基于网络药理学的逍遥散治疗痤疮的作用机制

目的：通过网络药理学方法探究逍遥散治疗痤疮的主要活性成分及其作用机制。方法：应用中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）筛选逍遥散中含有的有效成分及其作用靶标,并从基因表达综合数据库（GEO）中提取痤疮相关靶标。使用Cytoscape软件及其bisogenet插件构建逍遥散治疗痤疮的“化合物-靶点”网络,并绘制药物活性成分-靶蛋白-疾病蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,再分次进行拓扑分析,得出核心网络。采用R语言软件中ClusterProfiler数据包对逍遥散的潜在作用基因靶点进行基因本体（Gene Ontology,GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析,并进行可视化作图。结果：通过TCMSP,获得了逍遥散有效活性成分161个,潜在作用靶点2 619个,与146个痤疮相关靶点的共同靶点为37个,包括PTGS2、CCNA2、CHEK1、NR3C2等,潜在活性成分为木犀草素、槲皮素、异鼠李素等110个。GO和KEGG富集分析结果显示,逍遥散治疗痤疮主要通过脂多糖应答、细菌源性分子应答等作用机制,与肿瘤坏死因子信号通路、IL-17信号通路、P53信号通路、核因子κB信号通路等相关。结论：本研究通过网络药理学的方法验证了逍遥散治疗痤疮的多成分、多靶点、多通路的作用机制特点,简单阐述了逍遥散治疗痤疮潜在有效成分及作用通路,为后续的相关研究提供理论支持。     

基于网络药理学的茵陈五苓散防治肝纤维化机制研究

目的:通过网络药理学方法探索茵陈五苓散防治肝纤维化的作用机制。方法:通过TCMSP数据库检索茵陈五苓散的主要活性成分;通过检索CTD数据库选肝纤维化的疾病靶点;匹配药物-疾病靶点,应用Cytoscape软件构建中药-成分-靶点网络;运用STRING软件构建蛋白质互作用(PPI)网络,并将结果可视化;使用DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路分析。结果:获取茵陈五苓散防治肝纤维化主要活性成分46个,作用靶点84个;网络数据表明,茵陈的活性成分具有最大的总度值;GO功能富集分析和KEGG通路分析获取GO条目35个,信号通路14条。结论:茵陈五苓散可能是通过Fc epsilon RI等信号通路调控IL6、TNF与PTGS2等靶点减轻炎性反应并减少细胞外基质沉积发挥抗肝纤维化作用的,而中药茵陈与活性成分槲皮素可能在这之中发挥主要作用。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗类风湿关节炎合并肺间质纤维化的作用机制

目的基于网络药理学探讨黄芪治疗类风湿关节炎合并肺间质纤维化的潜在作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选出黄芪中的潜在活性成分,整合TCMSP数据库、靶点预测网站(Swiss Target Prediction)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GCBI文献数据库和人类基因数据库(Genecards),预测和筛选其治疗类风湿关节炎合并肺间质纤维化的作用靶点,运用韦恩图(Venny 2.1.0)对药物靶点和疾病靶点进行匹配。通过Systems Dock Web Site对主要活性成分和作用靶点进行分子对接验证。运用String数据库和Cytoscape软件构建绘制蛋白质相互作用网络,并用DisGeNET数据库对作用靶点进行类型归属。采用DAVID数据库对黄芪核心作用靶点进行生物功能和代谢通路分析,借助Cytoscape软件构建"药物-活性成分-核心靶点-通路-疾病"网络。结果筛选得到黄芪25个潜在活性成分,涉及9个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分有3个,主要通过调控TNF、NF-κB、MAPK、Toll样受体、TGF-β信号通路发挥治疗作用。结论黄芪对类风湿关节炎合并肺间质纤维化的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其治疗类风湿关节炎合并肺间质纤维化的作用机制提供了科学依据。     

基于网络药理学-分子对接研究乳香-没药配伍改善类风湿性关节炎的作用机制

应用网络药理学方法及分子对接技术,探讨乳香-没药配伍有效成分对应靶基因及治疗类风湿性关节炎(RA)可能的作用机制。基于文献研究并结合相关中药系统药理数据库和文献检索筛选得到乳香-没药主要有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库对活性成分进行靶标预测。同时通过DrugBank, GeneCards及Therapeutic Target Database(TTD)数据库收集RA相关靶标,并利用VENNY 2.1取交集靶标在线绘制药物与疾病共同靶标的韦恩图。运用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络图,根据相互关系大小筛选核心靶标。利用Cytoscape 3.6.0软件构建"中药-成分-靶点""中药-成分-靶点-疾病"网络模型和核心靶标相互作用网络模型。运用DAVID 6.8在线数据库对交集靶点进行基因GO功能分析和KEGG通路富集分析,Pathon将其可视化;最后运用AutoDock Vina和Pymol将得到的核心有效成分与核心靶标进行分子对接。结果收集乳香-没药药对中16个活性成分,得到相关潜在靶点320个,RA相关靶点468个,通过韦恩图得到交集靶点62个。主要作用于IL6,TNF,IL1B,MAPK1等多个靶标,涉及TNF信号通路和Toll样受体信号通路以发挥治疗RA作用。该实验基于网络药理学和分子对接方法,对乳香-没药配伍治疗RA可能的靶标和信号通路进行探讨,并对核心靶标与核心活性成分进行分子对接,为乳香-没药配伍作用机制的研究提供了科学依据。     

二至丸抗肝纤维化活性成分-靶点-通路的网络预测

目的:筛选二至丸抗肝纤维化主要活性成分,预测其抗肝纤维化的作用靶点及信号通路。方法:利用ADME计算方法,并依据中药系统药理学技术平台(TCMSP)等数据库、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)预测二至丸的活性成分及抗肝纤维化的潜在靶点,通过与人类基因组注释数据库(Gene Cards)中抗肝纤维化的作用靶点进行映射,筛选出二至丸抗肝纤维化的作用靶点。借助Cytoscape 3.5.1软件构建二至丸活性成分-作用靶点网络,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点进行基因本体(GO)生物过程及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路富集分析。结果:从二至丸中筛选得到18个活性成分,作用于114个靶点,主要涉及8个信号通路,参与10个生物过程。结论:二至丸活性成分主要通过转化生长因子-β(TGF-β),丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),磷酸肌醇-3激酶(PI3K)/丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt)信号通路(PI3K/Akt),核转录因子-κB(NF-κB),过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)等信号通路以及蛋白磷酸化、信号转导等生物过程发挥抗肝纤维化作用,体现了中药多成分、多靶点、多途径的作用特点,该研究为进一步深入开展二至丸抗肝纤维化药效基础研究和阐释其抗肝纤维化的作用机制提供理论依据。     

基于网络药理学和分子对接研究红花治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的:运用网络药理学和分子对接的方法研究红花治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法:通过查阅文献和数据库获取红花的有效药物成分,利用数据库预测红花的成分靶点与AD的靶点,并对红花靶标基因进行标准化。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“红花-成分-靶点”网络,利用红花的靶标基因与AD的靶标基因的交集基因构建蛋白相互作用(PPI)网络。通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG富集分析,最后利用Ledock软件对关键成分与核心靶点进行分子对接。结果:获得21种红花有效成分和391个作用靶点,AD的疾病靶点535个,其中红花与AD的共同作用靶点有94个。共得到535个GO分析,43个KEGG通路,主要涉及阿尔茨海默病信号通路、ErbB信号通路、5-羟色胺能突触、癌症中的蛋白多糖等;分子对接结果显示,核心成分与关键靶点具有良好的结合能力。结论:红花治疗由微循环障碍引起的AD的潜在作用机制,且具有多成分、多靶点、多通路的特点。     

基于网络药理学探讨赤芍抗血吸虫病及肝纤维化的作用机制

目的：通过网络药理学方法探讨赤芍有效成分治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库检索并收集赤芍有效成分及其对应的作用靶点，借助UniProt数据库将靶点蛋白的genename转换为genesymbol;通过GeneCards、OMIM、TTD疾病数据库搜集血吸虫病及肝纤维化相关靶点；将赤芍成分靶点和疾病靶点取交集，获得赤芍治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在靶点，利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”和“成分-靶点-通路”网络；通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析，采用Cytoscape 3.8.2软件进行分析和可视化呈现；通过Metascape数据库进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：筛选得到赤芍活性成分29种，成分靶点与血吸虫病及肝纤维化疾病的交集靶点19个，其中肿瘤抑制蛋白(TP53)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素8...     

正源方抗肝纤维化的网络药理学预测分析及实验验证

目的:基于网络药理学、分子对接技术预测正源方抗肝纤维化的作用机制,并进行细胞水平实验验证。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献检索获得正源方活性成分,通过PubChem、SwissTargetPrediction、Similarity Ensemble Approach数据库筛选活性成分潜在靶点,通过OMIM、GeneCards疾病数据库收集肝纤维化的相关靶点,运用Venny平台获得正源方与肝纤维化交集靶点,利用String数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过Cytoscape-CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点,利用String数据库进行基因本体功能注释(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-通路网络,使用AutoDock Vina软件模拟关键候选活性成分与核心基因的结合活性。建立人转化生长因子-β1(TGF-β1)诱导的人肝星状细胞LX2活化模型,噻唑蓝(MTT)比色法检测细胞活性,蛋白免疫印迹法(WB)检测磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路相关蛋白表达。结果:网络药理学筛选得到正源方活性成分145个及相关靶点1109个,肝纤维化靶点1573个,正源方抗肝纤维化潜在作用靶点415个,拓扑分析得关键靶点61个;PPI网络分析核心靶点为Akt1、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)等,GO富集分析得到1753个条目,其功能主要与细胞凋亡、细胞增殖、酶结合等有关;KEGG富集分析得到174个条目,主要涉及癌症通路、PI3K-Akt通路、细胞凋亡通路等;分子对接显示,槲皮素、木犀草素、熊果酸等与Akt1、VEGFA、Jun原癌基因(JUN)等靶点结合活性较强;细胞实验结果表明,不同剂量的正源方给药后,可以显著抑制TGF-β1诱导的LX2细胞的活化,降低磷酸化PI3K(p-PI3K)/PI3K、磷酸化Akt(p-Akt)/Akt蛋白表达,且具有质量浓度依赖性。结论:正源方可能通过多靶点、多通路发挥抗肝纤维化作用,其机制可能与抑制肝星状细胞活化、调控PI3K-Akt信号通路有关。     

基于网络药理学研究鳖甲煎丸抗肝纤维化的作用机制

目的基于网络药理学研究鳖甲煎丸抗肝纤维化的作用机制。方法利用TCMSP、CTD、CNKI数据库获取鳖甲煎丸的主要化学成分及其对应靶点,Uniprot数据库将其转化为标准基因。通过CoolGene、GeneCards数据库获取肝纤维化相关靶点,将鳖甲煎丸成分靶点与疾病靶点进行匹配映射得到鳖甲煎丸抗肝纤维化的关键靶点。利用STRING网站获得关键靶点的PPI网络图,DAIVID数据库进行GO富集分析与KEGG信号通路分析,Cytoscape软件构建成分-靶点网络、疾病-中药-成分-靶点网络,计算网络拓扑参数。通过Systems Dock Web Site软件,将鳖甲煎丸核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果鳖甲煎丸治疗肝纤维化的关键成分有78种,包括β-谷甾醇、槲皮素、山柰酚等;关键靶点有80个,包括STAT3、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)等。通过富集分析,得到丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、TNF及磷脂酰肌醇-3-激酶-Akt(PI3K-Akt)等107条信号通路。结论鳖甲煎丸可通过多成分-多靶点-多途径来发挥抗肝纤维化的整体作用。     

基于网络药理学探讨丹参治疗肝纤维化的作用机制

目的 采用网络药理学技术筛选丹参治疗肝纤维化的作用靶点,并探讨其治疗肝纤维化的作用机制.方法利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选丹参的主要活性成分及相应靶点,并检索OMIM、Genecard数据库以筛选肝纤维化的作用靶点.基于筛选结果,建立药物成分-靶点基因-疾病关系网络,进行基因GO功能和KEGG通路富集,以分析丹参治疗肝纤维化可能的作用机制.结果 筛选出丹参主要化学成分65个,与肝纤维化相关靶点93个,关键靶点涉及AKT1、IL-6、VEGFA、EGFR、FOS等.基因GO分析提示丹参的活性主要涉及泛素-蛋白质连接酶结合、酰胺结合、细胞因子受体结合等生物学过程.KEGG富集通路提示丹参治疗肝纤维化可能涉及PI3K-AKT信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路等.结论 通过网络药理学初步探究丹参治疗肝纤维化的作用机制,结果揭示丹参可能通过细胞增殖、凋亡、炎症等途径对肝纤维化发挥治疗作用,从而有效抑制肝纤维化的发展.     

大黄附子汤作用机制的靶标与通路探讨

目的:通过系统药理学方法探讨大黄附子汤的作用机制及原理。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库提取大黄附子汤中的活性成分和有关的靶标蛋白,通过运用软件Cytoscape 3. 5. 1构筑大黄附子汤有效成分与靶标关系网络进行拓扑学分析,使用STRING数据库进行蛋白之间相互作用(PPI)网络的构筑与分析,借助David数据库进行KEGG通路功能富集分析。结果:大黄附子汤的核心化合物有山奈酚(kaempferol)等,重要的靶标有前列腺素G/H合成酶2(Prostaglandin G/H synthase2)等,大黄附子汤有效成分中关键蛋白主要有JUN、RELA、TP53、CYP1A1、MAPK1等,KEGG结果表明大黄附子汤主要作用于化学致癌、细胞色素P450及视黄醇代谢等相关信号通路。结论:大黄附子汤主要通过多种途径、多种信号通路作用于多种靶点发挥抗炎、抗癌及治疗功能性便秘等作用。     

网络药理学指导下的疏肝健脾饮治疗乳腺癌作用机制探讨

目的:运用网络药理学方法建立疏肝健脾饮活性成分-作用靶点网络,明确靶点相应的生物功能和作用通路,探讨其与乳腺癌之间相互作用途径,并通过实验验证其正确性。方法:运用TCMSP(中药系统药理学数据库和分析平台)、知网收集疏肝健脾饮组成药物柴胡、薏苡仁、莪术、青皮、茯苓的主要成分及药物潜在作用靶点,并用Cytoscape软件将疏肝健脾饮成分-作用靶点网络可视化,于药物数据库DRUGBANK、OMIO中获取乳腺癌相对应的靶标基因,将两者靶点进行匹配,得到疏肝健脾饮活性成分治疗乳腺癌潜在作用靶点。利用STRING数据库获取蛋白质间相互作用网络,信息导入Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,借助DAVID在线工具进行疾病药物交集靶基因的基因本体论(GO)分析和KEGG通路富集分析。通过Western blot对HER-2指标进行检测以验证结果的准确性。结果:疏肝健脾饮中柴胡、薏苡仁、莪术、青皮、茯苓活性成分49个,潜在靶标553个,乳腺癌靶标157个,疏肝健脾饮靶标基因与乳腺癌疾病靶标基因的交集基因有17个。GO分析结果显示,生物功能包括性生殖结构发展、调节细胞蛋白质代谢过程、运动的积极调节、对药物的反应、调节RNA代谢过程、DNA依赖性的转录调节、细胞内受体介导的信号通路、调节蛋白质氨基酸磷酸化、调节细胞增殖。信号通路富集结果显示,疏肝健脾饮与乳腺癌交集靶基因的网络主要涉及癌症的途径、粘着力、非小细胞肺癌、ErbB信号通路、结直肠癌、前列腺癌、膀胱癌。其中与乳腺癌相关的主要通路为ErbB信号通路。Western blot结果示疏肝健脾饮能抑制荷瘤祼鼠乳腺癌组织中HER-2蛋白表达,且作用与他莫昔芬相当。结论:疏肝健脾饮治疗乳腺癌是多成分、多靶点共同作用于ErbB信号通路,抑制HER-2表达,从而降低乳腺癌细胞增殖,干预乳腺癌发展。     

基于网络药理学探讨桔梗-苦杏仁与肺癌相关分子机制

目的:基于网络药理学方法筛选桔梗-苦杏仁药对中的活性成分,预测治疗癌症的作用靶点及信号通路,构建多成分-多靶点-多通路的相互作用网络,进一步探究其治疗肺癌的可能作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)以及文献查阅,检索并收集桔梗-苦杏仁的活性成分及其对应的靶标。利用UniProt数据库和Genecards数据库获得桔梗-苦杏仁治疗肺癌的潜在靶标基因。用Cytoscape 3.6.0软件构建"成分-靶标"网络。结合String数据库及Cytoscape软件中的Generate style from statistics工具,构建蛋白质相互作用网络。通过Systems Dock Web Site网络服务器与桔梗-苦杏仁的活性成分进行分子对接。利用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库,对桔梗-苦杏仁的作用靶标进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体(GO)分类富集分析。结果:共筛选得到桔梗-苦杏仁的14个活性成分,包括acacetin,cis-dihydroquercetin,spinasterol,licochalcone B,luteolin等,和103个作用靶标,包括诱导型一氧化氮合酶蛋白(NOS2),环加氧酶1蛋白(PTGS1),雄激素受体(AR),环加氧酶2蛋白(PTGS2),二肽基肽酶4(DPP4)等,主要涉及prostate cancer,small cell lung cancer,hepatitis B,T cell receptor signaling pathway等信号通路。结论:该研究基于网络药理学的方法预测了桔梗-苦杏仁治疗肺癌的可能的作用机制,为后续的深入研究提供了方向。     

逍遥散“异病同治”抑郁症和糖尿病的网络药理学作用机制研究

目的构建逍遥散单味药-成分-共有靶点网络、蛋白相互作用网络,探究逍遥散"异病同治"抑郁症和糖尿病的共同作用机制。方法通过TCMdatabase@Taiwan、TCMID、Batman-TCM数据库结合文献挖掘获取逍遥散的化学成分和作用靶点,结合CTD、TTD、Pharm GKB、OMIM、Gencards、Drugbank数据库获取逍遥散治疗抑郁症和糖尿病的作用靶点。采用Cytoscape软件绘制单味药-成分-共有靶点网络。采用Metascape工具对逍遥散治疗抑郁症和糖尿病的共有靶点进行GO生物过程分析、Reactome通路分析、KEGG通路分析、蛋白相互作用网络构建和模块分析。分别采用Bio GPS、Genecards分析通路关键靶点的组织分布和亚细胞分布,并采用Cytoscape软件绘制组织-靶点、亚细胞-靶点网络。采用Dis Ge NET数据库对通路关键靶点进行蛋白归属。结果逍遥散治疗糖尿病和抑郁症共病涉及免疫炎症反应,与G蛋白偶联受体、胰岛素及其受体、单胺类神经递质相关,通过调节环磷酸腺苷(c AMP)信号通路、钙信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等实现。结论逍遥散治疗抑郁症和糖尿病共病的作用机制涉及脑源性神经营养因子(BDNF)相关信号通路、G蛋白偶联受体、单胺类神经递质、胰岛素及其受体等调节过程,可为深入阐释逍遥散抗抑郁作用特点及其药理机制提供依据。     

基于整合药理学平台莪术-冬凌草药对抗癌的分子作用机制

目的:基于整合药理学方法,筛选莪术-冬凌草药对抗癌的有效活性成分,并探讨其分子作用机制。方法:使用中医药整合药理学研究平台V2. 0分别筛选莪术和冬凌草的活性成分,使用数据库中疾病相关分子库收集癌症相关靶点,使用VENNY 2. 1平台匹配药物和疾病靶点。使用STRING数据库构建药对靶标-疾病靶标相互作用的核心靶点网络图。使用DAVID 6. 8数据库分析核心靶标的GO生物学过程和KEGG通路数据。使用数据库中药成分数据库分析药物核心成分ADMET性质。结果:筛选后共收集了174个药物活性成分,共涉及246个靶标,并获得核心靶标191个,取前100个靶标进行分析,结果显示,核心靶标主要作用于细胞代谢、调控、传导等生物过程,富集于癌症、IL-17、TNF、雌激素等信号通路。多维网络和ADMET性质分析显示,药物核心成分可能通过作用于原癌基因c-Abl、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、钙调蛋白1、细胞周期蛋白依赖性激酶6、核因子NF-kappa-B p105亚基和前列腺素G/H合酶2来参与癌症通路等信号通路,来发挥抗癌的作用。结论:莪术-冬凌草药对通过多靶点、多途径来发挥抗癌作用,为临床运用提供依据,也为其后续实验研究提供参考。     

杜仲治疗股骨头坏死分子机制的网络药理学研究

目的:基于中药网络药理学理论与生物信息学研究方法,探讨杜仲治疗股骨头坏死的潜在分子作用机制。方法:通过中药系统药理学成分分析平台BATMAN-TCM预测杜仲的活性成分及治疗作用靶点,与GeneCards、Gene、GAD等人类基因数据库获取的股骨头坏死作用靶点取交集,获得最终的靶标基因,通过STRING构建靶标基因间蛋白互作网络关系,采用Cytoscape软件构建杜仲活性成分-靶标基因网络、靶标基因互作网络,借助在线工具DAVID对靶标基因进行通路富集与基因本体论分析,筛选具有统计学差异的信号通路或生物学功能注释。结果:共获得杜仲苷、松脂醇、木黄酮等38个有效活性成分,其中异麦芽糖、咖啡酸二甲醚、灵猫酮等8个主要活性成分与TNF等17个股骨头坏死靶标基因直接联系。活性成分、靶标基因形成紧密联系的互作网络关系,靶标基因主要富集于酶结合、生长因子活性等14个基因本体论过程,以及凝血酶/蛋白酶激动受体等104个主要信号通路。结论:杜仲治疗股骨头坏死存在多成分、多靶点、多通路等特点,各活性成分、靶标基因存在一定协同调控或拮抗调控作用,主要涉及的骨代谢平衡、血管生成、炎症免疫调控等信号通路之间存在复杂相互作用,可能在股骨头局部、机体全身发挥调控作用。     

基于网络药理学和分子对接研究寿胎丸治疗复发性流产的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接方法探讨寿胎丸治疗复发性流产（RSA）的主要作用机制。方法：运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、BATMAN-TCM数据库检索寿胎丸所含主要的活性化学成分,并在TCMSP数据库中查询药物成分对应靶点,检索GeneGards数据库获得RSA相关靶点。运用R软件取药物与疾病靶点的交集制成韦恩图,再利用Cytoscape 3.7.2软件将药物-活性成分-靶点-疾病网络可视化,通过STRING数据库获得靶标蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。最后运用R软件对靶点基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：共得出主要活性成分21个,寿胎丸与RSA相关靶点共108个,通过GO分析得出133个功能条目,通过KEGG分析得出147条信号通路,涉及细胞因子受体结合、受体配体活动、泛素样蛋白连接酶结合等功能及AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化等通路。分子对接验证显示,寿胎丸的主要活性成分与RSA核心靶点具有较强的结合活性,为二者的相互作用提供了基础。结论：该研究利用网络药理学方法初步揭示了寿胎丸通过多成分、多靶点、多通路治疗RSA的作用机制,预测了寿胎丸可能通过TGF-β、PI3K/AKT、MAPK、JAK-STAT等通路保护妊娠,为进一步临床及实验研究提供了良好的理论依据。     

基于整合药理学探讨肾复康Ⅱ号胶囊治疗肾间质纤维化作用机制

目的:采用整合药理学的方法,对肾复康Ⅱ号胶囊治疗肾间质纤维化的作用机制进行探讨。方法:通过整合药理学平台对肾复康Ⅱ号胶囊化学成分及靶点进行收集,在Dis Ge NET、ETCM和Gene Cards数据库检索疾病靶点,进行靶标映射及KEGG通路富集分析,借助Cytoscape 软件构建肾复康Ⅱ号胶囊的药材-成分-靶点-通路网络并进行网络分析。结果:肾复康Ⅱ号胶囊挖掘到198个成分及1011个靶标,疾病相关靶点2117个,靶标映射后得到226个靶点,将226个药物和疾病共有靶标进行KEGG通路富集,得到20条重要通路。通过构建方剂-药材-成分-靶点-通路网络及网络分析,共获得37个关键成分,36个关键靶点。结论:肾复康Ⅱ号胶囊可能通过调节AR、NR3C1、NFKB1、AHR、VDR、ESR1、TNF、CASP3等靶点,调控PI3K-Akt信号通路、cAMP 信号通路、Rap1 信号通路、HIF-1 信号通路等。通过干预炎症反应、降低氧化应激、调节血压、血糖和血脂发挥对于肾间质纤维化的治疗作用。     

基于中医药整合药理学研究平台分析血府逐瘀汤治疗胰腺癌血瘀证的潜在活性成分及其作用机制

目的预测血府逐瘀汤治疗胰腺癌血瘀证的潜在活性成分并初步探讨其分子机制。方法利用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)数据库收集血府逐瘀汤的主要化学成分;利用中药靶标预测功能模块收集血府逐瘀汤的候选靶标谱;利用疾病数据库收集胰腺癌疾病基因集和血瘀证证候基因集;利用病证方关联分析模块构建"病-证-方"关联网络;利用Cytoscape软件绘制"成分-靶点-通路"网络图;利用蛋白互作网络分析数据库(STRING)构建蛋白相互作用(PPI)网络;利用生物学信息注释数据库(DAVID)进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;再利用AutoDock软件对主要成分和靶点进行分子对接验证。结果血府逐瘀汤治疗胰腺癌血瘀证的活性成分可能主要集中于柴胡、红花、牛膝、桔梗4味中药,主要通过40个化学成分、23个靶标、29条通路发挥其作用。结论血府逐瘀汤可能通过多种成分发挥治疗胰腺癌血瘀证的作用,通过影响MAPK3、CALM1、AKT1、HSP90AA1、CREB1等靶点,进一步影响肿瘤相关、代谢相关、免疫系统相关等通路。     

基于网络药理学的安肠愈疡汤治疗溃疡性结肠炎作用机制研究

目的基于网络药理学探讨安肠愈疡汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用机制。方法通过中医药整合药理学研究平台构建安肠愈疡汤的潜在靶标与UC疾病靶标之间的相互作用网络。基于GO数据库和KEGG通路数据库进行基因功能和通路富集,采用Cytoscape3.6.1软件构建靶标-信号通路网络、药物活性成分-靶标网络,采用荧光实时定量PCR对网络药理学主要分析结果进行验证。结果分析结果表明,安肠愈疡汤靶点主要关联UC炎症因子及免疫调控,糖类、脂质和氨基酸代谢,能量代谢,神经-内分泌系统调节等;体外实验提示,安肠愈疡汤参与调控GCK、CROT介导的糖脂代谢,GNB1介导的炎症通路,以及ATP1A1、COX7C介导的能量代谢、氧化磷酸化、线粒体电子呼吸链传递等通路。结论安肠愈疡汤治疗UC具有多成分、多靶点的特点,可为进一步研究其作用机制提供依据。