基于Oncomine和TCGA数据库分析SLC2A1基因在肺腺癌中的表达意义

目的阐明SLC2A1基因在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine和TCGA等生物信息数据库中有关SLC2A1的信息,并对所获取的数据资料挖掘并进行二次分析,对SLC2A1在肺腺癌中的作用进行荟萃分析。结果 Oncomine数据库中共收集了448项不同类型SLC2A1的研究结果,关于在肿瘤与对照组织中SLC2A1表达有统计学差异的结果有47项,其中SLC2A1表达增高的有43项,表达降低的有4项。肺腺癌中高表达的研究有8项、低表达的有0项。共有8项研究数据集涉及SLC2A1在肺腺癌组织和正常组织中的表达,包括786例样本。在数据库中综合比较这8项研究成果,发现与对照组相比,SLC2A1在肺腺癌中的表达高于正常组织(P0.05)。另外,免疫组织化学显示SLC2A1在肺腺癌组织中表达较强或中等,而在正常组织中表达较弱或呈阴性。TCGA数据库中挖掘的结果也同样显示高表达SLC2A1的患者总体死亡率较高,低表达SLC2A1的患者预后较好(P0.05)。结论基于公共数据库中肿瘤相关的基因信息,提示SLC2A1的m RNA水平在肺腺癌组织中呈现高表达,并与肺腺癌预后相关,其有望成为肺腺癌药物治疗的重要治疗靶点。     

基于公共数据库分析FABP5在肾透明细胞癌中表达及预后的意义

摘要： 目的 探讨脂肪酸结合蛋白5 （FABP5） 基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义。方法 提取Oncomine 和GEO数据库中有关FABP5的信息并进行表达情况分析, 通过DAVID数据库对差异基因进行功能注释, 采用 GEPIA进行预后分析。结果 Oncomine数据库中共找到445项FABP5在不同肿瘤类型中的研究数据集, 表达差异有统计学意义的结果中表达增高的有32项 （肾癌5项）, 表达降低的有24项 （肾癌0项）。肾癌中有4项涉及肾透明细胞癌和正常组织中FABP5的表达研究数据集。综合比较这4项数据集发现, FABP5在肾透明细胞癌中的表达量高于正常组织 （P＜0.05）。GEO数据库中GSE66271芯片数据分析结果发现差异基因FABP5在肾透明细胞癌中的表达量显著高于正常组织 （P＜0.01）。DAVID功能分析发现这些差异基因主要集中于影响细胞的转运蛋白活性和蛋白质的消化和吸收代谢功能。使用GEPIA分析来自TCGA数据库和GTEx项目的516例患者预后发现FABP5高表达的患者总体死亡率较高, 低表达FABP5的患者预后较好 （P=0.001 1）。结论 FABP5在肾透明细胞癌组织中呈现高表达,并与肾透明细胞癌预后差相关, 其有望成为抗肾透明细胞癌药物的重要治疗靶点。     

基于Oncomine和GEO数据库分析S100P在胰腺癌中的表达及临床意义

目的 阐明S100P蛋白在胰腺癌中的表达及临床意义.方法 检索Oncomine和GEO数据库中有关S100P的信息,并对所获取的数据资料挖掘并进行二次分析,对S100P在胰腺癌中的作用进行分析.结果 Oncomine数据库中共收集了438项不同类型S100P的研究结果,关于S100P表达差异有统计学意义的结果有63项,其中S100P表达增高的有38项,表达降低的有25项.胰腺癌中高表达的研究有5项、低表达的有0项.共有11项研究涉及S100P在胰腺癌组织和正常组织中的表达,包括387例样本.在数据库中综合比较11项研究成果,发现与对照组相比,S100P在胰腺癌中的表达量高于正常组织(P＜0.05).通过分析GEO数据库中的数据集GSE28735,自身对照发现S100P在胰腺癌组织中的转录水平显著高于其癌旁组织(P＜0.05).不仅如此,通过挖掘GEO数据库,分析数据集GSE28735和GSE57495,发现高表达S100P的患者总体病死率较高,低表达S100P的患者预后较好(P＜0.05).结论 通过深入挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中肿瘤相关的基因信息,提示S100P mRNA在胰腺癌组织中呈现高表达,并与胰腺癌预后相关,其有望成为抗胰腺癌药物的重要治疗靶点.     

组织因子表达与肝癌侵袭转移的关系

目的 探讨组织因子(TF)在人肝细胞肝癌(HCC)组织中的表达与肿瘤组织侵袭转移之间的关系.方法 对50例HCC及相应正常肝组织标本进行TF和CD34免疫组织化学EnVision~(TM)法检测.结果 (1)HCC中TF阳性表达率为62%,MVD值为(51.14±24.97),明显高于正常肝组织中的6%和(18.70±6.35).HCC中TF阳性组MVD值高于阴性组(P＜0.05).(2)HCC中TF的表达与患者静脉浸润、肝内外转移、包膜无或不完整有关(P＜0.05),Cox模型提示TF的表达足影响HCC患者总生存率的独立因素之一.结论 TF可能参与HCC侵袭转移,可作为评估HCC患者预后参考指标.     

基于数据挖掘分析PLOD2基因在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：阐明PLOD2基因在肺腺癌中的表达及临床意义。方法：检索Oncomine和TCGA等生物信息数据库中有关PLOD2的信息，对所获取的数据资料挖掘并进行2次分析，对PLOD2在肺腺癌中的作用进行荟萃分析。结果：Oncomine数据库中共收集了444项不同类型PLOD2的研究结果，关于在肿瘤与对照组织中PLOD2表达有统计学差异的结果有56项，其中PLOD2表达增高的有49项，表达降低的有7项。涉及到肺癌的研究共有9项。肺腺癌中高表达的数据集有8项、低表达的有0项。共有815例样本涉及PLOD2的mRNA在肺腺癌和正常组织中的表达。在数据库中综合比较8项研究成果，发现与对照组相比，PLOD2在肺腺癌中的表达高于正常组织（P < 0.05）。另外，免疫组织化学显示PLOD2在肺腺癌组织中表达较强或中等，而在正常组织中表达较弱或呈阴性。不仅如此，通过挖掘TCGA数据库，发现高表达PLOD2的患者总体死亡率较高，低表达PLOD2的患者预后较好（P < 0.05）。结论：通过深入挖掘公共数据库中肿瘤相关的基因信息，提示PLOD2的mRNA水平在肺腺癌组织中呈现高表达，并与肺腺癌预后相关，有望成为肺腺癌药物治疗的重要治疗靶点。     

基于Oncomine和GEO数据库分析SIRPα基因在乳腺癌中的表达意义以及丹参酚酸B的干预作用研究

目的通过挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中的相关数据,分析信号调节蛋白α(SIRPα)基因在乳腺癌中的表达及其临床意义,并探讨丹参酚酸B对乳腺癌细胞中SIRPα基因的干预作用。方法检索Oncomine和GEO数据库中有关乳腺癌和丹参酚酸B干预乳腺癌的数据集,对所获取的数据资料进行数据挖掘,并结合文献资料综合分析。考察丹参酚酸B作用于乳腺癌MCF7细胞的基因表达谱。结果对Oncomine数据库中共收集的9项关于乳腺癌和乳腺正常组织SIRPα基因有差异表达的研究数据进行分析,发现乳腺癌组织中SIRPα基因的表达明显低于乳腺正常组织,差异具有统计学意义(P0.05)。通过生存分析发现低表达SIRPα基因乳腺癌患者无病生存期明显差于高表达者,高表达患者的预后更好(P0.05)。通过挖掘GEO数据库中的数据集GSE85871发现丹参酚酸B能够上调乳腺癌细胞SIRPα基因的表达(P0.01)。结论SIRPα基因在乳腺癌组织中呈现低表达,并与乳腺癌患者的预后相关,该基因可能是丹参酚酸B干预乳腺癌细胞的一个新靶点。     

肝细胞癌中ATP1B3基因表达及功能的生物信息学分析

目的 探讨ATP1B3基因在肝细胞癌中的表达以及临床价值,预测ATP1B3基因在肝细胞癌发生发展中的作用.方法 通过Oncomine及TIMER数据库分析ATP1B3 mRNA在不同肿瘤中的表达水平的差异性.利用HCCDB、Oncomine以及TCGA等数据库,分析ATP1B3 mRNA在肝细胞癌和正常肝组织中的表达情...     

基于TCGA等数据库分析TMEM88在肝细胞中的表达水平及其与预后的关系

目的 比较跨膜蛋白88(transmembrane protein 88,TMEM88)在正常肝细胞和肝癌肝细胞中的表达情况，并观察其与患者预后的关系。方法 研究基于公共数据库癌症基因组图谱（TCGA）、STRING、cBioPortal和基因表达总览（GEO）等提供的数据，采用Kaplan-Meier、UALCAN、肿瘤免疫估计资源（TIMER）和基因表达谱富集分析（GEPIA）进行分析。结果 TMEM88在肝癌组织中的表达高于相应的正常肝组织。TMEM88在肝细胞癌组织中的表达与预后相关。TMEM88的低表达与肝癌患者的总体生存率、疾病特异性生存率、无进展生存率和无复发生存率有关，特别是在疾病晚期（2级和3级）。TMEM88在肝癌细胞中的MCPCOUNTER浸润率、Xcell浸润率和TEDER浸润率呈正相关。结论TMEM88在肝癌中是一个保护性基因，并促进免疫逃逸，或可作为肝癌的分子标志物，进而指导临床、判断预后。     

亚洲人群肝细胞癌mRNA-miRNA表达谱整合分析挖掘疾病治疗靶点

目的通过整合数据库分析筛选出与亚洲人肝细胞癌(HCC)生存期相关微小RNA(miRNA),并探讨该miRNA潜在的生物学调控网络。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取亚洲人群HCC癌组织编码基因(mRNA)和miRNA表达量数据集,采用perl语言和R语言对数据进行提取、整理和分析,利用加权基因共表达网络(WGCNA)获取miRNA的共表达基因,并对筛选得到的差异表达miRNA进行Kaplan-Meier生存分析,筛选出对总生存时间存在影响的miRNA。通过与WGCNA筛选得到的共表达基因和miRNA靶基因预测数据库miRPathDB结合探寻其潜在靶基因,并通过metascape网站进行功能预测。结果通过TCGA共下载到6例正常、126例HCC癌组织的mRNA表达量数据集和6例正常、166例HCC癌组织的miRNA表达量数据集,通过生物信息学分析筛选出hsa-mir-139-5p差异表达具有显著意义,且对HCC总生存期有显著影响,通过预测其靶基因,发现其与脂质代谢、碳代谢等代谢通路相关。结论hsamir-139-5p可作为潜在的HCC治疗靶点,但需要后续实验验证。利用生物信息学手段筛选生物标志物或治疗靶标,是一种高效而经济的研究方式。     

MIF4GD在肝细胞肝癌中的表达及其对预后判断的价值

目的 研究MIF4GD在肝细胞肝癌(HCC)中的表达及其对HCC预后判断的价值.方法 Western blot检测8例HCC及癌旁新鲜组织中MIF4GD表达.免疫组织化学法检测108例HCC及癌旁切片组织中MIF4GD及Ki-67表达.分析MIF4GD表达与HCC各临床病理参数间的相关性,并对病例进行随访,log-rank单因素和多因素Cox比例风险回归模型分析MIF4GD与HCC 预后的关系.结果 MIF4GD在HCC组织中的表达明显低于相应的癌旁组织.MIF4GD的表达强度与HCC组织学分级、静脉侵袭和肝硬化状态相关(P＜0.05),且MIF4GD表达与Ki-67呈负相关(r=-0.341,P＜0.01).MIF4GD低表达与HCC患者的不良预后显著相关(P＜0.05).结论 MIF4GD在HCC中低表达,其可作为HCC独立的预后指标,提示MIF4GD可能与HCC的发生、发展密切相关.     

Ku70蛋白在肝细胞癌患者体内的表达规律及其意义

目的研究Ku70蛋白在肝细胞癌(HCC)患者体内的表达规律及其临床意义。方法采用免疫组织化学染色方法检测106例肝癌、癌旁和92例正常肝组织中Ku70蛋白的表达,探讨Ku70蛋白表达与临床病理参数的关系及与生存情况的关系。结果肝癌组织中Ku70蛋白阳性表达率高于癌旁组织和正常肝组织(P<0.01)。ChildPugh分级、肿瘤大小、肿瘤分化程度、TNM分期是HCC患者肝癌组织中Ku70蛋白表达水平升高的危险因素。生存分析表明低表达组的生存率显著高于高表达组(P<0.05)。结论 Ku70蛋白可作为HCC早期筛查和预后判断的新型肿瘤标志物。     

基于数据库分析KIF23在乳腺癌中的表达及预后意义

目的 基于数据库分析驱动蛋白超家族23 （KIF23） 在乳腺癌中的表达及意义。方法 利用Oncomine数据库和GCBI数据库分析KIF23基因在正常乳腺组织及乳腺癌中的表达差异,并对相关研究进行综合分析。通过 Kaplan-Meier Plotter数据库分析KIF23表达水平与乳腺癌患者各项生存预后指标： 无复发生存 （RFS）、 总生存 （OS）、无远处复发生存 （DMFS）、 复发后生存 （PPS） 之间的关系。结果 Oncomine数据库显示, KIF23在乳腺癌中较正常组织表达增高。综合分析39项关于正常乳腺组织和乳腺癌组织中KIF23表达水平的研究发现, KIF23基因在乳腺癌所有差异表达基因中的排名中位数为900.0, 差异有统计学意义 （P＜0.05）, KIF23在乳腺癌中高表达。KIF23在23项浸润性和4项非浸润性乳腺癌的不同病理类型中均高表达, 且差异表达基因的中位数值排名有统计学意义 （P＜0.05）。 GCBI数据库亦显示, KIF23在乳腺癌中的表达水平 （587.27） 高于正常乳腺组织 （90.89）, 差异有统计学意义 （P＜ 0.05）。Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果表明, KIF23高表达患者的RFS、 OS、 DMFS和PPS劣于低表达患者, 且分层分析发现, 在ER （+） 组中KIF23高表达患者的上述生存预后指标均较差。结论 KIF23在乳腺癌中高表达, 且与恶性乳腺癌患者不良预后相关, 可能对乳腺癌的诊断、 治疗及预后评估具有重要意义。     

生物信息学分析OLFML2B基因在胃癌中的功能及临床预后价值★

目的 采用生物信息学方法分析OLFML2B基因在胃癌中的表达、功能及预后价值。方法 从Oncomine数据库挖掘胃癌中OLFML2B基因的表达信息，利用Kaplan-Meier plotter数据库分析OLFML2B在胃癌中的预后价值，并使用UALCAN数据验证胃癌中OLFML2B的表达水平及预后价值，最终通过LinkedOmics数据库探索胃癌中与OLFML2B相关的基因及可能的生物学过程。结果 Oncomine 数据库共纳入了319项OLFML2B在不同肿瘤中的研究结果，差异有统计学意义的共39项（均表现为OLFML2B在肿瘤中高表达），其中6项分析显示OLFML2B在胃癌中的表达较正常胃组织明显升高，包括324例样本，差异有统计学意义（Fold Change>2， P<0.000 1）。OLFML2B表达量与胃癌总体生存率呈负相关，即OLFML2B表达水平越高则患者总体生存率越低（P<0.05）。亚组分析发现，弥漫型胃癌与胃肠型胃癌患者中，OLFML2B高表达组总体生存率较低表达组明显缩短（P<0.05）。UALCAN数据库验证表明，OLFML2B在胃癌组织中高表达且与胃癌预后相关。此外，LinkedOmics数据库提示，OLFML2B可能作为癌基因，通过影响血管生成、细胞黏附和细胞周期等途径参与胃癌的发生发展。结论 与正常胃组织相比，OLFML2B在胃癌组织中的表达水平明显升高，其高表达与胃癌患者不良预后相关，可能成为胃癌预后的生物标志物，并以癌基因的角色参与胃癌的发生发展。     

基于 GEO数据库分析非小细胞肺癌癌组织中配对盒基因 8的表达及其与病人预后的关系

目的 探讨基于高通量基因表达数据库(Gene expression Omnibus,GEO数据库)分析配对盒基因8(PAX8)在非小细胞肺癌(NSCLC)病人癌组织中的表达情况及与预后的关系.方法 利用在线工具Oncomine分析PAX8在NSCLC与正常肺组织的表达情况,基于GEO数据库下载相关芯片数据(GSE77803),收集156例NSCLC组织的基因表达谱及相关临床数据,采用中位数法将其分为PAX8低表达组(n=78)和PAX8高表达组(n=78).分析PAX8的表达与病人性别、年龄、病理类型、T分期、N分期和术后复发情况之间的关系;采用生存分析PAX8的表达与病人预后生存之间的关系;采用基因本体(GO)注释分析PAX8基因的功能,采用KEGG PATHWAY分析PAX8可能参与的信号通路.结果 TCGA Lung 2数据集共检测了1537个样本,其中正常肺组织样本390例,肺癌组织样本共721例,血液样本420例,无意义样本6例.与正常肺组织相比,PAX8在肺腺癌和肺鳞癌中表达水平明显升高(P<0.05);基于GEO数据库中GSE77803(GPL570)数据集分析,NSCLC癌组织中PAX8的表达水平与病人的T分期、N分期和是否复发有关(P<0.05),生存分析显示,癌组织中PAX8低表达病人的总生存率为52.94％,中位生存期为54.6个月,显著高于PAX8高表达病人(34.35％,48.6个月)(log-rankχ2=4.609,P=0.032).PAX8低表达病人无病生存率为42.50％,中位生存期为51.7个月,显著高于PAX8高表达病人(28.71％,40.8个月)(log-rankχ2=5.712,P=0.017);GO注释和KEGG分析显示,PAX8可能参与调节NSCLC发生发展相关的信号通路的表达.结论 PAX8蛋白在肺腺癌和肺鳞癌中均存在异常高表达,PAX8低表达NSCLC病人具有更高的生存率.     

HJURP基因促进肾癌细胞增殖迁移的机制研究

目的　研究HJURP基因对肾癌细胞生物学功能的影响。方法　利用TCGA肾癌数据库分析HJURP基因在肾癌中的表达及对预后的影响,qPCR进一步检测HJURP基因在20例肾癌组织,肾癌细胞株CAKI-1、786O、A498及正常化肾小管细胞HK2中的表达。分别设计HJURP特异性siRNA（si-HJURP组）和对照序列（NC组）转染CAKI-1细胞株,采用细胞克隆形成实验和MTT法检测HJURP基因对肾癌细胞增殖活性影响,流式细胞术检测肾癌细胞周期变化,Transwell实验检测肾癌细胞迁移能力,Western blot检测上皮间质转化（EMT）及AKT通路相关蛋白的表达变化。结果　（1）TCGA数据库中HJURP在肾癌组织中显著高表达,且随着肿瘤分期的升高而增高（P＜0.05）。HJURP高表达组患者总生存率和无病生存率明显较HJURP低表达组患者降低。（2）肾癌组织及肾癌细胞株中HJURP表达均高于癌旁组织及正常肾小管细胞。（3）细胞学实验结果显示,与NC组相比,si-HJURP组CAKI-1细胞增殖活性明显受抑制,G2期细胞比例增高,细胞迁移数量明显下降,EMT相关蛋白N-cadherin表达下降,E-cadherin表达升高,同时AKT通路关键蛋白p-AKT及p-GSK3β明显下调（P＜0.05）。结论　HJURP基因在肾癌中高表达,促进肾癌细胞的增殖及迁移,其可作为肾癌的潜在临床诊治靶点及预后标志物。     

MTERF2在乳腺癌组织中的表达及与临床病理特征的相关性

目的探讨线粒体转录终止因子2(MTERF2)在乳腺癌组织中的表达情况及其与临床疾病病理特征的关系。方法分别采用qRT-PCR技术及免疫组化SP法检测46例乳腺癌组织及其配对癌旁组织中MTERF2 mRNA和蛋白质的表达水平。使用R2.15.3软件从美国癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)中下载乳腺癌数据集MTERF2 mRNA SeqV2数据及临床病理资料。利用R2.15.3软件分析MTERF2 mRNA表达量与临床病理参数的相关性及预后作用。采用Kaplan-Meier生存分析MTERF2表达量和乳腺癌患者预后的相关性。采用Cox回归多因素分析探讨影响乳腺癌患者预后的因素。结果 qRT-PCR结果显示,与癌旁组织相比,MTERF2 mRNA在乳腺癌组织的表达水平均显著降低(P=0.013)。免疫组织化学结果显示,MTERF2蛋白主要表达于细胞质,在乳腺癌组织中的表达水平显著低于癌旁组织(P=0.020)。从TCGA数据库中共下载1110例含有MTERF2 mRNA表达量和患者临床病理参数的乳腺癌组织样本,经筛选整理剔除临床资料不完整的病例后保留707例,统计分析表明,MTERF2 mRNA的表达量与乳腺癌患者的ER状态、PR状态、分子分型、癌症类型以及组织学诊断类型存在显著相关性(均P<0.001),而与患者的年龄、性别、T分期、N分期、M分期、AJCC病理分期、HER2状态、有无恶性肿瘤病史以及原发部位无显著相关性。Kaplan-Meier生存分析发现,乳腺癌患者MTERF2 mRNA的表达水平与总生存率(OS)和无疾病进展生存率(DFS)没有显著相关性(Log-rank,P=0.329和Log-rank,P=0.371)。Cox比例风险回归模型分析表明,乳腺癌患者的年龄、M分期以及肿瘤类型可能是影响乳腺癌患者预后的独立因素(P<0.05),但MTERF2 mRNA的表达量与乳腺癌患者的预后无关。结论 MTERF2 mRNA和蛋白质在乳腺癌组织的表达水平显著低于癌旁组织,MTERF2 mRNA的表达量与乳腺癌患者临床病理特征密切相关,但与乳腺癌患者的预后无显著相关性。     

Syndecan-1在肺腺癌组织中的表达及临床意义

目的研究Syndecan-1在肺腺癌组织中的表达情况及其与肺腺癌患者临床病理特征和预后的关系。方法用免疫组织化学法(SP法)检测76例肺腺癌组织及其癌旁正常肺组织中Syndecan-1的表达情况,并分析Syndecan-1表达与肺腺癌各项临床病理指标以及患者预后的相关性。结果在肺腺癌组织中Syndecan-1的染色结果为:25例(32.9%)阴性,18例(23.7%)弱阳性,19例(25.0%)阳性,14例(18.4%)强阳性;其中低表达者43例(56.6%),高表达者33例(43.4%)。在癌旁正常肺组织中,Syndecan-1染色结果为:29例(38.2%)阳性,47例(61.8%)强阳性;均为高表达。肺腺癌组织中Syndecan-1低表达与肿瘤分化程度(χ2=5.545,P=0.032)、卫星结节(χ2=6.061,P=0.018)、区域淋巴结转移(χ2=7.727,P=0.01)、pTNM分期(χ2=14.434,P<0.001)等因素相关。Syndecan-1低表达组患者术后三年生存率为14.0%,明显低于高表达组患者30.3%,差异具有统计学意义(χ2=12.555,P<0.001)。结论Syndecan-1可能参与了肺腺癌的发生发展,Syndecan-1与肺腺癌的临床病理特征及预后关系密切,可以作为肺腺癌的独立预后预测因子。     

基于TCGA数据库的肝细胞癌铁死亡相关LncRNA风险预测模型的构建

目的 基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库建立肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的铁死亡相关长链非编码RNA(LncRNA)风险预测模型.方法 通过TCGA数据库下载HCC基因表达谱数据和临床信息,获取LncRNA表达数据,从铁死亡基因数据库(FerrD...     

ATP6V1C1在肝细胞癌中的表达及功能研究

目的　探究ATP6V1C1在肝细胞癌（HCC）表达情况及功能。方法　本研究为基础研究,利用来自癌症基因组图谱数据库基因表达总库（GEO）测序数据,找出HCC差异表达基因（P<0.01,|logFc|≥1）,进一步利用来自于癌症基因组图谱（TCGA）在线数据UALCAN、Timer分析ATP6V1C1在HCC不同分期的表达情况及不同表达水平的预后情况,The Human Protein Atlas分析正常肝组织与肿瘤组织免疫组化。TCGA数据库包含女性患者121例,男性患者281例,年龄16～81岁,数据分析后台自行完成。KEGG信号了解ATP6V1C1对相关通路的影响。构建pcDNA3.1（+）-ATP6V1C1载体,购买siRNA干扰片段体外研究ATP6V1C1对肝细胞癌的影响。统计学方法采用独立样本t检验。结果　生物信息学分析提示ATP6V1C1在多种癌症中上调（P<0.05）,ATP6V1C1的表达水平与HCC的肿瘤分级有关,在肝癌患者中,ATP6V1C1表达上调患者相对下调患者预后更差（P<0.05）。过表达ATP6V1C1后明显促进HCC细胞的侵袭、迁移、增殖及克隆形成能力,同时,干扰ATP6V1C1抑制HCC细胞的侵袭、迁移、增殖及克隆形成能力。结论　ATP6V1C1在HCC中表达与预后相关,这个研究为HCC提供了新的可能诊断及治疗靶标。     

基于数据挖掘分析SLC22A1基因在肝细胞癌组织中的表达及其预后意义

目的探讨阳离子转运蛋白1(SLC22A1)基因在肝细胞癌中的表达情况和预后意义。方法用The Human Protein Atlas(HAP)数据库分析SLC22A1蛋白在肝细胞癌中的表达情况。利用Oncomine和GEPIA数据库分析SLC22A1基因在肝细胞癌和肝正常组织中的表达水平。利用GEPIA和Linked Omics数据库分析SLC22A1基因与肝细胞癌患者临床相关性:总生存期(OS)、无瘤生存期(DFS)、病理分期和种族。采用Metascape在线工具对SLC22A1相关基因进行功能和通路富集分析。结果 LC22A1蛋白和m RNA在肝细胞癌组织中显著低于正常组织,且与肝细胞癌预后呈正相关(P0.001)。肝细胞癌中SLC22A1基因表达水平与预后、病理分期存在显著差异性(P0.05),与种族无相关性。功能富集分析显示,SLC22A1基因通过影响小分子分解代谢过程、对异源生物刺激的反应和有机酸生物合成过程等发挥作用。通路富集分析显示,SLC22A1基因通过作用于过氧化物酶体、脂肪酸降解和精氨酸和脯氨酸代谢等通路起作用。结论细胞癌组织中SLC22A1蛋白和m RNA表达水平均显著低于肝正常组织,其表达情况与肝细胞癌预后存在显著关联,提示SLC22A1可能成为评估肝细胞癌预后的指标和研发肝细胞癌相关靶向药物的候选靶点,为肝细胞癌研究提供新研究思路。