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1.
基于CDDP标记铁皮石斛抗性种质筛选与多样性研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
吴永辉  张君毅  司灿  林清郁 《中草药》2017,48(22):4748-4754
目的利用CDDP标记技术对43份铁皮石斛Dendrobium officinale野生和栽培种质进行初步抗性筛选和遗传多样性分析,为铁皮石斛产业以及优良品种筛选保护提供理论基础。方法从21条CDDP引物中筛选出产物清晰、多态性好的引物对供试材料基因组DNA进行扩增。结果 16条引物共扩增出了151条带,其中多态性条带144条,多态性比率95.7%,表明供试材料具有丰富的遗传多样性。种群遗传多样性结果表明,3个种群多态性位点比例(PPL)为65.56%~82.12%,种群间基因分化系数(Gst)为0.110 2,基因流(Nm)为4.035 4,说明人为选择亦可能促进铁皮石斛的遗传多样性。结论铁皮石斛人工栽培种具有丰富的遗传多样性,同时统计结果分析表明,43份材料中可以初步筛选出8份具有潜在优良抗性的植株。  相似文献   

2.
不同产地连翘的DNA指纹图谱构建与聚类分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
吴婷  魏珊  米丽华  李敏  张淑蓉 《中草药》2016,47(5):816-820
目的以不同产地的14批连翘Forsythia suspensa为材料,运用RAPD技术对其进行遗传多样性研究并构建DNA指纹图谱。方法采用RAPD技术,从45条RAPD随机引物中进行筛选,以14批连翘进行DNA指纹图谱的分析研究。结果从45条RAPD随机引物中筛选出11条多态性好的引物,利用这11条RAPD引物进行PCR扩增,共获得80条谱带,平均每个引物扩增出7.27条谱带,其中多态性谱带67条,多态性条带比率为83.8%,是连翘药材资源研究的一种有效分子标记。14批连翘药材间的遗传相似系数(genetic similarity,GS)在0.487 5~0.962 5,表明遗传多样性比较丰富。聚类结果显示遗传多样性与连翘药材来源地有明显的相关性,而且与其亲缘关系较近有关,符合植物种群分布的一般规律。结论以14批不同产地连翘药材资源的RAPD扩增谱带为基础,构建连翘药材资源的DNA指纹图谱并进行聚类分析。  相似文献   

3.
《中药材》2019,(2)
目的:采用RAPD技术对不同来源的25个无花果栽培品系进行种质资源亲缘关系分析,并从分子水平加以分类,为进一步构建无花果DNA指纹图谱和品种性状改良奠定基础。方法:以25种无花果叶片为材料提取其基因组DNA,采用40条随机引物对其进行RAPD扩增。利用DPS v7.5软件计算遗传距离,利用UPGMA方法进行聚类分析。结果:40条引物共扩增出257条带,其中139条为多态性条带,多态位点率为54.1%。遗传距离变化范围在0.025~0.874,平均为0.449。在遗传距离为0.83时,可将25个无花果品系分为2大类:布兰瑞克为一类;其他24个品系聚为一类。大多数品系均聚集在遗传距离小于0.17的范围内。同时利用RAPD分子标记鉴别出了7、18、23号无花果。结论:25个无花果品系间遗传多样性较低,种群间相关性较强。  相似文献   

4.
不同产地石斛属种质资源的ISSR遗传多样性分析   总被引:3,自引:2,他引:1  
目的 对24份不同产地石斛属样品的遗传多样性和亲缘关系进行分析.方法 采用ISSR分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对24份石斛属样品进行遗传多样性和聚类分析.结果 从100条ISSR引物中共筛选出6条多态性稳定、清晰的引物,24份石斛样品共扩增出847个DNA片段,平均每个引物扩增出141个DNA片段,其多态性为100%.结论 24份不同产地石斛样品被划分为6个类群,遗传多样性非常丰富.  相似文献   

5.
《中药材》2016,(7)
目的:研究药用真菌蛹虫草的种质资源遗传多样性。方法:采用非加权平均距离聚类法(UPGMA)结合主坐标分析法(PCoA)对27株不同来源的蛹虫草菌株的SCoT分子标记条带进行研究。结果:从36个引物中筛选出8条重复性好、条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出59条条带,其中55条具有多态性,多态性比率为94.33%,平均多态性条带数为6.875。经NTSYSpc软件分析,27株蛹虫草菌株间的遗传相似系数在0.383~0.933之间,说明SCoT标记能够揭示蛹虫草种质间较高的遗传多样性。通过UPGMA法和PCoA法分析,27株蛹虫草分别分成6组和3组,菌株的遗传多样性与其来源有一定的相关性。结论:SCoT分子标记适用于药用真菌蛹虫草种质资源的多样性研究。  相似文献   

6.
目的对白及遗传多样性进行ISSR分析。方法以全国50批不同产地来源的白及为实验材料,采用ISSR分子标记方法进行各材料间的遗传距离分析。结果 10个ISSR引物共扩增出117个条带,平均每个引物产生11.7个条带,其中多态性条带111条,平均多态性百分率为94.9%。通过聚类分析,50份白及样品在遗传系数0.57的水平上共聚类为2大类群。结论不同产地的白及具有较丰富的遗传多样性,ISSR可有效应用于白及的遗传多样性研究。  相似文献   

7.
野生白及资源遗传多样性的SRAP分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
洪建聪  郭艳  翟利娜  陈铌铍  丁志山  金波 《中草药》2019,50(8):1966-1971
目的对不同来源的野生白及遗传多样性进行分析,为白及种质的选育、保护和开发提供参考。方法以全国不同地区的50份野生白及样品为材料,利用序列相关多态性扩增(SRAP)分子标记技术进行遗传多样性分析,使用UPGMA法进行白及亲缘关系的聚类分析。结果利用筛选出的15对SRAP引物组合,50份样品扩增获得共117个条带,平均每个引物产生7.8个条带,其中多态性条带106条,多态性比率为90.60%。聚类结果表明供试50份白及样品的遗传相似系数为0.59~0.87,以遗传系数0.66为基准可以分成6大类。遗传距离最近的2份紫花白及分别来自云南丽江市2号和湖北京山县2号,其遗传距离与地理距离无直接关联。结论野生白及资源间存在较丰富的遗传多样性,且地理距离与遗传距离并无直接关联,SRAP技术可为白及的资源保护、品种选育提供理论依据,为白及后续开发利用提供参考。  相似文献   

8.
佛手种质资源遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 研究佛手种质资源多样性和遗传关系.方法 采用随机扩增多态性随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了佛手13份种质材料的亲缘关系.结果 从110条引物中筛选出16条多态性高的引物,共扩增出185条DNA带,其中多态性带有168条,多态率为90.8%.通过聚类分析,在相似系数0.67的水平上将13份材料分为3类.结论 佛手种质间存在较丰富的遗传多样性,聚类结果与以产地为依据对佛手进行品种类群划分较为一致.  相似文献   

9.
李华  史美荣  肖娅萍 《中草药》2015,46(11):1666-1672
目的研究绞股蓝Gynostemma pentaphyllun种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法采用ISSR分子标记技术对来自全国12个省市不同生态环境的48份绞股蓝种质材料进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果 100条ISSR引物中共筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好且多态性明显的引物,48份材料DNA扩增共获得214个位点,其中多态位点206个,多态性比率(PPL)96.26%,平均每条引物扩增位点为14.27个;平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon多样性信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)分别为1.962 6、1.335 8、0.221 1和0.359 8;种质材料间的遗传相似系数变幅为0.57~0.96,平均为0.72。利用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.71为界,48份材料聚为4大类。结论绞股蓝种质材料间的遗传多样性较高,种质间的亲缘关系与其地理分布和生态环境并不完全一致。  相似文献   

10.
基于RAPD的青天葵遗传多样性及鉴别研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 建立及优化青天葵样品总DNA的提取方法及RAPD反应,探讨不同品种的青天葵及其替代品、伪品在DNA分子水平上的遗传多样性及其遗传关系.方法 使用高盐低pH值法提取总DNA,采用随机扩增多态性DNA,从49条随机引物中筛选能扩出清晰条带的引物,对22个青天葵样品及伪品进行RAPD分析.用统计分析软件对扩增出的条带进行聚类分析,以Shonnon's指数和Nei's指数对青天葵遗传多样性进行估算.结果 高盐低pH值法提取的新鲜样品纯度高,药材纯度低,但都能用于RAPD.选取能扩增出清晰条带的19条引物,把鲜品与干品分别聚类分析.干药材中小叶与中叶距离较近,与大叶及毛叶距离远.新鲜叶片中三种青天葵为一类,青天葵与其组培品、毛叶与红薯叶距离稍远,与车前草、积雪草距离最远.青天葵种群遗传多样性Shonnon's指数为0.463,Nei's指数为0.267,种群内遗传多样性较高,基因流为0.94.结论 不同品种青天葵间及伪品在分子水平上存在差异,可用此方法鉴别青天葵.青天葵的遗传多样性大多是由地理环境造成的.  相似文献   

11.
不同种源黄芩的RAPD分析   总被引:12,自引:1,他引:12  
目的:探讨黄芩不同种源的遗传多样性和亲缘关系,为黄芩育种提供依据。方法:采用14个10碱基随机引物,利用SPSS 10.0软件中的Within-groups linkage方法,对34个黄芩不同种源进行RAPD分析。结果:从115个引物中筛选出14个条带清晰、多态性明显并且重复性好的引物用于实验和统计分析,14个引物共扩出165个DNA片段,多态性DNA片段132个,占总扩增数的80.0%。34个黄芩种源可明显聚为A,B,C,D等4大类。结论:不同种源黄芩间具有丰富的遗传多样性;山东蒙阴3、山东蒙阴2、山东平邑种源间的遗传距离(0.315)较近,可考虑在黄芩系统选育中作为单一品种育种;黄芩种源间的遗传背景较为复杂,在遗传学上的分析结果与其外观形态大体上相似,但是与地理分布却没有一定的相关性,提示在黄芩良种选育过程中必须加强优良种子的选育和管理。  相似文献   

12.
分析中药黄芩道地性与遗传多样性。方法:用随机扩增的DNA多态性分析(RAPD)方法,对13个居群62个黄芩Scutellariabaicalensis和并头黄芩S.scordifolia样本,进行遗传多样性及黄芩居群遗传变异测定。结果:用14个随机引物,共获得114个条带,其中多态性条带112条。黄芩在物种水平上的多态性条带比率(PPB)值为95.5%,居群水平的平均PPB值为41.9%。黄芩样本RAPD聚类分析(UPGMA)没有表现出明显的分支,但显示出与地理位置有关三个类群。分子方差分析(AMOVA)显示,黄芩居群间的遗传变异占总变异的18.83%,居群内变异占81.17%。结论:首次在分子水平上证明黄芩道地性与遗传变异和地理环境有关系,并提出黄芩栽培选种的策略应该是最大限度地保持其遗传多样性。  相似文献   

13.
黄芩种群遗传多样性初步研究   总被引:15,自引:0,他引:15  
分析中药黄芩道地性与遗传多样性。方法:用随机扩增的DNA多态性分析(RAPD)方法,对13个居群62个黄芩Scutellaria baicalensis和并头黄芩S.scordifolia样本,进行遗传多样必琢黄芩居群遗传变异测定。结果:用14个随机引物,共获得114个条带,其中多态性条带112条。黄芩在物种水平上的多态性条带比率(PPB)值为95.5%,居群水平的平均PPB值为41.9%,黄芩样本RAPD聚类分析(UPGMA)没有表现出明显的分支,但显示出与地理位置有关三个类群。分子方差分析(AMOVA)显示,黄芩居群间的遗传变异占总变异的18.83%,居群内变异占81.17%。结论:首次在分子水平上证明黄芩地性与遗传变异和地理环境有关系,并提出黄芩栽培选种的策略应该是最大限度地保持其遗传多样性。  相似文献   

14.
目的:为了更好的保护利用黄芪资源,本研究试图开发出准确可靠、快速稳定的分子标记用于黄芪药材的研究及鉴定。方法:本研究以15份黄芪的基因组DNA为模板,进行随机扩增多态DNA(RAPD)扩增,筛选差异条带并回收、克隆和测序,根据差异条带的测序结果设计特异性SCAR引物。结果:成功获得了5个SCAR标记,SCAR引物在黄芪样品中的扩增结果表明,相对于RAPD标记,其多态信息含量降低,但标记的稳定性、特异性增高。结论:因此认为可以通过RAPD转化为SCAR标记的方法,大量开发这一特异性分子标记,为黄芪资源的遗传多样性研究、鉴定技术以及遗传图谱的构建奠定物质基础。  相似文献   

15.
HPLC法测定草豆蔻中小豆蔻明   总被引:2,自引:0,他引:2  
谭洁珍  李杰明 《中草药》2006,37(1):133-134
草豆蔻为姜科植物草豆蔻A lp in ia katsum ad a iH ayata的干燥近成熟种子。气香,味辛、微苦,性温。归脾、胃经。具燥湿健脾、温胃止呕功效。用于治疗寒湿内阻、脘腹胀满冷痛、嗳气呕逆、不思饮食[1]。种子含黄酮类化合物:小豆蔻明(cardam om in)、山姜素(alp inetin)、鼠李柠  相似文献   

16.
不同薯蓣皂苷元的盾叶薯蓣遗传关系的RAPD分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
薛焱  秦天才  张友德 《中草药》2006,37(1):115-118
目的从DNA水平分析鉴定不同薯蓣皂苷元盾叶薯蓣的遗传关系。方法从40个10 bp随机引物中筛选出12个引物,进行RAPD分析,应用POPGENE 1.31软件对扩增结果进行聚类分析。结果共扩增出73条DNA片段,其中多态性片段64条,占87.67%,盾叶薯蓣类型间具有明显的多态性差异。结论DNA分子多样性差异与薯蓣皂苷元量差异具有相关性,说明盾叶薯蓣的遗传基础可能对薯蓣皂苷元的形成和积累有显著的影响。  相似文献   

17.
基于药材性状特征和ISSR分子标记技术对7个地区的黑三棱科植物黑三棱进行测量比较及遗传多样性分析,针对湖南三棱建立分子鉴别方法。通过测量各产地三棱药材的质量、长度、宽度和厚度指标,分析三棱药材产地间差异。通过筛选扩增条带清晰、多态性丰富的ISSR引物,构建各产地三棱聚类树状图,分析不同产地三棱遗传多样性,筛选出目标引物并测序特异性片段。从ISSR引物中筛选出9条扩增条带清晰、多态性丰富的引物,扩增出73条清晰的谱带,平均每个引物扩增出8.0条,其中多态性条带38条,多态性比例为52.8%。聚类树状图显示样品间遗传相似系数为0.54~0.94,其中浙赣皖地区的三棱之间的遗传相似性系数较大,差异较小。湖南三棱药材性状特征相比其他产地三棱具有较明显差异,且遗传距离相对较远。筛选获得湖南三棱中扩增出特异性条带(327 bp)的引物ISSR-857,并对扩增得到的特异性片段进行测序,经BLASTn比对后,与该基因片段相似的序列较少,且与植物性状生长过程相关性不大。ISSR分子标记技术为湖南三棱的鉴别方法提供了新思路和方法参考,也佐证了"荆三棱"的产地特殊性。  相似文献   

18.
霍山石斛种内遗传稳定性的RAPD初探   总被引:6,自引:0,他引:6  
目的 研究霍山石斛荚果内遗传稳定性及荚果间的差异大小。方法 利用从20个随机引物筛选出来的3个稳定性较好的10碱基引物对来自5个不同荚果的霍山石斛种群进行RAPD检测。结果 5个荚果内遗传相似系数较大,在92.5926%-100.00%,其中H1、H9、H10、H14存在一定程度的变异,H23是一个较为稳定的群体;5个荚果间H1、H9、H10、H23的遗传距离较小,H14与其他4个荚果的遗传距离则较大。结论 建立霍山石斛稳定的无性快繁体系是切实可行的,同时说明霍山石斛种内存在一定的变异,H14与其他荚果的差异最大。  相似文献   

19.
Based on the use of Scutellaria baicalensis for the treatment of stroke in traditional Oriental medicine, the current study was carried out to evaluate neuroprotective effects of S. baicalensis after transient global ischemia using rat 4-vessel occlusion model. Methanol extracts from the dried roots of S. baicalensis (0.1-10 mg/kg) administered intra-peritoneally significantly protected CA1 neurons against 10 min transient forebrain ischemia as demonstrated by measuring the density of neuronal cells stained with Cresyl violet. Methanol extract of S. baicalensis inhibited microglial tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) and nitric oxide production, and protected PC12 cells from hydrogen peroxide-induced toxicity in vitro.  相似文献   

20.
半夏与其伪品掌叶半夏的RAPD鉴别   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的建立半夏及其伪品掌叶半夏的快速简单的分子鉴定方法。方法 SDS法提取半夏和掌叶半夏的基因组DNA,20个10碱基随机引物(S1-S20,上海生工)用于RAPD-PCR分析。结果 20个引物中有7个有效稳定的引物在半夏和掌叶半夏之间能显示出多态性指纹图谱,其中S10和S17在半夏和掌叶半夏之间显示较大差异。结论利用引物S10和S17进行RAPD-PCR能有效鉴别半夏和掌叶半夏。  相似文献   

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