应用比较毒理基因组学数据库解析棉酚对动物机体的毒性作用机制

目的 利用生物信息学方法分析棉酚(gossypol)及其衍生物醋酸棉酚(gossypol acetic acid)诱导的差异基因和涉及的信号通路,解析棉酚对动物机体的毒性作用机制,为开发减毒棉酚类新药物提供思路。方法 利用比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomic Database, CTD)筛选棉酚及其衍生物(醋酸棉酚)诱导的差异基因,分析两者诱导的共同差异基因、差异基因间相互作用网络、差异基因的KEGG通路,利用网络毒理学方法对分析结果进行验证。结果 CTD筛选得到棉酚及其衍生物(醋酸棉酚)诱导的差异基因115个,两者共同诱导的差异基因2个。基因相互作用网络分析与KEGG分析得出在差异基因中,CYCS、CASP3和BCL2L1有较多交互基因,介导多种细胞凋亡通路。以神经毒性为例,网络毒理学验证得出棉酚及其衍生物通过诱导CYCS、CASP3和BCL2L1等差异基因的表达引起对机体的毒作用。结论 本次基于2022年2月更新的CTD所开展的生物信息学分析得出,棉酚类物质的毒性作用主要是通过线粒体依赖性细胞凋亡途径实现的,即棉酚及其衍生物诱导Bcl-2基因家族表达下调、Caspase基因家族表达上调进而促进细胞凋亡从而起到毒性作用。     

发展基因组学和生物信息学刻不容缓

自丹麦学者约翰逊用基因 ( gene)来表述孟德尔在豌豆杂交实验中发现的“性状单位”或“单位因子”以来 ,基因这个词已被普遍接受并沿用了 90年 ,其含义亦随着对遗传物质认识的深化而逐渐具体化。基因的现代定义可表述为 :遗传信息的结构与功能单位 ,指一段 DNA分子 ,也可以是一段 RNA分子(如 RNA病毒 )。一个物种的全部遗传信息的总和则称为基因组 ( genome) ,既可以指一套染色体 (单倍体 ) ,也可以指其中的全部核酸。如人类基因组即指人的 2 3条染色体 ( 2 2条常染色体和 1条性染色体 )或 2 3条染色体内的全部 DNA,由 2 3条极长的DNA…     

人类基因组计划和医学的未来

２０世纪生物学的特征之一是从分子水平解释生命现象。蛋白质、糖和ＤＮＡ分子结构的阐明、试管婴儿的降生、转基因植物和转基因动物的广泛开展、克隆羊“多利”的诞生以及人类基因组“工作框架图”的完成是２０世纪生物学的巨大成就。２１世纪将是生物学的世纪 ,生命科学的信息化是２１世纪发展的主流方向 ,生物经济时代已向我们走来。医学的发展从临床医学、预防医学走向预测医学的新阶段。展望２１世纪的医学 ,基因诊断技术将会得到普及 ,基因治疗在２０年内成为现实 (常规应用 ) ,生命科学的其他方面将取得突破 ,从而造福人类。人类基因…     

抗病毒药物研究新领域：病毒感染基因组学

由于病毒基因组编码基因数量少，从病毒中发现药物靶标受到一定限制。最后的研究表明，抑制宿主细胞中某些蛋白的功能可以阻断病毒感染。与病毒基因组相比，人类基因组序列中可能包括更多的病毒繁殖有关的基因。用DNA微阵列技术分析宿主基因表达，是一种从宿主细胞角度发现潜在抗病毒靶标的有效方法。最近报道了有关病毒影响宿主细胞基因表达谱的研究战略，以及通过表达谱分析来发现与病毒复制有关的宿主细胞通路。因此，人类基因组学技术在发现新的抗病毒药物研究中具有重要作用。     

功能基因组学和蛋白质组学在生殖医学研究中的应用

后基因组时代,或者称为功能基因时代,是基因组研究的收获时代,研究重点已经从揭示生命的所有遗传信息转向整体水平上对生物功能的研究.第一个转向标志就是产生了"功能基因组学"学科,它采用了生物芯片(Biochip)、微阵列制样(Microarry)等新技术,对成千上万的基因表达进行分析和比较,力图从基因组整体水平上对基因的活动规律进行阐述.但是由于生物功能的体现者是蛋白质,仅仅从基因的角度来研究是远远不够的,因此在人类基因组计划和功能基因组学研究基础上,产生了一门在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科--蛋白质组学(Proteomocs).     

组合化学基因组学蛋白南学在药物发现上的应用和发展

本文主要介绍作为药物发现工具的组合化学、基因组学、蛋白质学在部分国外新技术公司的应用和发展状况，籍此了解组合化学、基因组学、蛋白质学的相关知识以药物发现之间的关系，并预测它们的发展方向和可能对未来药物发现产生的影响。     

染色质的重塑与基因表达调控

研究人员将基因组DNA称为基本或终极模板(ultimate template)，将染色质比作生理模板。染色质作为真核细胞遗传信息的载体，其动态的结构状态与真核细胞和基因的功能密切相关，对基因组中遗传信息的表达有显著影响。这种影响遗传信息表达的结构状态变化即是染色质的重塑。随着功能基因组学研究的深入，在染色质水平研究基因的表达调控是全面阐明真核基因表达调控机制以及在疾病发生中的异常的必经之路。现就染色质的结构及其变化在基因表达调控中的作用作一简要综述。     

基因组学与蛋白质组学对手法研究的意义

分子生物技术在很多学科领域中被广泛应用,并且许多研究已取得一定的成绩。反观推拿科研工作中应用分子遗传学生物技术相对较少。通过剖析推拿科研面临的现状和问题,探讨分子生物学技术在推拿科研中应用及其临床的指导意义,以期弥补当前推拿研究方法从宏观角度分析推拿问题的不足,开拓临床思路。应用分子生物技术有助于阐明推拿研究中各种重要问题。