特发性男性不育常见基因的SNP与易感性研究进展

单核苷酸多态性(SNP)是指某一人群的正常个体基因组内特定核苷酸位置上存在不同碱基,且最少的一种等位基因频率不小于1%.是人类基因组中分布最为广泛、存在数量最多的一种变异,反映了个体表型、疾病易感性和对药物、环境因素反应的差异.作为第三代分子遗传标记,SNP的高密度性、稳定性和二态性使其具有易于分型检测的优势.而随着人类基因组单体型图(HapMap)计划的实施,由SNP等位位点组成的单体型也成为近年来遗传学研究的组成部分.现就精子生成和成熟相关基因SNPs与特发性男性不育易感性关系进行综述,并分析其在男性不育的病因学诊断等方面的应用前景和目前存在的问题.     

单核苷酸多态性

在人类基因组核苷酸序列中 ,大约 5 0 0～ 10 0 0碱基对中就有 1个碱基发生中性变异 (不包括缺失、插入和重复 ) ,当人群中这种变异的频率 >2 %时 ,就称其为单核苷酸多态性(SNP)。在理论上 ,SNP有以下 4种类型 :C T(G A)、C A(G T)、C G(G C)、A T(T A) ,以转换形式为常见。SNP是形成人类个体差异的遗传基础。SNP作为遗传标记 ,由于其在基因组上密度大 ,可用于基因的精细定位和克隆。某些SNP对某些疾病、药物、环境因素敏感 ,反之亦然 ,故研究SNP对于阐明疾病易感性机制、设计个体化治疗方案和环境危险因素的评价与预警等都具…     

生命早期营养与抗感染免疫

<正>决定人类健康的两大重要因素是遗传(基因)和环境。基因表达的正确方式、部位和强度是个体健康的保证,而环境是影响基因表达的重要因素。环境因素极为复杂,其中营养在生命早期对基因表达的影响尤为重要。健康和疾病的发育起源     

单核苷酸多态性基因分型技术与人类营养风险评估

单核苷酸多态性位点(SNP)以遗传标记密度高、稳定性高及分型检测易于实现自动化的特点成为第3代多态性标记,在遗传诊断、遗传风险评估,连锁不平衡图谱和遗传关联分析等人类基因组学研究领域显示了强大的应用前景。本研究以原理为主线,从通用步骤中DNA片断PCR扩增,SNP鉴别反应和SNP检测识别机制三大方面剖析了SNP基因分型技术领域研究进展,最后指出了适合于我国营养素缺乏风险评估项目的 SNP基因分型新技术应具有的特点。     

特发性男性不育常见基因的SNP与易感性研究进展

单核苷酸多态性（SNP）是指某一人群的正常个体基因组内特定核苷酸位置上存在不同碱基。且最少的一种等位基因频率不小于1％。是人类基因组中分布最为广泛、存在数量最多的一种变异，反映了个体表型、疾病易感性和对药物、环境因素反应的差异。作为第三代分子遗传标记，SNP的高密度性、稳定性和二态性使其具有易于分型检测的优势。而随着人类基因组单体型图（HapMap）计划的实施，由SNP等位位点组成的单体型也成为近年来遗传学研究的组成部分。现就精子生成和成熟相关基因SNPs与特发性男性不育易感性关系进行综述，并分析其在男性不育的病因学诊断等方面的应用前景和目前存在的问题。     

广州生物库队列人群心脑血管病相关基因多态性研究

目的 应用Taqman单核苷酸多态性(SNP)分型法检测广州生物库队列人群心脑血管疾病相关基因的多态性.方法 从广州生物库队列研究(GBCS)中选取2000名研究对象,应用ABI7900HT型荧光定最PCR仪并采用Taqman SNP分型法检测该人群rs4220、rs5368及rs285等15个心脑血管疾病相关基因多态性.对检测的基因分型数据采用遗传平衡定律检测,并与国际染色体单倍型计划(HapMap)的中国人群数据进行比较.结果 (1)所有15个SNP的分型数据均满足遗传平衡定律;(2)有两个SNP的分型数据与HapMap的中国人群数据差异有统计学意义(rs4220 28.2%对17.8%,X~2=4.891,P=0.028;rs5368 22.1%对32.2%,X~2=5.137,P=0.024).对比美国Perlegen公司人类遗传变异研究(AFD-CHN-PANEL)、美国科学基金会等位基因频率数据库(ALFRED)、日本生物信息学协会(JBIC-allele)等多个基因库数据,造成本研究SNP频率不同于HapMup的中国人群数据的原因是华南人群在遗传背景上与北方人群有一定的差异.结论本研究的数据可能更能反映南方人的特性,因此,建立大样本的广州人群心脑血管疾病相关基因多态性数据库以研究基因与环境对心脑血管疾病的影响是必要的.     

单核苷酸多态性、环境因素与肝细胞肝癌遗传易感性的关系

肝细胞肝癌(HCC)的发生和演进是一个多基因、多因素的复杂过程,是遗传与环境因素相互作用的结果。单核苷酸多态性(SNP)作为第三代遗传标记,充分反映了个体间的遗传差异,决定了个体对疾病的易感性,正成为肝癌遗传易感性研究的重要工具。     

双生子方法在糖尿病析因研究中的应用进展

糖尿病是一种由遗传和环境因素共同作用导致的复杂疾病,严重影响人群健康水平和生存质量,双生子方法作为特殊的研究工具,可以估计基因和环境对糖尿病相关性状的相对作用。与一般研究对象相比,双生子拥有自然对照,结合遗传统计学和分子生物学技术进行方法学的拓展,有助于解析疾病危险因素,明确暴露与结局的真实关联。本文对国内外近十年来双生子方法在糖尿病析因研究中的应用进展进行了综述,总结了经典双生子模型、对内对照研究、全基因组和表观遗传流行病学研究等方法的优势和局限性。     

转化生长因子-β1基因多态性与新疆哈萨克族原发性高血压的关系

原发性高血压(EH)是一类由多基因和环境因素共同影响导致的复杂遗传性疾病,是最常见的慢性心血管病之一,其病因和发病机制尚未完全阐明.新疆哈萨克族人群是EH易感人群,居全国各民族高血压患病率的前5位[1].哈萨克族人群居住在气候寒冷,交通不便,相对隔离的山区,无异族通婚史,有着鲜明的民族聚集和高发的特征.目前国内外有关单核苷酸多态性(SNP)与疾病的关联研究,在SNP位点的选择上除了注意功能区(启动子和外显子)外,由于不同连锁标记间连锁不平衡(LD)模式,为增加基因分型的有效性,还需进行标签SNP(tagSNP)与疾病的关联研究.由于转化生长因子-β1(TGF-β1)基因是血压和血管重构的重要调节因子,可能导致高血压的发病,而TGF-β1基因多态性在高血压中的作用尚无确切结果,因此本研究采用SNaPshot技术对TGF-β1基因的tagSNP多态位点开展研究,以期进一步阐明基因型与EH发生的关联.     

SIRT1、SIRT1SNP与年龄相关性疾病研究进展

正单核苷酸多态性(SNPs)指在基因水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性,是人类可遗传变异中最常见的一种,是人类基因组中广泛而稳定分布的多态性位点。随着人类基因组计划的完成,人类基因组单体型图(Haplotype map,简称Hapmap)计划的开展,SNP与复杂的多基因疾病(如心血管疾病、糖尿病等年龄相关疾病)的关     

2型糖尿病易感基因单核甘酸多态性的研究进展

2型糖尿病是多基因复杂病,具有高度遗传异质性,不同地区、不同种族人群的遗传背景不同,参与2型糖尿病发生的易感基因也不同。近年来单核苷酸多态性与2型糖尿病发病相关性研究的取得了一定的进展,但尚未发现任何一个SNP在所有人群中均与2型糖尿病相关联。本文拟就2型糖尿病相关易感基因单核苷酸多态性及其发病机制研究进展进行综述。     

内蒙古通辽地区蒙古族人群VEGF受体2基因与冠心病的关联研究

目的：本研究拟在内蒙古通辽地区的蒙古族人群中验证血管内皮生长因子（VEGF）受体2（KDR）基因多态性与冠心病的关联。方法研究对象为2010年1月至2011年10月通辽市疾病预防控制中心收集的400例样本，其中包括200例健康的蒙古族对照人群和200例蒙古族冠心病患者。采用PCR联合限制性内切酶消化的方法对目的基因进行分型，并通过抽样测序以验证PCR-酶切方法的准确性。ELISA方法检测血浆中KDR的水平。结果 KDR的3个SNP位点均与蒙古族冠心病的易感度相关，其中SNP-604的OR=1.45（P<0.05），SNP1192的OR=1.42（P<0.05），SNP1719的OR=1.49（P<0.05）。ELISA结果显示SNP-604CC基因型携带者血浆中KDR蛋白水平显著低于SNP-604TT基因型携带者。与对照组相比，冠心病组KDR蛋白水平表达增加，与CRP表达水平成正比。结论 KDR的SNP-604、SNP1192和SNP1719与蒙古族冠心病遗传易感性相关，其作用机制主要是通过调节KDR的表达去影响KDR与VEGF结合率。     

组蛋白修饰在自身免疫病中的研究进展

自身免疫病是一类严重危害人类健康的慢性复杂性疾病,包括器官特异性自身免疫病（如胰岛素依赖型糖尿病）和系统性自身免疫病（如系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎）等20余种疾病。其共同特征为机体对自身抗原发生免疫反应而导致自身组织损害。目前确切的发病机制尚不明确,近年研究发现表观遗传异常所致免疫调控网络紊乱与自身免疫病发生、发展及其分子机制相关。表观遗传学是指非基因序列改变所致基因表达水平的变化,包括三种调节性机制：DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA。组蛋白修饰是调控基因表达的重要表观遗传学机制,与基因转录表达相关并已经证明在肿瘤的病理过程中起重要的作用。其与自身免疫性疾病（如SLE等）的关系已受到越来越多的重视。本篇综述拟讨论组蛋白修饰对基因表达的影响以及在自身免疫病发病中所起的作用。     

遗传病与相关表达条件——经络与遗传的关系

随着人类DNA基因谱的逐步被破译,发现很多疾病与遗传有关.甚至一些传染病象AIDS病都与遗传有关,现已发现有些人有抗AIDS病基因.     

Calpain10基因多态性与昆明地区人群2型糖尿病相关性研究

目的 探讨Calpain10基因多态性与昆明地区人群2型糖尿病遗传易感性的关系。方法采用病例-对照研究设计，以聚合酶链式反应-等位基因特异性扩增法（PCR-ASA），检测Calpain10基因单核苷酸多态性（SNP）43G／A位点和SNP44T／C位点基因型，并进行关联分析。结果 对131例2型糖尿病患者和131例正常对照进行了Calpain10基因SNP43和SNP44基因分型，与对照组相比，SNP43的G等位基因频率和SNP44的C等位基因频率在昆明地区2型糖尿病人群中显著升高（分别为93．13％，86．26％，P=0．0097；18．70％，9．92％，P=0．004）。结论 Calpain10基因SNP43位点G等位基因和SNP44位点C等位基因可能与昆明地区人群2型糖尿病的发病相关。     

免疫调节相关基因及其多态性与慢性乙型肝炎病毒感染的关系

机体对HBV的免疫耐受导致感染慢性化.已有大量研究发现,在慢性HBV感染过程中,免疫调节相关基因如人类白细胞抗原(HLA)、TNF-α、细胞凋亡因子-1(PD-1)、Bcl2家族凋亡协助蛋白(BIM)等基因的表达状态与肝脏炎症程度有关.动物模型中也观察到,封闭某些基因表达可以阻断免疫炎症,更进一步证实这一点.因此,涉及基因表达的宿主遗传背景对免疫应答的影响,成为新近关注的热点问题.人类基因组变异形式之一的基因拷贝数变异(CNVs)已被证实与多种免疫性疾病的发生与发展密切相关,虽然目前尚未证实哪些基因的CNVs与HBV感染转归有关,但已有的相关研究结果对研究HBV感染后疾病进程有借鉴作用.此文就HLA、TNF-α、PD-1、BIM等基因的多态性及基因表达差异对HBV感染的影响,以及近年来对CNVs与免疫性疾病关系研究所取得的进展进行了综述.     

复杂疾病遗传风险评价策略

不同于单基因遗传疾病,人类常见疾病如心脑血管疾病、代谢性疾病、精神行为异常、肿瘤等均是由多种环境和遗传因素共同导致的复杂疾病。随着人类基因组计划（human genome project,HGP）和国际人类基因组单体型图计划（the International Hap Map Project,Hap Map）的相继完成,高通量基因分型技术的发展,使得在大规模人群中开展全基因组关联研究成为现实。     

微RNA在2型糖尿病发病中的作用

2型糖尿病发病与遗传及环境因素密切相关.该病的家族聚集性及在某些种族的高发病率提示遗传因素在发病中重要的作用.2型糖尿病具有遗传异质性,其表型受到多基因遗传背景和复杂环境因素的共同控制.全基因组的研究也证实2型糖尿病和多种基因相关,但具体机制不清.已知调控基因表达方式主要有4种：组蛋白修饰、DNA甲基化、染色质重塑、非编码RNA调控[1].微RNA（miRNA）是目前非编码RNA中研究最多的一种.1993年Lee等首先报道在线虫中发现miRNA,并证实miRNA能够调节机体的发育时间.随后对人类的研究发现miRNA占人类全基因组的3％,其中30％编码蛋白质的基因受其调控,是重要的基因调控元件.     

GCK基因多态性与汉族人群血糖水平的关系研究

目的探讨GCK基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2268576、rs2908297、rs2971676、rs4607517与汉族人群空腹血糖(FG)水平的关系。方法应用Taq Man探针技术在ABI V7平台上对293名健康体检者GCK基因的4个SNP位点进行基因分型,并进行关联分析。结果 SNP位点rs4607517基因型与FG水平存在线性相关性(P=0.002)。rs4607517位点AA组患者平均FG值(5.16 mmol/L±0.49 mmol/L)高于AG组(4.9 mmol/L±0.49 mmol/L)和GG组(4.81 mmol/L±0.41 mmol/L),差异具有统计学意义(P=0.025,P=0.002)。结论 GCK基因内SNP位点rs4607517与中国汉族人群FG水平的遗传易感性相关联。     

非综合征性唇腭裂部分基因SNPs研究进展

非综合征性唇裂伴或不伴腭裂是人类最常见的先天性畸形之一,是一种遗传、环境因素及两者相互作用所致的多基因多因素遗传疾病.单核苷酸多态性是新一代遗传标记,可被用来寻找各种致病基因,目前认为单核苷酸多态性及其特定组合可能是造成以多基因多因素遗传病为代表的复杂性状疾病易感性的重要原因.