基于TCGA构建胃癌免疫相关基因预后风险模型及相关分析

目的 对TCGA数据库胃癌数据集进行分析,构建基于免疫相关基因的预后风险模型。方法 下载TCGA数据库中胃癌组织和癌旁组织中的基因表达数据及患者相关临床资料,进行数据整理、合并、表达差异分析。与ImmPort数据库取交集获得差异表达的免疫相关基因(IRGs),并进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。按照排除标准,将胃癌样本随机分为Train组(224例)、Test组(111例),利用Train组构建免疫相关基因预后风险模型并用Test组进行检验。将胃癌表达数据按照评估模型分为高、低风险2组,进行免疫浸润,分析2组免疫细胞表达水平的差异。观察2组免疫检查点表达差异及免疫治疗相关结果。结果 共得到238个差异表达的IRGs。GO功能富集分析结果示差异表达的IRGs主要参与免疫球蛋白生产、免疫反应分子介质的产生等生物学过程。KEGG通路富集分析结果示差异表达的IRGs主要参与细胞因子-细胞因子受体相互作用、神经活性配体-受体相互作用等通路。通过数据分析,得到6个IRGs(MPO APOH IGHD3-16 CGB5 GHR PRKCG)构建的预后风险模型。Train组和Test组中高风...     

肝癌组织FAM110A表达临床意义的数据库资料分析

目的结合人类蛋白图谱(HPA)、癌症基因图谱(TCGA)、Kaplan Meier-Plotter、生物通用交互作用数据库(BioGRID)、cBioPortal、STRING和DAVID等数据库分析基因110序列相似的家庭成员A(FAM110A)在肝癌中的表达及意义,并探讨FAM110A在肝癌中可能参与的生物功能。方法采用HPA数据库分析FAM110A在人体各种正常组织表达概况和FAM110A在肿瘤细胞中的定位。从TCGA下载374例肝癌样本及50例正常肝组织样本的转录组数据和肝癌病例对应的临床病理资料。采用R软件分析FAM110A在肝癌组织与正常肝组织间表达差异。进一步分析FAM110A表达量与肝癌临床病理特征之间的关系。采用Kaplan Meier-Plotter平台分析FAM110A表达量与肝癌患者预后的关系。采用cBioportal数据库搜索FAM110A在人肝癌组织中的共表达基因。使用DAVID平台对FAM110A的共表达基因进行基因本体论(GO)功能聚类分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后采用STRING数据库和cytohubba软件构建肝癌中FAM110A共表达分子调控网络。结果FAM110A在肝癌组织中表达高于正常肝组织,W=7124,P=0.006。FAM110A表达量与HCC细胞分化程度(χ²=6.0869,P=0.014)和AFP水平(χ²=6.6949,P=0.010)有统计学意义的关联,与性别(χ²=0.8762,P=0.349)、年龄(χ²=2.7599,P=0.097)、病理分期(χ²=1.9504,P=0.163)、有无肝硬化(χ²=0.1381,P=0.710)、有无脉管侵犯(χ²=1.8145,P=0.178)无统计学意义的关联。高表达FAM110A的肝癌患者预后更差,P<0.001。GO聚类分析显示,肝癌中FAM110A的共表达基因主要参与了细胞分裂、有丝分裂的核分裂、姐妹染色单体的凝聚、GTP酶活性的正向调节、DNA重组和先天性免疫反应等生物途经。KEGG通路富集分析显示,FAM110A的共表达基因集主要参与癌症的中心碳代谢、细胞周期、白细胞的迁移和Fc-r介导的吞噬作用等通路。结论FAM110A在肝癌中的表达量升高且高表达FAM110A患者的预后较差,FAM110A与肝癌患者的肿瘤细胞分化程度和AFP水平相关,FAM110A有望成为肝癌治疗的新靶点。     

基于TCGA数据库分析泛凋亡相关基因构建肺腺癌预后模型的预测价值及其对肿瘤免疫微环境的影响

摘 要：［目的］ 探讨泛凋亡（PANoptosis）对肺腺癌（lung adenocarcinoma，LUAD）患者预后及免疫微环境的预测价值。［方法］ 从TCGA数据库下载LUAD样本与正常样本的基因表达谱及临床数据，从已发表的文献中获取PANoptosis相关基因并分析其在肿瘤组和对照组间的差异表达基因。通过单变量Cox分析和LASSO-Cox回归分析构建生存预后模型，将患者按风险评分划为高、低风险组。通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线下面积（area under the curve，AUC）评价模型的预测性能，再对模型风险评分进行独立预后分析。GO和KEGG富集分析探索生物功能和潜在的信号通路。采用TIMER数据库ESTIMATE算法综合分析PANoptosis相关基因与免疫微环境相关性。通过qRT-PCR验证PANoptosis预后相关基因在LUAD组织和正常肺组织间的差异表达。［结果］ 共有15个PANoptosis相关基因在LUAD组和正常组间存在差异性表达，从中筛选出4个PANoptosis预后相关基因（RIPK3、NLRP3、FADD、MLKL）。在LASSO-Cox回归模型中，高风险组的生存率低于低风险组（P<0.001）。单变量和多变量Cox分析显示该评分模型是LUAD的独立预后因素（HR=2.179，95%CI：1.347～3.524，P=0.001），而GO和KEGG分析显示差异表达基因主要富集于与免疫相关的通路。高低风险组之间免疫微环境、免疫细胞差异和免疫检查点基因表达差异显著。此外，qRT-PCR实验也证实PANoptosis相关基因FADD（P=0.007）和NLRP3（P<0.001）在LUAD组和正常组之间表达存在差异。［结论］ 本研究构建的PANoptosis相关基因的生存预后模型可以预测LUAD患者的预后及免疫微环境。     

基于TCGA泛癌症分析线粒体裂变调节因子1的表达和预后意义

目的:基于TCGA泛癌症分析线粒体裂变调节因子1(mitochondrial fission regulator 1,MTFR1)的表达、预后意义及作用机制。方法:应用TCGA门户网站UALCAN泛癌症分析MTFR1的表达变化及预后关系；通过蛋白质相互作用平台STRING下载与MTFR1相互作用的蛋白质谱，经DAVID 6.8进行基因本体（GO）和KEGG信号通路分析。结果:UALCAN分析表明MTFR1在乳腺癌、肺鳞状细胞癌、头颈部鳞状细胞癌和食管癌中高表达（P＜0.001），而在肾透明细胞癌和甲状腺癌中低表达（P＜0.001）。MTFR1表达不利于乳腺癌、肺鳞状细胞癌和甲状腺癌的预后（P=0.014、P=0.022、P=0.001 3），而利于肾透明细胞癌的预后（P=0.005 3）。DAVID 6.8分析表明MTFR1相互作用蛋白主要定位于细胞膜；参与蛋白水解、线粒体靶向蛋白、蛋白质靶向内质网、信号肽处理过程；主要结合金属离子，具有金属肽酶、丝氨酸型肽酶和丝氨酸型内切酶活性等功能；参与的信号通路主要包括肾素-血管紧张素系统和谷胱甘肽代谢等。结论:MTFR1在乳腺癌、肺鳞状细胞癌、头颈部鳞状细胞癌和食管癌中高表达，而在肾透明细胞癌和甲状腺癌中低表达。MTFR1表达不利于乳腺癌、肺鳞状细胞癌和甲状腺癌的预后，而利于肾透明细胞癌的预后，可作为上述肿瘤预后的潜在标志物。     

基于生物信息学分析的肝细胞癌预后相关基因的筛选

[摘要] 目的：利用生物信息学方法筛选出肝细胞癌（HCC）组织与正常肝组织之间差异表达基因（DEG）,从转录组层面分析这些候选基因参与HCC发生发展的内在机制及其与HCC患者预后相关基因的临床意义。方法: 分别从基因表达数据库（GEO）及人类癌症基因组图谱（TCGA）网站中下载GSE45267、GSE64041、GSE84402 和TCGA中的基因表达谱,R软件和Bioconductor安装包用于筛选HCC组织与癌旁组织之间DEG,然后对这些DEG进行基因本体（GO）富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析、蛋白质相互作用（PPI）网络分析及生存分析。结果：共筛选出46 个上调基因和154 个下调基因,GO富集分析显示,这些DEG主要与细胞分裂、增殖、周期调控、氧化还原过程及某些代谢途径密切相关;KEGG通路分析显示DEG主要与色氨酸、视黄醇等代谢途径及P53 通路有关。在TCGA数据集中,6 个上调的中枢基因CCNA2、CDK1、DLGAP5、KIF20A、KPNA2、MELK的过表达被认为与HCC患者预后呈明显负相关（均P<0.01）。结论：筛选出的一组与预后负相关的中枢上调基因对HCC诊断和治疗的临床研究可能具有潜在的指导价值。     

基于TCGA数据库构建肝癌铜死亡的预后模型

目的 构建肝细胞癌（HCC）患者铜死亡相关基因（CRGs）的预后模型。方法 基于TCGA数据库HCC患者的mRNA数据集，分析CRGs在HCC患者中的表达，对CRGs及相关基因进行GO和KEGG富集分析。Kaplan-Meier生存分析曲线评估CRGs的生存预后价值，分析其与免疫细胞浸润的相关性。单因素Cox回归分析筛选出与HCC患者生存预后显著相关的CRGs,Lasso回归和多因素Cox回归分析构建预后模型。根据风险值对患者进行分组并进行生存分析，ROC曲线评估预后模型，单因素和多因素Cox回归分析风险评分及临床因素与预后的关系。结果 分析得到HCC中差异表达CRGs共11个，CRGs及其相关基因主要富集的GO条目为氧化还原酶活性，作用于供体的醛基或氧基，主要富集的KEGG信号通路为碳代谢。CRGs的表达水平与浆细胞样滤泡树突细胞、T辅助细胞等免疫细胞的浸润显著相关（P<0.05）。筛选并构建3个CRGs的预后模型，包括CDKN2A、DLAT和LIPT1。高风险组和低风险组的生存时间存在显著差异（P<0.001）。风险评分是预后不良的独立危险因素（P<0.001）。...     

LINC01215在结直肠癌组织中的表达及其临床意义

 目的 探讨LINC01215在结直肠癌（colorectal cancer,CRC）组织中的表达及其临床意义。方法 利用TCGA数据库分析LINC01215在CRC组织及其癌旁正常组织中的表达,并分析其与预后的关系;采用RT-qPCR检测2009年3月至2012年1月在广州医科大学附属第二医院诊治的137例CRC患者癌组织及其癌旁正常组织中LINC01215的表达水平,并分析其与患者临床病理特征的关系。通过MEM网站获取LINC01215靶基因并进行GO注释和KEGG分析。基于富集结果,对LINC01215进行单样本基因集富集分析（ssGSEA)和药物敏感性分析。结果 TCGA数据库分析结果显示,LINC01215在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织（P<0.001）。临床标本验证结果显示,LINC01215在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织（P=0.001）,且与组织分化程度相关（P=0.037)。TCGA数据库分析结果显示,LINC01215高表达组的中位总生存时间明显高于LINC01215低表达组［96个月（95%CI：80~113个月) vs 82个月（95%CI：70~95个月),P=0.002］。LINC01215低表达是CRC预后不良的危险因素（HR=1.69,95%CI：1.13~2.51,P=0.010)。GO和KEGG富集分析显示,LINC01215相关的靶基因主要参与蛋白质结合、T细胞受体等信号通路,ssGSEA显示LINC01215与28种免疫细胞相关（均P<0.05）。 药物敏感性分析显示LINC01215与Chelerythrine、Sapacitabine、Fenretinide、Hydroxyurea等药物敏感性有关（均P<0.05）。结论 LINC01215在CRC中低表达且与预后不良相关,其可能通过参与调节T细胞受体等信号通路影响CRC发生发展过程。     

肺腺癌CASZ1表达临床意义GEO及TCGA数据库资料分析

目的 CASZ1在多种肿瘤中异常表达,并参与肿瘤的发生发展,但其在肺腺癌中的表达及临床意义罕见报道。本研究旨在探讨CASZ1表达水平与肺腺癌临床病理特征和预后的关系。方法通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库探讨CASZ1在33种肿瘤中的表达情况。通过基因表达综合(Gene Expressi on Omnibus,GEO)数据库及癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得CASZ1在肺腺癌中的表达数据及相关病理参数,分析CASZ1表达水平与肺腺癌患者临床病理特征和总生存期(overall survival,OS)的关系,并通过免疫组化验证CASZ1蛋白在肺腺癌中的表达。通过TCGA数据库获得CASZ1在肺腺癌中的甲基化水平,分析肺腺癌中CASZ1表达失调的可能机制。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测CASZ1相关的基因通路。结果 GEPIA数据库分析结果显示,与正常组织相比,在11种肿瘤中CASZ1表达水平下调,在2种肿瘤中表达上调。在TCGA及GSE43458、GSE118370和GSE10072既往吸烟、吸烟及从未吸烟数据集中,CASZ1表达水平在肺腺癌组织中均下调,差异有统计学意义,均P<0.001。免疫组化结果提示,CASZ1蛋白在肺腺癌组织中表达也下调,t=5.969,P<0.001。TCGA及GSE68465数据集结果提示,CASZ1基因低表达组预后差于高表达组(χ^2=6.923,P=0.009;χ^2=11.175,P=0.001)。在肺腺癌组织中,CASZ1表达水平与6个甲基化位点(cg01551133、cg08885197、cg20288000、cg14170597、cg22728186和cg20329303)关联(P<0.001),其中cg01551133、cg14170597和cg22728186高甲基化组生存期短于低甲基化水平组(χ^2=11.290,P=0.001;χ^2=12.901,P<0.001;χ^2=7.083,P=0.008)。GSEA结果提示,CASZ1低表达样本富集在G2M检查点(P<0.001,FDR<0.001)、E2F信号通路(P<0.001,FDR<0.001)等基因集。结论肺腺癌中CASZ1表达水平下调,其甲基化水平升高可能是CASZ1失调的潜在机制,CASZ1低表达提示肺腺癌患者的预后差,可作为肺腺癌患者治疗的潜在靶点。     

术前外周血血小板-淋巴细胞比值与食管胃结合部腺癌患者预后相关性研究

目的探讨术前外周血血小板-淋巴细胞比值(PLR)对食管胃结合部腺癌(AEG)患者预后的影响。方法收集63例AEG患者,检测术前外周血PLR,分析PLR与肿瘤大小、TNM分期、分化程度等相关性及预后危险因素。结果以173.63作为PLR的临界值将AEG患者划分为高PLR组与低PLR组,患者的N分期(χ²=14.144,P<0.001)、病理分期(χ²=14.715,P<0.001)及分化程度(χ²=9.223,P=0.002)与PLR有关,而且PLR是术后较短的无复发生存期(HR:5.134;95%CI:1.399~18.842;P=0.014)的独立危险因素。结论术前外周血PLR可以作为一种简便的生物指标预测AEG手术患者的预后。     

AMPKg在NSCLC组织中表达及对A549细胞增殖迁移机制探讨

目的探讨腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)亚基γ(AMPKg)在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达情况和对NSCLC细胞增殖、侵袭和迁移的影响及机制。方法选取2010-01-01-2014-01-01新疆医科大学附属肿瘤医院120例NSCLC患者临床和病理资料。免疫组化法检测NSCLC癌组织及癌旁组织AMPKg的表达,根据免疫评分分为高表达组和低表达组。采用NSCLC A549细胞株进行实验,慢病毒转染抑制NSCLC细胞中AMPKg的表达,分为shCtrl组(转染空病毒组)和shAMPKg组(慢病毒shRNA-AMPKg组)。细胞增殖实验、划痕实验和Transwell实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力。蛋白质印迹法检测蛋白激酶B/雷帕霉素靶蛋白(Akt/mTOR)信号通路相关分子变化。KaplanMeier绘制生存曲线,Log-rank检验AMPKg高表达和低表达组别总生存率的差异,单因素和多因素Cox风险回归模型分析影响NSCLC预后的独立危险因素。结果 120例NSCLC患者中,AMPKg阳性率为58.3%(70/120)。AMPKg的异常表达与NSCLC患者病理类型(χ²=7.792,P=0.005)和TNM分期(χ²=15.664,P<0.001)相关。单因素Cox分析中病理类型(HR=1.945,95%CI:0.521~1.548,P=0.046)、TNM分期(HR=1.677,95%CI:1.267~2.351,P=0.002)和AMPKg表达(HR=2.438,95%CI:1.706~4.581,P<0.001)是影响NSCLC患者预后的危险因素。多因素Cox分析中,TNM分期(HR=1.522,95%CI:1.032~2.166,P=0.004)和AMPKg表达(HR=2.093,95%CI:1.103~3.537,P=0.031)是影响NSCLC患者预后的主要独立危险因素。中位生存期AMPKg高表达组(38.6个月)低于低表达组(59.3个月),χ²=20.020,P<0.001,AMPKg高表达的患者预后较差。细胞实验结果显示抑制AMPKg表达后,shAMPKg组细胞增殖能力在第4天(F=83.070,P<0.001)、第5天(F=81.200,P<0.001)降低。shAMPKg组细胞划痕愈合率为(84.80±6.31)%,小于shCtrl组(78.08±6.53)%,t=6.106,P=0.003。shAMPKg组和shCtrl组A549细胞迁移数分别为(96.84±39.86)个和(423.30±31.91)个,差异有统计学意义,t=11.070,P=0.004。shAMPKg组细胞和shCtrl组A549细胞侵袭数分别为(119.23±21.76)个和(561.67±15.67)个,差异有统计学意义,t=28.580,P<0.001。Akt/mTOR信号通路中shAMPKg组p-mTOR、p-AKT、EIF4G蛋白表达减少。结论高表达AMPKg可能预测NSCLC患者的疾病进展和不良预后,AMPKg促进NSCLC细胞增殖、迁移和侵袭,其机制可能通过调节Akt/mTOR信号通路影响NSCLC的进展,提示AMPKg可能是NSCLC的一种潜在分子标志物。     

肛管癌的疗效和预后因素分析

目的 回顾分析原发性肛管癌患者的疗效和预后因素。方法 2000—2011年本中心经治肛管癌患者3l例,鳞癌23例、腺癌8例。Ⅰ~Ⅲ期患者首程采用放疗为主治疗16例、手术为主治疗11例、化疗3例。结果 随访率为90%,随访时间满3年的样本数21例。全组3年总生存(OS)率和无进展生存(PFS)率分别为76%、56%。单因素分析显示临床分期和T分期为OS预后因素(χ²=12.11,P=0.001和χ²=4.64,P=0.031),并与PFS有相关趋势(χ²=2.91,P=0.088和χ²=2.75,P=0.097)。Ⅰ~Ⅲ期鳞癌患者首程放疗为主与手术为主治疗的3年OS率和PFS率均相似(80%与80%,χ²=0.08,P=0.776和78%与67%,χ²=0.17,P=0.697)。放疗患者3级皮肤或黏膜急性不良反应为37%,晚期肛门感觉或功能异常为9%。结论 临床分期、T分期是影响肛管癌患者预后的最主要因素,同期放化疗应作为肛管鳞癌患者根治性治疗手段的首选疗法,应用调强放疗技术有利于患者按计划完成放疗并避免发生严重不良反应。     

Foxp3+Treg和IDO+APC细胞在不同病变宫颈组织中的表达

目的:检测免疫抑制细胞Foxp3+Treg和免疫蛋白IDO在不同病变宫颈组织中的表达情况。方法:采用免疫细胞化学及蛋白印记（Western blot）检测Foxp3蛋白及IDO蛋白在宫颈癌细胞系HeLa、SiHa及C33A中的表达与分布;采用免疫组织化学法检测Foxp3和IDO在20例正常宫颈组织及45例不同程度宫颈病变组织中的表达情况。结果:Foxp3蛋白在HeLa、SiHa及C33A中无表达;IDO蛋白在HeLa、SiHa及C33A细胞的胞浆中均有表达。Foxp3蛋白在宫颈组织中表达于Treg,IDO蛋白在宫颈组织中表达于APC和/或异常细胞。宫颈病变组织中的Foxp3+Treg（H=43.211,P=0.000）和IDO蛋白的表达均明显高于正常组织（χ2=20.028,P=0.00;Z=226.600,P=0.00）。随着病理级别升高,Foxp3+Treg的侵袭性（H=28.307,P=0.000）增加,Foxp3+Treg与IDO+APC的数目显著正相关（rs=0.550,P=0.003）统计学正相关（rs=0.550,P=0.000）。结论:在宫颈癌进展的不同病理阶段,局部微环境中Foxp3+Treg数目随宫颈细胞恶性转化的进程而增多,IDO+APC细胞在早期宫颈病变组织中表达多于晚期病变。     

PD-1在肝细胞癌肿瘤浸润淋巴细胞中的表达及与预后的相关性

背景与目的：程序性死亡［蛋白］-1（programmed death-1,PD-1）在调节外周免疫耐受中发挥重要作用,PD-1在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）肿瘤浸润淋巴细胞中的表达状态与效应细胞CD8 ⁺ T淋巴细胞的关系尚不清楚,探讨HCC肿瘤浸润淋巴细胞中PD-1的表达及预后意义。方法：收集2008年1月—2016年12月在南通市第三人民医院接受手术的344例HCC患者的病理样本,制备组织芯片;采用免疫组织化学法检测HCC组织中PD-1、程序性死亡［蛋白］配体-1（programmed death ligand-1,PD-L1）的表达,分析PD-1在肿瘤浸润淋巴细胞中的表达与HCC临床病理学参数、PD-L1的表达、CD8 ⁺ T淋巴细胞之间的相关性及与患者预后的关系;采用免疫组织化学双标记法检测CD8 ⁺ PD-1 ⁺ 双阳性T淋巴细胞密度对HCC患者预后的影响。结果：PD-1阳性信号定位于HCC肿瘤浸润淋巴细胞的细胞膜或细胞质中。PD-1的高表达率为43.9%,其高表达与肿瘤组织学分级（P=0.009）、肿瘤细胞中PD-L1的表达（P<0.001）、肿瘤浸润淋巴细胞中PD-L1的表达（P<0.001）及肿瘤浸润CD8 ⁺ T淋巴细胞密度（P=0.003）有关,并且PD-1高表达是评估总生存（overall survival,OS）率、无病生存（disease-free survival,DFS）率的独立危险因子（OS：HR=1.654,P=0.010;DFS：HR=2.518,P<0.001）。另外,高密度肿瘤浸润CD8 ⁺ PD-1 ⁺ 双阳性T淋巴细胞组较低密度组OS和DFS更差（P均<0.001）。结论：PD-1在HCC肿瘤浸润淋巴细胞中表达可能是潜在的预后因子。     

中晚期宫颈鳞癌患者治疗前外周血Treg计数分析

背景与目的：中晚期宫颈鳞癌同期放化疗(concurrent chemoradiotherapy,CCRT)治疗前性价比高的疗效判断方法较有限,该研究拟通过检测治疗前外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/-调节性T细胞(regulatory T cells,Tregs)亚群计数及血清鳞癌抗原(squamous cell carcinoma antigen,SCC-Ag)水平,评价两者预测临床疗效的可行性。方法：采集44例Ⅱ_B~Ⅳ_A期宫颈鳞癌患者行CCRT治疗前的外周血标本,分别利用流式细胞免疫表型分析和酶联免疫法检测外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/- Treg计数及血清SCC-Ag水平。收集临床和病理资料,并统计检验2个指标对疗效的预测作用。结果：治疗前外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/- Treg计数在临床有效组低于无效组［(8.78±2.80)% vs (10.95±2.56)%,P<0.05］,血清SCC-Ag在不同临床疗效组间差异无统计学意义,且这2个、指标之间未发现相关性(Spearman’rho=-0.093,P=0.540)。经受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线确定治疗前外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/- Treg及血清SCC-Ag最佳界值分别为9.76%与9.50 ng/mL。单因素分析显示,治疗前外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/- Treg计数(OR=1.901,95%CI：1.112~3.219,P=0.017)对CCRT疗效有预测作用,而血清SCC-Ag水平无预测作用(OR=0.998,95%CI：0.001~4.253,P=0.897)。多因素Logistic回归分析显示,治疗前外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/- Treg为独立的临床疗效预测因子(OR=3.115,95%CI：1.253~7.742,P=0.014)。结论：治疗前外周血CD4⁺CD25⁺CD127^Low/- Treg计数用于中晚期宫颈鳞癌患者CCRT临床疗效预测具有可行性。     

宫颈鳞癌患者外周血HPV16 E6和E7特异性免疫反应及预后分析

目的 研究宫颈鳞癌患者外周血HPV16 E6和E7特异性免疫反应与临床特征和预后关系。方法 收集2013—2015年间新疆医科大学附属肿瘤医院经病理明确诊断的 72例宫颈鳞癌初治患者,并同期入组 75例体检者作为健康对照。采用酶联免疫斑点法检测患者治疗前外周血中经抗原重叠肽E6和E7刺激的T细胞特异性免疫反应。χ²检验和非参数检验分析宫颈鳞癌组和健康对照组的特异性免疫反应的频率和强度表达差异;Spearman法检验抗原特异性免疫反应和T细胞亚群相关性;log-rank法和Cox模型用于单因素和多因素预后分析。结果 宫颈鳞癌组HPV16 E6和E7特异性T细胞免疫反应频率均高于健康对照组(51.39%∶29.33%, P=0.006和45.83%∶25.33%, P=0.009),同时免疫反应强度也均高于健康对照组(20.00 SFC/10⁶∶10.76 SFC/10⁶, P<0.001和16.17 SFC/10⁶∶10.72 SFC/10⁶, P=0.017)。宫颈鳞癌组HPV16 E6特异性T细胞免疫反应强度和外周血CD⁺₄/CD⁺₈呈正相关(r=0.279,P=0.018);HPV16 E7抗原特异性T细胞免疫和外周血NK细胞占比和反应强度呈正相关(r=0.274,P=0.020)。单因素和多因素分析均显示治疗模式(放疗与放化疗 HR=2.918,95%CI为 1.454~5.854,P=0.003)和E6特异性免疫应答(应答与无应答 HR=0.491,95%CI为 0.243~0.990,P=0.047)是影响患者预后因素。E6特异性免疫应答组患者 5年总生存率明显高于无应答组(64%∶41%,P=0.041)。结论 HPV16 E6特异性T细胞免疫反应强度与CD⁺₄/CD⁺₈呈正相关,无应答与单纯放疗导致宫颈鳞癌患者预后不良。     

PD-L1多态性与105例晚期非小细胞肺癌铂类化疗敏感性及预后关系研究

目的探讨程序性细胞死亡配体-1(PD-L1)单核苷酸多态性(SNP)与晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者铂类药物化疗敏感性及生存预后的关联。方法对2015-01-01-2018-06-30南京医科大学附属苏州科技城医院肿瘤科接受铂类药物化疗的105例晚期NSCLC患者进行临床疗效评价,并随访无进展生存期(PFS)及总生存期(OS)。采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术对PD-L1基因rs4143815C/G、rs2297136T/C和rs10815225G/C多态性进行基因型分析。χ²检验比较不同基因型对化疗反应性的影响,Kaplan-Meier法进行生存分析,组间比较用Log-rank检验,Cox比例风险模型评估各种因素对生存预后的影响。结果rs4143815C/G多态性与晚期NSCLC铂类化疗敏感性密切关联,随着G等位基因数目的增加,化疗有效率逐渐升高(CC 19.5%、CG 45.5%、GG 65.0%),χ²=12.993,P=0.002。至少携带1个G等位基因的患者(CG+GG)化疗反应率为CC型的4.39倍(95%CI:1.759~10.96,χ²=10.786,P=0.001)。Kaplan-Meier法及Log-rank检验显示,rs10815225G/C多态性与患者生存预后密切关联,随着C等位基因数目的增加,PFS及OS均逐渐延长,GG、CG和CC基因型患者中位PFS分别为6.5、8.0和9.0个月,χ²=9.093,P=0.011;中位OS分别为16.0、22.0和23.0个月,χ²=11.674,P=0.003。突变基因型CG+CC患者中位PFS为8.5个月,与GG组(6.5个月)比较差异有统计学意义,χ²=7.226,P=0.007;同样,突变基因型CG+CC患者中位OS为23.0个月,比GG组OS(16.0个月)延长,差异有统计学意义,χ²=10.651,P=0.001。多因素分析结果显示,rs10815225G/C多态性仍是影响患者PFS和OS的独立预后因素。未发现rs2297136T/C多态性与上述观察指标之间存在统计学意义的关联。结论PD-L1基因rs4143815C/G多态性与晚期NSCLC患者铂类化疗临床反应密切关联,rs10815225G/C多态性可能影响患者的生存预后。     

原发性阴道恶性黑色素瘤患者预后影响因素分析:32例病例报道及系统评价

目的探讨原发性阴道恶性黑色素瘤(PMMV)的预后及其影响因素。方法收集郑州大学第一附属医院2013年1月至2018年6月收治的32例和中英文文献报道69例PMMV患者的临床病理资料,汇总后系统评价PMMV患者临床病理特征、预后及其影响因素。结果共纳入101例PMMV患者。平均发病年龄61岁,79.2%为绝经后女性,局部转移率33.7%,远处转移率6.9%。手术为主要治疗方式,达84.2%,但复发率高(74.4%)。中位无复发生存期(RFS)为11个月。肿瘤直径(χ²=4.487,P=0.034)、淋巴结转移(χ²=8.832,P=0.003)与RFS相关,其中淋巴结转移状态是RFS的独立影响因素(χ²=7.822,P=0.005)。中位总生存期(OS)为16个月,2 a生存率32.0%,5 a生存率17.5%。绝经状态(χ²=11.730,P=0.001)、美国癌症联合会分期(χ²=26.339,P<0.001)、肿瘤厚度(χ²=17.164,P=0.001)、是否溃疡(χ²=10.279,P=0.001)、肿瘤直径(χ²=28.010,P<0.001)、淋巴结转移(χ²=17.381,P<0.001)、阴道外转移(χ²=47.806,P<0.001)、治疗方式(χ²=20.852,P=0.001)、复发情况(χ²=28.375,P<0.001)与患者的OS相关,其中肿瘤直径(χ²=11.978,P=0.001)、肿瘤厚度(χ²=4.296,P=0.038)、阴道外转移(χ²=39.798,P<0.001)是OS的独立影响因素。结论PMMV为好发于绝经后老年女性的罕见妇科肿瘤,复发率高,预后差。肿瘤直径、肿瘤厚度、淋巴结转移、阴道外转移是PMMV预后的独立危险因素,积极手术、术后综合治疗可有效改善患者生存。     

B细胞易位基因2在食管鳞癌组织中的表达及临床意义

目的:探讨B细胞易位基因2（BTG2）在食管鳞状细胞癌（ESCC）组织中的表达及临床意义。方法:分析癌症基因组图谱（TCGA）数据库中BTG2 mRNA在ESCC组织及癌旁组织中的表达,受试者工作特征（ROC）曲线分析BTG2 mRNA表达量在预测ESCC患者疾病状态和放疗敏感性中的诊断价值;免疫组织化学检测我院184例ESCC患者癌组织标本BTG2蛋白表达,其中包括55例行根治性放疗术的ESCC患者,50例正常黏膜组织作为对照。分析BTG2蛋白表达情况与ESCC临床特征的关系。结果:与对照组比较,BTG2 mRNA在ESCC组织中表达下降（5.08±1.06 vs 5.91±1.29,t=2.387,P=0.019）,与放疗敏感组患者比较,BTG2 mRNA在放疗抵抗的ESCC患者癌组织中表达下降（3.82±0.97 vs 5.44±0.73,t=4.935,P＜0.001）,ROC结果显示BTG2 mRNA在鉴别放疗敏感与放疗抵抗患者时特异性为95.65%,敏感性为75%（AUC=0.902,P＜0.001）;免疫组织化学结果显示ESCC组织中BTG2阳性表达（103/184）低于正常黏膜组织（42/50）,差异有统计学意义（χ2=13.10,P＜0.001）;BTG2表达在放疗敏感和放疗抵抗组织中的阳性表达率分别为57.9%（22/38）和23.5%（4/17）,差异有统计学意义（χ2=5.565,P=0.018）;ESCC患者BTG2蛋白表达差异在不同性别、年龄、T分期及M分期中无统计学差异（P＞0.05）,与N分期（χ2=4.134,P=0.042）及临床分期（χ2=5.303,P=0.021）相关;单因素分析结果显示,肿瘤分级（HR=0.500,95%CI:0.317～0.790,P=0.003）、N分期（HR=0.275,95%CI:0.157～0.479,P=0.000）、M分期（HR=0.317,95%CI:0.151～0.665,P=0.002）、临床分期（HR=0.269,95%CI:0.167～0.434,P=0.000）及BTG2表达（HR=1.956,95%CI:1.242～3.079,P=0.003）与ESCC患者总生存（OS）有关;多因素分析结果显示,肿瘤分级（HR=0.613,95%CI:0.381～0.987,P=0.044）、N分期（HR=0.507,95%CI:0.259～0.991,P=0.047）、临床分期（HR=0.504,95%CI:0.278～0.916,P=0.025）及BTG2表达（HR=1.608,95%CI:1.011～2.558,P=0.045）影响ESCC患者的OS。结论:BTG2具有作为预测ESCC进展及放疗敏感性生物标记物的潜在价值,并且是影响ESCC患者总生存率的独立预后因素。