新型冠状病毒核酸临床检测要点及经验

2019年12月以来,新型冠状病毒感染引起的肺炎病例数快速攀升。因患者体内病毒核酸的存在是目前唯一的确诊依据,而目前临床上普遍反映核酸检测阳性率不够理想,故对病毒核酸检测的实验室条件、检验人员及检测过程中各个环节都有较高要求。本文着重阐述了新型冠状病毒核酸检测各个环节中的检测要点、最新的行业规范及共识内容,同时探讨临床检测中的疑难问题,以期为新型冠状病毒所致疾病的准确诊断提供理论依据。     

中国不同流行疫区利什曼原虫分离株的微卫星多态性分析

目的了解中国荒漠、山丘和平原疫区利什曼原虫分离株的种群遗传学和流行病学特点。方法选用7个微卫星标记(Lm2TG,Li21-34,Li71-19,Li45-24,Li71-7,Li71-33,Li72-17/2)分别对中国不同疫区的5株杜氏利什曼原虫分离株(9044、SC9、771、LIU和XU)与WHO杜氏利什曼原虫参照株(MHOM/IN/80/DD8)进行PCR扩增和测序,分析序列的微卫星多态性,使用MEGA5.0软件构建系统发育树,推断杜氏利什曼原虫的种群结构。结果 6株杜氏利什曼原虫分离株均扩增出7个微卫星位点。7个位点在杜氏利什曼原虫中检出3~7个等位基因,基因多样性最低为0.523 8(Li45-24),最高为1.000(Li72-17/2)。构建的系统发育树中,中国不同疫区的5株分离株与WHO参照株聚合为一群,其中山丘疫区四川犬分离株表现出明显的多态性。结论中国不同疫区杜氏利什曼原虫分离株的微卫星序列存在丰富的多态性,种系发育分析显示利什曼原虫遗传多态性与地理来源之间存在相关性。     

双侧掌腱膜变异并掌长肌缺如一例

在一具约40岁男性尸体上,发现双侧掌腱膜变异并掌长肌缺如。为积累国人体质变异资料,现报道如下:双侧前臂前面正中线部位无掌长肌,桡侧腕屈肌与尺侧腕屈肌相邻,其深面为指浅屈肌。双侧掌腱膜较正常有掌长肌腱和腕横韧带相连的掌腱膜更为发达,甚为坚韧,直接连于腕横韧带。双侧掌     

Penta D/Penta E基因座在云南回族群体中基因多态性研究

目的获得2个短串联重复（short tandem repeat，STR）基因座（Penta D、Penta E）在云南回族人群中的基因型及等位片段频率分布，获得相应位点的群体遗传学数据。方法204份EDTA抗凝血样采自云南昆明地区无血缘关系的回族个体，利用荧光标记复合扩增及毛细管电泳自动荧光检测的方法，对该群体样本检测，获得2个STR基因座等位基因的分布频率等群体遗传学数据，并检验它们基因型频率分布是否符合Hardy—Weinberg平衡，计算法医学常用各种概率。结果全部样本的每个STR基因座都获得了清晰的基因型分型结果。2个STR基因座均符合Hardy—Weinberg平衡。结论获得2个STR基因底的基因型分型结果，适用于法医学亲权鉴定和个人识别，为人类群体遗传学研究提供了2个STR基因座的云南回族群体数据。     

胃癌关键基因和通路的生物信息学和功能分析

目的：本研究拟通过生物信息学分析的方法分析胃癌及癌旁正常组织差异表达的基因，探索胃癌的发病机制，为胃癌的早期诊断和治疗评估提供新思路。方法：从基因表达数据库中获取GSE79973和GSE19826基因表达谱，使用GCBI在线实验室筛选差异表达基因，并使用基因本体论分析、代谢通路分析、基因信号通路网络分析、共表达分析对所获得基因进行分析。结果：与对照组相比，在胃癌组织中筛选出共1206个基因呈差异表达。其中，542个基因表达下调，664个基因表达上调；差异基因主要涉及细胞粘附、细胞外基质组织、细胞外基质分解、胶原蛋白分解代谢过程等方面，PAthway分析发现核心信号通路主要涉及粘附力、糖酵解/糖异生、Wnt信号通路、癌症通路等方面；基因信号通路网络分析发现的关键节点基因为UGT2B15、ITGA2、ITGB1、CYP3A4；共表达网络分析推测的关键节点基因为SH3GL2、CKMT2、CHIA、ATP4A。结论：INHBA、UGT2B15、ITGA2、ITGB1、SH3GL2等基因及其相关的生物过程可能是胃癌的潜在生物标志物和治疗靶标，生物信息学有助于全面深入研究疾病发生机制，筛选可能的核心靶点，为临床诊断及疾病治疗提供参考。     

361例疑似肺孢子菌肺炎患者核酸检测结果分析

目的对四川大学华西医院361例疑似肺孢子菌肺炎(PCP)患者核酸检测结果进行统计分析,分析PCP发病率以及PCP患者年龄、科室和病种分布情况。方法采用实时荧光定量PCR(qPCR)技术对PCP疑似病例进行核酸检测和诊断,通过实验室信息系统(LIS)和医院信息系统(HIS)收集患者耶氏肺孢子菌(PJ)核酸检测结果和患者临床信息。使用SPSS22.0和EXCLE2007软件对数据进行统计分析。结果 361例疑似PCP病例的总体患病率为31.02%(112/361),总体病死率为8.93%(10/112);年龄为31~40岁的疑似病例PCP发病率最高,达46.51%(20/43),41~50岁年龄段PJ核酸检测阳性病例32例(28.75%),占比最高;HIV患者和肾脏病患者的PCP发病率最高。结论 PCP发病呈现年轻化趋势,肾脏疾病正成为PCP的高发基础病种。     

3种RNA提取方法在血清丙型肝炎病毒RNA定量检测中的性能评价

目的 比较3种方法对血清HCV RNA的提取性能,并对其作方法学评价,揭示RNA提取技术对HCVRNA定量的影响.方法 使用QIAamp Viral RNA Mini Kit(Q法),NucliSens miniMag系统(M法)和匹基(PG)丙型肝炎病毒定量试剂盒自带RNA提取方法(P法)进行血清HCV RNA提取,实时荧光RT PCR定量检测,对77例临床血清标本进行了提取检测,同时设计了方法学评价实验,从准确度,重复性,线性和灵敏度方面评价3种方法.结果 77例临床标本的M、Q和P法阳性率分别是85.7%、84.4%和36.3%;25例共同阳性标本中,M和Q法的CT值分别比P法平均低7.5和9.35,表现出高于P法的提取效率和RNA质量;M和Q法的标准变异指数(S.D.I.)绝对值均<2,P法S.D.I.绝对值>2;M法平均CV为40.0%,Q法为71.0%,P法>100.0%;M法表现最佳的线性(R>0.99),M、Q和P法的最低检测限分别为39.4、394和3943 IU/ml.结论 从提取效率和收获RNA质量上M和Q法远远优于P法,进一步方法性能表明,M法为HCV RNA定量最佳提取方法,而P法因其提取效率低、收获RNA质量差以及重复性不好,不适合临床HCV RNA定量试验.