2004～2006年江西省甲3亚型流感疫苗预防效果的基因分析

[目的]了解江西省2004～2006年分离的甲3亚型流感病毒株HA1基因变异特征,分析WHO甲3亚型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感的预防效果. [方法]采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的H3型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit(Version5.0)、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析. [结果]21株甲3亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为960 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,平均点突变率为1.09%.2004年甲3亚型流感病毒分离株与当年WHO疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是97.8%～98.8%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为3.17个,但有毒株已出现在2个抗原决定簇区4个氢基酸替换.2005年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的甲3亚型流感上有良好的预防效果;对2006年度的甲3亚型流感预防效果不 够理想. 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的甲3亚型流感上有良好的预防效果;对2006年度的甲3亚型流感预防效果不 够理想. 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的     

1988-2005年甲3亚型流感流行株与疫苗株的HA1区差异探讨

目的 从基因层面探讨18年来我国及欧美国家甲3亚型流感流行株与当时WHO疫苗推荐株之间的差异。方法 收集1988—2005年间我国以及欧美国家的甲3亚型流感流行株与疫苗株的血凝素重链（HA1）区域的氨基酸序列，用BioEdit生物软件进行比较，分析其与当时疫苗推荐株在HA1以及HA1抗原决定簇区域的氨基酸差异。结果 在HA1区以及HA1区抗原决定簇位点，我国甲3亚型流感流行株与当年疫苗株之间的差异，均大于它与下一轮疫苗株之间的差异，且已达到十分显著的程度（P〈0．01）。而欧美国家甲3亚型流感流行株与当年疫苗株之间的差异，虽然稍大于它与下一轮疫苗株之间的差异，但尚不显著（P〉0．05）。此外，使用多年的疫苗株，无论在我国还是欧美，随着疫苗使用年数的增加，流行株与疫苗株之间的差异不断增大。结论 WHO推荐的甲3亚型疫苗株与我国甲3亚型流行株之间，从基因层面进行分析，存在明显的滞后现象。     

2008-2012年江西省甲型H3N2流感病毒HA1基因特征及与疫苗株差异分析

目的掌握2008-2012年江西省甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因特征,在分子水平了解WHO甲3型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感病毒预防效果。方法采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的甲3型流感病毒毒株进行核酸的提取,扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定并对HA1基因特性进行分析。结果 2008-2012年共分离到甲3型流感病毒553株,对其中23株毒株进行HA1基因序列测定,各年份的毒株HA1序列分别与当年WHO对北半球推荐的疫苗株进行比对,结果为2008-2012年氨基酸同源性分别为98.4%~99.1%、96.6%~98.4%、97.2%~98.4%、96.2%~97.2%和96.6%~98.1%;抗原决定簇区氨基酸平均变异数分别为1.3个、3.2个、1.4个、3个和2.5个;其中2009年有3株在2个抗原决定簇区发生了4~5个的氨基酸替换。结论2008-2012年甲型H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因在不断发生变异,疫苗对我省2008年度、2010年度和2012年度的甲型H3N2亚型流感保护效果良好,在2011年度保护效果存在滞后现象,对2009年甲型H3N2亚型流感保护效果较差。     

浙江省流行性感冒病毒分离株HA1基因分析

目的 研究浙江省近2年新分离的甲3型流行性感冒（流感）病毒株血凝素HA1基因特性，以了解浙江省流感病毒变异情况和WHO推荐疫苗株对人体的保护情况。方法 采集浙江省近2年类流感病人的咽拭子和含漱液标本进行流感病毒的分离，对分离到的甲3型流感病毒进行核酸的提取，采用逆转录一聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定，用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理，并与WHO推荐疫苗株进行比对。结果 近2年新分离到的甲3型流感病毒株HA，区域的核苷酸序列长度均为987bp，未发现核苷酸的丢失和插入，相应的点突变率为0．8％～1．3％，推导的氨基酸序列长度均为329个。2003年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A／Moscow／10／99比较，核苷酸同源性只有95．6％～95．9％，氨基酸总变异达20个，发生在抗原决定簇A、B区的有6个位点。2004年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A／fujian／411／2002（A／Kumamoto／102／2002，A Wyoming／3／2003）比较，核苷酸同源性达98．6％～99．1％，仅发生3～6个氨基酸的变异。基因进化树上，浙江省2003，2004年新分离的毒株均属于同一类性状的毒株，与2004年WHO推荐疫苗株接近．已远离2003年推荐疫苗株。结论 浙江省甲3型流感病毒的抗原性已发生漂移，与我省流感的流行密切相关。2003年WHO推荐使用的甲3型流感疫苗对我省甲3型流感的预防效果不够理想，2004年推荐使用的疫苗对我省甲3型流感的预防效果较好。     

2010年-2013年宜春市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因进化分析

目的掌握宜春市2010年-2013年甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因特征,了解WHO甲3型疫苗推荐株对宜春市甲3亚型流感病毒预防效果。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar 5.0、Bio Edit 7.0、Mega 3.1软件对测序结果进行分析处理。结果对14株毒株进行HA1基因序列测定,分别与当年WHO对北半球推荐的疫苗株进行比对,2010年、2012年、2013年氨基酸同源性分别为98.6%~98.7%、99.2%~99.3%、98.4%~98.8%;氨基酸平均替换数分别为7.5个、5个、8.25个,2012年和2013年分别有2处和4处变异位于抗原决定簇,2010年未在抗原决定簇区发生氨基酸变异替换;14株所测甲型H3N2亚型流感病毒与当年疫苗推荐株均在同一分支上,亲缘性较近。结论 2010年-2013年甲型H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因在不断发生变异,根据WHO不同年度推荐疫苗株生产的疫苗,对本市的甲型H3N2亚型流感保护效果良好。     

浙江省流行性感冒病毒监测与HA1基因分析

目的了解浙江省流感病毒变异情况和WHO推荐流感疫苗株对我省人体的保护情况。方法对浙江省近两年分离到的甲3型流感病毒进行核酸提取、病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,与WHO推荐疫苗株进行对比。结果近两年分离到的甲3型流感病毒株HA1区域的核苷酸序列长度均为987bp,未发现核苷酸的丢失和插入,相应的点突变率为0.8~1.3%,推导的氨基酸序列长度均为329个。2003年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A/Moscow/10/99相比,核苷酸同源性只有95.6%~95.9%,氨基酸总变异达20个,发生在抗原决定簇A、B区的有6个位点。2004年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A/fujtan/411/2002(A/Kumamoto/102/2002,A Wyoming/3/2003)相比,核苷酸同源性达98.6%~99.1%,仅发生3~6个氨基酸的变异,基因进化树上,我省2003、2004年分离的毒株都属于同一类性状的毒株,与2004年WHO推荐疫苗株接近,远离2003年推荐疫苗株。结论我省甲3型流感病毒的抗原性已发生漂移。2003年WHO推荐使用的流感疫苗株对我省甲3型流感的预防效果不够理想,2004年推荐使用的疫苗株对我省甲3型流感的预防效果较好。     

浙江省1998-2005年甲3亚型流感病毒株HA1区和NA区基因特性分析

目的分析近几年浙江省甲3亚型流行性感冒（流感）流行株血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因的特性、变异与流感流行的关系。方法选择浙江省1998—2005年流感流行期间分离的甲3亚型代表株25株，提取病毒RNA，扩增HA1和NA基因，进行序列测定，用BioEdit软件分析处理。结果浙江省近几年甲3亚型流感流行株在HA1区的核苷酸长度均为987bp，编码329个氨基酸；在NA区的核苷酸长度为1362bp，编码454个氨基酸。1998—2005年甲3亚型流感病毒HA1区与NA区的氨基酸同源性分别在90．9％～99．3％与95．2％～99．5％之间，HA1区的变异较NA区更大。这8年间在HA1区共发生了30个氨基酸的替代，其中14个氨基酸位点涉及HA1区的4个抗原决定簇；NA区发生了21个氨基酸替代，其中5个氨基酸位点涉及NA区的3个抗原决定簇。在1998与2002年无论是HA1区还是NA区，均产生了较大的变异，在氨基酸进化树上也形成了独立的分支。近年的甲3亚型毒株HA1区有11个糖基化位点，较早期毒株A/Aichi／2／68增加了5个，仅1998年至今的8年中就增加了3个。结论浙江省1998与2002年的二次较大规模的甲3亚型流感流行均与病毒的抗原性漂移有关。     

2007年-2009年江西省甲型流感A(H1N1)毒株HA1基因特性的分析

目的了解江西省2007年-2009年分离的甲1亚型流感病毒株HA1基因变异特征及规律,分析WHO2007年-2009年甲1亚型疫苗推荐株对江西省甲1亚型流感的预防效果。方法采集流感监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的甲1亚型流感病毒进行核酸的提取,采用RT-PCR方法扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar、Mage软件对测序结果进行分析处理,并与WHO 2007年-2009年北半球推荐疫苗株进行比对。结果测得15株甲1亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为987 bp,未发现核苷酸的丢失和插入。2007年与2008年本省甲1亚型流感病毒分离株与WHO疫苗推荐株,在HA1区域的氨基酸存在较大差异;而2009年本省甲1亚型流感病毒分离株与WHO疫苗推荐株之间差异则较小。结论 2007与2008年根据WHO疫苗推荐株生产的疫苗对该年度本省的甲1亚型流感的预防效果不够理想;而2009年根据WHO疫苗推荐株生产的疫苗对该年度本省的甲1亚型流感的预防具有一定的效果。     

2000—2007年佛山市甲1亚型（H1N1）流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000—2007年佛山市甲1亚型（H1N1）毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒,采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定,选取每年2～4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸,进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000—2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的,只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HAl区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A／NewCMedonia／20／99和A／Solomon Islands／3／2006相比,同源性分别为97．2％～99．7％和97．2％-98．5％。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加,只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较,佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变,应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

2008-2012年江西省乙型流感病毒HA1基因特性分析

摘要:目的　了解2008-2012年江西省分离的B型流感病毒株HA1基因变异特征。方法　采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的B型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录－聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、Mage对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果　10株Yamagata系B型毒株HA1基因之间的同源性为97.5%～100.0%,14株Victoria系B型毒株HA1基因之间的同源性为97.0%～99.9%。我省2008年分离的Yamagata系流感病毒与疫苗株间有5～7个变异,2009-2011年分离的Victoria系流感病毒与疫苗株间有5～7个变异,2012年分离的Yamagata系流感病毒与疫苗株间有1～4个变异,其中最多只有1个变异位于抗原决定簇。结论　2008-2012年江西省B型流感HA1基因未发生明显变异,WHO推荐的B型流感疫苗株对我省流行的B型流感具有保护作用。     

高危人群中脊髓灰质炎野病毒的监测研究

目的: 为监测脊髓灰质炎 (以下简称脊灰) 高危人群健康儿童中, 是否还有脊灰野病毒株循环。方法: 在曾是脊灰流行区的乡镇, 于1997～1998 年定点采集0～4 岁健康儿童粪便计538 人份, 用Hep-2C细胞分离病毒; 鉴定为脊灰病毒, 采用温度特征试验作毒力测定和RT-PCR试验型内分析。结果: 在2 年的监测中, 计分离到脊灰Ⅰ型病毒10 株, Ⅲ型病毒3株, 非脊髓灰质炎肠道病毒12 株。分离的脊灰病毒温度特征试验, 两种温度滴度差均> 5, 判为弱毒(疫苗) 株; RT-PCR型内分析亦为疫苗(Sabin) 相关株, 两试验结果吻合。结论: 在具有高免疫屏障的健康儿童中, 仍有脊灰病毒循环, 但均为疫苗相关株     

船舶鼠类种类及侵害情况调查

本文报告分析了汕头港船舶鼠类种类及侵害船舶部位情况,揭示黄胸鼠为优势种,并说明船上生活区尤以餐厅、厨房是鼠类的主要活动场所,为今后对船舶鼠类防制提供了依据。     

1997/1998北京青年人群中6株甲1型流感流行株(H_1N_1)分离及抗原性分析

１９９７年１０月～１９９８年３月，从北京青年中分离到６株Ｈ１Ｎ１流感亚型毒株，经国家流感中心鉴定确认。将６株中的５株与１９９４～１９９７年３株（Ｈ１Ｎ１）国家代表株作血凝抑制交叉试验，５株的抗原性明显不同于Ａ／桂防／１０／９４，抗原比均≥２。５株中的４株抗原性明显不同于Ａ／京防／２５／９６；５株中的２株抗原性明显不同于Ａ／京防／５３／９７。将６株Ｈ１Ｎ１流行株送日本ＷＨＯ流感协作中心作多株Ｈ１Ｎ１毒株抗原性初步分析，６株抗原性既不同于Ａ／日本山形／１２０／８６和Ａ／日本山形／３２／８９，也不同于国际代表株德国的Ａ／拜恩州／０７／９５和南非的Ａ／约翰内斯堡／８２／９６。表明Ｈ１Ｎ１流感亚型毒株自１９９４年以来抗原变异较大，需严密监测     

13年室间质控菌株鉴定工作的实践和体会

为了提高菌株鉴定水平, 我们自1985～1998 年参加了省临检中心细菌室间质控工作, 共鉴定下发菌株142 株,鉴定正确131 株(占92.25% ), 误检11 株(7.75% )。本文总结了鉴定工作的经验, 并对误检原因进行分析。认为理论、实践和学科新进展是提高鉴定水平的关键     

106株淋病奈瑟菌的耐药性分析

目的了解淋病奈瑟菌(NG)流行株对5种抗生素的敏感性,分析NG的耐药性特点,为淋病的治疗提供依据。方法纸片扩散法检测106株NG对5种抗生素的敏感性,用产色头孢硝噻吩法检测β-内酰胺酶。结果106株NG中检出97株对青霉素耐药(91.5%),由质粒介导的产青霉素酶NG(PPNG)为61株(57.5%),四环素耐药率为70.4%,其中质粒介导高度耐四环素NG(TRNG)为28株,占26.4%,环丙沙星耐药率为92.3%,末发现对大观霉素和头孢曲松的耐药菌株。结论青霉素、四环素以及氟喹诺酮类药物已不宜作为治疗淋病的常规药物,大观霉素、头孢曲松可作为治疗淋病的首选药物。     

不同型别幽门螺杆菌的耐药性

目的观察不同型别幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)的耐药性,为指导临床提高Hp根除率提供依据。方法对慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者,应用免疫印迹法检测Hp抗体,将Hp分为Ⅰ型和Ⅱ型。取胃粘膜组织进行Hp细菌培养;采用Kirby-baner药敏纸片法对培养出的Hp进行克拉霉素、阿莫西林、甲硝唑及左氧氟沙星敏感性检测。结果Ⅰ型Hp感染组中,慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌的发病率明显高于Ⅱ型Hp感染组(P0.05);Ⅰ型Hp在消化性溃疡和胃癌组中的感染率高于慢性胃炎组(P0.05)。Ⅰ型Hp对克拉霉素、阿莫西林及左氧氟沙星的耐药率高于Ⅱ型Hp(P0.05);Ⅰ型与Ⅱ型Hp对甲硝唑的耐药率都比较高,分别为82.9%和77.8%(P0.01),但2型之间差异无显著性。结论Ⅰ型Hp是慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌的致病因子,对阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星,尤其是甲硝唑具有耐药性。Ⅱ型Hp感染少见,且只对甲硝唑耐药明显。根据Hp分型来选择有效药物,有助于临床根除Hp感染治疗。     

浙江省杭州地区手足口病病原谱分析和肠道病毒71型VP1基因分析

[目的]分析杭州地区手足口病的病原谱构成,并对肠道病毒(EV)71型的VP1基因进行核苷酸和氨基酸的序列的比对分析,了解杭州地区EV71的基因特征。[方法]采集98份手足口病确诊病例的粪便标本,用EV71和柯萨奇病毒A组(CoxA)16型特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定,并选择6例EV71检测结果阳性的标本进行病毒分离并进行VP1基因的特异性扩增并进行测序,结合EV71各亚型的代表株构建系统进化树,并对VP1蛋白的氨基酸序列进行分析。[结果]通过RT-PCR特异性检测,发现EV71阳性结果22份,阳性率为22.4%;CoxA16阳性结果27份,阳性率为27.6%。测序结果表明6株EV71之间的VP1基因核苷酸同源性为92.2%～98.5%,氨基酸同源性为99.0%～100%。通过与各代表亚型进行核苷酸同源性比较后发现此次分离得到的EV71病毒都属于C4亚型。6株EV71与部分亚型代表株间在BCloop区域的氨基酸序列存在着差别,而SP70区域的氨基酸序列则完全一致。[结论]在手足口病患者中,由EV71感染引起的比例越来越大;此外,此次在杭州地区分离的EV71病毒都属于C基因型的C4亚型,尚没有证据说明此次在杭州地区分离的6株EV71毒株的毒力有增强。     

101株肠球菌的耐药性分析

<正> 肠球菌是人类肠道中的正常菌群,但当其进入人体血液或其他部位可引起败血症、尿路感染、心内膜炎、脑膜炎和伤口感染等。由于抗生素的广泛应用,使此菌对目前的多种抗生素产生耐药,给临床治疗造成了一定的困难。了解肠球菌的耐药性变化,指导临床上对该菌的合理用药非常重要。为此,我们对某医院2000年从住院部和门诊部病人中分离出来的101株肠球菌进行药敏试验,分析该菌的耐药特征,为临床合理用药提供参考。