非小细胞肺癌EGFR基因突变的临床意义研究

  目的   探讨非小细胞肺癌EGFR基因外显子突变与其临床病理特征的关系。   方法   利用ADx-ARMS?EGFR基因突变检测试剂盒,检测214例未接受过Gefitinib治疗的非小细胞肺癌患者组织中EGFR基因外显子18、19、20和21突变。   结果   非小细胞肺癌组织中EGFR基因总突变率为45.8%（98/214）,外显子18、19、20和21的突变率分别为0.93%（2/214）、22.0%（47/214）、2.3%（5/ 214）和20.6%（44/214）。另有2例19和21外显子双重突变。EGFR基因在肺腺癌组织中的总突变率为50.3%（93/185）明显高于肺鳞状细胞癌17.2%（5/29）（P=0.001）。EGFR基因在女性患者中的突变率57.0%（57/100）高于男性36.0%（41/114）（P=0.002）,EGFR基因在NSCLC淋巴结转移患者中的突变率（66.7%）显著高于无淋巴结转移患者（39.5%）（P < 0.05）,但EGFR基因突变率与肺癌患者的年龄、肿瘤分级和临床分期均无显著性差异（P>0.05）。   结论   中国肺癌尤其是肺腺癌患者存在EGFR基因的较高突变率,EGFR外显子19、21突变结合肺癌的临床病理特征有望成为评估TKI治疗非小细胞肺癌疗效的分子标志。      

非小细胞肺癌中EGFR和K-ras基因突变检测

目的:探讨不同类型非小细胞肺癌的EGFR和K-ras基因突变情况及其与肺癌相关临床病理特征的关系。方法:用厦门艾德ADxARMS试剂盒进行98例非小细胞肺癌患者肿瘤组织中EGFR（18,19,20,21外显子）基因和K-ras（12,13,61密码子）基因突变的检测。所有患者均未接受过吉非替尼的治疗。结果:98例样本中31例发生了EGFR基因突变,突变率为31.6%（31/98）,其中15例为19外显子缺失,13例为21 L858R外显子点突变,3例为20外显子突变,1例为18外显子突变。其中1例既有19外显子缺失突变,又有20外显子突变。腺癌中EGFR基因突变率较鳞癌、腺鳞癌、大细胞癌高。女性患者EGFR基因突变率较男性高。不吸烟患者EGFR基因突变率较吸烟患者高。低分化腺癌患者EGFR基因突变率较中、高分化患者高。21例发生了K-ras基因突变（21.4%）,其中12、13、61密码子均发现突变。突变率腺癌较鳞癌、腺鳞癌、大细胞癌高,与是否吸烟、患者性别、分化程度均无相关性。结论:非小细胞肺癌患者EGFR基因突变检出率较高,K-ras基因突变率较低,且两者不存在同时突变,EGFR基因突变与肺癌组织学类型、分化程度、性别等相关。K-ras基因突变与组织学类型相关。     

高分辨率熔解曲线技术检测非小细胞肺癌患者胸水中EGFR基因突变

目的探讨高分辨率熔解曲线(HRM)技术对非小细胞肺癌(NSCLC)患者胸水标本EGFR基因突变进行检测的可行性及临床意义。方法采用高分辨率熔解曲线技术检测30例非小细胞肺癌患者胸水标本EGFR基因18-21外显子基因突变,并与Sanger测序法检测结果进行对比分析。结果HRM法检测胸水中EGFR基因18-21外显子突变总检出率为26.67%(8/30),Sanger测序法检测突变总检出率为23.33%(7/30)。HRM法与Sanger测序法相比,敏感性为100%,特异性为95.83%,阳性预测值为88.89%,阴性预测值为100%。结论运用HRM技术对非小细胞肺癌患者胸水进行EGFR基因突变检测方法可行,适宜推广。     

中国非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体基因突变的研究

目的:针对表皮生长因子受体(EGFR)的分子靶向治疗越来越受到国内外的广泛关注,其中EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)Gefitinib和Erlotinib已在中国上市,批准用于治疗晚期非小细胞肺癌(NSCLC).EGFR突变是靶向药物TKI治疗有效的一个预测指标.有关我国非小细胞肺癌患者EGFR基因突变的研究已有若干报道,本文意在探讨中国北方地区非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体(EGFR)基因外显子18-21的突变特点.方法:收集50例来自北方地区的非小细胞肺癌患者的冰冻组织标本,进行EGFR基因外显子18-21的突变检测.结果:50例非小细胞肺癌组织中共检出突变15例(30%),其中外显子19突变6例,均为缺失突变del E746-A750,外显子21突变9 例 ,除1例为L861Q外, 其它均为 L858R替代突变 .女性患者的突变率( 12/23,52%)显著高于男性患者的突变率( 3/27 , 11%),P＝0.002 ;腺癌支气管肺泡癌患者的突变率( 13/26,50%)显著高于鳞癌患者的突变率( 2/20,10%),P=0.005;非吸烟者的突变率(10 /25,40%)高于吸烟者的突变率(5/25,20%),但无显著性差异,P=0.217.与其它报道比较,结果显示北方地区EGFR基因突变的总体发生率与其他地区无显著性差异 ,外显子19、20、21发生突变所占的比例除云南更常见于外显子19,有显著性差异(P＜0.05)外,与其他地区无显著性差异(P＞0.05).但北方地区突变的形式相对单一 .结论:中国南北方地区非小细胞肺癌患者EGFR基因突变发生率及主要突变类型基本一致,北方地区突变类型较单一,可给予针对性的检测.     

非小细胞肺癌胸腔积液与配对肿瘤组织中EGFR基因突变检测的比较

目的:探讨非小细胞肺癌胸腔积液与配对肿瘤组织标本中EGFR基因突变检测结果的一致性,评价胸腔积液标本检测EGFR基因突变的应用价值.方法:收集非小细胞肺癌患者胸腔积液与配对肿瘤组织样本72例,采用ARMS方法,检测样本中EGFR基因第18~21外显子突变情况.结果:细胞学样本和组织学样本中EGFR基因突变阳性率分别为48.61%和51.39%,两者差异无统计学意义(P>0.05),二者一致率为92.11%,不一致率为7.89%.结论:二者的一致率较高,恶性胸水可以作为无法获得肿瘤组织的晚期非小细胞肺癌EGFR基因检测的有效样本.     

HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变的临床意义

目的:探讨应用HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变状况及EGFR酪氨酸激酶受体抑制剂治疗的可行性。方法:收集43例肺腺癌患者癌性胸水上清液标本,提取DNA,应用HRM方法检测EGFR基因第18、19、20、21外显子突变状况。统计分析HRM方法与基因测序法检测EGFR突变率的差异。结果:43例肺腺癌患者癌性胸水上清液中,HRM法检测EGFR基因突变共17例,总突变率为39.53%,其中第19外显子突变14例,第21外显子突变3例。基因测序结果显示:EGFR突变14例,总突变率为32.56%,均为第19外显子突变。HRM方法检测第21外显子突变阳性的患者其基因测序结果均为阴性。这可能与HRM方法检测的灵敏度优于测序方法有关。两者突变率差异无统计学意义（P>0.05）。结论:对难以获取组织标本的肺腺癌患者而言,应用HRM方法检测其癌性胸水上清液,是了解其EGFR基因突变状况的可靠途径,对临床筛查靶向治疗药物具有一定的参考价值。     

肺癌细胞学及血液标本表皮生长因子受体基因突变对比研究

目的:研究肺癌患者渗出液细胞学及血液标本中表皮生长因子受体(EGFR)第18、19、21外显子基因突变频率和类型以及与肿瘤组织学标本的关系。方法:收集肺癌患者渗出液细胞学标本53例及血液标本24例,提取DNA,聚合酶链反应扩增EGFR外显子18、19、21序列,用直接测序法检测基因序列,分析EGFR基因突变频率和类型以及与肿瘤组织学标本的关系。结果:53例细胞学标本检测到15例EGFR基因突变（28.3%,15/53）,18外显子突变1例,19外显子突变5例,21外显子突变9例,细胞学标本与肺腺癌组织学标本突变率（32.2%）相比,差异没有显著性（P=0.624）。24例血液标本中检测到1例突变（4.2%,1/24）,位于21外显子,血液标本与肿瘤组织学标本突变率相比,差异有显著性(P=0.006)。结论:肺癌患者渗出液细胞学标本适用于直接测序法检测EGFR突变,血液标本不适于用直接测序法检测肿瘤EGFR基因突变状态。     

非小细胞肺癌表皮生长因子受体双向基因测序研究

目的 探讨中国人非小细胞肺癌表皮生长因子受体（EGFR）第18、19、21外显子基因突变状态。方法 32例病理证实的非小细胞肺癌组织标本,通过模板DNA提取、定量和Touchdown PCR扩增EGFR exon18、19、21序列,进行正、负链基因测序分析,并与10例非小细胞肺癌患者血液标本对照。结果 32例非小细胞肺癌组织发现7例共9种突变,即已报道的5例19外显子缺失和未见报道的21exonT〉G（L833V）及A〉T（H835L）杂合性突变,另有2例内含子多态改变。中国人非小细胞肺癌突变率为28．1％（9／32）,肺腺癌突变率为31．6％（6／19）。结论 中国人非小细胞肺癌的EGFR突变率与已报道的亚洲人女性肺腺癌的突变率相似,但存在中国人自身新的突变位点（L833V和H835L）及内含子改变,该突变率与国内易瑞沙治疗非小细胞肺癌有效率基本吻合。     

非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体Kras基因突变检测及与临床病理特征的相关性

目的分析非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体(EGFR)、Kras基因突变的情况及其与临床病理学特征的关系。方法收集1110例非小细胞肺癌标本,采用实时荧光PCR法检测标本中EGFR基因第18、19、20和21号外显子及Kras基因第2号外显子12和13密码子的突变情况。结果非小细胞肺癌EGFR基因的突变率为46.1%(512/1 110),Kras基因的突变率为7.1%(79/1110)。EGFR基因突变主要发生在女性、不吸烟和腺癌的患者,突变位点主要集中在第19和21号外显子,第18、19、20和21号外显子突变所占比例分别为3.3%(17/520)、46.0%(239/520)和5.0%(26/520)、45.8%(238/520)。结论非小细胞肺癌患者EGFR基因突变主要发生于女性、不吸烟和腺癌的患者,采用实时荧光PCR法检测分析非小细胞肺癌患者EGFR、Kras基因突变的情况,有助于选择靶向治疗获益人群,为个性化治疗提供依据。     

非小细胞肺癌患者血清EGFR基因突变循环DNA检测的临床研究

目的:探讨非小细胞肺癌患者血清EGFR基因突变循环DNA检测的临床意义。方法:选取2011年1月-2014年5月于我院接受治疗的124例非小细胞肺癌患者为研究对象,收集血清及组织标本DNA,检测DNA EGFR基因突变情况。结果:124例非小细胞肺癌患者血清EGFR基因检测结果显示:19号外显子突变11例,21号外显子突变8例,血清总检出19例,检出率为15.3%。组织样本中EGFR基因检测结果显示:19号外显子突变27例,21号外显子突变13例,血清总检出40例,检出率为32.3%。在组织样本中,79例男性EGFR基因突变检出14例,比例为17.7%;45例女性EGFR基因突变检出26例,比例为57.8%,相比具有显著性差异(P<0.05)。76例吸烟史患者检出突变16例,比例为21.1%;48例无吸烟史者检出突变24例,比例为50.0%,两者相比差异显著(P<0.05)。血清样本检测中结果与组织样本基本吻合,在性别和吸烟史方面患者基因突变有显著性差异(P<0.05),在癌症分期及类型方面无显著性差异(P>0.05)。结论:非小细胞肺癌患者血清循环DNA检测EGFR基因突变与肿瘤组织检测具有高度的一致性,这对肺癌患者的诊断、筛查和治疗有着重要的意义,为临床检测提供方便、有效的诊断方法。     

非小细胞肺癌中表皮生长因子受体基因突变ADx-ARMS分析及其与临床病理特征的相关性

目的:回顾性分析非小细胞肺癌(NSCLC)中采用ADx-ARMS法检测的表皮生长因子受体(EGFR)的基因突变率、突变分布特征及其与临床病理特征的相关性。方法:收集NSCLC标本共139例,其中包括手术切除样本 83 例、穿刺活检样本27 例、胸腔积液样本 18例及血液样本11例。所有样本均采用ADx-ARMS法检测EGFR基因酪氨酸激酶编码区第19至21号外显子的突变。 结果:在139例NSCLC标本中共检测出EGFR基因突变53例,突变率为38.1%;第19至21号外显子的突变率分别为43.4%(23/53)、0(0/53) 和56.6%(30/53);年龄大于等于中位年龄(60岁)与小于中位年龄的患者EGFR基因突变率分别为35.6%(26/73) 和40.9%(27/66),差异无统计学意义(P>0.05);女性患者中EGFR基因突变率(49.0%,25/51) 高于男性患者基因突变率(31.8%,28/88,P<0.05);腺癌中的基因突变率(41.8%,46/110)显著高于鳞癌(15.0%,3/20,P<0.01),而与未能分型的患者(37.5%,3/8)差异无统计学意义(P>0.05)。在手术切除、穿刺活检、胸腔积液以及血液样本中EGFR基因突变检出率分别为42.2%(35/83)、37.0%(10/27)、38.9%(7/18)和9.1%(1/11)。 结论:ADx-ARMS法是检测NSCLC中EGFR基因突变的快速有效方法,但不能检测未知突变类型。EGFR基因的总突变率与年龄无显著相关性;EGFR基因突变在女性和腺癌中多见;EGFR基因突变检出率与样本类型密切相关,对无法取得切除样本的患者,穿刺活检及胸腔积液样本是检测EGFR基因突变的有效样本。     

老年晚期非小细胞肺癌患者ＥＧＦＲ基因的突变研究

目的　探讨老年晚期非小细胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）患者ＥＧＦＲ基因突变情况及其与临床病理特征之间的关系。方法　采用ＰＣＲ扩增和实时荧光ＰＣＲ技术分析ＮＳＣＬＣ中ＥＧＦＲ基因第１９和２１号外显子的突变情况。结果　８６例老年ＮＳＣＬＣ酪氨酸激酶域存在体细胞突变２５例（２９.１％）,其中第１９号外显子的缺失突变为１３例（１５.１％）,第２１号外显子的替代突变为１２例（１４.０％）。肺腺癌、肺泡癌的突变率为３６.４％（２４／６６）,高于鳞癌的６.３％（１／１６）;女性患者突变率为４８.３％（１４／２９）,高于男性患者的１９.３％（１１／５７）;非吸烟患者的突变率为４３.９％（１８／４１）,高于长期吸烟者的１５.６％（７／４５）。结论 中国老年ＮＳＣＬＣ患者ＥＧＦＲ基因酪氨酸激酶区第１９和２１外显子的突变特征与肺癌总体患者类似,与年龄关系不大,突变率以腺癌、女性及非吸烟者较高。老年ＮＳＣＬＣ患者同样可以通过基因检测获得ＴＫＩ治疗预测信息。     

EGFR mutation status in tumour-derived DNA from pleural effusion fluid is a practical basis for predicting the response to gefitinib

Epidermal growth factor receptor (EGFR) mutations are strong determinants of tumour response to EGFR tyrosine kinase inhibitors in non-small-cell lung cancer (NSCLC). Pleural effusion is a common complication of lung cancer. In this study, we assessed the feasibility of detection of EGFR mutations in samples of pleural effusion fluid. We obtained 43 samples, which was the cell-free supernatant of pleural fluid, from Japanese NSCLC patients, and examined them for EGFR mutations. The epidermal growth factor receptor mutation status was determined by a direct sequencing method (exons 18-21 in EGFR). EGFR mutations were detected in 11 cases (E746_A750del in seven cases, E746_T751del insA in one case, L747_T751del in one case, and L858R in two cases). The EGFR mutations were observed more frequently in women and non-smokers. A comparison between the EGFR mutant status and the response to gefitinib in the 27 patients who received gefitinib revealed that all seven patients with partial response and one of the seven patients with stable disease had an EGFR mutation. No EGFR mutations were detected in the patients with progressive disease. The results suggest that DNA in pleural effusion fluid can be used to detect EGFR mutations and that the EGFR mutation status may be useful as a predictor of the response to gefitinib.     

靶向高通量测序在非小细胞肺癌中的临床应用

  目的  对8种与非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）个性化治疗高度相关的驱动基因进行检测,分析基因变异与临床病理特征的关系。  方法  收集天津医科大学肿瘤医院2016年6月至2017年8月212例NSCLC患者样本,对EGFR、KRAS、BRAF、ALK、MET、ERBB2、ROS1、RET 8种基因进行高通量测序。  结果  8种基因中EGFR基因变异率高达52.8%,其次为KRAS（8.5%）、ALK（8.0%）、ERBB2（6.1%）、MET（3.8%）、BRAF（1.4%）、RET（0.9%）、ROS1（0.9%）,75%样本检出至少1个驱动基因变异,驱动基因变异间呈现强烈互斥。最常见的EGFR突变为19外显子缺失和L858R突变,EGFR T790M突变与前面两个突变位点伴随出现。19外显子缺失患者携带非EGFR T790M突变比例低于L858R突变患者携带非EGFR T790M突变比例（P=0.04）。15.2%EGFR突变伴EGFR扩增,携带EGFR扩增且EGFR突变率 > 40%患者比例高于无EGFR扩增且EGFR突变率 > 40%患者（P < 0.01）。女性、不吸烟、腺癌患者易发生EGFR特别是EGFR敏感突变（P < 0.01）。肺腺癌（P=0.013）、临床分期晚（P=0.048）、淋巴结转移（P=0.027）患者携带EGFR扩增比例高。男性（P=0.009）、左侧肺癌（P=0.048）,吸烟患者（P=0.037）KRAS突变发生率较高。携带非KRAS突变、ALK融合的患者更年轻（P=0.005,P=0.031）,而携带KRAS突变患者年龄较高（P=0.055）。  结论  高通量测序可同时高效检测NSCLC患者中8种与靶向治疗相关驱动基因的变异谱,为临床医生的个体化诊疗提供参考,以多基因为基础的高通量测序为NSCLC诊疗提供更多的可能性。      

KRAS mutation is an important predictor of resistance to therapy with epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors in non-small-cell lung cancer.

PURPOSE: EGFR gene mutations and increased EGFR copy number have been associated with favorable response to epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKI) in patients with non-small-cell lung cancer (NSCLC). In contrast, KRAS mutation has been shown to predict poor response to such therapy. We tested the utility of combinations of these three markers in predicting response and survival in patients with NSCLC treated with EGFR-TKIs. EXPERIMENTAL DESIGN: Patients with advanced NSCLC treated with EGFR-TKI with available archival tissue specimens were included. EGFR and KRAS mutations were analyzed using PCR-based sequencing. EGFR copy number was analyzed using fluorescence in situ hybridization. RESULTS: The study included 73 patients, 59 of whom had all three potential markers successfully analyzed. EGFR mutation was detected in 7 of 71 patients (9.8%), increased EGFR copy number in 32 of 59 (54.2%), and KRAS mutation in 16 of 70 (22.8%). EGFR mutation (P<0.0001) but not increased EGFR copy number (P=0.48) correlated with favorable response. No survival benefit was detected in patients with either of these features. KRAS mutation correlated with progressive disease (P=0.04) and shorter median time to progression (P=0.0025) but not with survival. Patients with both EGFR mutation and increased EGFR copy number had a >99.7% chance of objective response, whereas patients with KRAS mutation with or without increased EGFR copy number had a >96.5% chance of disease progression. CONCLUSION: KRAS mutation should be included as indicator of resistance in the panel of markers used to predict response to EGFR-TKIs in NSCLC.     

中国非小细胞肺癌患者K-Ras和EGFR基因突变与临床病理特征的关系

目的 探讨中国非小细胞肺癌（NSCLC）患者中K-Ras和表皮生长因子受体（EGFR）基因突变情况及其与临床病理特征的关系。方法 回顾性分析2011年7月至2013年8月广州医科大学附属第一医院收治的381例NSCLC患者的临床病理特征,并应用扩增突变阻滞系统（ARMS）检测其癌组织中EGFR基因18、19、20、21外显子共21个点突变和K-Ras基因12、13密码子共6个点突变,分析其突变情况及与临床病理特征的相关性。结果 21例（5.5％）存在K-Ras基因突变,其中20例12密码子,1例13密码子Asp突变;146例（38.3％）存在EGFR突变,其中4例18外显子突变（G719S）,52例19号外显子序列缺失突变,3例20外显子序列缺失突变,85例21外显子突变（81例L858R,4例L861Q）,2例双突变。男性患者K-Ras基因突变率高于女性患者,差异有统计学意义（6.8％ vs. 2.5％, P=0.018）。EGFR基因突变与性别、吸烟史、临床分期、全身转移、病理类型均有关（P＜0.05）。二分类Logistic回归分析显示,病理类型和性别与EGFR基因突变密切相关。结论 中国NSCLC患者中EGFR突变常见,该突变与腺癌有关;K-Ras基因突变率较低,多见于男性,其他相关因素尚需进一步研究。     

Functional EGFR germline polymorphisms may confer risk for EGFR somatic mutations in non-small cell lung cancer, with a predominant effect on exon 19 microdeletions

Somatic mutations in the EGFR tyrosine kinase domain play a critical role in the development and treatment of non-small cell lung cancer (NSCLC). Strong genetic influence on susceptibility to these mutations has been suggested. To identify the genetic factors conferring risk for the EGFR tyrosine kinase mutations in NSCLC, a case-control study was conducted in 141 Taiwanese NSCLC patients by focusing on three functional polymorphisms in the EGFR gene [-216G/T, intron 1 (CA)n, and R497K]. Allelic imbalance of the EGFR -216G/T polymorphism was also tested in the heterozygous patients and in the NCI-60 cancer cell lines to further verify its function. We found that the frequencies of the alleles -216T and CA-19 are significantly higher in the patients with any mutation (P = 0.032 and 0.01, respectively), in particular in those with exon 19 microdeletions (P = 0.006 and 0.033, respectively), but not in the patients with L858R mutation. The -216T allele is favored to be amplified in both tumor DNA of lung cancer patients and cancer cell lines. We conclude that the local haplotype structures across the EGFR gene may favor the development of cellular malignancies and thus significantly confer risk to the occurrence of EGFR mutations in NSCLC, particularly the exon 19 microdeletions.