25个湖北钉螺种群扩增片段长度多态性分子标记的遗传变异研究

目的探讨湖北钉螺种群间的遗传变异及其程度。方法采用扩增片段长度多态性分子标记技术对来自中国大陆10省的25个种群钉螺基因组DNA样品池进行扩增，分析钉螺各种群间的遗传变异并对钉螺种群进行聚类分析。结果25个钉螺种群间的相似系数GSDICE在0．694～0．831之间，Nei无偏遗传一致性在0．635～0．799之间，遗传距离D在0．169～0．306之间，Nei无偏遗传距离在0．225～0．452之间，光壳钉螺种群间的遗传变异程度明显高于肋壳钉螺种群间的遗传变异程度（P〈0．01）。25个钉螺种群被聚成3类，A类包括来自福建福清和广西宜州的光壳钉螺种群；B类包括来自四川西昌、普格、丹棱、蒲江、广汉和云南大理的光壳钉螺种群；C类则由其他来自长江中下游地区的17个钉螺种群组成。结论在中国分布的湖北钉螺已发生较大的遗传变异，基因组水平上的钉螺种群聚类结果和其地理分布基本一致。     

微卫星锚定PCR分析19个湖北钉螺种群之间的遗传变异关系

目的探讨湖北钉螺种群间的遗传变异关系。方法采用微卫星锚定PCR分子标记技术对来自中国大陆8个省的19个种群钉螺基因组DNA进行扩增，分析钉螺各种群间的遗传变异并对钉螺种群进行聚类分析。结果19个钉螺种群间的遗传距离D在0～0．73之间，平均遗传距离D为0．22±0．013。19个钉螺种群被聚成4类，一类包括分布在长江中下游流域（湖南、湖北、江西、安徽、江苏）的16个钉螺种群；广西宜州、福建福清和云南大理的钉螺种群分别单独成一类。结论目前分布在中国大陆的湖北钉螺可能分为4个亚种，即指名亚种、滇川亚种、福建亚种、广西亚种。     

高山地区钉螺分布的空间特征研究

目的 分析山区钉螺分布的空间特征.方法 建立四川省普格县钉螺分布的地理信息系统(GIS),用空间自相关分析和空间扫描统计量法研究山区钉螺分布的空间特征.结果 普格县钉螺分布存在空间自相关,其有螺框出现率的全局Moran's I指数为0.095(P<0.05),局部空间自相关分析显示有28个钉螺孳生地的局部空间关联指数(LISA)值有统计学意义(P<0.05),这些环境又可细分为高-高、低-低、低-高和高-低四种空间关联模式.空间扫描统计量法共探测出24个钉螺孳生地聚集区,其中有14个高值聚集区,10个低值聚集区(P<0.05),与局部空间自相关的结果 较为吻合.结论 普格县山区钉螺分布存在空间自相关,钉螺孳生地在空间上呈一定的聚集性,同时存在空间分布的异质性,利用这一规律可以更好地控制钉螺.

Abstract：

Objective To analyze the spatial characteristic on the distribution of Oncomelania hupensis in mountainous regions.Methods Based on the geographic database of snail distribution in Puge county,Sichuan province,spatial autocorrelation analysis and spatial scan statistics were applied to analyze the spatial characteristic of snail distribution.Results With regard to the rate of frame with snails,the global Moran's I indicator was 0.095(P<0.05),which indicated the spatial autocorrelation of snail distribution in Puge county.Data from the local spalial autocorrelation analysis showed that there were 28 snail habitats with statistically significant differences on local indicators of spatial autocorrelation(LISA)value(P<0.05),among which existed high-high,low-low,low-high and high-low four types of correlation model.The Spatial Scan Statistics had in total identified 24 snail habitat clusters(P<0.05),including 14 high rate clusters and 10 low rate clusters,and the result was similar to that of LISA analysis.Conclusion There were spatial autocorrelation and spatial aggregation of snail distribution in mountainous regions,meanwhile spatial heterogeneity of snail distribution also existed.This law could be explored for beaer control of snails.     

湖北钉螺扩增片段长度多态性分子标记遗传多样性研究的合理样本量与分子位点数

目的探讨用扩增片段长度多态性（AFLP）分子标记研究湖北钉螺遗传多样性的合理样本量与分子位点数。方法选取湖南省岳阳市遗传变异较大的肋壳钉螺为研究材料，用AFLP方法对钉螺基因组DNA进行扩增，然后分析湖北钉螺样本量和分子位点数与遗传变异信息可靠性的关系。结果湖北钉螺样本量和分子位点数与遗传多样性信息的可靠性之间存在明显的关系。当样本量低于7只时，AFLP总位点数、多态位点数、多态位点频率、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数变化很大，而当样本量超过30只时，这些指标值的变化趋于平稳。当AFLP分子位点数低于128时，多态位点频率、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数以及这两个指数的标准差变化相当剧烈，当分子位点数超过338时，这些指标值的变化趋于稳定。结论在用AFLP分子标记技术研究湖北钉螺的遗传多样性时，每个钉螺种群内的样本量最好不应低于30只，用于研究分析的分子位点数最好不低于338个。     

湖北钉螺微卫星锚定PCR产物序列分析

目的 分析4个种群湖北钉螺中微卫星序列及其两侧序列的特点.方法 以(CA)8RY为引物对湖北钉螺基因组DNA进行微卫星锚定PCR(SSR-PCR)扩增,对全部159个扩增产物进行T克隆并测定其中82个片段的核苷酸序列.结果 SSR-PCR的扩增产物是湖北钉螺基因组DNA上的散在区域,不是微卫星序列,但扩增产物中含有微卫星序列,测序的82个片段中36个克隆片段含有微卫星序列.微卫星序列其侧翼序列有一定的保守性,同一个微卫星的侧翼序列多数情况下是相同的.(GA/CT)n、(TTAGGG/CCCTAA)n两类微卫星在4个钉螺种群中均有发现,(CAA)n仅在福建福清种群中发现,(TCTCTG)n仅在安徽贵池种群中发现,(GAA～TTC)n、(CAA/TTG)n、(CAT)n三种微卫星序列仅在四川普格种群中发现.结论 SSR-PCR扩增的不是微卫星,其结果的分析应当类似于随机扩增多态性DNA.因此SSR-PCR不能十分有效体现微卫星作为分子标记的优势,应当根据微卫星的侧翼序列设计针对微卫星的引物,对微卫星进行PCR扩增并进行分析.     

利用地理信息系统数据库分析钉螺空间区域的分布

目的　利用地理信息系统（ＧＩＳ）数据库分析中国大陆钉螺的空间区域分布。方法　收集中国九省３４ 个种群钉螺等位基因实验所得的种群遗传变异资料以及钉螺易感性实验资料,建立数据库。以世界数字地图为背景,在ＡｒｃＶｉｅｗ ３．０ ａ 软件上与钉螺的遗传变异和易感性数据库相联。采用ＡｒｃＶｉｅｗ 空间分析和ＧＩＳ重叠分析功能进行区域划分。收集１９９５ 年ＡＶＨＲＲＮＤＶＩ卫星图像组合成流行季节的卫星图像,并重叠各种群钉螺的杂合指数、多态位点百分率和血吸虫感染率分布图,进行图像分类。结果　空间分析结果,将钉螺遗传杂合性指数、多态位点百分率和钉螺感染率的分布图,划分成西部和东部二大区域,各区域内有各种类型。三层分布图与ＡＶＨＲＲＮＤＶＩ卫星图像重叠分析后,显示出西部四川、西部云南、中部江湖洲滩和东南部沿海４ 个明显不同的区域。结论　首次运用ＧＩＳ分析种群遗传学资料,佐证了中国大陆钉螺种群结构为分裂亚群结构,并可区分出多个亚种的理论。     

湖沼地区行政村尺度的洲滩阳性钉螺空间分布特征及变化趋势

目的 分析2004-2010年湖南省安乡县洲滩阳性钉螺空间分布特征及变化趋势,了解以传染源控制为主的综合防治措施的效果.方法 建立2004-2010年安乡县基于行政村的垸外查螺空间数据库,运用全局空间自相关(Moran''s I)、局部空间自相关(Anselin Local Moran''s I)与空间扫描统计量法探索洲滩阳性钉螺空间分布特征及变化趋势.结果 安乡县发现有感染性螺的洲滩由2004年的23处减少为2010年的10处,阳性螺框出现率也逐年降低,由2004年的4.32‰下降到2010年的0.12‰.全局空间自相关结果显示,总体研究区域上2004和2005年阳性螺框出现率存在空间自相关(Moran''s I=0.21,P＜0.10; Moran’s I=0.13,P＜0.10),其他年份不存在空间自相关,呈随机分布;局部自相关分析结果显示,随着时间的推移H-H模式的村呈减少趋势,2007、2008和2009年均出现了H-L相关模式的村,而2010年局部自相关分析,仅有1村有统计学意义,为H-L相关模式;空间扫描统计量法分析结果与局部自相关结果基本一致,聚集区域呈减少趋势,聚集半径也逐渐变小.结论 安乡县以传染源控制为主的防治策略取得了良好的效果,洲滩阳性钉螺空间分布特征也随之发生了变化,应根据目前的分布特征调整防治策略和措施.     

中国湖区五省血吸虫病聚集区域地理信息系统综合探测分析

目的 综合探测2008年中国湖区5省血吸虫病传播的聚集区域,为血吸虫病防治提供依据,也为相关疾病聚集区域探测方法的建立提供参考.方法 基于县级地理信息系统(GIS)基础上构建空间数据库,运用全局空间自相关Moran's I、局部空间自相关Getis-Ord Gj与SaTScarn软件综合探测血吸虫病聚集区域,并对结果进行比较.结果 全局空间自相关结果提示从整体研究区域来看,血吸虫病感染率分布呈现空间聚集性(P＜0.05);局部空间自相关结果提示有50个县(区)的局部空间自相关结果有统计学意义(P＜0.05),且z值均＞0,提示存在高值聚集;SaTScan统计结果探测出5个聚集区域,与局部空间自相关的结果较为吻合.结论 湖区5省沿江地区仍然是中国血吸虫病防治的重点,尤以湖北、湖南两省交界地带空间聚集性最高、范围最大.     

滇西南地区埃及伊蚊种群微卫星标记筛选研究

目的研究滇西南地区埃及伊蚊种群遗传学特征,针对该地区的埃及伊蚊种群筛选新的微卫星位点。方法从美国国立生物技术信息中心Gen Bank数据库中下载埃及伊蚊全基因组数据,利用Tandem Repeats Finder软件查找全基因组中的微卫星位点,选择重复单位为2~4 bp且重复次数30的微卫星位点,对其侧链进行BLAST比对,选择在基因组中单拷贝的位点设计引物,再对引物进行BLAST比对,选择扩增产物为单拷贝的引物进行相关筛选。结果从17个全基因组中共获得80条微卫星序列,并成功设计出11对多态性引物,核心序列包括5对2碱基重复,5对3碱基重复以及1对4碱基重复,共有98个等位基因,平均每对引物有9个等位基因,观察杂合度平均值为(0.394±0.026)。结论设计引物可稳定地扩增出目标条带,且多态性较高,可以用于埃及伊蚊的种群遗传学研究。     

浙江省2005-2011年痢疾流行状况及空间自相关分析

目的 分析浙江省2005-2011年痢疾流行状况及空间分布特点,为痢疾有效防控提供理论依据.方法 采用描述性流行病学方法描述从2005到2011在浙江省的痢疾数据,运用ArcGIS10.1软件对痢疾疫情数据进行空间显示和空间自相关分析.结果 2005到2011年浙江省痢疾发病率总体呈现下降趋势,年均发病率为26.20/10万;发病率最高的年龄组为0～5岁,男性发病高于女性;全局Moran's I空间自相关分析2005 ～ 2007年,2008～2009年,2010 ～ 2011年三个阶段值为1.181、1.591、1.297,P值均小于0,痢疾的发病存在空间聚集性,局部Local Moran's I自相关分析显示高发病地区主要集中在杭州市的下城区、上城区、滨江区、余杭区、拱墅区、西湖区、江干区、萧山区及附近县市.结论 浙江省痢疾发病空间分布并非随机分布,具有明显的地域聚集性,相关部门应针对其地域特点制定相应的防控措施.     

氯硝柳胺杀灭钉螺效果影响因素分析

目的 研究氯硝柳胺杀灭钉螺的效果并了解影响其杀灭效果的主要因素。方法 采用实验流行病学方法，对中国血吸虫病流行区的钉螺通过随机分层抽样，抽取了10个省（市）33个县共37个点，采集钉螺，随机分组，用不同浓度的氯硝柳胺分别浸泡24h、48h，观察其杀灭效果，计算不同药物浓度、不同作用时间和不同生境的LC50。统计分析采用SPSS 13．0软件进行。结果 氯硝柳胺溶液1．0mg／L浸泡24h和0．5mg／L浸泡48h，杀螺率均达100％。同一作用时间，对钉螺的杀灭效果随着药物浓度降低显著下降。浸泡钉螺24h，LC50均值为0．0939mg／L，而浸泡钉螺48h，LC50均值为0．0625mg／L，浸泡24h和48h间的杀灭钉螺LC50差异有统计学意义（t=5．001，P〈0．01）。在一定的浓度范围内，氯硝柳胺对钉螺的杀灭效果在48h、不同生境（山丘型、湖沼型和水网型）SlgLG50之间的差异具有统计学意义（F=4．264，P〈0．05）。非条件logistic回归分析，浓度、时间、生境的标准化回归系数估计值分别为2．047（OR=5．573）、0．263（OR=2．924）、0．187～0．210（1．969～2．560）。结论 氯硝柳胺能有效杀灭钉螺，药物浓度、作用时间以及钉螺孳生地类型为其主要影响因素。     

江宁县江滩钉螺空间分布特征分析

目的　探讨江宁县江滩钉螺的空间分布特征。方法　应用地理信息系统结合空间扫描法检测江滩钉螺分布的空间聚集性 ,并进一步以变异函数对钉螺的空间分布特征进行定量分析。结果　地理信息系统可见 ,2 0 0 0年江滩钉螺孳生地主要分布在洲滩的沿江地区 ;同时空间扫描分析发现在江滩分别有 2个活螺和 2个感染螺的高聚集区 ,其螺密度明显高于周围地区 (P <0 0 0 1) ;进一步以变异函数分析显示 ,江宁县江滩钉螺在空间的分布存在自相关性 ,其分布变异呈球型模型 ,当距离小于 0 0 3 0 1时 ,钉螺在空间分布上的变异与距离有关 ,并可以通过变异函数来估计。同时钉螺在空间各方向上的分布有所不同。结论　江宁县江滩钉螺分布的空间聚集性及自相关性 ,提示这些地区存在适合于钉螺孳生分布的因素     

2011―2020年山东省发热伴血小板减少综合征流行特征及空间聚集性

  目的  分析2011―2020年山东省发热伴血小板减少综合征(severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)流行特征及空间聚集情况,为SFTS科学防控提供依据。  方法  通过中国疾病预防控制信息系统收集数据资料,采用描述性分析、Joinpoint回归模型分析及空间自相关分析方法分析SFTS流行特征及空间聚集性。  结果  2011―2020年山东省累计报告SFTS病例4 642例,年均发病率为0.46/10万,累计报告死亡451例,平均病死率为9.72%。每年5―9月为发病高峰,中老年农民为发病的主要人群。Joinpoint回归分析显示,2011―2015年山东省SFTS发病率呈上升趋势,年度变化百分比(annual percentage changes, APC)为38.93%(t=2.91,P=0.033),2016―2020年趋于平稳,APC值为2.71%(t=0.53,P=0.620)。全局空间自相关分析显示,除2011年(Moran’ I=0.011,P=0.168)外,2012―2020年各年SFTS发病率均存在空间聚集性(均有P＜0.05)。局部空间自相关分析显示,“高-高”聚集区主要集中在济南市、淄博市等鲁中内陆和烟台市、威海市等鲁东沿海地区。  结论  山东省SFTS发病存在季节性和空间聚集性,应加大对高发季节和高危人群监测管理,加大对鲁中内陆和鲁东沿海地区的防控力度。     

不同地区钉螺对日本血吸虫易感性的实验研究

目的 观察不同地区钉螺对云南大理日本血吸虫的易感性，为今后教学科研所需尾蚴提供依据。方法 采自国内3省的钉螺以钉螺与钉螺40：1的比例进行群体感染，观察3省钉螺对大理地区日本血吸虫的易感性。结果 在相同条件下，不同地区钉螺对云南大理日本血吸虫易感性不同，湖北、安徽、云南的感染率分别为42．0％、28．6％9．5％，各地钉螺差异有显著性。结论 3省钉螺对云南血吸虫的感染率以湖北最高，云南最低。