为0．690±0．086，Luc/RL 为4．210±0．340)，而5 ′UTR-Luc(-)和 pGL3 enhancer 无明显虫荧光素酶表达(Luc/RL 分别为0．095±0．008和0．044±0． 005)；逆转录聚合酶链反应结果与之相符，5′UTR-Luc(+)检测到虫荧光素酶基因 mRNA，而5′UTR- Luc(-)则未检测到。5′UTR-EGFP(+)观察到较强绿色荧光，而5′UTR-EGFP(-)无荧光表达。 结论 HCV 基因组5′U TR DNA 序列具有明显的启动子活性，能启动下游基因的表达，在 HCV 基因组复 制过程中有重要作用。     

硫代反义寡核苷酸对裸鼠异植瘤HCV 5′NCR基因表达的抑制作用

目的 在HCV 5′NCR转基因细胞模型HepG2.9706细胞建立成功的基础上,采用裸鼠异植瘤模型进行HCV特异性硫代反义寡核苷酸（HCV363、HCV279及HCV349）的体内活性评价。方法 将HepG2.9706细胞接种于4－6周龄的雌性BALB／C裸鼠的侧腹皮下,动物随机分组,约1周后,采用腹腔注射途径,开始给药。结果 针对HCV 5′NCR的硫代反义寡核苷酸HCV363、HCV279及HCV349对异植瘤细胞内HCV 5′NCR调控荧光素酶表达具有明显的序列特异性抑制作用,抑制率分别为80．4％、78．6％及47．9％。三个不同浓度的HCV363作用结果表明随着药物浓度的增加,HCV363对荧光素酶基因的表达抑制活性明显增强,最大抑制率可达82．7％。结论 该研究提示反义寡核苷酸有可能成为HCV感染治疗的新途径。     

抑制性RNA在细胞内对丙型肝炎病毒5′非编码区翻译启动的抑制作用

目的：研究核糖体内部进入位点（IRES）特异性抑制性RNA（IRNA）在细胞内对HCV 5′非编码区（NCR）IRES翻译启动功能的抑制作用。方法：通过脂质体介导的基因转染方法,转染IRNA真核表达体与带荧光素（luc)的靶基因真核表达载体于人肝癌细胞（HHCC）,应用发光仪检测luc报告基因的表达活性。结果：IRNA能有效地抑制由HCV 5′NCR IRES介导的luc基因表达,抑制率最高达90％,最低50％,而IRNA突变体（mIRNA)无此活性。结论：IRES特异性IRNA能有效地抑制HCV 5′NCR介导的蛋白翻译启动作用。     

Inhibitor RNA blocks the protein translation mediated by hepatitis C virus internal ribosome entry site in vivo

AIM:To investigate the inhibitory effect of hepatitis C virus internal ribosome entry site (HCV IRES) specific inhibitor RNA(IRNA) on gene expression mediated by HCV IRES in vivo.METHODS:By using G418 screening system, hepatoma cells constitutively expressing IRNA or mutant IRNA (mIRNA) were established and characterized, and HCV replicons containing the 5′ untranslated region (5′UTR) were constructed by using the same method. Cotransfection of pCMVNCRluc containing HCV 5′UTR-Iuc fusion genes and eukaryotic vector of IRNA into human hepatic carcinoma cells (HepG2) was performed and the eukaryotic expression plasmid of IRNA was transfected transiently into HCV replicons, pCMVNCRluc or pCDNA-luc was cotransfected with pSV40-β Gal into IRNA expressing hepatoma cells by using lipofectamine 2000 in vitro. Then the reporting gene expression level was examined at 48h after transfection by using a luminometer and the expressing level of HCV C antigen was analysed with a confocal microscope.RESULTS: Transient expression of IRES specific IRNA could significantly inhibit the expression of reporter gene and viral antigen mediated by HCV IRES by 50% to 90% in vivo, but mIRNA lost its inhibitory activity completely. The luciferase gene expression mediated by HCV IRES was blocked in the HHCC constitutively expressing IRNA. At 48h after transfection, the expression level of reportor gene descreased by 20%, but cap-dependent luciferase gene expression was not affected. IRNA could inhibit the HCV replicon expression 24h after transfection and the highest inhibitory activity was 80% by 72h, and the inhibitory activity was not increased until 7d after transfection.CONCLUSION:IRNA can inhibit HCV IRES mediated gene expression in vivo.     

Inhibition of hepatitis C virus-directed gene expression by a DNA ribonuclease.

BACKGROUND/AIMS: The aim of this study was to determine whether DNA analogs of ribozymes could be prepared to inhibit hepatitis C virus (HCV) gene expression. METHODS: Two DNA ribonucleases, Dz2 and Dz4, were designed with varying arm lengths, to cleave at the 5'-noncoding region (NCR) just upstream from the translation start site, and core region of HCV genome, respectively. A reporter vector was prepared to contain target HCV regulatory sequences controlling a downstream luciferase gene. DNA ribonucleases with normal phosphodiester, as well as with terminal phosphorothioate linkages, were administered to Huh7 cells, and luciferase activity was measured. RESULTS: DNA ribonucleases were highly active in cleaving HCV RNA targets. Enzymes with longer arms had consistently higher cleavage activity compared to enzymes with shorter arms under cell-free conditions. Furthermore, in Huh7 cells, terminal phosphorothioate derivatives, Dz2 and Dz4, significantly suppressed HCV-luciferase fusion gene expression up to 45% and 67% of controls, respectively. Interestingly, phosphorothioate-modified DNA ribonucleases had greater inhibitory effects on target gene expression than their unmodified counterparts. In contrast, DNA ribonucleases with point mutations in the catalytic domain had significantly lower inhibitory effects compared to wild-type DNA ribonucleases. However, activity was not eliminated, suggesting that some antisense contribution was present. CONCLUSIONS: DNA ribonucleases directed against the HCV genome can specifically cleave target HCV RNA. Modifications of the extreme 3'- and 5'-termini protect against nuclease degradation without appreciable reduction in inhibitory activity against viral gene expression under intracellular conditions.     

短发夹状双链RNA抑制丙型肝炎病毒IRES介导的基因表达

目的研究载体表达的短发夹状双链RNA（shRNA）对丙型肝炎病毒（HCV）IRES介导的基因表达的特异性抑制作用。方法构建HCV IRES调控的绿色荧光蛋白表达载体（pIRES—GFP）和虫荧光索酶表达载体（p5′ UTR—Luc），以及针对HCV IRES的shRNA表达载体（pshRNA-HCV）。共转染HepG2细胞，于转染后24、48、72h观察绿色荧光的强弱，用Western blot检测绿色荧光蛋白的表达，半定量逆转录聚合酶链反应法检测GFP的mRNA水平。双荧光索酶系统检测虫荧光索酶活性。结果pshRNA-HCV作用组绿色荧光强度明显弱于未干扰组，GFP蛋白表达量及虫荧光素酶活性降低60％～70％，半定量逆转录聚合酶链反应显示pshRNA-HCV导致了GFP基因mRNA水平的降低。结论针对HCV IRES的shRNA能够显著和特异地抑制该区域调控的蛋白表达水平及mRNA水平，该研究结果为利用RNA干扰技术治疗HCV感染进行了初步探索。     

丙型肝炎病人系列血清中5'-NCR和C区基因变异研究

目的研究丙型肝炎病人的系列说清中ＨＣＶ ５'－ＮＣＲ及核心区基因变化。方法 ４例因献血感染ＨＣＶ病人的系列血标本,用特异性引物扩增５'－ＮＣＲ和核心区基因并进行测序。结果所有ＨＣＶ分离株基因序列均为１ｂ和２ａ型,５'－ＮＣＲ序列差异只与型别有关,与病人和不同时点采集的标本无关。核心区基因序列差异因病人和基因型别而异,未发现同一病人的同一基因型序列随时间而变化。结论５'－ＮＣＲ序列保守性大于核心区。型别是导致基因变化的主要原因。未发现该２区段基因的核苷酸改变与时间有关。     

抗丙型肝炎病毒锤头结构核酶的计算机设计和载体的构建

目的选择针对丙型肝炎病毒（HCV）5'非编码区（NCR）和核心区（C）的核酶（ribozyme,Rz）切割位点,构建带自剪切的Rz真核表达载体。方法应用计算机辅助设计,根据能量最低化原理,以HCV－H（1a）株SNCR和C靶序列,预测其二级结构,选择理想的Rz切割位点,设计锤头结构核酶;体外合成针对HCV5'NCR的Rz213和Rz260的cDNA,通过亚克隆技术连接于真核表达载体（pcDNA3）。结果在124个自然切割位点（CUX和GUX）中选出213（CUC）、260（GUA）、407（GUC）和498（CUU）4个切点;Rz213和Rz260的DNA序列分析,结果与合成序列完全一致,酶切鉴定两Rz连接正确。结论计算机可作为抗病毒Rz设计的重要辅助工具;通过亚克隆技术可使目的Rz两端带自剪切Rz,并成功地插入真核表达载体。     

Identification of an immunodominant epitope within the capsid protein of hepatitis C virus.

We have isolated cDNA clones from the 5' end of the Hutchinson strain of hepatitis C virus. Sequences encoding various segments of the HCV structural region were fused to the gene for glutathione S-transferase and analyzed for the expression of hepatitis C virus-capsid fusion proteins. With a set of these fusion proteins, both human and chimpanzee immune responses to capsid were studied. An immunodominant epitope was located within the amino-terminal portion of capsid that is preferentially recognized by antibodies in both human and chimpanzee hepatitis C virus-positive sera. In addition, analyses of sequential serum samples taken from humans and chimpanzees with either chronic or apparently self-limited infections revealed that a strong anti-capsid response develops rapidly after onset of infection.     

含有MS4A7基因启动子的荧光素酶报告基因质粒的构建及意义

目的构建含有人4次跨膜监视蛋白A（MS4A）基因启动子的萤火虫荧光素酶报告基因质粒。方法用PCR方法扩增获得含有人MS4A7基因启动子的DNA片段,将其连接至TA克隆质粒后转移至虫荧光素酶质粒pGL3-basic中,得到pGL3-MS4A7-Promoter重组质粒;经限制性内切酶酶切、PCR及测序鉴定得到确认;将该质粒转染进入HL-60细胞,并检测细胞中虫荧光素酶的活性。结果 pGL3-MS4A7-Promoter重组质粒插入片段和相邻序列正确,克隆的MS4A7基因片段有启动子活性。结论成功构建了pGL3-MS4A7-Promoter报告基因质粒,为进一步研究MS4A7基因的表达调控奠定了基础。