谷胱甘肽-S-转移酶P1基因多态性与炎症性肠病易感性的Meta分析

目的研究谷胱甘肽-S-转移酶P1(GSTP1)基因多态性与炎症性肠病(IBD)发病的关系。方法全面检索和筛选相关文献,通过Meta分析的方法对纳入研究结果进行数据合并,计算比值比(OR值)及95%的可信区间(95%CI),并评价其发表偏倚,运用敏感性分析评价结果的可靠性。结果实际纳入文献6篇,共包括1 219例溃疡性结肠炎(UC)患者,538例克罗恩病(CD)患者和正常对照组2 403例,进行Meta分析和关联性研究;GSTP1基因多态性与UC显性基因模型、隐性基因模型及等位基因的P值、合并OR值及95%CI分别如下:(GG+GA)vs.AA:P=0.05,OR=1.76,95%CI 1.00~3.08;GG vs.(GA+AA):P=0.03,OR=1.52,95%CI 1.05~2.21;G vs.A:P=0.03,OR=1.59,95%CI 1.04~2.45。我们根据种族的不同进行亚组分析,中国汉族人群显性基因模型、隐性基因模型及等位基因的P值、合并OR值及95%CI分别如下:(GG+GA)vs.AA:P<0.000 01,OR=2.20,95%CI 1.79~2.71;GG vs.(GA+AA):P<0.000 01,OR=1.82,95%CI 1.51~2.20;G vs.A:P<0.000 01,OR=1.89,95%CI 1.66~2.17。我们共检索到2篇欧洲人群GSTP1基因多态性与CD关系的研究,其显性基因模型、隐性基因模型及等位基因的P值、合并OR值及95%CI分别如下:(GG+GA)vs.AA:P=0.92,OR=1.03,95%CI 0.59~1.81;GG vs.(GA+AA):P=0.53,OR=1.40,95%CI 0.49~4.00;G vs.A:P=0.75,OR=1.09,95%CI 0.66~1.79。结论 GSTP1基因多态性可能是中国汉族人群UC的危险因素,其与中国汉族人群UC关系尚缺乏相关研究,GSTP1基因多态性与欧洲人群UC和CD的发病风险可能无明显关联。     

eNOS基因G894T多态性与糖尿病肾病易感性的荟萃分析

目的:系统评价内皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,eNOS)基因G894T多态性与糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)易感性之间的关系。方法:全面检索建库以来至2019年6月与eNOS基因G894T多态性及DN易感性相关的文献,通过纽卡斯尔渥太华(Newcastle-Ottawa Scale,NOS)标准对纳入文献进行质量评价。采用Stata 15.0进行统计学分析,通过计算发病风险比值比(odds ratio,OR)及95%置信区间(confidence interval,CI)来评估eNOS基因G894T多态性与DN易感性之间的关系。结果:共纳入29项病例对照研究,包含实验组5345例,对照组4827例。分析结果显示eNOS基因G894T多态性可显著增加DN发病风险[等位基因模型T vs G:OR=1.39(95%CI:1.19~1.64),P<0.001;纯合子模型TT vs GG:OR=1.34(95%CI:1.02~1.77),P=0.038;显性遗传模型TT+GT vs GG:OR=1.48(95%CI:1.21~1.81),P<0.001;隐性遗传模型TT vs GG+GT:OR=1.30(95%CI:1.04~1.63),P=0.022;杂合子模型TG vs GG:OR=1.43(95%CI:1.17~1.75),P=0.001]。结论:eNOS基因G894T多态性可明显增加DN易感性。     

TNF-α-308基因多态性与胃癌易感相关性的meta分析

目的分析肿瘤坏死因子-α(TNF-α)启动子308位点多态性与胃癌易感性的关系。方法检索Pubmed、Embase、Web of Science、Cochrane library、万方数据和中国知网数据库中有关TNF-α-308基因多态性与胃癌发病风险的病例对照研究,时间截至2022年6月。由2位研究者独立进行文献筛选、提取数据及评价偏倚风险,通过Stata16.0软件进行Meta分析。结果纳入41项病例-对照研究,共7528例胃癌患者和10924例对照。Meta分析结果显示:等位,杂合和显性模型TNF-α-308位点多态性与增加胃癌患病风险相关[A vs G:OR=1.21,95%CI(1.01,1.44),P=0.039;AG vs GG:OR=1.26,95%CI(1.07,1.49),P=0.392;AA+AG vs GG:OR=1.22,95%CI(1.00,1.47),P=0.046]。5项由幽门螺旋杆菌感染引发胃癌的研究结果显示,TNF-α-308位点多态性与幽门螺旋杆菌感染的胃癌易感无关。亚组分析显示,亚洲地区[A vs G:OR=1.29,95%CI(1.04,1.61),P=0.022;AG vs GG:OR=1.35,95%CI(1.06,1.71),P=0.014;AA+AG vs GG:OR=1.36,95%CI(1.07,1.73),P=0.013]和非洲所有遗传模型TNF-α-308位点多态性与增加胃癌发病风险相关(P<0.05),美洲和欧洲任何遗传模型下均未显示二者关联;Taqman分型研究中所有遗传模型均显示TNF-α-308多态性与增加胃癌患病风险相关(P<0.05)。结论亚洲地区TNF-α-308位点多态性可能与增加胃癌易感风险有关;TNF-α-308位点多态性与幽门螺旋杆菌感染的胃癌易感无关。     

鼠双微粒体2 基因 rs1625525 和rs1196336 位点基因多态性与乳腺癌遗传易感性的相关性研究

目的 探讨鼠双微粒体 2（murine double minute 2,MDM2）基因 rs1625525,rs1196336两个位点多态性与乳腺癌遗传易感性的关系。方法 选取 2021年 1月～12月中国人民解放军联勤保障部队第九二三医院收治的乳腺癌患者 176例,乳腺良性瘤患者 156例,同期女性健康体检者 203例作为研究对象,采用多重 SNaPshot技术检测 MDM2基因 rs1625525A/G和 rs1196336A/T两个位点的基因多态性,比较各组两位点基因型和等位基因频率,分析两个位点多态性与乳腺癌遗传易感性的关系。结果 MDM2基因 rs1625525位点的 AA,AG和 GG基因型在乳腺癌组的基因型频率分别为 48.9%,39.2%和 11.9%,在对照组的基因型频率分别为 50.7%,44.3%和 5.0%。三种基因型在对照组与乳腺癌组分布频率差异有统计学意义（χ2=6.314,P<0.05）, GG基因型和隐性模型可能增加乳腺癌的患病风险 (OR=2.522, 95%CI:1.115～5.708,P=0.026;OR=2.699,95%CI:1.221～5.966,P=0.014）。 rs1196336位点在共显性模型、显性模型、隐性模型和等位基因模型与乳腺癌患病风险均无明显相关性（OR=1.045,95%CI:0.686～1.591;OR=1.048, 95%CI:0.402～2.728; OR=1.045,95%CI:0.694～1.574; OR=1.026,95%CI:0.403～2.613;OR=1.031, 95%CI:0.747～1.423,均 P>0.05）。结论 MDM2基因 rs1625525位点 GG基因型和隐性模型可能增加乳腺癌的患病风险 , rs1196336位点基因多态性与乳腺癌的发病风险无明显相关性。     

白细胞介素相关基因多态性与尘肺易感性系统评价与meta分析

目的综合分析白介素(interleukin,IL)相关基因多态性与尘肺病的易感关联性。方法检索PubMed、the Cochrane Library、Embase、中国知网、WanFang Data、VIP、CBM等数据库,检索时间为建库至2022年1月8日。2名研究者独立提取资料并评价文献偏倚风险。采用RevMan 5.2以及Stata 14.0软件,分别以等位基因模型、显性模型、隐性模型、共显性模型(2种)、超显性模型等对IL相关基因多态性与尘肺病易感的关联进行meta分析。结果共纳入29篇文献,共计尘肺病例组5315例,对照组5332例。8项关于IL-1β(-511)C/T多态位点meta分析结果显示,隐性模型(OR=1.57,95%CI=1.06~2.33,P=0.024)、共显性模型TT vs CC(OR=1.80,95%CI=1.03~3.13,P=0.039)与尘肺的易感风险相关。6项关于IL-1RA(+2018)T/C多态性分析结果显示,等位基因模型(OR=1.65,95%CI=1.21~2.27,P=0.002)、显性模型(OR=1.65,95%CI=1.11~2.46,P=0.013)、隐性模型(OR=2.14,95%CI=1.50~3.06,P=0.000)、共显性模型(CC vs TT)(OR=2.29,95%CI=1.58~3.32,P=0.000)与尘肺的易感风险有关。4项有关IL-1α(-889)C/T多态位点的meta分析结果显示,显性模型(OR=1.75,95%CI=1.02~3.01,P=0.042)、共显性模型CT vs CC(OR=1.79,95%CI=1.21~2.636,P=0.004)与尘肺的易感风险相关。3项关于IL-1α(+4845)G/T多态位点的meta分析结果显示,等位基因模型(OR=1.59,95%CI=1.03~2.56,P=0.038)与尘肺的易感风险相关。4项关于IL-6(-634)C/G多态位点的meta分析结果显示等位基因模型(OR=0.60,95%CI=0.47~0.75)、显性模型(OR=0.47,95%CI=0.35~0.64)、共显性模型(OR=0.63,95%CI=0.42~0.94)(OR=0.36,95%CI=0.24~0.54)、超显性模型(OR=2.51,95%CI=1.71~3.69)与尘肺的易感风险有关。2项研究meta分析结果显示,IL-8(781)C/T、IL-8 Met31Arg T/G、IL-8(-251)A/T多态性与尘肺的易感风险有关联。而IL-1β(+3953)C/T、IL-6(-174)G/C、IL-10(-592)A/C多态位点及其他白介素相关基因的多种基因模型的分析结果均显示与尘肺的易感风险无关。结论IL-1RA(+2018)T/C、IL-6(-634)C/G多态位点与尘肺的易感风险显著相关;IL-1α(+4845)G/T、IL-1β(-511)C/T、IL-1α(-889)C/T多态位点与尘肺的易感风险可能有关;IL-1β(+3953)C/T、IL-6(-174)G/C多态位点与尘肺病的易感风险无关联;后续仍需多中心大样本量的研究进一步探讨分析。     

Pre-miR-146a rs2910164基因多态性与癌症易感性的荟萃分析

目的探讨pre-miR-146a rs2910164(CG)位点多态性与癌症易感性的关系。方法通过Pubmed和Embase数据库全面检索相关文献,用固定效应模型或随机效应模型进行数据合并,用STATA 12.0软件分析,并由Begg漏斗图和Egger检验来评估发表偏倚。结果 37篇文献被纳入分析,包括18 736例癌症患者和25 417例对照者。用荟萃(meta)分析结合风险比(odd ratio,OR)及95%可信区间(CI)分析,发现rs2910164与整个癌症易感性无显著关联。种族分层分析发现,rs2910164 G等位基因可增加亚洲人群(GG vs CC:OR=1.19,95%CI=1.02~1.39;GG vs GC+CC:OR=1.11,95%CI=1.00~1.23)、降低高加索人群(GG vs GC+CC:OR=0.89,95%CI=0.80~0.99)对癌症的易感性。癌症类型的分层分析发现,rs2910164G等位基因与肝细胞癌(GG vs CC:OR=1.47,95%CI=1.19~1.80;GG vs GC+CC:OR=1.25,95%CI=1.05~1.47)的易感性相关。结论 rs2910164 G等位基因可增加亚州人群、降低高加索人群对癌症的易感性,并与肝细胞癌的易感性相关。     

APE1 T1349G基因多态性和膀胱癌易感性的关系

目的探讨脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(APE1)T1349G基因多态性与膀胱癌易感性的关系。方法采用前瞻性研究,选取2013年1月至2017年1月诊治的膀胱癌患者297例为研究对象,选取同期健康体检者300例为对照组。采集各受试者外周静脉血并提取基因组DNA,采用两对引物-聚合酶链式反应(PCR-CTPP)检测APE1基因多态性并分析是否符合哈迪-温伯格平衡(HWE)定律;采用Logistic回归分析APE1基因多态性与膀胱癌易感性之间的关系。结果 APE1在1349位点存在单核苷酸多态性,分别为野生型纯合子TT型、突变杂合子TG型、突变纯合子GG型。APE1 T1349G基因多态性基因型频率分布符合哈迪-温伯格平衡(HWE)定律。APE1 1349GG基因型发生膀胱癌的风险显著高于APE1 1349TT基因型(OR=2.18,95%CI=1.99~2.39,P0.05),APE1 1349TG基因型发生膀胱癌的风险高于APE1 1349TT基因型(OR=1.12,95%CI=0.95~1.32,P0.05);APE1 1349位点等位基因T颠换为G,发生膀胱癌的风险显著升高(OR=1.89,95%CI=1.69~2.11,P0.05)。APE1 T1349G多态性位点各基因型与膀胱癌患者的病理分级和TNM分期无明显相关性(P0.05)。结论 APE1 T1349G基因多态性与膀胱癌发病有关,该基因位点GG基因型以及G等位基因可增加膀胱癌的发病风险。     

人类ErbB2转录因子1基因多态性与陕西汉族人群胃癌的关系研究

目的探讨人类ErbB2转录因子1(TOB1)基因多态性与陕西汉族人群胃癌之间的关系。方法选取320例胃癌患者为胃癌组,350例经胃镜检查及病理活检排除胃癌的门诊患者为对照组,对TOB1基因4个候选单核苷酸多态性(SNP)位点(rs61482741、rs34700818、rs12601477、rs4626)进行基因分型。分析TOB1基因候选SNP位点等位基因、基因型、显性模式和隐性模式频率与胃癌风险的关系;分析TOB1基因候选SNP位点连锁不平衡情况。结果胃癌组与对照组TOB1基因4个候选SNP位点基因分型结果均符合哈迪-温伯格平衡(P0.05)。TOB1基因易感位点包括内含子区域rs61482741位点G等位基因(P=0.011,OR=1.42,95%CI=1.15～1.78)、GG基因型(P=0.016,OR=1.91,95%CI=1.18～3.23)、显性模式GG+CG基因型(P=0.032,OR=1.44,95%CI=1.05～1.93)、隐性模式GG基因型(P=0.043,OR=1.68,95%CI=1.03～2.74);外显子区域rs4626位点G等位基因(P=0.006,OR=1.41,95%CI=1.16～1.76)、GG基因型(P=0.006,OR=1.85,95%CI=1.20～2.85)、显性模式GG+AG基因型(P=0.023,OR=1.53,95%CI=1.10～2.16)、隐性模式GG基因型(P=0.028,OR=1.56,95%CI=1.09～2.21);内含子区域rs34700818和rs12601477位点等位基因、基因型、显性模式和隐性模式频率在胃癌组与对照组间比较,差异均无统计学意义(P0.05)。结论TOB1基因内含子区域rs61482741和外显子区域rs4626位点可能是陕西汉族人群胃癌高风险易感基因位点。     

CTLA-4+49A/G基因多态性与结直肠癌易感性的荟萃分析

目的探讨细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)外显子上49位点基因多态性与结直肠癌易感性的关系。方法通过计算机检索和手工检索,收集CTLA-4+49A/G基因多态性与结直肠癌易感性关系的病例-对照研究,筛选出符合条件的文献,应用荟萃(meta)分析软件对各项研究进行异质性检验,计算合并OR值及其95%可信区间(CI),并进行发表偏移的评估。结果国内外共有7篇文献纳入研究(结直肠癌患者1 084例,对照组1 934例);meta分析结果显示,CTLA-4+49A/G基因多态性在全部人群中与结直肠癌有相关性:显性遗传模型(AG+GG vs AA:OR=1.81,95%CI=1.17~2.81,P0.05);隐性遗传模型总体无统计学意义(P0.05)。人群分层分析发现,CTLA-4+49A/G基因多态性与结直肠癌易感性在亚洲人群中有相关性:显性遗传模型(AG+GG vs AA:OR=2.42,95%CI=1.40~4.16,P0.05);隐性遗传模型总体无统计学意义(P0.05)。但与欧洲人群结直肠癌易感性无明显相关:显性遗传模型(AG+GG vs AA:OR=0.93,95%CI=0.65~1.33,P0.05);隐性遗传模型无统计学意义(P0.05)。结论 CTLA-4+49A/G基因多态性与结直肠癌易感性相关,但主要表现在亚洲人群。     

系统评估多个基因多态性位点与鼻咽癌易感性关联的Meta分析

目的统的评估基质金属蛋白酶(MMP)-1基因1G/2G、MMP-2基因-1306C>T、CYP2E1基因RsaⅠ和MDM2基因309T>G多态性位点与鼻咽癌易感性的关联。方法检索Pub Med、万方和CNKI数据库,筛得1G/2G、-1306C>T、RsaⅠ和309T>G基因多态性与鼻咽癌易感性关联的病例-对照研究。采用Stata 12.0软件对纳入各项研究进行统计学分析。结果本文共纳入13项病例-对照研究,包含病例组3 752例,对照组4 526例。Meta分析结果提示,MMP-2基因-1306C>T多态性位点与鼻咽癌易感性呈显著正相关:B vs.A:OR=1.657,95%CI:1.316~2.086,P=0.000;BB vs.BA+AA:OR=1.710,95%CI:1.342~2.179,P=0.000。此外,我们还发现CYP2E1基因RsaⅠ多态性位点与鼻咽癌易感性呈显著正相关:BB vs.AA:OR=3.218,95%CI:1.622~6.385,P=0.001;BB vs.BA+AA:OR=3.468,95%CI:1.760~6.834,P=0.000。然而,MMP-1基因1G/2G和MDM2基因309T>G多态性位点与鼻咽癌易感性无关。在以种族为依据的亚组分析中,可发现MDM2基因309T>G多态性位点与亚洲人群鼻咽癌易感性无关。结论 MMP-2基因-1306C>T和CYP2E1基因RsaⅠ多态性位点与鼻咽癌易感性呈显著正相关,可作为该疾病诊断和筛查的潜在靶点。     

中国人群脂联素基因启动子区-11377C/G位点多态性与2型糖尿病易感性的Meta 分析

目的 探讨中国人群脂联素基因启动子区-11377C/G位点多态性与2型糖尿病易感的相关性.方法 检索2011年11月前中国生物医学文献数据库(CBM)、中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据库、维普中文科技期刊数据库(VIP)及Medline、Cochrane Library、Embase、Springer、Ovid等数据库,收集有关中国人群脂联素基因-11377C/G多态性与2型糖尿病的相关性研究;评价纳入研究质量,提取有效数据,采用Review Manager5.0软件进行Meta分析.结果 共纳入12组研究中国人群脂联素基因启动子区-11377C/G位点多态性与2型糖尿病的相关性的病例-对照研究,2型糖尿病病例2 598例,对照4 508例.Meta分析发现,脂联素基因启动子区-11377C/G位点C/G多态性与2型糖尿病相关性中G等位基因与C等位基因[OR=1.14,95%CI(1.03,1.25),P=0.009]、基因型(CG+GG)与CC[OR=1.19,95%CI(1.06,1.35),P=0.004]、基因型CG与CC[OR=1.14,95%CI(1.00,1.29),P=0.05]、基因型GG与CC[OR=1.34,95%CI(1.06,1.71),P=0.02]均具有统计学意义差异.结论 中国人群脂联素基因启动子区-11377C/G位点多态性与2型糖尿病易感性存在相关性.     

NKX2.5基因c.63 A＞G多态性与先天性心脏病关联性的荟萃分析

目的系统评价NKX2.5基因c.63 A>G多态性与先天性心脏病(CHD)发病风险的相关性。方法计算机检索PubMed、Web of Science、中国知网、万方等数据库,检索时限截至2019年5月31日,获取有关NKX2.5基因c.63 A>G多态性与CHD关联性的病例-对照研究,采用Stata 12.0软件进行荟萃(meta)分析。选择优势比(OR)和95%置信区间(CI)分析NKX2.5基因多态性与CHD的潜在发病风险,根据异质性检验结果选择固定或随机效应模型进行数据合并,并采用漏斗图和Egger′s检验评价发表偏倚。结果共纳入18篇文献,研究对象共计4 987例。Meta分析结果显示,NKX2.5基因c.63 A>G多态性与CHD发病风险无关联(GG vs AA:OR=1.13,95%CI:0.79~1.61,POR=0.494;GA vs AA:OR=1.05,95%CI:0.75~1.49,POR=0.77;G vs A:OR=1.09,95%CI:0.88~1.35,POR=0.415)。按照国别进行亚组分析结果显示,NKX2.5基因c.63 A>G多态性与CHD易感性在中国及非中国人群中均无相关性;而按照CHD疾病分型进行亚组分析显示,GA基因型的人群ASD发病风险低于AA基因型。结论 NKX2.5基因c.63 A>G多态性可能与ASD的发病有关,但仍需更大样本高质量的病例-对照研究进一步验证。     

环氧化酶2蛋白与食管癌关系的系统评价

目的 系统评价环氧化酶2(cyclooxygenase-2,Cox-2)表达水平与食管癌的关系.方法 计算机检索Cochrane Libtary(2011年第1期),PubMed、CNKI等数据库,并辅以手工检索,按照纳入与排除标准选择病例对照试验.评价质量及提取资料后,采用STATA11.0软件对所收集的数据进行系统评价.结果 共纳入18个研究,其中食管癌患者1 471例,正常对照551例.Meta分析结果显示:Cox-2在食管癌组及正常对照组的表达差异具有统计学意义[比值比(odds ratio,OR) =24.59,95％可信区间(confidence interval,CI) =8.64～70.02,P＜0.05].临床病理结果显示:Cox-2在食管癌侵及纤维膜与未侵及纤维膜(OR =3.46,95％CI=1.74～6.89),淋巴结转移组与非淋巴结转移组(OR=2.04,95％ CI =1.12～3.72)的表达差异均具有统计学意义(P＜0.05).Cox-2在食管癌男性组与女性组(OR =1.13,95％ CI =0.81～1.58),年龄＜60岁组与≥60岁组(OR =1.06,95％CI =0.68～1.65),肿瘤直径＜5 cm与≥5 cm(OR=1.52,95％CI=0.90～2.57),中上段与下段(OR =0.63,95％CI=0.36～1.09),低分化与中高分化(OR =0.49,95％CI=0.23～1.08),T3～T4期与T1～T2期(OR =2.30,95％CI =0.96～5.52),Ⅲ～Ⅳ期与Ⅰ～Ⅱ期(OR =1.25,95％ CI =0.64～2.44)的表达差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 Cox-2在食管癌中高表达,并且其高表达增了食管癌纤维膜浸润、淋巴结转移的危险性.     

中国人群脂联素基因+276G/T位点多态性与T2DM易感性的Meta分析

目的 探讨中国人群脂联素基因+276G/T位点多态性与2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 检索2011年8月前中国知网、维普中文科技期刊全文数据库、中国万方数据库、中国学位论文全文数据库和中国重要会议论文全文数据库及Medline、Cochrane Library、Embase、Springer、Ovid等数据库,收集有关中国人群脂联素基因+276G/T位点多态性与T2DM相关性研究的文献;评价纳入研究质量,提取有效数据,采用Review Manager 5.0软件进行Meta分析.结果 共纳入11项研究中国人群脂联素基因+276G/T位点多态性与T2DM相关性的病例对照研究;T2DM患者1 697例,健康对照者1 341例.Meta分析结果显示,脂联素基因+276G/T位点G/T多态性与T2DM的相关性中T等位基因与G等位基因(OR=0.83,95% CI为0.65～1.05,P=0.12)、基因型(GT+TT)与GG(OR=0.82,95% CI为0.60～1.12,P=0.20)、基因型GT与GG(OR=0.93,95%CI为0.63～1.38,P=0.72)、基因型TT与GG(OR=0.81,95%CI为0.46～1.42,P=0.46)比较,差异均无统计学意义.结论 中国人群脂联素基因+276G/T位点多态性可能与T2DM易感性无关.     

北京地区新生儿细胞色素P450单核苷酸多态性及其代谢表型分布的研究

目的 了解北京地区新生儿细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)重要单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点及其代谢表型的分布情况,为儿童的精准用药提供支持。方法 利用Taqman-PCR方法检测1 000例新生儿的CYP2D6(100C>T),CYP2C9(1075A>C),CYP2C19(681G>A),CYP2C19(636G>A),CYP3A4(878T>C)和CYP3A5(6986A>G)位点基因型及等位基因频率,并计算其代谢表型分布。结果 ①CYP2D6(100C>T)和CYP3A5(6986A>G)位点的杂合型基因型频率较高,分别为51.7%和44.9%。CYP3A5(6986A>G)位点的突变型等位基因频率较高,为61.8%。②CYP2D6,CYP2C9和CYP3A4均以快代谢型为主,检出率分别为79.0%,99.8%和100%。慢代谢型主要是CYP2C19和CYP3A5基因,检出率分别为12.5%和39.4%。③CYP450各亚型基因型分布在不同性别间比较差异均无统计学意义(χ²=0.113～3.316,均P>0.05)。结论 CYP3A5(6986A>G)和CYP2D6(100C>T)在新生儿人群中的突变频率较高,CYP3A5和CYP2C19的慢代谢型人群分布较高,在临床用药中要注意结合基因检测结果来确定用药剂量。     

Aberrant splicing caused by single nucleotide polymorphism c.516G>T [Q172H], a marker of CYP2B6*6, is responsible for decreased expression and activity of CYP2B6 in liver

CYP2B6 is a polymorphic human drug metabolizing cytochrome P450 with clinical relevance for several drug substrates including cyclophosphamide, bupropion, and efavirenz. The common allele CYP2B6*6 [c. 516G>T, Q172H, and c.785A>G, K262R] has previously been associated with lower expression in human liver and with increased plasma levels of efavirenz in human immunodeficiency virus patients, but the molecular mechanism has remained unclear. We present novel data showing that hepatic CYP2B6 mRNA levels are reduced in *6 carriers, suggesting a pretranslational mechanism resulting in decreased expression. As one possibility, we first analyzed the common promoter variant, -750T>C, but the results did not suggest a prominent role in phenotype determination. In contrast, analysis of liver mRNA splicing variants demonstrated that the most common form lacking exons 4 to 6 (SV1) was tightly associated with the *6 allele and apparently also with the rare variant c.777C>A(CYP2B6*3). Further investigation using minigene constructs transfected into eukaryotic cell lines COS-1 and Huh7 demonstrated that the single nucleotide polymorphism c.516G>T in allele CYP2B6*6 was alone responsible for aberrant splicing resulting in high-splice variant (SV) 1 and low-CYP2B6 expression phenotype. Minigenes carrying the single c.785A>G polymorphism or the rare c.777C>A variant resulted in normal and intermediate expression phenotypes, respectively. In conclusion, the mechanism of the common *6 allele involves predominantly aberrant splicing, thus leading to reduced functional mRNA, protein, and activity. These results establish the single nucleotide polymorphism 516G>Tasthe causal sequence variation for severely decreased expression and function associated with CYP2B6*6.     

Additive effect of interleukin-6 and C-reactive protein (CRP) single nucleotide polymorphism on serum CRP concentration and other cardiovascular risk factors

BACKGROUND: Serum C-reactive protein (CRP) levels, closely associated with cardiovascular disease (CVD) risk are influenced by CRP or interleukin-6 (IL-6) single nucleotide polymorphism (SNPs). However, it is still controversial. Therefore, we investigated the association of IL-6/CRP SNPs and serum CRP levels or other CVD risk factors in healthy adult Korean men. METHODS: In healthy adult men (age>or=20 years, n=677), we genotyped IL-6-572C>G and CRP SNPs (-717G>A, 1444C>T, 2147A>G) and measured anthropometric parameters, lipid profile, serum levels of CRP and IL-6 and insulin resistance. RESULTS: At IL-6-572C>G (n=677), subjects with G/G genotype (n=42) showed higher concentrations of CRP (P=0.027) and IL-6 (P=0.028) as compared with C allele carriers after age-adjustment (C/C: n=371, C/G: n=264). Fasting insulin and homeostatis model assessment insulin resistance (HOMA-IR) were also higher in G/G genotype. However, there were no significant differences in other metabolic biomarkers. Among 677 study subjects, 676 were genotyped at CRP-717G>A (G/G: n=513, G/A: n=150, A/A: n=13), 672 at CRP+1444C>T (C/C: n=580, C/T: n=85, T/T: n=7), and 668 at CRP+2147A>G (A/A: n=273, A/G: n=296, G/G: n=99). There were no significant differences in CRP concentrations and other markers related to CVD risk according to each CRP SNP genotype. However, we could find the additive gene-gene interaction between IL-6-572C>G and CRP SNPs on CRP concentration; subjects with the 'G/G' at IL-6-572 showed the highest CRP levels when they have variant allele at CRP SNPs after adjusted for age, body mass index, cigarette smoking and alcohol drinking (-717G>A: F=7.806, P=0.005; CRP+1444C>T: F=8.398, P=0.004; and CRP+2147A>G: F=7.564, P=0.006, respectively) Particularly, G allele carriers at CRP+2147A>G in subjects with IL-6-572G/G showed highest HOMA-IR (F=9.092, P=0.003). CONCLUSION: The present data showed that serum CRP levels and other CVD risk factors appeared more influenced by IL-6-572C>G rather than CRP SNPs (-717G>A, 1444C>T, and 2147A>G), however CRP levels and insulin resistance may be additively affected by IL-6-572 and CRP SNP, particularly when subjects with G/G genotype at IL-6-572 have allele variant at CRP SNPs.     

定量评估PD-1多态性rs10204525与中国人上消化道癌症风险的相关性分析

目的系统评估PD-1多态性rs10204525和中国人上消化道癌症（UGIC）风险的相关性。 方法通过计算机检索PubMed、MEDLINE和中国知网等数据库,共纳入4项研究（2536例UGIC病例和3491例对照人群）,应用Stata统计包12.0进行荟萃分析,采用95%置信区间（CI）的合并的比值比（OR）评价PD-1多态性rs10204525与中国人UGIC风险的相关性。 结果荟萃分析显示：rs10204525在纯合子（GG vs AA：OR=0.81,95% CI=0.58~1.15,P=0.236）、杂合子（AG vs AA：OR=0.97,95% CI=0.87~1.08,P=0.523）、显性（AG＋GG vs AA：OR=0.95,95% CI=0.86~1.05,P=0.333）、隐性（GG vs AG＋AA：OR=0.82,95% CI=0.58~1.16,P=0.263）和等位（T vs C：OR=0.95,95% CI=0.88~1.03,P=0.211）基因模型中,与中国人UGIC风险没有相关性。 结论PD-1的多态性rs10204525与中国人UGIC风险没有显著相关性,这个结论在纯合子、杂合子、显性、隐性和等位基因模型中均成立。