北京地区2007-2008年G9型A组人轮状病毒VP7和VP4基因分析

目的 了解北京地区2007-2008年检测到的G9型A组人轮状病毒外壳蛋白VP7和VP4的基因特征.方法 选取经过轮状病毒核酸杂交方法检测为G9型轮状病毒的12份儿童腹泻患儿的粪便标本,应用针对VP7全长基因的特异引物对进行RT-PCR扩增,对所获得的VP7全长基因进行克隆和测序,将所获得的序列与GenBank中的G9型原型病毒株和近期流行株的VP7基因进行序列和种系进化分析;经巢式PCR对G9型的VP4进行P基因分型.结果 12株G9型轮状病毒经VP7基因的序列比较分析得到确认.P基因分型结果显示北京地区近年来存在G9P[8]和G9P[6]型两种组合的轮状病毒感染.序列和种系进化分析发现北京G9型株VP7基因与世界范围内近期流行的G9型株一样都属于进化分支Ⅲ,彼此间的核苷酸和氨基酸同源性较高,而与国内最早报道的G9型T203进化关系较远,且北京G9P[8]和G9P[6]型株分别与国内近期报道的新疆G9P[8]和G9P[6]型株及相应的武汉G9型株VP7基因,在氨基酸位点上存在一些共同的氨基酸残基取代.结论 北京地区近年存在G9P[8]和G9P[6]两种不同基因组合的G9型轮状病毒感染,需要进一步加强对G9型轮状病毒的分子流行病学监测.     

酒泉地区婴幼儿腹泻的A组轮状病毒分子基因特征研究

目的采用基因分型方法调查研究酒泉地区婴幼儿A组轮状病毒（rotavirus，RV）腹泻的基因分型特点。方法对2001年11月至2002年12月酒泉地区收集的腹泻婴幼儿324份粪便标本，电脑随机抽样选取204份采用酶联免疫吸附试验（enzyme—linked immunosorbant assay，ELISA）和逆转录聚合酶链反应（RT—PCR），进行轮状病毒病原检测，扩增A组轮状病毒VP4和VP7基因，并对阳性标本进行基因分型。结果酶联免疫吸附试验法测得204份粪便标本的A组轮状病毒阳性率为54．9％（112／204）。对酶联免疫吸附试验呈阳性的标本进行逆转录-聚合酶链反应法检测A组轮状病毒G，P基因型，结果表明，酒泉地区流行的A组轮状病毒主要基因型为G3P[8]型（50．0％），其余依次为G1P[4]（15．8％）、G3P[4]（15．8％）、G1P[8]（10．6％）、G2P[4]（2．6％）和G1G3P[4]（2．6％）、G1G3P[8]（2．6％）。结论A组轮状病毒是酒泉地区婴幼儿非细菌性腹泻的主要病原，其中G3P[8]型是主要基因型。     

中国1998～2004年G9型轮状病毒分子流行病学研究

目的研究中国流行的轮状病毒(Rotavirus,RV)G9型毒株的分子流行病学特征。方法在中国9个地区收集5岁以下腹泻患儿粪便标本,应用酶联免疫吸附试验(ELISA)方法检测RV,对阳性标本用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)分型,选择G9型毒株进行VP7基因全长克隆测序和分子流行病学分析。结果1998~2004年共检测出RV1 268份,其中45份为G9型(3.5%),昆明最多(34/45),其次是兰州(8/45)、长春(2/45)、卢龙(1/45),北京、郑州、杭州、福州、广州未检测到G9型毒株。对35份G9型标本进行P分型鉴定:15份为P[8]型,12份为P[6]型,5份为P[4]型,1份为P[8 4]混合型,2份未能分型。中国1998~2000年以P[8]G9毒株流行为主,而2001年后以P[6]G9毒株为主。22株G9型病毒VP7基因序列比对结果表明,中国流行的G9型毒株彼此同源性高,同属G9第3亚型。结论中国流行的RV G9型株与世界各地的流行株同源性较高,国内传播范围扩大的趋势值得关注。     

呼和浩特地区2008-2009年婴幼儿轮状病毒性腹泻流行株分型研究

目的研究呼和浩特地区2008年6月～2009年5月婴幼儿腹泻轮状病毒(rotavirus,RV)的基因型。方法采集内蒙古妇幼保健院2008年6月～2009年5月所有≤59月龄的住院腹泻患儿粪便标本313份。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测RV;对RV抗原阳性的标本用巢式逆转录聚合酶链式反应(nested RT-PCR)对6种流行的VP7基因型(G1、G2、G3、G4、G8、G9)和5种流行的VP4基因型(P[8]、P[4]、P[6]、P[9]、P[10])进行分型;最后整理数据,应用SPSS 13.0统计软件包进行统计分析。结果 313份粪便标本中,125份为RV抗原阳性(39.94%)。对阳性标本进行VP7基因分型,结果为G1型64.8%(81/125)、G2型2.4%(3/125)、G3型14.4%(18/125)、G9型0.8%(1/125)、G1+G3混合型16.8%(21/125)、G2+G3混合型0.8%(1/125);进行VP4基因分型,结果为P[8]型84.0%(105/125)、P[4]型4.0%(5/125)、P[8]+P[4]型1.6%(2/125),13份未分出型别。结论 RV是...     

呼和浩特地区2008-2009年婴幼儿轮状病毒性腹泻流行株分型研究

目的研究呼和浩特地区2008年6月～2009年5月婴幼儿腹泻轮状病毒（rotavirus,RV）的基因型。方法采集内蒙古妇幼保健院2008年6月～2009年5月所有≤59月龄的住院腹泻患儿粪便标本313份。采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测RV;对RV抗原阳性的标本用巢式逆转录聚合酶链式反应（nested RT-PCR）对6种流行的VP7基因型（G1、G2、G3、G4、G8、G9）和5种流行的VP4基因型（P[8]、P[4]、P[6]、P[9]、P[10]）进行分型;最后整理数据,应用SPSS 13.0统计软件包进行统计分析。结果 313份粪便标本中,125份为RV抗原阳性（39.94%）。对阳性标本进行VP7基因分型,结果为G1型64.8%（81/125）、G2型2.4%（3/125）、G3型14.4%（18/125）、G9型0.8%（1/125）、G1+G3混合型16.8%（21/125）、G2+G3混合型0.8%（1/125）;进行VP4基因分型,结果为P[8]型84.0%（105/125）、P[4]型4.0%（5/125）、P[8]+P[4]型1.6%（2/125）,13份...     

青海省67份轮状病毒结构蛋白VP7基因分型和分布情况

目的 研究2016-2017年青海地区腹泻患者轮状病毒基因分型及流行病学分布。方法 收集门诊及住院部腹泻的粪便标本238份,采用实时荧光PCR法对轮状病毒A组进行检测,阳性标本进行VP7基因扩增和测序。结果 238份粪便标本中,通过实时荧光PCR 检测到轮状病毒A组阳性67份,阳性率为28.15%（67/238）;对67份轮状病毒A阳性标本进行VP7蛋白检测和测序,测序后得到29份核苷酸序列,用Clustral X Bootstap NJ Tree软件构件进化树,分析发现2016年3月-2017年12月青海轮状病毒以G9P8型为主,共26株,占89.66% (26/29),G2P4型2株(2/28),G3P8型1株(1/28), 轮状病毒腹泻发病高发季节为9-12月,其中以12月份检出最高,占总数的61.19%（41/67）。病人以成人为主,成人和5岁以下儿童比例为1.73[DK]∶1。结论 2016-2017年青海地区轮状病毒以流行病毒株G9P8型为主。     

多重RT-PCR同步检测A组轮状病毒P基因型

目的 建立A组轮状病毒VP4基因型的多重PCR分型方法，并用此方法对武汉地区婴幼儿腹泻样本进行检测。方法 在分析A组轮状病毒VP4基因的基础上，选取引物con2、con3进行第一轮RT-PCR，然后以A组轮状病毒5个P基因型P[6]、P[8]、P[9]、P[4]和P[10]的特异性引物，进行第二轮巢式PCR，建立多重巢式RT-PCR同步检测A组轮状病毒P基因型技术。结果 利用该方法可以同时检出5种不同基因型标准株混合物中的各个型别。将纯化的A组轮状病毒标准株RNA系列稀释后，用本方法进行检测，其灵敏度为0．1ng/μl。同时还对40份从武汉市儿童医院采集的A组轮状病毒阳性的腹泻儿童大便样本进行检测，其中P[8]有29例、P[4]有5例，另外发现有P[8]与P[4]混合感染4例。说明该方法对实际样本中的混合感染也能很好地分型。结论 应用多重巢式RT-PCR对A组轮状病毒基因型研究将为临床诊断和实验研究提供一种快速、灵敏和特异的检测手段。     

武汉市儿童医院婴幼儿腹泻轮状病毒的VP4型别分析

目的研究武汉市儿童医院腹泻门诊A组轮状病毒VP4基因的分子流行病学特征. 方法利用聚丙烯酰胺凝胶电泳,将检测出的A组轮状病毒阳性样利用多重RT-PCR技术对VP4基因进行分型研究. 结果武汉地区793份腹泻患儿粪便样本经检测轮状病毒阳性257例,阳性率为32.4%.其中P [8]型232例(90.3%),P [4]型3例(1.2%),P [8]与P [4]混合感染15例(5.8%),尚有7例(2.7%)未能分出型别.对检测结果按采样时间、年龄和性别分布分别进行了分析. 结论武汉地区A组轮状病毒以P[8]型为主要流行基因型,患儿以6月至1岁为主,男女性别差异不大,武汉地区婴幼儿腹泻A组轮状病毒VP4基因分型研究将为轮状病毒疫苗的研制提供基础.     

乌鲁木齐市腹泻患儿轮状病毒分子分型

目的 了解2012年新疆乌鲁木齐市婴幼儿轮状病毒流行特征及基因型别特点.方法 收集2012年1-12月在乌鲁木齐市第一人民医院就诊住院的0～60月龄婴幼儿腹泻患儿粪便标本300份,用酶联免疫法进行轮状病毒抗原检测,检测结果阳性标本用逆转录-聚合酶链式反应法进行G/P基因分型鉴定.结果 在300份粪便标本中,检测出阳性样本131份,阳性率为43.7％;在G基因分型鉴定中,G9型为优势株,占53.44％,其次为G2型,占17.56％,G3和G1型分别占12.98％和9.92％,G型混合感染占6.11％;在P基因型鉴定中,P[8]型占绝对优势,占73.28％,其次为P[4]型,占20.61％,混合感染占5.34％;G9P[8]型是最常见的G/P组合,占48.85％,其次为G2P[4]型,占17.56％.结论 2012年乌鲁木齐轮状病毒流行优势毒株发生了从G3到G9的漂移,G9P[8]成为该地区最主要的基因型.     

安徽省婴幼儿腹泻轮状病毒G/P分型分析

目的了解安徽省婴幼儿腹泻轮状病毒的基因型别分布特点。方法对2011年1～12月收集的5岁以下住院婴幼儿腹泻粪便标本307份,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测轮状病毒抗原,阳性标本运用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行G型和P型分型。结果 307份粪便标本中轮状病毒阳性率为15.64%(48/307);G3型为优势株,占47.91%(23/48),G9型占27.08%(13/48),G1型占16.67%(8/48),混合G型感染占14.58%(7/48),G2型占6.25%(3/48),G4型占2.08%(1/48);P基因型中最常见为P[8],占62.67%(32/48),P[4]占8.33%(4/48);G3P[8]优势组合占47.91%。结论引起安徽地区婴幼儿腹泻的轮状病毒G3P[8]是主要优势流行株,G9型为次之的优势株且存在混合G型感染。     

柳城县婴幼儿腹泻轮状病毒流行特征分析

目的研究柳城县婴幼儿腹泻轮状病毒(RV)G型和P型的分型.方法2010年1~4月收集柳城县5个医疗机构就诊的婴幼儿腹泻粪便标本237份,采用A群轮状病毒诊断试剂盒(胶体金法)进行初筛,对RV初筛阳性标本用聚丙烯酰胺凝胶电泳、酶联免疫吸附及逆转录-聚合酶链反应进行RV检测和G、P分型.结果初筛检出89份阳性标本,阳性率37.55%;复检检出71份阳性标本,在71份阳性标本中G型分型为G1型8株(11.27%),G2型5株(7.04%),G3型38株(53.52%),G4型2株(2.82%),G9型10株(14.08%),混和型3株,未定型5株; P型分型为 P[8]型60株(84.51%),P[4]型5株(7.04%),P[6]4株(5.63%),P[9],P[10]型未检出,混合型1株,未定型1株,G型与P型组合以G3P[8]最常见,G9P[8]、G1P[8]、G2P[4]次之.结论柳城县婴幼儿RV流行型别以G3P[8]为主.     

婴幼儿轮状病毒性腹泻的临床特点及分子流行病学分析

目的:通过分子流行病学调查银川地区婴幼儿轮状病毒性腹泻的病原学特点和临床相关性分析。方法:采用酶联免疫吸附试验(ELISA)及逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法对银川地区2009年7月～2010年6月收集的256例婴幼儿腹泻粪便标本进行轮状病毒(RV)检测。结果:在256例标本中应用ELISA法检测RV阳性率为60.2%(154/256),RT-PCR法阳性率为53.9%(138/256);其中G2型55份(39.9%)、G3型42份(30.4%)、未能分型26份(18.8%),不同G型混合感染8份(5.8%),G1型7份(5.1%),未发现G4和G9型。对标本进行P分型,P[4]基因型62份(44.9%),未能分型40份(29%),P[8]基因型36份(26.1%),无混合感染,未发现P[6]、P[9]、P[10]型。RV G型与P型的关系主要为P[4]G2、P[8]G3。结论:HRV是银川地区婴幼儿病毒性腹泻的最主要病原,临床症状重于非HRV腹泻。     

昆明市儿童医院1998～2001年轮状病毒哨点监测分析

目的 了解昆明市轮状病毒腹泻的流行状况。方法 以昆明市儿童医院为哨点监测,监测对象为5岁以下腹泻住院患儿,收集患儿的临床资料和粪便标本进行轮状病毒的检测和分型。病毒检测用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和酶联免疫吸附试验(ELISA),毒株分型用ELISA和/或反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)。结果 3年监测中共收集466份腹泻患儿的粪便标本,轮状病毒的检出率为52.8％(246/466)。轮状病毒感染97％发生于2岁以下儿童。感染有明显的季节性,10～12月份是流行季节。对204份轮状病毒阳性标本进行G分型,G1型为流行优势株,占47.5％,其次为G2型(17.6％)、G3型(15.7％)G9型(4.9％)和G4型(1.0％)。P基因型以P[4]、P[8]和P[6]型为常见。最常见的P-G组合型是P[4]G2,占34.1％(14/41),其次是P[8]G1和P[6]G9,分别占29.3％(12/41)和12.2％(5/41),还有其他7种不常见的P-G组合的毒株类型。结论 轮状病毒是昆明地区儿童腹泻住院的主要病原,毒株呈现型的多样性,应该开发和应用轮状病毒疫苗预防控制其流行。     

2008-2015年河南省A组轮状病毒基因型别变迁及流行病学特征研究

目的 分析2008-2015年河南省5岁以下腹泻儿童A组轮状病毒的感染状况,分子型别变迁及流行病学特征,为A组轮状病毒感染的监测、防控及爆发病例的调查及疫苗研发提供基线数据和方法学参考。方法 采集河南省4个监测哨点医院5岁以下儿童腹泻病例粪便样本2 510份,双抗体夹心ELISA法检测A组轮状病毒,阳性样本抽提病毒RNA,两步巢式多重RT-PCR进行G-P基因分型,同时收集患者流行病学与临床信息进行分析。结果 2510份腹泻样本共检出A组轮状病毒784份,总阳性率31.2%,各年的阳性率在17.4%~46.9%间,其中2013年阳性率最高(46.9%),2008年阳性率最低(17.4%)。轮状病毒检出率的季节性特征显著,存在秋季(9-11月份)和春季(3-5月份)两个较为显著的高峰。784株A组轮状病毒G分型以G1、G2、G3、G9为主;P分型以P[4]、P[8]为主;型别组合以G9P[8]、G2P[4]、G3P[8]、G1P[8]为主,还存在G13P[8]、G234P[8]、G39P[8]等混合感染型别;G1[8]、G3P[8]逐年递减,G9P[8]逐年递增,已成为河南省A组轮状病毒优势型别。A组轮状病毒感染病例男女性别比1.3∶1(450/334);阳性病例主要为4~12个月龄的婴幼儿患者(61.4%,481/784);城市阳性病例257例,阳性率26.4%(257/974);农村阳性病例527例,阳性率34.3%(527/1536),农村显著高于城市(χ2=18.15,P<0.001)。从临床体征看,大部分感染病例无发热、呕吐、脱水症状,出现发热、腹泻、呕吐、脱水等临床症状的病例多以轻症为主。结论 河南省5岁以下腹泻患儿中存在较高的A组轮状病毒感染率,以秋季和春季为主,秋季高于春季且存在混合感染病例;病原体可分为多种基因型别,G9P[8]为主要优势型别;病毒感染病例呈现不同的流行病学及临床特点,值得深入研究。     

2018-2020年济宁市病毒性腹泻患者轮状病毒感染率和基因型特征北大核心CSCD

目的了解济宁市病毒性腹泻患者轮状病毒感染率和轮状病毒基因型分布特征。方法2018-2020年在济宁市各县(市、区)每月采集3-5例病毒性腹泻患者的粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法检测轮状病毒核酸和进行基因型鉴定,分析轮状病毒核酸检测阳性率和基因型构成。结果本研究病毒性腹泻患者轮状病毒核酸检测总阳性率为6.6%(80/1217),0-4岁、5-9岁、10-14岁、≥15岁患者阳性率分别为11.6%、1.4%、1.3%、2.7%;1月份、2月份阳性率较高,分别为36.0%、25.0%。在34例基因型检出病例中,G2、G9基因型分别占2.9%、97.1%;P[4]、P[8]、P[4+8]基因型分别占2.9%、91.2%、5.9%;G2P[4]、G9P[8]、G9P[4+8]组合基因型分别占2.9%、91.2%、5.9%。结论2018-2020年济宁市病毒性腹泻患者轮状病毒感染以儿童为主,1-2月份感染风险高,G9P[8]基因型为优势流行毒株。     

石家庄市5岁以下儿童轮状病毒感染状况研究

目的:掌握石家庄市5岁以下腹泻儿童轮状病毒的感染状况.方法:于2006年11月～2007年11月在河北省儿童医院和石家庄市第一医院收集5岁以下儿童疑似病毒性腹泻病例粪便标本,用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测标本中HRV抗原,对部分阳性标本采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行HRVG血清型和P基因型分型.结果:170份标本HRV抗原107份阳性,阳性率62.9%.G血清型以G3型为主,未发现G4血清型.P血清型以P8为主,未发现P6、P9、P10等基因型.GP血清组合除常见的G1P[8]、G2P[4]、G3P[8]外,出现G9P[8]组合.结论:HRV是石家庄市婴幼儿腹泻的重要病原,流行的主要血清型为G3型.     

福州地区2009-2014年腹泻儿童轮状病毒特征

目的 了解轮状病毒在福州地区腹泻儿童中的流行情况.方法 收集2009-2014年5岁以下腹泻住院儿童粪便标本,用ELISA法检测轮状病毒抗原,RT-PCR法确定基因型别.对G9轮状病毒阳性标本的VP7基因全长测序及进化分析.结果 福州地区腹泻儿童轮状病毒高峰期在10～12月,呈单峰流行态势.G9轮状病毒在2011年后成为福州地区优势流行型别,毒株VP7基因核苷酸序列相似性92.5％～100％,毒株间有较高的同源性,进化分析都属于G9第3亚型.结论 G9轮状病毒在福州地区流行强度逐渐加强,目前已成为优势流行型别.毒株同源性高,属G9型3亚型.     

2007～2008年广西罗城县轮状病毒腹泻哨点监测分析

目的了解广西轮状病毒腹泻流行状况和特点。方法以广西罗城县为监测哨点,监测对象为5岁以下腹泻住院患儿,全年收集患儿的粪便标本进行轮状病毒检测和分型,使用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行病毒检测,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行病毒分型。结果2年共收集607份腹泻患儿粪便标本,轮状病毒检出率为54.29%。轮状病毒腹泻的主要流行季节为11月至次年2月,2岁以下患儿占全部患儿总数的96.11%。G1型为主要流行优势株,占64.54%,其次是G9型占12.77%。P基因型以P[8]为最常见型,P[6]次之;P[8]G1成为2007～2008年的主要流行株,还有其他7种不常见的P-G组合的毒株类型。结论轮状病毒是广西罗城县婴幼儿腹泻住院的主要病原,毒株流行型别显示一定的多样性和规律性,提示有必要在广西长期开展轮状病毒监测。     

兰州地区2004-2005年度婴幼儿病毒性腹泻的病原学研究

目的了解兰州地区主要四种腹泻病毒的流行病学特点.方法收集兰州大学第一医院儿科2004年7月至2005年6月5岁以下全部住院腹泻患儿400例的粪便标本,分别采用Dako公司酶免疫试剂盒检测轮状病毒、星状病毒、腺病毒,杯状病毒检测采用酶免疫法和逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）法.对轮状病毒、星状病毒阳性标本用RT-PCR进行毒株分型鉴定.结果400份标本中四种病毒检测阳性率依次为轮状病毒47.3%、杯状病毒15.5%、星状病毒9.5%、腺病毒7.5%.其中有混合感染的病例数占13.5%.轮状病毒毒株G血清型分型结果为G2（34.4%）、G3（32.8%）、G1（1.1%）、不同型混合感染（5.8%）、未能分型（25.9%）,P基因型分型结果为P[4]（45%）、P[8]（22.1%）、未能分型（32.9%）.G型与P型组合P[4]G2（43.6%）、P[8]G3（25.6%）,P[4]G3（13.8%）、P[8]G2（3.2%）、P[4]G1和P[8]G1各1例.星状病毒血清分型结果为1型（57.8%）、3型（2.6%）、8型（2.6%）、未能分型（36.8%）.病毒性腹泻的高发季节轮状病毒最为明显为10-12月份.发病年龄主要为2岁以下婴幼儿,轮状病毒的高发年龄是6-23月龄.结论兰州地区婴幼儿病毒性腹泻的病原复杂,轮状病毒仍是最主要病原,该年度轮状病毒的主要流行株为P[4]G2,与往年明显不同,病原混合感染比例较大,值得重视.