人脂联素基因启动子荧光素酶报告基因载体的构建

目的:克隆不同长度人脂联素基因(AD)启动子片段,构建含人AD启动子片段的荧光素酶报告基因载体并进行测序鉴定。方法:利用PCR技术从人全血基因组DNA中扩增出AD启动子片段,经纯化酶切后克隆入载体pGL-3 basic中,形成重组质粒,筛选阳性克隆进行测序,并与GenBank比对。结果:从人全血基因组DNA中PCR扩增得到1.1 kb和2.1 kb AD启动子片段,构建2种报告基因载体,将其命名为AD promoter1.1-pGL-3 basic和AD promoter2.1-pGL-3 basic,经测序证实所插入的目的片段与GenBank检索的人AD启动子序列99.6%匹配。结论:成功构建了含人AD启动子片段的报告基因载体。     

重组腺病毒PAd-VP3的制备及其与姜黄素协同诱导SW480细胞凋亡的实验研究

目的利用细菌内同源重组法构建携带凋亡素VP3基因的重组腺病毒,观察其与姜黄素单独或联合对结肠癌SW480细胞凋亡及周期分布的影响。方法设计VP3 cDNA扩增引物,从PET15b-VP3质粒中扩增VP3 DNA序列,与pShuttle-IRES-hrGFP连接构建pShuttle-VP3-hrGFP穿梭质粒,PCR和EcoRⅤ酶切电泳鉴定;线性化穿梭质粒pShuttle-VP3-hrGFP,转化含pAdeasy-1的超感受态BJ5183大肠杆菌,构建pAd-VP3重组腺病毒质粒并经PCR、电泳及测序鉴定,线性化腺病毒质粒经脂质体转染AD293细胞进行pAd-VP3重组腺病毒的包装和扩增,CsCI密度梯度离心法进行病毒浓缩和纯化并将其单独或联合姜黄素作用人结肠癌SW480细胞,观察其对细胞凋亡及周期分布的影响。结果pShuttle-VP3-hrGFP穿梭质粒构建鉴定成功,pAd-VP3重组腺病毒质粒经酶切获得一大于23 kb的大片段和4.5kb的片段,PCR反应扩增出了402 bp的片段,重组质粒测序证实VP3-hrGFP编码区成功地克隆入了腺病毒pAd中,且其序列与GeneBank中VP3 CDNA序列完全一致。成功包装出携带VP3基因的腺病毒,滴度为1.738×1012opu·ml-1,获得的重组腺病毒及姜黄素单独或合用均可阻滞细胞周期于G0/G1期,诱导细胞凋亡(P0.05,P0.01),二药联用效果更为显著(P0.01)。结论细菌内同源重组法可快速、高效地制备携带凋亡素VP3基因的重组腺病毒,并能与姜黄素协同通过阻滞细胞周期于G0/G1期诱导结肠癌SW480细胞凋亡。     

糖尿病肾病肾阴虚证DNA消减文库的构建

在多年糖尿病肾病(diabetic nephropathy，DN)肾虚证的研究中，结果发现血管紧张素Ⅰ转换酶(angiotensin Ⅰ—converting enzyme．ACE)基因多态性与肾阴虚证密切相关。这提示肾阴虚证存在其相关基因。目前克隆疾病的相关基因有多种方法，其中抑制性消减杂交(suppression subtractiv ehybridization。SSH)对研究复杂基因组的差异基因具有一定的优越性。目的：采用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridiration，SSH)构建汉族人糖尿病肾病(diabetic nephropathy，DN)肾阴虚证DNA消减文库。方法：选择汉族DN且中医辨证为肾阴虚证的患者以及正常人作为其对照组，进行正向和反向消减杂交。用硅胶法抽提血白细胞DNA。用Rsa Ⅰ酶切基因组DNA成大小不等的片段，分别与两种不同的接头连接．进行两次消减杂交及两次抑制性PCR，将PCR产物与U载体连接，经蓝白斑筛选后，再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒，构建DN肾阴虚证DNA消减文库。结果：用SSH方法筛选出了DN肾阴虚证的差异DNA片段，得到586个白色克隆，再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒，从而成功地构建了DN肾阴虚证的DNA消减文库。结论：SSH技术能够快速有效地分离差异DNA片段以构建DN肾阴虚证DNA消减文库．为进一步筛选和克隆DN肾阴虚证相关基因奠定了基础。     

板桥党参基因组DNA提取方法的改进及其18S rRNA基因序列分析

目的:为研究道地药材板桥党参Codonopsis tangshen Oliv.的遗传多样性、种类鉴定等,提取高质量的基因组DNA;探讨板桥党参18S rRNA基因的序列特征,为板桥党参分子鉴定提供分子依据。方法:以板桥党参鲜嫩叶片为材料,采用自行改进的CTAB法提取出基因组DNA;采用PCR直接测序技术测定板桥党参的18S rRNA基因序列,并分析其序列组成。结果:使用改进的CTAB法从鲜叶中提取板桥党参的基因组DNA浓度较高;以其基因组DNA为模板对18S rRNA基因进行PCR克隆并测序,获得了板桥党参18S rRNA基因序列特征。结论:改进的CTAB法提取板桥党参基因组DNA效果较好;DNA测序技术可作为板桥党参基原鉴定准确而有效的分子鉴定方法。     

糖尿病肾病肾阴虚证DNA消减文库的构建

在多年糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾虚证的研究中,结果发现血管紧张素Ⅰ转换酶(angiotensin Ⅰ-converting enzyme,ACE)基因多态性与肾阴虚证密切相关[1].这提示肾阴虚证存在其相关基因.目前克隆疾病的相关基因有多种方法,其中抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)对研究复杂基因组的差异基因具有一定的优越性.目的:采用抑制性消减杂交技术(suppression sub-tractive hybridization,SSH)构建汉族人糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证DNA消减文库.方法:选择汉族DN且中医辨证为肾阴虚证的患者以及正常人作为其对照组,进行正向和反向消减杂交.用硅胶法抽提血白细胞DNA,用RsaⅠ酶切基因组DNA成大小不等的片段,分别与两种不同的接头连接,进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将PCR产物与U载体连接,经蓝白斑筛选后,再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建DN肾阴虚证DNA消减文库.结果:用SSH方法筛选出了DN肾阴虚证的差异DNA片段,得到586个白色克隆,再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了DN肾阴虚证的DNA消减文库.结论:SSH技术能够快速有效地分离差异DNA片段以构建DN肾阴虚证DNA消减文库,为进一步筛选和克隆DN肾阴虚证相关基因奠定了基础.     

中药半夏的DNA分子与分子鉴别

目的 :分析半夏 [Pinelliaternata(Thunb .)Breit.]的核基因组 18SrRNA基因核苷酸序列 ,以中药半夏正品基原进行分子鉴别。方法 :采用PCR直接测序技术测定半夏及其伪品的 18SrRNA基因序列并作DNA序列变异分析。结果 :半夏和伪品虎掌的 18SrRNA序列长度均为 180 5bp ,两者存在 4个变异位点 ,而且在半夏 18SrRNA序列中有一个限制性内切酶AseⅠ识别位点 ,通过PCR RFLP图谱分析可以区别两者。结论 :通过DNA序列和PCR RFLP图谱差异分析 ,可对半夏正品基原进行准确而有效的分子鉴别     

人胰激肽原酶的表达

 目的克隆人胰腺组织激肽原酶基因，构建分泌型原核表达载体。方法使用RT-PCR的方法扩增人胰腺组织cDNA，从中扩增出激肽原酶基因。将扩增的激肽原酶基因用XhoⅠ和EcoRⅠ双酶切后，连接到同样双酶切处理的pET-20b(+)载体上，酶切鉴定后，进行核苷酸序列分析和融合蛋白的表达。结果将IPTG诱导表达的菌体进行SDS-PAGE，在相对分子质量31.4×103处可见明显的高表达带。蛋白质免疫印迹实验表明，重组蛋白具有激肽原酶的抗原性。结论成功克隆人胰腺组织激肽原酶基因，并高效表达融合蛋白，为进一步开发基因工程药物打下基础。     

沉默人p38MAPK基因表达的RNA干扰的逆转录病毒载体的构建

目的构建沉默人p38MAPK基因表达的RNA干扰的逆转录病毒表达载体。方法查找人p38MAPK cDNA序列,利用软件设计并合成能够形成互补双链并能转录出靶向人p38MAPK基因的短发夹状RNA的两条寡核苷酸序列,退火后连接至线性化载体pSIREN上,获得重组质粒pSIREN-p38MAPK,酶切和测序进行鉴定。结果双酶切重组质粒获得特定的酶切图谱,证实所合成核酸片段的正确重组;测序结果显示重组核酸片段序列与设计的序列完全相同。结论成功构建了沉默人p38MAPK基因的重组质粒pSIREN-p38MAPK。     

基因测序技术在中药质量研究中的应用(Ⅰ)——山东郓城猴头半夏基原的DNA测序鉴别

目的 :分析半夏Pinelliaternata(Thunb .)Breit.及其伪品虎掌南星PinelliapedatisectaSchott的核基因组序列 ,为半夏正品基原鉴别提供分子依据。方法 :采用PCR直接测序技术测定半夏及其伪品的18SrRNA基因核苷酸离列并作序列变异和选择性内切酶谱 (PCR SR )分析。结果 :半夏和伪品的 18SrRNA序列长度均为 180 5bp ,根据排序比较 ,半夏原植物与商品药材间的序列完全相同 ,虎掌南星亦如此。而半夏与其伪品虎掌南星间则存在序列差异 (有 4个变异位点 )。在半夏 18SrRNA序列中有一个限制性内切酶AseⅠ识别位点 ,通过PCR SR图谱显示 80 0bp和 90 0bp2个酶切片断 ,而虎掌南星则无此位点 ,PCR SR图谱显示 1个未消化的 180 0bp片断。 结论 :通过核基因组序列和PCR SR图谱差异 ,DNA测序技术可成为半夏正品基原鉴别准确而有效的分子方法     

t-PA基因慢病毒表达载体的构建及其在内皮祖细胞中的表达研究

目的:构建t-PA基因慢病毒表达载体并转染脐血来源的内皮祖细胞,评估其转染后功能变化情况。方法:RT-PCR获得t-PA cDNA,将真核表达质粒pcDNA3.1(+)和t-PA基因片段分别双酶切,构建pc DNA3.1(+)/t-PA质粒。对其进行酶切鉴定和测序,使目的基因连接入载体质粒中,构建成重组慢病毒载体质粒,制备包装病毒质粒转染内皮祖细胞。倒置荧光显微镜下观察转染24h后内皮祖细胞中绿色荧光蛋白的表达情况,RT-qPCR和Western blot检测转染后t-PA基因的表达水平。采用Brdu标记细胞DNA、BCA蛋白定量、MTT分析法检测内皮祖细胞DNA合成能力、总蛋白含量和细胞存活率。结果:成功构建了含有t-PA基因cDNA序列的慢病毒表达载体p Lenti6.3-t-PA,DNA测序结果完全正确,倒置荧光显微镜下可见绿色荧光蛋白表达,内皮祖细胞转染重组慢病毒后t-PA表达水平比未转染组显著增高(P0.01)。t-PA慢病毒表达载体转染内皮祖细胞后,内皮祖细胞DNA合成能力、细胞总蛋白含量、细胞存活率均较对照组无明显变化。结论:成功构建t-PA基因慢病毒表达系统,转染内皮祖细胞后对其DNA合成、总蛋白合成、细胞存活率无明显影响。     

脂联素调控序列荧光素酶报告基因荧光素酶活性的分析

目的:通过将1 100 bp长度的人脂联素(adiponectin,AD)启动子上游的调控基因(包括启动子,-1066 To+4 bp)插入荧光素酶报告基因载体pGL3-Basic中,构建成含启动子调控序列的荧光素酶报告基因(pGL3-Basic-ADI1100),用于脂联素在中国仓鼠卵巢细胞(CHO)中的表达调控研究。方法:利用PCR技术扩增1 100 bp长度AD启动子片段,与PUC19T载体连接,将PUC19T-ADI1100质粒,及荧光素酶报告基因pGL3-Basic质粒转染大肠肝菌(DH5a)后扩增,提取并纯化PUC19T-ADI1100和pGL3-Basic;分别以KpnI,XhoI酶切pGL3-Basic;电泳并回收ADI1100片段和pGL3-Basic酶切大片段,在T4 DNA连接酶的作用下,将ADI1100片段插入荧光素酶报告基因pGL3-Basic中,并转染CHO细胞,检测荧光素酶报告基因活性。结果:通过酶切及基因测序的方法证实所构建质粒含有脂联素启动子上游调控序列;瞬时转染实验显示AD启动子在CHO细胞中的转录表达随时间的变化而升高,转染后48 h的双报告基因活性是pGL3-Basic的30倍。结论:该荧光素酶报告基因构建成功,为后续筛选有抑制肥胖作用的中药提供基础。     

稳定表达SAV细胞的建立及其相互作用蛋白的筛选

目的建立能稳定表达SAV(Salrador Homolog)的人胚胎肾细胞HEK293细胞池并从中纯化出SAV相互作用蛋白复合物。方法从人胚胎肾细胞HEK293中提取RNA,RT-PCR扩增得到SAV基因片断,构建表达质粒pBabe-SBP-FLAG-SAV。将pBabe-SBP-FLAG-SAV质粒和病毒包装质粒共同转染HEK293T细胞来产生病毒,收获病毒后感染HEK293细胞。通过嘌呤霉素筛选直至没有细胞死亡并用Western-blot验证表达情况。用链酶亲和素beads从该稳定细胞池中纯化SAV相互作用蛋白并通过银染检测。结果 pBabe-SBP-FLAG-SAV真核表达载体构建成功,包装病毒感染HEK293后通过Western-blot检测可见SAV蛋白的表达,FLAG beads和链酶亲和素beads免疫沉淀进一步证明了该融合蛋白表达的正确性。链酶亲和素纯化出的SAV相互作用蛋白复合物在银染时可见。结论成功构建了pBabe-SBP-FLAG-SAV真核表达载体及稳定表达细胞池,纯化得到SAV相互作用蛋白复合物。为阐明这些蛋白复合体在Hippo信号通路中的作用提供了可靠信息。     

中药材龟甲细胞色素b基因特异性鉴定研究

 目的 建立一种实用、简便、准确的中药材龟甲DNA分子标记鉴定方法。方法 采用酚-三氯甲烷抽提法和盐析法提取龟甲mtDNA。从GenBank数据库中下载乌龟及常见伪品源动物mtDNA细胞色素b基因序列,经序列比较分析,设计特异性引物,并使用该引物对正品及其伪品mtDNA进行扩增并测序。结果 盐析法提取DNA的浓度高于酚-三氯甲烷抽提法,并且盐析法省时、经济。本实验所设计引物只能扩增正品龟甲mtDNA,测序结果与龟甲同源性100%。结论 盐析法是一套适合从龟甲中提取高质量DNA的方法,本实验所设计的引物具有高度特异性,可用于龟甲类药材的鉴定。     

基于巢式PCR方法联合Sanger测序技术对大黄庶虫丸中水蛭成分真伪的鉴定

目的 基于DNA条形码技术建立一种可以实现对大黄庶虫丸中水蛭成分真伪品鉴定的方法。方法 首先以COⅠ通用引物对大黄庶虫丸中成药DNA进行一轮聚合酶链式反应(PCR)扩增,随后采用自行设计和筛选出的水蛭通用引物对一轮PCR反应液进行二轮PCR扩增,联合Sanger测序技术,对二轮PCR扩增产物测序,最后对测序结果峰图采用seqman软件进行序列拼接,将拼接后的DNA序列在NCBI数据库中用BLAST在线比对软件进行比对判定,进而鉴定水蛭成分真伪。结果 本实验建立的巢氏PCR方法联合Sanger测序技术通过了对9份经COⅠ通用引物鉴定的水蛭干药材的验证,结果验证两方法鉴定结果一致。同时采用本研究建立的巢氏PCR方法联合Sanger测序技术对收集的14批大黄庶虫丸进行鉴定,共有5批鉴定出含有伪品水蛭成分。结论 本实验建立的的巢氏PCR方法联合Sanger测序技术能够实现对大黄庶虫丸中水蛭成分真伪品的鉴定,对中成药的质量控制具有一定的意义。     

大蒜鳞茎蒜氨酸酶基因克隆及其在毕赤酵母中的表达

目的从大蒜鳞茎中克隆蒜氨酸酶基因,构建蒜氨酸酶真核表达载体,并在毕赤酵母系统中表达,进一步探讨重组蒜氨酸酶的生物学活性。方法利用RT-PCR方法克隆大蒜鳞茎蒜氨酸酶基因,通过pPIczαC载体构建pPIczαC-蒜氨酸酶真核表达质粒,电转化法导入毕赤酵母X-33,筛选阳性克隆,经甲醇诱导后取表达上清进行SDS-PAGE和Western blotting分析。利用丙酮酸法检测重组蒜氨酸酶和提取的天然蒜氨酸酶的活性,Lowry法测2种蒜氨酸酶蛋白质量,通过比活力比较2种酶活性大小。结果从大蒜内克隆出蒜氨酸酶基因,大小为1 500 bp,重组蒜氨酸酶相对分子质量约为5.5×104,存在于毕赤酵母表达上清液中。重组蒜氨酸酶比活力为(82.09±3.89)U/mg,天然蒜氨酸酶比活力为(176.49±5.06)U/mg。结论蒜氨酸酶基因可以在毕赤酵母表达系统中获得表达,重组蒜氨酸酶具有酶活性,但是其活性低于提取的天然蒜氨酸酶。     

BCSG1基因RNAi表达载体的构建与鉴定

目的:构建乳腺癌特异性基因(BCSG1)RNAi重组质粒,并检测其在三阴乳腺癌细胞株MDA-MB-321中对BCSG1基因表达的干扰效果和对细胞增殖的影响。方法:将两组干扰片段BCSG1-R1、BCSG1-R2及阴性对照片段BCSG1-C分别克隆入pGenesil-1穿梭质粒,经酶切鉴定及测序后,将测序正确的克隆转染入大肠杆菌DH5α中进行扩增Real-time PCR检测重组质粒转染MDA-MB-321细胞后,各组细胞内BCSG1-mRNA表达水平,Transwell细胞侵袭实验检测重组质粒对MDA-MB-321细胞侵袭能力的影响。结果:成功将干扰片段和阴性对照片段克隆入pGenesil-1质粒,构建出pGenesil-1-BCSG1-R1、pGenesil-1-BCSG1-R2和pGenesil-1-BCSG1-C重组质粒。与对照组相比,BCSG1-R1和BCSG1-R2组的BCSG1-mRNA表达水平明显下调(P0.05);干扰后,MDA-MB-321细胞侵袭能力明显下降(P0.05)。结论:成功构建BCSG1-RNAi重组质粒,可有效下调三阴乳腺癌细胞株MDA-MB-321内BCSG1的表达及细胞的侵袭能力。     

稳定表达人有机阳离子转运体1的细胞模型构建

 目的 建立能稳定表达人有机阳离子转运体1（human organic cation transporter1, hOCT1）野生型及两个突变体的马丁达比狗肾上皮（Madin-Darby canine kidney, MDCK）细胞模型。方法 从人肝组织中提取hOCT1野生型基因,经定点突变获得hOCT1_P341L,hOCT1_M420del两个突变型基因,构建表达质粒pcDNA3.1(+)-hOCT1,pcDNA3.1(+)-hOCT1_P341L,pcDNA3.1(+)-hOCT1_M420del。将质粒转染MDCK细胞,通过G418筛选获得抗性克隆,并通过hOCT1的荧光底物(4-二甲氨基苯乙烯基)-N-甲基吡啶 (ASP+)筛选得到具有较高活性的MDCK-hOCT1细胞。经反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)及经典底物N-甲基-4-苯基吡啶(MPP+)的摄取实验,鉴定筛选得到的单克隆细胞株hOCT1 mRNA的表达及功能。结果 本实验获得的hOCT1野生型及2个突变体细胞模型与转染空载体的MDCK细胞相比,其 hOCT1 mRNA表达量显著增高,对经典底物MPP+的摄取为转染空载体细胞的12.5,13.7,12.0倍,hOCT1抑制剂可显著抑制细胞对MPP+的摄取。结论 建立的细胞模型可用于hOCT1抑制剂及底物的筛选。     

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??OBJECTIVE To clone target gene by RT-PCR method, construct VEGF₁₆₅ lentivirus vectors, transfect adipose tissue derived stem cells (ADSCs) and verify the expression of VEGF₁₆₅ in vitro and in vivo. METHODS RT-PCR technology was employed to clone VEGF₁₆₅ gene, and this gene was cloned to lentivirus vector pLVX-EF1??-IRES2-AcGFP1 to construct a lentiviral vector pLVX-EF1??-VEGF₁₆₅-IRES2-AcGFP1. Bacterial colonies PCR and sequencing analysis were used for identification. Then, Lenti-X 293T cells were transfected with main vector pLVX-EF1??-VEGF₁₆₅-IRES2-AcGFP1, packaging plasmid gag-pro, vpr-pol, Tet-Off^TM, tat-IRES-rev and coating plasmid env(VSV-G). Lentiviral vectors were packaged and the titer was determined. ADSCs were isolated by collagenase digestion method, then cultured, and identificated by morphology, immunofluorescence and multi-directional differentiation. ADSCs was transfected with packaged VEGF₁₆₅ lentivirus. Immunofluorescence and ELISA were used to detect the expression of VEGF₁₆₅ in vitro. ADSCs transfected with VEGF₁₆₅ lentivirus were injected into nude mice. ELISA was used to detect the expression of VEGF₁₆₅. RESULTS The VEGF₁₆₅ gene fragment was cloned successfully, and the lentiviral vector plasmid pLVX-EF1??-HVEGF₁₆₅-IRES2-AcGFP1 was confirmed to contain VEGF₁₆₅ gene fragment as shown by bacterial colonies PCR. DNA sequencing analysis confirmed that VEGF₁₆₅ gene sequencing was exactly the same with that reported by Genbank. After transfection, a large number of Lenti-X 293T cells with green fluorescence were observed by fluorescent microscopy. The concentration of the virus titer was 1??10⁸ TU??mL^-1. ADSCs were identified by morphology, immunofluorescence and multi-directional differentiation methods, in line with the literature reported ADSCs characteristics. There were about 90% of ADSCs which could express VEGF₁₆₅ after being transfected with the viruses by immunofluorescence detection, also, VEGF₁₆₅ protein was proved by ELISA to express stably and efficiently in vitro and in vivo. CONCLUSION Lentiviral vectors expressing VEGF₁₆₅ are successfully constructed by cloning target gene with RT-PCR method. After transfection, ADSCs expressing VEGF165 protein stably in vitro and in vivo can be obtained.