细胞色素P450 2C19基因多态性与原发性肝细胞癌的相关性研究

细胞色素P450（CYP）2C19代谢美芬妥英的酶活性在人群中呈快代谢型和慢代谢型二态分布。突变型等位基因是CYP2C19基因多态性的分子生物学基础。目的：对原发性肝细胞癌（HCC）患者的CYP2C19等位基因进行基因分型．探讨CYP2C19基因多态性与原发性HCC的关系。方法：纳入48例原发性HCC患者和88名健康对照者。设计相应引物，以聚合酶链反应．限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测CYP2C19ml和CYP2C19m2突变型等位基因．对两组基因多态性进行分析比较。结果：HCC组CYP2C19慢代谢型（ml／m1和ml／m2）发生率为25．0％（12例）．与健康对照组的11．4％（10例）相比差异有统计学意义（P〈0．05，OR=3116，95％CI：1140—7113）。结论：CYP2C19慢代谢型与原发性HCC之间存在相关性，可能增加人群对HCC的易感性。     

人MxA基因启动子-88/-123位多态性荧光PCR检测方法的建立及临床应用

目的 建立一套快速、灵敏和特异的人抗黏液蛋白A(MxA)基因启动子中干扰素刺激应答元件-88/-123位多态性检测体系,为合理应用IFN-α治疗慢性乙型肝炎提供分子生物学检测手段.方法 对经IFN-α治疗的患者进行HBV DNA、HBV基因分型及MxA基因启动子中干扰素刺激应答元件-88/-123位多态性位点检测,确定基因多态性与IFN-α治疗效果之间的关系.通过各种条件优化实验,建立MxA基因启动子中干扰素刺激应答元件-88/-123位多态性荧光PCR检测体系,并通过与DNA序列分析法检测结果的对比,验证荧光PCR检测体系的灵敏性及特异性,从而对该体系的临床适用性进行初步评估.采用卡方检验计算P值、回归分析法计算对比率和95%可信区间.结果 MxA基因启动子干扰素刺激应答元件中-88位为G/T杂合型和-123位为C/A杂合型者皆为IFN-α敏感型,-88位为G/G纯合型和-123位为C/C纯合型者为IFN-α不敏感型.与DNA序列分析的金标准相比,荧光PCR检测的符合率为99.65%.结论 荧光PCR检测体系,可灵敏、快捷地检测患者MxA基因多态性位点.     

聚合酶链反应－单链构象多态性用于耐利福平结核分支杆菌rpoB基因突变的研究

目的研究结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变及其与利福平（ＲＦＰ）耐药性的关系。方法以参考菌株结核分支杆菌Ｈ３７Ｒｖ为对照，用聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）方法分析了４０株结核分支杆菌临床分离株。ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法由ＰＣＲ扩增和扩增产物ＤＮＡ单链多态性分析组成。结果两对引物ＰＣＲ扩增产物分别为４１１和２５８ｂｐ，其敏感性分别为５ｐｇ／μｌ、５００个菌／ｍｌ和１ｐｇ／μｌ、５００个菌／ｍｌ；均为属特异性。４０株结核分支杆菌临床分离株２５８ｂｐ扩增片段ＳＳＣＰ图谱的特点：以参考菌株结核分支杆菌Ｈ３７Ｒｖ为对照，１０株敏感株均无区别；单耐ＲＦＰ或包括ＲＦＰ多种抗结核药３０株，除３株外，其余２７株ＳＳＣＰ图谱有明显的区别；检测阳性率为９０％，特异性为１００％。结论ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法可检测出耐ＲＦＰ结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变；该基因是ＲＦＰ的药物靶编码基因，它的突变与ＲＦＰ耐药性有密切关系，这有助于结核分支杆菌耐药性的快速检测和研究     

611例汉族人维生素D受体基因多态性与骨密度关系研究

采用PCR-RFLP分析了611名上海地区汉族人的维生素D受体(VDR)基因型,并测量其骨密度(BMD),统计分析发现男女性VDR基因分布差异存在统计学意义,Bb基因型在男性中的分布频率(26.9%)高于女性(12.7%,P<0.01)。不同基因型的人群BMD差异无统计学意义。     

基质金属蛋白酶1和3多态性与类风湿性关节炎易感性的Meta分析

目的探讨基质金属蛋白酶1(MMP-1)(-1607 1G/2G)和基质金属蛋白酶3(MMP-3)(-1171 5 A/6A)多态性与风湿性关节炎发病风险的关系。方法本组搜索Pub Med、Medline、Embase、谷歌学术搜索、中国生物医学文献数据库和万方知识服务平台,所有发表的病例对照研究MMP-1(-1607 1 G/2G),MMP-3(-1171 5 A/6A)多态性和风湿性关节炎风险的Meta分析。采用固定或随机效应模型计算优势比(OR)和95%置信区间(CI)对MMP-1(-1607 1G/2G)多态和MMP-3-1171(5 A/6A)多态与RA易感性的关系进行总体评估。所有分析均使用STATA 12.0统计学软件进行处理。结果共有5项独立的研究被纳入当前的Meta分析。在所有五个模型没有发现MMP-1(-1607 1 G/2G)和MMP-3(-1171 5A/6A)多态性与类风湿性关节炎(RA)易感性的明显关联,在白种人和亚洲人的亚组分析中也发现了相同的结论。结论该Meta分析表明,MMP-1和MMP-3多态性与类风湿性关节炎发病无显著相关性。     

环氧合酶-2-1195G/A和锰超氧化物歧化酶9Ala/Val基因多态性与高脂饮食的交互作用及其与溃疡性结肠炎的关系

目的 探讨环氧合酶-2-1195G/A(COX-2-1195G/A)和锰超氧化物歧化酶9Ala/Val(MnSOD9Ala/Val)基因多态性与高脂饮食的交互作用及其与溃疡性结肠炎(UC)的关系。方法 采用病例-对照研究的方法,以750例UC患者及750例健康对照者的外周血白细胞为样本,采用聚合酶链反应(PCR)技术分析COX-2-1195G/A和MnSOD9Ala/Val基因多态性。结果 UC组和对照组COX-2-1195G/A(A/A)基因型的分布频率分别为49.07%和21.20%,MnSOD9Ala/Val(V/V)基因型的分布频率分别为50.13%和22.40%,差异均有统计学意义(P均＜0.01)。COX-2-1195G/A(A/A)基因型(OR=3.5808,95%CI=1.8062～5.3478)和MnSOD9Ala/Val(V/V)基因型(OR=3.4828,95%CI=1.9137～5.5496)者患UC的风险均显著增加。基因突变的协同分析结果显示,COX-2-1195G/A(A/A)/MnSOD9Ala/Val(V/V)基因型者在UC组和对照组中的分布频率分别为40.67%和8.40%,差异有统计学意义(P＜0.01),COX-2-1195G/A(A/A)/MnSOD9Ala/Val(V/V)基因型者患UC的风险显著增加(OR=7.5655,95%CI=4.1849～11.2037)。UC组高脂饮食率显著高于对照组(49.73%比20.13%,P＜0.01),高脂饮食与COX-2-1195G/A(A/A)(γ=11.81821)和 MnSOD9Ala/Val(V/V)(γ=9.0107)基因型均有交互作用。结论 COX-2-1195G/A(A/A)和MnSOD9Ala/Val(V/V)基因型及高脂饮食是UC的易患因素,基因多态性与高脂饮食的交互作用增加了UC的发病风险。     

湖北省汉族人类免疫缺陷病毒感染人群白细胞介素28B的基因多态性

目的 了解湖北省汉族HIV、HCV合并感染人群IL28B基因型的分布.方法 纳入100例抗HIV、抗-HCV均阳性的汉族人群,荧光定量PCR检测HCV RNA,基因测序法对IL28B进行基因分型.数据行x2检验.结果 目标人群IL-28B基因型中,95例为C/C基因型,C/C基因型频率为96.0％,其中,HCV RNA阴性20例,占21.1％;5例C/T和T/T基因型患者中,无HCV RNA阴性病例(x2=1.043,P-0.588).结论 湖北省汉族HIV、HCV合并感染人群IL-28B 基因型中C/C基因型所占比例较高.     

肾素-血管紧张素-醛固酮系统基因多态性与大动脉粥样硬化性卒中的相关性:中国南方汉族人群研究

目的 研究肾素-血管紧张素-醛固酮系统血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)基因M235T、血管紧张素Ⅱ1型受体(angiot ensinⅡtype 1 receptor,AGTR1)基因A1166C、醛固酮合酶( aldosterone synthase,CYP11B2)基因- 344C/T多态性与中国南方汉族人群大动脉粥样硬化性卒中(large-artery atherosclerosis,LAA)的相关性.方法 采用聚合酶链反应和基因测序技术对中国南方汉族LAA患者和正常对照者AGT基因M235T、ATGR1基因A1166C和CYP11B2基因- 344C/T多态性进行基因分型,并通过二分类logistic回归分析确定这3种基因多态性与LAA的相关性.结果 共纳入LAA患者107例和142名健康对照者.LAA组AGT基因235TT基因型(66.36％对50.70％,x2=6.122,P=0.047)和T等位基因(79.44％对70.07％,x2=5.581,P=0.018)频率显著高于对照组,AGTR1基因1166CC基因型(0％对0％,x2=1.494,P=0.222)和C等位基因(7.48％对4.93％,x2=1.399,P=0.237)频率与对照组无显著性差异,CYP11B2基因- 344CC基因型(9.35％对4.23％,x2=3.603,P=0.165)和C等位基因(27.10％对26.06％,x2=0.069,P=0.793)频率与对照组亦无显著性差异.二分类logistic回归分析显示,这3种基因多态性与单纯性LAA患病均无显著相关性.合并高血压的LAA患者AGT基因235TT基因型(68.00％对41.90％,x2=12.446,P=0.002)和T等位基因(79.33％对64.76％,x2=8.993,P=0.003)频率均显著高于血压正常对照组,logistic回归分析显示,暴露于TT基因型的优势比(odds ratio,OR)为2.153[ 95％可信区间(confidence interval,CI)0.789 ～5.872],T等位基因的OR值为2.089(95％ CI1.285 ～3.396).结论 AGT基因M235T多态性与南方汉族人群单纯性LAA无关,但可能与合并高血压的LAA患病风险相关;CYP11B2基因- 344C/T多态性和AGTR1基因A1166C多态性与南方汉族人群LAA发病无关.     

烟雾病的遗传学研究进展

烟雾病(moy amoya disease,MMD)是一种少见的脑血管病,在东亚地区的发病率较高.MMD的发病机制目前仍不明确,但流行病学研究提示遗传因素在MMD发病中具有重要作用.文章就MMD相关基因的研究进展进行了简要综述.     

白介素-1β基因多态性与晚期膝骨关节炎易感性的关联性研究

目的探讨IL-1β基因的单核苷酸多态性和单体型与中国汉族人晚期膝骨关节炎（KOA）的易感性相关。方法采用病例对照研究,纳入120例中国汉族膝OA患者和130例年龄、性别匹配的健康对照者,用酶联免疫吸附测定法（ELISA）测定血清中IL-1β的水平,用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法对IL-1β基因的-511C／T（rs16944）、＋3954C／T（rs114363）和-31C／T（rs1143627）位点进行单核苷酸多态性进行分析,并测序验证酶切结果。结果膝骨性关节炎患者组血清中白细胞介素1β水平明显高于健康对照组（t=-8．26,P〈0．01）,单核苷酸多态性分析显示：在膝OA患者组和健康对照组之间IL-1β-31C／T位点基因型分布和等位基因频率没有明显差异,该研究中没有发现IL-1β＋3954Tr基因型。膝OA患中的IL-1β-511TC、IL-1β＋3954CT基因型频率较健康对照组增加（P〈0．05,P〈0．05）,通过Logistic回归分析,IL-1β-511TC、IL-1β＋3954CT基因型与膝OA高风险发病率具有相关性（IL-1β-511TC,OR=1．842,95％CI=1．021—3．327,P〈0．05;IL-1β＋3954CT,OR=2．372,95％CI=1．022—5．509,P〈0．05）。此外,单体型分析显示与单体型TCC相比,单体型TCT和CCC与膝OA高风险发病率具有更强的相关性（TCT．OR=3．24,95％CI：1．50—7．00,P〈0．01;CCC．OR=6．07,95％CI：2．20—16．07,P〈0．01）。结论白细胞介素-1β基因的-511C／T（rs16944）和＋3954C／T（rs114363）位点多态性与中国汉族人膝OA的易感性相关。