蒙药安神补心六味丸抗抑郁作用网络药理学机制研究北大核心CSCD

目的应用网络药理学、分子对接技术、体外实验技术,预测以及验证蒙药安神补心六味丸的抗抑郁药理作用机制。方法TCMSP数据库及文献挖掘获取安神补心六味丸的活性成分,SwissTargetPrediction预测成分相关靶点信息,Cytoscape构建药材-成分-靶点网络。通过GeneCards、Drugbank、OMIM等数据库检索抑郁症靶点。STRING数据库获取蛋白相互作用关系网络信息。DAVID数据库进行GO生物过程富集分析和KEGG信号通路富集分析。Autodock vina软件进行分子对接验证。BV2小胶质细胞建立体外损伤模型,CCK-8法检测细胞活力,qPCR法检测相关核心靶点mRNA表达量。结果筛选出安神补心六味丸活性成分34个,涉及140个潜在作用靶点,筛选核心靶点59个,共涉及99条信号通路;分子对接结果显示桦木酸、豆甾醇、β-谷固醇、槲皮素等10种活性成分与AKT1、APP、ALB、MAPK3、VEGFA、MAPK1靶点均拥有良好的结合能力。体外实验结果表明,经给药后,BV2细胞活力较模型组明显上升。安神补心六味丸可调节各核心靶点mRNA的表达。结论安神补心六味丸可能主要通过羟色胺突触等信号通路以及相关核心靶点来发挥抗抑郁作用。     

基于UPLC-Q-TOF-MS/MS和网络药理学研究连翘治疗急性肺损伤的作用机制

目的: 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析连翘的入血成分,并结合网络药理学研究连翘治疗急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的作用机制。方法: 使用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)建立ALI大鼠模型,采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术鉴定连翘的入血成分,结合PharmMapper、GeneCards和Disgenet数据库筛选连翘入血成分治疗ALI的潜在作用靶点,String平台绘制蛋白互作(PPI)网络图,Cytoscape软件做网络拓扑分析并筛选核心靶点,通过David数据库对核心靶点富集分析,使用Autodock Vina和PyMol软件对相关入血成分与核心靶点进行分子对接。结果: 肺组织切片结果显示ALI大鼠模型制备成功;得到37个连翘入血成分;连翘治疗ALI核心靶点70个,涉及PI3K/Akt、MAPK和Ras等152个相关通路;agatholic acid、无梗五加苷B、连翘苷、连翘酯苷A和芦丁5个入血成分与核心靶点JAK2和JAK3分子对接的结合能均小于-4.25 kJ·mol^-1,对接结果良好。结论: 该研究明确了连翘的入血成分,网络药理学预测agatholic acid、无梗五加苷B、连翘苷、连翘酯苷A和芦丁可能为连翘防治ALI的主要成分,其作用机制可能与靶向JAK2和JAK3调控PI3K/Akt信号通路有关。     

基于网络药理学探讨枣仁安神颗粒治疗失眠的作用机制

目的 基于网络药理学探讨枣仁安神颗粒治疗失眠的作用机制。方法 通过查阅相关文献,挖掘枣仁安神颗粒的入血成分,并采用反向分子对接,预测入血成分的相关靶点,与失眠靶点进行交集映射,获得其治疗失眠的作用靶点。利用蛋白互作筛选核心靶点,并进行分子对接验证。基于共有靶点,采用功能注释生物信息学芯片进行分析,得到枣仁安神颗粒治疗失眠的关键通路。结果 方中3味中药酸枣仁、丹参、北五味子共得到29个入血成分和184个潜在靶点,其中19个成分、60个靶点和36条通路与失眠极为密切,主要涉及神经活性配体-受体相互作用、色氨酸代谢、5-羟色胺能突触、GABA能突触等相关分子环节。结论 方中3味中药以作用靶点为媒介,连接入血成分及相关通路,从而发挥抗失眠的生物学效应,体现了中药多成分、多靶点,多途径协同起效的作用特点。     

基于网络药理学及分子对接探讨淡豆豉抗抑郁的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术预测淡豆豉抗抑郁活性成分、作用靶点及通路，探讨其潜在作用机制。方法 利用CNKI、TCMSP、TCMIP检索并筛选淡豆豉抗抑郁潜在活性成分；运用PharmMapper服务器预测活性成分的作用靶点；利用UniProt数据库查询靶点蛋白对应的基因名；运用DrugBank、GeneCards和DisGeNET数据库检索抗抑郁作用靶基因，并将活性成分靶点相互映射获得淡豆豉活性成分抗抑郁靶点；通过String数据库下载靶蛋白相互作用数据，与获取的潜在作用靶点利用Cytoscape 3.7.2.软件构建淡豆豉–活性成分–潜在靶点相互作用网络图。运用DAVID数据库分析潜在靶点的基因本体（GO）分子功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路，最后利用Autodock Vina和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果 预测获得淡豆豉主要活性成分8个，作用靶点396个，与抑郁症交集潜在靶点334个，GO分子功能和KEGG通路涉及多种生物学过程以及脂质和动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、小分子量G蛋白（Ras）信号通路、叉头框蛋白（FoxO）信号通路等多个信号通路。将关键活性成分和靶点进行对接，其中丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）与大豆苷元结合能力较好；磷酸肌醇3-激酶调节亚基1（PIK3R1）与木犀草素、槲皮素结合能力较好；HSP90-α热休克蛋白（HSP90AA1）与黄豆黄素结合能力较好。结论 淡豆豉以多种活性成分、多个作用靶点和途径发挥其抗抑郁作用，为淡豆豉在临床上用于抑郁症的干预和治疗提供依据。     

基于网络药理学和分子对接法探讨安神补心六味丸治疗冠心病的作用机制

摘要：目的:采用网络药理学和分子对接法探讨蒙药安神补心六味丸治疗冠心病（CHD）的分子作用机制。方法:通过文献挖掘、多个数据库检索收集整理并筛选安神补心六味丸的活性成分以及治疗CHD的相关靶点,运用Cytoscape 3.6.0构建"中药-活性成分-靶基因"网络,使用String数据库并结合Cytoscape 3.6.0筛选出关键靶点;通过DAVID数据库对潜在靶点进行功能及信号通路富集分析,利用Auto Dock Vina对成分和靶基因网络分析结果进行分子对接验证。结果:从安神补心六味丸中筛选得到52个活性成分,涉及CHD作用靶点141个,网络拓扑分析筛选出24个关键靶点,基因本体（GO）功能富集分析得到GO条目263个,京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析筛选得到29条信号通路,主要涉及亚油酸代谢、花生四烯酸代谢和Ras信号通路等。通过分子对接得到结合能≤-5 kcal·mol-1的活性成分20个,与排名前6的关键靶点均有较好的亲和力。结论:安神补心六味丸中的活性成分鞣花酸、异鼠李素及柚皮苷等能作用于多个靶点和调控多条通路,对CHD可能具有治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接的薏苡附子散对类风湿性关节炎及慢性心力衰竭“异病同治”作用机制探讨

目的 基于网络药理学和分子对接方法探讨薏苡附子散治疗类风湿性关节炎(RA)及慢性心力衰竭(CHF)"异病同治"的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选薏苡附子散的活性成分,并利用 Pubchem 数据库获得 Smile 号,进而通过 Swiss Target Prediction 数据库获取活性成分对应的靶点。在 GeneCards 和 OMIM数据库平台预测 RA 及 CHF 疾病作用靶点。对活性成分靶点与疾病交集靶点进行蛋白质相互作用(PPI)网络构建及核心靶点筛选,并进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。筛选核心成分和核心靶点,利用 AutoDock 软件进行分子对接验证。结果 从薏苡附子散中共筛选得到符合条件的活性成分 10 个,活性成分潜在作用靶点 403 个,RA 疾病靶点 1 112 个,CHF 疾病靶点 2 983 个,取交集,获得药物、疾病交集靶点 69 个。GO 富集分析结果显示主要与炎症反应的调节、MAPK 级联调控、对氧化应激的反应、骨化的调节、平滑肌细胞增殖等相关;KEGG 通路富集分析得到 236 条通路,与RA及CHF相关且排序较靠前的通路有 PI3K-Akt 信号通路、NF-κB 信号通路、MAPK 信号通路等。分子对接结果表明,薏苡附子散中的核心成分多根乌头碱、水黄皮素、豆甾醇具有与核心靶点 TNF、SRC、ESR1 和 PTGS2良好的结合潜力。结论 薏苡附子散治疗 RA 和 CHF 具有多靶点效应,涉及多条生物过程和信号通路,可能通过调控炎症反应、氧化应激反应、血管生成和发育、心脏收缩调节及 MAPK 级联调控等发挥"异病同治"作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探究脾积丸治疗胰腺癌的分子机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究脾积丸治疗胰腺癌的潜在通路与物质基础。方法 以口服生物利用度（OB）≥30%与类药性（DL）≥0.18为筛选条件,在中药系统药理学平台（TCMSP）数据库获取脾积丸主要活性成分及关键靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb和TDD数据库获得胰腺癌主要靶点;绘制Venn图,构建主要成分–关键靶点网络图,绘制蛋白互作（PPI）网络;进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后以分子对接来验证所得靶点。结果 筛选得到32个活性成分,预测获得210个靶点,核心基因17个;脾积丸治疗胰腺癌的活性成分是槲皮素、山柰酚、柚皮素、芒柄花黄素、川陈皮素。GO功能富集分析得到生物过程（BP）2 409个、细胞组成（CC）91个、分子功能（MF）14个;KEGG通路富集分析获得179条通路。核心成分与主要核心靶点有一定的结合活性,其中槲皮素与HIF1A靶点对接活性最好。结论 脾积丸可通过多成分、多靶点和多通路发挥治疗胰腺癌的作用,为后续探究脾积丸治疗胰腺癌提供研究思路。     

基于网络药理学及分子对接探讨山楂改善代谢性高血压的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨山楂改善代谢性高血压(metabolic hypertension,MH)的物质基础及作用机制。方法 利用HERB、ETCM数据库并结合文献调研收集山楂成分；通过SwissTargetPrediction、GeneCards等数据库筛选山楂的全部成分改善MH的靶点；借助Cytoscape软件构建山楂“活性成分-靶点-疾病”网络；利用DAVID进行GO富集及KEGG通路分析；并借助Autodock软件对核心成分和核心靶点进行分子对接验证。结果 从山楂中筛选出89个活性成分，作用于84个靶点，其中山楂改善MH的核心活性成分为山楂酸、阿里红酸B、亚麻酸、亚油酸、甲基正壬酮、芹菜素、熊果酸等；核心靶点为CYP19A1、PPARA、ESR1、PTGS2、PPARG、NR3C1、MMP9、TNF等；作用机制主要涉及炎症、糖脂代谢、血管内皮功能等多条信号通路；分子对接显示山楂核心活性成分与核心靶点具有较高亲和力。结论 山楂可能通过多成分调节TNF、IL-17、AGE-RAGE、HIF-1、cGMP-PKG等多条信号通路，进而抑制炎症反应、改善糖脂代谢异常、改善血...     

红禾麻入血成分治疗类风湿性关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接的方法探究红禾麻入血成分治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的作用机制。方法 在数据库中预测入血成分和疾病相关靶点,获取两者的共有靶点并运用String数据库分析蛋白-蛋白相互作用关系。利用Metascape数据库对共有靶点进行基因功能注释（Gene Ontology, GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）富集分析;建立红禾麻入血成分-靶点网络和入血成分-靶点-信号通路网络图,综合筛选关键靶点;运用AutoDock vina软件对入血成分与关键靶点进行分子对接验证。结果 红禾麻入22个血移行成分和代谢产物作用于292个疾病靶点;INS、IL-6、MAPK3及TNF等可能是红禾麻治疗RA的关键靶点,涉及对细胞氮化合物反应、激素刺激反应和有机氮化合物反应等生物过程,主要涉及的传导途径是TNF信号通路与Th17细胞分化等。分子对接结果显示,黄酮类和酚酸类可能是红禾麻治疗RA的主要活性成分,与关键靶点产生较强的亲和力。结论 红禾麻治疗RA具有...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨柏子养心丸治疗失眠症的作用机制

目的 采用网络药理学方法及分子对接技术探讨柏子养心丸治疗失眠症的潜在分子机制。方法 通过TCMSP数据库收集柏子养心丸的主要化学成分,经ADME筛选活性化合物并获取其作用靶点;搜索GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank数据库归并失眠症相关疾病基因;使用R语言程序对药物与疾病靶点取交集并上传至STRING平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,应用Cytoscape软件进一步判别其核心模块;基于R语言平台对交集靶点进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape软件构筑"柏子养心丸活性成分-失眠症基因"网络,并使用CytoNCA工具分析其关键药效组分与核心靶点;运用AutoDock套件进行网络关键成分与靶点的分子对接验证,并追溯PPI核心模块与其关联成分实行潜在成分与靶标的二次挖掘。结果 共筛选出槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芩素、柚皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等柏子养心丸的有效成分,治疗失眠症的作用靶点为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、雌激素受体1(ESR1)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、环加氧酶1(PTGS1)等,各靶点与对应成分的对接活性较强。生物学通路主要涉及神经活性配体-受体相互作用通路、神经退行性变-多种疾病通路、脂质和动脉粥样硬化通路等。结论 从多角度全方位阐明柏子养心丸以"多成分、多靶点、多途径"的模式干预失眠症的潜在机制,可为其质量标准完善和机制深入考察夯实基础。     

基于网络药理学结合分子对接技术分析血平片治疗月经不调的作用机制

目的运用网络药理学和分子对接技术探讨血平片治疗月经不调的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索血平片有效成分的活性靶点,GeneCard和Disgenet数据库检索与“irregular menstruation”相关的疾病靶点,筛选出交集靶点并输入String数据库构建蛋白互作网络,利用Cypscape数据库分析并筛选出核心靶点,构建疾病–通路–靶点–化学成分网络。使用David数据库对交集靶点进行基因本体（GO）和京东基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 通过网络拓扑关系图筛选出了柚皮素、大黄酚、山柰酚、甲基异茜草素、大黄素和大黄素甲醚6个主要成分与丝苏氨酸特异性蛋白激酶（Akt1）、肿瘤坏死因子（TNF）、原癌基因酪氨酸蛋白激酶（SRC）、雌激素受体1（ESR1）、表皮生长因子受体（EGFR）和过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARG）6个核心靶点进行分子对接验证。结果显示,血平片活性成分大黄素、甲基异茜草素、山柰酚等与Akt1、TNF、SRC、ESR1、EGFR、PPARG均有较好的结合活性。结论 血平片可通过多成分作用多靶点治疗月经不调。     

基于网络药理学的香附抗抑郁作用机制研究

目的 基于网络药理学方法研究香附多成分-多靶点-多途径的抗抑郁潜在作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库、文献挖掘和本实验室已有研究收集香附化学成分，并依据类药原则进行筛选。使用PhamMapper和DrugBank数据库进行靶点预测和筛选，通过MAS 3.0及KEGG通路注释分析香附抗抑郁效应化学成分的作用通路，采用Cytoscape 3.6.1软件构建"化合物-核心靶点-通路"网络，预测其抗抑郁药效成分及相关作用靶点。结果 香附中的69个化合物作用于103个靶点，29个核心靶点。构建的"化合物-核心靶点-代谢通路"网络预测发现，香附中48个化学成分直接或间接作用于15个核心靶点，8条抑郁相关代谢通路，主要涉及细胞过程、对应激的应答等生物过程，通过调节黏附斑、神经营养因子、血管内皮生长因子（VEGF）、促性腺激素释放激素（GnRH）、NOD样受体、胰岛素、趋化因子、ErbB信号通路发挥抗抑郁作用。结论 网络药理学分析结果初步揭示了香附以多成分、多靶点、多通路的协同作用方式发挥抗抑郁效应机制。     

基于网络药理学从线粒体自噬途径探讨八味沉香散抗缺血性心脏病的作用机制北大核心CSCD

目的基于网络药理学结合分子对接技术及细胞实验验证,探讨八味沉香散经线粒体自噬途径抗缺血性心脏病(ischemic heart disease,IHD)的潜在机制。方法利用Swiss target prediction平台预测八味沉香散入血成分靶点;从GeneCards、NCBI、OMIM数据库中筛选缺血性心脏病、线粒体自噬相关靶点;取三者交集得到八味沉香散经线粒体自噬途径抗缺血性心脏病的潜在靶点。构建“成分-疾病-潜在靶点”网络及蛋白质相互作用网络,分别进行网络分析筛选出关键活性成分和核心靶点,并进行分子对接。利用DAVID数据库进行GO富集及KEGG富集分析。构建H9C2细胞缺氧模型,考察八味沉香散含药血清对H9C2细胞存活率、自噬水平及关键通路相关蛋白表达的影响。结果筛选得到八味沉香散经线粒体自噬途径抗IHD的关键活性成分9种,核心靶点8个;分子对接结果显示关键活性物质和核心靶点均有较好的结合活性。KEGG结果显示八味沉香散经线粒体自噬途径抗IHD的作用可能与EGFR、PI3K-Akt、MAPK、FoxO等信号通路有关。细胞实验结果表明八味沉香散可增加缺氧条件下H9C2细胞的细胞活性,明显降低细胞中LC3、p62的蛋白相对表达量,升高p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT的蛋白相对表达量。结论八味沉香散可能通过槲皮素、山奈酚、柚皮素、去氢二异丁香酚等活性成分作用于AKT1、STAT3、MAPK3,EGFR等多个靶点调控线粒体自噬发挥抗缺血性心脏病的作用,其具体机制可能与PI3K-AKT信号通路相关。     

基于网络药理学和分子对接技术挖掘半贝丸治疗支气管炎的作用机制

目的 通过网络药理学及分子对接技术探讨半贝丸治疗支气管炎的分子作用机制。方法 基于TCMSP数据库结合文献报道筛选半贝丸的有效活性成分并预测作用靶点,构建半贝丸"成分-靶点"网络;运用GeneCards数据库和OMIM数据库获取支气管炎疾病靶点,构建韦恩图,获得半贝丸治疗支气管炎的作用靶点;采用Cytoscape软件构建"疾病-活性成分"网络模型;运用String平台将共同靶点进行蛋白相互作用(PPI)网络分析,通过Metascape数据库对靶点进行基因本体(GO)功能富集及基因组百科全书(KEGG)通路富集;并采用SwissDock在线数据库进行分子对接。结果 筛选得到半贝丸活性成分29个,共获得潜在靶点95个,支气管炎疾病靶点1 964个,半贝丸与支气管炎共同靶点49个。网络分析结果表明,半贝丸治疗支气管炎的关键靶点包括蛋白激酶(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤抑制因子P53(TP53)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、原癌基因c-Jun产物(JUN)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)等,主要通过细胞对有机环状化合物的反应、凋亡信号通路、转录调节复合物、半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路等生物过程发挥作用,KEGG富集主要涉及磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/Akt、细胞凋亡、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)等信号通路。分子对接结果显示半贝丸中β-谷固醇、黄芩素、豆甾醇等关键化合物与Akt1、VEGFA、TP53、CASP3等关键靶点有较好的结合能力。结论 半贝丸治疗支气管炎具有多成分、多靶点和多通路等特征。     

基于网络药理学探讨白头翁抗结直肠癌的作用机制

目的通过网络药理学筛选白头翁中有效成分,探讨白头翁抗结直肠癌的物质基础及作用靶点和信号通路。方法利用中药分子机制生物信息学分析工具数据库BATMAN-TCM筛选白头翁活性化合物及其靶点;通过PharmDB-K和Dis Ge NET数据库获取直肠癌基因后与白头翁中有效化合物基因靶点交集,获得疾病-药物靶基因;使用蛋白质相互作用网络数据库String将疾病-药物-蛋白靶基因进行蛋白互作分析,运用R语言筛选出核心基因;运用R包及Cytoscape3.2.1的Clue GO插件进行GO分析和KEGG通路富集分析。最后分别采用SYBYL-X2.0与Discovery Studio4.5软件进行分子对接,将药物活性成分与靶基因进行结合活性的双重验证。结果在白头翁成分中,共有11个活性化合物,对应508个靶标基因,与结直肠癌靶标基因进行交集后共有67个基因;在此基础上筛选出21个核心基因,其主要通过在p53信号转导通路,结直肠癌通路,癌症中的中心碳代谢通路等11条核心通路发挥抗癌作用。分子对接验证结果表明,白头翁活性成分中,皂苷类、生物碱成分与结直肠癌靶标基因均有较好结合作用,其中包括:葳岩仙皂苷A与HSP90、KIT、SIRT1能结合,蝙蝠葛碱与NR3C1、ESR1、KIT结合。结论白头翁通过多成分、多靶点、多通路治疗结直肠癌,为白头翁抗肿瘤治疗的作用机制及后续实验验证提供了依据及基础。     

基于网络药理学与分子对接技术探讨蛇床子治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的 运用网络药理学结合分子对接技术探讨蛇床子治疗阿尔茨海默病的作用机制。方法 借助TCMSP数据库获取蛇床子的活性成分及潜在作用靶点;检索GeneCards、OMIM、DisGeNET数据平台得到阿尔茨海默病的潜在作用靶点,筛选两者共同靶点;应用Cytoscape 3.7.1构建蛋白相互作用（PPI）网络图并筛选发挥治疗作用的关键靶点,再借助R语言进行基因本体（GO）功能分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;运用AutoDock Vina软件,对核心靶点和药物主要活性成分进行分子对接,验证网络分析结果。结果 蛇床子包含主要活性成分20个,化学成分与疾病共同靶点56个,网络拓扑分析显示B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、雌激素受体α(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、糖原合成酶激酶3β(GSK3B)、半胱氨酸蛋白水解酶3(CASP3)为关键靶点,通过调控神经活性配体-受体的相互作用、钙信号通路、p53信号通路、多种细胞凋亡、磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B(Akt)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等发挥治疗作用。分子对接验证中...     

基于网络药理学探究当归芍药散入血成分治疗原发性痛经的有效性及机制

目的 以当归芍药散入血成分为研究对象，基于网络药理学和动物实验探究当归芍药散治疗原发性痛经的有效性及作用机制。方法 运用Gene Cards、OMIM数据库筛选与当归芍药散入血成分对接的原发性痛经靶点，利用R语言获得关键靶标，进行蛋白互作网络构建，针对筛选出的靶点进行GO和KEGG通路富集；利用AutoDock Vina 1.2.3版软件进行分子对接；通过当归芍药散给药干预原发性痛经模型大鼠，从行为学和组织病理学角度验证当归芍药散的有效性。结果 共筛选出当归芍药散入血成分12个，作用于肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-6、VEGFA、PTGS2等核心靶点，主要参与IL-17、TNF、花生四烯酸代谢等信号通路。分子对接显示Z-丁烯基酞内酯、洋川芎内酯I、芍药内酯苷3个活性成分与靶标蛋白结合能力较强。动物实验表明，原发性痛经模型大鼠扭体反应明显增加(P<0.05),子宫内膜剥脱及水肿严重；当归芍药散能有效减少大鼠扭体次数(P<0.05),减轻子宫内膜剥脱及水肿。结论 当归芍药散主要通过中枢镇痛、调控激素效应、抑制子宫炎症反应等药理作用发挥治疗原发性痛经的效果，...     

基于网络药理学和分子对接探索血必净注射液治疗冠状病毒肺炎的潜在机制

目的基于网络药理学和分子对接预测血必净注射液治疗冠状病毒肺炎潜在靶点及分子机制,为揭示血必净注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在网络作用机制提供科学依据。方法检索国内外文献获取血必净注射液主要活性成分,通过ETCM、TCMSP及Targetnet在线数据库预测作用靶点;检索GeneCards、CTD及OMIM数据库获取冠状病毒肺炎相关靶点;整合分析获取血必净注射液治疗冠状病毒肺炎的靶点;采用STRING分析靶点蛋白的互作关系;通过Enrichr数据库进行基因功能及作用通路富集分析;采用Cytoscape软件进行网络可视化;最后采用iGEMDOCK软件对关键靶点进行分子对接分析。结果本研究共收集到血必净注射液中活性成分30个,可作用于222个靶点,进一步分析其治疗冠状病毒肺炎的17个核心成分与18个核心靶点,主要作用于甲型流感,NF-κB、HIF-1及VEGF等信号通路。发现与关键靶点对接较好的成分有羟基红花黄色素A、绿原酸及丹酚酸B等。结论本研究揭示了血必净注射液治疗冠状病毒肺炎多成分、多靶点、多通路的特点,可为其治疗COVID-19潜在网络作用机制提供新的线索。     

基于“活性成分-作用靶点-通路”网络葛根抗缺氧作用生物机制研究

目的应用网络药理学技术,构建葛根抗缺氧作用的"活性成分-作用靶点-通路"网络,阐述葛根抗缺氧作用生物机制。方法基于化学成分数据库及Linpinski 5规则筛选葛根活性成分;Swiss target prediction及Genclips预测葛根抗缺氧作用靶点,String构建靶点交互作用网络并分析其关键靶点;DAVID数据库富集作用靶点的代谢通路,Cytoscape构建"活性成分-作用靶点-通路"网络,阐述葛根抗缺氧作用的生物机制。分子对接技术对分析结果进行可靠性验证。结果发现葛根抗缺氧主要活性成分34个,主要是异黄酮类、酚类化合物;作用靶点44个,其中ESR1,PTGS2,EGFR,NOS3,AR是关键靶点,作用靶点涉及一氧化代谢通路、5羟色胺突触通路、缺氧诱导因子信号通路等12条通路。分子对接结果显示多数活性成分与关键靶点具有结合作用。"活性成分-作用靶点-通路"网络显示葛根异黄酮、酚类活性成分通过疾病靶点,调控一氧化代谢通路、5羟色胺突触、HIF-1信号等通路。结论葛根异黄酮、酚类活性成分可能通过ESR1,PTGS2,EGFR等靶点调节缺氧诱导因子信号、一氧化氮代谢、5羟色胺等通路发挥抗缺氧作用。     

基于网络药理学与分子对接探讨二妙散治疗宫颈人乳头瘤病毒感染的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨二妙散治疗宫颈人乳头瘤病毒（HPV）感染作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台检索二妙散的有效成分和作用靶点;GeneCards、OMIM数据库检索宫颈HPV感染相关疾病靶点。将药物有效成分作用靶点与疾病靶点取交集;利用STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用（PPI）网络,利用Cytoscape 3.8.2软件对PPI进行拓扑分析;将潜在作用靶点导入DAVID数据库进行基因本体功能（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用AutoDock Tools 1.5.7软件和Pymol软件对核心作用靶点与有效成分进行分子对接及可视化。结果 获得二妙散有效成分28个,作用靶点为221个,筛选出核心靶点5个,包括蛋白激酶B1（Akt1）、肿瘤蛋白p53（TP53）、雌激素受体α（ESR1）、转录因子AP-1（JUN）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3（CASP3）。GO富集分析显示,潜在作用靶点与细胞增殖的正向调节、细胞凋亡过程的负调控、转录的正调控、RNA聚合酶II启动子转录的正调控等生物过程有关;KEGG富集分析结果包括磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/Akt信号通路、白细胞介素-17（IL-17）信号通路、细胞衰老、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路等,核心作用靶点与有效成分具有较稳定的结合能力。结论 二妙散具有多种活性成分,通过多靶点、多途径干预宫颈HPV感染,发挥治疗作用。