基于网络药理学探讨七福饮治疗阿尔茨海默病的机制

目的:基于网络药理学方法探讨七福饮治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分及其作用机制。方法:应用中药系统药理学(TCMSP)分析平台、ETCM数据库、SymMap数据库筛选七福饮的活性成分及作用靶点。利用Genecards数据库、OMIM数据库、Pubmed-Gene数据库筛选AD相关靶点,取交集得到七福饮治疗AD的靶点。将上述靶点导入STRING数据库,利用Cytoscape软件构建"活性成分-作用靶点"网络和蛋白相互作用(PPI)网络,筛选出关键成分和关键靶点,并进行GO生物功能注释和KEGG通路分析。应用Schrodinger软件进行分子对接验证。结果:对七福饮共筛选出106个活性成分、511个作用靶点,AD相关靶点369个。"活性成分-作用靶点"网络分析显示,山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇可能是七福饮治疗AD的关键活性成分。PPI网络分析显示,丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、脑源性神经营养因子(BDNF)、胰岛素(INS)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、肿瘤蛋白p53(TP53)可能是七福饮治疗AD的关键靶点。通路分析提示,七福饮治疗AD的机制可能与多巴胺能突触、cAMP信号通路、白介素-17信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路等有关。分子对接显示,AKT1与腺嘌呤、BDNF与Inermine、INS与川芎内酯E、MAPK3与异甘草黄酮醇、TP53与7-乙酰氧基-2-甲基异黄酮的结合能力较强。结论:七福饮通过多成分、多靶点、多通路减轻神经元损伤,发挥治疗AD的作用。     

基于网络药理学研究麻杏苡甘汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的 运用网络药理学方法筛选麻杏苡甘汤治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法 通过多个数据库筛选药物主要活性成分、靶点及与RA相关的疾病靶点,获取交集基因。采用Cytoscape 3.7.0软件构建麻杏苡甘汤治疗RA的成分-靶点-通路网络,采用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用R语言对靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 筛选出的药物核心成分为谷甾醇、槲皮素、木犀草素、查尔酮B、β-谷甾醇等,蛋白互作频次较高的靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素(IL)-6、血管内皮生长因子(VEGFA)、表皮生长因子(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)等,与RA紧密联系的信号通路有磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、低氧诱导因子(HIF)-1、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、Janus激酶-信号转导及转录活化因子通路(JAK-STAT)、RA、Wnt等。结论麻杏苡甘汤治疗RA具有多成分-多靶点-多途径的作用特点,为其进一步研究提供新的思路与线索。     

基于网络药理学探讨三七抗急性肺损伤相关分子机制

目的:利用网络药理学的方法研究三七抗急性肺损伤的相关分子机制。方法:利用TCMSP数据库获取三七的活性成分,再通过药物动力学参数筛选出主要活性成分,并通过文献予以补充;通过Swiss Target Prediction数据库获取各活性成分靶点;通过Gene Cards、OMIM、Dis Ge NET数据库获取急性肺损伤靶点;利用STRING数据库进行蛋白质相互作用分析,采用Cytoscape3.7.2构建PPI网络并挖掘出其潜在蛋白质功能模块;采用Metascape平台对三七抗急性肺损伤靶点进行GO分类富集分析和KEGG通路富集分析。结果:共筛选出9个活性成分,槲皮素、人参皂苷Rh2和人参皂苷Rg1等可能为三七抗急性肺损伤作用的主要活性成分,核心靶点有PIK3CA、AKT1、PIK3R1、VEGFA、EGFR等。三七抗急性肺损伤作用可能涉及的通路有磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、血管内皮生长因子（VEGF）信号通路、Ras信号通路、Rap1信号通路等。结论:本研究初步揭示了三七抗急性肺损伤的多成分、多靶点、多通路的作用机制。     

基于网络药理学探究大泻心汤治疗肺癌的作用机制

目的 运用网络药理学方法探究大泻心汤治疗肺癌的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取大泻心汤中单味药的活性成分及其靶点。利用疗效药靶数据库(TTD)、DisGeNET数据库查找肺癌相关靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件确定该复方治疗肺癌的关键靶标,绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)图,同时构建“中药-化合物-靶点-疾病”网络构建图。使用DAVID平台对共同靶点进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,并使用Omicshare Tools进行可视化。结果 大泻心汤共筛选获得164个活性成分,与肺癌疾病靶点交集出154个共同靶点,通过筛选共同靶点得到27个关键靶点,主要为信号转导和转录活化因子3(STAT3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)及肿瘤抑制基因TP53等。GO功能分析显示与细胞氧化应激反应、核受体、转录因子调节等有关;KEGG信号通路富集分析得到173条信号通路,主要涉及乙型肝炎、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、小细胞...     

基于网络药理学分析土茯苓治疗乳腺癌的作用机制

目的 基于网络药理学分析土茯苓治疗乳腺癌的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台（the Traditional Chinese Medicine Database Analysis Platform,TCMSP）获取土茯苓的主要活性成分及其靶点。以TCMSP预测的活性成分为基础,通过Swiss、SEA、TCMSP和PharmMapper数据库预测、合并土茯苓主要活性成分的靶点;从OMIM、CTD、Genecards、PharmGKB和DisGeNET数据库获取乳腺癌主要作用靶点;通过取交集到土茯苓与乳腺癌的共同靶点;STRING数据库对共同靶点进行蛋白-蛋白相互作用（protein-protein interaction network,PPI）分析、Cytoscape 3.8.2软件构建PPI网络;采用Metascape平台对核心靶点进行GO富集分析与KEGG信号通路富集分析,并利用微生信在线绘图平台进行可视化处理。结果 从土茯苓中筛选得到15种活性成分及614个作用靶点,与2 195个乳腺癌相关靶点取交集,得到273个共同靶点;土茯苓治疗乳腺癌的有效活性成分有异黄杞苷、花旗松素、槲皮素、柚皮素、落新妇苷、谷甾醇、β-谷甾醇、豆甾醇和薯蓣皂苷元等;关键靶点为RAC-α丝氨酸／苏氨酸-蛋白激酶、肿瘤细胞抗原、表皮生长因子受体等;涉及生物学通路较多,主要功能有细胞代谢、细胞生长、细胞增殖、转移、凋亡和血管生成等,且多数通路与PI3K/AKT信号通路相关。结论 土茯苓治疗乳腺癌具有多成分、多靶点、多通路的特点,通过分子网络的内在联系预测到土茯苓可能通过PI3K/AKT信号通路发挥治疗乳腺癌的作用,这为其实验研究和临床应用提供了一定的理论基础。     

基于网络药理学探讨玫芦消痤膏治疗痤疮的作用机制

目的 采用网络药理学分析方法研究玫芦消痤膏(MXO)治疗痤疮(Acne)的作用靶点及信号通路,探索其作用机制.方法 该研究利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选MXO活性成分和中药靶标,然后使用Uni Prot数据库进行基因名注释,并在Gene Cards数据库中检索痤疮的相关疾病靶标.利用Rversion 3.6.2软件、Cytoscape 3.7.1软件,构建中药-活性成分-靶点多维网络及MXO-Acne互作网络,利用STRING数据库,评估和整合蛋白之间的相互作用.最后利用R语言中Bioc Manager包进行基因本体功能注释及KEGG通路富集分析.结果 共筛选得到MXO活性成分35个,槲皮素、山柰酚、木犀草素、花生四烯酸、β-胡萝卜素、芒柄花黄素、没食子酸和异鼠李素等是关键活性成分;作用靶标基因92个,核心蛋白有Rac-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素(IL)-6、血管内皮生长因子A(VEGFA)、前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)和粒细胞趋化蛋白-1(CXCL8)等,主要涉及核受体活性、转录因子活性、类固醇激素受体活性、细胞因子活性等生物过程,KEGG通路主要富集在TNF、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、IL-17、AGE-RAGE等信号通路.结论 预测了MXO治疗痤疮的潜在作用机制,为进一步的活性成分研究和实验验证提供了理论依据.     

基于网络药理学探析四君子汤抗衰老作用机制

目的借助网络药理学方法初步探究四君子汤抗衰老的作用机制。方法基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选四君子汤中4味中药的主要活性成分及靶点,分别在Genecards和人类孟德尔遗传在线(online mendelian inheritance in man,OMIM)疾病数据库中检索衰老相关靶点,用Cytoscape3.7.0软件对四君子汤活性成分靶点以及抗衰老靶点进行可视化。在STRING在线平台构建共表达靶点蛋白质-蛋白质互作网络,通过R3.6.2软件对四君子汤抗衰老靶基因进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果 TCMSP中筛选出71个主要成分,210个成分靶点。疾病数据库获取到279个衰老靶点。通过靶点映射发现四君子汤活性成分作用的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素6(IL-6)、表皮生长因子(EGF)等55个共表达靶基因,发现靶基因主要参与细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性等生物过程,主要富集在糖尿病并发症(AGE-RAGE)、磷脂酰肌醇3'-激酶-Akt(PI3K-Akt)、缺氧诱导因子1(hypoxia-inducible factor 1,HIF-1)、白介素17(interleukin17,IL-17)及肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等信号通路和多种癌症途径。结论本研究初步探究了四君子汤抗衰老作用的活性成分及靶基因,网络关系构建及通路富集结果充分体现了其多成分-多靶点-多途径的复杂特点,为进一步深入阐释其抗衰老机制奠定了基础。     

基于网络药理学和分子对接的三九胃泰颗粒抗炎镇痛作用机制研究

目的:基于网络药理学探讨三九胃泰颗粒抗炎镇痛的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库和相关文献筛选出三九胃泰颗粒的活性成分，并对其活性成分作用靶点进行预测，运用Cytoscape软件构建“三九胃泰颗粒-潜在活性成分-靶点”网络。通过GeneCards数据库收集炎症、疼痛相关靶点并与药物靶点相交集。通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析，京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集、基因本体(GO)分析于DAVID数据库中进行。Cytoscape软件构建“三九胃泰颗粒潜在活性成分-炎症疼痛相关靶点-通路”网络。AutoDockTools和PyMOL软件用于三九胃泰颗粒抗炎镇痛核心成分和核心靶点的分子对接。结果:共获取三九胃泰颗粒的潜在活性成分73种，其中核心活性成分15个，包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等；三九胃泰颗粒发挥抗炎镇痛作用的核心靶点22个，包括PTGS2、HSP90AB1、PTGS1等，参与药物的应答、炎症应答、MAPK级联的正调节等生物过程，涉及脂质和动脉粥样硬化、TNF、PI3K-AKT、MAPK等信号通路。核心成分槲皮素、山柰酚、β-...     

基于生物信息学及网络药理学分析丹皮酚抗瘢痕疙瘩的作用机制

目的筛选丹皮酚作用于瘢痕疙瘩(KD)的潜在药物靶点和信号通路,初步分析丹皮酚抗KD的作用机理。方法从CTD和GeneCards数据库中获取KD致病基因,从TCMSP和PubChem数据库中获取丹皮酚直接靶标基因。采用STRING数据库和Cytoscape3.7.1软件进行网络拓扑分析,筛选出KD候选基因、丹皮酚候选靶点基因和丹皮酚的潜在药物靶点。利用DIVAD软件进行基因功能富集(GO)分析和信号通路富集(KEGG)分析,并采用Cytoscape软件构建药物靶点网络图。下载GEO芯片数据进行最佳药物靶点验证。结果共筛选出KD候选基因143个、丹皮酚候选靶点基因29个,丹皮酚抗KD的潜在药物靶点11个,并构建出一个包含11个节点、86条边的潜在药物靶点PPI网络;这些潜在药物靶点与磷脂腺肌醇3激酶/蛋白质丝氨酸苏氨酸激酶(PI3K/Akt)信号通路、凋亡信号通路及核转录因子-κB(NF-κB)信号通路等相关。结论丹皮酚可能通过作用于PI3K/Akt信号通路、凋亡通路及NF-κB信号通路中的核转录因子κB抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白、B细胞淋巴瘤-2、磷脂酶和张力蛋白同源物、转化生长因子β1、Akt1、丝裂原活化蛋白激酶1、白细胞介素-6、NF-κB1、纤维连接蛋白1、半胱氨酸蛋白酶3起到抗KD的作用。     

基于网络药理学探讨左归丸治疗早发性卵巢功能不全机制

目的基于网络药理学分析左归丸治疗早发性卵巢功能不全的有效活性成分,预测其作用靶点,并探讨其潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台筛选左归丸的活性成分及预测作用靶点,并在Uniprot数据库搜索靶点基因,在GeneCards数据库、CTD数据库、OMIM数据库筛选出早发性卵巢功能不全的靶点基因,通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络和"药物-活性成分-靶点"网络,通过DAVID数据库对核心靶点进行GO富集分析及KEGG通路富集分析并利用R语言和Cytoscape软件绘图。结果以OB值和DL值两个参数筛选得到83个有效化合物,包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇等。与疾病相关的候选作用靶点共181个,关键靶点涉及细胞肿瘤抗原53(TP53)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、转录因子AP-1家族成员(JUN)、肿瘤坏死因子(TNF)。GO富集分析涉及对药物、毒物的应答,基因转录,抑制凋亡等。KEGG通路富集分析显示含靶点数较多的是癌症信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、叉头框蛋白O亚家族信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B通路和丝裂原活化蛋白激酶信号通路。结论研究通过网络药理学系统探讨了左归丸有效成分对应的靶点,以及治疗早发性卵巢功能不全的作用机制,可为今后基础或临床研究提供科学依据。     

芪蛭通窍胶囊“异病同治”前列腺增生症和慢性前列腺炎的网络药理作用机制及分子对接

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨芪蛭通窍胶囊(QTC)异病同治前列腺增生症(BPH)和慢性前列腺炎(CP)的作用机制。方法 基于TCMSP、BATMAN、PubChem及Swiss Target Prediction数据库搜集、获取QTC活性成分及相应靶点、GeneCards数据库预测BPH和CP靶点基因，利用Venny 2.1.0获取交集靶点、Cytoscape 3.10.1构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图，基于STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络后导入Cytoscape输出核心靶点、Metascape数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，最后进行分子对接测试。结果 共获得QTC活性成分70个，包括槲皮素等；“药物-疾病”交集靶点214个。QTC可能作用于前列腺组织缺氧和炎症微环境，干预缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、白细胞介素-6(IL-6)等多个靶点，调控核因子-κB(NF-κB)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、HIF-1α等多条相关途径。分子对接结果显示槲皮素与8个核心靶点均具有较好的结合能。结论 QTC可能通过多靶点、多信号途径改善前列腺组织缺氧、炎症微环境而对BPH和CP发挥异病同治作用，但尚需在进一步研究中予以验证。     

基于网络药理学探讨五苓散治疗心力衰竭作用机制

目的根据网络药理学方法对五苓散治疗心力衰竭(HF)的作用机制进行研究探讨。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对五苓散进行活性成分及靶点筛选,检索与疾病靶点有关的数据库TTD、Pharmg KB、Dis Ge NET筛选HF的作用靶点,构建韦恩图得到五苓散治疗HF的作用靶点,使用Cytoscape 3.7.1建立成分-靶点-疾病网络,基于DAVID数据库对靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果基于TCMSP得到五苓散治疗HF的30种活性成分和58个潜在靶点,构建韦恩图得到交集核心靶点26个,GO功能富集分析得到条目163个,其中生物过程条目118个、细胞组成条目15个、分子功能条目30个;KEGG通路富集分析得出条目46个,主要包括细胞凋亡、钙离子信号通路、HIF-1信号通路、PI3K-AKT信号通路等。结论基于网络药理学初步探讨并验证了五苓散治疗HF多成分-多靶点-多通路的整体调节作用特点,预测了五苓散治疗HF的潜在作用机制,以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

活血消异方治疗子宫内膜异位症网络药理学研究

采用网络药理学方法探析活血消异方治疗子宫内膜异位症(EMT)的相关靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Swiss Target Prediction网络数据库推测并获取活血消异方组方的药物活性成分及靶点。利用基因卡片(GeneCard)数据库筛选获取EMT的疾病相关靶点,绘制药物成分-药物靶点网络、药物-疾病靶点的网络及核心蛋白质互作(PPI)网络,并对关键靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)基因富集分析。结果:从活血消异方中筛选出主要活性成分共99个,纳入靶点166个,其中疾病与药物的共同靶点66个;GO分析得到785项结果,主要涉及细胞的增殖、代谢、凋亡及激素受体活性等过程;KEGG分析得到124条通路,活血消异方治疗EMT主要涉及细胞增殖与凋亡、P53信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶/分子蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。结论:活血消异方治疗EMT具有多成分、多靶点的特征,且涉及多条信号通路,此为进一步探讨该方治疗EMT机制提供了思路。     

基于网络药理学探讨藏红花治疗糖尿病肾病的作用机制

目的基于网络药理学方法探讨藏红花治疗糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的作用机制。方法通过TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)数据库获取藏红花的主要成分,根据毒药物动力学(ADME)进行筛选,进一步获取其作用靶点;通过Genecards、OMIM、Drug Bank数据库获取DN相关靶点,利用Cyto Scape 3.7. 1软件构建藏红花治疗DN靶点网络图,利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络。采用Metascape平台对藏红花治疗DN的核心靶点参与的生物学过程及通路进行富集分析,之后采用Cyto Scape 3.7. 1软件构建"藏红花成分-DN靶点-通路"网络。结果藏红花调节DN的主要活性成分为槲皮素、山柰酚、藏红花酸等,核心靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT-1)、肿瘤抑制蛋白(TP53)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、核因子κB(NF-kappa B)等,藏红花调节DN的主要生物学通路包括晚期糖基化产物(AGE-RAGE)信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论西红花可通过AGE-RAGE、PI3K-Akt等多条通路对DN发挥治疗作用。     

基于网络药理学研究六君子汤治疗年龄相关性黄斑变性的机制

  目的  通过网络药理学分析六君子汤治疗年龄相关性黄斑变性(AMD)的靶点和信号通路,并探讨其作用机制。  方法  从中药网络药理学数据和分析平台(TCMSP)搜索六君子汤6味中药的化学成分,并筛选出可能活性成分;在Swiss Target Prediction数据库查询活性成分的对应靶点;使用DrugBank、TTD和OMIM数据库收集AMD的疾病靶点;Venny分析得到活性成分和疾病的共同靶点;从String数据库获取共同靶点的蛋白相互作用信息,使用Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络和活性成分-靶点相互作用网络;通过David数据库进行共同靶点基因功能GO和KEGG通路富集分析;采用SD大鼠制备含药血清,通过ARPE-19细胞,验证六君子汤对关键信号通路的影响。  结果  获得六君子汤活性成分154个、对应靶点934个,AMD疾病靶点266个,两者共同靶点92个;蛋白相互作用网络分析得到37个主要靶点,活性成分-靶点网络分析获得39个关键活性成分;GO分析获得277个生物过程条目,主要富集在转录因子结合、丝氨酸/苏氨酸激酶活性、蛋白质磷酸化、蛋白激酶C活性、蛋白激酶活性、蛋白脱乙酰酶活性、蛋白自磷酸化、肽-丝氨酸磷酸化、NAD依赖的组蛋白脱乙酰酶活性、MAP激酶活性等。KEGG通路分析产生107个条目,主要富集在VEGF信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、NOD样受体信号通路、催乳素信号通路、神经营养素信号通路、MAPK信号通路、炎症介质对TRP通道的调节等;六君子汤对氧化损伤ARPE-19细胞有保护作用,能下调VEGF、AKT、ERK1/2及p38蛋白表达。  结论  六君子汤是通过多组分、多途径、多靶点发挥治疗AMD的作用,潜在机制是影响细胞增殖和迁移、细胞凋亡、血管形成、炎症过程。      

大黄治疗慢性肾衰竭的网络药理学机制

【目的】基于网络药理学探讨大黄治疗慢性肾衰竭的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索大黄化学成分,通过SwissTargetPrediction数据库得到大黄的预测靶点,通过GeneCards数据库获取慢性肾衰竭相关靶点。将大黄的预测靶点与慢性肾衰竭相关靶点进行映射,得到大黄治疗慢性肾衰竭的预测靶点。通过Cytoscape 3.6.0软件,生成大黄治疗慢性肾衰竭的蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络,再在DAVID网站进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。【结果】大黄活性化合物有16种,筛选出大黄可能与慢性肾衰竭相关的靶点93个,关键靶点共30个,包括SRC、ESR1、CSNK2A1、FYN、STAT3、MAPK1、EGFR、SMAD3、STAT1、MAPK3、AKT1等。通过KEGG通路分析得到122条通路,结合文献检索,筛选出治疗慢性肾衰竭的可能通路为20条,主要通路包含磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)—苏氨酸激酶(Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Foxo信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、Wnt信号路、Hippo信号通路、转化生长因子β(TGF-β)信号通路等。【结论】大黄通过多成分、多靶点、多通路治疗慢性肾衰竭,其机制主要与调控肾纤维化相关通路有关。     

基于网络药理学与分子对接的蒺藜皂苷D抗肺纤维化的作用机制研究*

目的: 采用网络药理学和分子对接技术探讨蒺藜皂苷D治疗肺纤维化可能的分子机制。方法: 采用SwissTargetPrediction数据库收集蒺藜皂苷D靶点,通过UniProt数据库将相应靶点蛋白名称进行标准化;通过DrugBank数据库、GeneCards数据库和OMIM数据库检索“pulmonary fibrosis”,获取肺纤维化疾病靶点;通过韦恩图获取蒺藜皂苷D和肺纤维化的共同靶点,并进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析、基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。利用分子对接技术验证蒺藜皂苷D与核心靶点的结合能力。结果: 获取蒺藜皂苷D 43个潜在靶点,肺纤维化疾病1 492个相关靶点,蒺藜皂苷D与肺纤维化共同靶点17个,PPI网络中自由度排名前8个靶点分别为MAPK3、PPARG、IL6、TNF、VEGFA、TGFβ1、FGF2和STAT3;GO功能富集注释得到生物学过程(BP)条目418条,细胞组成(CC)条目22条,分子功能(MF)条目29条;KEGG通路分析得到69条信号通路;分子对接提示MAPK3、FGF2、STAT3、IL6、PPARG与蒺藜皂苷D的结合能均≤-5.0 kcal/mol。结论: 蒺藜皂苷D通过多靶点、多途径的效应发挥治疗肺纤维化的生物活性,其可能通过MAPK3、FGF2、STAT3、IL6和PPARG等靶点调控MAPK信号通路和PI3K-Akt信号通路治疗肺纤维化。     

基于网络药理学研究十全育真汤治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的运用网络药理学方法预测十全育真汤治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubMed等相关数据库,筛选出十全育真汤的活性成分及对应靶点;通过GeneCards等疾病数据库筛选出NSCLC相关靶点;将药物靶点与疾病靶点相映射得到十全育真汤治疗NSCLC的靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件筛选出关键活性成分,并构建"药物-靶点-疾病"网络;采用DAVID 6.8数据库分析基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路;采用STRING V11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。结果筛选出十全育真汤治疗NSCLC的关键活性成分26个,包括槲皮素、木犀草素和山柰酚等,关键活性成分对应的靶点182个; GO功能及KEGG富集分析显示,信号通路主要涉及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路和血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等15条通路; PPI网络分析显示,十全育真汤治疗NSCLC的核心靶点主要集中在细胞增殖、凋亡、细胞周期、炎症及血管生成等方面。结论十全育真汤治疗NSCLC的作用机制可能与提高免疫、抑制血管生成及促进细胞凋亡等有关。     

基于网络药理学分析附子-干姜药对治疗溃疡性结肠炎作用机制

目的 运用网络药理学方法探讨附子-干姜药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选附子-干姜药对活性成分;通过UniProt数据库获取活性成分的可能作用靶点;采用GeneCards数据库获取溃疡性结肠炎疾病靶点;采用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析;采用Cytoscape 3.7.1软件构建附子-干姜药对治疗溃疡性结肠炎的药物-成分-靶点-疾病网络图;采用Bioconductor中R包进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果 从附子-干姜药对中共筛选出活性成分32个,药物与疾病共同靶点110个; PPI网络共有节点107个,边1007条; GO功能富集分析生物学过程(BP)、分子生物学功能(MF)和细胞组分(CC)分别为1659,117,53条; KEGG信号通路富集分析得到136条相关通路,主要涉及细胞凋亡(Apoptosis)、PI3K-Akt信号通路、p53信号通路等。结论 附子-干姜药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制具有多靶点、多通路的特点。     

PI3K-Akt信号通路与心肌保护

越来越多的研究表明,药物及非药物手段可以在再灌注之初通过活化磷酯酰肌醇-3-激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-Akt)这一共同通路,发挥提高心肌功能和促进细胞存活的重要作用。本文对PI3K、Akt、下游靶点、效应器在缺血/再灌注中的作用进行综述,阐明PI3K-Akt信号通路的主动保护效应在心肌保护中的重要性。