鄂尔多斯地区汉族人群TLR9基因多态性与肝癌的关系

目的探讨内蒙古鄂尔多斯地区汉族人群TLR9基因单核苷酸多态性(SNP)rs187084与原发性肝癌(HCC)发生的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对当地167例原发性肝癌患者和316例健康对照者的TLR9基因rs187084位点进行基因分型,用非条件性Logistic回归计算比值比(OR)和95%可信区间(95%CI),评估各等位基因和基因型与HCC发病风险的关系。结果 SNP rs187084与该地区人群患原发性肝癌无相关性,但在男性人群中,CC基因型与男性HCC的发生相关,为男性人群HCC发生的危险因素[OR=2.32,95%CI:(2.24~2.70)]。结论 SNP rs187084可能在鄂尔多斯地区汉族男性人群原发性肝癌的发生中发挥一定作用。     

叉形头转录因子O亚型相关基因位点多态性与肝细胞癌关系

目的探讨叉形头转录因子O亚家族（forkhead box-containing protein O subfamily,FOXO）基因多态性与肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）遗传易感性的关系。方法采用以医院为基础的病例对照研究方法,选取1 049例HCC患者作为病例组,1 052例无肿瘤患者作为对照组,对照组按年龄、性别、民族与病例组频数匹配。采用高通量TaqMan MGB实时荧光定量聚合酶链式反应（real-time fluorescent guantitative polymerase chain reaction,RT-PCR）技术对FOXO1的rs17592236位点、FOXO3的rs4946936位点和FOXO4的rs4503258位点进行基因分型。应用Logistic回归模型分析上述位点单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与HCC发病风险的关系,并研究基因多态性与环境因素的交互作用。结果 rs17592236、rs4946936和rs4503258位点基因型在病例组和对照组中分布差异均无统计学意义（均有P〉0.05）。多因素Logistic回归分析发现,rs17592236位点CT/TT基因型可能降低HCC发病风险[P=0.010,OR（95%CI）=0.699（0.526~0.927）]。分层分析结果显示rs17592236位点SNP与HCC发病风险存在统计学关联。交互作用分析显示,rs17592236、rs4946936、rs4503258位点多态性与吸烟、饮酒、HBV感染、肝癌家族史4种环境因素均存在交互作用,rs17592236与rs4503258位点SNPs之间存在基因-基因交互作用[P=0.003,OR（95%CI）=0.755（0.628~0.908）]。结论携带FOXO1的rs17592236位点突变等位基因T可能降低HCC发病风险。rs17592236、rs4946936、rs4503258与环境危险因素的交互作用可能与HCC发生有关。     

细胞周期信号通路相关基因单核苷酸多态性与肝细胞癌临床病理特征关系

目的探讨细胞周期信号通路相关基因CDC25C、CDKN2A(p16)、MCM4、MCM7、PARDC(DNA-PK)、RAD21、RBL2(p107)、YWHAB(14-3-3)、SMAD3、KAT2B、CHEK1单核苷酸多态性(SNP)与肝细胞癌(HCC)临床病理特征的关系,为HCC的预后预测提供科学依据。方法于2007年7月—2011年3月整群抽取在广西医科大学第一附属医院肝胆外科就诊和治疗的498例新发HCC患者进行相关流行病学调查和临床病理资料的收集,并采集其空腹静脉血提取血液样本DNA,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱方法对14个细胞周期信号通路相关基因SNP位点进行基因分型。结果在校正了年龄、性别、民族、HCC家族史、HBs Ag、吸烟和饮酒情况后,多因素非条件logistic回归分析结果显示,携带YWHAB基因rs2425675位点等位基因A基因型AG/AA患者的包膜侵犯风险为基因型GG患者的2.097倍(OR=2.097,95%CI=1.034~4.256);携带RBL2基因rs3929位点等位基因C基因型GC/CC患者的包膜侵犯风险为基因型GG患者的2.234倍(OR=2.234,95%CI=1.100~4.534);携带CDC25C基因rs3734166位点等位基因G基因型GA/GG患者的子灶发生风险为基因型AA患者的0.460倍(OR=0.460,95%CI=0.259~0.816),癌栓发生风险为基因型AA患者的0.651倍(OR=0.651,95%CI=0.439~0.965);携带CHEK1基因rs515255位点等位基因T基因型TC/TT患者的子灶发生风险为基因型CC患者的0.451倍(OR=0.451,95%CI=0.252~0.807),肿瘤数目多发的风险为基因型CC患者的0.655倍(OR=0.655,95%CI=0.442~0.971)。分层分析结果显示,YWHAB基因rs2425675位点在无HCC家族史、不吸烟、不饮酒的患者中,其SNP多态性与肝癌肿瘤包膜侵犯和假包膜的发生存在统计学关联(均P0.05);CDC25C基因rs3734166位点在无HCC家族史、不吸烟、不饮酒、HBs Ag阴性和阳性的患者中,其SNP多态性与子灶、癌栓、脉管侵犯和肝硬化的发生存在统计学关联(均P0.05);CHEK1基因rs515255位点在无HCC家族史、不吸烟、饮酒、不饮酒和HBs Ag阳性的患者中,其SNP多态性与包膜侵犯、子灶的发生和肿瘤数目多发存在统计学关联(均P0.05);RBL2基因rs3929位点在吸烟、不吸烟、饮酒、不饮酒和HBs Ag阴性患者中,其SNP多态性与包膜侵犯和脉管侵犯的发生存在统计学关联(均P0.05)。结论 YWHAB、RBL2、CDC25C和CHEK1基因SNP多态性可能与HCC的临床病理特征相关。     

原发性肝细胞癌与IL-2、IFN-γ基因多态性关系

目的探讨细胞因子IL-2基因-330T/G(rs2069762)位点和IFN-γ基因-1615C/T(rs2069705)、+5171A/G(rs2069727)位点单核苷酸多态性与原发性肝细胞癌(HCC)发生的关系。方法采用医院为基础的病例对照研究方法于2007年6月—2010年7月在广西医科大学第一附属医院和广西肿瘤医院收集784例HCC患者和同期在广西医科大学第一附属医院及广西区医院体检中心1 017名健康对照人群进行环境暴露调查;采用Taq-Man荧光定量PCR技术对上述位点进行分型,应用logistic回归模型分析组间基因-环境和基因-基因的交互作用。结果 IFN-γ的-1615C/T和+5171A/G位点存在连锁不平衡(D’=0.976,r2=0.549,P=2.22-16),单倍型CG在人群中发生频率<0.03,其他3种单倍型CA、TA、TG频率在病例组和对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);IL-2-330T/G和IFN-γ-1615C/T、+5171A/G 3个位点的基因型在HCC患者和健康对照人群中分布差异均无统计学意义(P>0.05);吸烟、饮酒和携带HBV等环境暴露因素与-330T/G位点的突变基因G对HCC的发生有协同作用,交互作用指数S分别为1.38、1.50、1.03;吸烟、饮酒、有肝癌相关家族史和携带HBV等环境暴露因素与-1615C/T、+5171A/G位点的基因多态性在HCC患病风险中存在负交互作用;logistic回归分析结果表明,携带IL-2的-330T/G位点突变基因G并且同时携带IFN-γ的-1615C/T、+5171A/G位点的突变纯合子TT/GG能增加HCC患病风险(OR=1.84,95%CI=1.08～3.83)。结论 IL-2基因-330T/G和IFN-γ基因-1615C/T、+5171A/G位点多态性与环境暴露因素存在交互作用,基因-环境、基因-基因交互作用可能增加HCC发生风险。     

ALDH2和CYP2E1基因多态性及饮酒习惯与肝细胞癌易感性的关系

目的研究乙醛脱氢酶2(ALDH2)和细胞色素P4502E1(CYP2E1)基因多态性与饮酒因素交互作用在广西原发性肝细胞癌发生中的作用。方法对广西壮族自治区300例肝细胞癌和292例正常对照进行流行病学调查研究,并用PCR-RFLP方法检测ALDH2和CYP2E1基因型。结果病例和对照组中ALDH2和CYP2E1变异基因型携带者分别占50.3%、48.0%和32.3%、32.9%(P0.05)。饮酒频度每周≥3次(高频饮酒)且携带变异基因ALDH2和CYP2E1者发生肝癌的危险度分别是饮酒频度每周3次(低频饮酒)且携带野生基因型者的3.334倍(95%CI=1.746～6.406)和1.803倍(95%CI=0.974～3.336),同时携带两变异基因型者患肝癌风险为1.200倍(95%CI=0.730～1.972),且饮酒增加两变异基因型携带者的肝癌发病风险(OR=1.816,95%CI=0.985～3.348)。结论单一ALDH2或CYP2E1基因型与肝细胞癌易感性无关;但高频饮酒且携带变异基因ALDH2或CYP2E1者患肝癌风险增加,且两变异基因型单倍体增加肝癌发病风险。提示乙醇在增加肝癌发病风险的过程中存在基因-环境和基因-基因相互作用。     

miRNA单核苷酸多态性与宫颈癌的相关性研究

目的探讨miR-27a、miR-34a/c和miR-107单核苷酸多态性与宫颈癌的相关性。方法收集104例宫颈癌及186例对照,采用多重PCR技术对miR-27a,miR-34a/c和miR-107单核苷酸多态性进行分析,卡方检验分析各基因型与宫颈癌之间的相关性。结果在病例组和对照组中,miR-27a rs895819 TT、CT和CC基因型的分布为52.9%、44.1%、2.9%和59.8%、33.7%、6.5%,miR-34b/c rs4938723 TT、CT和CC基因型的分布为51.9%、35.6%、12.5%和47.3%、44.1%、8.6%,miR-107 rs2296616 TT、CT和CC基因型的分布为80.8%、19.2%、0%和81.2%、17.7%、1.1%,各位点基因型频数分布差别均无统计学意义(P0.05)。进一步分层分析发现,不同年龄的各基因型分布在对照组和病例组中差异也均无统计学意义(P0.05)。结论 miR-27a rs895819、miR-34b/c rs4938723和miR-107 rs2296616基因多态性可能与宫颈癌发生无关。     

CCND1基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的病例对照研究

目的探讨细胞周期蛋白D1基因(CCND1)rs9344位点多态性与肝细胞癌易感性的关联;方法采用病例对照研究,对经肝内穿刺活检确认的266例原发性肝细胞癌新发病例及经年龄、性别匹配的306例健康对照,应用MALDI-TOF法检测CCND1 rs9344基因多态性,以χ2检验比较CCND1基因型及相关危险因素在病例对照间分布的差异,采用非条件Logistic回归分析基因型与肝癌发病风险的关系。结果 CCND1 rs9344位点存在GG、GA、AA三种基因型,G/A等位基因及各基因型在肝癌组与对照组中分布未见明显差异,但在分层分析中发现,有肝脏疾病史人群中病例组AA基因型携带比例高于对照组,差异有统计学意义,与GG基因型相比,AA基因型伴有肝病史个体罹患肝细胞癌的风险比值比为5.29(OR=5.29,95%CI:1.42-24.49);结论 CCND1 rs9344位点多态性与肝细胞癌易感性无明显相关,AA基因型携带者且有肝脏疾病史对比其他基因型携带者患肝细胞癌的风险较高。     

TCF7L2和KCNQ1基因多态性与2型糖尿病的关联

目的研究TCF7L2和KCNQ1基因多态性与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的关联,并探讨基因-环境之间的交互作用。方法采用以社区为基础的病例对照研究方法,在北京市房山区选取349例T2DM患者和300例对照,采用单碱基延伸方法对研究对象的基因型进行检测,运用广义多因子降维法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR)分析基因-环境交互作用。结果 Logistic回归分析结果显示,TCF7L2基因rs12255372位点GT基因型个体患T2DM的风险是GG基因型个体的2.049倍(OR=2.049,95%CI:1.107~3.792),KCNQ1基因rs2237892位点CC基因型个体患T2DM的风险是TT基因型个体的2.619倍(OR=2.619,95%CI:1.609~4.263),rs2237897位点CC基因型个体患T2DM的风险是TT基因型个体的3.066倍(OR=3.066,95%CI:1.870~5.029),饮酒者患T2DM的风险是不饮酒者的2.749倍(OR=2.749,95%CI:1.753~4.311)。GMDR分析结果显示,饮酒-rs2237892-rs2237897-rs12255372模型的验证样本准确度(0.657 2)和交叉验证一致性(10/10)均最高。结论在本次调查的人群中,TCF7L2、KCNQ1基因多态性与T2DM存在关联,KCNQ1基因rs2237892、rs2237897位点、TCF7L2基因rs12255372位点与饮酒因素对T2DM发病存在交互作用。     

广西肝细胞癌与TGF-β1及IL-12B基因多态性关系

目的 探讨广西地区肝细胞癌遗传易感性与人群转化生长因子β1( TGF-β1)基因和白细胞介素12B(IL-12B)基因单核苷酸多态性关系.方法 采用以医院为基础的病例对照研究,选取广西户籍的新发肝细胞癌患者608例,选取相同户籍地、年龄、性别和民族频数匹配的非肿瘤患者612例作为对照,采用TaqMan MGB实时荧光定量PCR方法检测TGF-β1 rs1800469(-509 C＞T)位点和IL-12B rs3212227(3' UTR+ 1188A＞ C)位点基因单核苷酸多态性,比较不同基因型与肝细胞癌患病风险的关系.结果 对照组IL-12B基因rs3212227位点的C突变等位基因频率为43.5％,病例组为48.9％,差异有统计学意义(P＜0.05);与IL-12B基因rs3212227位点AA基因型相比,携带rs3212227AC杂合子及携带rs3212227 CC突变基因型的个体发生原发性肝细胞癌的风险明显升高(分别校正OR=1.271,95％ CI =0.976～1.655;校正0R=1.515,95％CI=1.092～2.102);IL-12B基因rs3212227位点AC+ CC基因型可增加女性和＜55岁者罹患肝细胞癌的风险(分别校正OR =2.036,95％ CI=1.169 -3.548;校正OR=1.529,95％ CI=1.129 ～2.071);肝细胞癌患病风险与TGF-β1基因rs 1800469位点多态性无明显关联.结论IL-12B基因rs3212227位点与广西地区人群原发性肝细胞肝癌发病风险明显关联.     

脂联素rs266729多态性和肥胖在多囊卵巢综合征中交互作用研究

目的 探讨脂联素rs266729多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)关联性及其与肥胖交互作用.方法 采用多聚酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析2014年2月至2015年8月住院的120例PCOS患者和同期140例体检正常对照者的rs266729基因型.非条件Logistic分析各基因型与发病易感性的关系以及与肥胖的交互作用.结果 携带C(CC/CT)基因个体患病风险较非C基因携带者(TT)风险明显增加1.55倍(OR=1.55,95%CI:1.41~3.71,P=0.00;校正OR=1.61,95%CI:1.51~4.01,P=0.00);非条件Logistic分析表明认携带CC/CT基因型肥胖个体PCOS罹患风险是携带TT基因非肥胖个体的3.88倍(OR=3.88,95%CI:2.72~5.76,P=0.00;RERI=2.51,95%CI:1.22~3.80;AP=0.54,95%CI:0.34~0.74;S=1.56,95%CI:1.12~2.83).结论 脂联素rs266729多态性增加多囊卵巢综合症罹患风险,且与肥胖存在多囊卵巢综合症发病中存在协同效应.     

survivin基因易感性及其单倍型与原发性肝细胞癌关系

目的探讨汉族人群中存活素(survivin)基因rs8073069及rs1042489位点与原发性肝细胞癌(HCC)的相关性,为采取干预措施提供参考依据。方法采用病例对照研究方法对在江苏省海门市10个社区收集的176例汉族HCC病例和随机匹配的196名健康汉族人群进行一般情况问卷调查以及survivin基因rs8073069和rs1042489位点基因分型。结果 rs8073069位点CC、CG、GG基因型和C、G 2个等位基因在HCC病例组的频率分别为8.52%、35.22%、56.25%2、6.14%7、3.86%,在对照组的频率分别为6.12%3、9.80%、54.08%、26.02%7、3.98%,不同遗传模式下rs8073069位点基因型和等位基因分布在HCC病例组与对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);rs1042489位点CC、CT、TT基因型和C、T 2个等位基因在HCC病例组的频率分别为17.61%、55.68%、26.70%、45.45%、54.55%,在对照组的频率频率为13.78%、52.04%、34.18%、39.80%、60.20%,不同遗传模式下rs1042489位点基因型及等位基因在HCC病例组与对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);多因素Logistic回归分析结果表明,在相加遗传模式下,HBsAg+和有乙肝史是HCC的危险因素r,s8073069G-rs1042489T单倍型是HCC的保护因素;不同遗传模式下环境因素与单倍型交互作用分析结果表明,显性、隐性和相加遗传模式均未发现单倍型与环境因素的交互作用(P>0.05)。结论汉族人群survivin基因rs8073069和rs10424892位点多态性与HCC的易感性无关;rs8073069G-rs1042489T单倍型是HCC的保护单倍型。     

人类白细胞抗原DRA基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究

目的 探讨人类白细胞抗原DRA基因（human leukocyte antigen DRA,HLA-DRA）单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与肝细胞癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）易感性的关联。方法 采用以医院为来源的非匹配病例对照研究方法,纳入365例HCC患者作为病例组以及365例非HCC患者作为对照组。利用问卷收集研究对象的一般人口学特征和相关暴露因素资料,并采用TaqMan-MGB探针定量PCR法对rs3135395 G>T、rs3135338 T>C和rs2395178 G>C进行基因型检测。应用非条件logistic回归模型计算SNP位点各基因型与HCC易感性的比值比（odds ratio,OR）及95%可信区间（confidence interval,CI）。结果 携带rs3135338 TC基因型和显性模型（TC+CC）的个体HCC易感性较TT基因型携带者显著降低（OR=0.47,95% CI=0.25~0.91,P=0.024;OR=0.53,95% CI=0.28~0.95,P=0.045）。与rs2395178 GG基因型携带者相比,GC基因型和显性模型（GC+CC）携带者HCC易感性显著降低（OR=0.41,95% CI=0.29~0.57,P<0.001;OR=0.58,95% CI=0.41~0.81,P=0.002）。结论 HLA-DRA基因rs3135338 T>C和rs2395178 G>C与HCC易感性相关,可为揭示免疫相关基因遗传多态性对HCC发生的作用提供一定参考。     

IL-17 and IL-21 polymorphisms in relation to HBV related hepatocellular carcinoma in Chinese Han population

ObjectiveInflammatory cytokine gene polymorphisms may influence the hepatic and extrahepatic HBV-related disease. In this study, we aimed to investigate the relationship between polymorphisms of IL-17, IL-21 gene and HBV related hepatocellular carcinoma in Chinese Han population.MethodsWe performed a multi-center study comprised 866 HBV-related hepatocellular carcinoma (HCC) patients and 1086 unrelated patients with a diagnosis of chronic hepatitis B (CHB) as control to evaluate the effects of IL-17 (rs4711998), IL-21 SNPs (rs12508721, rs13143866 and rs2221903) and the susceptibility of HCC. MassARRAY technology was utilized to genotype. Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to detect the serum IL-17 and IL-21 level. Quantitative real time polymerase chain reaction (qRT-PCR) was used to analyze the serum viral loads.ResultsIn logistic regression analysis, our results showed the frequency of rs4711998 allele G in CHB group was significantly higher than that in HCC group (P = 0.042, 0.859(0.743–0.994)), and it is present only among females. Compared to HCC group, rs13143866 A allele was more likely to appear in HCC group (P = 0.015, 1.268 (1.049–1.532)). The frequency of AA also showed different between HCC group and CHB groups (P = 0.011, 3.135 (1.292–7.603)), which showed strong sex-specific relationships. ELISA showed a higher serum IL-17 and IL-21 expression in HCC patients compared to CHB patients (P all <0.05). Haplotype rs12508721C/rs13143866A/rs2221903T in male HCC group was statistically higher than in male CHB group(P = 0.013) but not in females (P > 0.05).ConclusionWe suggested rs4711998 allele A as risk factors for women to develop HBV related-HCC in Chinese Han population. rs13143866 allele A as risk factors to develop HBV related-HCC in Chinese male population. Male patients with haplotype rs12508721C/rs13143866A/rs2221903T may with 1.3-fold risk for HBV-related HCC.     

U2依赖型mRNA剪接体与肝癌的相关性研究

目的 探讨U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态性与肝癌的风险关联.方法 采用两阶段病例对照研究,筛查阶段采用Openarray中通量分型技术对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因(U2AF1、U2AF2、SRSF1、SRSF2、SF3B1、SF3A1、SF1和PRPF40)的21个潜在功能标签SNP位点在筛查人群(武汉地区378例新发肝癌病例和461例非肿瘤对照)中进行基因分型;对筛查阶段得到的阳性位点进一步在验证人群(北京地区428例新发肝癌病例和647例非肿瘤对照)中采用TaqMan基因分型技术进行验证.采用加法交互模型分析吸烟/饮酒及遗传因素的交互作用.结果 两阶段人群中均观察到SF3A1基因的rs5994293与肝癌发病风险存在显著关联.合并分析显示,以携带TT基因型者为参照,携带G等位基因者的肝癌发病风险降低30%(OR=0.70,95%CI:0.58～0.84,FDR-P=0.000 5);合并阶段在HBsAg阴性者中观察到吸烟合并饮酒和rs5994293 TT基因型之间存在加法交互作用.结论 携带SF3A1 rs5994293 T等位基因可能增加肝癌发生风险,但仍需大样本研究及功能研究的验证.     

超重肥胖儿童的脂代谢异常与INSIG2基因的关联研究

目的 研究儿童超重肥胖和脂代谢与胰岛素诱导基因2(INSIG2)变异的相关性.方法 选择北京市2030名7～18岁的儿童进行身体测量及血脂、INSIG2基因rs13428113多态性检测.结果 研究对象rs13428113多态性的等位基因突变率(T>C)为49.3%.比较体重正常、超重和肥胖组基因型及等位基因频率,发现三组差异无统计学意义(P>0.05).在超重组中CC基因型携带者的体重指数、腰臀比、肱三头肌和髂前上棘皮褶厚度高于TT/TC基因型携带者;在肥胖组中CC携带者总胆固醇水平高于TT/TC携带者(P<0.05).结论 INSIG2基因rs13428113多态性与超重肥胖儿童的脂代谢异常有关,可能加重肥胖、血脂异常程度.     

Correlation Between MTHFR Polymorphisms and Hepatocellular Carcinoma: A Meta-analysis

The correlation between methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) polymorphisms and hepatocellular carcinoma (HCC) remains controversial. Therefore, we performed this study to better assess the relationship between MTHFR polymorphisms and the likelihood of HCC. A systematic research of PubMed, Medline, and Embase was performed to retrieve relevant articles. Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated. A total of 15 studies with 8,378 participants were analyzed. In overall analyses, a significant association with the likelihood of HCC was detected for the rs1801131 polymorphism with fixed-effect models in recessive comparison (P?=?0.002, OR = 0.62, 95% CI 0.43–0.82). However, no positive results were detected for the rs1801133 polymorphism in any comparison. Further subgroup analyses revealed that the rs1801131 polymorphism was significantly associated with the likelihood of HCC in Asians with both FEMs (recessive model: P?<?0.0001, OR = 0.42, 95% CI 0.29–0.62; allele model: P?=?0.004, OR =1.20, 95% CI 1.06–1.35) and random-effect models (recessive model: P?=?0.002, OR = 0.47, 95% CI 0.29–0.75). Nevertheless, we failed to detect any significant correlation between the rs1801133 polymorphism and HCC. In conclusion, our findings indicated that the rs1801131 polymorphism may serve as a genetic biomarker of HCC in Asians.     

let-7启动子区基因多态性与肝细胞肝癌遗传易感性的关联

目的 探讨let-7启动子区域基因多态与中国人群肝细胞肝癌(HCC)易感性的关联.方法 采用病例-对照研究设计,以经确诊的1300例乙型肝炎病毒(HBV)阳性HCC患者作为病例组,选取1344例HBV持续性感染患者作为对照组.收集研究对象血液标本5ml,提取基因组DNA.以let-7启动子区rs10877887和rs13293512为研究位点,应用TaqMan探针方法进行多态性检测,并用logistic回归计算OR(95％CI)值,比较不同基因型与HCC患病风险的关系.结果 rs10877887位点3种基因型TT、CT及CC在病例组分布频率分别为43.0％ (542/1261)、44.7％ (564/1261)及12.3％( 155/1261);在对照组中分别为44.0％( 581/1319)、44.4％( 585/1319)及11.6％ (153/1319).rsl3293512位点3种基因型TT、CT及CC在病例组分布频率分别为32.0％( 406/1270)、48.1％(611/1270)及19.9％ (253/1270),在对照组中分别为33.1％ (427/1291)、49.4％( 638/1291)及17.5％ (226/1291).多因素logistic回归分析显示,携带rs10877887位点至少1个突变等位基因C的个体与携带TT基因型的个体相比,HCC患病风险差异无统计学意义(CC+ CT对TT:调整OR=1.05,95％ CI:0.90～ 1.23);与携带TT基因型个体比较,携带rs13293512位点至少1个突变等位基因C的个体HCC患病风险差异无统计学意义(CC+ CT对TT:调整OR=1.06,95％ CI:0.89～ 1.25).两位点联合分析显示:携带0、1、2及3～4个突变等位基因C的患者在病例组分别占13.3％( 164/1235)、36.2％ (447/1235)、33.0％ (408/1235)及17.5％ (216/1235),在对照组中分别占14.2％ (181/1269)、37.0％ (469/1269)、33.1％ (420/1269)及15.7％ (199/1269).携带1、2及3～4个突变等位基因C个体的HCC患病风险分别是不携带突变等位基因个体的1.05(0.81～1.34)、1.07(0.83～1.38)、1.22(0.91 ～ 1.62)倍,呈一致趋势,但无统计学意义(Wald x2=1.79,P=0.181).结论 let-7启动子区域rs10877887和rs13293512位点多态改变可能不是中国人群HCC易感性标志.     

微小RNA前体区域基因多态与肝细胞肝癌遗传易感性关联的研究

目的 探讨微小RNA前体(pre-miRNA)区域基因多态与中国人群肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)易感性的关系.方法 采用病例-对照研究设计,包括确诊的HCC患者963例、乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)阳性对照829例和HBV阴性对照852名.选取pre-miRNA区域多态位点hsa-mir-146a rs2910164 C→G及hsa-mir-196-a2 rs11614913 T→C为研究位点,应用引物错配限制性分析(primer introduced restriction analysis-PCR,PIRA-PCR)方法进行多态性检测,应用logistic回归计算OR值及95%CI,比较不同基因型与HCC发病风险的关系.结果 rs2910164位点3种基因型CC、CG、GG在病例组分布频率分别为34.5%(319/925)、48.6%(450/925)、16.9%(156/925),在HBV阳性对照组中分别为36.4%(274/753)、45.0%(339/753)、18.6%(140/753),在HBV阴性对照组中分别为36.1%(303/840)、46.0%(386/840)、18.0%(151/840).rs11614913位点3种基因型TT、CT、CC在病例组分布频率分别为29.7%(277/934)、48.1%(449/934)、22.3%(208/934),在HBV阳性对照组中分别为30.3%(238/785)、51.0%(400/785)、18.7%(147/785),在HBV阴性对照组中分别为28.6%(239/837)、49.8%(417/837)、21.6%(181/837).在调整年龄、性别、吸烟、饮酒因素后,未能发现两位点多态与HCC发病危险之间存在明显关联[与HBV阳性对照相比:hsa-mir-146a rs2910164(GC+GG对CC):校正0R=1.10,95%CI:0.90～1.36;hsa-mir-196-a2 rs11614913(CC+CT对TT):校正OR=1.01,95%CI:0.81～1. 25;与HBV阴性对照相比:hsa-mir-146a rs2910164(GC+GG对CC):校正OR=1.06,95%CI:0.87～1.29;hsa-mir-196-a2 rs11614913(CC+CT对TT):校正OR=0.94,95%CI:0.76～1.16].分别以年龄、性别、吸烟、饮酒进行分层分析也未能发现两多态位点与HCC发病风险相关联.结论 hsa-mir-146a rs2910164 C→G及hsa-mir-196-a2 rs11614913 T→C多态性可能不是中国人群HCC的易感性标志物.

Abstract：

Objective To investigate the relationship between genetic polymorphism in microRNAs (miRNAs) precursor and genetic prediposition of hepatocellular carcinoma (HCC) in Chinese population. Methods A case-control study including 963 HCC cases and 829 HBsAg positive controls and 852 HBsAg negative controls was conducted. hsa-mir-146a rs2910164 C→G and hsa-mir-196-a2 rs11614913 T→C were selected,where the genotypes were determined by the primer introduced restriction analysis-PCR (PIRA-PCR) assay. Odd ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were evaluated by logistic regression analysis to investigate the relationship between onset risk of HCC and different genotypes. Results The genotype frequencies of CC, CG and GG at rs2910164 gene locus were separately 34. 5 % ( 319/925 ) ,48.6% (450/925) and 16.9% ( 156/925 ) in cases; 36.4% ( 274/753 ) ,45.0% ( 339/753 ) and 18. 6%(140/753) in HBsAg positive controls; and 36. 1% (303/840) ,46.0% (386/840) and 18.0% (151/840) in HBsAg negative controls. The genotype frequencies of TT, CT and CC at rs11614913 were respectively 29.7% (277/934) ,48. 1% (449/934) and 22.3% (208/934) in cases; 30. 3% (238/785) ,51.0% (400/785) and 18. 7% (147/785) in HBsAg positive controls; and 28. 6% (239/837) ,49. 8% (417/837) and 21.6% ( 181/837 ) in HBsAg negative controls. No significant relationships were observed between these two single nucleotide polymorphisms (SNPs) and onset risk of HCC after adjusting the factors as age,gender,smoking and drinking status in comparison with HBsAg positive controls: hsa-mir-146a rs2910164 (CG +GG vs CC): adjusting OR = 1.10,95% CI: 0. 90 - 1.36; hsa-mir-196-a2 rs11614913 ( CC + CT vs TT):adjusting OR= 1.01,95% CI: 0. 81 -1.25; as well as in comparison with HBsAg negative controls: hsa-mir-146a rs2910164 ( CG + GG vs CC ): adjusting OR = 1. 06,95% CI: 0. 87 - 1.29; hsa-mir-196-a2 rs11614913 ( CC + CT vs TT ): adjusting OR = 0. 94,95% CI: 0. 76 - 1.16. As well, no significant relationships were observed between these two SNPs and onset risk of HCC in the subgroups stratified by age,gender,smoking and drinking status. Conclusion hsa-mir-146a rs2910164 C→G and hsa-mir-196-a2 rs11614913 T→C may not play an important role in the HCC predisposition among Chinese populations.