甲状腺乳头状癌与基质金属蛋白酶抑制因子3（TIMP3）基因启动子甲基化的关系研究

目的 研究基质金属蛋白酶抑制因子3（TIMP3）基因启动子甲基化水平与甲状腺乳头状癌发生的内在联系,建立基于启动子高甲基化抑癌基因的甲状腺乳头状癌早期诊断方法 。方法 收集甲状腺手术切除的组织标本共46例,其中甲状腺乳头状癌（Papillary thyroid carcinoma,PTC）29例,结节性甲状腺肿（nodular goiter）17例。经提取DNA,设计并合成BSP引物,PCR扩增,采用亚硫酸氢盐法克隆测序（bisulfite sequencing）和Sequenom Mass ARRAY甲基化DNA定量分析法检测甲状腺乳头状癌组织TIMP3基因启动子CpG片段的甲基化水平。结果 亚硫酸盐修饰测序结果 显示TIMP3基因在甲状腺乳头状癌组织中的高甲基化克隆百分比为70％,显著高于结节性甲状腺肿的0％（P〈0．05）。TIMP3基因启动子区5个CpG位点在甲状腺乳头状癌组织中的甲基化有呈较高的甲状腺乳头状癌特异性。Sequenom Mass ARRAY提供的单一CpG位点甲基化定量数据显示TIMP3基因在甲状腺乳头状癌组织的甲基化率均值（0．28）高于结节性甲状腺肿的甲基化率均值（0．15）,差异有统计学意义（P〈0．05）。TIMP3基因启动子3个CpG位点在甲状腺乳头状癌组织中的甲基化率均值高于结节性甲状腺肿甲基化率,差异有统计学意义（P〈0．05）。结论 TIMP3基因CpG-16及CpG-17位点可能为甲状腺乳头状癌的启动子甲基化检测的关键位点,有望成为甲状腺癌早期诊断的分子标志物。     

中国女性外周血EMR3基因甲基化水平与乳腺癌的相关性

目的 探究中国人群外周血中C19orf57、MAP9、EMR3、NEK6和PCOLCE2基因的甲基化水平与乳腺癌的相关性。方法 通过病例对照研究收集了258例早期乳腺癌患者和272名健康女性的外周血,并采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术（MALDI-TOF-MS）定量检测基因上CpG位点的甲基化水平。使用logistics回归模型校正协变量分析DNA甲基化水平与乳腺癌的相关性。Spearman秩相关用于分析基因甲基化水平与年龄的关系。使用非参数检验分析不同临床特征组别的甲基化水平差异。结果 与欧美人群的乳腺癌EMR3高甲基化相反,EMR3基因的低甲基化与中国女性的乳腺癌相关,但该相关性仅存在于≥ 50 岁的女性中（每减少 10%的甲基化,EMR3_CpG_1：OR=1.40;EMR3_CpG_2：OR=2.31;EMR3_CpG_3：OR=2.76,P< 0.05）。EMR3的甲基化水平与肿瘤分期、大小、淋巴转移、ER、PR、HER2、Ki67等没有或仅有弱相关。C19orf57甲基化与乳腺癌无相关性。结论 外周血EMR3基因的低甲基化与中国女性乳腺癌之间存在相关性,尤其是年龄较大或绝经后女性。     

促甲状腺激素受体基因启动子区甲基化与乳头状甲状腺癌的关系研究

目的观察促甲状腺激素受体（TSHR）在乳头状甲状腺癌（PTC）中的表达,分析其基因启动子区甲基化与肿瘤发生的关系。方法选择50例PTC和32例良性甲状腺肿瘤患者（对照组,包括20例结节性甲状腺肿和12例甲状腺腺瘤患者）,对两组患者手术获取的标本提取RNA后,逆转录为cDNA,进行PCR,检测鸭HR基因的表达情况;运用甲基化特异性PCR（MSP）法检测上述组织中TSHR基因启动子区甲基化的情况。结果PTC组患者中,有34例（68．0％）TSHR基因启动子发生甲基化,16例（32．0％）TSHR基因mRNA表达缺失;对照组患者中,有7例（21．9％）TSHR基因启动予发生甲基化,4例（12．5％）TSHR基因mRNA表达缺失,PTC组织TSHR基因启动子区甲基化率及TSHR基因mRNA表达缺失率均显著高于对照组,差异有统计学意义（X^2值分别为16．61和4．02,P〈0．05）。34例发生了TSHR基因启动子区甲基化的PTC患者中,有14例（41．2％）TSHRmRNA表达缺失;16例未发生甲基化的PTC患者中,2例（12．5％）发生了mRNA表达缺失,二者mRNA表达缺失率间差异有统计学意义（X^2=4．11,P〈0．05）。结论PTC患者TSHR基因启动子甲基化发生率显著高于良性甲状腺肿瘤患者,而TSHR基因mRNA的表达则较良性甲状腺肿瘤降低;推测TSHR基因启动子区甲基化可能与PTC的发生、发展相关。     

抑癌基因RAS启动子甲基化与乳头状甲状腺癌的关系

目的观察抑癌基因RAS在乳头状甲状腺癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)中的表达,分析其启动子甲基化与肿瘤发生的关系。方法 选择50例PTC和32例良性甲状腺肿瘤(对照组,包括20例结节性甲状腺肿,12例甲状腺腺瘤)患者,对2组患者手术获取的标本提取RNA后,反转录为cDNA,进行多聚酶链反应(polymerase chain reaction,PCR),检测RAS基因的表达情况;运用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)检测上述组织中RAS基因启动子区甲基化的情况,并对2种抑癌基因甲基化和未甲基化的组织随机进行测序。结果 PTC组患者中,有30例(60%)RAS基因启动子发生甲基化;对照组患者中,有10例(31.3%)RAS基因启动子发生甲基化;PTC组织RAS基因启动子甲基化率均显著高于对照组,差异有统计学意义(χ2=6.46,P<0.05)。乳头状甲状腺癌mRNA的半定量的值为0.56±0.10,对照组mRNA半定量的值为0.67±0.16,乳头状甲状腺癌mRNA的表达明显低于对照组,两者差异具有统计学意义(t=2.83,P<0.05)。经DNA测序证实,RAS基因启动子发生甲基化的其CpG岛的碱基未发生改变,仍为CG;未发生甲基化的,碱基由CG变为TG。结论 PTC患者RAS基因启动子甲基化发生率显著高于良性甲状腺肿瘤患者,而RAS基因mRNA的表达则较良性甲状腺肿瘤降低;推测RAS基因启动子甲基化可能与PTC的发生、发展相关。     

慢性黏液分泌过多与痰中肿瘤抑制基因启动子甲基化水平的相关性分析

目的研究吸烟者痰液DNA中的肿瘤抑制基因,评估慢性黏液分泌过多(CMH)与痰中基因启动子甲基化的相关性。方法纳入2013年至2016年延安大学附属医院呼吸内科诊治的患者,使用甲基化特异性(MSP)方法评估700例城市吸烟者和380例农村吸烟者痰样品中11个肿瘤抑制基因的启动子甲基化水平。结果 CMH与甲基化基因的总体增加的数量显著相关,其中硫酸酯酶2(SULF2)甲基化表现出最一致的相关性。SULF2甲基化和CMH之间的关联在两组吸烟者男性中显著增加(OR=2.73,95%CI 1.53~4.93,P=0.001;OR=2.96,95%CI1.47~5.94,P=0.002),但在女性中不显著。与目前吸烟者比较,具有持续性CMH的男性曾经吸烟者中甲基化水平与CMH之间的关联更为明显(SULF2:OR=3.64,95%CI 1.57~8.35,P=0.002)。结论具有持续性CMH的男性前吸烟者痰液细胞中肺癌风险基因的启动子甲基化水平显著增加,可能会增加患肺癌的风险。     

中国人群外周血RABL6基因甲基化与早期肺癌的关联性研究

目的 基于病例对照研究，探索中国人群外周血RABL6基因甲基化水平与早期肺癌(LC)之间的相关性。方法 采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱定量检测275例LC患者(81.5%为Ⅰ期)和年龄、性别匹配的185例良性肺结节对照以及267例健康对照外周血RABL6中7个CpG位点的甲基化水平。采用无序多分类Logistic回归法分析RABL6甲基化水平与LC之间的相关性。应用Mann-Whitney U检验比较不同临床特征分组之间RABL6甲基化水平。结果 与健康对照比较，RABL6＿CpG＿17甲基化水平与LC在女性中呈负相关(甲基化水平每减少10%:OR=2.47,95%CI=1.19～5.13,P=0.016),在男性中呈正相关(甲基化水平每减少10%:OR=0.52,95%CI=0.29～0.94,P=0.030)。此外，在年龄>55岁的人群中观察到了RABL6＿CpG＿2和RABL6＿CpG＿5位点的高甲基化与LC存在关联(甲基化水平每减少10%:OR=0.77,95%CI=0.60～0.99,P=0.038;OR=0.58,95%CI=0.34～0.97,P=0.038)...     

肾小管上皮细胞间质转分化过程中E-cadherin和α-SMA基因启动子区甲基化状态研究*

目的：了解大鼠肾小管上皮细胞间质转分化与E-钙黏附蛋白（E-cadherin）和α-平滑肌肌动蛋白（α-SMA）基因启动子区甲基化状态之间的关系。方法：将大鼠肾小管上皮细胞分为对照组和TGF-β1处理组。对两组细胞采用免疫细胞化学方法检测E-cadherin和α-SMA蛋白表达情况,用ELISA法检测培养液中Ⅰ型胶原蛋白的含量。同时分别提取两组细胞中的基因组DNA,应用焦磷酸测序技术对E-cadherin和α-SMA基因启动子区甲基化水平进行检测。结果：TGF-β1处理组细胞中E-cadherin基因启动子区有2个CpG位点甲基化频率高于对照组,而α-SMA基因启动子区有2个CpG位点甲基化频率低于对照组。结论：E-cadherin和α-SMA基因启动子区甲基化状态的改变参与了肾小管上皮细胞间质转分化过程。     

外周血中KCNMA1基因甲基化水平与肺癌的发生和发展相关

目的 探究外周血中KCNMA1基因的甲基化水平与肺癌的相关性。方法 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）技术对285例肺癌患者、186例年龄、性别匹配的良性肺结节患者和278例匹配的健康对照外周血中KCNMA1基因上4个CpG位点甲基化水平进行半定量检测。使用Logistic回归模型校正协变量分析DNA甲基化水平与肺癌的相关性。使用Mann-Whitney U检验分析不同临床特征组别的甲基化水平差异。结果 在>55岁和女性人群中,KCNMA1＿CpG＿5甲基化水平最高四分位Q4 vs最低四分位Q1均与肺癌显著相关（>55岁人群：OR=2.60,95%CI:1.25～5.41,P=0.011;女性人群：OR=2.09,95%CI:1.03～4.26,P=0.042）,且KCNMA1＿CpG＿5甲基化的相关性从Q2到Q4逐渐增强（P=0.003,0.038）。与良性患者相比,KCNMA1＿CpG＿5最高四分位Q4在男性肺癌患者中的OR值为0.35(95%CI:0.16～0.79,P=0.012)。浸润性腺癌中KCNMA1＿CpG＿3甲基化水平显著低于...     

cg08721802位点异常甲基化对良恶性肺结节鉴别诊断的价值探讨

目的 探讨基于外周血单个核细胞（peripheral blood mononuclear cells,PBMCs）的DNA差异甲基化修饰位点在肺良恶性结节临床鉴别诊断中的价值。方法 采用850k甲基化芯片检测20例良性肺结节和34例恶性肺结节患者PBMCs的全基因组甲基化状态,初步构建PBMCs来源的良恶性肺结节特异性甲基化图谱并获得差异甲基化位点（differentially methylated positions,DMPs）,对DMPs所在的基因进行基因本体（gene ontology,GO）分析及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）分析。利用LASSO回归分析方法对DMPs进行统计筛选。将36例良性肺结节患者和84例恶性肺结节患者随机分成2组队列（测试队列和验证队列）,通过焦磷酸测序方法对所选的位点进行分析验证,并采用受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线进行分析,计算ROC曲线下面积（area under the curve,AUC）,评估其对肺良恶性结节的预测效能。结果 发现队列的良恶性肺结节患者PBMCs差异甲基化图谱具有明显差异。以Δβ>0.06,adjust P<0.01作为预筛选条件共得到421个DPMs。使用LASSO回归分析进一步筛选得到6个CpG位点。根据Pearson 相关分析,以及进一步去除具有引物错配风险及引物合成困难的位点,得到cg05460181（AUC=0.793,P<0.0001）和cg08721802（AUC= 0.893,P<0.0001）2个位点。测试阶段,通过焦磷酸测序测试2个位点在16例良性肺结节患者及34例恶性肺结节患者中的甲基化水平,发现cg08721802位点对肺良恶性结节具有较高的诊断价值（AUC=0.778,敏感度=85.29%,特异度=56.25%,P<0.01）。验证阶段,在另一个包含20例良性肺结节患者及50例恶性肺结节患者的独立样本集中对cg08721802的甲基化水平进行检测,发现其对区分良恶性肺结节仍具有临床价值（AUC=0.768,敏感度=84%,特异度=50%,P<0.01）,cg08721802位点诊断效能明显高于传统肿瘤标志物,cg08721802位点与CEA结合明显提高了对大小为6~20 mm的结节诊断价值。结论 cg08721802甲基化水平在良恶性结节患者中具有明显差异,可以作为良恶性肺结节鉴别诊断的新型分子标志物。     

TSHR和RASSF1A基因甲基化与乳头状甲状腺癌的相关性

目的:研究乳头状甲状腺癌TSHR和RASSF1A基因启动子甲基化的状况,分析两种抑癌基因甲基化与临床病理资料间的关系及两种抑癌基因甲基化的相关性,探讨PTC的发生机制。方法:提取50例PTC组织和32例对照组织DNA,使用甲基化PCR检测两种基因启动子区甲基化的情况;对两种基因甲基化和未甲基化的组织测序;采用SPSS13.0软件分析两种抑癌基因甲基化之间的关系及两种抑癌基因启动子甲基化和主要的临床病理参数的关系。结果:50例PTC中,发现34例TSHR基因、30例RASSF1A基因启动子发生甲基化;32例对照组中,7例TSHR基因、10例RASSF1A基因启动子发生了甲基化;PTC组TSHR基因和RASSF1A基因启动子甲基化率均显著高于对照组,差异有统计学意义。DNA测序证实,两种抑癌基因发生甲基化的其CpG岛的碱基仍为CG,未发生甲基化的碱基由CG变为TG。计算TSHR和RASSF1A基因甲基化间的相关系数r=0.490,提示PTC组两个抑癌基因甲基化之间存在显著相关性。RASSF1A和TSHR基因甲基化与患者的年龄、性别、临床分期均未见相关性;RASSF1A基因甲基化与患者是否伴有淋巴结转移无关,TSHR基因甲基化与患者是否伴有淋巴结转移相关。结论:两种抑癌基因启动子甲基化与PTC的发生有关,且可能在甲状腺肿瘤的早期阶段既已存在;TSHR基因甲基化在甲状腺癌的恶性进展中可能发挥一定作用。     

超声检查指标联合预测甲状腺乳头状癌颈部中央区淋巴结转移的价值研究

背景常规超声检查指标单独诊断甲状腺乳头状癌（PTC）颈部中央区淋巴结转移（CLNM）的灵敏度较低,而淋巴结转移（LNM）与否可影响患者的诊疗方案。目的探讨超声检查指标联合预测PTC颈部CLNM的价值。方法回顾性收集2013年3月至2020年5月于石河子大学医学院第一附属医院行甲状腺手术及颈部中央区淋巴结清扫的446例PTC患者的临床资料,包括性别、年龄及超声检查指标（结节直径、结节数目、单发位置、多发部位、内部成分、内部回声、边界、边缘、微钙化、纵横比、后方回声衰减、被膜侵犯）。依据患者术后病理结果将其分为发生颈部CLNM 159例（35.65%）,未发生颈部CLNM 287例（64.35%）。采用二元逐步非条件Logistic回归分析探究PTC患者发生颈部CLNM的影响因素。绘制各指标预测PTC患者发生颈部CLNM的受试者工作特征（ROC）曲线。结果不同性别、年龄、结节直径、边缘、微钙化、纵横比、被膜侵犯PTC患者颈部CLNM发生率比较,差异有统计学意义（P<0.05）。二元Logistic回归分析结果显示,男性〔OR=1.727,95%CI（1.059,2.816）〕、年龄<45岁〔OR=2.690,95%CI（1.728,4.187）〕、结节直径>10 mm〔OR=2.385,95%CI（1.544,3.684）〕、被膜侵犯〔OR=1.773,95%CI（1.153,2.724）〕是PTC患者发生颈部CLNM的独立危险因素（P<0.05）,回归方程：Logit（P）=-1.627+0.546×性别+0.989×年龄+0.869×结节直径+0.572×被膜侵犯。Logit（P）联合指标预测PTC患者发生颈部CLNM的灵敏度为67.92%、特异度为61.67%（最佳截断值为0.32）,ROC曲线下面积（AUC）为0.695〔95%CI（0.650,0.738）〕;联合指标预测PTC患者发生颈部CLNM的AUC分别大于性别、年龄、结节直径、被膜侵犯单独预测（Z值分别为4.137、3.682、3.070、3.679,P值均<0.05）。结论男性、年龄<45岁、结节直径>10 mm、被膜侵犯是PTC患者发生颈部CLNM的独立危险因素,且上述4种指标联合预测PTC患者发生颈部CLNM的价值较高。     

甲状腺乳头状癌中 DNA修复基因 hMLH1的甲基化与BRAF突变的关系

目的研究甲状腺乳头状癌(PTC)中DNA修复基因hMLH1的甲基化状况,分析其与PTC的T1799ABRAF基因突变的关系。方法应用甲基化特异性PCR(MSP)对60例PTC和20例癌对侧甲状腺正常组织进行hMLH1的甲基化检测。直接测序法检测上述标本中T1799ABRAF突变。结果60例PTC中,hMLH1甲基化的发生率为23%(14/60),T1799ABRAF突变率为65%(39/60)。在正常甲状腺组织中,没有检测到hMLH1的甲基化或突变。基因的甲基化或突变与临床病理特征没有显著关联。携带T1799ABRAF突变的PTC较携带野生型BRAF基因的PTC更容易发生DNA修复基因的甲基化〔13/39(33%)vs1/21(5%),P=0.022〕。结论PTC中DNA修复基因hMLH1的甲基化较T1799ABRAF突变少见;甲基化与T1799ABRAF突变有关联。     

SHOX2基因甲基化水平对肺癌和良性肺部疾病的鉴别诊断研究

Objective　To evaluate the value of SHOX2 gene methylation level for differential diagnosis in patients with lung cancer and benign lung diseases.Methods　Patients with lung cancer and benign lung diseases hospitalized in the Department of Thoracic Surgery and Department of Eespiration of the Central Hospital of Wuhan from March 2014 to June 2016 were enrolled.Among them,173 patients with lung cancer were defined as lung cancer group,and 194 patients with benign lung diseases as benign lung disease group.Routine serological examination and tumor markers were detected in all patients.The SHOX2 gene methylation was detected by Sanger sequencing,and the SHOX2 gene methylation level was calculated by △△CT method.The value of each index in differential diagnosis of lung cancer was analyzed by receiver operating characteristic（ROC） curve.The relationship between each index and lung cancer pathological type and TNM staging was analyzed.Results　The white blood cell count（WBC） and △△CT value of lung cancer group were lower than those of benign lung disease group,while the serum gastrin releasing peptide precursor（ProGRP）,squamous cell carcinoma antigen（SCC-Ag）,cytokeratin 21 fragment antigen（Cyfra21-1） and carcinoembryonic antigen（CEA） were higher than those in benign lung disease group（P<0.05）. The result of multivariate Logistic regression analysis showed that serum ProGRP,serum Cyfra21-1,and △△CT values were factors influencing lung cancer（P<0.05）. The area under ROC curve（AUC） of △△CT value for the diagnosis of lung cancer was 0.843.The sensitivity was 58.2%,and the specificity was 93.1% when the optimal threshold was 2.69.The AUC of serum ProGRP was 0.711,with optimal threshold of 32 ng/L,sensitivity of 63.5% and specificity of 77.4%.The AUC of serum Cyfra21-1 was 0.677,the best cut-off value 2.92 μg/L,sensitivity 56.1%,and specificity 72.3%.The AUC of serum ProGRP for the diagnosis of lung cancer was greater than that of serum Cyfra21-1（Z=3.569,P=0.038）. The AUC of the △△CT value combined with serum ProGRP was 0.860.The AUC of △△CT value combined with serum ProGRP in the diagnosis of lung cancer were greater than that of △△CT value,serum ProGRP,and serum Cyfra21-1（Z=4.046,Z=5.607,Z=8.215,P<0.05）. The △△CT value of patients with squamous cell carcinoma,small cell carcinoma was lower than that of patients with adenocarcinoma,large cell carcinoma and other unknown pathological types（P<0.05）. The △△CT value of patients in stage Ⅲ lung cancer was lower than that of those in stage Ⅰ and stage Ⅱ（P<0.05）,and the △△CT value of patients in stage Ⅳ lung cancer was lower than that of those in stage Ⅰ,stage Ⅱ and stage Ⅲ（P<0.05）. Conclusion　SHOX2 gene methylation has its value in the differentiation of lung cancer and benign lung disease.It is correlated with lung cancer pathological type and TNM staging,which can be used as an auxiliary index for diagnosis of lung cancer.     

ACR TI-RADS预测伴桥本甲状腺炎的甲状腺乳头状癌颈淋巴结转移的价值

目的： 探讨美国放射学会甲状腺影像报告与数据系统（ACR TI RADS）预测伴桥本甲状腺炎（Hashimoto′s thyroiditis,HT）的甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)颈淋巴结转移的价值。方法： 回顾性分析271例伴HT的PTC患者,依据有无颈淋巴结转移分为有转移组和无转移组,比较两组患者术前超声声像图表现差异,并根据声像图表现分别进行Kwak甲状腺影像报告与数据系统(Kwak TI RADS)和ACR TI RADS分级,采用二分类Logistic回归分析确定颈淋巴结转移的独立影响因素。绘制肿瘤最大径、纵横比、ACR TI RADS分值的ROC曲线,评估各预测因素的诊断效能。结果： 年龄、性别、肿瘤最大径、纵横比、ACR TI RADS分值与伴HT的PTC患者颈淋巴结转移明显相关（P<0.05）。Logistic回归分析显示: 肿瘤最大径、ACR TI RADS分值、纵横比>1是颈淋巴结转移的独立危险因素（OR分别为1.169、1.392、2.765, P均<0.05）。肿瘤最大径、ACR TI RADS分值、纵横比>1联合预测模型的ROC曲线下面积为0.887（95% CI：0.849～0.925）,敏感性为86.2%,特异性为75.0%。结论：ACR TI RADS分值是伴HT的PTC患者颈淋巴结转移的独立影响因素,与肿瘤最大径、纵>1横比联合预测模型可为临床制定治疗方案提供一定的影像学依据。     

超声造影定量分析诊断乳头状甲状腺癌患者颈部淋巴结转移的效能分析

目的 探究超声造影(CEUS)定量分析诊断乳头状甲状腺癌(PTC)患者颈部淋巴结转移的效能分析。 方法 回顾性分析2017年1月—2018年1月在宁波市鄞州人民医院行手术治疗的90例PTC患者,根据术后病理是否发生颈部淋巴结转移将其分为转移组(40例)和无转移组(50例),比较2组患者癌结节大小,CEUS特征(灌注强度、均匀强度、灌注缺损及灌注模式),CEUS定量参数[上升时间(RT)、峰值强度(PI)、平均渡越时间(MTT)、曲线下面积(AUC)、峰值降半时间(TPH)、上升斜率(WIS)及达峰时间(TTP)],应用ROC曲线分析CEUS相关指标取不同cut-off值的诊断价值。 结果 100个癌结节中76.00%(76/100)表现为低增强,89.00%(89/100)表现为灌注强度不均匀,转移组癌结节大小显著高于无转移组(P=0.002);2组患者癌结节边缘区PI、AUC和WIS显著高于中央区(均P<0.05),转移组边缘区PI、边缘区AUC显著高于无转移组(均P<0.001);ROC曲线显示,癌结节边缘AUC、边缘PI和结节大小的AUC分别为0.866、0.869和0.720,其中边缘AUC和边缘PI对颈部淋巴结转移的诊断效能均高于癌结节大小(P=0.026、0.018);Youden指数提示癌结节边缘AUC、边缘PI和结节大小位于最佳截点时,边缘AUC和边缘PI的准确率、灵敏度和阴性预测值的诊断价值显著高于结节大小(P_AUC=0.042、0.001、0.019,P_PI=0.018、0.003、0.022)。 结论 在PTC患者颈部淋巴结是否发生转移的诊断中,癌结节边缘区CEUS定量参数PI和AUC准确率和灵敏度高,具有重要的临床意义。      

基于生物信息学分析LncRNA AC005479.2在甲状腺乳头状癌中的表达及相关分析

目的 通过生物信息学分析探讨甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)的关键基因及其潜在调控分子靶标,探索其在PTC中的分子调控机制。方法 通过TCGA数据库检索并下载甲状腺乳头状癌的基因表达谱,使用Rstudio中的“Limma”软件包寻找甲状腺乳头状癌与癌旁组织之间的是否存在差异长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)。使用WGCNA构建及临床相关性分析。通过GSEA进行富集分析和注释。结果 经TCGA数据库筛选,共510例甲状腺乳头状癌的肿瘤组织与58例癌旁组织被纳入分析,共得到了58个差异表达lncRNA,其中包括36个高表达基因与22个低表达的基因。使用动态树切割法识别基因模块,设定模块内最低基因个数为100,最终得到11个相应的模块,结果显示,蓝色模块与甲状腺乳头状癌显著相关。蓝色模块内差异lncRNA共有34个,对Blue模块内34个差异lncRNA进行单因素和多因素Cox回归分析,得到AC005479.2。随后对AC005479.2绘制受试者工作特征曲线,曲线下面积为0.838。通过GO和KEGG...     

基于FNA-Tg和血清Tg的二元Logit回归模型对甲状腺癌淋巴结转移或复发的判定价值

  目的  通过二元Logit回归分析患者淋巴结细针细胞学穿刺洗脱液甲状腺球蛋白测定值（FNA-Tg值）、血清甲状腺球蛋白值（血清Tg值）及其比值,建立对甲状腺癌淋巴结转移、复发情况的预测模型。  方法  （1）收集术前为分化型甲状腺癌伴可疑淋巴结转移患者64例。（2）通过ROC曲线初步评估FNA-Tg值、血清Tg值及其比值对淋巴结良恶性鉴别的诊断价值。（3）使用二元Logit回归分析进一步评价上述3项指标的诊断价值并建立预测模型。  结果  （1）ROC曲线:淋巴结FNA-Tg对应的AUC值为0.998（95% CI 99.27%～100.34%）,切点值为0.82;血清Tg对应的AUC值为0.824（95% CI 70.64%～94.14%）,切点值为18.27;淋巴结FNA-Tg/血清Tg对应的AUC值为1.000（95% CI 100.00%～100.00%）,切点值为0.461。（2）二元Logit回归全进入法3项自变量同时存在,二元Logit回归全进入法3项自变量同时存在,FNA-Tg值、血清Tg值及其比值3项P值均 > 0.05,模型3项自变量同时存在对淋巴结良恶性无诊断价值;二元Logit回归全进入法淋巴结FNA-Tg单一变量。淋巴结FNA-Tg可以解释88%淋巴结良恶性的变化,P = 0.038 < 0.05,回归系数2.68,OR值14.587,预测模型公式为:In（p/1-p） = -4.122 + 2.680*淋巴结FNA-Tg,似然比检验P = 0.000 < 0.001,AIC值14.386,BIC值18.704,总体预测准确率为95.31%;二元Logit回归全进入法血清Tg单一变量,血清Tg能解释淋巴结良恶性27.8%的变化原因,P = 0.000 < 0.001,回归系数0.164,OR值1.179,预测模型公式为:In（p/1-p） = -2.466 + 0.164*血清Tg,似然比检验P = 0.000 < 0.001,AIC值67.33,BIC值71.648,总体预测准确率为75%。  结论  术前FNA-Tg、血清Tg及其比值在判定甲状腺结节良恶性有很好的诊断价值。基于FNA-Tg、血清Tg的二元Logit回归模型公式能较好的预测甲状腺癌患者淋巴结转移、复发的情况。     

PITX2启动子甲基化及其与膀胱癌临床病理的关系

目的:由于近些年表观遗传学的发展,基因启动子甲基化检测在预测癌症诊断预后方面拥有巨大的潜力。PITX2启动子的高CpG岛增加其甲基化程度,其能够成为新的膀胱癌预测因子。方法: QRT-PCR检测永生化膀胱上皮细胞系（SV-HUC）和3种膀胱癌细胞系（EJ、5637、T24）以及癌组织和癌旁组织的差异性表达。通过DNA甲基化测定实验对33例全膀胱切除术切除癌组织进行甲基化程度测定,分为大于50%甲基化,小于50%甲基化建立甲基化程度与肿瘤分期分级的联系。结果:使用实时定量RT-PCR（Q-PCR）证明PITX2在膀胱癌细胞中高表达。癌组织中甲基化程度明显高于癌旁组织。PITX2启动子甲基化与肿瘤大小（P =0.026 7）、高级别（P =0.027 7）和TNM分期（0.016 0）显着相关。在预测肿瘤侵袭（T2-T4肿瘤）中,PITX2启动子甲基化的ROC曲线下面积（AUC）为0.867。 Kaplan-Meier生存分析表明,与低PITX2甲基化表达的肿瘤相比,高PITX2启动子甲基化表达的肿瘤与较短的总体存活相关。结论:PITX2在膀胱癌组织中异常高表达,并且PITX2启动子区域在癌组织中存在高甲基化是患者不良预后的独立危险因素,因此,PITX2启动子甲基化可能成为膀胱癌肿瘤发生进展有效的预测因子。