生物信息学筛选活动性肺结核的潜在生物标志物的临床研究

〔摘 要〕 目的：利用生物信息学技术筛选活动性肺结核（PTB）诊断和治疗监测的潜在生物标志物。方法：通过 GEO 数据库下载 GSE19444 和 GSE19435 基因芯片数据集。利用 GEO2R 工具筛选活动性 PTB 患者与健康对照间的差异表达基 因（DEG），使用 CentiScape 插件确定中枢基因（Hub 基因），并通过 GSE56153 数据集验证 Hub 基因在活动性 PTB 治疗 期间的变化。结果：两个数据集中共筛选 505 个 DEG，上调 251 个，下调 254 个。DEG 网络的 9 个子模块中模块 1 评分最 高，包含的 25 个基因主要参与病毒防御、干扰素信号通路等反应。在 25 个基因中筛选了 13 个 Hub 基因，通过验证，提示 上调的 IFIT3、IFI35、STAT1 和 GBP1 在初诊活动性 PTB、治疗 8 周、治疗 28 周和健康对照组的表达水平有显著降低趋势。 结论：筛选出的 IFIT3、IFI35、STAT1 和 GBP1 与活动性 PTB 的发生和治疗密切相关，有望成为 PTB 诊断和治疗监测的潜 在生物标志物。     

关于统计学检验结论在文章中表达的要求

根据人民卫生出版社出版的全国高等学校教材《卫生统计学》第5版,报告统计学检验的结论时,对Р值小于或等于检验水准(一般为0.O5)的情况,一律描述为“差异有统计学意义”,同时写明P的具体数值或相应的不等式,不再采用将P<0.05描述为“差异有显著意义(或差异有显著性)”将P<0.01描述为“差异有非常显著意义(或差异有非常显著性)”的表达方法。     

白芍与赤芍种质问题探讨

白芍与赤芍均来源于芍药Paeonia lactiflora Pall.，通常认为加工方法是导致2种药材功效差异的本质原因，仅根据加工方法而不考虑药材种质，就会出现药材的性状、活性成分含量不能很好吻合药材的质量标准。芍药具有丰富的遗传多样性，从白芍和赤芍的本草考证、种质差异及药材化学成分差异的影响3个方面阐明了白芍和赤芍药材的种质存在的差异，白芍应为古人从野生芍药中选育出的栽培品种P.lactiflora ′Baishao′。白芍与赤芍基原问题的澄清可为优质药材生产提供参考。     

肿瘤标志物检验在胃癌诊断中的临床价值分析

目的分析探讨肿瘤标志物检验在胃癌诊断中的临床价值。方法选择在本院进行治疗的胃癌患者40例,将其列为观察组,选取体检健康者40例,将其列为普通组,具体的选择时间为2018年2月-2019年2月,对两组患者的CEA、CA72-4、CA19-9水平及阳性表达率进行比较分析。结果观察组患者CEA、CA72-4、CA19-9明显高于普通组,差异具有统计学意义(P<0.05)。观察组患者的肿瘤标志物阳性表达率明显高于普通组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论肿瘤标志物在胃癌的诊断中具有非常重要的意义,肿瘤标志物对胃癌患者的诊断较为确切,利于患者的确诊及后期治疗,从而提高患者的生命及生活质量。     

非吸烟女性肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测

目的：对非吸烟女性肺癌潜在相关基因进行生物信息学分析及功能预测，探讨非吸烟女性肺癌患者的发病机制及预后标志物。方法：选择从GEO数据库下载非吸烟女性肺癌患者的基因芯片并用GEO2R软件筛选出差异表达基因（differentially expressed gene，DEG），再利用STRING 在线分析软件对DEG 进行GO 和KEGG 分析以及蛋白互作（protein-protein interaction,PPI）网络分析，然后利用插件（M-CODE）对所有DEG进行可视化处理，筛选关键DEG，最后利用GEPIA及Kaplan-Meier plotter在线工具对关键DEG进行功能预测及预后分析。结果：共筛选出160 个DEG，其中上调54 个、下调106 个；GO分析其生物学功能主要与血管形成、单个生物细胞间黏附、GTPase活性正调控和信号转导密切相关（均P<0.05）。KEGG分析发现，可能主要与细胞黏附分子、白细胞迁移、紧密连接和胞吞作用相关（均P<0.05）。PPI 网络分析获得8 个关键DEG，分别是TIE1、PECAM1、VEGFD、ICAM2、ESAM、EMCN、ROBO4 和CLDN5。结论：TIE1、CLDN5、ICAM2、ESAM、VEGFD、ROBO4 可能是非吸烟女性肺癌发病机制的研究靶点，PECAM1、EMCN可能是预测非吸烟女性肺癌患者病情进展及预后的标志物。     

甲状腺癌患者组织miR表达的变化探究

目的探究与观察甲状腺癌患者组织miR表达的变化情况。方法选取2016年1月至2017年11月本院就诊的52例甲状腺癌患者为观察组,同时期的52例甲状腺良性疾病患者为对照组。检测与比较两组的组织miR表达情况,并比较不同分期甲状腺癌患者的组织miR表达情况。结果观察组的组织miR表达高于对照组,分期较高的甲状腺癌患者的组织miR表达高于分期较低者,差异有统计学意义(P <0.05)。结论甲状腺癌患者的组织miR呈现高表达的情况,且分期较高者的表达也相对较高,因此在甲状腺癌患者中的检测价值较高。     

LRIG3基因过表达对人神经母细胞瘤细胞系SK-N-MC细胞生物学行为的影响

目的 探讨富含亮氨酸重复序列免疫球蛋白样蛋白3（LRIG3）基因过表达对人神经母细胞瘤细胞系SK-N-MC细胞生物学行为的影响。方法 体外培养人神经母细胞瘤细胞系SK-N-MC细胞，分成空白对照组（A组，不转染任何载体或质粒）、载体组（B组，转染载体）和LRIG3过表达组（C组，转染含LRIG3基因过表达质粒）。 荧光定量PCR和免疫印迹法检测LRIG3、Caspase-3和Caspase-9的mRNA和蛋白表达水平。Transwell试剂盒检测细胞侵袭能力，AV-PI试剂盒检测细胞凋亡水平，CCK-8试剂盒检测细胞增殖能力。结果 C组Caspase-3和Caspase-9的mRNA和蛋白表达水平以及细胞凋亡率明显高于A组和B组（P<0.05），细胞增殖率和细胞侵袭能力明显低于A组和B组（P<0.05），而A组和B组之间均无统计学差异（P>0.05）。结论 LRIG3过表达可以抑制人神经母细胞瘤细胞系SK-N-MC细胞增殖和侵袭，促进其凋亡，其机制可能与促进Caspase-3和Caspase-9表达有关