GHR基因单核苷酸多态性与广西肝癌家系遗传易感性的研究

目的 探讨生长激素受体（growth hormone receptor,GHR）基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与广西扶绥县肝癌家系遗传易感性的关系。方法 选取广西扶绥县25个肝癌家系和17个健康对照家系人群为研究对象,其中肝癌家系肝癌患者25例（肝癌家系肝癌组）、非肝癌者81名（肝癌家系非肝癌组）;健康对照家系80名（对照组）。采用飞行时间质谱技术检测GHR基因rs6451620位点基因型及等位基因分布频率,非条件logistic回归模型分析rs6451620位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 GHR基因rs6451620位点存在G和A两种等位基因,AA、GA、GG 3种基因型。GHR基因rs6451620位点基因型频率符合遗传平衡。GHR基因rs6451620位点等位基因G和A在肝癌家系肝癌组中的分布频率分别为64%和36%,肝癌家系非肝癌组为60.5%和39.5%,对照组为70.6%和29.4%。以肝癌家系肝癌组和非肝癌组人群为研究对象时,携带A等位基因型的个体发生肝癌的风险是G等位基因型个体的0.81倍（95%CI：0.27～2.41,P=0.699）,以肝癌家系肝癌组和健康对照人群为研究对象时,携带A等位基因型个体发生肝癌的风险是G等位基因型个体的1.49倍（95%CI：0.73～3.04,P=0.274）。结论 GHR基因rs6451620位点单核苷酸多态性与广西肝癌家系遗传易感性无明显相关性。     

广西扶绥县壮族肝癌家系人群Itgb1基因多态性与肝癌遗传易感性的研究

目的 研究广西扶绥县壮族肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC,以下简称肝癌)高发家系人群Itgb1基因rs2298141位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和肝癌遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,选择扶绥县20个肝癌高发家系共79例(肝癌高发家系组)和10个正常对照家系共40名(正常对照家系组)为研究对象,应用时间飞行质谱技术(MALDI-TOF MS)检测两组Itgb1基因rs2298141位点的基因型及等位基因频率,并应用非条件logistic回归分析该位点基因多态性与肝癌遗传易感性的关系.结果 正常对照家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为40.00％、47.50％、12.50％.肝癌高发家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为50.00％、40.00％、10.00％;两组Itgb1基因rs2298141位点各基因型频率与期望值吻合度较好(P＞0.05),符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律.正常对照家系组人群中AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险分别是AA基因型个体的0.67倍(95％CI:0.22～2.1,P=0.50)和1.05倍(95％CI:0.17～6.6,P=0.96);肝癌高发家系组人群中未患肝癌者AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险分别是AA基因型个体的0.91倍(95％CI:0.31～2.71,P=0.86)和2.2倍(95％CI:0.40～11.96,P=0.37),但差异无统计学意义(P＞0.05).结论 广西扶绥县壮族人群中Itgb1基因rs2298141位点的SNP与罹患肝癌无明显相关性.     

广西扶绥县壮族人群ITGβ1基因多态性与肝癌家系遗传易感性的关系

目的 探讨广西扶绥县壮族人群中肝癌高发家系ITGβ1基因rs2298141位点多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,选取广西扶绥县壮族人群正常对照家系组40名;肝癌高发家系组79例,其中肝癌患者20例,直系亲属59例.采用质谱方法检测ITGβ1基因rs2298141位点基因型分布频率,非条件logistic回归分析不同基因型与HCC发病风险的关系.结果 ITGβ1基因rs2298141位点存在AA、AG、GG 3种基因型.ITGβ1基因rs2298141位点基因型分布遵循Hardy-Weinberg遗传平衡定律.ITGβ1基因rs2298141位点A等位基因在正常对照组、肝癌高发家系直系亲属组、肝癌高发家系肝癌患者组中的分布频率分别为63.75％、61.02％、70％,G等位基因分布频率分别36.25％、38.98％和30％,与A等位基因型个体比较,正常对照家系人群中携带G等位基因型的个体发生HCC的风险增加0.75倍(95％ CI:0.33～1.7,P=0.50),肝癌高发家系直系亲属组人群发生HCC的风险增加0.67倍(95％CI:0.31～1.45,P=0.31).正常对照家系组、肝癌高发家系直系亲属组和肝癌高发家系肝癌患者组人群AA基因型分布频率分别为40％、42.73％和50％,AG基因型分别为47.5％、37.29％和40％,GG基因型分别为12.5％、20.34％和10％.与AA基因型个体相比,正常家系组和肝癌高发家系直系亲属组中AG基因型个体发生HCC的风险分别增加0.67倍(95％ CI:0.22～2.1,P=0.50)和0.9倍(95％ CI:0.31～2.71,P=0.86);GG基因型个体发生HCC的风险分别增加1.05倍(95％ CI:0.17～6.6,P=0.96)和2.2倍(95％ CI:0.40～11.96,P=0.37),差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 未发现ITGβ1基因rs2298141位点多态性与广西扶绥县肝癌家族聚集的遗传易感性存在显著相关.     

广西扶绥县壮族人群 ESR1 基因SNP与肝癌家系遗传易感性的关系

目的：探讨广西壮族自治区扶绥县肝癌高发地区壮族人群雌激素受体1基因（estrogen receptor1 gene, ESR1）单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与肝癌遗传易感性的关系。方法： 采用病例-对照研究和限制性片段长度聚合酶链反应（PCR-RFLP）方法,对扶绥县21个肝癌高发家系组共85例及同居住地10个正常对照家系组共39例进行 ESR1 基因型分布频率的检测;运用非条件Logistic回归分析基因多态性与肝癌发生危险性的关系,并将实验结果结合临床资料进行统计学分析。 结果： （1）经 ESR1 基因型检测分型,正常对照家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为74.36%、17.95%和7.69%;肝癌高发家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为83.53%、11.76%和4.71%;（2）基因型在两组人群中的分布符合 Hardy-Weinberg平衡定律;（3）正常对照家系组人群中AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险率分别是AA基因型个体的0.218（95% CI =0.025~1917, P =0.170）和0.509（95% CI =0.049~5.260, P =0.571）,肝癌高发家系组人群中非肝癌者AG、GG基因型的个体罹患肝癌的风险率分别是AA基因型个体的0.298（95% CI =0.035~2.515, P =0.233）和0.671（95% CI =0.070~6.391, P =0729）,差异均无统计学意义。 结论： 广西扶绥县壮族人群中, ESR1 基因rs3798757位点SNP多态性与罹患肝癌无关。     

广西扶绥县壮族人群 ATF 5 基因多态性与肝癌家系遗传易感性的关系

目的:探讨广西扶绥县壮族人群ATF5基因rs283526和rs8647位点多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系.方法:采用病例-对照研究方法,选择广西扶绥县壮族人群HCC家系79例(观察组)、正常对照家系40例(对照组),运用质谱方法检测ATF5基因rs283526和rs8647位点基因型分布频率;应用非条件Logistic回归分析不同基因型与HCC发病风险的相关性.结果:对照组人群ATF5基因rs283526位点CT、TT基因型个体发生HCC的风险分别是CC基因型个体的0.181倍(95％ CI =0.440-0.736,P＜0.05)和0.348倍(95％ CI=0.151-0.804,P＜0.01)、rs283526位点携带T等位基因型的个体发生HCC的风险是C等位基因型个体的0.405倍(95％CI=0.226-0.726,P＜0.01).ATF5基因rs8647对照组人群GA、AA基因型个体发生HCC的风险分别是GG基因型个体的1.022倍和1.949倍,其携带A等位基因型的个体发生HCC的风险是G等位基因型个体的0.952倍,但差异均无统计学意义(P＞0.05).结论:广西扶绥县HCC家系ATF5基因rs283526多态性与肝癌遗传易感性有相关性,其等位基因T是HCC的保护因素.     

广西扶绥县肝癌家系XRCC1基因Arg399Gln多态性与肝细胞癌的遗传易感性

目的研究广西扶绥县肝癌家系人群DNA修复基因XRCC1Arg399Gln多态性与肝细胞癌（HCC）遗传易感性的相关性。方法采用病例-对照研究方法,对扶绥县21个肝癌家系人群和10个正常家系人群,运用PCR-RFLP方法分析XRCC1基因Arg399Gln位点多态性,并应用Logistic回归模型分析该位点多态性与肝细胞癌遗传易感性的关系。结果通过XRCC1Arg399Gln基因型检测分型,肝癌家系人群携带变异等位基因Gln的频率为23.68%,正常家系人群为13.16%,等位基因在两组间的分布差异无统计学意义（P〉0.05）。基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。正常家系人群中携带Arg/Gln者发生HCC的风险是携带Arg/Arg者的1.622倍（95%CI=0.475～5.541,P=0.440）。肝癌家系人群中除肝癌患者外,携带Arg/Gln、Gln/Gln者发生HCC的风险分别是携带Arg/Arg者的1.198倍（95%CI=0.362～3.968）和2.964倍（95%CI=0.434～20.220,P分别为0.768、0.267）。结论广西扶绥县肝癌家系人群中,XRCC1399Arg/Gln基因型和Gln/Gln基因型者患HCC的风险较Arg/Arg基因型者有增加的趋势,但不存在显著相关性。     

DNA修复基因RAD52 miRNA靶序列单核苷酸多态性与肝细胞癌遗传易感性研究

目的 探讨DNA修复基因RAD52 3'非翻译区（3'- untranslated region,3'-UTR）miRNA靶序列单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与广西地区人群肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）遗传易感性的关系。方法 采用病例- 对照研究,对1 002例确诊的HCC新发病例和1 013例非肿瘤患者RAD52基因3'-UTR区域miRNA靶序列SNPs （rs1051669、rs1051672、rs7301931和rs7310449）进行基因分型,并分析其基因型频率分布及其与HCC遗传易感性的关系。结果 RAD52基因各SNP基因型在病例组和对照组中的分布频率差异均无统计学意义（P>0.05）。调整年龄、性别、吸烟、饮酒和HBV感染等因素后,未发现各SNP与HCC易感性有关联;分层分析发现,在女性人群中,与携带rs1051669 C等位基因相比,TT基因型可显著降低个体罹患HCC的风险（TT vs CT/CC：OR=0.03,95%CI：0.00~0.62,P=0.03）;与携带rs1051672 G等位基因相比,AA基因型可显著降低个体罹患HCC的风险（AA vs GA/GG：OR=0.03,95%CI：0.01~0.88,P=0.04）。结论 RAD52基因3'- UTR区域miRNA靶序列SNPs rs1051669、rs1051672位点可能与广西地区女性人群HCC易感性有关。     

IL-17基因多态性与胃癌易感性的关系

目的 探讨白介素-17（Interleukin-17,IL-17）基因rs2275913、rs763780多态性与胃癌易感性的关系。方法 收集青岛地区355例汉族胃癌患者为胃癌组,同期进行健康体检的300名正常者为对照组,采集两组患者外周血,提取全血基因组DNA,PCR扩增目的基因片段,采用DNA直接测序法检测IL-17基因rs2275913、rs763780位点基因型,分析其位点多态性与胃癌易感性的关系。结果 胃癌组与对照组IL-17基因 rs2275913位点基因型分布差异有统计学意义（χ²=17.192,P＜0.001）。与GG基因型相比,携带AA基因型的个体胃癌发病风险增加,差异有统计学意义（χ²=16.829,P＜0.05;OR=2.891,95%CI=1.721~4.857）;携带GA基因型的个体胃癌发病风险增加,但差异无统计学意义（χ²=0.878,P＞0.05）。胃癌组与对照组相比,IL-17基因 rs763780位点基因型分布差异无统计学意义（χ²=1.381,P=0.501）。结论 IL-17基因 rs2275913 A等位基因的携带会增加青岛地区汉族人群胃癌发病风险,IL-17基因 rs763780位点多态性与胃癌发病风险无明显相关性。     

广西扶绥县壮族人群 XRCC1 Arg399Gln（rs25487）和Arg280His（rs25489）多态性与肝癌家系遗传易感性的关系

目的:研究广西壮族自治区扶绥县壮族人群肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)家系DNA修复基因XRCC1Arg399Gln(rs25487)和Arg280His(rs25489)多态性与HCC家系遗传易感性的相关性。方法:采用病例-对照研究和质谱检测方法,对广西扶绥县壮族人群20个HCC家系组79例和10个正常对照家系组40例进行XRCC1基因Arg399Gln(rs25487)和Arg280His(rs25489)基因型分布频率检测,应用非条件Logistic回归分析基因多态性与HCC发生危险性的关系,并将实验结果结合临床资料进行统计学分析。结果:正常对照家系组人群XRCC1 Arg399Gln(rs25487)中AG、AA基因型个体发生HCC的风险分别是GG基因型个体的9倍(95%CI=0.828~97.780,P=0.071)和5.14倍(95%CI=0.445~59.450,P=0.190);HCC家系组人群中非HCC患者AG、AA基因型的个体发生HCC的风险分别是GG基因型个体的4倍(95%CI=0.689~23.230,P=0.122)和2.85倍(95%CI=0.464~17.583,P=0.257),差异均无统计学意义。Arg280His(rs25489)正常家系组人群中GA基因型个体发生HCC的风险分别是GG基因型个体的2.4倍(95%CI=0.530~10.877,P=0.256);HCC家系组人群中非HCC患者GA基因型的个体发生HCC的风险分别是GG基因型个体的1.02倍(95%CI=0.286~3.650,P=0.973),差异均无统计学意义。结论:广西扶绥壮族人群中XRCC1 Arg399Gln(rs25487)和Arg280His(rs25489)多态性与患HCC的风险无显著相关性。     

Rac 1基因rs 6951997位点多态性与广西扶绥县壮族肝癌家族聚集的遗传易感性关系

目的探讨广西扶绥县壮族Rac 1基因rs 6951997位点多态性与肝癌家族聚集的遗传易感性关系。方法以广西扶绥县壮族20个肝癌高发家族(肝癌家族组79例)和10个健康对照家族(健康对照家族组40名)为研究对象,应用飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)检测两组中Rac 1基因rs 6951997位点的基因型及等位基因频率,以非条件logistic回归分析其多态基因型与肝癌发生危险性的关系。结果肝癌家族组Rac 1基因rs 6951997位点的GT基因型的分布频率(6.30%)高于健康对照家族组(2.50%),二者差异无统计学意义(OR=3.76,95%CI∶0.28~51.45,P=0.32)。其位点等位基因T型、G型在肝癌家族组中的分布频率分别为96.83%、3.16%,在健康对照家族组中的分布频率分别为98.75%、1.25%,两组差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论 Rac 1基因rs 6951997位点多态性与广西扶绥县壮族肝癌家族聚集的遗传易感性未有显著相关。     

PLXNC1 多态性与广西肝癌遗传易感的关系及其表达*

目的:探讨PLXNC1 基因多态性与广西肝癌遗传易感性关系及表达。方法:以广西20个肝癌高发家族（肝癌家族组79例）和10个健康对照家族（健康对照组40例）为研究对象,应用飞行时间质谱技术检测两组中PLXNC1 基因rs 2272335 的基因型及等位基因频率,免疫组织化学染色检测PLXNC1 在不同肝组织中的表达。结果:PLXNC1 基因rs 2272335 位点健康对照组人群中携带C 等位基因型的个体发生干细胞肝癌（hepatocellularcarcinoma ,HCC ）的风险分别是T 等位基因型个体的4.16倍（95%CI 为0.37～47.3）,差异有统计学意义（P = 0.032）。核心成员组与 肝癌患者组两组间差异无统计学意义（P > 0.05）。PLXNC1 基因rs 2272335 位点基因型TT、TC、CC在肝癌患者组人群、核心成员组人群、健康对照组人群三组间者差异无统计学意义（P > 0.05）。 肝癌组织中,PLXNC1 蛋白表达水平3.12± 1.12显著高于肝癌癌旁组织1.54± 0.67和正常肝组织1.23± 0.87（P < 0.05）。结论:PLXNC1 基因rs 2272335 位点C 等位基因型可能是广西HCC 发生的危险因素。PLXNC1 过度表达与肝癌发生密切相关。      

TNF-a基因多态性与广西肝癌家族聚集性的相关性研究

目的研究肿瘤坏死因子基因TNF—a-308、TNF-a-238与广西肝癌家族聚集性的关系。方法在广西肝癌高发区选取12个肝癌高发家族（124例）及与之相对应的12个非肿瘤对照家族（129例）为研究对象,采用SNP芯片技术检测两组中TNF—a-308、TNF—a-238的基因型及等位基因频率。结果肝癌高发家族组TNF-a-308G／A基因型分布频率高于对照家族组,差异有统计学意义（22．6％ vs 11．6％,x2=5．376,P=0．020）;肝癌高发家族组TNF-a-308A等位基因分布频率亦高于对照家族组,差异有统计学意义（11.3％VS5．8％,x2=4．877,P=0．024）。两组TNF-a-238基因型频率及等位基因频率差异均无统计学意义（P〉0．05）。结论TNF—a-308基因多态性可能与广西肝癌家族聚集性相关,携带TNF-a-308A等位基因可能会增加肝癌高发家族成员患肝癌的风险;TNF—a-238基因多态性与广西肝癌家族聚集无统计学关联。     

Positive Association Between miR-499A>G and HepatocellularCarcinoma Risk in a Chinese Population

A case-control study of the association of miR-499A>G rs3746444 with risk of hepatocellular carcinoma(HCC)was conducted. Patients with HCC and healthy control subjects were recruited for genotyping of miR-499A>G using duplex polymerase-chain-reaction with confronting-two-pair primer(PCR-RFLP) analysis. TheMiR-499 GG genotype was associated with a decreased risk of HCC as compared with the miR-499 AA genotype(adjusted OR=0.74, 95%CI=0.24-0.96). Similarly, the GG genotype showed a 0.45-fold decreased HCC risk in arecessive model. The MiR-499 G allele was significantly associated with decreased risk of HCC among patientsinfected with HBV in a dominant model (OR=0.09, 95%CI= 0.02-0.29). In conclusion, the MiR-499A>G rs3746444polymorphism is associated with HCC risk in the Chinese population, and may be useful predictive marker forCAD susceptibility.     

Association of MicroRNA 196a and 499 Polymorphisms with Development of Cirrhosis and Hepatocellular Carcinoma Post-HCV Infection in Egyptian Patients

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the commonest primary tumor of the liver. Chronic HCV infection is the leading cause of end-stage liver disease, HCC and liver-related death in Egypt. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in microRNAs were reported to increase susceptibility to tumorigenesis; affect prognosis and as promising biomarkers in virus-host interactions. This study was conducted to investigate the role of genetic variants of miR-196a2 (rs 11614913) C>T and miR-499 (rs 3746444) A>G in the development of cirrhosis and HCC in Egyptian HCV infected patients. Genotyping of the candidate SNPs was performed by Real Time PCR in 75 HCV-related HCC patients, 75 cirrhotic patients on top of HCV and 75 healthy controls. There was significant difference in miR-499 (rs3746444) genotypes frequency between the three studied groups as the GG genotype was significantly lower in HCC cases than other groups (P = 0.009) while the combined miR-499 (AA+AG) genotypes were significantly higher in HCC cases than other groups (P = 0.005). Also a significant difference was found in miR-499 genotypes frequency when compared between HCC and cirrhosis groups as the GG genotype was significantly lower in HCC cases than cirrhosis group (P = 0.006) while the combined miR-499 (AA+AG) genotypes were significantly higher in HCC cases than in cirrhosis group (P = 0.003) [OR (95% CI) = 0.131 (0.028-0.601)]. The frequency of the G allele was significantly lower in HCC than other groups (P = 0.024) and significantly lower in HCC than normal group (P = 0.006) [OR (95%CI) = 0.501 (0.304-0.825)]. For miR-196a2 (rs11614913) C>T polymorphisms, no significant association was found with HCC risk. Our study concluded that the G allele of miR-499 is associated with lower risk of HCV related HCC development. No significant association of miR-196a2 (rs 11614913), genotypes or alleles with risk for HCC development, could be detected.     

BRCA1基因miRNA结合位点多态性与肝细胞癌术后总生存期的关联研究

目的 探讨BRCA1基因microRNA（miRNA）结合位点上的单核苷酸多态性对肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）患者术后总生存期（overall survival,OS）的影响。方法 纳入2004年6月—2013年12月于广西医科大学附属肿瘤医院接受根治术切除的363例HCC患者为研究对象,采用Cox比例风险模型、Kaplan-Meier法分析BRCA1基因miRNA结合位点多态性与HCC患者术后OS的关系。结果 BRCA1 3'-UTR miRNA结合位点上的rs8176318（C>A）与HCC患者术后OS显著相关。在隐性模型下校正乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）感染、BCLC分期、肿瘤直径、癌栓等因素后,Cox比例风险回归分析结果显示,与携带rs8176318 CC/CA基因型的HCC患者相比,携带AA基因型患者的死亡风险显著降低（HR=0.675,95%CI：0.494~0.922,P=0.014）。Kaplan-Meier分析结果显示,携带AA基因型的HCC患者比携带CC/CA基因型患者中位OS明显延长（46.1个月 vs 33.8个月,P=0.049）。利用GTEx数据库进行表达数量性状基因座分析,发现在肝脏组织中rs8176318 A等位基因与BRCA1 mRNA较低的表达水平相关（P<0.001）。结论 BRCA1 rs8176318可能影响HCC患者术后的生存结局,A等位基因与患者术后较低死亡风险有关,这一结果需要更大样本量的多中心研究验证。     

Fas／FasL基因多态性与肝细胞癌易感性的关系

目的 探讨凋亡相关基因Fas及其配体FasL单核苷酸多态性（SNPs）与肝细胞癌（HCC）易感性的关系。方法 收集本院2013年1月至2016年12月经病理确诊的126例HCC患者的外周血标本,在Sequenom MassARRAY系统上利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法（MALDI-TOFMS）进行Fas多态性位点 rs1571013、rs1800682及rs1468063和FasL多态性位点rs6700734、rs763110的基因分型,选取130例健康体检者的外周血作对比,采用Hardy-Weinberg平衡分析以上5个SNPs位点的遗传平衡情况,比较HCC患者与健康对照rs1571013、rs1800682、rs1468063、rs6700734和rs763110基因型和等位基因的分布差异并计算比值比（OR）及其95%置信区间（95%CI）来评价以上SNPs与HCC易感性的关系。结果126例HCC患者及130例健康体检者的Fas多态性位点 rs1571013、rs1800682及rs1468063和FasL多态性位点rs6700734及rs763110基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡。HCC组与对照组rs1468063、rs6700734和rs763110基因型分布的差异无统计学意义（P＞0.05）,且与HCC易感性无关;rs1571013分布上,HCC组A／A基因型及等位基因A的比例均高于对照组（P<0.05）,其中以G／G基因型为参照,A／A基因型发生HCC的风险升高至2.492倍（P<0.05）,而A／G、A／G+A／A发生HCC的风险未改变（P＞0.05）,以G等位基因为参照,A发HCC的风险升高至1.549倍（P<0.05）。rs1800682分布上,HCC组G／G基因型及等位基因G的比例均高于对照组,差异有统计学意义（P<0.05）,以A／A基因型为参照,G／G基因型发生HCC的风险升高至2.880倍（P<0.05）,而A／G、A／G+G／G发生HCC的风险未改变（P＞0.05）;以A等位基因为参照,G发生HCC的风险升高至1.651倍（P<0.05）。 结论 Fas rs1571013、rs1800682与HCC易感性有关,其中携带突变等位基因的HCC发生风险升高,在HCC易感人群筛查中有一定价值。     

DNA修复基因XPD XPC XRCC4基因多态性与结直肠癌易感性的关联性研究

  目的  探讨DNA修复基因XPD rs13181（codon751A/C,Lys751Gln）、rs238406（codon156C/A,Arg156Arg）、XPC rs2279017（i11C/A）和XRCC4 rs3734091（codon247T/C,Ala247Ser）的单核苷酸多态性与结直肠癌易感性的关系。  方法  采用TaqMan技术对2013年4月至2016年1月北京肿瘤医院收治的338例结直肠癌患者（病例组）和315例健康者（对照组）进行多态位点基因型的检测。  结果  XPD rs13181基因型GT和等位基因G增加个体结直肠癌的发病风险（GT>TT,adjusted OR=1.69,95%CI:1.15~2.47,P=0.007;G>T,adjusted OR=1.77,95%CI:1.19~2.64,P=0.005）;XRCC4 rs3734091基因型GT和等位基因T增加个体结直肠癌的易感性（GT>GG,adjusted OR=9.02,95%CI:5.61~14.50,P＜0.001;T>G,adjusted OR=4.06,95%CI:2.49~6.61,P＜0.001）;XPD rs13181和rs238406的单倍体型GT显著降低结直肠癌的发病风险（adjusted OR=0.39,95%CI:0.18~0.85,P=0.018）。XPCrs2279017等位基因G和XRCC4 rs3734091等位基因T的联合效应（adjusted OR=28.43,95%CI:6.85~117.95,P＜0.001）以及XPD rs13181等位基因G和XRCC4 rs3734091等位基因T的联合效应（adjusted OR=10.24,95%CI:4.69~22.35,P＜0.001）显著增加个体结直肠癌的易感性。  结论  XPD rs13181和XRCC4 rs3734091位点的多态性与结直肠癌的易感性相关。      

A nonsynonymous single-nucleotide polymorphism in the PDZ-Rho guanine nucleotide exchange factor (Ser1416Gly) modulates the risk of lung cancer in Mexican Americans

BACKGROUND: Based on in vitro studies, Rho guanine nucleotide exchange factors (RhoGEFs) are key regulators of mitogenic and transforming pathways. At least 1 family member, PDZ-RhoGEF, also integrates signaling between monomeric Rho G proteins and heterotrimeric G proteins through a so-called regulator of G-protein signaling (RGS) domain. Recently, the authors reported that 3 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 2 members of the RGS family were associated with significant reductions in the risk of cancer. METHODS: For the current report, the authors studied the risk of lung cancer associated with a nonsynonymous SNP (rs868188; Ser1416Gly) in PDZ-RhoGEF in a large lung cancer case-control study of 2260 Caucasians and 369 Mexican Americans. RESULTS: Compared with individuals who had the wild-type genotype (AA), Mexican Americans with the variant genotypes (AG and GG) had a significantly reduced risk for lung cancer (odds ratio [OR], 0.57; 95% confidence interval [95%CI], 0.34-0.94). The protective effect appeared to be more evident in younger individuals (OR, 0.42; 95%CI, 0.20-0.91), men (OR, 0.36; 95%CI, 0.18-0.71), and ever smokers (OR, 0.50; 95%CI, 0.29-0.88). A joint effect was observed between Ser1416Gly and polymorphisms in 2 cell-cycle control genes: p53 (intron 3) and cyclin D1 (CCND1). Tallying the variant alleles of the 4 RGS gene SNPs, a gene-dosage effect was apparent. Compared with individuals who had < 3 variant alleles, patients with > or = 3 variant alleles had a 51% reduction in lung cancer risk (OR, 0.49; 95%CI, 0.28-0.88). CONCLUSIONS: To the authors' knowledge, this is the first epidemiological study to link PDZ-RhoGEF polymorphisms with cancer risk. The results suggest that there are interactions between RGS2, RGS6, and PDZ-RhoGEF and validate this family of proteins as key regulators of tumorigenesis.