非编码RNA在心脏缺血再灌注损伤中的研究进展

经典的遗传学中心法则认为RNA是DNA与蛋白质中间的信使,但随着RNA测序技术的发展,人们逐渐发现占人类基因组98.5％的不编码蛋白的基因同样发挥着重要生物学作用[1].曾被认为是转录过程中垃圾产物的非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA),能够调节多种生物学信号通路,与DNA、RNA和蛋白质相互作用,参与人类疾病的发生发展,具有重要的研究价值.根据ncRNA核苷酸长度可分为长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)和小ncRNA.狭义上,小ncRNA包括microRNA(miRNA)和circRNA[2].     

长链非编码RNA对创面愈合调控作用的研究进展

非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)是不被翻译为蛋白质,但具有功能的一类RNA分子,其在哺乳动物基因组中占额达98%,参与并调控细胞增殖、分化和凋亡等生物过程[1-4].长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA分子,定位于细胞核或细胞质内,从表观遗传、转录水平和转录后水平等多种层面调控基因表达.目前,人体中已发现大约9 000多种,小鼠体内发现6 000多种,约占ncRNA的80%[5-6].根据lncRNA在基因组上相对于编码基因的位置,将lncRNA分为5类:正义(sense)lncRNA、反义(antisense)lncRNA、双向(bidirectional)lncRNA、内含子(intronic)lncRNA和基因间(intergenic)lncRNA,其功能由所处位置决定.     

长链非编码RNA与肿瘤的研究进展

基因组学研究表明,哺乳动物基因组具有广泛密集转录的特点,只有不到2％转录为蛋白质,而超过98％转录为非编码RNA(ncRNA)[1].ncRNA按其长度可分为小非编码RNA(small ncRNA)和长链非编码RNA (LncRNA).目前研究的热点仍集中于ncRNA如微小RNA (microRNA)、小干扰RNA(siRNA)等,而对于LncRNA的研究仍然处于相对陌生的领域.尽管LncRNA曾被认为是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能[2].然而近年来越来越多的研究表明LncRNA能够广泛地参与基因组调节,如X染色体失活、基因组印迹、染色质修饰、转录、剪接、翻译、降解、转运等,从而广泛参与调控个体的生长发育以及细胞凋亡、增殖、分化等生命活动,并与包括肿瘤在内的许多疾病有着千丝万缕的联系[34].现就LncRNA在肿瘤发生发展过程中的作用机制以及研究进展作一综述.     

微小RNA经Wnt通路调控成骨分化及其力学响应的研究进展

微小RNA(miRNA)是一类长度约22 nt的内源性非编码RNA,主要通过识别靶基因mRNA和靶基因mRNA的非编码区碱基配对,引导沉默复合体降解mRNA或阻碍其翻译,在转录后水平负调控基因的表达[1].miRNA在干细胞分化、增殖和新陈代谢中,起着关键调节作用[2].Wnt信号通路是一个蛋白质相互作用的复杂网络,为生物生长发育所必需[3-4].     

超基因:基因表达的“多面手”

真核生物基因组的转录是基因表达的重要环节,转录产物不仅包括编码蛋白的信使RNA,还包括众多类型的非编码RNA。在转录过程中,有些基因位点可生成不止一种RNA分子,其中可能包括编码RNA分子,但更多的是非编码RNA分子,这类可转录生成多种RNA分子的基因位点被命名为超基因。根据转录模式的不同,超基因分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型。本文结合实例,对各型超基因的转录特点及其在细胞中的调控作用进行综述。     

非编码RNA——功能基因组研究的新热点

多年来,研究者们对人类基因组的关注主要集中在编码蛋白质的基因和蛋白质本身.随着人类基因组计划的完成和哺乳类转录组数据的不断积累,揭示出人类和其他高级真核生物的遗传物质只有极小一部分编码蛋白质[1],而超过97%的转录产物是功能多样的RNA分子,即非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)[2].     

lncRNA的基因调节功能以及与肿瘤的发生

目的 本文对以下几方面最新的研究进行综述：（1）长链非编码RNA的生物学特性;（2）长链非编码RNA的转录调控;（3）长链非编码RNA在肿瘤发展过程中作用的近期研究。 数据来源 本文所引用的数据主要来自于2002年到2010年6月间PubMed、HighWire出版的论文。检索词为“非编码RNA”、“基因调控”和“肿瘤”。 资料选择 （1）长链非编码RNA在基因表达调控中的机制;（2）肿瘤与长链非编码RNA的关系以及长链非编码RNA在肿瘤中所发挥的作用。 结果 长链非编码RNA通过染色体重塑、转录控制及转录后控制而在转录调控中发挥着非常重要的作用。事实证明,长链非编码RNA和多种肿瘤相关;既可以作为肿瘤抑制因子又可以作为肿瘤促进因子而发挥作用。 结论 长链非编码RNA可以完美地调节基因表达系统的平衡,在肿瘤细胞转化过程中发挥重要作用。 传统的观点认为RNA是DNA和蛋白质之间传递信息的中介,随着DNA测序技术的发展,非常惊奇的的发现：人的基因组不到2%的基因为蛋白编码基因(Birney, et al.,2007;Mercer, et al.,2009)。而主要的基因序列转录为非编码RNA（Non-coding RNAs ,ncRNA）,大量的ncRNA构成巨大的分子网络,在真核生物的生命活动调节中发挥中枢的作用。虽然近十年来对于非编码RNAs的研究取得了不少成果,但大部分研究都集中于短链非编码RNAs(包括 siRNA、miRNA、piRNA)。长链非编码RNAs（Long noncoding RNAs,lncRNA）,起初被认为是基因转录的“噪音”,是RNA聚合酶的副产物,无生物学功能(Struhl,2007),所以被学者冷落,近几年研究表明lncRNA参与了基因的转录调控,是基因调控网络中的关键成员之一,参与了很多疾病的发展。本文就lncRNA的调控机制及与肿瘤的关系进行综述。     

长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA (long non-coding RNA, LncRNA)是真核细胞中一类转录本长度超过200 nt的非编码RNA分子,无或很少有蛋白编码功能,在哺乳动物基因组普遍被转录.LncRNA曾经被认为是转录过程中的副产物,不具有生物学功能.目前越来越多的研究证实LncRNA 具有复杂的生物学功能,并与人类疾病的发生有密切的关系.本文综述LncRNA功能及其与疾病方面的研究进展.     

细菌sRNA功能、预测及鉴定方法的研究进展

生物体中除了mRNA、tRNA、rRNA三种我们熟知的RNA外,还存在大量的非编码RNA(non-coding RNA)。它们隐藏于基因组内的信息层,有学者称之为基因组内"暗物质",不可见却执行着新层次调控基因表达的功能[1]。研究者在对非编码RNA的研究中发现了大量具有转录后调控功能的非编码小RNA,如MicroRNAs(miRNAs)、Small     

长链非编码RNA与前列腺癌

功能基因组学的飞速发展将越来越多的目光引向了对非编码转录产物功能的研究。在某些情况下或者是至少在一种特定的细胞类型中,人类的常染色体中几乎每一对核苷酸对都会发生转录现象[1]。转录产物中能够稳定存在的信使RNA(messenger RNA,mRNA)不超过2%,其余绝大部分为非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)[2]。关于ncRNA的分类,目前有两种较常用的方法,一种是依据ncRNA的表达特点及功     

细菌sRNA与抗菌药物的药理作用及耐药性

非编码微小RNA即microRNA在细胞生长、增殖、分化、凋亡等生命过程中起重要的调控作用,几乎参与所有疾病的病理生理过程,为近年研究的热点课题。原核细胞也存在非编码RNA,称为小RNA(small non-coding RNA,sRNA)。sRNA作为一种应答元件,通过与靶mRNA碱基互补配对抑制靶基因mRNA翻译或(和)降解mRNA,在转录后水平调控细菌多种功能,影响细菌生长与繁殖[1,2]。虽然sRNA的发现(1967年)早于microRNA(1993年),但     

miRNA-205与肿瘤

小分子RNA (miRNAs)是内源性非编码小RNA,大约由21 ～25个核苷酸组成.1993年,Lee等[1]首先发现在线虫体内存在一种RNA(lin-4),是一种不编码蛋白但可以生成一对小的RNA转录本,每一个转录本能在翻译水平通过抑制一种核蛋白lin-14的表达而调节了线虫的幼虫发育进程.对于出现这种现象的原因,科学家们猜测是由于基因lin-14的mRNA的3UTR区独特的重复序列和lin-4之间有部分的序列互补造成的.在第一幼虫阶段的末期降低lin-14的表达将启动发育进程进入第二幼虫阶段.7年后科学家又发现了第二个miRNA-let-7,let-7相似于lin-4,同样可以调节线虫的发育进程[2].     

LncRNA MALAT1与肺部疾病关系的研究进展

长链非编码 RNA(long non-coding RNA, ln-cRNA)是转录长度超过200 nt且缺乏蛋白质编码能力的RNA分子,因其异常表达与疾病的发生发展密切相关而成为当前的研究热点[1].肺腺癌转移相关转录本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma trans...     

环境胁迫下细菌非编码小RNA对基因表达的调控

细菌非编码小RNA(sRNA)是长度约为50～500个核苷酸的RNA分子。其编码基因位于基因间区域,在细菌基因组中可被转录但不被翻译为蛋白质,随着生物信息学和RNA测序技术的发展,sRNA功能受到广泛关注。在不断变化的环境中,细菌遇到各种各样生存压力,sRNA通过感应环境变化调节相应基因的表达。在细菌适应环境的过程中发挥了重要作用。本文对环境胁迫下细菌sRNA的表达变化和其对基因的表达调控进行综述,揭示sRNA细菌基因转录后调控、生物适应性进化等生命过程的重要意义。     

微小RNA在肾脏及其相关疾病中的调控作用

微小RNA(miRNA)是细胞内源性的一种非编码的RNA,可表达出原始miRNA转录物(pri-miRNA),较大的primiRNA经一种RNA内切酶Ⅲ(Drosha)和辅助因子Pasha(含有双链RNA结合区域)加工成单链miRNA前体,随后具有发卡结构的单链miRNA前体在细胞质中被双链RNA专一性RNA内切酶(Dicer)切割成约22 nt的miRNA.成熟的miRNA中的一条单链与RNA诱导的沉默复合体(RNAinduced silencingcomplex,RISC)结合,形成RISC复合体.通过与靶基因mRNA的3'非翻译区(3'UTR区域)的碱基完全或不完全配对,导致mRNA降解或mRNA翻译抑制,即转录后基因沉默[1].     

近视相关非编码RNA的研究进展

非编码RNA是一类无法借由翻译形成蛋白质的RNA,包括微RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)等,曾被认为是"转录噪音".研究发现非编码RNA参与许多人类疾病病理生理过程,包括细胞的增殖、分...     

lncRNA与心血管疾病

非编码RNA(ncRNA)占哺乳动物RNA的98%,既往认为非编码RNA不具备生物学功能,但近些年来的研究发现,非编码RNA可从表观遗传学、转录调控及转录后调控等多个层面实现对基因表达的调控,其表达水平的变化与多种疾病密切相关,亦影响到心血管疾病的发病进程。其中,长链非编码RNA(lncRNA)成为基因组学研究中一颗冉冉升起的新星,其可从转录水平调控疾病相关基因的表达,亦可竞争性结合microRNA,以影响目的基因的表达和功能。文章从非编码RNA的来源、分类、作用机制及lncRNA在心血管疾病中的研究进展进行综述。具有细胞和组织特异性的lncRNA未来则有望成为一类全新的疾病诊断、判断预后的特异标志物和新药作用靶点,为疾病的临床诊断与治疗提供新思路。     

lncRNA与miRNA相互调控作用机制及其在胃癌中的影响

微小RNA(miRNA)是一类通过与mRNA结合从而调控众多编码基因的非编码小RNA。长链非编码RNA(lncRNA)在不同程度上调控基因的表达,包括染色质修饰、转录和转录后处理等,其转录本长度大于200bp。miRNA和lncRNA的相互调控在肿瘤的发生、发展中也发挥重要作用。本文在介绍lncRNA与miRNA相互调控及机制的基础上,总结其对胃癌(gastric cancer,GC)发生、发展的影响。     

红细胞生成相关长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA（lncRNA）是一类转录本长度>200nt的非蛋白质编码RNA。lncRNA是一种功能性RNA分子,参与了细胞分裂、分化、生存等重要过程的调控。近年来红细胞生成相关长链非编码RNA的功能也相继被揭示,本文就相关研究进展进行综述。     

MicroRNA与心房颤动心肌纤维化关系进展

微小RNA（MicroRNA,miRNA）是一类长度为18-25个核苷酸的内源性非编码小RNA,通过与靶蛋白mRNA3’端非编码区的不完全互补结合,抑制mRNA转录后的靶蛋白的表达或通过降解mRNA的方式调节特异基因表达。近来发现,miRNA与心房颤动有关,但具体调控机制尚未完全清楚。心房颤动发病机制非常复杂,其中心房肌纤维化被认为是心房颤动发生的重要病理基础。研究发现,miRNA在心血管疾病心肌纤维化起重要作用．本文就miRNA与心房颤动心肌纤维化关系做一综述。