微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究

目的：应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法：按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总ＤＮＡ并纯化ｍＲＮＡ;将４０９６种人类基因ＰＣＲ产物用ＣａｒｔｅｓｉａｎＰｉｘｓｙｓ７５００点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片;将等量的对照组织和喉鳞癌组织ｍＲＮＡ分别逆转录合成荧光分子掺入的ｃＮＤＡ－链做探针,混合后杂交上述基因芯片,经严格洗片后用ＳｃａｎＡｒｒａｙ３０００扫描仪扫描芯片     

基因表达谱芯片在胰腺癌相关基因筛选中的应用研究

目的：探讨基因表达谱芯片技术在高通量筛查肿瘤相关基因群及研究胰腺癌分子病理变化中的应用价值。方法：应用含有４０９６条人类全长基因的ｃＮＤＡ表达谱芯片,对３例临床切除的胰腺癌及正常胰腺标本的基因表达谱进行分析。结果：在３例胰腺癌和正常胰腺组织中均有差异表达的基因３９８条,其中新基因２８９条,老基因１０９条。从老基因中筛选出有显著表达差异基因３７条,其中在胰腺癌组织中上调基因２０条,下调基因１７条。结     

基因芯片对PMA激活的血管内皮细胞早期反应基因的研究

目的 :用基因芯片研究 PMA激活的血管内皮细胞的早期反应基因 (imm ediate early response gene,ERG)。方法 :以包含 40 96条人类基因的 DNA芯片检测血管内皮细胞受代谢增强剂 PMA(phorbol myristate acetate)激活后早期的基因表达谱 ,并从中筛查出 ERG。结果 :血管内皮细胞受 PMA作用 6 h后 ,17条基因上调 ,11条下调。数据处理聚类分析表明 17条上调基因中多数 (13/ 17)属蛋白质磷酸酶和转录调控因子基因 ,而下调基因中多数 (9/ 11)为细胞分裂相关基因。结论 :证明PMA激活的人血管内皮细胞早期反应基因主要是转录调控因子和蛋白质磷酸酶基因。     

Molecular cytogenetic characterization of 16p11.2 microdeletions with diverse prenatal phenotypes: Four cases report and literature review

ObjectiveChromosome 16p11.2 deletions have been recognized as a genetic disorder with well-described postnatal phenotypes. However, the prenatal manifestations are atypical for lacking of enough evidence.Case reportFour pregnant women underwent amniocentesis for cytogenetic analysis and chromosomal microarray analysis (CMA) because of various indications for prenatal diagnosis: prenatal ultrasound abnormalities (cases 1, 2 and 4) and the childbearing history of cerebral palsy child (case 3). No overlapping phenotypes were observed in cases 1, 2 and 4, which might indicate phenotypic diversities in prenatal phenotypes for 16p11.2 microdeletion. All four fetuses showed normal karyotypic results while CMA identified 0.303–0.916 Mb microdeletions of 16p11.2, encompassing BP2–BP3 and BP4–BP5 regions separately. According to the parental CMA verification, case 1 carried a maternal inherited duplication in the region of Xp22.33 and a de novo deletion in the region of Xp21.1. All parents opted for the termination of pregnancies based upon genetic counselling.ConclusionOur findings enriched the intrauterine phenotypic features of 16p11.2 microdeletions, which would be beneficial for genetic counselling in clinic. In addition, preimplantation genetic testing was recognized as a first-tier approach for such carriers if they intended to conceive again.     

肺癌中p53和p63 蛋白表达的高通量组织微阵研究

目的探讨p53和p63蛋白在肺癌中的表达及意义,并比较两者之间的表达关系.方法组织微阵(tissue microarray,TMA)技术和免疫组化S-P方法(immunohistochemistry,IHC).结果p53蛋白IHC染色中,TMA有价值的肿瘤标本为234(72.9%),总的表达率(+、++、+++)率为48.3%(113/234).随着肺鳞状细胞癌(squamous cell carcinoma,SCC)和腺癌(adenocarcinoma,Ad)分级升高,p53蛋白表达增强,与肺SCC及Ad病理分级有明显相关性(P＜0.05).p53蛋白表达与生存期呈明显负相关性(P＜0.05).p53蛋白表达与病理分型和临床分期等无明显相关性(P＞0.05).p53蛋白表达在肺癌原发肿瘤和转移淋巴结之间无明显差异(P＞0.05).p63蛋白IHC染色中,TMA有价值的肿瘤标本为264(82.2%),总的表达率(+、++、+++)为67.8%(179/264).p63蛋白在小细胞肺癌(small cell lung carcinoma,SCLC)表达最低16.0%(4/25),非小细胞肺癌(non-small cell lung carcinoma,NSCLC)与SCLC之间表达存在明显差异(P＜0.05).p63蛋白表达与病理组织分级、临床分期、生存期等无明显相关性(P＞0.05).p63蛋白表达在肺癌原发肿瘤和转移淋巴结之间无明显差异(P＞0.05).结论1.p53是肺癌的独立预后指标;2.p63蛋白在肺癌的不同病理类型的不同表达,说明肺癌的不同病理类型分子机理有所不同;3.p53蛋白和p63蛋白表达之间无明显相关性;4.TMA可以有效分析比较组织中肿瘤标记物的表达情况.     

清胰消积中药对实验性胰腺癌基因表达的影响

目的:研究中药清胰消积方对裸鼠体内人胰腺癌SW1990细胞移植瘤的抑瘤作用,并利用基因表达谱芯片探索其作用机理。方法:荷瘤裸小鼠随机分为对照组、5-FU组、中药不同剂量组,治疗后计算抑瘤率。提取对照组及中药中剂量组肿瘤组织mRNA,制备cDNA探针并分别用Cy3和Cy5两种荧光染料标记,与基因表达谱芯片进行杂交,经扫描、分析,得出药物作用后表达有差异的基因。结果:中药18g/kg、36g/kg、72g/kg剂量组抑瘤率分别为21.31%、38.16%及29.09%。筛选出癌基因、蛋白翻译合成、DNA合成和修复、细胞信号传导蛋白等表达下调的基因共7条。结论:清胰消积中药对人胰腺癌体内生长有抑制作用,调节癌基因及其相关的信号传导、改变肿瘤细胞蛋白合成等可能是其作用机制。     

KAI1在肺癌组织芯片中的表达及其生物学意义

背景与目的　KAI1基因是新发现的转移抑制基因,它在多种肿瘤中有表达。该研究通过分析KAI1蛋白在肺良性病变组织、癌前组织、原发癌组织及局部淋巴结肺转移癌组织中的表达及其与临床病理生理特征之间的关系,探讨其在肺癌发生、发展、浸润、转移中的作用。方法　应用组织芯片技术和免疫组化S P方法检测肺癌组织中KAI1蛋白的表达。统计学方法采用χ2 检验、Fisher确切概率。结果　KAI1 蛋白在10例肺良性病变组织中阳性表达率为100.0%,在12例癌前病变组织中为66.7%,而在89例肺原发癌组织中表达仅为24.7%,在淋巴结转移肺癌病灶中更是显著下调(0)(P<0.05);原发癌组织中KAI1 蛋白的表达与患者年龄、性别、大体病理类型均无明显关系(P>0.05),而与肿瘤的组织学类型、分化程度、病理分期以及是否伴有淋巴结转移密切相关(P<0.05)。结论　KAI1 蛋白的异常表达可能参与了肺癌的恶性进展,它的表达降低促进了肿瘤的浸润转移,检测肺癌组织中KAI1 表达对肺癌的诊断及预后判断有一定的参考价值。     

毒物基因组学展望

本文介绍了毒物基因组学定义，并阐述了毒物基因组学对特异毒性、实验病理、混合物危险性评价、免疫毒理、神经毒理、生态毒理、预测毒理学等研究的突破性作用，是毒理学一次革命.     

恙螨体内汉坦病毒核酸的基因芯片检测

目的 建立快速、灵敏、特异的汉坦病毒基因芯片诊断方法。方法 根据发表的汉坦病毒属(HV)76-118株和R22株S基因核苷酸序列，设计引物和探针，制备寡核苷酸芯片。用CV3标记核苷和引物，运用不对称PCR技术制备单链荧光标记核苷酸片段，并与芯片上的寡核苷酸探针杂交，荧光扫描仪检测并分析信号。结果 研究制备的基因芯片能够检测汉坦病毒HTN型和SEO型病毒核酸的特异性荧光信号。结论 HV的基因芯片检测具有特异、灵敏、快速的优点。基因芯片的制备和检测技术的建立，可为肾综合征出血热等传染病的诊断和预防提供理想的方法。