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1.
目的 研究IL-13、IL-4和β2肾上腺素受体(β2AR)基因多态性与慢性阻塞性肺病易感性之间关系.方法 提取92例COPD患者及80例对照组基因组DNA,采用聚合酶链反应--限制性酶切片段长度多态性方法检测IL-13基因+2044位点、IL-4基因-589位点和-33位点单核苷酸多态性(SNPs);采用聚合酶链反应--琼脂糖电泳法检测IL-4基因可变串联重复序列(VNTR)的多态性;采用等位基因特异性多聚酶链反应法检测β2AR基因+46位点和+79位点多态性;统计分析各基因型和等位基因频率;采用SHESIS软件分析IL-13、IL-4和β2AR基因多态性位点单倍型.结果 β2AR基因+46位点,两组基因型和等位基因比较差异有显著性(P<0.05);其他研究位点基因型及等位基因频率分布在两组间比较差异均无显著性(P>0.05);单倍型(+2044G:-589C:-33C:VNTR1:+46A:+79C)在COPD组和对照组分别占14.7%和7.5%,两组间比较差异有显著性(P<0.05).结论 β2AR基因+46位点(A/G)多态性可能与我国中部地区汉族慢性阻塞性肺病易感性有关,单倍型(+2044G:-589C:-33C:VNTR1:+46A:+79C)可能也是COPD的易感因素.  相似文献   

2.
近年来,人们对β2-肾上腺素受体(β2-AR)基因编码区及调控区遗传多态性进行研究.许多研究已证明这些多态性与哮喘表型及治疗反应性相关,并且这些多态性之间有潜在的相互作用.形成染色体相的单倍型(一条染色体上排列着多个SNPs)。进一步的研究证实染色体上的单倍型而非单个SNPs决定着哮喘表型及治疗反应性。单倍型研究已成为β2-AR遗传多态性与哮喘相关研究的一个常用的重要的工具。  相似文献   

3.
有关β2-肾上腺素能受体(β2-AR)基因与哮喘的相关研究大多数都集中于两个常见的编码区非同义突变,即Arg16Gly和Gln27Glu,研究的结果存在着大量的不一致性。近来对β2-AR单倍型的研究表明,β2-AR基因的多个SNP以及它们的相互作用即单倍型在哮喘发病中比这两个常见的多态性更为重要。最近三个meta-分析表明Arg16Gly以及Gln27Glu多态性与哮喘发病无关,尽管已有研究证明它们与哮喘的其它表型相关。β2-AR基因不是哮喘发生的主要危险因素,但其多态性在决定药物反应性方面很可能重要的。本文综述了近年来有关β2-AR基因多态性在哮喘研究中的作用和这些研究的局限性以及将来β2-AR基因多态性的研究方向。  相似文献   

4.
2000年Horikawa等在人类第2号染色体NIDDM1区域内发现钙激活蛋白酶-10(Calpain-10)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)-43、-19、-63与2型糖尿病(T2DM)有关,其中SNP-43等位基因G纯合状态与T2DM既关联又连锁,而由这三个位点组成的单体型组合112/121是欧美人群T2DM的高危类型。  相似文献   

5.
过去有关β2肾上腺素能受体基因(ADRB2)多态性的研究重点集中在编码区的多态性,这些多态性可能与哮喘的发生、表型及治疗反应相关,但是研究结果不完全一致。近年来大量研究发现,不仅仅是编码区,5’和3'非翻译区的多态性同样能改变β2肾上腺素能受体(β2AR)的功能并影响着哮喘的治疗反应等,应同时对β2-AR基因中所有的变异即完整的单倍型进行识别和分析。现综述近来对ADRB2基因编码区、5’和3’非翻译区多态性的研究新进展,特别是3'非翻译区poly-C重复序列的长度的变异可能对哮喘息者的肺功能和对β2激动剂的治疗反应具有重要作用。  相似文献   

6.
目的 研究中国南方汉族人群β2肾上腺素能受体(ADRB2)基因单核苷酸多态性/单倍型与支气管哮喘(简称哮喘)相关表型的相关性.方法 采用Taqman探针法对379例哮喘患者和435例健康对照者ADRB2基因6个位点(T-2387C、5'LC Arg19 Cys、Arg16Gly、Glu27Gln、Thr164Ile和C523A)进行基因分型,并确定其单倍型.采用酶联免疫吸附(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)法检测血清总IgE.结果 164位均为野生型纯合基因型,未检测到突变型等位基因,未纳入统计分析.T-2387C、5'LC Arg19 Cys、Arg16Gly、Glu27Gln和C523A基因型频率和单倍型频率在轻+中度哮喘组与重度哮喘组间分布差异均无统计学意义(x2分别为:2.45,4.12,0.43,5.81,0.44;2.39,0.80,1.42,0.20,P值均>0.05),在夜间哮喘组与非夜间哮喘组间分布差异亦无统计学意义(x2分别为:0.77,1.51,1.68,1.51,1.03;1.05,0.45,1.01,0.40,P值均>0.05).哮喘组血清总IgE[(83.95±67.35) μg/L]高于正常健康组[(66.12±61.27)μg/L)],各位点基因型间血清总IgE水平比较差异无统计学意义(x2或Z值分别为:1.88,-1.21,1.677,-1.17,1.93,P值均>0.05),5个位点组成的4种纯合型单倍型间血清总IgE水平比较差异亦无统计学意义(x2为1.33,P>0.05).同种基因型的哮喘患者血清总IgE水平与哮喘病情严重程度及夜间哮喘差异均无统计学意义(Z值分别为:-0.73,-0.06,-0.64,-1.35,-1.82,-1.15,-0.05,-1.15,-1.37,-1.78,-0.44,-0.01,-0.35;-1.48,-0.93,-0.45,-0.42,-0.48,-0.11,-0.09,-0.80,-0.27,-0.26,-0.30,-0.23,-1.03,P值均>0.05).但将不同严重程度哮喘组分层分析发现,重度哮喘组Arg/Cys19+Cys/Cys19、Gln/Glu27+Glu/Glu27有更高的血清IgE水平.结论 ADRB2基因单核苷酸多态性/单倍型与哮喘严重程度、夜间哮喘无显著相关性,但-47、79位可能与重度哮喘患者血清总IgE有关.  相似文献   

7.
近年来,人们对β2-肾上腺素受体(β2-AR)基因编码区及调控区遗传多态性进行研究,许多研究已证明这些多态性与哮喘表型及治疗反应性相关,并且这些多态性之间有潜在的相互作用,形成染色体相的单倍型(一条染色体上排列着多个SNPs)。进一步的研究证实染色体上的单倍型而非单个SNPs决定着哮喘表型及治疗反应性。单倍型研究已成为β2-AR遗传多态性与哮喘相关研究的一个常用的重要的工具。  相似文献   

8.
目的 研究β2-肾上腺素能受体基因的多态性/单倍型与支气管舒张剂的反应性及血清免疫球蛋白E的负对数(lgIgE)间的关系.方法 2006年2月至2007年2月采用DNA测序法测定了201例哮喘患者(哮喘组)和276名健康对照者(健康对照组)的β2-AR基因5个位点(-47、-20、46、79、252)的基因型并确定其单倍型.统计学处理采用SPSS 11.5软件.以拟和优度的x2检验计算各位点基因型频率是否符合Hardy-Weinberg平衡.5个位点基因型的频率比较采用卡方检验,位点间的连锁不平衡采用确切概率法,不同基因型及单倍型与定量指标间的比较采用方差分析.如果方差分析有统计学意义,则用LSD方法对各组间的值进行两两比较.结果 哮喘组中Arg16Arg16基因型患者的支气管舒张剂反应性为(13±4)L,与Arg16Gly16基因型[(7±3)L]及G1y16Gly16基因型[(7±3)L]比较差异有统计学意义(F=81.55,P<0.01);在哮喘组6种单倍型中,单倍型Arg16Gln27/Arg16Gln27的△FEV1最高[(13.4±3.5)L],与其他种单倍型[Gly16Gln27/Gly16Gln27(6.4±0.6)L、Gly16Glu27/Gly16Glu27(7.6±3.1)L、Gly16Gln27/Gly16Glu27(6.9±3.5)L、Gly16Gln27/Arg16Gln27(7.2±3.3)L及Gly16Glu27/Arg16Gln27(7.9±2.7)L]比较差异有统计学意义(F=32.55,P<0.01);哮喘组中Gln27Gln27基因型患者的血清lgIgE为(2.51±0.33)IU/L,与Gln27Glu27基因型患者的血清lgIgE[(2.30±0.82)IU/L]比较差异有统计学意义(F=3.89,P<0.05);哮喘组中单倍型Gly16Glu27/Arg16Gln27的血清lglgE最低[(2.13±0.15)IU/L],与其他4种单倍型[Arg16Gln27/Arg16Gln27为(2.56±0.14)IU/L、Gly16Glu27/Gly16Glu27为(2.40±0.16)IU/L、Gly16Gln27/Gly16Glu27为(2.54±1.26)IU/L、Gly16Gln27/Arg16Gln27为(2.48±0.48)IU/L]比较差异有统计学意义(F=3.56,P<0.01).结论 依据所研究的哮喘表型,无论是β2-AR基因的多态性,还是单倍型均可能影响疾病的表现.  相似文献   

9.
目的探讨5-脂氧合酶激活蛋白(ALOX5AP)基因单核苷酸多态性与中国汉族人群阿司匹林抵抗(AR)的相关性。方法纳入450例持续服用阿司匹林(100mg,≥7d)的缺血性心脑血管病中的高危患者,血栓弹力图检测花生四烯酸途径的血小板聚集率,依据诊断标准分为AR组110例,阿司匹林敏感(AS)组340例。聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术分析SG13S32、SG13S89和SG13S114单核苷酸多态性。应用Haploview软件构建单倍型,并进行分析。结果 AR组与AS组SG13S114T/A突变A等位基因频率分布(40.5%vs 31.3%,P=0.01)和AA/TA基因型及TT基因型比较,差异有统计学意义(35.5%vs 46.2%,P=0.03)。而2组SG13S89、SG13S32基因型和等位基因分布频率比较,差异无统计学意义(P0.05)。logistic回归分析显示,携带SG13S114AA/TA基因型的人群发生AR的风险是携带TT基因型的3.241倍(95%CI:1.552~6.767,P=0.002)。单倍型分析显示,TG是1种危险单倍型,携带TG单倍型的人群AR发生风险是不携带TG单倍型人群的1.490倍(95%CI:1.088~2.040,P=0.014),AG是1种保护单倍型,可以减少AR发生的风险(OR=0.691,95%CI:0.502~0.952,P=0.029)。结论 ALOX5AP rs10507391与汉族人群AR相关;危险单倍型TG可增加AR发生风险。  相似文献   

10.
目的探讨白细胞介素10(interleukin10,IL-10)启动子区3个位点(IL-1082/-819/-592)的单核苷酸多态性、Mpylori感染与福建地区非责门胃癌之间的相关性。方法采用PCR和直接测序分析来检测IL-10基因多态性;采用胃黏膜快速尿素酶实验检测幽门螺旋杆菌。结果①IL-10.1082位点:胃癌组中A/A型(17.4%)、A/G型(26.4%)、G/G型(9.4%)与对照组相比有统计学意义(P〈0.05)。②IL-10-592位点与IL-10-819位点:胃癌组中C/C基因型(44.8%),C/A基因型(31.2%),A/A基因型(24%)与对照组相比无统计学意义(P〉0.05)。③胃癌患者IL-10-1082、IL-10-592和IL-10-819等位基因分布在H.pylori感染阳性组与阴性组之间,差异无统计学意义(P〉0.05)。结论①IL-10-1082A等位基因与福建地区胃癌发生相关。②IL—10—819/592等位基因与胃癌发生无相关。③IL-10.1082位点、IL-10-819/-592位点等位基因与执pylori感染之间无相关。  相似文献   

11.
目的探讨脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447x多态性位点之间的连锁不平衡和单体型对新疆哈萨克族和汉族人群代谢综合征(MS)的影响。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法检测802例研究对象(包括哈萨克族和汉族MS患者各200例和对照各201例)的脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X基因多态性。结果(1)哈萨克族和汉族MS组H-和x等位基因频率均低于各自对照组[哈萨克族H-等位基因:22.0% vs 28.6%(P=0.031),X等位基因5.5%VS12.4%(P=0.001);汉族H-等位基因:18.0% vs 28.9%(P=0.000),X等位基因:4.0% vs 12.4%(P=0.000)],但两民族间无差别(P均〉0.05)。(2)脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X多态性位点之间存在强连锁不平衡。(3)该两个多态性位点之间只存在H+/S、H-/s和H-/x三种单体型,两个民族MS组与对照组之间单体型频率均有统计学差异(X^2哈萨克=13.17,P=0.001;X^2汉=20.68,P=0.000),两民族间无差别(P〉0.05)。(4)哈萨克族和汉族H+H-/H—H-基因型与SX/XX基因型的组合都有升高HDL—C水平和降低TG水平的作用(P〈0.05)。结论脂蛋白脂酶基因HindⅢ和S447X多态性与MS相关,两位点之间存在强连锁不平衡,H-/X单体型可能是MS的保护因素,并对血脂水平产生有益的影响。  相似文献   

12.
Association of the interleukin-1 receptor antagonist gene with asthma   总被引:5,自引:0,他引:5  
The interleukin-1 cluster on human chromosome 2q12-2q14 harbors various promising candidate genes for asthma and other inflammatory diseases. We conducted a systematic association study with single-nucleotide polymorphisms (SNPs) located in candidate genes situated in this cluster. Single-marker, two-locus and three-locus haplotype analysis of SNPs yielded several significant results (p < 0.05-0.0021) for the human IL1RN gene encoding the IL-1 receptor antagonist protein, an antiinflammatory cytokine that plays an important role in maintaining the balance between inflammatory and antiinflammatory cytokines. These findings were replicated and confirmed in an independent Italian family sample in which significant, although weaker, association with asthma was detected. A sequencing approach to the coding region of the human IL1RN gene revealed additional DNA variants, from which a selection was also associated with the disease in German and Italian samples. Calculation of the linkage disequilibrium for the human IL1RN gene showed strong linkage disequilibrium for nearly all analyzed SNPs. Further haplotype analysis indicated that six SNPs are sufficient for tagging all haplotypes with a prevalence of more than 1%. The most frequent haplotype constructed from these SNPs was 1.4-fold overtransmitted in the German family sample.  相似文献   

13.
目的研究细胞间黏附分子(ICAM)系统的3个基因(ICAM1、ICAM2和ICAM3基因)的7个单核苷酸多态性(SNPs)位点与原发性高血压的相关性。方法采用TaqMan荧光定量PCR技术,对中国上海地区313例老年高血压(EH)患者和252例老年血压正常(NT)者进行基因分型,单位点及单倍型分析。结果发现ICAM2基冈的A/G多态分布与高血压相关,G等位基因频率在EH组高于NT组(0.35vs0.23,P〈0.001);G等位基因携带者(AG+GG基因型)左室重量指数高于AA基因型(108.60±26.36)g,m2VS(100.30±23.32)g/m2,(P=0.023)。末发现其他SNP分布与高血压相关。结论ICAM2基因A/G多态与老年原发性高血压相关。  相似文献   

14.
15.
RATIONALE: The comprehensive evaluation of gene variation, haplotype structure, and linkage disequilibrium is important in understanding the function of beta2-adrenergic receptor gene (ADRbeta2) on disease susceptibility, pulmonary function, and therapeutic responses in different ethnic groups with asthma. OBJECTIVES: To identify ADRbeta2 polymorphisms and haplotype structure in white and African American subjects and to test for genotype and haplotype association with asthma phenotypes. METHODS: A 5.3-kb region of ADRbeta2 was resequenced in 669 individuals from 429 whites and 240 African Americans. A total of 12 polymorphisms, representing an optimal haplotype tagging set, were genotyped in whites (338 patients and 326 control subjects) and African Americans (222 patients and 299 control subjects). RESULTS: A total of 49 polymorphisms were identified, 21 of which are novel; 31 polymorphisms (frequency > 0.03) were used to identify 24 haplotypes (frequency > 0.01) and assess linkage disequilibrium. Association with ratio (FEV1/FVC)2 for single-nucleotide polymorphism +79 (p < 0.05) was observed in African Americans. Significant haplotype association for (FEV1/FVC)2 was also observed in African Americans. CONCLUSIONS: There are additional genetic variants besides +46 (Gly16Arg) that are important in determining asthma phenotypes. These data suggest that the length of a poly-C repeat (+1269) in the 3' untranslated region of ADRbeta2 may influence lung function, and may be important in delineating variation in beta-agonist responses, especially in African Americans.  相似文献   

16.
目的 分析湖北汉族人群T淋巴细胞免疫球蛋白黏蛋白-3(TIM-3)启动子区-1516G/T和外显子3区4259G/T单核苷酸多态性及其连锁不平衡关系,探讨其构成的单体型与支气管哮喘(简称哮喘)易感性之间的关系.方法 2004年6月至2007年10月采用等位基因特异性聚合酶链反应检测湖北汉族175例哮喘患者(哮喘组)和202名健康者(健康对照组)TIM-3-1516G/T和4259G/T的单核苷酸多态性,计算基因型和等位基因频率、两位点间的连锁不平衡系数(D')值及单体型频率.结果 TIM-3基因-1516G/T基因型GG、GT和TT在健康对照组中分布频率分别为82.7%(167/202)、17.3%(35/202)、0(0/202),哮喘组分布频率分别为82.9%(145/175)、17.1%(30/175)、0(0/175);TIM-3基因4259G/T基因型GG、GT和,TT在健康对照组中分布频率分别为0.5%(1/202)、2.5%(5/202)、97.0%(196/202),哮喘组分布频率分别为0.6%(1/175)、5.7%(10/175)、93.7%(164/175).对照组D'值为1.0,哮喘组D'值为0.9.湖北汉族人群中存在3种单体型(G-G、G-T、T-T),这3种单体型频率在健康对照组分别为1.7%(7/404)、89.6%(362/404)、8.7%(35/404),哮喘组分别为3.4%(12/350)、88.0%(308/350)、8.6%(30/350);3种单体型(G-G、G-T、T-T)与哮喘易感性无相关性(x2值分别为2.15、0.47、0.003,P均>0.05).结论 TIM-3基因-1516G/T与4259G/T之间存在紧密连锁不平衡关系,G-G、G-T、T-T与哮喘易感性无相关性.但不排除是否与其他种族人群中哮喘易感性相关或与其他过敏性疾病和自身免疫性疾病的易感性相关.  相似文献   

17.
目的探讨老年人脂联素基因SNPs+45T〉G和SNPs+276G〉T与老年非糖尿病冠心病的相关性。方法选择2005年11月至2009年12月人住我院心血管内科病房,行冠状动脉造影、年龄≥65岁的非糖尿病患者688例,根据冠状动脉造影结果分为冠心病组396例和对照组292例。采用聚合酶链式反应/连接酶检测反应方法检测多态性位点。结果SNPs+45T〉G基因表型为突变型GG者发生冠心病的危险性较TT型者显著增加(OR=2.65,P〈0.01);SNPs+276G〉T基因表型为GG型者发生冠心病的危险性较TT型者显著增加(OR=2.36,P〈0.01);杂合子GT型者发生冠心病的危险陛也较TT型者显著增加(OR=1.66,P〈0.05)。logistic回归分析显示,SNPs+45T〉G基因表型为GG型,SNPs+276G〉T基因表型为GG和GT型是冠心病发病独立的危险因素。SNPs+45T〉G和SNPs+276G〉T位点存在连锁不平衡,脂联素基因SNPs+45T〉G基因表型为突变型GG型者SNPs+276G〉T基因表型均为GG型,而SNPs+276G〉T基因表型为突变型TT型者SNPs+45T〉G基因表型均为TT型,即GGGG基因表型和TTTT基因表型,且SNPs+45T〉G和SNPs+276G〉T位点基因表型为GGGG型者发生冠心病的危险性显著高于TTTT型者(OR=4.77,P〈0.01)。结论在老年非糖尿病者中,脂联素基因SNPs+45T〉G基因表型为GG型者和SNPs+276G〉T基因表型为GG或GT型者可能是冠心病的易感人群。  相似文献   

18.
目的 研究 β_2 肾上腺素能受体 (β_2-adrenoceptor,β_2-AR)基因 5’ 调控区单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms ,SNPs)与老年人原发性高血压 (essentialhypertension ,EH)的关系。 方法 应用荧光标记自动测序法测定 β2 AR基因 5’ 调控区序列 ,确定单核苷酸多态位点及类型 ;通过聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)法对来自安徽省大别山地区的健康和EH汉族老年人群进行SNPs基因分型。 结果  5’ 调控区 1 3kb范围内共检出 2个SNPs,均为G→A碱基转换 ,分别位于编码区起始位点上游 10 2 3碱基 (- 10 2 3bp)和 6 5 4碱基 (- 6 5 4bp)。SNPs的基因型频率在健康老年人群分布符合Hardy Weinberg平衡。 - 10 2 3位和 - 6 5 4位SNPs各基因型和等位基因频率在EH组和对照组的分布差异无显著性 (P >0 0 5 ) ,重度EH组 - 10 2 3位SNPs的AA基因型频率为2 6 6 7% ,对照组为 6 98% ,两组相比差异有显著性 (P <0 0 5 ) ,A等位基因频率 (5 0 0 0 % )也显著高于对照组 (2 7 91% ,P <0 0 5 )。 结论 β2 AR基因 - 10 2 3位SNPs可能与老年人EH相关 ,提示 β2 AR基因可能是老年人EH的易感基因。  相似文献   

19.
OBJECTIVE: To address whether the gamma haplotype at exon 3 of the SAA1 gene is directly associated with type AA amyloidosis or is merely in linkage with an unknown polymorphism that is primarily associated with disease risk, we examined the SAA1 gene for new polymorphisms. METHODS: We analyzed DNA samples from 44 rheumatoid arthritis (RA) patients with AA amyloidosis (amyloid group), 55 RA patients without AA amyloidosis (RA group), and 58 non-RA healthy subjects (non-RA group). We also examined DNA samples from 50 Caucasians to compare linkage disequilibrium relationships involving SAA1 region polymorphisms between Japanese and Caucasoid populations. RESULTS: We observed 3 novel single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5'-flanking region of SAA1: -61C/G, -13T/C, and -2G/A. Comparison of allele frequencies and ratios of individuals with particular alleles between the study groups revealed statistically significant differences between the amyloid and RA groups and between the amyloid and non-RA groups. Statistical analysis revealed that the -13T/C SNP was strongly associated with AA amyloidosis. In addition, we found tight linkage between the -13T allele and the alpha haplotype, rather than the beta haplotype, at exon 3 in the Caucasoid population, while -13T was closely linked to the gamma and beta haplotypes, rather than the alpha haplotype, in the Japanese population. Since the linkage disequilibrium relationship was reversed between the Japanese and Caucasoid populations, different exon 3 haplotypes of SAA1 are found to be associated with the risk of AA amyloidosis in different ethnic groups. CONCLUSION: Our data suggest that the SAA1 -13T allele, rather than SAA1 exon 3 haplotypes, is primarily associated with AA amyloidosis risk.  相似文献   

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