基于生物信息学探讨肝癌相关细胞焦亡基因及潜在中药预测

目的 探究肝癌患者的细胞焦亡基因与预后的相关性以及细胞焦亡差异基因的相关性,并预测调控差异表达基因的中药,通过分析中药的性味归经、药物分类探讨治疗肝癌患者细胞焦亡的中医理论,为中医药现代化提供新思路。方法下载TCGA数据库中肝癌患者的转录组数据,以关键词“pyroptosis”搜索GenCards数据库,获取细胞焦亡相关基因并筛选、分析其在肝癌的表达量、共表达情况,并进行预后分析、基因本体论（gene ontology,GO）功能富集分析、DO（diease ontology）疾病分析;再通过CTD数据库查找对基因有调控作用的化学成分。最后应用COREMINE数据库查找相关中药,并统计高频中药的性味归经、药物分类。结果 共筛选出16个与预后相关的细胞焦亡基因,其中11个基因有较多相关的中药,其中高频中药为茶树根、郁金、人参、丁香、干姜等;药性以寒、温为主;药味以苦、甘为主;归经以肝、肺经居多;以补虚药、清热药、化痰止咳平喘药、解表药、理气药和活血化瘀药为主。结论 通过生物信息学技术分析得出肝癌相关细胞焦亡基因及对应的高频中药,为治疗肝癌的中药新药开发及中医药理论的微观挖掘提供思路。     

巨噬细胞激活与极化在心肌纤维化的作用及中医药干预

心肌纤维化（MF）是多种心脏疾病的常见病理表现,由于心肌细胞的不可再生性,MF的发生代表心肌出现不可逆性的损伤。以往的研究认为,成纤维细胞介导的胶原沉积是心肌纤维化的主要机制。最新的研究发现,心脏本身存在免疫调控机制,巨噬细胞激活/极化在MF中占有重要地位。随着中医药研究的不断深入,学者们发现中药可通过调控肾素-血管紧张素-醛固酮系统（RAAS）系统、调节炎症进程、修复细胞外基质、管理氧化应激、维护自噬平衡等方面干预MF,而这一过程与巨噬细胞的激活及M1/M2型极化密切相关。在整个MF过程中,巨噬细胞活化是有益的,但不可过度,否则将变为有害。在MF早期,适当的M1型巨噬细胞极化有利于激活免疫,清除有害物质;在MF中后期,适当的M2型巨噬细胞极化有利于重塑受损的心肌。若巨噬细胞活化过度/不足,或M1/M2型巨噬细胞极化的平衡被打破,则效应由挽救变为破坏。具有调控巨噬细胞活化/极化的中药多具有益气养阴,理气活血的功效,但也不乏清热燥湿解毒之品。因此,MF的发生可能为气阴不足、湿热蕴毒、气滞血瘀所致。通过总结巨噬细胞激活/极化在MF中涉及的生物学过程,阐述中医药从不同角度调控巨噬细胞激活及M1/M2型极化改善MF的研究进展,以期为中医药治疗MF提供借鉴。     

基于生物信息学及分子对接研究天牛止眩胶囊治疗原发性高血压的潜在活性成分及分子机制

目的 利用生物信息学及分子对接,探讨天牛止眩胶囊治疗原发性高血压（essential hypertension,EH）的潜在活性成分及分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台、BATMAN-TCM平台筛选天牛止眩胶囊的活性成分及药物靶点,使用GeneCards、PharmGkb、TTD、DrugBank检索EH的疾病相关靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“药物–成分–靶点”网络图,应用STRING平台进行蛋白质–蛋白质相互作用分析,使用R软件包进行基因本体论（gene ontology,GO）与京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析,运用AutoDockTools及AutoDock Vina进行分子对接验证,使用PyMol软件进行可视化分析。结果 共筛选出天牛止眩胶囊有效成分53种,涉及相关靶点基因422个。筛选出关键活性化合物217个,拓扑分析得出核心靶点蛋白AKT1、MAPK8、NFKB1、FOS、MAPK1、JUN等10个,GO及KEGG富集分析结果提示天牛止眩胶囊干预EH主要涉及细胞对外的刺激、对活性氧的反应、氧化应激反应等多种生物学途径与涉及脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等相关通路。分子对接结果显示FOS与槲皮素及山柰酚结合力最强。结论 天牛止眩胶囊中的槲皮素、山柰酚等多种关键活性成分可作用于FOS、JUN、AKT等多个核心靶点蛋白,发挥调控血压、降低心脑血管并发症危险等级、保护靶器官的作用。     

基于生物信息学分析肝癌差异基因及潜在的中药干预

目的 探究肝癌患者的差异基因表达量与预后的相关性,以及差异基因在多种癌症的调控作用,并寻找潜在的治疗靶点以及对应中药,为临床中药的使用、中医药组方及加减用药提供依据.方法 从TCGA数据库下载肿瘤患者的转录组数据以及相应临床数据,使用R语言的edgeR包分析得出差异表达基因,并筛选、分析关键基因在泛癌的表达量及共表达情...     

陈新宇教授运用平调阴阳法治疗肥厚型心肌病

肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)为临床常见遗传性心肌病之一,预后差异较大,为心源性猝死的主要原因之一.陈新宇教授在长期临床诊疗中倡导首辨阴阳、次辨虚实,运用平调阴阳法论治HCM.方药多选取桂枝加黄芪汤、生脉散、桂枝茯苓丸、柴胡加龙骨牡蛎汤等,灵活加减,临床疗效佳.