靶向测序诊断黑棘皮病1家系

【摘要】 报道临床症状不典型的家族性黑棘皮病1家系。先证者女，4岁，自1周岁时，颈部、腹部出现黑色斑片，近年来逐渐扩大至唇周、躯干前部。腹部皮肤全反式共聚焦显微镜检查可见乳头环下延扭曲及沟壑结构，乳头环内可见中高折光颗粒结构。先证者父亲及祖母既往有类似病史，但随着年龄增长色素沉着自发性消退，仅有局部皮纹增粗。采集先证者及父母、祖母外周血，对先证者外周血DNA行Panel靶向测序，结果显示，先证者存在FGFR3基因14号外显子c.1949A>C（p.Lys650Thr）错义突变，Sanger测序验证证实先证者及其父亲和祖母均存在此突变。诊断：家族性黑棘皮病。     

高黏型肺炎克雷伯菌分子流行病学特点

目的分析临床分离的高黏性肺炎克雷伯菌(Hypermucoviscous Klebsiella Pneumoniae,HMKP)分子流行特征,为临床控制此类细菌的传播提供实验室资料。方法收集2017年4月-2019年5月某教学医院临床患者首次分离的HMKP,PCR扩增6种常见高毒力血清型基因K1、K2、K5、K20、K54、K57,9个毒力基因rmpA、kfu、Aerobactin、iroN、entB、ybtS、fimH、mrkD、allS,多位点序列分型(MLST)分析菌株间的同源性。结果共收集63株HMKP,标本主要来自急诊ICU和神经内科ICU,两者共占33.33%(21/63);痰液标本占比最高,为50.79%(32/63),其次为血液标本,占20.63%(13/63)。HMKP菌株对大部分抗菌药物均敏感。血清分型以K1和K2型为主,分别占39.68%和30.16%。K1型的毒力基因携带模式以rmpA+Kfu+Aer+iroN+entB+ybtS+fimH+mrkD+allS为主,占92.00%,K2型以rmpA+Aer+iroN+entB+fimH+mrkD为主,占47.37%。主要的ST分型有ST23型21株,ST86型7株,ST65型4株,ST218型4株。结论 HMKP在医院内多引起重症监护患者的下呼吸道感染,应当制定严格的预防措施和实施长期的监测来控制HMKP菌株在这些病区的流行。     

HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者HBV前C/BCP突变/准种与HBeAg和HBV DNA的关系

目的探讨HBeAg阳性慢性乙型肝炎（eP-CHB）HBV前C/BCP突变/准种及其与HBeAg、HBV DNA水平的关系。 方法采用断面研究对2016年1月至2018年12月就诊于首都医科大学附属北京佑安医院的220例eP-CHB患者进行前C/BCP突变检测，其中24例患者进行前C/BCP区扩增、克隆，同步检测血清HBeAg和HBV DNA水平，分析前C/BCP突变/准种的发生情况及其与HBeAg和HBV DNA水平的关系。 结果220例eP-CHB患者中，HBV前C/BCP总突变率为70.0%（154/220），前C/BCP共同突变率为18.2%（40/220），前C突变率为30.9%（68/220），BCP突变率为57.3%（126/220）。HBV DNA≥ 5 lgIU/ml患者上述4种突变检出率均高于HBV DNA< 5 lgIU/ml者，其中前C/BCP总突变和BCP突变患者差异有统计学意义（χ² = 5.809、P = 0.016，χ² = 5.081、P = 0.024）。HBeAg水平越低（< 500 COI、500～1 000 COI和> 1 000 COI共3组患者比较），以上4种突变检出率越高，差异有统计学意义（χ² = 31.738、17.291、16.263、22.164，P均< 0.001）。HBV DNA≥ 5 lgIU/ml患者中，HBeAg水平越低，以上4种突变检出率越高，差异亦均有统计学意义（χ² = 40.503、19.654、16.727、29.119，P < 0.001）。准种检测中，前C区高突变组患者HBeAg水平低于低突变组，差异有统计学意义（t = 2.230、P = 0.017），前C、BCP高突变组与低突变组间HBV DNA水平差异无统计学意义（t = 0.624、P = 0.462，t = 0.893、P = 0.317）。 结论eP-CHB患者中仍存在广泛的前C/BCP突变。高HBV DNA、低HBeAg表达者，前C和BCP突变的发生率较高；前C区突变株在准种中比率高者更影响HBeAg的表达。推测前C/BCP突变可能是eP-CHB出现低HBeAg、高HBV DNA，并导致抗病毒治疗停药后易复发的原因。     

人Mcl-1基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

目的:对人Mcl-1基因启动子区结合蛋白进行生物信息学分析。方法:从Gene Bank数据库中获取人Mcl-1基因5'调控区,使用在线软件JASPAR对该序列可能存在的转录因子结合位点进行预测。结果:Relative profile score threshold在85%、90%、95%和100%时,该序列存在1700、1147、368和32个可能的转录因子结合位点,包含Arid3a,Atoh1,ETV6,Gata1,GATA3,KLF5,LMX1A,LMX1B,MZF1,Prrx2,SPI1,TBX4,USF1,YY1,ZEB1等。结论:人Mcl-1基因5'调控区存在多种转录因子的结合位点,这些转录因子大多与肿瘤发生,红细胞生成及神经发育等有关。     

脑白质疏松与亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性的研究

目的探讨影响脑白质疏松(leukoaraiosis,LA)形成的相关因素,并分析亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性对LA发病的影响。方法收集2015年1月~2016年3月在我院接受治疗的134例LA患者作为LA组和73例健康体检的老年人作为对照组,收集受试者的一般临床资料并进行相关生化检测。对照组70例、LA组131例患者进行MTHFR的2个基因C667T及A1298CPCR扩增和基因多态性分析。结果 logistic回归分析显示,年龄(95%CI:1.877~5.134,P=0.000)、高血压(95%CI:1.223~4.631,P=0.011)、同型半胱氨酸(95%CI:1.647~6.090,P=0.001)为LA的独立危险因素。2组患者C677T不同基因分型和碱基比例比较,差异无统计学意义(P0.05)。A1298C不同基因分型和碱基比例比较,差异有统计学意义(P0.05)。结论 LA与MTHFR C667T基因多态性无相关,MTHFR A1298C基因突变可能与LA的发病相关。     

亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T和A1298C位点多态性与胃癌易感性的相关性分析

目的探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T和A1298C位点多态性与胃癌易感性的相关性。方法回顾性收集2008年1月至2014年1月期间在笔者所在医院住院的、行MTHFR基因C677T和A1298C位点检测的160例胃癌患者作为胃癌组,收集同期160名自愿接受上述基因检测的健康体检人员作为对照组,比较2组2种位点基因型的分布情况。结果胃癌组患者MTHFR基因C677T位点的基因型为:CC 72例,CT 64例,TT 24例;对照组为:CC 78例,CT 69例,TT 13例。胃癌组患者MTHFR基因A1298C位点的基因型为:AA 58例,AC 84例,CC 18例;对照组为:AA 62例,AC 77例,CC 21例。2组C677T位点及A1298C位点的基因型分布比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 MTHFR基因C677T位点和A1298C位点多态性与胃癌的易感性无明显相关性。     

额颞叶痴呆MAPT基因的研究进展

额颞叶痴呆是一种隐匿起病、进行性的神经变性性疾病,是仅次于阿尔茨海默病的第二大常见早发型痴呆类型,具有高度遗传异质性。近年来,额颞叶痴呆的基因研究正在如火如荼进行,目前已证实7种单基因突变可导致额颞叶痴呆。其中MAPT基因是最早被发现与额颞叶痴呆有关的致病基因,也是最主要最常见的一种致病基因。本文将就MAPT基因的结构、功能及其突变类型、动物模型、未来治疗方向在额颞叶痴呆中的研究现状进行综述。     

端粒、端粒酶基因及其突变在肝癌发生发展中的研究进展

<正>研究者凭借对端粒的功能和维持机制的阐述在2009年获得了诺贝医学奖[1],这些研究者发现了端粒是一段位于真核生物线性染色体末端的DNA-蛋白复合体,通过防止染色体的末端融合来维持染色体的稳定,端粒酶通过对端粒的损伤后修复来维持端粒的稳定。在这篇综述中,阐述的是这些发现在肿瘤中的应用。在人体细胞中,限制细胞生长的两个机制:衰老和生长停滞是防止癌症的有效机制,当平均端粒长度达到大约5     

耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌整合子分布与多位点序列分析

目的通过检测临床分离耐碳青霉烯类阴沟肠杆菌(Carbapenem-resistant enterobacter cloacae,CRECL)整合子,采用多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)了解其流行特点,为医院控制感染提供依据。方法收集并保存临床CRECL 15株;鉴定与药敏试验采用BD phoenix M50全自动细菌鉴定仪;整合子、可变区、MLST和碳青霉烯酶测定采用聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)和琼脂糖凝胶电泳,并对可变区阳性、七对管家基因和碳青霉烯酶的菌株DNA测序,所得数据与数据库比对分析。结果 15株CRECLⅠ类整合子阳性检出率80.0%(12/15),未检出II类及III类整合子;全部CRECL菌株均扩增出可变区,其中11株检测出耐药基因盒,分别为aacA 4-cr、blaOXA30、CatB 3、ARR-3、QacEdelta 1共5种;15株CRECL菌株检出5种序列分型(ST),其中11株为ST 93型,其余为ST 167型、ST 1108型、ST 136型、ST 4型;12株菌株检测出新德里金属-β-内酰胺酶1基因(NDM-1)。结论Ⅰ类整合子与阴沟肠杆菌耐药存在相关性,可能在耐药基因传播中起重要作用;医院CRECL整合子阳性菌株检出率较高;ST型主要为ST 93型,整合子阳性菌株及NDM-1与ST型有较好一致性。