生物序列比对算法与图形硬件加速研究

探索准确、高效、低成本、通用性并存的生物序列比对方法.将点阵图算法、启发式算法等各种序列比对算法中准确性最高的动态规划算法在计算机中实现,并通过流模型将其映射到图形硬件上,以实现算法加速;通过数据库比对搜索实例,进行比对时间和每秒百万次格点更新(MCUPS)性能值评测.结果表明,该加速算法在保证比对准确性的同时,能较大地提高比对速度.与目前最快的启发式算法相比,比对平均加速为18倍,最高加速可达28倍.     

“以学生为中心”教学与教学评价的理论与实践探索——以医学生物信息学为平台

随着主体教育的深入和素质教育的推行,“以学生为中心”的教育思想得到了教育界的高度重视.文章从理论角度,深度剖析了“以学生为中心”教学和教学评价的特点及重要性;并以医学生物信息学为平台,对其进行了实践探索.结果显示,“以学生为中心”教学和教学评价能较好地培养学生解决问题、自我评价、信息处理等高级技能,提升创新能力.     

新型教学体系在生物信息学中的探索与实践

学科交融是现代科学的趋势、当今高等教育的难点。以生物信息学为教学平台,研究交叉学科的创新性教学。创立以专业背景为基础、整合型教学大纲为主线、创新型教学内容为载体、大实验体系为抓手、＂多样性教学模式＂为工具的新型教学体系。该体系能发挥学生学习积极性、协同性和创造性,提升学生学习、科研、应用能力,对提高交叉学科的教学质量有很强的借鉴意义。     

高等院校生物信息学双语教学课程建设之我见

生物信息学是一门新兴交叉学科,该学科的出现为生命科学的研究带来革命性的变革,它几乎是今后所有生物医药研发所必需的工具。文章针对生物信息学的特点和教学现状,分析了开展双语教学的难点,提出生物信息学双语教学课程建设的对策。     

丹酚酸A抑制TLR4/JNK MAPK改善棕榈酸诱导的心肌细胞损伤

目的:研究丹酚酸A对脂毒性诱导的H9C2心肌细胞损伤的改善作用并初步探究其分子机制。方法:采用棕榈酸体外诱导建立H9C2心肌细胞脂毒性模型并给予丹酚酸A进行干预,采用乳酸脱氢酶法检测细胞损伤,采用细胞增殖-毒性检测试剂盒检测细胞存活率,采用罗丹明123染色观察心肌细胞线粒体膜电位变化,采用蛋白免疫印迹技术研究丹酚酸A改善作用的分子机制。结果:浓度为400μmol/L的棕榈酸可显著导致H9C2心肌细胞脂毒性损伤(P<0.05)。不同浓度(10、20、40、80μmol/L)丹酚酸A暴露对心肌细胞无毒性作用(P>0.05)。丹酚酸A干预显著改善脂毒性诱导的心肌细胞损伤及细胞线粒体膜电位降低(P<0.05)。激活Toll样受体4(Toll-like receptors,TLR4)可显著增强脂毒性诱导的心肌细胞损伤(P<0.05),而抑制TLR4显著减轻棕榈酸诱导的细胞脂毒性(P<0.05)。此外,丹酚酸A显著抑制棕榈酸诱导的TLR4及其下游c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK MAPK)(P<0.05)。结论:丹酚酸A改善脂毒性诱导的心肌细胞损伤,该保护作用可能与其抑制TLR4/JNK MAPK信号通路有关。     

大蒜素的药理作用及其开发应用

大蒜素(allicin)又名大蒜新素,化学名二烯丙基三硫化物(CH2=CH-CH2-S-S-S-CH2-CH=CH2),是从蒜的球形鳞茎中提取的挥发性油状物,为大蒜的主要有效成分,被誉为天然广谱抗生素。近年来,大蒜素以其来源广、结构简单、生物活性作用明显、不易产生耐药性、价格低廉等优点,在防治心血管     

多媒体系统在植物学实验教学中的应用

应用先进的多媒体演示系统进行实验教学,实验教学广度和深度明显提高.结合植物学实验教学特点,探讨了多媒体系统的功能、实验课件制作、教学效果、操作方法和维护.     

大蒜素对人脐静脉细胞抗氧化损伤保护作用

目的：研究大蒜素（Allicin）对过氧化氢（H2O2）诱导人脐静脉内皮细胞（HUVEC）凋亡的保护作用及其作用机理。方法建立H2O2诱导HUVEC细胞的氧化应激凋亡模型;采用MTT、RT-PCR、Western-blot等方法检测来探究大蒜素对其保护作用与可能作用机制。结果大蒜素能够减少H2O2诱导HUVEC的凋亡;使基因eNOS的表达显著增加;使凋亡相关PARP蛋白切割减弱、前体Caspase-3蛋白表达增加,Bax蛋白表达减弱。结论大蒜素对H2O2诱导HUVEC凋亡具有较好的保护作用,对氧化应激状态下的HUVEC细胞起保护作用。     

急性白血病治疗中静脉丙种球蛋白的应用

急性白血病化疗抑制期的出血感染治疗棘手,死亡率高,亦是目前大剂量化疗失败的重要因素。1991年我院开始在常规治疗基础上加用静脉丙种球蛋白,疗效明显,使5例急性白血病化疗抑制期达21天的感染得到控制,2例抑制期有颅内出血患者安全渡过抑制期达完全缓解,现报告如下。 一、一般资料:12例中,男5例,女7例,平均年龄38岁,均为初诊病例。经骨髓检查加组化染色确诊。按天津白血病会议诊断标准,其中M_1 2例,M_2 2例,M_3 2例,M_4 2例,M_5 2例,M_6 1例,慢粒急淋变1例。11例采用DA或HA方案化疗,1例采用VDCP方案化疗。12例化疗抑制期7～21天,白细胞平均最低值0.65×10~(9)/L,血小板平均最低值2.5×10~(9)/L,12例均合并感染(其中上呼吸道感染2例,肺部感染2例,口腔感染5例,腹泻2例,臀部感染1例)。最高体温平均39.8℃,2例高热达40℃时出现头痛、呕吐,轻度意识障碍,1例左口角歪斜左巴氏征( ),另1例布氏征( )。均经头颅CT证实左丘脑出血破入脑室,1例右底节区小量出血,诊断合并颅内出血。     

急性嗜碱性粒细胞白血病1例

患者女,33岁。1987年10月下旬受凉后鼻塞、流涕、咽痛,自服克感敏、速效感冒胶囊,症状消失,1周后出现双下肢皮肤瘀斑。12月上旬又出现上述症状,并畏寒、发热(38℃),血常规无异常,予安痛定、病毒灵注射液治疗,3天后症状消失,但进行性乏力,活动后心悸、气短,皮肤瘀斑,并有鼻衄,经期延长、