p16基因甲基化及其功能改变

ｐ１６基因失活存在于多种肿瘤中，ｐ１６基因的纯合性缺失和５′ＣｐＧ岛甲基化是其失活的主要机制，本文综述了近年来国外学者对ｐ１６基因５′ＣｐＧ岛甲基化的研究工作，并简述５′ＣｐＧ岛甲基化与基因表达、ｐ１６基因失活与肿瘤发生的关系     

软组织平滑肌肉瘤中p16基因的甲基化检测

目的 探讨软组织平滑肌肉瘤（ＬＭＳ）中p16基因ＩＮＫ４Ａ的甲基化状态及其与p16表达的关系。方法 应用ＭＳＰ法检测３８例软组织平滑肌肉瘤,１０例平滑肌瘤及５例正常平滑肌组织中p16基因ＩＮＫ４Ａ的甲基化状态,用免疫组织化学ＳＰ方法检测p16蛋白表达情况。结果 ３８例ＬＭＳ中９例发生异常甲基化,异常甲基化率为２３.7%（９／３８）。其中,７例p16蛋白表达阴性,２例p16蛋白弱阳性,在p16蛋白表达阴性的ＬＭＳ中,异常甲基化率为５０％（７／１４）。结论 p16基因第一外显子启动子区５‘CpG岛的异常甲基化是导致p16基因失活、蛋白缺如的重要基因外机制,并可能参与肿瘤的发生。     

Rett综合征MECP2基因突变分析

目的 分析我国典型的Rett综合征患儿甲基化CpG结合蛋白－2基因（methyl-CpG-binding protein 2,MECP2）突变。方法 使用PCR扩增、单链构象多态性分析、PCR产物克隆和DNA测序的方法。检测分析了26例Rett综合征患儿、其父母和其中2例患儿的妹妹MECP2基因3个外显子的基因突变。结果 26例Rett综合征患儿中发现14例有9种类型MECP2基因的杂合性突变，突变均位于第3外显子。其中7例有3种错义突变：C473T（T158M)4例,C674G(P225R)1例，C916T（R306C）2例；4例有3种无义突变：C502T（R168X）2例，C763T（R255X）1例，C880T（R294X）1例；2种由于缺失导致的突变：1例为1152del 44bp和1例1158－1167／1171－1186del 26bp；1鲍由于碱基插入导致的移码突变：874insA。1158－1167／1171－1186del 26bp和874insA突变为首次报千，突变均为新生突变。此外，新发现了一种源于你亲的错义变异1141G（P381A）。结论 我国Rett综合征患儿存在MECP2基因突变，典型的Rett综合征MECP2基因突变率大于50％。     

5-氮杂-2'-脱氧胞苷对HepG2细胞RUNX3基因表达及细胞增殖的影响

目的探讨人肝癌细胞系HepG2经5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-Aza-2-’deoxycytid ine,5-Aza-CdR)处理后诱导高甲基化失活的RUNX3基因重新表达的可能性及对细胞生长的影响,寻找抗癌治疗的新靶点。方法RT-PCR检测抑癌基因RUNX3 mRNA的表达;MTT、集落形成实验观察细胞的生长活性;流式细胞术和透射电镜分析细胞周期及细胞凋亡的变化。结果肝癌细胞经不同浓度之5-Aza-CdR处理后,原无RUNX3 mRNA表达的细胞均检出基因重新表达,细胞生长速度出现不同程度减慢及细胞克隆形成率显著降低(P<0.01)。用药后肝癌细胞发生明显的S期阻滞,电镜显示肝癌细胞形态学改变。结论去甲基化制剂5-Aza-CdR能有效地激活肝癌细胞系HepG2因高甲基化所致RUNX3基因沉默的再转录,诱导该基因的表达,从而抑制肿瘤细胞生长。     

HIV-1感染引起组蛋白乙酰化和增加p21WAF1表达

目的：DNA甲基化和组蛋白乙酰化是基因表达调控的主要形式。人类免疫缺陷病毒（HIV-1）可引起T淋巴细胞DNA甲基化酶上调。本文旨在明确HIV-1对细胞周期依赖刺激酶抑制剂p21^WAF1表达的影响。方法：建立HIV-1感染的Hut78细胞系；以RT-PCR和Westem blotting 分析p21^WAF1表达情况；以亚硫酸氢钠修饰DNA和基因测序，研究p21^WAF1基因启动子甲基化，以Western blot-ting 和染色体免疫测定探究总组蛋白和与p21^WAF1基因启动子相关的组蛋白乙酰化水平。并以GST pull-down和免疫沉淀分析HIV-1导致乙酰化及乙酰化引起p21^WAF1过表达的可能机理。结果：HIV-1感染后，其反式激活蛋白Tat与辅助转录因子P/CAF、hGCN5结合，共同刺激组蛋白H3乙酰化。尽管p21^WAF1启动子部分区域有甲基化发生，但p21^WAF1表达仍上调。这可能与E2A对p21^WAF1的作用有关。结论：HIV-1感染可引起T淋巴细胞p21^WAF1基因的甲基化和乙酰化紊乱，导致p21^WAF1表达增强。     

脂肪酸合成酶表观遗传学调控的研究进展

脂肪酸合成酶(fatty acid synthase, FASN)在肿瘤和能量代谢性相关疾病中表达异常上升,且与多种表观遗传学调控机制相关。研究FASN的表观遗传学调控可以深入阐明FASN在疾病发生发展中的作用,为纠正异常表达的FASN提供新思路。本文综述了Fasn基因DNA甲基化、FASN mRNA甲基化和甲基化读码器蛋白、微小RNA与长链非编码RNA、组蛋白H3与H4磷酸化与乙酰化修饰以及FASN蛋白的翻译后修饰等FASN表观遗传学的调控机制,为通过表观遗传学靶点发挥对FASN的抑制作用提供新证据。     

血清叶酸与RAR - β、MGMT甲基化在宫颈上皮内瘤变中的交互效应

目的 探讨血清叶酸与RAR - β、MGMT 启动子区CpG岛甲基化在宫颈上皮内瘤变（CIN）中的交互效应。方法 基于课题组建立于山西省（介休市和阳曲县）的已婚妇女人群队列,选取2014年6月 - 9月病理学确诊的CIN患者（CINⅠ147例、CINⅡ/Ⅲ 134例）及正常宫颈妇女（156例）为研究对象。收集全部对象人口学特征及相关因素,采集空腹静脉非抗凝血与宫颈脱落细胞。采用化学发光免疫法检测血清叶酸浓度,甲基化特异性PCR法检测基因CpG岛甲基化状态,导流杂交法判定HPV感染状况。采用Kruskal - Wallis H检验、χ2检验、趋势χ2检验进行资料分析,非条件logistic回归模型和交互作用指标评价交互效应。结果 血清叶酸在NC、CINⅠ和CINⅡ/Ⅲ组总体分布差异有统计学意义（P＜0.001）。低血清叶酸（≤23.13 nmol/L）可增加CINⅠ和CINⅡ/Ⅲ的发生风险（OR = 6.78,95%CI:3.75～12.26;OR = 64.13,95%CI:18.34～224.20）,且随病变进展,血清叶酸逐渐降低（χ2趋势 = 92.69,P＜0.001）。CIN组RAR - β、MGMT CpG岛甲基化率均高于NC组,且甲基化率随病变进展逐渐上升（χ2趋势 = 20.19,P＜0.001;χ2趋势 = 15.35,P＜0.001）。在各组中低血清叶酸与RAR - β、 MGMT CpG岛高甲基化均呈正相加交互作用（CINⅠ:S = 2.23,95%CI:1.63～8.08,S = 1.21,95%CI:1.01～10.01;CINⅡ/Ⅲ:S = 2.43,95%CI:1.72～6.80,S = 2.83,95%CI:1.55～8.10）,但未显示相乘交互作用（P＞0.05）。结论 低血清叶酸和RAR - β、 MGMT CpG岛高甲基化均可增加CIN的风险,且可能存在相加交互作用。     

血管性认知障碍肾阳虚证的调查研究及DNA甲基化本质

目的：在病证结合背景模式下,调查血管性认知障碍肾阳虚证的分布情况并从DNA甲基化角度探讨血管性认知障碍肾阳虚证的生物学内涵,为未来中医药治疗该病证提供表观遗传学层面的靶点。方法：2020年9月至2022年11月,通过量表对北京社区居民进行认知障碍筛查,对血管性认知障碍（VCI）患者进行证候分析;后纳入VCI肾阳虚证患者与健康对照者,采集外周血,采用Illumina Human Methylation 850K BeadChip对受试者的外周静脉血进行全基因组DNA甲基化检测,筛选差异甲基化基因并对其进行生信分析。结果：研究共调查1 902人,患有VCI的人数为201例,占总调查人数的10.57%,其中肾阳虚证者占72.14%;甲基化结果显示,与正常组比较,VCI组有386个差异甲基化位点,可注释到136个基因。京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析显示,两组间差异基因主要涉及哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR）信号通路、雌激素（Estrogen）信号通路、环磷酸腺苷（cAMP）信号通路等通路。蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析显示,表皮生长因子受体（EGFR）、EGF...     

FAM19A4基因启动子甲基化检测在宫颈癌及其癌前病变筛查的研究

宫颈癌是最常见的妇科恶性肿瘤之一。目前人乳头瘤病毒(HPV)检测及细胞学检查是宫颈癌及其癌前病变(CCPL)的主要筛查手段。由于上述传统筛查方法,仍然存在对CCPL漏诊的风险,因此寻找有效识别CCPL的特异性分子标志物,具有重要临床意义。对具有序列相似性家族19成员A4(FAM19A4)基因启动子甲基化定量检测,可有效检出CCPL组织,较传统筛查方法有较高特异度,有望成为CCPL筛查的特异性分子标志物。笔者拟就FAM19A4基因启动子甲基化定量检测,在CCPL筛查中应用的最新研究现状进行阐述,旨在为进一步推进CCPL筛查方法的开发,提供思路。     

癌组织中p16基因甲基化分析

目的探讨抑癌基因p16在胃癌组织中是否存在甲基化异常及其与胃癌发生发展的关系.方法对20例胃癌组织及相应正常胃粘膜组织应用甲基敏感酶(HpaII)和甲基非敏感酶(MspI)酶切,结合PCR扩增技术,对p16基因外显子1、外显子2的二核苷酸胞嘧啶特定序列5'-CCGG-3'位点甲基化进行检测.结果20例胃癌组织中,p16基因外显子1、2异常甲基化分别为5例(25%)和9例(45%),正常组织未发现甲基化异常;14例高甲基化标本中,中分化胃癌4例,低分化7例,高分化1例;有2例存在外显子1、2同时甲基化异常,二者均为低分化胃癌,进展期胃癌(Ⅲa、Ⅳ期各1例)中1例呈现泳动易位;外显子2甲基化异常多发生于晚期肿瘤患者(P<0.05).结论p16基因甲基化异常可能会造成基因功能丧失,从而失去对细胞增殖的负性调控作用,导致胃癌发生与进展;外显子2高甲基化与临床进展有关,可能为晚期事件.