肺泡灌洗液高通量测序检测在肺部疾病诊疗中的作用研究进展

在呼吸系统疾病中,需要临床生物标志物用于诊断和评估对治疗的反应及判断预后。BALF包含微生物的核酸、游离DNA,RNA、外泌体等,能更全面的反映肺部的整体情况。NGS可以同时测定几百万甚至上亿条DNA或者RNA序列,利用NGS检测气管肺泡灌洗液,在诊断病原微生物方面,具有快速、不用培养的优点,并在肿瘤相关DNA与RNA的检测方面也有着其他基因学手段无法比拟的优势。肺部不断暴露于来自口咽和其他来源的各种微生物群落,回顾和综合通过BALF检测在健康和不同疾病状态的肺部微生物群落的现状。利用NGS检测BALF在肺部感染特殊病原菌的诊断方面的应用也日渐成熟。BALF中的非编码RNA以及cfDNA的检测可以用来协助诊断肺部疾病及判断疾病的发生发展,并且发现使用BALF EV DNA的液体活检是具有组织特异性的并且极其敏感。应用高通量测序检测肺泡灌洗液的特殊指标,所需时间短,可反复取材,是临床用来诊断、评估、预测肺部疾病,包括各类型感染性疾病及肺部肿瘤的一种新方法。     

Survivin-shRNA对视网膜母细胞瘤HXO-RB44细胞自噬及凋亡的影响

目的:研究Survivin-shRNA对视网膜母细胞瘤HXO-RB44细胞自噬及凋亡的影响。方法:培养视网膜母细胞瘤HXO-RB44细胞，构建Survivin-shRNA载体。按照处理不同分为Survivin-shRNA组、GFP组和CON组。分别采用流式细胞术检测Survivin-shRNA对HXO-RB44细胞凋亡和细胞周期的影响，应用MTT法检测Survivin-shRNA对HXO-RB44细胞活性的影响，Western blot法检测Survivin-shRNA对HXO-RB44 细胞自噬相关蛋白LC3、p62 与mTOR 表达的影响。结果:流式细胞术结果表明，与Control组和GFP组相比，Survivin-shRNA组细胞凋亡率增加，差异有统计学意义（P＜0.05）；随着作用时间的延长，S期出现阻滞，48 h阻滞最强，显著高于对照组（P＜0.05）。MTT结果发现Survivin-shRNA可抑制HXO-RB44细胞增殖活性，与Control组和GFP组相比，差异有统计学意义（P＜0.05）；Western blot结果发现，与对照组相比，LC3表达量显著增加（P＜0.01）；而mTOR表达量降低（P＜0.01）。结论:Survivin-shRNA可促进视网膜母细胞瘤HXO-RB44细胞的凋亡和自噬水平，进而特异性杀伤肿瘤细胞。     

lncRNA-LINC00473在胃癌组织中的表达及临床意义

目的:分析LINC00473在胃癌中的表达情况、临床意义及对人胃癌细胞增殖水平的影响。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃腺癌相关数据集，分析肿瘤组织与正常组织之间LINC00473的表达差异；利用 Kaplan-Meier 曲线进行患者生存分析；MTT方法检测胃癌细胞增殖水平、流式细胞术检测凋亡率的改变。结果:与癌旁组织比较，LINC00473在胃癌组织中的表达明显增加，差异具有统计学意义（P＜0.05）；生存分析发现，LINC00473表达与胃癌患者OS和DFS时间相关，LINC00473高表达的胃癌患者，OS和DFS时间明显缩短（P＜0.05）。转染LINC00473 siRNA至胃癌细胞后，结果发现与阴性质粒转染组比较:转染siRNA-LINC00473的胃癌细胞，LINC00473 表达明显降低；LINC00473表达下调后细胞增殖水平减慢，凋亡率增加。结论:LINC00473是一个新的胃癌生物标记物，可作为潜在的治疗新靶点。     

LncRNAs在甲状腺癌中的生物学功能及其临床价值研究进展

甲状腺癌是最常见的内分泌系统恶性肿瘤之一,近几十年来发病率增加迅速。虽然大多数甲状腺癌预后良好，但有些病例仍可能会分化成更具侵袭性和致命性的甲状腺癌。虽然有越来越多的证据表明lncRNAs在人类癌症发生发展中发挥作用，但其在甲状腺癌中的具体作用和机制仍很不明确。在本综述中，我们总结了近年来与甲状腺癌相关的lncRNAs的新发现，并讨论其作为甲状腺癌诊断、预后生物标志物和治疗靶点的潜在价值。      

环状RNA与肿瘤相关性研究进展

环状RNA(circRNA)是一种新型的具有独特性质的非编码RNA，它不具有5' 端帽子和3' 端尾巴，是以共价键形成的闭合环状分子。circRNA对核酸外切酶具有抵抗性，因此具有一定的稳定性，且在哺乳动物中广泛表达，在不同的组织及发育阶段表达量具有差异性。circRNA因其特殊的性质，成为近几年来的研究热点。目前，已有大量的研究发现circRNA参与细胞衰老、增殖、凋亡、炎症等病理生理过程，在多种疾病的发生发展中发挥着重要的作用。当然，circRNA在肿瘤中的研究也在逐渐起步。众多研究证实，circRNA在肿瘤组织及癌旁正常组织中的表达量差异显著，且相关circRNA表达量与肿瘤细胞的恶性程度及侵袭性具有相关性。当下，已有多数研究证实了circRNA具有miRNA的反应元件，其可以通过碱基互补配对原则海绵样吸附相关miRNA，从而调控下游基因的表达。尤其在各种肿瘤中，circRNA的海绵样作用机制研究已日益成熟。除此之外，circRNA亦可翻译成蛋白或多肽调控基因的表达。circRNA的作用机制复杂多样，其具体的作用分子机制已成为众多科学研究者的研究方向。circRNA不仅在组织中特异表达，在血浆及外泌体中同样存在，且表达量具有差异性，这进一步证实了circRNA可作为潜在的生物标记物。本文通过查阅大量文献，简要综述了circRNA的生物特征、作用机理及其在各种肿瘤疾病中的研究进展及应用价值。      

RNA恒温扩增-金探针层析法在肺炎支原体检测中的应用

目的:比较RNA恒温扩增-金探针层析法和荧光PCR法检测肺炎支原体的结果,探讨前者在肺炎支原体检测中的临床应用价值。方法:采用整体抽样的方法收集344例临床咽拭子标本,分别用RNA恒温扩增-金探针层析法和荧光PCR法进行检测,以荧光PCR法所得结果为参比,对检测结果进行统计分析。结果:RNA恒温扩增-金探针层析法阳性检出率13. 08%,荧光PCR法阳性检出率12. 79%,差异无统计学意义(χ2=0. 012 9,P>0. 05)。RNA恒温扩增-金探针层析法与荧光PCR法相比阳性符合率为97. 73%,阴性符合率为99. 33%,总符合率为99. 13%,一致性系数(Kappa值)为0. 961 3。结论:二者总符合率高,有相同的检出能力。在此基础上,RNA恒温扩增-金探针层析法作为一种创新方法,还具有操作简单、设备要求不高、结果判读明了等优点,因此该方法在肺炎支原体检测中有很强的临床应用价值。     

组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA对食管癌细胞ncRNA/mRNA表达谱的影响

目的:分析组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA处理前后,食管癌细胞株EC109中差异表达的非编码RNA(ncRNA)和mRNA表达谱,初步预测与TSA作用相关的ncRNA和mRNA。方法:采用MTT、细胞周期等方法检测TSA的效应;运用应用芯片技术分别检测TSA处理前后EC109细胞中ncRNA和mRNA表达谱变化,并对差异ncRNA和mRNA表达谱进行整合分析。结果:TSA以剂量时间依赖方式抑制细胞增殖,细胞周期阻滞和凋亡的发生。芯片检测共发现461个ncRNA和758个mRNA显著性差异表达,生物信息学分析显示差异涉及红比霉素、阿霉素代谢过程、氧化还原、核小体的装配、染色质结构组织和端粒的结构组织等。通过数据库分析预测及整合分析,得到了361个ncRNA-mRNA靶基因对。结论:差异表达的ncRNA和mRNA对TSA的生物学效应密切关联,为进一步研究基因功能及其在肿瘤中的生物学意义奠定基础。