膜辅助蛋白CD46 rs1970530遗传变异对肝癌发病风险的影响

背景与目的：膜辅助蛋白CD46可保护宿主细胞免受补体依赖的细胞毒性作用，研究表明，CD46可能作为肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）患者的潜在生物标志物。探讨CD46基因表达及启动子区遗传变异与HCC发病风险的关系。方法：通过基因表达谱交互分析（gene expression profiling interactive analysis，GEPIA）在线网站分析HCC组织和正常肝组织CD46表达的差异；2011—2015年在华北理工大学附属唐山市工人医院和华北理工大学附属唐山市人民医院经病理学检查确诊且未经放化疗的240例HCC患者作为病例组，对照组为同时期入院体检的500名健康人群。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析（polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism，PCR-RFLP）法进行基因分型，检测两组基因型频率和等位基因频率，评估CD46 rs1970530遗传变异与HCC发病风险的关系。结果：CD46在HCC组织与正常组织中的表达差异有统计学意义（P<0.05）。经非条件logistic回归分析发现，CD46 rs1970530至少携带一个G等位基因型在病例组及对照组之间差异有统计学意义（OR=0.666，95% CI：0.448~0.990，P<0.05）；两组间等位基因G频率差异有统计学意义（OR=0.689，95% CI：0.478~0.994，P<0.05）。分层分析结果显示，至少携带一个G等位基因者可降低高年龄组（>60岁）（P=0.048）和男性（P=0.023）人群的HCC发病风险，在女性和低年龄组（≤60岁）中差异无统计学意义（P>0.05）。按吸烟状态进行分层分析，rs1970530变异与HCC易感性无明显关联（P>0.05）。结论：HCC中CD46基因高表达及CD46 rs1970530遗传变异影响HCC发病风险。     

MSH2基因遗传变异影响肺癌易感性及预后

目的探讨MSH2基因启动子区遗传变异与肺癌易感性及预后的关系。方法选取700例非小细胞肺癌患者和700例正常受试者进行成组病例对照研究,随访并收集2组人群的一般资料和生存资料。用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术和Taqman探针法分别对rs6757310和rs1863332进行基因型检测。用卡方检验比较分类变量的分布,用非条件Logistic分析各基因型与肺癌遗传易感性的关系。用Kaplan-Meier生存曲线、Log-Rank检验和Cox多因素回归模型评估各基因型患者间的预后差异。结果总人群中rs6757310和rs1863332变异未引起肺癌易感性变化。进一步分层分析显示,MSH2 rs6757310 CC基因型与吸烟者肺癌易感性相关(吸烟,P<0.05;累计吸烟量>30包/年,P<0.05),并导致鳞癌易感性增强(P<0.05)。MSH2 rs1863332 GG基因型仅在老年人中引发更高的肺癌易感性(P<0.05)。生存分析显示:MSH2 rs6757310 CC基因型患者中位生存时间(MST)为31个月,均显著低于CG基因型(61个月)和GG基因型(45个月),差异均有统计学意义(均P<0.05);MSH2 rs1863332 GG基因型患者MST为19个月,均显著低于GT基因型(39个月)和TT基因型(48个月),差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论MSH2 rs6757310和rs1863332遗传变异可能影响肺癌易感性及预后。     

CD55启动子区rs2564978多态性影响肝癌遗传易感性

目的 探讨CD55在肝癌中表达及预后影响,并分析CD55 rs2564978遗传变异对肝癌遗传易感性的影响。方法 通过数据库GEO和Kaplan-Meier plotter分析CD55在肝癌中表达及预后影响;随机抽取中国北方汉族334例肝癌患者和940例健康对照进行成组设计病例对照研究。PCR-RFLP法进行基因多态检测,卡方检验比较分类变量的分布,非条件logistic校正混杂因素,OR及其95%CI评价各基因型与肝癌易感性的关系。结果 CD55在肝癌组织中表达上调（t=-3.130,P=0.003）且CD55高表达与携带肝炎病毒的肝癌患者不良预后相关（HR=2.28,95%CI:1.10～4.72,P=0.022）。与TT基因型携带者相比,CT基因型（OR=1.45,95%CI:1.08～1.96,P=0.014）与CC基因型（OR=1.55,95%CI:1.08～2.22,P=0.018）携带者肝癌易感性均上升。分层分析显示,rs2564978 T>C变异增加男性肝癌易感性（OR=1.58,95%CI:1.03～2.41,P=0.036）;高年龄组（>60岁）CC携带者具有更高的肝癌易感性（OR=2.46,95%CI:1.35～4.47,P=0.003）;吸烟人群和饮酒人群中,CC携带者肝癌易感性上升（吸烟:OR=1.91,95%CI:1.02～3.58,P=0.042;饮酒:OR=2.37,95%CI:1.20～4.67,P=0.013）。结论 CD55在肝癌组织中表达上调并导致肝癌患者预后不良;CD55启动子区rs2564978遗传变异可能与肝癌易感性相关。     

LINC01936在乳腺癌中的表达及其对细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭特性的影响

摘 要：［目的］ 研究LINC01936在乳腺癌中的表达及其对细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响。［方法］ 从UCSC XENA数据库中获取LINC01936在1 099例乳腺癌组织和292例非配对癌旁组织及112例配对样本中的表达数据。用LINC01936-pcDNA3.1或pcDNA3.1质粒转染人乳腺癌MCF-7细胞,获得过表达LINC01936的MCF-7细胞和对照 MCF-7细胞。使用cell counting kit-8(CCK-8) 细胞增殖实验测定LINC01936对MCF-7细胞增殖的影响。采用Transwell实验和细胞划痕实验测定细胞迁移和侵袭能力。通过细胞黏附实验检测黏附能力。荧光Hoechst33342染色法用于评价LINC01936对细胞凋亡的影响。Western blot和免疫荧光法用于检测NF-κB的蛋白水平。［结果］ 生物信息学分析表明,LINC01936在乳腺癌组织中低表达。CCK-8检测显示,LINC01936抑制MCF-7细胞的增殖（P<0.05）。Transwell实验及细胞划痕实验表明,转染LINC01936过表达质粒后,MCF-7细胞迁移和侵袭能力下降。细胞黏附实验表明,LINC01936减弱乳腺癌细胞的黏附能力（P<0.05）。荧光染色分析表明,LINC01936过表达促进MCF-7细胞的凋亡。Western blot和免疫荧光显示,LINC01936促进NF-κB的表达。［结论］ LINC01936可能通过促进NF-κB的表达来抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并促进细胞凋亡。     

5-Aza-dC联合不同化疗方案对肺腺癌细胞凋亡的影响

目的:探讨不同化疗药物联合DNA甲基化酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷（5-Aza-dC）对肺腺癌细胞A549细胞凋亡的影响。方法:采用前瞻性随机对照研究方法,分别使用顺铂、紫杉醇、吉西他滨及5-Aza-dC联合药物处理A549细胞。根据药物干预方式的不同分为对照组、顺铂联合紫杉醇（TP）组、顺铂联合吉西他滨（GP）组...     

基于生物信息学分析CD59在胰腺癌中的表达 及预后影响

目的 通过生物信息学方法分析CD59在胰腺癌中的表达及预后意义。方法 利用基因表达谱交互分析2（gene expression profiling interactive analysis 2，GEPIA2）和人类蛋白组图谱（human protein atlas，HPA）数据库比较CD59在胰腺癌组织与癌旁组织中的表达差异；利用卡普兰麦尔（Kaplan-Meier plotter）数据库评价CD59表达水平对患者预后的影响；利用String和Cytoscape3.9.1软件分析CD59蛋白互作网络；利用DAVID6.8对CD59及关键的互作基因进行基因富集和通路富集分析。结果 与正常组织相比，CD59在胰腺癌组织中的表达显著上调（P<0.05），CD59高表达患者的总体生存时间（HR=2.3，95%CI：1.52~3.50）和无复发生存时间（HR=4.31，95%CI：1.57~11.83）较CD59低表达患者短。蛋白互作网络分析揭示CD59与CD55、GOLGA2、LMAN1、TMED2和SERPINA1等多个分子关系密切。基因本体（gene ontology，GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）富集分析表明CD59主要参与补体激活、先天免疫反应和冠状病毒-COVID-19等通路。结论 CD59在胰腺癌组织中高表达，受免疫相关基因的影响，且与患者预后较差相关，可作为胰腺癌早期诊断及预测预后的标志物之一。     

CD46 rs1970530遗传变异影响肺腺癌易感性和预后

目的 探讨CD46 rs1970530变异与肺腺癌易感性和预后的关系。方法 该病例对照研究包括400例肺腺癌患者和600例正常对照。使用χ2检验比较病例组和对照组中性别、年龄和吸烟状况之间的分布差异。使用PCR -限制性片段长度多态性分析对CD46 rs1970530遗传变异进行基因分型。使用非条件logistic回归分析CD46 rs1970530变异与肺腺癌易感性的关系。使用Kaplan - Meier生存曲线、Log - Rank检验和Cox多因素回归模型评估CD46 rs1970530变异各基因型患者间的预后差异。通过UALCAN数据库分析CD46基因在肺腺癌组织及其癌旁正常组织中的表达差异,使用Kaplan - Meier Plotter数据库分析CD46表达对肺腺癌患者总体生存时间的影响。结果 CD46基因在肺腺癌组织中的表达显著高于正常组织,且CD46高表达肺腺癌患者的总体生存时间显著高于CD46低表达患者。与CD46 rs1970530 AA基因型携带者相比,至少携带一个G等位基因的肺腺癌患者的发病风险显著增加（OR = 1.52,95%CI:1.10～2.09）。不同性别和年龄的中位生存时间不存在统计学差异（P＞0.05）。在肺腺癌患者中,不吸烟者的中位生存时间（48个月）显著高于吸烟者（19个月）（P = 0.001）。携带CD46 rs1970530 GG基因型的肺腺癌患者的中位生存时间（10个月）显著低于AA基因型（35个月）和AG基因型患者（56个月）（P = 0.002）。多因素COX回归分析显示,CD46 rs1970530GG基因型是肺腺癌患者预后的高危因素（HR = 5.15,95%CI:1.81～14.66）。结论 CD46 rs1970530变异可以增加肺腺癌的发病风险,并提示预后不良。