类风湿关节炎患者外周血单个核细胞组蛋白H3赖氨酸4三甲基化水平的研究

目的 研究类风湿关节炎(RA)患者外周血单个核细胞（PBMCs）组蛋白H3赖氨酸4（H3K4）三甲基化(Me3)水平。方法 梯度密度离心法分离8例RA患者和8例健康者的PBMCs,采用染色质免疫共沉淀联合芯片技术（ChIP-chip）在全基因组范围内对RA患者及健康者的PBMCs组蛋白H3K4me3进行高通量的筛选。染色质免疫共沉淀-实时定量聚合酶联反应（ChIP-qPCR）验证芯片结果。定量反转录聚合酶联反应（qRT-PCR）检测H3K4me3显著差异基因的mRNA表达水平。结果 RA患者与健康对照相比较,鉴定出364个基因存在H3K4me3显著差异,其中有66个基因显示有H3K4me3 程度增高, 298个基因有H3K4me3 程度降低;ChIP-qPCR验证结果与CpG岛芯片结果一致。结论 RA患者与健康者之间的PBMCs存在组蛋白H3K4me3显著改变。ChIP-chip技术有利于进一步揭示RA分子机制,发现新的治疗靶点。     

膀胱罕见混合癌1例

患者男67岁,2007年10月因血尿、尿频、尿急一个月就诊,膀胱镜见“膀胱前壁新生物”,活检提示“膀胱腺癌”,10月7日行“膀胱部分切除术”,术中见“膀胱前壁新生物,约3cm×3cm×2cm”。病理：膀胱腺癌,部分神经内分泌癌。镜检：肿瘤细胞大部分呈肠型腺样排列,中等分化,小灶细胞较小,核染色1条,弥漫排列,部分区域细胞中等大小,圆形,成短梭形,粒大,染色质粗,胞浆丰富,     

RA诱导SH—SY5Y细胞分化中NEF3基因表达的调控

目的 研究全反式维甲酸(RA)诱导神经母细胞瘤分化过程中NEF3表达的调控.方法 用RA诱导神经母细胞SH-SY5Y,用实时RT-PCR分析NEF3和BrgI的mRNA表达;并同时测定RGI蛋白的表达.共转染含有2.8kb NEF3上游序列的报告基因质粒、Brg1的表达质粒或者其负显性突变质粒,检测后两者对NEF3-CAT启动子活性的调控.结果 RA诱导12～24h,SH-SY5Y细胞中NEF3与Brg1几乎同时表达出现第1个高峰,之后表达量下降.共转染结果 显示Brgl可促进NEF3-CAT表达增加,而其突变型没有作用.结论 RA诱导初期,染色质重塑复合物ATP酶亚基Brg1可能导致NEF3上游调控序列所处的染色质结构发生改变,从而有利于NEF3基因的表达.     

染色体异染色质区增加及其细胞遗传学分析

目的分析染色体异染色质区增加与生殖相关的临床效应。方法对6958例生殖异常患者通过取外周血淋巴细胞培养,显带进行染色体核型分析。结果检出染色体异染色质区增加196例,占被检患者的2.82%。结论染色体异染色质区增加导致自然流产、不孕不育、死胎、闭经、生殖器发育异常、少弱及无精子症等遗传效应,在遗传咨询中应引起足够的重视,对临床诊治工作有重要意义。     

染色质与真核基因调控

概括地介绍了染色质在真核基因调控中的关键作用,讨论了从核小体核心组蛋白的修饰、染色质重塑、DNA甲基化和siRNA等方面对染色质高级结构的阻遏或活化状态的调控及其机制。相关内容可为阐明多种生理过程和疾病发生的机理提供新思路,并为疾病的防治提供新靶点。     

精子DNA完整性与不明原因复发性流产的相关性

目的探讨精子DNA完整性与不明原因复发性流产的相关性。方法选取2019年8月至2020年12月在郴州市第一人民医院因不明原因复发性流产就诊的患者,其丈夫作为实验组(n=59),同时选取有正常生育能力男性作为对照组(n=53)。男女双方年龄均≤35岁的研究对象中,实验组12例,对照组18例。常规分析精液并用精子染色质扩散法(SCD)检测精子DNA碎片指数(DFI)。结果对照组与实验组精液量、精子浓度、前向运动精子百分率以及正常形态精子百分率比较差异均无统计学意义(P均0.05)。实验组精子DFI为17.00%(13.00%,28.00%),高于对照组12.00%(9.50%,18.00%),P0.01。男女双方年龄均≤35岁的研究对象中,实验组精子DFI为(16.22±8.68)%,高于对照组(10.75±4.60)%,P0.05,而精液量、精子浓度、前向运动精子百分率及正常形态精子百分率在实验组和对照组差异均无统计学意义(P均0.05)。结论精子DNA完整性受损伤可能是不明原因复发性流产的相关因素,对评估生育力具有临床意义。     

基于TCGA构建染色质调节因子相关LncRNA的胃癌预后模型

目的 通过TCGA数据库构建胃癌染色质调节因子相关LncRNA的预后模型,协助评估胃癌患者的预后。方法 从TCGA数据库下载胃癌的转录组数据及临床数据,通过差异分析获得在胃癌中差异表达染色质调节因子后共表达筛选出染色质调节因子相关LncRNA,采用COX分析构建胃癌预后模型,并对其预测能力进行风险曲线分析、单因素和多因素独立预后分析、多指标采用受试者工作特征(ROC)曲线验证。结果 通过差异分析得出148个在胃癌中差异表达的染色质调节因子,共表达分析及COX分析发现,12个染色质调节因子相关LncRNA具有预后作用并纳入构建预后模型。生存分析、风险曲线分析、单因素和多因素独立预后分析、多指标ROC曲线分析结果均显示该预后模型具有较好的预后预测效果。结论 成功构建胃癌染色质调节因子相关LncRNA预后预测模型,能较好地预测患者预后,为胃癌治疗提供参考。     

SWI/SNF复合体在胃癌发生和免疫治疗中的研究进展

SWI/SNF复合体为具有调控转录活性的染色质重塑家族之一,在调控机体生理功能稳态发挥重要作用。近年来多项研究表明,SWI/SNF复合体相关基因失调在肿瘤发生发展扮演重要角色,且具有作为肿瘤免疫检查点疗效生物标志物的潜能。因此,文章就近年来SWI/SNF成员与胃癌临床特征、分子机制和免疫治疗等相关研究展开综述,为胃癌诊疗提供新见解。     

表观遗传在乳腺癌发生发展中的研究进展

乳腺癌是全球女性最常见的癌症,其发病机制主要包括遗传、环境影响及生活方式因素等。与乳腺癌致病因素中单向基因改变相比,可逆的异常表观遗传修饰更加常见。导致乳腺癌发生发展的表观遗传修饰主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑及非编码RNA改变,深入了解其调控机制有助于对乳腺癌的预防及治疗。     

CHD4基因表达对急性T淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定

目的：探讨人染色质解旋酶DNA结合蛋白4（recombinant chromodomain helicase DNA binding protein 4,CHD4）基因表达对急性T细胞淋巴细胞白血病细胞增殖和凋亡的影响及其启动子鉴定。方法：使用siRNA?CHD4瞬时转染T淋巴细胞白血病细胞（Jurkat）敲低CHD4基因表达,实时荧光定量qRT?PCR和Western blot检测细胞转染后CHD4表达量,流式细胞术测定细胞凋亡率及细胞周期变化;CCK?8分析测定CHD4基因对Jurkat细胞增殖的影响。根据生物信息学分析,以Jurkat细胞提取的全基因组DNA为模板,PCR扩增CHD4基因候选启动子区2 091 bp片段,以pGL3?Basic为载体,克隆含有CHD4基因候选启动子区的序列,制备重组质粒,并且构建一系列含CHD4基因候选启动子5′侧翼区截短序列质粒。将含CHD4启动子序列的质粒及截短序列质粒转染至Jurkat细胞和人胚胎肾T细胞（HEK293T）,双荧光素酶报告基因检测各片段的启动子活性,确定CHD4基因启动子最小活性区域,并通过生物信息学方法分析该区域转录因子结合位点,构建结合位点突变的质粒,通过双荧光素酶报告基因检测,分析结合位点对CHD4 转录的影响。结果：流式细胞检测结果发现,与对照组比较,CHD4抑制Jurkat细胞凋亡,转染siRNA?CHD4的Jurkat细胞G0/G1期比例显著升高,而S期比例下降（P＜0.01）;CCK?8检测CHD4基因对Jurkat细胞的增殖有促进作用（P＜0.05）;成功构建含有CHD4基因候选启动子序列的质粒及其截短序列质粒,与pGL3?Basic空载体相比,含有CHD4基因候选启动子序列的质粒活性明显增加（P＜0.05）。CHD4基因最小活性区域位于转录起始位点-233~-13 bp,其中包含NF?κB、MZF1等转录因子结合位点;NF?κB 对CHD4启动子活性具有正向调控作用。结论：CHD4基因对Jurkat细胞凋亡有抑制作用,并且促进其增殖。CHD4最小活性区域位于转录起始位点-233~-13 bp,转录因子NF?κB 对CHD4基因启动子活性具有正向调控作用。