肺腺癌病人血清蛋白质组构型与病理分期的关系

目的用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)建立肺腺癌病人血清蛋白质组构型,筛选相对特异标记物,并探讨其与病理分期的关系。方法肺腺癌病人71例,均经手术病理证实;正常人71名,按照性别,年龄,吸烟史与71例肺腺癌病人配对。用WCX2芯片检测各血清标本,筛选肺腺癌相对特异性蛋白质峰,并分析肺腺癌相对特异性蛋白与病理分期的关系。结果与正常人比较发现5个肺腺癌显著高表达的潜在标记物,相对分子量分别为4047.79±1.60、4203.99±1.91、4959.81±2.13、5329.30±2.55和7760.12±4.11,其中分子量为4047.79±1.60和7760.12±4.11的肺腺癌相对特异性蛋白与病理分期呈正相关。结论SELDI-TOF-MS蛋白质质谱技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,能直接筛选出肺腺癌病人血清中相对特异的潜在标记物。     

应用SELDI质谱技术筛选胰腺癌患者的血清标志蛋白

目的:探讨应用SELDI质谱技术对胰腺癌患者血清中特异性标志蛋白的筛选方法。方法:采用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术，选择WCX磁珠及蛋白芯片阅读机对胰腺癌及健康人(对照组)和胰腺良性疾病组的血清进行检测，以筛选胰腺癌患者血清中特异表达差异蛋白。结果:发现胰腺癌血清表达差异的潜在标志物（蛋白）4个，相对分子质量分别为5 705 Da，4 935 Da,5 318 Da和3243 Da，其中4 935 Da，3 243 Da差异表达蛋白质在对照组中低表达，而在胰腺癌组中高表达，5 705 Da和5 318 Da差异表达蛋白质在胰腺癌组中低表达而对照组中高表达。结论:应用SELDI技术筛选胰腺癌患者血清中的特异性生物标记物的方法快速、有效;检测到的4个差异蛋白质可能是胰腺癌患者血清特异性生物标记物。     

富组蛋白-3在肾透明细胞癌患者中的表达及临床意义

目的利用蛋白质芯片技术筛查肾透明细胞癌患者手术前后血清差异性表达的蛋白质,并探讨其临床意义。 方法选取2015年10月至2016年10月在新疆医科大学第一附属医院泌尿外科手术治疗并经术后病理证实为肾透明细胞癌患者89例为肾癌组,选择同期在我院体检的健康志愿者以及非肾细胞癌患者100例为对照组。肾癌组术后规律随访1年。运用表面增强激光解析电离化飞行时间质谱系统（SELDI-TOF-MS）和CM10弱阳离子交换蛋白芯片技术系统检测肾癌组及对照组血清差异性表达的蛋白质。应用线性支持向量机（SVM）方法建立蛋白质指纹图诊断模型,留一法交叉验证模型判别效果。通过ZUCI-PDAS蛋白质谱数据分析系统软件对血清差异性蛋白质进行分析。 结果质荷比（M/Z）为2745的蛋白质在肾癌组与对照组呈差异性表达,所对应为富组蛋白-3,其表达水平在肾癌术前组较对照组呈低表达,差异有统计学意义（P<0.05）;肾癌组术前与术后1个月、3个月、6个月以及12个月后的表达水平比较,术前表达水平低于术后各随访段水平,差异均有统计学意义（P<0.05）。术后3、6、12个月表达水平与术后1个月相比较,差异有统计学意义（P<0.05）。术后6、12个月与术后3个月表达水平相比较,差异无统计学意义（P>0.05）。依据富组蛋白-3在肾癌组患者与健康人血清中表达量不同,利用ROC曲线法分析,曲线下面积AUC=0.804,灵敏度为86.7％,特异度为66.7％。该蛋白质表达强度的某一界点作为标记,预测诊断肾透明细胞癌的灵敏度为86.3％（76/89）,特异度为88.0％（88/100）。 结论富组蛋白-3在肾癌与健康人群中的表达存在差异,且肾癌术后其表达水平升高,提示富组蛋白-3与肾细胞癌具有相关性,有望成为肾透明细胞癌新的分子标记物。     

应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱蛋白质芯片技术筛选前列腺癌血清标志物的研究

目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测前列腺癌患者的血清蛋白质指纹图谱,筛选特异性诊断标志物.方法 以病理确诊的45例前列腺癌患者血清和45例BPH患者血清为研究对象.采用SELDI蛋白质芯片技术检测血清的蛋白表达图谱.用BiomarkerWizard软件分析差异蛋白,对所得蛋白进行初步诊断分析.结果 应用IMAC-CU固相金属亲和芯片在未经治疗的前列腺癌和BPH患者血清中检测到9个差异蛋白质峰,其蛋白质含量差异有统计学意义(P＜0.01),其中7个差异蛋白(3771.14,3968.26,4050.39,4279.20,4464.03,4481.59,8919.34)在前列腺癌患者血清中呈高表达,2个差异蛋白(5440.68,6102.82)呈低表达.联合相对分子质量为3771.14和4481.59的2个羞异蛋白诊断前列腺癌,其敏感性为86.7%(39/45),特异性为88.9%(40/45).经蛋白质数据库搜索,找到6种与差异蛋白相对分子质量最接近的蛋白质,分别为Pepeide YY、Apolipoprotin C-II、Glueagon like peptide(7-37)、uncharacterized protein C14orf128、Medin、Neuropeptide Y.结论 SELDI蛋白质芯片技术可筛选出前列腺癌中相对特异的潜在标志蛋白,具有较好的临床应用前景.     

血清蛋白质指纹图谱在甲状腺癌诊断中的应用

目的 检测甲状腺癌、甲状腺良性结节和正常人血清中蛋白质组图谱，筛选特异的蛋白质标记物。构建用于甲状腺癌早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型。方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术检测108例血清标本的蛋白质质谱，其中甲状腺癌40例（Ⅰ～Ⅱ期26例，Ⅲ～Ⅳ期14例），甲状腺良性结节36例，正常人32例。随机抽取87例标本（甲状腺癌32例，甲状腺良性结节30例，正常人25例）作为训练组，应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据，建立甲状腺癌诊断模型，留一法交叉验证。结果区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性87．5％，特异性80．0％，用15例未知血清盲法测试敏感性100％。特异性86％。区分甲状腺癌和甲状腺良性结节的诊断模型交叉检验敏感性81％，特异性87％，用14例未知血清盲法测试敏感性88％，特异性83％。结论 SELDI-TOF-MS技术结合生物信息学方法检测甲状腺癌血清蛋白质指纹图谱是早期诊断甲状腺癌的一种特异性强。敏感性高的新方法。值得进一步研究。     

血清蛋白质标记物检测在小儿肾母细胞瘤预后监测中的价值

目的 探索肾母细胞瘤患儿预后监测的新方法。方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术检测肾母细胞瘤患儿术前后血清蛋白质标记物的表达差异。肾母细胞瘤患儿血清标本100例，其中术前30例、术后2周24例、术后3个月和6个月各23例，正常儿童血清标本20例，以生物信息学方法支持向量机分析质谱数据。结果 肾母细胞瘤患儿手术（包括根治术和姑息性切除术）前后血清蛋白质标记物有明显差异。筛选出2个质荷比（m／z）位于6984．0、6455．0处的蛋白质标记物：术前30例标本2种蛋白质标记物表达强度分别为299．8±134．6、1037．0±375．9，与正常对照组（表达强度分别为1110．6±213．8、2268．7±1058．0）比较差异有统计学意义（P〈0．01）；19例根治术患儿术后2周2种蛋白质标记物表达强度分别为1101．2±221．8、2065．2±660．5，与术前组比较差异有统计学意义（P〈0．01），与正常对照组比较差异无统计学意义（P〉0．05）。2例根治术和3例姑息性切除患儿术后2周2种蛋白质标记物表达强度分别为358．1±213．3、1307．9±402．2，与术前组比较差异无统计学意义（P〉0．05）。术后3、6个月复查发现，持续高表达者均无复发转移征象，持续低表达者为瘤体未切净或已有远处潜在转移者。结论 血清蛋白质标记物检测为肾母细胞瘤术后患者预后判断提供了一种可能的新方法。     

蛋白质芯片技术筛选膀胱癌尿液标记物的研究

目的　寻找膀胱癌尿液中新的肿瘤标记物。　方法　采用表面增强激光解吸 /离子化 飞行时间质谱 (SELDI TOF MS)技术 ,选用IMAC Cu 3蛋白质芯片对 6 1例膀胱癌及 95例对照组尿液标本进行检测以筛选膀胱癌患者尿液中差异表达蛋白质。　结果　两组尿液标本结果比较发现 ,膀胱癌差异表达明显的潜在标记物 4个 ,相对分子质量分别为 344 5、370 3、3896、5 932。其中 344 5蛋白质被鉴定为α defensin ,诊断膀胱癌的敏感性为 80 % ,特异性为 75 % ;370 3蛋白质诊断膀胱癌的敏感性为32 % ,特异性为 94 % ,阳性者中 97%为高级别浸润性膀胱癌 ;3896、5 932诊断敏感性分别为 78%、5 5 % ,特异性分别为 4 0 %、35 %。　结论　SELDI TOF MS蛋白质芯片技术是一种快速、简便易行、用量少和高通量分析方法 ,能直接筛选出膀胱癌患者尿液中相对特异的潜在标记物 ,具有较好的临床应用价值。     

蛋白指纹图谱技术在骨肉瘤临床诊断中的初步应用

目的 比较骨肉瘤患者和正常对照者血清蛋白表达谱的差异,筛选骨肉瘤相关血清蛋白标志物,并建立基于决策树的预测模型,为筛选和建立骨肉瘤临床诊断的血清学指标提供依据.方法 27例骨肉瘤患者血清(男17例,女10例)及47名相匹配者正常对照血清标本随机分为两组:60份(23例骨肉瘤,37名正常对照)为建模组,14份(4例骨肉瘤,10名正常对照)为盲法筛选组.利用表面增强激光解吸离子化-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time of fight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术进行蛋白质谱分析.采用蛋白质飞行质谱仪对结合在CM10芯片上的血清蛋白进行读取分析.通过Biomarker Wizard软件比较两组人群血清蛋白质谱的差异,经生物信息学分析得到决策树模型并进行盲法验证.结果 在质荷比(M/Z)1488.15～19842u范围内,共检测到96个有效蛋白峰,其中9个峰差异有统计学意义.利用三倍交叉证实方法对建模组的蛋白质谱数据进行1000次随机抽样,得到1000个决策树.根据交叉证实的正确率选出最佳的20个决策树模型作为最终预测模型.用其对14个盲法筛选样本进行归类预测的正确率为85.71%.结论 应用SELDI-TOF-MS技术可筛选出骨肉瘤相关血清蛋白标志;建立的决策树模型可以对骨肉瘤作出较为准确的预测判断.     

中药肾康灵干预阿霉素肾病大鼠血蛋白质质谱表达的实验研究

目的：应用血蛋白质组学筛选阿霉素肾病（AN）大鼠血清中差异表达的蛋白质,旨在蛋白质分子水平探索频复发性肾病综合征（FRNS）的诊断标志物及中药肾康灵治疗的作用靶点。方法：利用表面增强激光解析-电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）联合CM10蛋白质芯片技术检测各组大鼠血蛋白质组质谱的表达,采用PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机自动收集数据,使用Ciphergen Proteinchip Software3.2.1和Biomarker Wizard分析软件筛选出各组大鼠血清差异表达的蛋白质。结果：在质荷比值（M/Z）2000~50000范围内,P〈0.05,芯片共捕获到30种差异蛋白质,质谱仪筛选出B组与A组比较的25种差异蛋白,C组与B组比较筛选出5种差异蛋白,其中3种差异蛋白在B、C、D、E组间差异有统计学意义,且从B组→C组→D、E组→A组呈递减趋势,这3种蛋白峰分别为8837.7、15013.0、15053.2。结论：SELDI-TOF-MS能有效分析阿霉素肾病大鼠血清蛋白质质谱,中药肾康灵干预治疗后蛋白质质谱表达差异有统计学意义。     

肝癌患者肝移植术后肿瘤复发相关的血清蛋白质标记物筛选

目的 筛选与肝癌患者肝移植术后肿瘤复发相关的术前血清生物标记物,并建立肿瘤复发的预测模型.方法 76例受者被纳入本项研究,其中35例术后发生肿瘤复发和转移(复发组),其余41例均无瘤存活(无瘤存活组).移植前收集受者血清,采用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术获取受者的蛋白质指纹图谱,利用"生物标记物向导"软件对两组受者间的蛋白峰进行比较.随机选择60例受者(复发组30例,无瘤存活组30例)的血清蛋白指纹图谱作为建模组,通过"生物标记物模型"软件(BPS)建立预测模型.取另外16例(复发组5例,无瘤存活组11例)受者的血清蛋白指纹图谱作为验证组,采用盲法验证该模型的灵敏性和特异性.结果 复发组和无瘤存活组受者的临床资料及病理特征间仅术前肿瘤大小和血管侵犯程度的比较,差异有统计学意义(P＜0.05).建立血清蛋白质指纹图谱后,在质荷比(M/Z)2000～3000范围内,共检测出368个蛋白峰,两组间有显著差异的蛋白峰共有22个,其中9个在复发组中表达上调,13个表达下调.通过对原始图谱的初步判断及利用建模组受者上述22个有显著差异的蛋白质,建立决策树预测模型,该模型可以显著地将复发组和无瘤存活组受者区分开.将16例验证组受者的血清蛋白指纹图谱代入决策树预测模型,验证结果显示,5例复发组受者中肿瘤复发4例,无瘤存活1例;11例无瘤存活组受者中无瘤存活受者8例,肿瘤复发3例.该模型的灵敏性为80.0%(4/5),特异性为72.7%(8/11).结论 由SELDI-TOF-MS筛选出的血清差异蛋白质可作为肝癌患者肝移植术后肿瘤复发相关的生物标记物,决策树预测模型对肝癌患者接受肝移植的适应证、有无肝外微小转外灶及制定肝移植诊疗计划具有一定临床指导意义.     

采用蛋白指纹图谱技术筛选大肠癌特异性相关蛋白

目的探讨大肠癌血清蛋白质指纹图谱的变化,企以建立诊断模型寻找早期诊断大肠癌的方法。方法利用CM10蛋白芯片和表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELD1-TOF-MS)技术对48例大肠癌患者和34例健康人的蛋白质谱进行分析;运用Ciphergen Protein Chipsoftware5.1软件分析处理数据和筛选标志物,建立蛋白指纹图谱诊断模型。随机另选33例大肠癌患者和34例健康人血清盲法验证大肠癌早期诊断模型。结果(1)48例大肠癌患者与34例健康人血清蛋白质在质荷比(M/N)为2770.34~16061.26间有27个蛋白质含量差异有统计学意义(P0.05),其中18个M/Z峰在大肠癌中高表达,9个M/Z峰在健康人中高表达。(2)经分析获得由M/Z为2770.34,7971.57,11493.00 3个质谱峰建立的诊断模型,在48例大肠癌患者中有38例被正确分组,34例健康人中32例被正确分组,灵敏度和特异性分别为79.17%(38/48)和94.12%(32/34)。(3)验证研究中经盲法测定灵敏度和特异性分别为72.73%(24/33)和91.18%(31/34)。结论SELD1-TOF-MS技术具有快速、准确、灵敏度和特异性高的优点,通过蛋白芯片仪发现的特异性相关蛋白,有望成为大肠癌早期诊断中有应用价值的临床检测指标。     

血清蛋白质指纹图谱模型在肾癌诊断中的应用

目的 探讨肾癌早期诊断的新方法。方法 血清标本66份，其中肾癌患者34份，健康对照组32份，应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术获得WCX2蛋白芯片表达图谱，采用Biomarker Patterns^TM软件分析差异蛋白并初步建立肾癌血清标志物诊断模型。结果 在相对分子质量1000～50000范围内共检测到101个蛋白峰，其中7个有统计学意义（P〈0．01）。所建立肾癌诊断模型敏感性为88％（30／34），特异性为91％（29／32）。采用此模型盲法分析42份未知血清标本，敏感性为80％（16／20），特异性为82％（18／22）。结论 用SELDI—TOF—MS技术平台和生物信息学技术建立的诊断模型为肾癌早期诊断提供了新途径。     

SELDI-TOF-MS技术在胰腺癌诊断中的应用

目的 应用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)从胰腺癌患者血清中筛选标志蛋白,找出最佳的标志蛋白组合模式作为临床诊断指标.方法 收集29例胰腺癌患者血清标本和57例年龄、性别相匹配的非癌人群血清标本作为对照.采用SELDI技术检测其蛋白质指纹图谱表达,所得到的结果采用Biomarker Wizard及Biomarker Patterns system软件分析,筛选最终可能用于胰腺癌诊断的蛋白标志物并优化组合建立胰腺癌诊断模型.结果 发现胰腺癌患者和对照组血清蛋白质指纹图谱之间有26个差异表达特异性蛋白,分析系统筛选出一组包含4个标志蛋白(5705、4935、5318和3243 Da)建立起一个胰腺癌的诊断模型,对胰腺癌诊断的敏感性为100%,特异性97.4%.盲法验证此模型敏感性88.9%、特异性89.5%.结论 SELDI-TOF-MS技术的特异性及敏感性远远高于目前所采用的某一单独标志物的血清学诊断,其结果对进一步研究胰腺癌的蛋白质组学改变及其临床诊断应用可能具有重要意义.     

SELDI-TOF-MS在肿瘤性胆囊息肉样病变诊断中的作用

目的 寻找肿瘤性胆囊息肉样病变(PLG)患者血清中的特异性蛋白,并建立诊断模型.方法 应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)和WCX型磁珠检测23例肿瘤性PLG、21例非肿瘤性PLG和26例正常人的血清蛋白质指纹图谱,并联合应用Biomarker wizard及Biomarker Patterns Software软件分析处理数据.结果 初步筛选出对诊断肿瘤性PLG有代表性的22个特异性蛋白,分析系统在设定条件下筛选出3个特异性蛋白(5064.52 Da,7916.33 Da,7643.32 Da)用于建立肿瘤性PLG的诊断模型.此模型对肿瘤性胆囊息肉样病变诊断的敏感度为100%,特异度为89.4%.结论 SELDI-TOF-MS技术可筛选出肿瘤性PLG的特异性蛋白并建立起肿瘤性PLG的诊断模型.     

下咽鳞癌患者血清比较蛋白质组学研究

目的 从蛋白质组学角度探讨下咽癌血清蛋白质组指纹图谱.方法 采集58例下咽癌患者和41正常对照者血清,应用CM10芯片和PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机检测,对下咽癌组和正常组及下咽癌组内不同亚组间的血清蛋白质指纹图谱比较,寻找相关差异蛋白,初步建立分类树诊断模型和放疗敏感性预测模型.结果 下咽癌组与正常对照组间有9个差异蛋白质峰(P<0.05);建立的下咽癌决策分类树诊断模型诊断符合率为90.10%;下咽癌颈淋巴结转移组和无转移组差异无统计学意义(P>0.05);分化较差组和分化较好组有1个蛋白差异有统计学意义(P<0.05);化疗敏感组和不敏感组差异无统计学意义(P>0.05);放疗敏感组和不敏感组比较,P≤0.05时有5个差异蛋白峰,均在放疗敏感组高表达.Biomarker Pattern软件建立的下咽癌放疗敏感性分类树预测模型,灵敏度100.00%,特异度83.33%.结论 下咽癌和正常对照比较血清中存在特异性的差异表达蛋白,下咽癌放疗敏感组患者血清中m/z为6115.75的蛋白较放疗不敏感组高表达(P<0.01).     

Proteomic analysis of resectable non-small cell lung cancer: post-resection serum samples may be useful in identifying potential markers

Surface-enhanced laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) can be used to analyse peptides and proteins in clinical samples. A prospective study was undertaken on patients undergoing curative resection for non-small cell lung cancer (NSCLC): we used SELDI-TOF-MS to compare the proteomic profiles of serum from these patients both before surgical resection and after resection (disease-free) to identify potential biomarkers. Student t-tests were used, and a P-value of <0.01 was considered significant. Twenty-five patients with NSCLC [76% male, mean age 69 (range 53-81) years] were analysed. There were 13 squamous cell carcinomas, 10 adenocarcinomas and 2 large cell carcinomas with a stage distribution of four stage IA, 11 stage IB, five stage IIB, three stage IIIA, one stage IIIB and one stage IV. SELDI spectra generated with immobilised metal affinity chromatography arrays produced 170 peaks. Of these, 35 showed significant differences in their intensities between the preoperative and post-resection states (P<0.01). Postoperative samples in the disease-free state may represent good controls to identify biomarkers in NSCLC, avoiding the difficulties associated with cross-sectional studies. These pilot data need to be validated with larger numbers of patients.     

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??Study of searching for the serum proteomic patterns of early liver metastasis of colorectal cancer by SELDI- TOF-MS CAI Xiang-jun*??WANG Fu-rong, WANG Chun-xi, et al. *Department of General Surgery, 202 Hospital of PLA??Shenyang110003,China
Corresponding author: CAI Xiang-jun, E-mail??caixiangjun61@126.com
Abstract Objective To detect the serum proteomic patterns in early liver metastasis of colorectal cancer patients by surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry (SELDI- TOF-MS). Methods The relative contents of serum proteins of 20 colorectal cancer patients and 20 early liver metastasis of colorectal cancer patients were detected by WCX2 chip and SELDI-TOF-MS between 2007 and 2009 in 202 Hospital of PLA. Results At the M/Z values range from 2000u to 30 000u, the contents of two proteins (3774u and 11 851u) had significant difference in the two groups. Conclusions SELDI-TOF-MS shows great potentiality for early liver metastasis of colorectal cancer in diagnosis and screening of tumor biomarkers, and deserves generalization.     

SELDI-TOF-MS在筛选结直肠癌相关生物标记物中的应用

表面增强激光解吸/电离-飞行时间-质谱(surface-enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)是一项新的蛋白质组学技术,近年来运用该技术发现了一些能用于结直肠癌早期诊断、术前分期或预测放化疗疗效的新的牛物标记物,其敏感性和特异性均高于传统的生物标记物.SELDI-TOF-MS可能会对结直肠癌的早期诊断和个体化治疗带来帮助.