基于蛋白质谱技术的胰腺癌化学治疗评估模型的建立及其意义

化疗在晚期胰腺癌治疗中有着不可取代的作用.目前,胰腺癌患者较为常用的化疗药物有吉西他滨、5-氟尿嘧啶(5-FU)、紫杉醇类等[1].82个研究中心的3023例晚期胰腺癌患者的Ⅲ期临床试验结果显示,吉西他滨较5-FU能更好的改善患者的预后[2].但是,目前现有的胰腺癌相关标志物,如血清CA19-9、CEA水平及影像手段如CT、MRI等对胰腺癌化疗效果的评估及监测效力却依然低下.因此,建立一种高敏感、高特异的,对化疗效果及预后有着监测能力的新型的评估方法对改善患者的预后及指导治疗有着极大的意义.     

利用磁珠分离联合MALDI-TOF-MS技术判定早期IgA肾病的病理表现

目的利用尿蛋白质组学的新方法,寻找无创性尿液标记物,用以判断临床早期IgA肾病的病理表现。方法对55例早期IgA肾病患者[其中23例病理表现较重（重病理损伤组）,32例病理表现较轻（轻病理损伤组）]及14例病理检查完全正常者（正常对照组）的尿液,利用阳离子磁珠分离技术联合基质辅助激光解吸／电离飞行时间质谱法（MALDI-TOF-MS）分析尿液蛋白质质谱。结果建立了3个尿蛋白质／多肽模型。发现潜在的生物标志物及其诊断模型可以区分重病理损伤组和轻病理损伤组,其敏感性和特异性分别为90．48％和96．77％。区分轻病理损伤组和正常对照组的诊断模型,其敏感性和特异性分别为9355％和85-71％。区分重病理损伤组和正常对照组的诊断模型,其敏感性和特异性分别为100％和9286％。结论利用磁珠分离联合MALDI-TOF-MS的尿蛋白质组技术在判定早期IgA肾病的病理表现显示出较大潜力。     

肾母细胞瘤患儿血清蛋白质标记物的筛选及鉴定

目的 筛选肾母细胞瘤患儿特异性血清蛋白质标记物并对其进行鉴定,以确定其作为肾母细胞瘤血清学诊断和预后监测的特异标志物.方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肾母细胞瘤患儿手术前后及正常小儿的血清蛋白质组,筛选差异蛋白质峰,并对目标蛋白质进行分离纯化、酶解,采用液质联用串联质谱(LC-MS/MS)分析,用SEQUST检索程序查询美国Bioworks公司提供的蛋白质序列数据库.结果 经SELDI-TOF-MS技术筛选出m/z位于6455.5和6984.4的蛋白质标志物在肾母细胞瘤组低表达(表达强度为1029±364、297±126),正常小儿组高表达(2108 ±837、753±226),差异均有统计学意义(均P＜0.01);m/z位于9190.8的蛋白质标志物在肾母细胞瘤术前组低表达(283±154),术后组和正常小儿组高表达(5974 ±657、6231±519)差异均有统计学意义(均P＜0.01).对m/z位于6455.5和9190.8的标志物进行鉴定,结果分别为载脂蛋白CⅢ和触珠蛋白.结论 检测血清中载脂蛋白CⅢ和触珠蛋白含量可能成为肾母细胞瘤的血清学诊断、恶性度分级和预后监测指标,值得进一步研究与应用.     

脑脊液蛋白质指纹图谱模型在急性颅脑损伤研究中的应用

颅脑损伤是当今威胁人类生命的主要疾患之一,尽管对颅脑损伤的研究不断深入,但颅脑损伤仍有高伤残率和高致死率.常规的颅腩损伤诊断多依赖于CT、MRI、SPECT(单光子发射计算机断层扫描)等神经影像学技术,这些诊断工具在判定患者的一般脑功能状态上是有价值的,但缺乏对脑损伤程度的精确及量化的评估.     

滋阴清热方对狼疮鼠脾淋巴细胞的核蛋白质的影响

目的:探讨滋阴清热方和泼尼松对狼疮鼠脾淋巴细胞的核蛋白质的影响。方法:用生理盐水(对照组)、中药、西药和中西药等不同的干预措施处理狼疮鼠5周,提取脾淋巴细胞核蛋白质,运用表面增强激光解析离子化-飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测各处理组狼疮鼠核蛋白质的表达差异,揭示滋阴清热方以及联合泼尼松治疗SLE的作用环节。结果:在脾淋巴细胞的核蛋白质中发现对照组出现一些加重自身免疫的蛋白质,而西药组出现一些抑制免疫反应的蛋白质;中西药组和西药组对脾淋巴细胞的核蛋白质影响的结果是相似的。结论:滋阴清热方中药和或泼尼松可能通过影响脾淋巴细胞细胞的分化和蛋白质的表达达到治疗目的。     

尿蛋白组学筛选检测过敏性紫癜患者的肾损害

目的 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选早期过敏性紫癜肾炎患者尿液中的特异标志蛋白.方法 CM10(弱阳离子交换表面)蛋白芯片结合SELDI-TOF-MS技术,检测60例过敏性紫癜患者(30例伴发紫癜性肾炎,30例不伴肾炎)尿液中的蛋白质质谱,用浙江大学肿瘤研究所蛋白芯片数据分析系统筛选过敏性紫癜肾炎特异的尿液蛋白标志物.结果 共检测到154个经过信噪比和强调过滤的高质量质谱蛋白质峰,从中筛选出2个表达差异显著(P＜0.05)的蛋白标志物.用遗传算法结合支持向量机模型的方法筛选出最佳模型,用留一法评估模型的预测效果为敏感性84％,特异性71％.结论 尿蛋白质谱与生物信息学分析方法对早期过敏性紫癜肾炎的检测具有一定的敏感性和特异性.     

血清蛋白质指纹图谱在甲状腺癌诊断中的应用

目的 检测甲状腺癌、甲状腺良性结节和正常人血清中蛋白质组图谱，筛选特异的蛋白质标记物。构建用于甲状腺癌早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型。方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测108例血清标本的蛋白质质谱，其中甲状腺癌40例（Ⅰ～Ⅱ期26例，Ⅲ～Ⅳ期14例），甲状腺良性结节36例，正常人32例。随机抽取87例标本（甲状腺癌32例，甲状腺良性结节30例，正常人25例）作为训练组，应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据，建立甲状腺癌诊断模型，留一法交叉验证。结果区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性87．5％，特异性80．0％，用15例未知血清盲法测试敏感性100％。特异性86％。区分甲状腺癌和甲状腺良性结节的诊断模型交叉检验敏感性81％，特异性87％，用14例未知血清盲法测试敏感性88％，特异性83％。结论 SELDI-TOF-MS技术结合生物信息学方法检测甲状腺癌血清蛋白质指纹图谱是早期诊断甲状腺癌的一种特异性强。敏感性高的新方法。值得进一步研究。     

支持向量机软件在胰腺癌早期诊断中的应用研究

目前应用于临床的血清标志物大多为肿瘤相关标志物，即一种标志物可在不同肿瘤中都可能有表达，特异性较低。我们应用统计学和生物信息学的支持向量机软件建立胰腺癌的肿瘤标志物的组合模式识别系统，用以判断正常，胰腺良性疾病及胰腺恶性肿瘤三种人群，并评价其临床意义，进而为其他肿瘤的诊断提供可行的判断方法。     

脑膜瘤和脑良性肿瘤及脑外伤患者脑脊液蛋白质谱差异表达模型的研究

目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和生物信息学分析技术寻找脑脊液中能鉴别脑膜瘤和其他脑良性肿瘤及脑外伤诊断的新标志物。方法收集14例脑膜瘤、9例其他脑良性肿瘤和27例轻度脑外伤患者的脑脊液标本，用H4蛋白芯片和SELDI-TOF-MS检测蛋白质谱的表达。用Biomarker PattemsTM Software分析软件进行数据处理，建立区分脑膜瘤和脑外伤患者脑脊液中蛋白质谱差异表达模型和区分脑膜瘤和其他脑良性肿瘤脑脊液中蛋白质谱差异表达模型；并用2个模型对各2例脑膜瘤、其他脑良性肿瘤和脑外伤患者进行盲法交叉验证。结果用5个质荷比峰建立的区分脑膜瘤和脑外伤脑脊液蛋白质谱差异表达模型的准确率为98％(49/50)．敏感性为100％(14/14)，特异性为96．3％(26/27)，阳性预测率为93．3％(14/15)，阴性预测率为100％(27/27)。用4个质荷比峰建立的区分脑膜瘤和其他脑良性肿瘤脑脊液蛋白质谱差异表达模型的准确率为96％(48/50)，敏感性为100％(14/14)，特异性为94．4％(34/36)，阳性预测率为92．3％(14/16)，阴性预测率为100％(34/34)。盲法交叉验证，第一个模型能将脑肿瘤、其他脑良性肿瘤和脑外伤全部正判，第二个模型将1例脑外伤误判。结论用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息学技术初步建立的区分脑膜瘤与脑外伤和其他脑良性肿瘤的脑脊液蛋白差异表达模型，为寻找脑膜瘤中新的肿瘤标志物进行蛋白质组学研究开辟了一条新的途径。     

胆道闭锁血清蛋白质标记物的检测

目的 寻找特异性诊断胆道闭锁的血清蛋白标记物.方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测28例血清标本(胆道闭锁7例,先天性胆总管囊肿7例,婴肝综合征3例,正常对照11例)的蛋白质质谱表达,结合生物信息学方法(SVM)分析数据.结果 筛选出m/z位于3403、2108、2111、2131、2823的5个蛋白质标记物区分肝胆疾病和正常对照小儿的血清蛋白指纹图谱模型,敏感性94.1%,特异性81.8%;筛选出m/z位于3403蛋白质标记物区分胆道闭锁和正常对照小儿的血清蛋白指纹图谱模型,敏感性100%,特异性100%;筛选出m/z位于3403、4796的2个蛋白质标记物区分胆道闭锁和其他肝胆疾病的血清蛋白指纹图谱模型,敏感性71.4%,特异性80.0%.结论 应用SELDI-TOF-MS结合SVM构建的胆道闭锁血清蛋白指纹图谱模型为胆道闭锁的早期诊断方法开拓了新方向,值得进一步研究.