高分辨率熔解曲线技术检测结直肠癌患者KRAS基因突变

目的探讨高分辨率熔解曲线技术(HRM)检测结直肠癌患者KRAS基因突变的可行性及其临床意义。方法采用HRM技术检测60例结直肠癌患者石蜡包埋组织标本KRAS基因2号外显子12和13位密码子突变,并与Sanger测序法检测结果进行对比分析。结果 HRM法检测结直肠癌患者KRAS基因2号外显子12和13位密码子突变检出率为36.67%(22/60),Sanger测序法检测突变检出率为33.33%(20/60)。HRM法检测突变检出率高于Sanger测序法,HRM法检测敏感性为100%,特异性为95.24%。结论 HRM法检测KRAS基因突变,灵敏度高,敏感性和特异性好,具有操作简便、节约时间、成本低的特点,方法可行。     

高分辨率熔解曲线分析技术检测EGFR基因突变方法的建立及其初步临床应用

目的建立高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析技术检测表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变的方法,并探讨其的临床应用价值。方法建立HRM技术检测EGFR基因突变方法,并用其检测200例非小细胞肺癌患者肿瘤石蜡包埋标本,并与测序法的结果进行比较。结果所建HRM检测方法 Tm与ct值的CV值均较小,重复性好。HRM法检测标本EGFR基因突变的结果与测序法相比,突变总检出率分别为40.0%和37.0%,敏感性为100%,特异性>95%。结论 HRM法检测EGFR基因突变,敏感性高,特异性强,重复性好,操作简便,节约时间,成本低,适用于临床。     

高分辨率熔解曲线分析技术检测血清游离DNA的EGFR基因突变

目的利用高分辨率熔解曲线分析技术(high resolution melting,HRM)检测石蜡包埋组织和血清游离DNA的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变,分析两者之间的关系,并探讨其临床应用价值。方法利用HRM技术检测EGFR基因突变的方法,检测200例非小细胞肺癌患者石蜡包埋标本和200例相应的血清游离DNA,并将二者结果进行比较分析。结果HRM法检测非小细胞肺癌患者石蜡包埋组织DNA的EGFR基因突变总检出率为43.5%,血清游离DNA的EGFR基因突变总检出率为25.0%,HRM法检测血清游离DNA的EGFR基因突变与检测石蜡包埋组织DNA的EGFR基因突变相比,敏感性为57.5%,特异性为100%。结论 HRM法检测血清游离DNA的EGFR基因突变为无法获取肿瘤组织标本的患者提供了新的检测机会。     

HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变的临床意义

目的:探讨应用HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变状况及EGFR酪氨酸激酶受体抑制剂治疗的可行性。方法:收集43例肺腺癌患者癌性胸水上清液标本,提取DNA,应用HRM方法检测EGFR基因第18、19、20、21外显子突变状况。统计分析HRM方法与基因测序法检测EGFR突变率的差异。结果:43例肺腺癌患者癌性胸水上清液中,HRM法检测EGFR基因突变共17例,总突变率为39.53%,其中第19外显子突变14例,第21外显子突变3例。基因测序结果显示:EGFR突变14例,总突变率为32.56%,均为第19外显子突变。HRM方法检测第21外显子突变阳性的患者其基因测序结果均为阴性。这可能与HRM方法检测的灵敏度优于测序方法有关。两者突变率差异无统计学意义（P>0.05）。结论:对难以获取组织标本的肺腺癌患者而言,应用HRM方法检测其癌性胸水上清液,是了解其EGFR基因突变状况的可靠途径,对临床筛查靶向治疗药物具有一定的参考价值。     

ADx-ARMS方法检测晚期非小细胞肺癌患者胸水标本癌细胞基因突变的临床意义

目的:探讨应用ADx-ARMS方法检测非小细胞肺癌患者胸水标本癌细胞基因突变应用于指导小分子EGFR酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKIs）治疗的可行性与临床意义。方法:ADx-ARMS检测24例非小细胞肺癌患者胸水标本EGFR基因第19、20和21外显子突变与KRAS基因第2外显子突变。统计分析胸水标本与前期检测过的非小细胞肺癌组织中的EGFR、KRAS突变率差异。结果:24例胸水标本中,EGFR突变与KRAS突变分别为14例（58.3%）和1例（4.2%）。前期检测过的非小细胞肺癌组织EGFR和KRAS突变率分别为47.6%和4.5%。EGFR和KRAS突变率在胸水标本与前期肺癌组织中差异无统计学意义（P>0.05）。结论:对失去手术机会而难以获得组织标本的晚期非小细胞肺癌患者,可应用ADx-ARMS方法选择胸水标本筛查EGFR、KRAS基因突变,从而指导EGFR-TKIs的临床应用。     

高分辨率熔解曲线分析技术在检测非小细胞肺癌组织EGFR基因突变中的应用

目的：探索高分辨率熔解曲线（high resolution melting,HRM）分析技术在检测肺癌组织表皮生长因子受体（epidermal grouthfactor receptor,EGFR）基因突变中的应用。方法：利用HRM技术,进行人肺癌组织EGFR基因外显子19和21突变筛查,并做测序验证。结果：外显子19的HRM分型结果显示,52例样品中有3种类型熔解曲线,45例样品为A型,5例为B型,2例为C型。外显子21的分析结果显示有2种熔解曲线,49例样品为N型,3例样品为M型。测序结果显示,外显子19 A型熔解曲线代表外显子19的野生型,B型熔解曲线代表杂合性缺失delE746-A750（c.2235-2249del）,C型熔解曲线代表杂合性缺失delL747-S752（c.2240-2257del）。外显子21 N型熔解曲线代表野生型,M型熔解曲线代表杂合性L858R（c.2573T-G）,HRM分析结果与测序结果完全一致。结论：本研究表明HRM分析技术能准确检测EGFR基因突变,是一种适合肺癌组织中EGFR基因突变筛查的方法。     

特异引物双扩增实时PCR法和Sanger DNA测序法检测肺癌组织中表皮生长因子受体基因突变

目的 探讨特异引物双环探针扩增实时PCR技术表皮生长因子受体(EGFR)检测方法(ADx-EGFR实时PCR法)和Sanger DNA测序法在肺癌EGFR基因体细胞突变检测中的临床价值.方法 收集肺癌组织石蜡切片208例,分别采用ADx-EGFR实时PCR法和Sanger DNA测序法检测肺癌组织中EGFR基因外显子18、19、20、21的突变类型,计算其突变率,分析两种检测方法检测EGFR基因突变的一致性.结果 208例肺癌组织中,ADx-EGFR实时PCR法成功检测208例,检出EGFR基因突变40例,突变检出率为19.2％;Sanger DNA测序法成功检测196例,检出突变22例,突变检出率为11.2％.肺癌组织中主要以外显子19缺失和外显子21上的L858R的点突变为主,分别占4.8％ (10/208)和11.6％ (23/208),其余的突变类型少见.结论 对于甲醛固定石蜡包埋组织而言,ADx-EGFR实时PCR法检测EGFR基因成功率和突变检出率均高于Sanger DNA测序法,可成为临床上检测肿瘤EGFR基因突变的方法.     

HRM法检测肺癌EGFR基因突变

目的：HRM法检测中国不同区域肺癌患者的EGFR基因突变,统计突变类型间比率,为临床EGFR-TKI分子靶向治疗提供依据,并验证HRM法的临床适用性。方法：收集2010年手术切除的肺癌石蜡标本253例,HRM法检测EGFR基因突变情况,并用基因测序法进行验证。结果：在253例肺癌标本中,HRM法检测出EGFR基因突变率为42%,与基因测序法检测出的突变率40%无显著性差异,并检测出2例T790M突变,11例多点突变和2例E18新位点突变。将本实验中收集的东部地区和非东部地区肺癌患者的EGFR基因突变率相比较,无显著性差异。经实验验证,HRM法的灵敏度高于基因测序的灵敏度,且HRM法的特异性为100%。结论：HRM技术具有高灵敏度、高特异性和高准确率等特点,且比基因测序法更简单方便,成本更低,适合在临床开展。明确EGFR突变类型十分必要,可以为临床可否运用EGFR-TKI分子靶向治疗提供重要依据。本实验中收集的肺癌标本EGFR基因突变不存在地域差异。     

HRM法检测肺癌EGFR基因突变

目的:HRM法检测中国不同区域肺癌患者的EGFR基因突变,统计突变类型间比率,为临床EGFR-TKI分子靶向治疗提供依据,并验证HRM法的临床适用性。方法:收集2010年手术切除的肺癌石蜡标本253例,HRM法检测EGFR基因突变情况,并用基因测序法进行验证。结果:在253例肺癌标本中,HRM法检测出EGFR基因突变率为42%,与基因测序法检测出的突变率40%无显著性差异,并检测出2例T790M突变,11例多点突变和2例E18新位点突变。将本实验中收集的东部地区和非东部地区肺癌患者的EGFR基因突变率相比较,无显著性差异。经实验验证,HRM法的灵敏度高于基因测序的灵敏度,且HRM法的特异性为100%。结论:HRM技术具有高灵敏度、高特异性和高准确率等特点,且比基因测序法更简单方便,成本更低,适合在临床开展。明确EGFR突变类型十分必要,可以为临床可否运用EGFR-TKI分子靶向治疗提供重要依据。本实验中收集的肺癌标本EGFR基因突变不存在地域差异。     

非小细胞肺癌胸腔积液与配对肿瘤组织中EGFR基因突变检测的比较

目的:探讨非小细胞肺癌胸腔积液与配对肿瘤组织标本中EGFR基因突变检测结果的一致性,评价胸腔积液标本检测EGFR基因突变的应用价值.方法:收集非小细胞肺癌患者胸腔积液与配对肿瘤组织样本72例,采用ARMS方法,检测样本中EGFR基因第18~21外显子突变情况.结果:细胞学样本和组织学样本中EGFR基因突变阳性率分别为48.61%和51.39%,两者差异无统计学意义(P>0.05),二者一致率为92.11%,不一致率为7.89%.结论:二者的一致率较高,恶性胸水可以作为无法获得肿瘤组织的晚期非小细胞肺癌EGFR基因检测的有效样本.     

非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体Kras基因突变检测及与临床病理特征的相关性

目的分析非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体(EGFR)、Kras基因突变的情况及其与临床病理学特征的关系。方法收集1110例非小细胞肺癌标本,采用实时荧光PCR法检测标本中EGFR基因第18、19、20和21号外显子及Kras基因第2号外显子12和13密码子的突变情况。结果非小细胞肺癌EGFR基因的突变率为46.1%(512/1 110),Kras基因的突变率为7.1%(79/1110)。EGFR基因突变主要发生在女性、不吸烟和腺癌的患者,突变位点主要集中在第19和21号外显子,第18、19、20和21号外显子突变所占比例分别为3.3%(17/520)、46.0%(239/520)和5.0%(26/520)、45.8%(238/520)。结论非小细胞肺癌患者EGFR基因突变主要发生于女性、不吸烟和腺癌的患者,采用实时荧光PCR法检测分析非小细胞肺癌患者EGFR、Kras基因突变的情况,有助于选择靶向治疗获益人群,为个性化治疗提供依据。     

超声引导粗针活检在非小细胞肺癌诊断及EGFR基因突变检测中的应用

目的:探讨超声引导下粗针活检在周围型非小细胞肺癌的诊断及EGFR基因突变检测中应用价值.方法:31例周围型非小细胞肺癌患者行超声引导下肺肿块粗针活检术,活检小标本行病理学检测及PCR法EGFR基因突变分析.结果:31例非小细胞肺癌活检小标本取材满意率100％,穿刺定性诊断符合率100％,EGFR基因检出率100％,并发症发生率3.2％.病理结果:腺癌25例、鳞癌2例、腺鳞癌3例、肉瘤样癌1例.31例非小细胞肺癌活检小标本中,检测到EGFR基因突变11例,阳性率35.5％.其中5例为第19外显子框内多核苷酸缺失,5例为第21外显子L858R突变,1例为联合突变L861Q/G719X(第18外显子G719X突变和第21外显子L861Q突变).结论:超声引导下肺肿块粗针活检术简便、安全、有效,能明确周围型非小细胞肺癌的诊断,是非小细胞肺癌获得肿瘤组织检测EGFR基因突变的可靠方法.     

非小细胞肺癌患者血清EGFR基因突变循环DNA检测的临床研究

目的:探讨非小细胞肺癌患者血清EGFR基因突变循环DNA检测的临床意义。方法:选取2011年1月-2014年5月于我院接受治疗的124例非小细胞肺癌患者为研究对象,收集血清及组织标本DNA,检测DNA EGFR基因突变情况。结果:124例非小细胞肺癌患者血清EGFR基因检测结果显示:19号外显子突变11例,21号外显子突变8例,血清总检出19例,检出率为15.3%。组织样本中EGFR基因检测结果显示:19号外显子突变27例,21号外显子突变13例,血清总检出40例,检出率为32.3%。在组织样本中,79例男性EGFR基因突变检出14例,比例为17.7%;45例女性EGFR基因突变检出26例,比例为57.8%,相比具有显著性差异(P<0.05)。76例吸烟史患者检出突变16例,比例为21.1%;48例无吸烟史者检出突变24例,比例为50.0%,两者相比差异显著(P<0.05)。血清样本检测中结果与组织样本基本吻合,在性别和吸烟史方面患者基因突变有显著性差异(P<0.05),在癌症分期及类型方面无显著性差异(P>0.05)。结论:非小细胞肺癌患者血清循环DNA检测EGFR基因突变与肿瘤组织检测具有高度的一致性,这对肺癌患者的诊断、筛查和治疗有着重要的意义,为临床检测提供方便、有效的诊断方法。     

改良的内切酶突变体富集法检测肺癌标本中EGFR基因突变

背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变是肺癌靶向药物疗效的可靠预测指标,因此基因突变的检测具有非常重要的临床意义。本研究建立使用常规实验仪器、高灵敏度、简便的检测表皮生长因子受体突变的方法,以利于临床中快速的检测EGFR基因突变。方法采用改良的内切酶法富集法检测251例肺腺癌DNA标本中EGFR基因外显子19缺失突变和21(L858R)点突变,并与直接测序进行比较。利用混合突变/野生型EGFR基因的细胞系测定改良方法的灵敏度。结果在251例腺癌标本DNA中使用测序法检测出EGFR外显子19突变46例、外显子21突变26例。采用改良的突变体富集法检另外测出外显子19突变78例、外显子21突变57例,总突变率53.8%。灵敏度检测显示对于外显子19和21,新方法的检测灵敏度达0.5%。结论本方法具有简便、经济、灵敏度高等特点,便于临床快速筛查非小细胞肺癌病理组织中的EGFR基因突变。     

晚期肺癌血清游离DNA中EGFR外显子19的基因突变研究

目的分析晚期肺癌的上皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)外显子19基因突变的类型及发生率。方法从血清中提取游离DNA进行EGFR外显子19特异性PCR扩增和基因测序。结果24例肺部良性疾病血样中EGFR基因外显子19均为野生型;而130例肺癌血样中检出突变55例,EGFR外显子19基因突变的检出率为42.3%。外显子19基因突变均为第746~752位密码子的碱基缺失,共有7种突变类型。外显子19基因突变主要见于肺腺癌及小细胞肺癌,其检出率分别为58.9%和57.1%,突变与患者年龄及性别无明显相关性。在肺癌的不同组织类型中,外显子19的突变形式存在显著差异,肺腺癌的基因突变谱与肺鳞癌、腺鳞癌及小细胞肺癌明显不同。结论晚期肺癌病人的血清游离DNA中存在EGFR基因突变,这类突变可以通过适当的方法检测出来,这种血液检测方法在晚期肺癌的EGFR基因诊断及靶向治疗中具有广泛的应用价值。     

qPCR-HRM法检测NSCLC组织EGFR突变

目的比较qPCR-HRM法和测序法检测非小细胞肺癌(NSCLC)组织表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的差异。方法收集北京协和医院胸外科2010年6月至2011年7月收治的42例非小细胞肺癌患者的石蜡标本,分别用qPCR-HRM法和测序法检测肿瘤组织EGFR基因突变,使用McNemar检验比较其差别。结果 42例标本qPCR-HRM法检测EGFR突变率为33.3%(14/42),测序法为28.6%(13/42),统计学计算未见差异(P=0.5)。结论 qPCR-HRM法检测NSCLC组织EGFR基因突变是一种灵敏、可靠的检测方法,可用于体细胞EGFR突变的检测和测序前突变的筛选。     

PCR-SSCP检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的敏感性分析

目的 探讨分析PCR-SSCP检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的敏感性.方法 应用PCR-SSCP检测36例非小细胞肺癌标本的突变情况,阳性结果再进行DNA测序.结果 通过PCR-SSCP分析,11例存在突变,突变率为30.6%(11/36);PCR-SSCP分析阳性的结果通过DNA测序全为序列异常.结论 PCR-SSCP检测肺癌EGFR基因突变具有较高的敏感性.     

变性高效液相色谱技术检测非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体基因突变的研究

 目的　探讨采用变性高效液相色谱（DHPLC）技术检测表皮生长因子受体（EGFR）基因突变的优势。方法　应用DHPLC技术检测49例非小细胞肺癌（NSCLC）患者EGFR基因第19与21外显子突变情况,并应用DNA直接测序法验证DHPLC检测基因突变的准确性。结果　49例NSCLC患者中,应用DHPLC检测出13例EGFR基因突变;其中第19外显子缺失突变10例（76.92 %）;第21外显子替代突变3例（23.08 %）。DNA直接测序法突变检测结果与DHPLC一致,DHPLC检测EGFR基因突变灵敏度为100 %。结论　DHPLC技术可以快速、准确、大规模筛选EGFR基因突变。     

肺癌细胞学及血液标本表皮生长因子受体基因突变对比研究

目的:研究肺癌患者渗出液细胞学及血液标本中表皮生长因子受体(EGFR)第18、19、21外显子基因突变频率和类型以及与肿瘤组织学标本的关系。方法:收集肺癌患者渗出液细胞学标本53例及血液标本24例,提取DNA,聚合酶链反应扩增EGFR外显子18、19、21序列,用直接测序法检测基因序列,分析EGFR基因突变频率和类型以及与肿瘤组织学标本的关系。结果:53例细胞学标本检测到15例EGFR基因突变（28.3%,15/53）,18外显子突变1例,19外显子突变5例,21外显子突变9例,细胞学标本与肺腺癌组织学标本突变率（32.2%）相比,差异没有显著性（P=0.624）。24例血液标本中检测到1例突变（4.2%,1/24）,位于21外显子,血液标本与肿瘤组织学标本突变率相比,差异有显著性(P=0.006)。结论:肺癌患者渗出液细胞学标本适用于直接测序法检测EGFR突变,血液标本不适于用直接测序法检测肿瘤EGFR基因突变状态。     

福建省非小细胞肺癌患者EGFR基因突变分析

 目的　检测福建省非小细胞肺癌（NSCLC）患者表皮生长因子受体（EGFR）基因突变情况。方法　提取50例NSCLC患者新鲜癌组织及其对应的正常组织标本的DNA，用EGFR基因巢式聚合酶链反应（PCR）及脱氧核糖核酸（DNA）测序技术分析NSCLC患者EGFR基因突变情况。结果　50例NSCLC患者的正常组织EGFR第19、21外显子均为野生型，而50例NSCLC患者的癌组织EGFR基因突变检出率为26 ％（13／50）。第19外显子缺失突变10例，第21外显子替代突变3例。结论　福建省NSCLC患者EGFR突变以19外显子突变为主。