非编码RNA——功能基因组研究的新热点

多年来,研究者们对人类基因组的关注主要集中在编码蛋白质的基因和蛋白质本身.随着人类基因组计划的完成和哺乳类转录组数据的不断积累,揭示出人类和其他高级真核生物的遗传物质只有极小一部分编码蛋白质[1],而超过97%的转录产物是功能多样的RNA分子,即非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)[2].     

非编码小RNA参与转录水平基因表达调控

研究表明,人类基因组约有50%的DNA序列可转录为RNA,但其中98%的RNA不能翻译为蛋白质[1],此类在转录过程中所产生的大量非编码RNA曾一度被认为是无用的"垃圾"[2].但自从1998年RNA干扰现象[3]被发现以来,非编码小RNA(ncRNA)所介导的基因表达调控越来越被人们所关注.迄今为止,国际上对非编码小RNA并没有给出明确的定义.     

长链非编码RNA与肿瘤的研究进展

基因组学研究表明,哺乳动物基因组具有广泛密集转录的特点,只有不到2％转录为蛋白质,而超过98％转录为非编码RNA(ncRNA)[1].ncRNA按其长度可分为小非编码RNA(small ncRNA)和长链非编码RNA (LncRNA).目前研究的热点仍集中于ncRNA如微小RNA (microRNA)、小干扰RNA(siRNA)等,而对于LncRNA的研究仍然处于相对陌生的领域.尽管LncRNA曾被认为是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能[2].然而近年来越来越多的研究表明LncRNA能够广泛地参与基因组调节,如X染色体失活、基因组印迹、染色质修饰、转录、剪接、翻译、降解、转运等,从而广泛参与调控个体的生长发育以及细胞凋亡、增殖、分化等生命活动,并与包括肿瘤在内的许多疾病有着千丝万缕的联系[34].现就LncRNA在肿瘤发生发展过程中的作用机制以及研究进展作一综述.     

长链非编码RNA及其在系统性红斑狼疮发生发展中的作用

<正>人类基因组有超过30亿个碱基对,其中大约包含有20 000个蛋白质编码基因,仅约占人类基因组的1.5%,非蛋白质编码基因占人类基因组的98.5%,ENCODE项目研究发现至少80%的人类基因组被转录成无编码蛋白质能力或编码能力极低的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)~([1～2])。ncRNA根据长度大小可分为:小于200个核苷酸的短链非编码RNA     

长链非编码RNA对创面愈合调控作用的研究进展

非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)是不被翻译为蛋白质,但具有功能的一类RNA分子,其在哺乳动物基因组中占额达98%,参与并调控细胞增殖、分化和凋亡等生物过程[1-4].长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA分子,定位于细胞核或细胞质内,从表观遗传、转录水平和转录后水平等多种层面调控基因表达.目前,人体中已发现大约9 000多种,小鼠体内发现6 000多种,约占ncRNA的80%[5-6].根据lncRNA在基因组上相对于编码基因的位置,将lncRNA分为5类:正义(sense)lncRNA、反义(antisense)lncRNA、双向(bidirectional)lncRNA、内含子(intronic)lncRNA和基因间(intergenic)lncRNA,其功能由所处位置决定.     

外泌体源性非编码RNA作为肝癌标志物的研究进展

非编码RNA(ncRNA)为不具备编码蛋白质功能的基因组转录产物,在基因转录、转录后及翻译水平发挥调控作用,与肿瘤发生和发展密切相关。外泌体ncRNA在细胞间通讯中起着关键作用。某些外泌体ncRNA在肿瘤中存在差异性表达,提示其具备作为肿瘤液体活检标志物的潜在价值。本文对外泌体ncRNA中的微小RNA(microRNA, miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)、环状RNA(circular RNA, circRNA)作为肝细胞癌标志物的研究进展进行综述,探讨了外泌体源性非编码RNA作为肝癌诊断与预后新型生物标志物的临床应用价值。     

非编码RNA与复发性流产的研究进展

复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)是妊娠常见的并发症之一,其病因较为复杂,临床发生率逐年上升。非编码RNA(non-coding,ncRNA)在复发性流产的发生与发展中具有重要作用,ncRNA能通过调节细胞周期、细胞凋亡和上皮间充质转化等细胞过程来影响滋养细胞的生长、迁移与侵袭。多项研究发现ncRNA中长链非编码RNA、微RNA、环状RNA等均与复发性流产密切相关,可以作为复发性流产潜在诊断与预测性生物学标志物。本文综述近年来非编码RNA与复发性流产关系的相关研究进展,为诊断与治疗复发性流产提供思路。     

LncRNA MALAT1与肺部疾病关系的研究进展

长链非编码 RNA(long non-coding RNA, ln-cRNA)是转录长度超过200 nt且缺乏蛋白质编码能力的RNA分子,因其异常表达与疾病的发生发展密切相关而成为当前的研究热点[1].肺腺癌转移相关转录本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma trans...     

非编码RNA与胰岛素信号通路关系及其临床应用

非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）是一类没有或只有有限编码蛋白能力的RNA,主要包括微小RNA（microRNA,miRNA）、长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）、环状RNA（circular RNA,circRNA）、转运RNA（transfer RNA,tRNA）、PIWI相互作用RNA（PIWI-interacting RNA,piRNA）和核小RNA（small nucleolar RNA,snoRNA）。目前,研究已经发现ncRNA在调控胰岛β细胞功能及胰岛素信号通路传导过程中发挥着核心作用,而胰岛素信号传导阻滞是糖尿病发生的重要原因。因此,本文综述了近年来ncRNA与胰岛素信号通路之间的调控关系的研究进展,同时探讨了ncRNA作为糖尿病潜在治疗靶点及临床诊断标志物的可能性,以期为糖尿病的治疗与诊断提供参考。     

非编码RNA在肺动脉高压中的作用

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类具有多种功能而不翻译蛋白质的RNA。它包括microRNA、lncRNA、ceRNA等。ncRNA主要通过表观遗传学在基因转录过程中对其表达进行调控。近年大量研究发现ncRNA可以引起多种疾病,如心血管疾病、肿瘤、肺动脉高压(PAH)等。本文对ncRNA在PAH形成过程中的作用相关研究进展作综述,以期为肺动脉高压的治疗提供理论依据。     

长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA (long non-coding RNA, LncRNA)是真核细胞中一类转录本长度超过200 nt的非编码RNA分子,无或很少有蛋白编码功能,在哺乳动物基因组普遍被转录.LncRNA曾经被认为是转录过程中的副产物,不具有生物学功能.目前越来越多的研究证实LncRNA 具有复杂的生物学功能,并与人类疾病的发生有密切的关系.本文综述LncRNA功能及其与疾病方面的研究进展.     

血液肿瘤T淋巴细胞免疫功能相关ncRNAs的研究进展

非编码RNA(ncRNA)是指不编码蛋白质的片段RNA,包括"管家"非编码RNA、小RNA和长非编码RNA等,其参与了生物个体的发育与分化、生殖、细胞凋亡和细胞重编程等,且其失控能促进恶性肿瘤的发展.血液肿瘤包括各类白血病、恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤以及骨髓增殖性肿瘤等,其发生发展以及预后与机体的免疫系统功能密切.相关研...     

长链非编码RNA与恶性黑色素瘤关系研究进展

<正>人类基因组中约有90%的DNA能转录为RNA,其中仅约2%的RNA能翻译为蛋白质,其余的RNA均为非编码RNA(Noncoding RNA,ncRNA)~([1])。研究发现,自然界中生物的复杂性与非编码序列密切相关。根据非编码RNA的长度,将它们分为短链非编码RNA(RNA,small untranslated,SncRNA)和长链非编码RNA(RNA,long noncoding,LncRNA)。其中,LncRNA能够通过染色体质量构和组蛋白修饰的调控影响肿瘤等疾病的发生发展~([1])。恶性黑色素瘤(malignant melanoma,     

长链非编码RNA与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的研究进展

许多人类肿瘤是由致瘤病毒引起的,除病毒编码蛋白外,大量证据表明,由致瘤病毒诱导宿主转录的非编码 RNA（non-coding RNA, ncRNA）也是促进肿瘤产生的重要辅佐因子。在早期,由于ncRNA不能编码蛋白质,因而被研究者认为是无用的RNA,但随着科学技术的发展,人们逐渐了解其在多种生物学过程中的重要性。肝细胞癌（hepatocellular carcinoma, HCC）在原发性肝癌中的占比大,其患者死亡率在所有癌症中排名第三,常见于亚洲、非洲和欧洲南部,乙型肝炎病毒（hepatitis B virus, HBV）的慢性持续性感染是其主要产生原因。大于200个核苷酸识别的ncRNA被称为长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）。目前人们对lncRNA在HBV相关HCC中的机制仍不清楚,但越来越多的证据表明lncRNA在HBV相关HCC过程中发挥了关键性作用,使得lncRNA成为HCC治疗的关键要素。本文主要就HBV感染导致的HCC与lncRNA之间的关系作一综述。     

长链非编码RNA，微小RNA和环状RNA在宫颈癌中的作用

宫颈癌的发生、发展和预后是一个多因素、多通路的病理过程，除了高危乳头瘤病毒感染外，表观遗传调控机制在宫颈癌的发生、发展中也发挥了重要作用。非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）通常不参与蛋白质合成，但长链非编码 RNA（long non-coding RNA，lncRNA），微小RNA（microRNA，miRNA）和环状 RNA（circular RNA，circRNA）可通过多种机制参与调控肿瘤细胞的生长、恶性转化、细胞迁移和侵袭，与宫颈癌的进展、侵袭有关，对宫颈癌的诊断和治疗有重要意义，并已成为宫颈癌诊断和预后新的生物标志。本文总结了lncRNA、miRNA和circRNA在宫颈癌发生、发展中的作用。     

lncRNA的基因调节功能以及与肿瘤的发生

目的 本文对以下几方面最新的研究进行综述：（1）长链非编码RNA的生物学特性;（2）长链非编码RNA的转录调控;（3）长链非编码RNA在肿瘤发展过程中作用的近期研究。 数据来源 本文所引用的数据主要来自于2002年到2010年6月间PubMed、HighWire出版的论文。检索词为“非编码RNA”、“基因调控”和“肿瘤”。 资料选择 （1）长链非编码RNA在基因表达调控中的机制;（2）肿瘤与长链非编码RNA的关系以及长链非编码RNA在肿瘤中所发挥的作用。 结果 长链非编码RNA通过染色体重塑、转录控制及转录后控制而在转录调控中发挥着非常重要的作用。事实证明,长链非编码RNA和多种肿瘤相关;既可以作为肿瘤抑制因子又可以作为肿瘤促进因子而发挥作用。 结论 长链非编码RNA可以完美地调节基因表达系统的平衡,在肿瘤细胞转化过程中发挥重要作用。 传统的观点认为RNA是DNA和蛋白质之间传递信息的中介,随着DNA测序技术的发展,非常惊奇的的发现：人的基因组不到2%的基因为蛋白编码基因(Birney, et al.,2007;Mercer, et al.,2009)。而主要的基因序列转录为非编码RNA（Non-coding RNAs ,ncRNA）,大量的ncRNA构成巨大的分子网络,在真核生物的生命活动调节中发挥中枢的作用。虽然近十年来对于非编码RNAs的研究取得了不少成果,但大部分研究都集中于短链非编码RNAs(包括 siRNA、miRNA、piRNA)。长链非编码RNAs（Long noncoding RNAs,lncRNA）,起初被认为是基因转录的“噪音”,是RNA聚合酶的副产物,无生物学功能(Struhl,2007),所以被学者冷落,近几年研究表明lncRNA参与了基因的转录调控,是基因调控网络中的关键成员之一,参与了很多疾病的发展。本文就lncRNA的调控机制及与肿瘤的关系进行综述。     

竞争性内源性RNA与胃癌的相关研究进展

胃癌是全球最常见的癌症之一,是影响全球健康的一个主要问题。胃癌的发生发展是一个多因素共同作用的结果。近年来,非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),特别是微小RNA(microRNA,mi RNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),因在人类各种疾病中具有重要意义,包括癌症,而受到广泛关注。无疑,竞争性内源性RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)假说的提出为疾病中的基因调控作用提供了新思路。根据最新发现,本文描述了ceRNA在胃癌发生、发展中的作用和意义,并探讨了ceRNA在胃癌中的相互作用及其可能的分子机制。     

近视相关非编码RNA的研究进展

非编码RNA是一类无法借由翻译形成蛋白质的RNA,包括微RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)等,曾被认为是"转录噪音".研究发现非编码RNA参与许多人类疾病病理生理过程,包括细胞的增殖、分...     

lncRNA/microRNA调控中枢神经系统损伤后神经干细胞增殖的研究进展

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)作为影响神经干细胞增殖的潜在靶点,近年来已成为研究改善中枢神经系统损伤的关键影响因素。虽然神经干细胞在成体神经组织中不易增殖,但由于ncRNA具有调控细胞更新的作用,且微小RNA(microRNA,miRNA)与长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)之间作用方式具有复杂性与多样性,因此近年来二者成为调控神经干细胞增殖的研究热点。本文总结近年来miRNA、lncRNA及miRNA与lncRNA共同作用如何影响神经干细胞的增殖,并就目前研究的局限性进行深入分析,并阐述康复医学领域通过物理因子介导神经干细胞增殖的研究,为将来相关领域的研究提供方向。     

睾丸发育相关基因1在肿瘤中的效应和机制

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是RNA分子中的一个新类型,它广泛参与肿瘤发生发展的过程。睾丸发育相关基因1(testis developmental related gene 1,TDRG1)作为一种长链非编码RNA,在诸多人类肿瘤中呈现异常表达并通过不同机制影响肿瘤增殖、侵袭转移且与患者的预后密切相关。本文对TDRG1在肿瘤中的生物学效应和分子机制进行综述。