lncRNA RP11-86H7.1在川崎病诊断中的临床意义

目的：探讨lncRNA RP11-86H7.1在川崎病（KD）患者血清中的表达及其与临床病理特征及预后的关系。方法：筛选KD特异相关的循环lncRNA，分KD治疗前患儿组、KD治疗后患儿组、普通发热患儿组及健康儿童组，采用qPCR检测各组血清lncRNA RP11-86H7.1相对表达。分析血清lncRNA RP11-86H7.1相对表达与KD临床病理特征间关系；绘制ROC曲线，分析血清lncRNA RP11-86H7.1表达水平对KD的诊断效能。结果：KD急性患儿组血清lncRNA RP11-86H7.1相对表达量高于各对照组（P＜0.05）；年龄和性别比例与低表达组比较差异无统计学意义（P＞0.05）；qPCR发现lncRNA RP11-86H7.1在KD急性期患儿血清中表达水平明显高于KD恢复期、健康儿童及发热儿童组，差异均有统计学意义（P＜0.05）。结论：血清lncRNA RP11-86H7.1在KD患者中表达上调，其可作为KD早期诊断和评估预后的潜在的生物标志物。     

lncRNA/miRNA在胰腺癌发生发展中的研究进展

ncRNA/miRNA在多种实体肿瘤中表达异常，参与肿瘤的增殖、侵袭、转移。胰腺癌是发病率较高、死亡率高的恶性肿瘤，通过深入研究lncRNA/miRNA在胰腺癌发生发展中的分子机制，可为胰腺癌的治疗提供新的靶点。     

SNHG6靶向miR-101/TGFBR1促进AMI小鼠左心室心肌纤维化

目的探讨SNHG6对急性心肌梗死(AMI)小鼠左心室心肌的影响。 方法将30只雄性C57/BL6小鼠构建成AMI小鼠后随机均分为AMI组、AMI+SNHG6组、AMI+miR-101-3p组、AMI+SNHG6+miR-101-3p组、AMI+miR-101-3p+TGFBR1组,另设正常小鼠6只为假手术组。qRT-PCR检测AMI小鼠SNHG6、miR-101-3p表达水平。心脏彩超检测各组小鼠左室射血分数(LVEF);马松和天狼星红染色法以及免疫组化分析各组小鼠左心室心肌纤维化变化。将H9C2细胞株分为阴性对照组(转染空质粒)、SNHG6组(转染质粒SNHG6)、miR-101-3p组(转染质粒miR-101-3p)。Western blotting检测各组TGFBR1蛋白表达;采用双荧光素酶报告基因法预测并验证SNHG6/miR-101-3p/TGFBR1荧光素酶活性及调控机制。 结果AMI小鼠较假手术组SNHG6表达显著增加,miR-101-3p降低(P＜0.05)。与AMI组比较,AMI+SNHG6组小鼠LVEF降低,心肌纤维化程度加重(P＜0.05);AMI+miR-101-3p组LVEF升高,心肌纤维化程度减轻(P＜0.05)。AMI+SNHG6+miR-101-3p组较AMI+SNHG6组LVEF升高、心肌纤维化程度减轻(P＜0.05),而AMI+miR-101-3p+TGFBR1组较AMI+miR-101-3p组LVEF降低、心肌纤维化程度加重(P＜0.05)。双荧光素酶报告基因法验证显示,miR-101-3p组SNHG6、TGFBR1野生型质粒的荧光素酶活性较阴性对照组明显降低(P＜0.05)。 结论SNHG6抑制miR-101-3p上调TGFBR1加重AMI小鼠左心室心肌纤维化。     

Activated Ras/JNK driven Dilp8 in imaginal discs adversely affects organismal homeostasis during early pupal stage in Drosophila,a new checkpoint for development

Background

Dilp8-mediated inhibition of ecdysone synthesis and pupation in holometabolous insects maintains developmental homeostasis through stringent control of timing and strength of molting signals. We examined reasons for normal pupation but early pupal death observed in certain cases.

Results

Overexpression of activated Ras in developing eye/wing discs inhibited Ptth expression in brain via upregulated JNK signaling mediated Dilp8 secretion from imaginal discs, which inhibited ecdysone synthesis in prothoracic gland after pupariation, leading to death of ~25- to 30-hour-old pupae. Inhibition of elevated Ras signaling completely rescued early pupal death while post-pupation administration of ecdysone to organisms with elevated Ras signaling in eye discs partially rescued their early pupal death. Unlike the earlier known Dilp8 action in delaying pupation, hyperactivated Ras mediated elevation of pJNK signaling in imaginal discs caused Dilp8 secretion after pupariation. Ectopic expression of certain other transgene causing pupal lethality similarly enhanced pJNK and early pupal Dilp8 levels. Suboptimal ecdysone levels after 8 hours of pupation prevented the early pupal metamorphic changes and caused organismal death.

Conclusions

Our results reveal early pupal stage as a novel Dilp8 mediated post-pupariation checkpoint and provide further evidence for interorgan signaling during development, wherein a peripheral tissue influences the CNS driven endocrine function.

     

结肠癌免疫相关 lncRNA 风险预测模型的建立

目的 分析影响结肠癌预后的免疫相关 lncRNA, 并构建预测结肠癌患者预后的相关预测模型。 方法 下载 TCGA 数据库中的结肠癌 lncRNA 表达谱, 数据经 TPM 标准化后分析所有 lncRNA 的差异性表 达, 其中缺失值的补充采用 KNN 法, 通过共表达方法提取并鉴定免疫相关 lncRNA, 然后对差异性表达的 lncRNA 进行 LASSO 回归分析, 再进行单因素和多因素 COX 回归分析。 最后使用 R 4. 0. 2 统计学软件的 ggplot2 包基于 lncRNA 风险评分与基因表达关系, 构建风险因子关联图、 KM 曲线及评价模型预测价值的 ROC 曲线。 结果 经过表达差异性分析发现, 共有 2 258 个 lncRNA 在癌和癌旁组织中差异性表达, 其中上 调的有 1 648 个, 下调的有 610 个。 选取差异表达前 100 位的免疫相关 lncRNA 进行 LASSO 回归分析, 共筛 选出 12 个 lncRNA, 再进行单因素和多因素 COX 回归分析后显示 AC092723. 1、 AC007182. 1 和 AC004947. 1 与预后明显相关, 使用 R 4. 0. 2 统计学软件构建预后风险因子关联图, ROC 曲线显示其预测 1 年、 3 年和 5 年的预测价值均较高, 其 AUC 分别为 0. 79 (95 % CI: 0. 67 ~ 0. 91), 0. 78 (95 % CI: 0. 66 ~ 0. 9), 0. 7 (95 % CI: 0. 51 ~ 0. 9)。 结论 研究使用 TCGA 公共数据库进行生物信息学分析并构建的预后模型显示有 较高的预测价值, 除具有一定的临床意义外, 对未来 lncRNA 相关结肠癌的研究也提供了一定的方向。     

药物性肝损伤与免疫性肝损伤肝组织中lncRNA表达谱的差异分析

目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)在药物性肝损伤及免疫性肝损伤中表达谱的变化,并分析二者的差异。方法:利用lncRNA芯片技术分别检测对乙酰氨基酚诱导的小鼠药物性肝损伤及刀豆蛋白A诱导的小鼠免疫性肝损伤肝组织的lncRNA表达谱,通过对原始数据进行预处理达到均一化后,筛选出差异表达lncRNA并进行分析。结果:与正常肝脏组织比较,变化1.5倍以上并且差异有统计学意义(P0.05)的lncRNA被认为是差异表达的lncRNA;药物性肝损伤肝组织中变化1.5倍以上的共68条,其中升高1.5倍以上的共21条,降低1.5倍以上的共47条;免疫性肝损伤肝组织中变化1.5倍以上的共60条,其中升高1.5倍以上的共17条,降低1.5倍以上的共43条。所有的lncRNA中有8条lncRNA同时在2种肝损伤肝组织中上调,在药物性肝损伤肝组织上调的lncRNA中占38%,在免疫性肝损伤肝组织中占47%;有28条lncRNA同时在2种肝损伤肝组织中下调,在药物性肝损伤肝组织下调的lncRNA中占59%,在免疫性肝损伤肝组织中占65%。结论:与正常肝脏组织比较,药物性肝损伤肝组织和免疫性肝损伤肝组织中lncRNA表达谱均发生明显变化,且2种不同肝损伤肝组织比较,lncRNA表达谱也存在差异,提示2种肝损伤肝组织中这些同时上、下调的lncRNA可能参与了2种肝损伤之间相似或是相同的病理生理过程,而那些表达不同的lncRNA可能参与相对特异的肝损伤机制的发生。