中国大陆EV71病毒分离株的分子流行病学研究

目的了解1987-2010年中国大陆肠道病毒71型（EV71）分离株的分子流行病学特点及其种系进化、基因分型和遗传变异性。方法从GenBank/NCBI上获得中国大陆来源的具有完整VP1或近似完整VP1基因的核苷酸序列信息的413株EV71毒株进行分析,采用MEGA5.0软件,构建系统进化树,计算相同或不同基因型及基因亚型毒株的核苷酸与氨基酸的相似性。结果 1987-2010年,中国大陆20个省、市或地区均分离到具有完整VP1序列的毒株,且2008年以来数量陡增;中国大陆流行的主要是C型,只有2008年安徽和2009年湖北发现了A型;各基因型在43、58、142、164、167、184、240、249、292等氨基酸位点发生了特异性变异;从健康人体内分离的HQ129932毒株与其他序列比较,氨基酸无特异性变异。结论 C型株可能具有更强的传染力;氨基酸位点变异对于EV71病毒进化有重要意义;VP1基因与疾病的严重程度无明显关联;应加强C4a亚型疫苗候选疫苗株对其他基因型毒株的交叉保护作用研究。     

中国大陆柯萨奇病毒A组16型全基因参照序列的初步建立和分析

目的建立中国大陆柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)流行株的全基因参照序列。方法从GenBank中获得CoxA16中国大陆分离株的所有全基因序列和氨基酸序列,用DNAstar/MegAlign软件对所得序列进行多序列比对和进化分析,按照参照序列标准拟定CoxA16的全基因参照序列和氨基酸序列,并与参考序列进行比对分析。结果中国大陆分离的CoxA16毒株全基因序列共8株,分离于2005-2009年,其中2008年5株,广东省5株;通过序列比对获得了大陆CoxA16全基因和氨基酸参照序列;参考毒株间核苷酸序列同源性介于79.0%～98.8%,氨基酸序列同源性为94.3%～99.9%,与参照序列的核苷酸同源性为79.7%～97.0%,氨基酸同源性介于95.1%～99.5%之间,同源性最低的为2008年安徽阜阳的FY18株。结论比对分析了中国大陆CoxA16毒株全序列,成功建立了中国大陆CoxA16全基因和氨基酸参照序列。     

广东珠海地区慢性胃炎患者幽门螺杆菌的体外多重耐药性研究

目的分析广东珠海地区幽门螺杆菌（Hp）临床分离株体外多重耐药特点,为临床根除Hp治疗提供依据。方法对珠海地区312例经胃镜确诊、活检快速尿素酶试验阳性的慢性胃炎患者行Hp分离及菌株培养,采用折点敏感试验方法测定Hp对甲硝唑、呋喃唑酮、阿莫西林、克拉霉素的单药及多药耐药情况。结果共获得95株Hp菌株,其对4种抗生素耐药率由高到低依次为甲硝唑、呋喃唑酮、阿莫西林、克拉霉素,双重耐药率为30．53％-58．95％,多重耐药率26．32％～37．89％。结论广东珠海地区Hp多重耐药情况严重,行根除Hp治疗时应尽量避免应用甲硝哗：府进行药敏试验,寻求个体化治疗方案。     

他汀类药物抗感染作用的研究进展

他汀类药物(statins)除有降脂作用外,还具有多效性,包括抗氧化、抗炎抗感染、免疫调节、改善血管内皮细胞功能和抑制血栓形成、稳定粥样硬化斑块等作用。目前对statins的抗微生物感染作用研究越来越多,包括实验室的研究和人群的流行病学研究,本文收集了statins抗细菌感染、抗病毒作用、抗真菌及其他微生物感染的实验室及流行病学证据并进行了分析。     

EV71疫苗的研究进展

肠道病毒71型（Enterovirus 71，EV71）的感染主要引起儿童的手足口病（hand—foot-and—mouth disease，HFMD），以手、脚和口腔粘膜疤疹或破溃成溃疡为主要临床特征，严重者可引起无菌性脑膜炎、脊髓灰质炎样瘫痪、致命性脑炎等中枢神经系统并发症。自从EV71病毒于1969年首次从美国加利福尼亚州患有中枢神经系统疾病的婴儿粪便标本中分离出来后，它在欧洲和亚洲国家已引起多次高死亡率的流行暴发。     

淋巴瘤的疾病分类分析

恶性淋巴瘤是一大组复杂的淋巴造血系统恶性肿瘤的总称,2001年世界卫生组织正式出版了淋巴造血组织肿瘤的分类,WHO（2008版）淋巴瘤分类对原有类型作出了必要修正,并增加了近年来被认识和明确的新类型,霍奇金淋巴瘤（HL）的分型没有变动,编码员只有熟练掌握淋巴瘤的主要分型,找相关资料或向病理科医师请教,才能提高对淋巴瘤分类的准确率.     

中国大陆柯萨奇病毒A组16型全基因参照序列的初步建立和分析

目的建立中国大陆柯萨奇病毒A组16型（CoxA16）流行株的全基因参照序列。方法从GenBank中获得CoxA16中国大陆分离株的所有全基因序列和氨基酸序列,用DNAstar/MegAlign软件对所得序列进行多序列比对和进化分析,按照参照序列标准拟定CoxA16的全基因参照序列和氨基酸序列,并与参考序列进行比对分析。结果中国大陆分离的CoxA16毒株全基因序列共8株,分离于2005-2009年,其中2008年5株,广东省5株;通过序列比对获得了大陆CoxA16全基因和氨基酸参照序列;参考毒株间核苷酸序列同源性介于79.0%～98.8%,氨基酸序列同源性为94.3%～99.9%,与参照序列的核苷酸同源性为79.7%～97.0%,氨基酸同源性介于95.1%～99.5%之间,同源性最低的为2008年安徽阜阳的FY18株。结论比对分析了中国大陆CoxA16毒株全序列,成功建立了中国大陆CoxA16全基因和氨基酸参照序列。     

中国大陆柯萨奇病毒A组16型全基因参照序列的初步建立和分析

目的 建立中国大陆柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)流行株的全基因参照序列.方法 从GenBank中获得CoxA16中国大陆分离株的所有全基因序列和氨基酸序列,用DNAstar/MegAlign软件对所得序列进行多序列比对和进化分析,按照参照序列标准拟定CoxA16的全基因参照序列和氨基酸序列,并与参考序列进行比对分析.结果 中国大陆分离的CoxA16毒株全基因序列共8株,分离于2005-2009年,其中2008年5株,广东省5株;通过序列比对获得了大陆CoxA 16全基因和氨基酸参照序列;参考毒株间核苷酸序列同源性介于79.0％～98.8％,氨基酸序列同源性为94.3％～99.9％,与参照序列的核苷酸同源性为79.7％～97.0％,氨基酸同源性介于95.1％～99.5％之间,同源性最低的为2008年安徽阜阳的FY18株.结论 比对分析了中国大陆CoxA16毒株全序列,成功建立了中国大陆CoxA16全基因和氨基酸参照序列.     

基于EV71交叉保护抗原P1的前体蛋白B细胞抗原位点的预测

目的 获得EV71 P1保守氨基酸序列COBRA EV71 P1和基于此序列的B细胞抗原表位预测信息.方法 从NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上下载获取1970-2010年间世界各地暴发流行的包含P1或VP1基因片段的EV71源序列和对应的氨基酸序列,根据VP1基因片段信息构建系统进化树,对源序列进行基因分组;对多基因型的EV71 P1氨基酸源序列采用多序列比对,以优势氨基酸位点代替差异氨基酸位点的方法,获得EV71 P1保守序列(COBRA EV71 P1),并运用IEDB Analysis Resource(http://tools.immuneepitope.org/main/)在线预测工具和DNASTAR软件里的Protean模块,运用单参数和二级结构预测综合考虑的方法,对COBRA EV71 P1前体蛋白的B细胞抗原表位进行预测.结果 成功比对出COBRA EV71 P1氨基酸序列,预测结果发现在COBRA EV71 P1前体蛋白的第10-24,41-60,68-82,208-225,328-345,498-514,592-609,664-678,772-786和841-855位点均具有较好的亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的无规则卷曲和β-转角,有可能是COBRA EV71 P1前体蛋白的优势表位.结论 经生物信息学分析,推测COBRA EV71 P1可能具有三个基因型EV71 P1前体蛋白的候选B细胞线性抗原表位,为EV71重组多表位疫苗设计和多基因型病毒样颗粒疫苗实验提供了理论基础.